이 원고는 쌍떡잎 잡초에서 절제된 잎으로 제초제 대사율을 효과적으로 정량화하여 변동성을 줄이고 전체 식물 분석에서 일반적으로 관찰되는 제초제 흡수 또는 전좌의 가능한 교란 효과를 제거하는 방법을 설명합니다.
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이 원고는 쌍떡잎 잡초에서 절제된 잎으로 제초제 대사율을 효과적으로 정량화하여 변동성을 줄이고 전체 식물 분석에서 일반적으로 관찰되는 제초제 흡수 또는 전좌의 가능한 교란 효과를 제거하는 방법을 설명합니다.
절개 쌍떡잎 잡초인 워터헴프(Amaranthus tuberculatus)에서 제초제 대사 속도를 분리하고 정확하게 결정하기 위해 제초제 흡수를 정상화하고 제초제 내성(R) 및 제초제에 민감한(S) 워터헴프 개체군에 기여하는 요인인 전좌를 제거하기 위해 식물 복제 전략과 결합된 절제 잎 분석을 개발했습니다. 식물의 유기 살충제에 대한 생체 역학 분석에는 일반적으로 흡수, 전좌(표적 부위로의 전달), 대사 운명 및 표적 부위와의 상호 작용 측정이 포함됩니다. 제초제 대사는 제초제 저항성 잡초 및 제초제 내성 작물에서 측정해야 하는 중요한 파라미터이며, 일반적으로 방사성 표지된 제초제를 사용한 전체 식물 테스트로 수행됩니다. 그러나 전체 식물 방법에서 파생된 생체 역학 매개변수를 해석하는 데 있어 한 가지 어려움은 극성 대사 산물은 일반적으로 제초제 해독 반응 후 식물 내에서 움직이지 않기 때문에 전좌가 제초제 대사 속도의 영향을 받는 경우가 많다는 것입니다. 이 원고에 기술된 프로토콜의 장점으로는 R 및 S 개체군에서 제초제 분해율의 재현 가능하고 정확하며 신속한 측정, 방사성 표지된 제초제 소비량의 상당한 감소, 추가 취급 및 폐기가 필요한 방사성 표지된 식물 물질의 대폭적인 감소, 온실 대신 실험실 또는 성장실에서 방사성 표지된 제초제 실험을 수행할 수 있는 능력 등이 있습니다. 제초제 내성이 전 세계적으로 쌍떡잎 잡초 개체군에서 계속 발전하고 확산됨에 따라, 본 명세서에 개발 및 설명된 절제 잎 분석 방법은 제초제 대사 및 해독 속도 향상으로 인해 비표적 부위 기반 저항성을 조사하는 데 매우 유용한 기술을 제공할 것입니다.
잡초의 제초제 저항은 식품 및 섬유 1, 2의 글로벌 생산에 심각한 위협을 선물한다. 현재 백 이상 잡초 종에 강한 집단과 생물 형의 수천 전 세계적으로 문서화하고 3 연구되고있다. 식물에 제초제 저항성을 부여하는 주요 메커니즘은 제초제 - 단백질 결합 반응 속도 또는 대상 사이트 유전자 2의 증폭에 영향을 미치는 유전 적 변이를 포함하는 제초제 대상 사이트 유전자와 단백질의 변경입니다. 시토크롬 P450 모노 옥 시게나 제 (P450) 또는 글루타치온 S의 -transferase (GST) 효소의 높은 활동을 통해 대사 해독 대상 현장 기반 메커니즘 2에서 여러 가지 방법으로 구분된다 잡초의 제초제 저항성을 부여하는 또 다른 메커니즘입니다. 대사 기반의 저항 (피트니스 처벌 일명) 공장 피트니스 비용은 제초제 저항 메커니즘 정보 발생할 수 있는지 여부에 대한 상당한 파급 효과를 가지고m뿐만 아니라 잡초 개체군 1,2,4에서 교차 또는 다중 제초제 내성을 부여하는 단일 해독 메커니즘 전위에. 일반적으로 식물에 제초제 대사는 세 가지 단계 5로 나눌 수 있습니다. 증가 극성 부분 제초제 해독 5,6로 이어지는, 또는 O- 탈 알킬화 반응 - 단계 I는 방향족 고리 또는 알킬 그룹의 P450 매개 수산화, 또는 N으로 같은 제초제 변환 또는 활성화를 포함한다. 새로 나는 GSTs 감소 글루타티온에 결합에 대한 링크 사이트를 제공 할 수 있습니다 또는 단계 II 5,7에서 UDP에 의존하는 글리코에 의해 포도당 단계에 관능기를 도입했다. 예를 들어, 옥수수의 primisulfuron 메틸의 주요한 초기 대사 산물은 또한 하이드 록시 primisulfuron 글루코 내지 (단계 II)를 대사 후 장기간 저장 또는 상기 대사위한 액포로 이송 될 수 히드 록시 primisulfuron 메틸 8 인 찬성cessing 5,6 (단계 III).
Waterhemp (Amaranthus의 tuberculatus)는 미국의 옥수수 생산 (ZEA이 메이), 콩 (글리신 최대), 면화을 (고십 피움 히르 수툼) 방해하기 어려운 제어, 쌍자엽 연간 잡초 종입니다. waterhemp의 유전 적 다양성의 높은 수준은 자웅 이주의 생물학 및 장거리 바람 수분에 의해 촉진되고, 하나의 여성 waterhemp 공장 만 씨앗 9 개까지 생성 할 수 있습니다. 이 씨는 자연스럽게 효과적인 분산 메커니즘 waterhemp을 부여하는, 작고 쉽게 확산됩니다. Waterhemp는 성장시기 (9)에 걸쳐 연속 발아를 표시하고, 그 씨앗은 휴면 몇 년 후 발아 할 수 있습니다. Waterhemp은 경작 할 작물 재배 시스템 (10)에있는 대부분의 잎이 넓은 잡초보다 더 높은 성장률을 가지고 C 4 식물입니다. 또한, 다수의 집단 waterhemp 여러 FAM에 내성제초제 3 ilies.
일리노이 waterhemp (MCR)의 이용의 인구는 4- 히드 록시 phenylpyruvate 시게나 제 (HPPD) 예컨대 메소 트리 온 등 -inhibiting 제초제 (11)뿐만 아니라, 아트라진 및 아세토 락 테이트 신타 제 (ALS)에, 제초제 -inhibiting primisulfuron 메틸을 포함하는 내성 비 대상 현장 기반 메커니즘 (12, 13)로 인해. 와 아트라진에 강한하지만 메소 트리 온에 민감하고, primisulfuron 메틸을 민감 WCS (14) 지정된 waterhemp 인구 (때문에 ALS 유전자의 돌연변이에) primisulfuron 메틸 내성 ACR (14) 지정 waterhemp의 다른 인구, 메소 트리 온 및 아트라진가 우리의 이전 연구 12, 현재 실험 MCR와 비교 하였다 (표 1에 요약 하였다). 초기 연구는 MCR에, HPPD 유전자 서열 또는 발현 수준의 변화, 또는 감소 메소 트리 온의 흡수를 감지하지 않았다인구 때 메소 트리 온 민감한 인구 (12)와 비교. 그러나, 전체 식물 대사 연구는 11, 12 메소 이전 표현형의 반응과 상관 ACR과 WCS에 비해 MCR에서 부모 메소 트리 온 제초제의 상당히 낮은 수준을 보여 주었다.
| Waterhemp 인구 | 약어 | 메소에 표현형 | 메소 트리 온 저항 메커니즘 | Primisulfuron에 표현형 | Primisulfuron 저항 메커니즘 |
| 맥린 카운티 저항하는 | MCR | 저항하는 | 대사 * | 저항하는 | 대사 |
| 아담스 카운티 저항하는 | ACR | Sensit필자 | - | 저항하는 | ALS (14)에 대상 사이트 돌연변이 |
| 웨인 카운티에 민감한 | WCS | 민감한 | - | 민감한 | - |
* 향상된 대사 이외의 비 표적 사이트 저항 메커니즘은 또한 MCR 인구 (12) 메소 트리 온 저항을 부여 할 수있다.
표 1 : 본 연구에 사용 일리노이 waterhemp 개체군의 설명.
그대로 waterhemp 모종의 제초제 대사의 비율을 결정하는 것에 더하여, 다른 실험적 방법은 개발되었으며 절제 waterhemp 리프 세이 (12)뿐만 아니라 다양한 P450 억제제 (예 tetcyclacis 및 말라 티온)를 사용하여 대사를 조사하기 이전 연구에서 사용. 이 방법은 previ에서 waterhemp을 위해 특별히 적응했다적출 된 잎의 분석이 아직 쌍자엽 식물에 제초제 대사 연구를 수행보고되지 않은 때문에 절제 옥수수에 primisulfuron 메틸 대사의 OU를 조사, 15 나뭇잎. organophophosate 살충제 말라 티온 자주 생체에 사용 된 체외 제초제 대사 연구에서 P450의 참여 (16)를 나타냅니다. 예를 들어, 관용과 옥수수에 메소 트리 온의 빠른 대사는 말라 티온은 메소 트리 온 (17) 옥수수 감도를 증가 할 때 확인되었다 P450 - 촉매 링 수산화,에 기인한다. 마찬가지로, 말라 티온은 절제 옥수수에서 루게릭 병 억제제 primisulfuron 메틸 15 잎의 신진 대사를 억제 하였다. 식물 조직, 출현 후 제초제의 대사를 평가할 때 적출 리프 기술의 주요 이점은, 생성 된 데이터는 전체 플랜트 전위 패턴 무관하다는 것이다, 중요한 요인을 고려한다. 따라서,이 방법은 정량 할 수 있으며질적 대사는 단일 처리 리프 (12)에 초점을 분석한다.
식물 클로닝 전략은 적출 리프 프로토콜과 함께, 이전에 대사 과정 (12)을 실시 waterhemp에 이용 하였다. 때문에 waterhemp (별도의 남성과 여성의 식물)과 자웅 이주 Amaranthus 종 (9) 내에서 유전 적 다양성의 큰 정도의 이종간 교배 특성으로,이 프로토콜은 유 전적으로 동일한 waterhemp 모종 시간 코스 실험에서 분석 하였다 것을 보장. 이 문서는 쌍자엽 잡초 (waterhemp)에서 제초제 신진 대사의 속도를 측정하기위한 절제 잎 방법의 유틸리티를 보여줍니다. 부모 제초제의 양 (흡수 된 제초제의 50 %가 저하하는 시간을 추정하기 위해 단순 일차 곡선 적합 하였다 비선형 최소 제곱 회귀 분석에 의해 각각의 시간 점 (도 1)에서 측정 한 한 나머지 DT 50). 대리인역상 고속 액체 크로마토 그래피 (RP-HPLC)에서 크로마토 내성 ALS-및 시간 과정 연구 중에 부모 제초제 및 극성 대사 산물 (들)의 병용 형성의 소실을 나타내는 과민 waterhemp 인구 (그림 표시되는 2). 우리 문서의 포커스가 균일 링 - 표지 (URL- 14 C) 제초제를 사용하여 설명하고 쌍자엽 식물 제초제 대사의 정확하고 재현 가능한 요금을 결정하기위한 식물 클로닝 방법과 조합 적출 리프 분석의 유용성을 입증하는 것이다 자신의 전체 식물의 반응에 차이가 세 waterhemp 인구는 HPPD-하고 루게릭 병 억제 제초제 (표 1).
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1. 식물 재료, 성장 조건, 그리고 식물 복제
참고 : 세 waterhemp 집단이 연구 조사 하였다 : MCR (아담스 카운티, 일리노이에서), ACR, 및 WCS (맥린 카운티, 일리노이에서) (표 1) (웨인 카운티, 일리노이에서).
2. 절제 Waterhem과 대사 연구를 실시P 잎
절제된 잎에서 제초제 대사 3. HPLC 분석
주 : 다음 RP-HPLC 조건 (12)를 사용하여 부모 제초제 제초제 대사로 총 추출 방사능를 해결합니다.
4. 통계 절차

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메소 트리 온 신진 대사의 속도에 큰 차이는 WCS 또는 ACR과 MCR (그림 1) 중 하나를 사이에 검출되었다. 각각의 시점에서, MCR은 더 빠른 속도로 이전의 전체 공장의 표현형 응답 (11)과 상관이 메소 트리 온 민감한 인구, WCS 및 ACR보다 메소 트리 온을 물질 대사로 변화했다. 각 집단에서 단일 부모의 공장에서 충분히 식물을 복제하여, 제초제 대사 시간 코스 분석에 의한마다 코스 (12) 내에서 유전 적 다양성의 부족으로 균일하고 재현성이다. 예를 들어, 클론 5 호선 12 메소 대사의 시간 과정은 그림 1에 표시됩니다. 여섯 가지 클론 라인의 총 여섯 개별 부모 식물에서 파생 된 각 인구 (표 1)에서 분석 하였다 전체 평균 (DT)를 결정하기 위해 MCR에 그 메소 트리 온 신진 대사를 표시 (50) 값이 훨씬 빠르게이었다 (
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여기에 설명 된 절제 잎 방법은 옥수수가 15 나뭇잎에 primisulfuron 대사 연구에서 이전에 사용되었지만, 우리의 결과는이 프로토콜은 또한 쌍자엽 잡초 종 12 제초제 신진 대사를 측정하기위한 효과적인 정확하고 재현성이 있음을 입증. 전체 식물 연구에 비해 적출 잎 기술의 가장 큰 장점은 적출 잎은 전체 식물 전위의 출현 후 패턴, 전신 제초제 또는 식물 또는 인구 중 제초제 흡수의 차이 독립적이라는 것이다. 적출 리프 세이가 온실 조건 하에서 성장 된 전체 식물에 비해 공부 튜브에 넣고 단일 리프로, 성장 챔버에서 수행되기 때문에, 또한, 환경 적 변동성이 감소된다. 식물 복제 전략도 내 유전 분산의 큰 정도를 최소화 할 MCR (12)에 메소 트리 온 저항 메커니즘을 연구하기위한 우리의 방법에 포함트윈 Amaranthus 인구 9. 잡초 Amaranthus 집단 내 유전 적 다양성은 출현 후 제초제
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저자는 공개할 것이 없습니다.
식물 성장 및 추출에 도움을 주신 Wendy Zhang, Austin Tom, Jacquie Janney, Erin Lemley, Brittany Janney, 크로마토그래피 분석을 지원해 주신 Dr. Anatoli Lygin, 그리고 자금을 지원해 주신 Syngenta Crop Protection에 감사드립니다.
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| 이름 | 회사 | 카탈로그 번호 | 댓글 |
|---|---|---|---|
| Agar | Sigma-Aldrich | A1296 | 사전 발아 씨앗 |
| 포팅 미디엄 | Sun Gro 원예 | 49040233 | 식물 성장을 위한 |
| Nutricote | Agrivert | 총 혼합물 13-13-13 T100 | 느린 방출 비료 |
| 성장 챔버 E15 | Controlled Environments Limited | 20207 | 식물 배양 |
| Tris 기반 | Fisher Scientific | BP152-500 | 절제 잎용 |
| 버퍼 HCl (집중) | Fisher Scientific | A144500 | |
| Murashige 및 Skoog (MS) 염의 pH 조정 | Sigma-Aldrich | M0404 | 절제 잎의 배양 |
| 메탄올 | 피셔 사이언티픽 | A452-4 | 잎 배양 후 세척 |
| 아세톤 | Sigma-Aldrich | 179124 | 식물 추출물 |
| 아세토니트릴 (HPLC 등급) | Macron Fine Chemicals | MKH07610 | HPLC 이동상 |
| 포름산 | Mallinckrodt Analytical | MK259205 | Acidify mobile phase, pH |
| 마이크로 원심분리기 | Eppendorf | 5417R | 1.5 또는 2.0 ml 튜브 |
| 원심분리기(온도 조절) | Eppendorf | 5810R | 15 또는 50 ml 튜브 |
| , 폴리프로필렌 원심분리기 튜브 | Corning Inc. | 430790 | 15 ml, 멸균 |
| 회전 증발기 | BÜ CHI | R200 | 농축 식물 샘플 |
| 액체 섬광 분광법 (LSS) | Packard Instruments | 104470 | 14C |
| 고성능 액체 크로마토그래 | Perkin Elmer | N2910401 | 제초제 대사 산물 |
| 분해 흐름 섬광 분석기 | 14C | ||
| Hypersil Gold C18 컬럼 | 써모사이언티픽 | 03-050-522 | 역상 |
| Ultima-Flo M 칵테일 | Perkin Elmer | 6013579 | Flow-scintillation 분석기 |
| Scintillation 칵테일 (ScintiVerse BD) | Fisher Scientific | SX18 | for LSS; 생분해성 |
| 실험실 균질화기 | Kinematica | CH-6010 | 잎 시료 균질화 |
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