이 게시 재조합 α-synuclein, β-synuclein, 또는 간단한 색도계 분석 결과 사용 하 여 γ-synuclein 단백질 재조합 단백질 인산 가수분해 효소 2A 촉매 소 단위 (PP2Ac)의 활동을 측정 하는 방법을 보여 주는 프로토콜을 제공 합니다. 우리는 쥐의 뇌에서 PP2Ac로 α-synuclein 특이성에 관한 연구 결과 보여줍니다.
방법 논문
이 게시 재조합 α-synuclein, β-synuclein, 또는 간단한 색도계 분석 결과 사용 하 여 γ-synuclein 단백질 재조합 단백질 인산 가수분해 효소 2A 촉매 소 단위 (PP2Ac)의 활동을 측정 하는 방법을 보여 주는 프로토콜을 제공 합니다. 우리는 쥐의 뇌에서 PP2Ac로 α-synuclein 특이성에 관한 연구 결과 보여줍니다.
Α-Synuclein (aSyn), β-Synuclein (bSyn), 및 γ-Synuclein (gSyn) 높은 척추 신경 조직에 표현 되는 보호자와 같은 단백질의 보존된 가족의 구성원입니다. 3 synucleins의만 aSyn가 파 킨 슨 병, 치 매 Lewy 몸, 그리고 여러 시스템 위축 등 신경 장애에서 강하게 연루 되었습니다. 일반 aSyn 함수를 공부 하 고, 데이터를 풍부 하 게 표현된 dephosphorylating 효소 PP2Ac 체 외 , vivo에서의 촉매 소 단위의 활동을 자극 하는 그 aSyn 나타냅니다. 사전 데이터는 인간 두뇌에 있는 aSyn 집계 Lewy 몸 병 리, 수용 성 aSyn 불용 성 되고있다 영역에서 PP2Ac 활동 감소 보여준다. 그러나, 모든 3 개의 synucleins 아미노산 시퀀스에서 상당한 homology를가지고 있기 때문에 실험 모든 PP2Ac 활동을 조절할 수 있는지 테스트 하도록 설계 되었습니다. 재조합 synucleins 및 PP2Ac 재조합 형 단백질을 사용 하 여, 활동 공작 석 녹색 색도계 분석 결과 의해 평가 되었다. 데이터는 모든 3 개의 재조합 synucleins 셀 무료 분석 실험, synucleins 사이 보존된 homology 바인딩할 하는 PP2Ac 활성화 능력을 가진 모든 3 개의 homologs를 부여 수 있습니다 가능성 제기에 PP2Ac 활동 자극 밝혔다. 그러나 Co immunoprecipitation 데이터,, PP2Ac 변조 가능성이 aSyn와 PP2Ac에서 vivo에서간의 내 생 적인 상호 작용을 통해 발생 하는 것이 좋습니다.
다양 한 패턴의 지역화 되어 있지만에 뇌 척수 신경 조직, 모든 3 개의 synucleins 농축은 synucleins의 배포를 정의 하는 연구 보고1. 예를 들어, aSyn은 대뇌 피 질 및 기초 중추2,3연 접 사이트에서 가장 풍부한, bSyn는 더 균일 한 분포 두뇌와 척수4,5, 이며 gSyn 척수에 더 풍부한 그리고 주변 신경6. 모든 synucleins의 배아 식 일부 발생할 수 있습니다, 비록 3 homologs는 신생아 기간4,5,6,,78동안 더 풍부한 되. 놀랍게도, synuclein 트리플 녹아웃 쥐에서 데이터 손실의 모든 3 개의 synucleins 나이 발병 신경 부전9, 중앙 신경 시스템 (CNS)10, 에서 중요 한 synuclein 기능을 지 원하는 원인 표시 11. 그것은 아직 알려져 있지 synuclein 트리플 녹아웃 쥐 PP2Ac 배포 또는 활동에 변화를 표시 하는 경우. 단일 synuclein 녹아웃 쥐에서 데이터 공개 aSyn 혼자의 손실 뇌12에 PP2Ac 활동을 크게 줄일 수 있다. CNS, 뿐만 아니라 모든 synucleins 본문13,,1415에 걸쳐 다른 조직에 지역화합니다.
그것의 기초가 튼튼한 유전 링크를 neurodegeneration16,17, 때문에 aSyn는 최고의 공부 3 synucleins의. 페레즈 실험실 특히 CNS11,12,,1819,20,21, aSyn의 정상 기능 활동을 정의 하 긴 했습니다. 22,23 주변 조직24,25에서 최근에. 이러한 가운데, 그 aSyn 발견 했다 자극 PP2Ac 활동19에서 핵심 규제 역할을 한다. PP2A 활동 도파민 생산26의 규정을 포함 하 여 정상적인 뇌 기능에 널리 기여 한다. PP2A holoenzyme 구성 3 개의 독립적인 소 단위, 촉매 C 소 단위, PP2Ac, 스 캐 폴딩 A 소 단위, 및 여러 다른 규제/타겟팅 B 소 단위 PP2A를 제공 하는 특정 subcellular microdomains에 PP2A를 지역화 하는 데 도움이 중 하나 기능의 다양성27 증거를 보여주는 PP2Ac와 aSyn의 상호 작용의 인산 가수분해 효소 활동 생체 외에서 그리고 vivo에서12,,1921,23에 크게 기여 25. 집계 aSyn 조직 PP2Ac 활동23,25감소는 aSyn 단백질 집계, Lewy Lewy 몸 (DLB)와 파 킨 슨 병 및 치 매 신경 내부 형태의 시체 때와 마찬가지로 축적 때 때 녹는 aSyn의 수준을 감소. 모든 3 개의 synucleins는 상당한 상 동28 을 (aSyn bSyn와 gSyn 56% 66% 정체성을 공유) 및 PP2Ac의 활성화에 기여 하는 그 aSyn, synuclein 단백질 가족의 모든 구성원 수는 가설 이었다 증가 PP2Ac 활동, 적어도 생체 외에서. 이 평가, PP2Ac 활동 재조합 aSyn, bSyn, 및 gSyn Fathi 외 의 방법 후 간단한 색도계 분석 결과 사용 하 여 측정 되었다 29.이 메서드와 소설 발견 여기 상세한.
1입니다. 버퍼 및 시 약의 준비
| 인산 염 표준 | ||||||
| 0.1 m m 포4 솔루션 (mL) | 0 | 75 | 150 | 300 | 600 | 1200 |
| 이온된 초순 (mL) | 1250 | 1,175 | 1100 | 950 | 650 | 50 |
| PO4 [pmol]의 최종 농도 | 0 | 150 | 300 | 600 | 1200 | 2400 |
표 1: 인산 염 표준입니다.
2. PP2A 분석 결과 재조합 Synucleins에 대응
참고: 각 반응에 대 한 총 최종 볼륨 것 60 µ L, 그래서는 실험 synucleins 사용 하는 각 샘플의 볼륨에 맞게 적절 하 게 pNPP 버퍼의 초기 볼륨을 조정 해야 합니다. 대부분의 경우, pNPP 버퍼의 볼륨 40 및 44 µ L 사이 있을 것입니다.
3. 광도 분석
단백질 기능 및 활동은 인 산화와 같은 포스트 번역 상 수정 하 여 변경할 수 있습니다. 많은 단백질 키 니 아 제에 의해 phosphorylated 하거나는 인산 가수분해 효소에 의해 dephosphorylated 될 수 있습니다. 단백질 인산 가수분해 효소 2A의 경우 (PP2A)이 multisubunit 인산 가수분해 효소는 phosphoproteins의 광범위 한 번호에 떠들고, 트레오닌 잔류물의 dephosphorylation을 용이 하 게. 비정상적인 PP2A 활동 단백질 기능 타우 단백질 hyperphosphorylated를 될 수 있는 많은 질병, aSyn hyperphosphorylated, 될 수 있는 파 킨 슨 병을 포함 하 여 그리고 Alzheimer의 질병 발생의 dysregulation 발생할 수 있습니다. 이 빠르게 PP2Ac 활동을 평가 하 고 비정상적인 PP2Ac 활동 세포 역 기능으로 이어질 수 있습니다 경우 결정 하는 내부 절차를 최적화에 대 한 정당성을 제공 합니다.
PT 기판 (그림 1A)에서 죽 습이 셀 무료 색도계 분석 결과, 활동 무료 포4 의 양을 측정 하 여 측정 되었다 PP2Ac를 사용 하 고 표준 곡선 (그림 1B에서에서 포4 의 알려진된 picomolar 금액에 비해 ). PP2Ac 활동 또한 ( 그림 1A에 큰 화살표)에서 추가 synuclein의 부재에서 기준선 PP2Ac 활동에 비해 응답 0.0, 0.1, 0.5, 1.0, 및 2.0 µ M synucleins (그림 1A)에서 측정 했다.

그림 1 : 재조합 synucleins 정품 인증 PP2A 표준에서 인산 염의 알려진된 수준 관련 측정. (A) aSyn, bSyn, 및 gSyn에서 0-2 µ M 단백질 농도, 0을 비교-범위에서 평가 했다 2400 pmol 포4 표준. 공작 석 녹색 PP2Ac 분석 결과 대 한 표준 곡선 (B) A 알려진된 양의 한 실험 조건에서 가져온 값을 계산할 수 있다 인산 염을 제공 하기 위해 생성 되었습니다. 모든 경우에 때 PP2Ac 활동 증가, 무료 포4 pT 기판에서 죽 습의 양을 증가 하 고 어두운 녹색 색상을 생산. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.
결과 초기 창업 단계에서 PP2Ac에 synucleins의 추가 무료 포4 측정, 그로 인하여 증가 PP2Ac 활동을 보여주는의 양을 증가 수 보여줍니다. 모든 3 개의 재조합 synucleins (aSyn, bSyn, gSyn) PP2Ac 활동 (그림 2)을 크게 증가 시킬 많은 반복 표시 후 통계 분석. 이 결과 제안 수용 성 세포 synucleins의 변경 PP2Ac 활동을 변경할 수 있습니다. 따라서 세포 항상성 영향을 수 있습니다. 그러나 그것은 알 수 없습니다,, 모든 3 개의 synucleins PP2Ac에서 vivo에서,의 활성화에 기여 하는 경우 그림 3에서 데이터 제안 PP2Ac 활동에서 에 비보에기여 하는 그 aSyn 가능성이 있지만.

그림 2 : PP2Ac 활동은 모든 3 개의 synucleins에 의해 자극 됩니다. 재조합 aSyn, bSyn 또는 gSyn의 다양 한 농도에 대 한 응답 PP2Ac 활성화의 그래픽 표현을 표시 됩니다. 모든 3 개의 재조합 synucleins PP2Ac 활동을 자극. 대부분 실험에서 aSyn ANOVAs 통계 소프트웨어를 사용 하 여 수행 했다 비슷해 전반적으로 조금 더 강력한 것으로 나타났다. 데이터는 4-9 독립적인 실험의 평균 ±를 SEM을 나타냅니다. ns, 중요 하지; p < 0.05; p < 0.01; p < 0.0001. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.
평가 synuclein(s) 두뇌에서 PP2Ac와 상호 작용할 수, 공동-immunoprecipitation (공동-IP) 분석 실험은 야생 타입 마우스 두뇌와 PP2Ac-관련-항 체, 1D 6을 사용 하 여 수행 했다. 단백질은 다음 SDS 페이지를 구분 하 고도 말 PP2Ac, aSyn, bSyn, 및 gSyn 설립된 방법19를 사용 하 여 조사 했다. 재조합 synuclein 컨트롤 aSyn, bSyn 및 gSyn 항 체 특이성 (그림 3A)를 보여 줍니다. 공동 IP 데이터 공개는 두뇌에 있는 PP2Ac와 관련 된 주요 synuclein 했다 aSyn, 훨씬 bSyn (그림 3B), 공동 IP에서 내려와 아무 gSyn 공동 IP (데이터 표시 되지 않음)에 내려 왔어요. 이 내 인 성 aSyn 뇌에 PP2Ac의 규정에 대 한 독특한 역할을 제안합니다. 그것은 또한 bSyn nonamyloidogenic로 알려져 있다으로 bSyn 기반 요법 PP2Ac 변조 그 synucleinopathy에 PP2A 활동을 복원 하는 잠재력을가지고 수 가능성 제기와 같이 아직 여기 자극 PP2Ac30, 31.

그림 3: 쥐의 뇌에서 내 인 성 synucleins와 PP2Ac의 상호 작용. (A) 재조합 aSyn, bSyn 및 gSyn synuclein 특정 항 체와 함께 아래와 같이 조사 했다. (B) 사용 하 여 마우스 뇌 homogenate 공동 IP 항 1D 6 체로 수행한 다음 샘플 immunoblots에서 분석 했다. 데이터는 PP2Ac, aSyn, 및 bSyn, 하지만 PP2Ac와 공동-IP 하지 않았다 gSyn 표시 됩니다. 시작 샘플 보여 줍니다 PP2Ac의 상대 수준 (1 레인), aSyn (4 차선), 그리고 초기 homogenates에서 bSyn (레인 7). 최종 샘플 보여 줍니다 PP2Ac의 나머지 레벨 (2 레인), aSyn (5 레인), 및 homogenates 1D 6 후에 bSyn (8 레인) PP2Ac 공동-IP. PP2Ac의 중요 한 수준의 했다 1D 6을 사용 하 여 immunoprecipitated 항 체 (3 차선), 또한 아주 작은 bSyn (레인 9, 화살표에 희미 한 bSyn 신호 표시를 강력 하 게 설쳐) 하지만 aSyn (레인 6, 화살표에)의 충분 한 양을 아래로 가져. * 별표 하 고 마크는 일반적인 신호도 말에 괄호. 사용 하는 항 체에 대 한 자세한 내용은 테이블의 자료 를 참조 하십시오. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.
PT이 공작 석 녹색 분석 결과 32P 표시 기판 사용 하는 고전적인 방법 보다 수행 하기가 때문에 PP2Ac 활동을 측정 하기 위해 사용 되었다. 방사능 분석 실험을 통해이 분석 결과의 또 다른 장점은 radioisotopes 일부 위험을 제기 하 고 비쌀 수 있다, 특히 32P 이라는 분자를가지고 짧은 반감기, 분석 실험 시 약 만료 전에 수행할 수 있는 한의 수를 제한 하는. 방사능도 하지 않아도 32의 처리 보다는 공작 석 녹색을 사용 하 여 P 낭비. 공작 석 녹색 분석은 또한 매우 민감한 기판 p-nitrophenylphosphate (pNPP)로 수 비 선택은 사용 하는 다른 색도계 분석 결과에 비해 떠들고/트레오닌 인산 가수분해 효소의 활동을 측정 하는 경우 효소32의 광범위 한 수로 dephosphorylated.
상업 공작 석 녹색 키트 PP2A 활동을 측정 하기 위해 몇 시간 동안 사용할 수 그리고 이전 실험실에서 사용 되었다. 그러나, 많은 녹색 공작 석 분석 하 고, 이러한 키트 prohibitively 비싼 되었다. 또한, PP2A 활동에 대 한 상업 키트 1 년 동안만 안정적인 형태 분말 시 약에서 사용할 수 있는 하는 동안 이며 적절 한 스토리지, 오랜 시간에 대 한 구조적으로 안정는 쉽게 사용할 수 분석 결과 구성 요소를 제공.
BSyn 및 gSyn을 테스트 하기 전에 aSyn로 사용 되었다 긍정적인 컨트롤 PP2Ac 활동을 자극 하 고 PP2Ac는 분석 실험에 필요한 양을 결정 하 고 또한 결과 데이터 표준 곡선 (150-2400 pmol 포4 의 규모에 남아 확인 하 ). 그것은 aSyn PP2Ac 자극 하는 경우 너무 강하게 반응이 일반적으로 선형 하지만 데이터 오프 규모 갈 것 이다을 관리 솔루션에 화학 침전, 그건 불가능 한 접시와 함께 출시 된 무료 포4 의 정확한 금액을 측정 하 독자입니다.
기여 하는 aSyn는 PP2Ac 활동 vivo에서 그리고 생체 외에서12,19,21,,2325, 그리고 그 모든 synucleins 상당한 homology, 그것은 있었다 가설 그 모든 synuclein 가족 셀 무료 분석 실험에서 PP2Ac를 자극 수 있습니다. 여기 설명 된 색도계 분석 결과 사용 하 여, 실제로, 모든 3 개의 재조합 synucleins (aSyn, bSyn, gSyn) PP2Ac 활동, 모든 3 개의 synucleins 신 경계에 비슷한 기능을 수행할 수 있습니다 가능성 제기를 자극 발견 했다. 그러나, 파 킨 슨 병에서 뇌 또는 경우 매우 포함 하는 조직에 있는 더 적은 PP2Ac 활동 Lewy 몸을 가진 치 매 집계 aSyn23. 은닉 Lewy 몸 같은 병 리 또한 전시 마우스 조직 PP2Ac 활동25감소. 이, bSyn도 gSyn 녹는 aSyn의 손실에 대 한 보상 일반적으로 수 좋습니다 그림 3에서 새로운 데이터 뿐만 아니라 aSyn 녹아웃 쥐12, 이전 데이터 및 두뇌, 또는 양자 택일로 그 synuclein homologs 하지 않을 수 있습니다 강하게 표시 (그림 3) aSyn PP2Ac와 연결. 알 렌 두뇌 지도 책 많은 뇌 분야에서는 모든 3 개의 synuclein mRNAs의 colocalization 그리고 비록 트리플 synuclein 녹아웃 쥐 생성 된9,33, PP2Ac 활동은 그 모델에 평가 하지 되었습니다. 흥미롭게도, 폴로-같은 키 2에 의해 Ser129에 phosphorylated aSyn PP2Ac12, 활성화 수 하지만 증거 bSyn에 대 한 여기에 표시 된 아주 작은 bSyn와 함께 온 그 bSyn 인 산화 PP2Ac 활동에 영향을 것입니다 제안 쥐의 뇌 (그림 3)에서 PP2Ac. 함께 찍은, 데이터 aSyn, 가능성이 같은 내 인 성 PP2Ac 활동 변조기 증진과 질병 기여할 것이 좋습니다.
여기에 설명 된 프로토콜 다양 한 치료에 대 한 응답에서 phosphopeptide 기판 dephosphorylate PP2Ac의 용량을 결정 하는 간단 하면서도 강력한 기술입니다. 예를 들어,이 같은 방법론 ceramides로 잠재적인 새로운 치료 학34, 다른 PP2Ac 활성 테스트 또는 PP2Ac 억제제에서 체 외에서의 영향을 평가 하기 위해 사용할 수 있습니다. 그것은 또한 유사한 분석 1D 6 고립 되었다 PP2Ac의 활동을 측정할 수 다는 것을 지적 하는 것이 중요 셀 추출 물 또는 신체 조직, 앞에서 설명한 저자12,19, immunoprecipitation 25. ATP 활동 또한 확인할 수 있습니다 이러한 분석 결과 사용 하 여 공작 석 녹색 분석 결과 대 한 미래 응용 프로그램 PP2Ac 활동, 측정 넘어 존재.
Note 표준 곡선 모든 독립적인 PP2Ac 분석 결과 대 한 각 시간을 생성 해야 합니다. 그것은 자유로운 인산 염 인위적 배경 신호를 증가 하 고 잘못 된 결과가 사용 하는 모든 시 약을 인산 염 무료, 필수입니다. 분석 결과의 날에 모든 샘플 수 분석을 위한 충분 한 신선한 MGT 솔루션 준비 하 필수적 이다. 또한, MGT만 좋은 일입니다 하 그것은 몇 시간 후에 침전 하는 경향이 있다. 공급 업체에서 구입한 PP2Ac aliquotted 이어야 하 고 저장 된 그것은 그것의 활동을 감소 시키는 냉동 해 동 주기를 방지 하기 위해 받은 직후 냉동. 로 다른 가수분해 pT 기판 (예: PP1, PP535), dephosphorylate 수 없는 PP2Ac가 아닌 immunoprecipitation에 의해 고립 되었다 세포 또는 조직 추출, 분석할 때 샘플 무료 인산 염을 제거 하려면 열을 통해 전달 되어야 합니다 그리고 가수분해의 특정 억제제 앞에서 설명한18로 인산 가수분해 효소 특이성을 확인 하는 데 사용 해야 합니다.
박사 페레즈 1999-2011 년에서 피츠버그 대학 의과대학에서 신경과 학과 교수진의 일원이 되었다.
저자 켄 드 라 Mackett, 산드라 Slusher와 Jie 첸 메서드를 최적화 하기 위해 일 이전 실험실 구성원의 노력을 주셔서 감사 합니다. 저자는 또한 건강의 국가 학회, 마이클 제이 폭스 재단, 택 사스 기술 대학 건강 과학 센터 엘 파소 학술 활동 연구 프로젝트 (SARP), Lizanell 및 콜버트 Coldwell 재단, 여러 시스템 위축 연합, 감사 합니다. 오늘 가족 연구, 그리고이 연구의 재정 지원에 대 한 안 나 매도 일 선물 자금.
| 이름 | 회사 | 카탈로그 번호 | 댓글 |
|---|---|---|---|
| 시약 | |||
| 1 M Trizma Base | Sigma-Aldrich | T15003 | |
| CaCl2 (calcium chloride) | Fisher Scientific | C70-500 | |
| Concentrated HCl | JT Baker | 9535-33 | |
| 암모늄 몰리브덴산염 | Sigma-Aldrich | A1343 | |
| 공작석 녹색 옥살레이트 염 | Sigma-Aldrich | M6880 | |
| Tween 20 | Sigma-Aldrich | P9416 | |
| Threonine phosphopeptide (KRpTIRR) | New England peptide LLC | BP12-011 | |
| KH2PO4 ( 인산칼륨) | Sigma-Aldrich | 795488 | |
| 재조합 인간 PP2A C 서브유닛 | 케이맨 화학 | ||
| 재조합 인간 &알파;-시누클레인 | r펩타이드 | S-1001-2 | |
| 재조합 인간 &베타;-시누클레인 | r펩타이드 | S-1003-2 | |
| 재조합 인간 &감마;-시누클레인 | r펩타이드 | S-1007-2 | |
| PP2Ac 1D6 항체 | Millipore | 05-421 | |
| PP2Ac 항체 | Novus Biologicals | NB100-92217 | |
| aSyn 항체 C-20 | Santa Cruz Biotechnology | sc-7011-R | |
| bSyn 항체 | EP1537Y Novus Biologicals | NB100-79903 | |
| gSyn 항체 E-20 | Santa Cruz Biotechnology | sc-10698 | |
| Zeba 스핀 탈염 컬럼, 7K MWCO, 0.5mL | Thermo-Fisher Scientific | 89882 | |
| Name | Company | 카탈로그 번호 | 코멘트 |
| >Equipment/Software | |||
| Multiskan Spectrum Plate Reader | Thermo Fisher Scientific | ||
| pH 측정기 | 피셔 사이언티픽 | 13-636-AB15P |
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허가 요청An erratum was issued for: Recombinant α- β- and γ-Synucleins Stimulate Protein Phosphatase 2A Catalytic Subunit Activity in Cell Free Assays
One of the authors' names was corrected from:
Brian Marcus
to:
Brian S. Marcus