(1) 세포 내 세균 병원체를 표적으로 하는 진핵 세포 침투 항균제를 동시에 식별하고 (2) 진핵 세포 독성을 평가하기 위해 고처리량 실시간 분석이 개발되었습니다. 그 후 동일한 기술의 변형이 디지털 디스펜싱 기술과 결합되어 용이한 고해상도, 용량 반응, 2차원 및 3차원 시너지 연구를 가능하게 했습니다.
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(1) 세포 내 세균 병원체를 표적으로 하는 진핵 세포 침투 항균제를 동시에 식별하고 (2) 진핵 세포 독성을 평가하기 위해 고처리량 실시간 분석이 개발되었습니다. 그 후 동일한 기술의 변형이 디지털 디스펜싱 기술과 결합되어 용이한 고해상도, 용량 반응, 2차원 및 3차원 시너지 연구를 가능하게 했습니다.
세포 내 항균 활성 및 진핵 세포의 세포 독성의 전통적인 조치는 엔드 포인트 분석에 의존하고 있습니다. 이러한 엔드 포인트 분석은 세포 용해, 집락 형성 단위 결정, 또는 시약을 추가로 판독을하기 전에 몇 가지 추가 실험 단계를 필요로한다. 예를 들어, 높은 처리량 스크리닝 분석법 중에 수천을 수행 할 때, 이러한 유형의 분석법에 필요한 하류 노력은 상당하다. 따라서, 높은 처리량 항균 검색을 용이하게하기 위해, 우리는 동시에 세포 내 세균 증식의 억제제를 식별하고, 진핵 세포의 세포 독성을 평가하기위한 실시간 분석을 개발 하였다. 특히, 실시간으로 세포 내 세균의 성장 검출은 세균 룩스 오페론 (1 차 세대 분석) 또는 형광 단백질 기자 (2 차 생성, 직교 분석) 중 하나와 세균 검사 균주를 표시하여 사용 하였다. 비 독성, 세포 막 impermeant 핵산 결합 염료또한 대 식세포의 초기 감염시 추가되었습니다. 이 염료는 가능한 세포에서 제외됩니다. 그러나, 비 - 실행 가능한 숙주 세포 엔트리 핵 DNA의 형광 표식 (디옥시리보 핵산)를 허용 막 완전성을 잃는다. 특히, DNA는 숙주 세포 사멸의 용액 기반의 판독을 제공하고, 형광 양자 수율이 크게 증가와 관련된 바인딩. 우리는 마이크로 플레이트 포맷에서 높은 처리량 스크린을 수행하고, 현미경으로 세포의 성장과 세포 독성을 평가하기 위해 결합 분석을 사용 하였다. 특히 항균제 함께 적용 둘 이상의 항균제의 결합 된 효과는 개별적으로 적용될 때보다 큰 시너지 효과를 입증 할 수있다. 다른 농도에서 항생제의 조합 순열을 평가해야하기 때문에 세포 내 병원균에 대한 시험 관내 시너지 효과를 테스트하는 것은 일반적으로 엄청난 작업입니다. 그러나, 우리는 우리의 실시간 분석이 자동화, 디지털 분배 기술 쪽과 함께 발견손쉬운 시너지 테스트 ermitted. 이러한 접근 방식을 사용하여, 우리는 체계적으로 세포 내 병원균, 레지오넬라 뉴모 필라에 혼자 항생제의 많은 수의 행동과 조합을 조사 할 수 있었다.
세포 내 구획에 일시적으로 증가 또는 상주 병원균은 치료 근절하기 어렵다. 의무 또는 상대적으로 이러한 레지오넬라 뉴모 필라, Coxiella burnetii의, 브루셀라 종으로 세포 내 병원균을 의무. , Francisella의 야토 및 진균 종. 종종 달에 몇 년의 범위 일 수있다 치료를위한 항생제 치료의 과정을 연장 필요합니다. 또한, 세포 외 병원균은 일시적으로 세포 내 틈새 시장을 점유하고이 방법으로 항생제 치료의 일반적인 과정에 의해 허가를 탈출하고 나중에 악성 감염의 새로운 라운드를 시작합니다 나타날 수 있습니다. 황색 포도상 구균 (1) 및 uropathogenic 장내 세균 2,3 감염이 점점 인식 예입니다. 따라서, 근본적으로 신약 개발 목표는 세포 내 구획 침투 신규 항생제를 확인하는 것이다. 최적의 치료는 빨리 근절하기세포 생물 및 하위 억제 항균 노출을 통해 저항의 개발을 방지 특히 바람직하다.
이를 위해 모델 병원체, 레지오넬라 뉴모의 세포 성장을 표적 세포 - 침투제 항균제를 식별하기 위해 고 처리량 스크리닝 기술을 개발했다. 4
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1. 실시간 세포 내 성장과 진핵 세포 세포 독성 분석
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마이크로 세포 성장 분석
도 1은 분석 단계도이다. 도시 자동화 단계가 수동으로 수행 될 수있다. 그러나, 처리량이 큰 액체 핸들링 시스템을 이용하여 용이하게된다.
도 2는 384- 웰 마이크로 플레이트, 듀얼 판독 실시간 세포 성장 및 (Lp02)은 중 어느 하나에 lux 오페론 (도 2A, 2B) 또는 mNeptune2 형광 단백질로 표시된 레지오넬라 균주 (하여 진핵 세포 독성 분석에서 대표적인 결과를 나타낸다 그림 2C, 2D) 기자. 양성 및 음성.......
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우리는 세포 내 박테리아의 성장 및 숙주 세포 독성의 동시 검출을위한 실시간 분석을 설명한다. 프로토콜에서 몇 가지 중요한 단계가 있습니다. 첫째, 강력한 분석 성능, 세균 및 세포 독성 판독 사이에 충분한 스펙트럼 분리가 있어야합니다. 이러한 분리는 루시 페라 제 오페론 기자와 형광 DNA 결합 염료의 조합에 대한 고유이다. 그러나, 우리의 경험 (표 1-3,도 2), 이중 사용을 기반으로 형광 판독이 겹치지 않는 형광 신호 (예를 들어, 원적외선 형광성 단백질 리포터 녹색 핵산 염색 사용) 강력한 얻기 필요 용액 기반 데이터. 또한, 이전의 경험에서, 잠재적으로 가능한 판독기 광학 또는 솔루션의 형광 특성과 관련, 녹색 또는 주황색 발광 만 DNA의 얼룩> 0.5, stron을 나타내는 척도보다 더 큰 즉, 사용할 수있는 세포 독성 데이터, Z '를 준g 분석 성능을 제공합니다. .......
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저자는 공개할 것이 없습니다.
이 논문에보고 된 연구 내용은 전적으로 저자의 책임이며 JEK하는 보너스 번호 R01AI099122에서 알레르기 및 국립 보건원 (National Institutes of Health)의 감염증의 국립 연구소에 의해 지원되었다 반드시 국립 연구소의의 공식 견해를 대변하지 않습니다 건강. 우리는 ICCB - 롱 우드의 검사 시설 및 / 또는 국가 검사 실험실을위한에서 제니퍼 스미스, 데이비드 Wrobel, 스와 치앙마이, 더그 홍수, 숀 존스턴, 제니퍼 Nale, 스튜어트 Rudnicki, 폴 연의, 리처드 시우, 레이첼 소장에게 감사의 말씀을 우수의 뉴 잉글랜드 지역 센터 디펜스의 개발과 높은 처리량 심사 분석의 성능을 자신의 도움 (U54AI057159에서 지원) 감염증을 신흥. 우리는 또한 원고에 도움이 의견 케네스 P. 스미스에게 감사의 말씀을 전합니다.
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| 이름 | 회사 | 카탈로그 번호 | 댓글 |
|---|---|---|---|
| J774A.1 세포 | 미국식 배양 컬렉션 | TIB-67 | 숙주 세포 |
| ACES | 시그마-알드리치 | A9758 | 완충 된 숯 효모 추출물 한천 및 완충 효모 추출물 매체를 만들기 위해 |
| 효모 추출물, 한외 여과 | Becton-Dickinson/Difco | 210929 | 완충 숯 효모 추출물 한천 및 완충 효모 추출물 배지를 만드는 데 사용됩니다. 낮은 등급은 성장 장애를 일으키거나 성장 억제제에 대한 레지오넬라균의 민감도를 변경할 수 있습니다 |
| 알파-케토글루타르산, 모노칼륨 염 | 시그마-알드리치 | K2000 | 완충 숯 효모 추출물 한천 및 완충 효모 추출물 배지 제작 |
| 피루브산 나트륨 | Sigma-Aldrich | P5280 | 완충 숯 효모 추출물 한천 및 완충 효모 추출물 매체 제조용 |
| 산칼륨, 이염기 | Thermo Fisher Scientific | P288-500 | 완충 숯 효모 추출물 한천 및 완충 효모 추출물 매체 L |
| -시스테인 | Sigma-Aldrich | C-7755 | 완충 숯 효모 추출물 한천 및 완충 효모 추출물 매체 제작 |
| 암모늄 철 (III) 구연산 | 염 Sigma-Aldrich | F5879 | 완충 된 숯 효모 추출물 한천 및 완충 효모 추출물 매체를 만드는 데 사용됩니다. 피로 인산 철을 대신 사용할 수 있지만 정확하게 무게를 측정하기가 더 어렵습니다 |
| 수산화 칼륨 용액, 농축 | Thermo Fisher Scientific | SP236-500 | 완충 숯 효모 추출물 한천 및 완충 효모 추출물 배지를 만드는 데 사용됩니다 |
| Deonized water | N / A | N / A | 완충 된 숯 효모 추출물 한천 및 완충 효모 추출물 매체를 만들기 위해 |
| 티미딘 (조직 배양 등급) | Sigma-Aldrich | T1895 | RPMI 1640 및 완충 효모 추출물 한천/중간 &mdash를 모두 보충하기 위해; 후자에 대해 낮은 등급의 티미딘을 사용할 수 있지만, RPMI 1640 RPMI 1640에서 세포 성장 장애 및/또는 세포 사멸을 유발할 수 있음 |
| , 표준 제형 | 10-040-CV | 를 통한 Corning | 도금 전에 J774A.1 세포를 성장시키기 위해; 2 mM L-글루타민 포함 |
| RPMI 1640 결핍 페놀 레드 | Corning via Thermo Fisher Scientific | 17-105-CV | 384웰 디쉬에서 J774A.1 세포 도금용(도금 전 성장에 적합하지 않음); 또한 L-글루타민 &mdash 부족; 사용 전 2mM까지 |
| 보충 L-글루타민, 0.85% NaCl (조직 배양 등급)에 200mM | Thermo Fisher Scientific | SH30034.02 | 핍된 RPMI 1640 보충용, 2 mM 최종 농도 |
| 철분 보충 송아지 혈청 | Gemini Bioproducts | 100-510 | RPMI 1640 보충, 9.1% 최종 농도 |
| Trypan Blue 용액 | Sigma-Aldrich | T8154 | 세포 밀도 계수 중 J774A.1 세포 사멸 측정을 위한 염색 |
| SYTOX Green, DMSO | Thermo Fisher Scientific | S7020 | 의 5 mM 용액형광 판독 또는 상피 형광 현미경 검사에 의한 J774A.1 세포 사멸 측정을 위한 염색용(주황색-적색 또는 근적색 형광 박테리아와 함께). 125nM 최종 농도에서 사용합니다. |
| 세포 배양 인큐베이터 | Thermo Fisher Scientific | 13-255-26 | J774A.1 세포 배양용(감염 전후 모두); 박테리아 배양에도 사용할 수 있으며, 표준 분위기 인큐베이터를 대신 사용할 수도 있습니다. |
| 오비탈 쉐이커 | BellCo Glass | 7744-01010 | 감염 전 J774A.1 세포의 쉐이킹 인큐베이션용; 세포 배양 인큐베이터 내부에 맞습니다; 쉐이커 베이스 7744-01000 및 트레이 7740-01010 포함 (이것들은 별도로도 구매 가능) |
| 쉐이커 플라스크 (250 ml) | ChemGlass Life Sciences | CLS-2038-04 | 감염 전 J774A.1 세포의 쉐이킹 인큐베이 |
| 션용 플라스크용 쉐이커 클램프 (250 ml) | BellCo Glass | 7744-16250 | 감염 전 J774A.1 세포의 진탕 배양용 |
| 셰이커 플라스크 (1,000 ml) | ChemGlass Life Sciences | CLS-2038-07 | 감염 전 J774A.1 세포의 진탕 배양용 |
| 플라스크 (1,000 ml)용 셰이커 클램프 | BellCo Glass | 7744-16100 | 감염 전 J774A.1 세포의 진탕 배양 |
| 플라스크 용 스폰지 폼 캡 (250 ml-1,000 ml) | ChemGlass Life Sciences | CLS-1490-038 | 감염 전 J774A.1 세포의 진탕 배양용; 표준 금속 캡에 비해 오염 위험 감소 |
| MultiDrop Combi 프로그래밍 가능한 다채널 연동 펌프 | Thermo Fisher Scientific | 5840300 | 형광단을 함유한 J774A.1 세포, 매체 및 박테리아 현탁액을 다수의 384웰 접시에 분배하기 위해 |
| Combi standard bore manifold | Thermo Fisher Scientific | 24072670 | 기본 프리디스펜스 부피 20 μ l은 침전 &mdash를 보상하기에 충분하지 않습니다. 80 μ으로 증가; l |
| 백색 384의 조직 문화를 위해 대우되는 좋은 접시 | Corning | 3570 | 독서 발광과 형광을 위해; Greiner 카탈로그 # 781080도 성공적으로 테스트 |
| DMSO (조직 배양 등급, 밀봉 앰플) | Sigma-Aldrich | D2650 | 양성 대조군 및 테스트 화합물 |
| Azithromycin | Sigma-Aldrich | PHR1088 | 항생제 양성 대조군 |
| 사포닌 (Quillaja 나무 껍질에서) | Sigma-Aldrich | S-4521 | Cytoxicity 양성 대조군 |
| 다중 채널 피펫터 | Thermo Fisher Scientific | Finnpipette | 고정된 양의 양성 대조군 화합물 이송용; 피펫터는 반복적인 고정 부피 분주를 가능하게 하는 멈춤쇠가 있는 디지털 분주가 있어야 합니다. |
| Epson 핀 이송 로봇 | Epson/ICCB-L | (맞춤형 장비) | |
| 에서 고정된 양의 테스트 화합물 이송11 피코리터에서 10 &마이크로에 이르는 다양한 양의 테스트 화합물을 전송하기 위해; | |||
| l D300 디지털 디스펜싱 시스템 | Hewlett-Packard via Tecan | T8 + | 디스펜싱 테스트 화합물 |
| Nikon | Ti | 에피 형광 현미경 | 라이브 셀 이미징; 모든 표준 형광 현미경은 위상차 또는 DIC 광학으로 녹색 (플루오레세인), 주황색-빨간색에서 빨간색 (텍사스 레드) 및 원적외선 (Cy5) 형광을 100X 오일로 이미징 할 수 있습니다. 최고 해상도를 위한 대물 |
| 렌즈 유리 바닥 조직 배양 접시 | MatTek Corporation | P35G-1.5-20-C | 라이브 셀 이미징용. MatTek과 같은 접시는 도립 에피 형광 또는 컨포칼 현미경을 사용하여 600X 또는 1,000X 배율로 현미경 시각화를 가능하게 합니다. 이 특정 접시는 공칭 직경 3.5cm, 내부 직경 3.3cm이며 바닥에 직경 20mm #1.5 두께의 커버 슬립이 삽입되어 있습니다. |
| Photoshop, CS6 | Adobe | Adobe Photoshop 또는 이와 유사한 프로그램을 사용하여 빛, 현미경 및 형광 이미지를 의사 색칠하고 병합할 수 있습니다. | |
| Mathematica 10 | Wolfam | 2-dimensioonal isocontour isobolograms 및 3차원 surface isobolograms의 생성용. |
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