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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
이 프로토콜은 마우스 사교성을 정량하는 방법을 설명한다. 그들이 이동하고 특별한 케이지에서 상호 작용하는 마우스는 녹화됩니다. 동영상 처리가 뛰어난 정확성과 신뢰성 사교성의 자동화 된 정량화 수 있습니다.
마우스 사교성을 높이기위한 약물을 시험하기위한 바람직한 모델 생물이다. 우리 실험 마우스 표준화기구에 배치되어 해당 동작은 세 가지 세션 (호출 세션 I, II 및 III)을 평가하는 마우스 사교성을 정량하는 방법을 제시한다.
장치는 세 개의 구획 (그림 1 참조)이, 왼쪽과 오른쪽 구획 ( "경기 부양 마우스"라고 함) 마우스를 수용 할 수있는 반전 컵이 포함되어 있습니다.
세션 I에서, 시험 마우스 케이지에 넣고 그 이동성 구획간에 천이의 수에 의해 특징된다. 세션 II에서, 자극 마우스 반전 컵 중 하나에 배치되어 상기 테스트 마우스 사교성은 그것이 비어 반전 컵 대 동봉 자극 마우스를 포함하는 컵 근방 보내는 시간의 양에 의해 정량화된다. 세션 III에서, 반전 된 컵이 제거 D 두 마우스는 자유롭게 상호 작용합니다. 세션 III의 시험 쥐의 사교성은 그 자극 마우스 향해 접근하게 사회의 숫자로하고 자극 마우스에 의한 사회 접근을 방지하는 횟수에 의해 정량화된다.
영화의 자동화 평가 세션 I과 II의 모든 설명 사교성 조치의 결정 수있는 테스트 마우스의 코 검출 (세션 III에를 접근은 자동으로 식별하지만 수동으로 분류된다). 코를 찾으려면 빈 케이지의 화상 디지털 동영상의 각 프레임으로부터 감산되고, 결과적인 이미지는 마우스 픽셀을 식별 치화된다. 마우스 꼬리는 자동으로 제거되고, 나머지 마우스의 두 개의 가장 먼 점들이 결정된다; 이러한 코와 꼬리의 기지 가까이에 있습니다. 마우스의 움직임을 분석하여 연속 인자를 사용함으로써, 코 식별된다.
"그림 1"SRC = "/ 파일 / ftp_upload / 52508 / 52508fig1.jpg"/>
3 세션 동안 사교성 그림 1. 평가 세션 I (상) :.. 케이지에 테스트 마우스의 적응도 세션 II (가운데). 자극 마우스를 거꾸로 컵에 동봉되는 동안 테스트 마우스가 케이지에서 자유롭게 이동 세션 III (아래) : 테스트 마우스와 자극 마우스 모두 서로 자유롭게 이동과 상호 작용을 할 수있다.
장애인 사교성은 자폐증 스펙트럼 장애 (의 ASD) 1, 2를 포함하는 신경 발달 장애의 범위의 기본 증상 도메인 중 하나입니다. 그것은 심각한 관계를 개발하는 환자의 능력을 제한하고 크게 환자, 가족, 보호자 2,3 영향을 미칩니다.
더 나은 치료를 손상 사교성 기초가되는 메커니즘을 이해하고 개발하기위한 노력의 일환으로 여러 마우스 모델 1,4-9을 연구 하였다. 그러한 변형은 BALB / C 마우스, ASD5 8-12 환자에서 본 기능을 닮은, 현저하게 낮은 사교성을 나타내는 타고난 변형이다. 예를 들어, BALB / C 마우스는 사회적 접근과 스위스 웹스터 비교 균주 (10)보다 자극 마우스 (예를 들어, 사회 회피)에 의한 사회적 접근에 일반적으로 부정적인 응답의 낮은 주파수를 표시합니다.
제안 된 치료가 effectiv 있는지 여부를 테스트하려면사교성을 높이는 전자는 객관적 조치가 필요하다. 널리 받아 워크 세 구획되어있는 표준 장치에서 사교성를 분석하는 것이다 (도 1 참조).
왼쪽과 오른쪽 구획 각각은 사회적으로 두드러진 자극 마우스를 수용 반전 와이어 컵이 포함되어 있습니다. 시험 마우스 세에서 10 분 간격으로 (세션 I-III)하기위한 장치로 방출된다 세션 II 및 III 시험 마우스의 사교성의 다양한 측면을 평가하는 동안 세션 나는 시험 마우스의 운동 활성을 평가합니다.
세션 I에서, 시험 마우스 장치에 적응시킨다. 이 세션에서, 시험 마우스가 다른 구획 사이하게 전이의 수를 측정한다. 중요한 것은, 사교성 측정은 표준 3 구획에있어서 운동 활성에 의존 얻어진 감소 된 운동 활성의 SOCi 해석을 혼동 할능력 데이터.
세션 II, 시험 마우스 자유롭게 이동하고 자극 마우스 반전 컵 중 하나에 배치된다 (카운터). 자극 마우스는 4 주령 이계 수컷 ICR 마우스, 나이와 성별 일치 테스트 마우스에 있습니다. 자극 마우스는 사회 구획으로 지정 측면에서 거꾸로 컵에 동봉하고, 빈 반전 컵은 nonsocial 구획으로 지정 측면에 배치됩니다. 세션 II, 시험 마우스의 사교성은 (는) (이하 2cm 거리)는 "nonsocial"거꾸로 컵 근처에 소비 한 시간 대 "사회"거꾸로 컵 근처에 소비 한 시간을 비교하여 정량화하고, 시간을 기준으로한다 그것은이 nonsocial 실에서 소비 한 시간 대 사회 구획에 보낸다. 스위스 웹스터 마우스 비교기 사회적 구획 및 사회에 대한 유의적인 환경을 보여주지 BALB / c 마우스에 비해 사회적 반전 컵 근방 훨씬 많은 시간을 소비거꾸로 컵 또는 사회적 실 (12).
세션 III에서, 테스트 및 자극 마우스 (반전 컵이 제거) 자유롭게 상호 작용할 수 있습니다. 구획 사이의 사교성의 조치에 박힌 행동과 전환을 안정적으로 테스트 및 자극 마우스와 분석 간의 자유로운 상호 작용의 세 번째 10 분 세션에서 얻을 수있다. 이 보고서에서 테스트 마우스의 사교성은이 조치를 통해 정량화 : 그것은 사회적 접근이 자극 마우스를 향해 (코 첫번째) 전진으로 정의 자극 마우스,으로 만드는 사회적 접근 방법 1) 수를되도록 코는보다 2cm 떨어진 자극 마우스에서이다; 2) 자극 마우스에 의한 사회적 접근의 avoidances의 수. 이 켜거나 자극 마우스에서 멀리 이동하거나 일시적으로 자극 마우스 후 ( "행동을 동결") 이동 중지 된 경우 테스트 마우스를 접근 한 경우 테스트 마우스는 접근 방식을 피하는 것으로 간주됩니다. BALB /c 마우스 스위스 웹스터 비교기 10 균주에 비해 자극 마우스 자극 마우스에 의한 사회 접근법 부정적인 응답의 수가 증가 향해 이루어지는 사회적 접근법의 수의 감소를 나타낸다.
행동 영화의 평가는 전통적으로 (아마도 감소 속도) 신중 영화를보고 마우스 특정 구획 또는 반전 된 컵 (10)의 하나의 근처에 소비하는 시간을 스톱워치를 활성화함으로써, 즉 수동으로 수행되었다. 이 방법은 따라서 반복 동영상의 시청 요구이며, 아주 시간 소모적. 또한, 정밀도가 마우스 반전 컵 2cm 내에 있는지 여부를 인식하는 스톱워치 및 측정 능력 평가자의 반응 시간에 의해 제한된다. 최근 작업이 화합물에서 (D 세린과 D-시클로 세린)가 BALB / c 마우스 9,10,12에 사교성을 복원하는 효과가 입증되었다. 그것은 두 구성 요소의 MODU 것으로 알려져있다늦은 공지 된 NMDA 수용체는 사회적 행동 2,12에서 중심적인 역할을한다. 화합물의 대규모 어레이는 잘 정의 된 다양한 방식으로 NMDA 수용체 활성을 조절하는 것으로 알려진 한 ASD 처리의 침투의 잠재력이 화합물 우선 매우 바람직한 평가를위한 빠른 자동있어서의 신속한 평가를하게된다.
아래에서 설명하는 마우스 사교성의 평가를 위해 개발 한 자동 분석 절차입니다. 이는 마우스 나 마우스의 위치를 식별하는 마우스 영화의 모든 프레임의 화상 처리 방법을 사용한다. I 및 II 세션에서, 상기 코 위치를 검출하고 사교성 측정을 계산하는 데 사용한다. 세션 III에서는 자동으로 모든 접근을 감지하지만, 수동 분류 (사회적 접근, 사회적 회피, 또는 기타)가 필요합니다.
1) 실험 과정과 2) 자동 분석 : 설명의 편의를 위해 프로토콜은 두 부분으로 나누어 져있다. 모든 동물은 실험 동물 (15)의 관리 및 이용에 대한 안내에 따라 처리하고, 모든 절차는 기관 동물 관리 및 사용위원회에 의해 승인되었습니다.
1. 실험 절차
2. 자동 분석
주 : (2)의 명령은 그래픽 사용자 인터페이스를 통해 발행되는 콘 (도 2 참조)우리의 소프트웨어를 trols. 여기에서 우리는 우리의 소프트웨어가 있습니다 단계별 처리를 설명; 또한이 소프트웨어는 사용자 입력없이 배치 모드에서 분석을 수행 할 수있다.

그림 3은 빈 케이지와 행동 영화의 컬러 프레임을 보여줍니다. 마우스는 아직 케이지에 도입되지 않았습니다. (사회적 nonsocial) 컵 및 구획 경계의 위치는 중첩된다. 도 4에 도시 된 참조 프레임으로 사용 된 비어있는 케이지의 색 프레임은 8 비트 그레이 스케일로 변환된다. 기준 프레임은 캡쳐 된 동영상의 모든 다른 프레임으로부터 감산된다.
그림 5는 중첩 구획 경계와 컵의 위치를 다시, 세션 I 동안 영화에서 프레임 중 하나를 보여줍니다. 참조 프레임을 차분 프레임이라고 샘플 프레임 결과로부터 감산되어,도 6에 도시된다.
도 7은 상기 차분 프레임의 진화 버전이다. (섹션 2.1.3.3 참조). 그림은 또한 코 (빨간색 원)의 위치와 TA의 기본을 보여줍니다김정일 (회색 원)) 섹션 2.2.4에서 결정.
노즈 위치 동영상의 각 프레임에 대해 확립되면, 마우스의 궤적은도 8. 임의의 방식으로 분석 약 1,000 프레임 커버 영화의 부분을 마우스 코의 위치 (백색 원)를 표시 할 수있다 (~ 30 초).
도 9는 케이지 구획 간의 천이의 수는 운동 활성의 척도로서 사용된다 세션 I.위한 사교성 분석의 결과 (도시 된 예에서, 10 분, 59 전환 정상적인 운동 활성을 나타낸다)을 나타낸다. 케이지의 다른 부분에 소요 된 시간은 세션 II의 사회적 부 / 컵에 대한 선호도를 판단하는 기준 역할을한다.
도 10은 세션 II위한 사교성 분석의 결과를 나타낸다. 특히 관심의 표시 엑사으로합니다 (nonsocial 대 사회 컵 근처에 소요 된 시간이다mple 230.8 대 72.3 초)과 중립 및 nonsocial 구획 (314.7 대 109.4 대 185.5 초) 대 사회. 사회 컵과 구획으로 맑은 바이어스 제어 마우스에 대한 전형적인 및 세션 I (그림 9)의 데이터와 비교하여 명확하게 바이어스 정말 자극 마우스의 존재의 결과임을 보여줍니다.
도 11은 세션 III위한 사교성 분석의 결과를 나타낸다. 사회적 접근 (35 분 10)뿐만 아니라 자극 마우스 (9/10)에 의한 사회적 접근에 압도적으로 긍정적 인 반응의 높은 수는 정상 사교성와 마우스의 전형이다.

그림 2. 그래픽 사용자 인터페이스입니다. 하시기 바랍니다 다이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 핥아.

도 3 빈 케이지. 이것은 그레이 스케일 변환 후의 기준 프레임으로서 사용된다. 빨간색 원은 반대 측의 사회 컵과 nonsocial 컵의 위치를 보여줍니다. 수직 흰색 선은 다른 구획에 케이지를 분할하고, 사각형은 케이지의 내부 경계를 보여줍니다.

그림 4. 그림 3의 그레이 스케일 버전.

5. 원래 프레임 그림. 그레이 스케일 형식의 동영상 프레임. 사회 실린더는 흰색 원으로 표시되며,사회 실린더보다 2cm 더 큰 반경 추가 회색 원은 시험 마우스가 사회 실린더에 "가까이"로 간주되는 영역을 구별하기 위해 그려집니다. 반대 구석에서, nonsocial 실린더는 다시 회색 원과 큰 반경 가까운 nonsocial 실린더로 간주되는 영역의 경계에 그려지는 2cm에 추가 원으로 표시됩니다. 수직 흰색 선은 다른 구획에 케이지를 분할하고, 사각형은 케이지의 내부 경계를 보여줍니다.

6. 차이 이미지를 그림. 이미지는 샘플 프레임과 기준 프레임을 뺀.

그림 7. 진화 된 이미지입니다. 디의 픽셀(예 30) 특정 임계치를 초과 fference 화상 마우스 픽셀을 고려 화이트 나타낸다. 빨간색 원은 코를 나타내고, 흰색 원은 꼬리입니다.

그림 8. 마우스 궤적. 작은 흰색 원이 프레임이 캡처 된 I 때까지 세션의 시작부터 코의 위치를 보여줍니다.

세션 I.에 대한 사교성 분석 그림 9. 결과는 각각의 케이지 구획 위의 숫자는 시간을 나타냅니다 (이 경우 그들에 소요 마우스 왼쪽 칸에서 254.3 초, 중성 실에서 155.2 초, 오른쪽에서 237.0 초 구획). 동그라미 안의 숫자는 시간 마우스가 입술에 가까운 소비 나타낸다pective 컵 ( "가까운"멀리보다 2cm를 의미, 또는 두 개의 원의 외부 내부) : 가까운 왼쪽 컵에 140.0 초, 닫을 오른쪽 컵 105.6 초. 하단 중앙의 숫자는 마우스가 케이지의 다른 구획 (예 59 회) 사이에 전환 빈도를 나타냅니다.

세션 II에 대한 사교성 분석 그림 10. 결과. 세션 II에, 하나의 자극 마우스 구획 위 원은 그림 9 / 세션 I. 주와 같이 케이지의 다른 부분에 소요 된 시간을 나타냅니다 내부의 번호가 있음 반전 컵 (이 경우 왼쪽 하나)의, 그래서이 잔은 "사회"컵이된다. 처음가 주어진 세션에 대해 I의 대책뿐만 아니라, 시간 시험 마우스 사회적 실린더 (2cm 이내) 가까이에 걸리는중앙의 오른쪽 아래에. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

세션 III에 대한 사교성 분석 그림 11. 결과. "접근"다음의 숫자는 테스트 마우스에 의해 만들어진 사회적 접근, 순위 "후 숫자의 수를 말한다. RESP. "와"NEG. RESP. "상태 자극 마우스에 의한 사회적 접근에 테스트 마우스로 긍정적이고 부정적인 응답 수.
저자는 공개 아무것도 없어.
이 프로토콜은 마우스 사교성을 정량하는 방법을 설명한다. 그들이 이동하고 특별한 케이지에서 상호 작용하는 마우스는 녹화됩니다. 동영상 처리가 뛰어난 정확성과 신뢰성 사교성의 자동화 된 정량화 수 있습니다.
이 연구는 버지니아의 연방 건강 연구위원회에서 교부금에 의해 지원되었다.
| 플렉시 글라스 케이지 | Norva Plastics, Norfolk, VA | 맞춤 제작 | 원고에 설명 된 치수 및 레이아웃, 필요에 따라 조정할 수 있습니다 . 이미지 처리를 용이하게하기 위해 비 반사 플렉시 글라스를 사용하십시오 |
| 와이어 컵 | 주방 플러스 | 315 | 자극 마우스를 수용하기 위해 하나, 빈 |
| 비디오 카메라 | 소니 | HDR-PJ790 | 다음과 같은 모든 카메라로 교체 가능 비교 가능한 사양 |
| OpenCV(이미지 처리 라이브러리) | Willow Garage | N/A | 모든 최신 이미지 처리 라이브러리 사용할 수 있습니다. |