C형 간염 바이러스(HCV)는 간경변과 암을 포함한 간 질환을 일으키는 주요 인간 병원체입니다. HCV 감염성 세포 배양 시스템은 HCV 복제의 분자 메커니즘을 이해하고 새로운 치료법을 개발하는 데 필수적입니다. 여기에서는 HCV 복제 주기의 다양한 단계를 조사하기 위한 프로토콜에 대해 설명합니다.
방법 논문
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C형 간염 바이러스(HCV)는 간경변과 암을 포함한 간 질환을 일으키는 주요 인간 병원체입니다. HCV 감염성 세포 배양 시스템은 HCV 복제의 분자 메커니즘을 이해하고 새로운 치료법을 개발하는 데 필수적입니다. 여기에서는 HCV 복제 주기의 다양한 단계를 조사하기 위한 프로토콜에 대해 설명합니다.
C 형 간염 바이러스 (HCV)는 세계 인구의 3 %에 영향을 미치는 만성 간염, 간경변 및 간암 등의 심각한 간 질환의 원인이됩니다. HCV는 가족 플라 비 바이러스과에 속하는 포락선 RNA 바이러스이다. 현재의 치료는 완전히 효과가없고, 부작용이 발생합니다. 가능한 HCV 백신이 없습니다. 따라서, 지속적인 노력은 백신과 더 나은 치료를 개발하기 위해 필요합니다. HCV 세포 배양 시스템은 바이러스 진입, 게놈 복제, 포장, 및 송신을 포함하여 HCV 성장의 각종 단계 연구에 중요하다. 제시된 현재 프로 시저에서, 우리는 야생형 intragenotype의 2A 키메라 바이러스, FNX-HCV, 그리고 바이러스 복제를 연구하는 레 닐라 루시퍼 라제 리포터 유전자를 운반하는 재조합 FNX-Rluc 바이러스를 사용했습니다. 인간 간암 세포주 (허-7을 기준으로)의 시험 관내 형질 도입에 사용 된은 HCV 게놈 RNA를 전사를. 무 세포 배양 상층 액, 단백질 해물과 t전 체 RNA는 HCV의 성장을 평가하는 사후 형질 포인트는 다양한 시간에 수확. HCV 게놈의 복제 상태 정량적 RT-PCR 및 HCV의 존재를 시각화하는 이중 가닥 RNA에 의해 평가 하였다. HCV 단백질 발현은 HCV NS3 및 NS5A 단백질에 대한 특이 항체를 이용하여 웨스턴 블롯 및 면역 형광 분석에 의해 확인되었다. 배양 상청 및 바이러스 역가에 감염성 입자를 방출 HCV의 RNA 형질 감염 세포를 측정 하였다. 루시페라아제 리포터 분석법은 HCV의 복제 수준 및 감염성을 평가하기 위해 사용되었다. 결론적으로, 우리는 HCV의 복제주기의 다른 단계를 특성화하기위한 다양한 바이러스 적 분석을 제시한다.
C 형 간염 바이러스 (HCV)는 간경변과 간암의 원인이됩니다. 그것은 350,000의 사람들이 매년 1-3 죽어과 170 만명이 전 세계적으로 영향을 미칩니다. HCV는 9.6 KB의 게놈의 크기와 양의 가닥 RNA 바이러스이다. HCV 게놈은 단백질 가수 분해 10 폴리펩티드에 다양한 세포 및 바이러스 프로테아제에 의해 절단된다 ~ 3000 개의 아미노산의 단일 폴리 단백질로 번역된다. HCV는 속 Hepacivirus에 프로토 타입 바이러스와 가족 플라 비 바이러스과 4에 속한다. 노출되면, HCV는 개인의 80 %에 만성 감염을 설정합니다. 감염이 진단은 간 저하를 방지하기 위해 치료 적 개입을 허용 할 수 있습니다 대부분 증상이 적시에 있습니다. 현재 치료는 차선이고 백신은 5,6 사용할 수 없습니다.
C 형 간염의 원인은 1989 7 설명했다. HCV 복제를 공부하는 것은 C 형 간염 백신과 치료 연구를위한 중요하지만이 있었다긴 효율적인 바이러스 배양 시스템의 부족에 의해 방해. HCV의 분자 클론은 간내 접종 8시 침팬지에 감염 될 것으로 나타났다. 이어서, HCV 서브 게놈 플리은 세포 배양 시스템 9,10에서 바이러스 게놈 복제 단계를 절개 할 수있는 기술되었다. 유전자형 2A의 HCV의 발견은 JFH-1 (일본어 전격 성 간염 1) 분리, 세포 배양을 감염시킬 수는 HCV의 복제 연구를 11 ~ 13를위한 새로운 길을 열었습니다. 유전자형 2A 변형 JFH-1 간 및 내 유전자형 키메라 바이러스와 유전자형 1 HCV 기반 기반 감염성 문화 시스템뿐만 아니라 14 ~ 18 사용할 수 있습니다.
우리는 성공적으로 단백질 도메인 및 시스 - 작용하는 RNA 요소 (19, 20)의 고해상도 기능 프로파일의지도를 구하는 것이 JFH-1 균주 및 HCV의 intragenotype의 2A 키메라 바이러스를 사용했습니다. 이 기사에 따르면, 우리가 할 수 일상적으로 사용하는 효과적인 문화 시스템을 설명HCV의 복제주기 및 호스트 병원체 상호 작용의 다양한 단계를 공부. 우리는 바이러스 게놈 복제 및 intragenotype 2a 개의 HCV와 레 닐라 루시퍼 기반 기자 HCV의 새로이 감염을 평가 한 바이러스 분석을 제시한다.
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프로토콜의 일반적인 개요는도 1에 도시되어있다.
1. 셀
2. 바이러스와 플라스미드 구문
3. 체외 HCV의 RNA의 전사
4. HCV RNA 형질 및 시료 채취
5. HCV 게놈 복사를 평가하기위한 전사 정량 PCR (RT-qPCR에)를 역방향
6. 웨스턴 블로 팅 분석 HCV 단백질 발현 (그림 3C)를 검출
7. 면역 형광 분석 (IFA)
8. 측정 바이러스 역가
바이러스 게놈 복제 및 감염성 9. 닐라 루시퍼 라제 리포터 분석
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C 형 간염 바이러스는 RNA 바이러스이다. 따라서, 유전자 조작 목적, HCV 게놈 cDNA를 박테리아 플라스미드 벡터에 클로닝되었다. T7 RNA 폴리머 라제 프로모터 서열은 HCV 게놈의 5 '말단 바로 전에 도입되었다. HCV 분석 워크 플로우에 대한 일반적인 개요를 그림 1에 제시되어있다. 정확한 3 '끝 HCV 게놈 RNA를 생성하려면, 플라스미드를 포함하는 HCV 게놈은 XBA I 제한 효소 생성 된 단일 가닥 오버행이 녹두 클레아 소화를 둔화 된 절단된다 . HCV 선형화 된 플라스미드의 품질을 아가 로스 겔 전기 영동 (도 2B)에 의해 평가 하였다. HCV DNA는 시험 관내 전사에 매개 T7 RNA 중합 효소를 실시하고 그 결과 RNA는 9.6 킬로베이스 (도 2c)에서 하나의 제품을 얻었다.
우리는 intragenoty...
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이 그림은 C 형 간염 바이러스의 복제 사이클을 분석하는 방법을 설명한다. HCV는 인간의 병원체이며, 소정의 바이오 안전성 의정서는 엄격하게 준수해야하는 것입니다. HCV 감염 세포 배양 시스템은 이전 11-13,16,17 설명되었다. 예시 된 프로토콜을 다음과 같은 때 우리가 구현하는 몇 가지 중요한 포인트가 있습니다. 첫째, 다운 스트림 연구에 그대로 전체 길이 바이러스 게놈 RNA의 좋은 품질을 가지고 높은 중요하다. 바이러스의 cDNA를 들고 입력 플라스미드를 선형화하고 신중하게 무디게 할 수있다. XBA I 오버행을 무디게하기 위해 사용 된 녹두 콩 클레아가 아닌 특정 클레아 제와 장시간 배양은 바이러스 게놈의 3 '말단의 손상이나 성능 저하가 발생합니다. 클레아는 페놀 - 클로로포름 추출 또는 음이온 교환 칼럼 정제에 의해 지정된 30 분 인큐베이션 후에 즉시 제거되어야한다. DNA 치료 핵산 분해 효소의 젤 추출로 추천 할 수 없습니다효소는 전기 영동 과정 중에 활성...
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Huh-7.5.1 세포주를 제공해 주신 F. Chisari에게 감사드립니다. 원고를 편집해 주신 Justine Ho에게 감사드립니다. 이 작업은 Cedars-Sinai Medical Center Institutional Programmatic Research Award와 National Center for Advancing Translational Sciences의 지원을 받았으며 V.A.에 UL1TR000124 지원했습니다.
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| 이름 | 회사 | 카탈로그 번호 | 댓글 |
|---|---|---|---|
| 둘베코' s 변형 된 독수리' s 매체 (DMEM) | Fisher Scientific | 10-017-CV | |
| 비 필수 아미노산 | Fisher Scientific | MT25025CI | |
| HEPES | Life Technologies | 15630080 | |
| Glutamax | Life Technologies | 35050061 | |
| Opti-MEM 감소 혈청 매체, 페놀 없음 Red | Life Technologies | 11058-021 | |
| Huh-7.5.1 | 스크립스 연구소 | 세포주는 프랜시스 치사리 박사가 스크립스 연구소와 시더스-시나이 메디컬 센터 | |
| 플라스미드 (pFNX-HCV, pFNX-HCV Pol null, pFNX-Rluc, and pFNX-Rluc Pol null) | Cedars-Sinai Medical Center | HCV 플라스미드는 중첩된 올리고-뉴클레오티드를 사용하여 Dr. Arumugaswami에 의해 합성되었습니다. | |
| XBAI | 뉴 잉글랜드 Biolabs Inc. | R0145S | |
| 녹두 뉴클레아제 | 뉴잉글랜드 Biolabs Inc. | M0250S | |
| T7 RiboMAX Express 대규모 RNA 생산 시스템 | Promega | P1320 | |
| Rneasy Mini Kit | Qiagen | 74104 | |
| Nanodrop 2000 | Thermo Scientific | Nanodrop 2000 | |
| Electroporation Cuvette (4 mm) | Bioexpress | E-5010-4 | |
| Gene Pulser Xcell Total System | Bio-Rad | 165-2660 | |
| 마우스 단클론 항-dsRNA 항체 J2 | 영어 & 과학 컨설팅 Kft. | ||
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| 염소 안티 토끼 IgG Alexa Fluor 594 | Life Technologies | A11020 | |
| PVDF 멤브레인 패키지 | Bio-Rad | 162-0263 | |
| 블로팅 등급 차단제 Non-Fat Dry Milk | Bio-Rad | 170-6404XTU | |
| Tween-20 | Bio-Rad | 170-6531XTU | |
| 항-C형 간염 바이러스 NS3 항체 [8 G-2] | Abcam | ab65407 | |
| 항-C형 간염 바이러스 NS3 항체 [H23] | Abcam | ab13830 | |
| 염소 항-마우스 IgG 고추냉이 과산화효소 (HRP)와 결합 | 잭슨 면역 연구소 Inc. | 115-035-003 | |
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