얼룩말 핀치새(Taeniopygiaguttata)는 가치 있는 모델 유기체입니다. 그러나 얼룩말 핀치새의 발달 초기 단계는 광범위하게 연구되지 않았습니다. 이 프로토콜은 발달 및 분자 응용을 위해 초기 배아를 해부하는 방법을 설명합니다.
얼룩말 핀치새(Taeniopygiaguttata)는 가치 있는 모델 유기체입니다. 그러나 얼룩말 핀치새의 발달 초기 단계는 광범위하게 연구되지 않았습니다. 이 프로토콜은 발달 및 분자 응용을 위해 초기 배아를 해부하는 방법을 설명합니다.
얼룩말 핀치 (Taeniopygia의 guttata)는 독성 1, 2, 문제 3, 메모리를 포함하고 4,5,6 학습 연구의 많은 분야에서 점점 더 중요한 모델 생물이되고있다. 시퀀스 게놈을 가진 유일한 가수로, 얼룩말 핀치 발달 연구에 사용하기 위해 큰 잠재력을 가지고; 그러나, 얼룩말 핀치 개발의 초기 단계는 잘 연구되지 않았습니다. 얼룩말 핀치 개발에 연구의 부족은 작은 계란과 배아를 해부의 어려움에 기인 할 수있다. 다음 해부 방법은 배아 발달의 모든 단계에서 형태와 유전자 발현의 조사를 허용 배아 조직의 손상을 최소화 할 수 있습니다. 이것은 시야를 모두 허용하고 배아의 형광 품질의 영상은, 같은 현장 하이브리드 (ISH), 세포 증식 분석, 이러한 양적 정말이에요 정량적 분석을위한 RNA 추출에서와 같이 분자 절차에 사용L 타임 PCR (qtRT-PCR)를.이 기술은 연구자가 접근하기 이전에 어려웠다 개발의 초기 단계를 연구 할 수 있습니다.
이 기술의 전반적인 목표는 개발 연구의 넓은 범위에서 사용하기위한 배아의 초기 단계에서 얼룩말 핀치 (Taeniopygia의 guttata) 배아를 획득하는 것입니다. 얼룩말 핀치 주된 송 버드 모델 생물이되었으며 독성 1, 2, 문제 3, 메모리, 4,5,6, 7,8 비교 신경 해부학을 배우고, 언어 발달 9,10 등 다양한 분야에서 광범위하게 사용되어왔다 . 시퀀스 게놈을 가진 유일한 가수로, 얼룩말 핀치 알려진 조류 11, 12, 13의 50 % 이상을 나타내는 Passeriformes 순서의 분자 유전 연구를 할 수 있습니다.
필드의 다양한 배열의 성인 및 청소년 얼룩말 핀치의 사용에도 불구하고, 몇 가지 연구는 특히 개발 초기 단계에서, 얼룩말 핀치 배아에서 수행되었다. 이것은 그들의 계란의 작은 크기에 기인 할 수있다차 배아, 그리고 닭고기가 (갈 루스 루스 인 domesticus) 이전에 지배적 인 모델 시스템 17,18,19,20,21로 사용하는 연구를위한 모델 생물의 14,15,16 그들의 새로운 상태. 그러나, 비 보컬 학습자로, 닭 보컬 학습, 보컬 학습, 유전, 동작 및 모터 (10)를 학습에 관련된 대뇌 피질 - 기저핵 회로의 개발의 유전 적 기초를 공부에 적합한 모델 시스템이 아닙니다.
그것은 얼룩말 핀치 배아 훨씬 더 섬세하고 더 쉽게 손상 해부 및 분자 과정에서 병아리 배아보다하는 것이 중요합니다. 얼룩말 핀치 배아 permeabilization 단계를 수행 할 때 특히 더주의가 필요합니다. 병아리 배아를 해치지 않을 것이다 강한 세제 효소는 얼룩말 핀치 배아를 손상시킬 수 있습니다. 일반 배려의 측면에서, 그것은 인큐베이터에 배치하기 전에 작은 컵에 얼룩말 핀치 달걀을 넣어하는 것이 필요하다회전 할 때 배양 중에 파손되는 것을 방지하기 위해.
얼룩말 핀치 쉽고 다산 포로 연중 번식, 행동 연구에 순종하고, 보컬 학습자입니다. 이러한 특성은 얼룩말 핀치의 사용은 발전, 유전학 및 언어의 행동 양상을 통합 모델 생물을위한 필요성을 해결하는 것을 허용한다. 얼룩말 핀치 (22)에 특정 최근에 개발 준비 가이드와 함께 아래에 자세히 해부 방법은, 얼룩말 핀치 점점 유용 표준화 된 개발 모델 생물합니다. 그러나, 초기 단계에서 배아를 획득하는 것은 어려운하실 수 있습니다. 이 프로토콜은 연구자가 쉽게 초기 단계의 배아를 얻을 수 있습니다. 얼룩말 핀치의 복잡한 행동, 또는 다른 작은 개발에 독성 영향의 초기 개발 및 분자 개발 기초 조사 연구, 연작 조류이 절개 방법이 유용합니다.
윤리 문 : 방법은 윌리엄과 메리의 대학에서 사육 식민지에서 길 들여진 얼룩말 핀치와 함께 실시했다. 모든 절차는 RSPCA의 가이드 라인 (23)을 따라 윌리엄과 메리의 OLAW (실험 동물 복지 사무소) 동물 복지 보증 (# 1 A3713-01)의 대학에 의해 승인되었고 (# 2013-06 기관 동물 관리 및 사용위원회 (IACUC)의 승인을했다 - 02-8721 - dacris).
1. 달걀 수집 및 창업 보육
난자에서 배아의 2. 제거
여분의 배아 조직에서 배아의 3. 분리
4. 에듀 세포 증식 분석. 법인 설립 및 얼룩말 핀치 배아 에듀 감지.
5. 에듀 반응 프로토콜을 "클릭"
다음 단계는 모든 유리 병에서 수행됩니다.
난황 막 (A)에 부착 노른자 (B)에서 배아를 분리하는 적절한 방법을 설명하면서 그림 1에 도시 된 단계는 배아의 모양을 나타냅니다. 태아는 난황 막에 비해 훨씬 가볍고 접합의 영역을 식별 할 수 있습니다. 노른자는 버려야 될 때까지 배아 자체는 구별하기 어려운 경우가 많습니다. 배아는 난자에서 해부되면, 고정 할 수 있습니다 또는 플래시는 나중에 사용하기 위해 냉동. 현장 하이브리드의가 해부 배아에 계획되어있는 경우,이 접합의 영역을 통해 태아에 부착 난황 막 제거 할 필요가있다.이 막은 (C) 제거되면 2 배의 향상된 가시성을 보여줍니다 그림, 그리고 난황 막 (A, B)를 벗겨하는 적절한 방법. 해부 및 고정 후, 전체 현장 하이브리드에 탑재 그림 3 (A, A ', B, B에서와 같이 실시 하였다') 및 그림 4 (A, A', B, B ')와 그림 5 (A, B, C) orthodenticle의 호 메오 박스 (homeobox) 2 발달 메틸 수은의 낮은 복용량에 노출 된 배아 (의 Otx2) 발현의 차이를 감지하기 위해. 5는 그림 센스 조사 결과, 배경의 시연 부족. 제어 배아는 6 22 (A, 무대 위해 개발하는 동안 그림 4, 같은 시점에서 알 해부에도 불구하고, 발달 메틸 수은 (메틸 수은)에 노출 된 태아는 5 단계 22 (B, B ')으로 진행 '). 해부 그림 4와 같이 배아의 그룹은 둥지에서 수집하고 같은 시간에 인큐베이터에서 촬영했다. 일부 천연 변이는 개발에 존재하더라도, 이전의 해부 된 데이터에 근거하여, 인큐베이터에서 온도 변동은 2.4 ppm으로 메틸 배아가 develo의 원인이 될 것 같지는 않다pmentally 지연. 단계에서의 차이는 발달 메틸 수은에 노출 된 배아에서 세포 증식의 변화를 나타냅니다.
해부하기 전에, EDU는 하루 2 알에 주입하고 밤새 배양시켰다. 스테이지 (16) (22) 태아의 해부 및 고정 후, EDU는 그림 6 (A, B, C)에서와 같이 증식하는 세포의 검출을 허용, 화학을 "클릭"을 사용하여 시각화 하였다. 그것은 개발 진행을 방해 할 수 메틸 수은에 노출로, 인큐베이터 및 해부하는 동안 계란을 배치하거나 EDU 분석을 수행 할 때주의 깊게 시점을 모니터링하는 것이 중요합니다. 초기 주입 단계 1.3에 지정된 컬렉션의 날이었다 0 일에 실시 하였다. 이 배아는 약 38 시간 후 (7 단 22) 해부했다. 생존율만큼 분사량 478 NL 하에서되면서 약 90 % (대조군의 배아와 같은 비율)로 밝혀졌다.
이 절개 방법은 고품질의 RNA를 추출 할 수 있습니다. 단계 16 22 배아를 해부 한 후, RNA 추출은 그림 7에서 볼 수있는 것처럼, 더 최적화가 필요로 제조 업체의 프로토콜에 따라 수행되었다. 난황 막의 제거는 RNA 추출 및 저장 QRT-PCR의 응용 프로그램에 대한 필요했다.
참고 : 전방 및 후방 지역은 각각 이미지의 상단과 하단에 있도록 모든 배아 수치가 지향하고 있습니다.

그림 1. 얼룩말 핀치 배아를 찾기 및 해부 절차는 1-10 22 스테이지. 희미한 흰색 디스크 (A) 알 수있을 때까지 부드럽게 노른자를 압연하여 배아를 찾습니다. 일단배아는 노른자의 중심에 위치하고 있으며, 노른자는 첫 번째 컷 (1) 이후의 인하 (2) 인 접합 (ZJ)의 영역을 국경 난황 막 압력을 완화 단계적으로 (B)의 해부 난황 막에 부착. 스케일 바는 1mm를 나타냅니다.

난황 막과 배아 구조의 가시성의 그림 2. 제거. 4 % PFA를 포함하는 페트리 접시에 노른자에서 배아의 제거, 장소 배아 다음과 같습니다. 동일계 하이브리드 화를 수행 할 필요가있는 경우, 배아 구조의 시인성이 필수적이며 난황 막 (A)를 제거함으로써 달성 될 수있다. 그립 여분의 벌금 난황 막 집게를 밀고하고 필요한 경우 부드럽게, 바깥 쪽 가장자리에 직접적으로 배아를 처리하여 멀리 배아를 벗겨(B). 난황 막 제거는 배아 구조의 선명도를 증가하고, 배아는 현장 하이브리드 (C)에 몇 군데 나 처리 할 수 있습니다. 스케일 바는 1mm를 나타냅니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 3. 전체 마운트 현장 하이브리드에이 발달 orthodenticle의 호 메오 박스 (homeobox) 2 (의 Otx2)의 메틸 수은. 발현 패턴에 노출 얼룩말 핀치 배아에서 수행은 0.0 ppm으로 메틸 수은 (A, A ')와 2.4 ppm으로 메틸 수은 (B, B에 노출 된 배아를 특징으로했다 ') 부모의 다이어트를 통해. 할 일rsal (A)과의 Otx2의 복측 (A ') 표현은 치료 그룹의 배아가 동일한 시점에서 해부 하였다. 스테이지 (12) (22) 중에 중뇌 및 광섬유 소체 전체에 표시되지만 발달 (B) 등쪽에서 본 지연된 무대 11 22 약어의 특징 인 헤드 구조의 복부 (B ')보기 :. MB, 중뇌; 영업 이익, 눈 소포. 스케일 바는 1mm를 나타냅니다.

그림 4. 전체 마운트 원래의 장소에 하이브리드가 발달 orthodenticle의 호 메오 박스 (homeobox) 2 (의 Otx2)의 메틸 수은. 발현 패턴에 노출 얼룩말 핀치 배아에서 수행은 6 단계 22 엠브리 특징으로했다 OS는 0.0 ppm으로 메틸 수은 (A, A ')와 단계 2.4 ppm으로 메틸 수은 (B, B에 노출 5 22 배아'부모의 다이어트를 통해)에 노출. 약어 : 오전, 중배엽의 전연; 아니, 척색, 척색 중배엽; PO, proamnion, 전방 blastopore; PS, 원시 행진 22. 스케일 바는 1mm를 나타냅니다.

그림 5. 전체가 현장에서 마운트 하이브리드가 감지 프로브를 사용하여 얼룩말 핀치 배아에서 수행. (A) 5 단계 22 배아. (B) 초기 단계 6 22 배. (C) 단계 11에서 22 배. 스케일 바는 1mm를 나타냅니다.
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그림 6. 에듀 설립 얼룩말 핀치 배아 드 tection. 에듀 화학이 스테이지 (16) 22 배아 (A, B, C)에서 증식하는 세포를 감지하는 데 사용했다 "클릭". EDU는 티미 딘 (26, 27)의 위치에 DNA에 통합되고, 클릭 화학 (27)를 사용하여 감지됩니다. 대량 살상 무기 확산은 somites의 측면 모서리 및 tailbud에서 명확하게 볼 수 있습니다. 패널 A는 태아의 후방에 독점적으로 발생 확산을 보여주고 개별 증식 세포를 보여줍니다. 패널 B는 전체 배아의 증식 위치를 보여줍니다. 패널 C는 전방 지역을 보여주고, 더 자세히에서 높은 증식 telencephalon (TE)를 보여줍니다. 요약 : AF, 양수 배; FLB, 앞다리 봉오리; HLB, 뒷다리 봉오리; 르, 렌즈 소포; MS, 중뇌; MT, metencephalon; OPC, 눈 컵; PA, 인두 아치; SM, 체절 중배엽; 결핵, tailbud; 테, telencephalon. 스케일 바는 1mm를 나타냅니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

해부 얼룩말 핀치 배아. 제어 (0.0 ppm)를 1.2 ppm으로 메틸 수은의 배아에서 추출한 RNA의 그림 7. 품질은 해부 단계 3.8의 설명에 따라 플래시가 동결되었다. 각 레인은 각 치료 그룹에서 두 균질화 된 배아에서 추출한 RNA를 보여줍니다.
배아 준비 가이드 (22)와 게놈 주석의 최근 발전은 얼룩말 핀치 개발 연구를위한 바람직한 모델 생물합니다. 그러나, 단계 1에서 3-7밀리미터 범위 얼룩말 핀치 배아의 작은 크기와 취약성 - 10 22, 11, 14 해부 어렵게 만들 수 있습니다. 위치과 청결 노른자의 표면에서 배아를 제거하는 것은 도전이 될 수 있습니다. 이 프로토콜은 쉽게 절차를 수행하기 위해 충분한 세부 사항을 제공한다. 이 프로토콜은 성공적으로 절개를 보장하기 위해 일반적으로 알려져 있지 않습니다 만, 필요한 중요한 단계를 보여줍니다. 예를 들어, 배아 및 나와 배제 용지의 무게의 시트 사이 노른자의 작은 층을 남겨두기 위하여 필수적이다.
배아의 식별 및 제거 모두 어려울 수 있습니다. 이 후 난황의 표면에 배아를 식별 해결하기 위해, 직접 노른자 위에 빛을계란에서 제거하고 배아를 찾기 위해 45 ° 각도로 노른자보고되었습니다. 배아가 위치한되면, 배아를 찢어지지주의하면서 종이의 무게에 노른자를 잘라.
구조의 더 나은 시각화를 위해 8 22 - 추가 응용 프로그램은 해부학 현장 하이브리드의 차이, 또는 세포 증식 시험 법에 대한 이미지를 포함하는 경우는 1 단계에서 난황 막 제거하는 것이 중요합니다. 초기 단계에서 노른자 또는 난황 막 제거 할 때 문제가 발생하는 경우, 배아 취약성을 줄이기 위해 1X PBS로 세척하기 전에 4 % PFA의 배아를 수정. 설명 된대로 첫 해부 동안 난황 막을 제거함으로써, 구조 현장 하이브리드의를 수행 한 후 명확하게 얼룩말 핀치 배아에 보이는 그대로입니다.
EDU의 한계는 배아 사망에 478 NL 리드에 투여 볼륨의 관리입니다. 그러나 광대 한 복용량 범위는 varyin 수 있습니다증식 세포 태그의 g 수준.
이 키트에 사용되는 "클릭"반응은 구리 (I) - 촉매 - 알킨 - 아 지드 - 사이클로 (구리 (I) AAC)입니다. 이러한 특정 반응에서, 알킨 함유 티미 딘 아날로그 분자 (EDU)가 적극적으로 셀을 분할하여 통합된다. 듀의 알킨 그룹 DNA의 나선 구조로부터 돌출 한 자유 알킨 그룹에 바인딩 녹색 형광 분자에 접합 지드 분자에 노출에 의해 검출된다. 녹색 형광 배아에서 새로 증식하는 세포를 보여줍니다. 이러한 반응 종은 생물에 자연적으로 존재하지 않기 때문에 아 지드의 바이오 직교성과 알킨 그룹이 아닌 특정 얼룩을 방지 할 수 있습니다. DNA가 발생하는 반응의 순서 변성 할 필요가 없으므로, 상기 DNA 의존성 분석은 쉽게 27을 행할 수있다.
이 방법의 고유 제한은 작은 크기와 파편입니다얼룩말 핀치 배아의 ility. 주의 수행이되지 않을 경우 15 22 손상 배아 구조가 발생할 수 있습니다 - 배아의 난황 막 제거 1 단계입니다. 그러나이 프로토콜은 조사자 이전 깊이 연구되지 않은 구조적 기형 및 유전자 발현을 조사하는 초기 배아 단계를 사용할 수 있도록 절개 방법을 단순화한다. 이 프로토콜은 수사관 성인 표현형의 발달 기원을 확인 할 수 세포 분자 분석의 과다에 대한 방법을 엽니 다. 예를 들어, 유전자 발현은 다양한 환경 조건에서 보컬 학습에 연루 또는 개발 28, 29,30,31의 초기 단계에서 약물 치료를 다음 검사 할 수있을 것이다. 이 글에서 설명하지 않지만,이 방법은 잠재적으로 얼룩말 핀치 조직 섹션과 일렉트로 / OV에 대한 현장 하이브리드의 방사성 등의 절차를 허용O 수술 32, 33, 34. 얼룩말 핀치 문학의 광대 한 본문 내에서 중요한 모델 생물로 설립 된 것을 감안할 때, 이러한 연구는 성인 생리학과 행동 발달 메커니즘을 연결 언어 7, 9의 특히 발전에 숨은 기회를 제공합니다.
저자가 공개하는 게 없다.
저자는 자신의 자금 출처, 윌리엄과 메리의 대학 하워드 휴즈 의학 연구소 학부 과학 교육 프로그램을 감사한다; 보조금 스폰서 : NIH (MSS) 허가 번호 : R15NS067566. 또한 동물 보호에 대한 지원은 예술과 과학의 윌리엄 앤 메리 대학 생물학과 대학에서 지원을 인정합니다.
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