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방법 논문

네이티브 전기 영동, In-gel Assay 및 Electroelution으로 미토콘드리아 전자 수송 사슬의 수퍼 콤플렉스 분석

13.7K 조회수

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DOI:

10.3791/55738

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2017년 6월 1일

이 논문에서

요약

이 프로토콜은 기능적 미토콘드리아 전자 수송 사슬 복합체 (Cx) IV와 그 복합체 (supercomplexes)의 분리를 기술하여 네이티브 전기 영동을 사용하여 어셈블리 및 구조에 대한 정보를 나타냅니다. 네이티브 젤은 면역 블로 팅 (immunoblotting), 겔 (in-gel) 분석법, 전기 분해 (electroelution)로 정제하여 개별 복합체를 추가로 특성 분석 할 수 있습니다.

초록

미토콘드리아 전자 수송 사슬 (ETC)은 다양한 연료의 분해로 인해 생성 된 에너지를 세포의 ATP 인 생물 에너지로 변환시킵니다. ETC는 respirasomes (CI, C-III, C-IV) 및 전자 전달 및 ATP 생산의 효율성을 증가시키는 synthasomes (CV)라고 불리는 supercomplexes로 조립되는 5 개의 거대한 단백질 복합체로 구성됩니다. ETC 기능을 측정하기 위해 50 년 이상 다양한 방법이 사용되었지만 이러한 프로토콜은 개별 복합체와 수퍼 콤플렉스의 조립에 대한 정보를 제공하지 않습니다. 이 프로토콜은 ETC 복잡한 구조를 연구하기 위해 20 년 이상 전에 수정 된 방법 인 고유 겔 폴리 아크릴 아미드 겔 전기 영동 (PAGE) 기술을 설명합니다. 네이티브 전기 영동으로 ETC 복합체를 활성 형태로 분리 할 수 ​​있으며,이 복합체는 면역 블로 팅 (immunoblotting), 겔화 분석 (IGA) 및 전기 분해로 정제 할 수 있습니다. 다시 조합하여네이티브 젤 PAGE와 다른 미토콘드리아 분석 결과를 비교해 보면 ETC 활동, 동적 인 조립 및 분해, 그리고 이것이 미토콘드리아 구조와 기능을 어떻게 조절하는지에 대한 완성도를 얻을 수 있습니다. 이 작품은 또한 이러한 기술의 한계를 논의 할 것입니다. 요약하면, 네이티브 PAGE 기술은 면역 블로 팅, IGA, 전기 분해가 뒤 따르는 것으로 미토콘드리아 ETC 수퍼 콤플렉스의 기능과 구성을 조사하는 강력한 방법입니다.

서론

ATP 형태의 미토콘드리아 에너지는 세포 생존에 필수적 일뿐만 아니라 세포 사멸의 조절에도 필수적이다. 산화 적 인산화에 의한 ATP의 생성에는 기능적 전자 전달 사슬 (ETC, Cx-1 내지 IV) 및 미토콘드리아 ATP 신타 제 (Cx-V)가 필요하다. 최근의 연구에 따르면 이러한 큰 단백질 복합체는 respirasomes 및 synthasomes 1 , 2 라고 불리는 수퍼 콤플렉스로 구성되어 있습니다. 이러한 대규모 단지와 수퍼 콤플렉스의 조립, 역학 및 활동 규제를 분석하는 것은 어려운 일입니다. 분광 광도계를 사용하여 수행 한 산소 전극 및 효소 분석으로 얻은 산소 소비 측정은 ETC 복합체 활성에 대한 유용한 정보를 제공 할 수 있지만이 분석법은 관련된 단백질 복합체 또는 수퍼 콤플렉스의 존재, 크기 및 하위 구성에 관한 정보를 제공 할 수 없습니다. 그러나, 청색 및 투명한 천연 (BN 및 CN) PAGE 3 은 복잡한 구성 및 조립 / 해체에 대한 중요한 정보와 생리 및 병리학 적 조건 하에서 이들 중요한 호흡 복합체의 초분자 조직의 동적 조절에 대한 강력한 도구를 창출했습니다.

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프로토콜

모든 실험은 C57BL / 6N 마우스 (야생형)의 심장을 사용하여 수행 하였다. 쥐는 자궁 경부 전위 이전에 이산화탄소로 마취되었고, 모든 절차는 로체스터 대학의 실험실 동물 의학부에 따라 주법, 연방 법령 및 NIH 정책에 따라 엄격하게 수행되었다. 의정서는 로체스터 대학 동물 동물 보호 및 사용위원회 (동물 자원위원회)의 승인을 받았습니다.

1. CN 및 BN 페이지

참고 : BN 및 CN PAGE에 사용되는 모든 장비는 세제가 없어야합니다. 이것을 보장하기 위해 모든 장비를 0.1M 염산으로 씻은 다음 탈 이온화 된 H 2 O로 광범위하게 헹구십시오.

  1. 예비
    1. 4 ° C에서 25 MM imidazole, pH 7.0으로 구성된 양극 완충액을 준비하십시오. 4 ° C에서 보관하십시오.
    2. CN 또는 BN PAGE 용 음극 완충액을 준비하십시오.
      1. CN PAGE의 경우 7.5 mM imidazole과 50 mM tricine을 사용하십시오. 1 리터의 완충액에 sodium deoxycholate 0.5g과 lauryl maltoside 0.2g을 넣는다. 4 ° C에서 7.0으....

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결과

미토콘드리아 supercomplexes를 시각화하기 위해 쥐에서 새로 격리 mitochondria가 사용되었다 17 , 18 . Mitochondrial supercomplexes는 일부 연구자들에게는 용인 될 수 있지만, 분해 및 해동의 반복주기에 민감합니다. 보관을 위해 동결이 필요한 경우 최상의 결과를 얻으려면 샘플을 한 번 이상 동결 및 해동하지 않아야합니다.

미토콘드리아 ETC 복합체를 BN PAGE로 시각화하기 위해 분리 된 심장 미토콘드리아의 단백질 100 μg을 4-10 % 젤에 로딩했다 ( 그림 1A ). 로딩 및 음극 완충액의 쿠마시 스테인은 실행 중 단백질 복합체를 표지하기에 충분합니.......

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토론

기능적 ETC는 미토콘드리아 ATP 생성에 필요합니다. ETC의 복합체는 respirasomes (Cx-I, -III 및 -IV) 1 과 신타 소솜 (Cx-V) 2의 두 가지 유형의 수퍼 콤플렉스를 형성 할 수 있습니다. ETC를 supercomplexes로 편성하는 것은 전반적인 ETC 효율성을 증가시키는 것으로 생각되는 반면, 각 복합체의 조립은 손상되지 않은 ETC에 필요하다. 이러한 수퍼 콤플렉스가 어떻게 조립 및 분해되는지는 잘 알려져 있지 않지만 여기에 제시된 프로토콜은 이러한 프로세스를 더 잘 이해할 수 있습니다.

ETC 어셈블리 연구의 주요 과제는 이러한 단백질 복합체의 크기입니다. 예를 들어, 미토콘드리아 호흡기는 Cx-I (약 880 kDa)와 하나 이상의 Cx-III 분자 (460 kDa) 및 Cx-IV (200 kDa, 이량 체로 활성)로 구성되어 분자와의 복합체를 형성.......

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공개 사항

저자는 공개 할 것이 없습니다.

감사의 글

이 연구는 미국 심장 학회 설립자 제휴사 (12GRNT12060233)와 로체스터 대학의 Strong Children 's Research Center의 연구비 지원으로 이루어졌습니다.

....

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재료

이 논문에 사용된 재료 목록
이름회사카탈로그 번호댓글
Protean II 미니 젤 챔버Biorad1658004미니 젤 전기 영동을 붓고 실행하는 전체 세트
Protean XL 맥시 젤Biorad1653189맥시 젤 전기 영
디언트 메이커, Hoefer SG15 VWR95044-704붓는 미니 젤 그라디언
메이커, 맥시 젤VWRGM-100붓는 맥시 젤 그래디언트
전사 키트Biorad1703930멤브레인으로 단백질을 습식으로 이송하는 전체 세트
Electroeluter 모델 422Biorad1652976천연 또는 SDS PAGES에서 단백질의 전기 용출
유리판 Biorad1653308Short plates
유리판Biorad1653312스페이서 플레이트
유리판Biorad1651823내부 플레이트
유리 플레이트Biorad1651824외부 플레이트
전원 공급 장치Biorad1645070기본 전기영동에 적합한 전원 공급 장치
ECL-Western Thermo Scientific32209Chemolumniscense 기질
SuperSignal-West DuraThermo Scientific34075Enhanced chemolumniscense 기질
필름/자가방사선 촬영 필름GE 헬스케어28906845웨스턴 블롯 문서화
필름 프로세서 CP1000AgfaNC0872640
Canon Power Shot 640 CanonNA젤, 멤브레인 및 블롯을 문서화하기 위해 사진을 찍습니다.
Canon Power Shot 640 카메라 후드 가벼운 테이블에서 사진을 찍을 수 있는Canon
아크릴아미드/비아크릴아미드Biorad161014840% 사전 혼합 용액
글리신시그마G7403
SDS(도데실황산나트륨)인비트로젠15525-017
트리스 베이스시그마T1503버퍼
트리신시그마T0377
소듐데옥시킬레이트시그마D66750세제
EDTA시그마E5134
수크로오스시그마S9378
MOPS시그마M1254버퍼
이미다졸시그마I15513버퍼
라우릴 말토시드시그마D4641세제
Coomassie G250Biorad161-0406
아미노헥산산시그마O7260
네이티브  분자량 키트GE 헬스케어 17-0445-01네이티브 전기영동을 위한 고분자량 교정 키트.
NameCompany카탈로그 번호Comments
NADHSigmaN4505
Nitroblue 테트라졸륨SigmaN6639
Tris HClSigmaT3253
ATP   SigmaA2383
NameCompany카탈로그 번호Comments
Lead(II) nitrate (Pb(NO3)2):Sigma228621
올리고마이신SigmaO4876
이름Company카탈로그 번호코멘트
Ponceau SSigmaP3504
Abcamab14748항체 ATP synthase subunit ATP5A
anti-NDUFB6Abcamab110244Cx-1 subunit NDUFB6
anti-VDAC 항체Calbiochem529534VDAC
ECL HRP 연계 항체GE Health CareNA931VATP5A, NDUFB6 및 VDAC 차단 시약에 대한 2차 항체
Biorad170-6404
BSA
염화나트륨SigmaS9888
염화칼SigmaP9541
EGTASigmaE3889
NameCompany카탈로그 번호Comments
Silver staining KitInvitrogenLC6070
동 그라트 차폐 카메라륨

참고문헌

  1. Lenaz, G., Genova, M. L. Supramolecular organisation of the mitochondrial respiratory chain: a new challenge for the mechanism and control of oxidative phosphorylation. Adv Exp Med Biol. 748, 107-144 (2012).
  2. Saks, V., et al.

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