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방법 논문

Xenopus 에 Leapfrogging CRISPR/Cas9-기반에 대 한 원시 생식 세포 이식

7.7K 조회수

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DOI:

10.3791/56035

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2018년 2월 1일

이 논문에서

요약

생존을 위해 필수적인 유전자 돌연변이 라인을 만들기 위한 기술 장애물 포즈. Leapfrogging 게놈 야생-타입 동물 생식 변이 들고 만드는 원시 생식 세포 이식으로 편집을 결합 하 여 치 사 율 circumvents. Leapfrogging 또한 F1 세대에서 null homozygous 돌연변이의 효율적인 생성을 허용합니다. 여기, 이식 단계는 보여 줍니다.

초록

편집 하는 게놈 돌연변이 라인의 창조 많은 유기 체에서 유전자 분석을 가속. CRISPR/Cas9 메서드가 아프리카 발톱된 개구리, Xenopus, 생물 의학 연구에 대 한 오랜 모델 유기 체에서에서 사용 하기 위해 적응 되었습니다. CRISPR/Cas9-타겟 mutagenesis와 homozygous 돌연변이 라인을 만들기 위한 전통적인 번 식 계획 몇 가지 어렵고 힘 드는 단계 있다. 특히 노크 embryogenesis에 필수적인 유전자와 관련 된 장애를 극복 하기 위해 돌연변이 배아의 생성을 촉진 하기 위하여 leapfrogging 이라는 새로운 방법을 개발 되었다. 이 기술을 활용 하 여 "잘라내기 및 붙여넣기" Xenopus 배아의 견고성 embryological 방법. Leapfrogging PGC 연기나 wildtype 형제에 효율적으로 mutagenized 기증자 배아에서 원시 생식 세포 (PGCs)의 전송을 사용합니다. 이 메서드는 공상 동물 wildtype 체세포 돌연변이 생식을가지고 작성 하 여 필수적인 유전자의 효율적인 돌연변이 대 한 수 있습니다. 때 두 F0 동물 운반 "도약 이식" (즉, 돌연변이 세균 세포)는 intercrossed, 그들은 생산 homozygous, 또는 복합 heterozygous, null F1 배아, phenotypic 데이터를 얻기 위해 전체 생성 시간 절약. F0 phenotypic 분석 CRISPR/Cas9 mutagenesis 다음 내 화물은 임산부 효력 유전자 분석을 위한 새로운 접근 방법을 제공 합니다 또한 leapfrogging. 이 원고 leapfrogging PGC 이식 성공적으로 수행 하는 방법에 대 한 특별 한 강조와 함께 하는 방법을 자세히 설명 합니다.

서론

어떻게 유전자 표현 형 인코딩합니다 Mendel의 법률의 재발견 이후 생물학에서 주요 질문 되었습니다. 인코딩된 제품 약속 잠복 새로운 생물학 및 장황 질병 상태에 대 한 도구를 제공 하기의 기능과 유전자, 그들의 규칙 및 유전자 네트워크 내에서 상호 작용의 역할의 이해. 절반 이상이 세기1, 아프리카 발톱된 개구리, Xenopus, 기초 생물학 및 의학, 발달의 유전 통제를 포함 하 여 다양 한 주제에 대 한 연구에 대 한 선도 모델을 하고있다. 역사적으로, Xenopus 에 대부분의 연구는 allotetraploid 개구리, X. laevis, 사용 하지만 더 최근에, 그것의 diploidy 인 X. tropicalis 개발 되었습니다 양서류 유전자 모델. 완전 한 게놈 시퀀스 두 Xenopus 종2,3에서 조립 되어 있다. "개구리 커뮤니티"입니다 지금 전환점에 어디 기본 게놈 수정 기술 허용 유전자 기능 연구 거의 것입니다. 프로그래밍 가능 CRISPR/Cas9 endonucleases 유전자의 mutagenesis를 biallelic 돌연변이 가능한 대부분의....

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프로토콜

여기에 설명 된 모든 메서드는 기관 동물 관리 및 사용, Irvine가 주 대학의 위원회에 의해 승인 되었습니다.

1입니다. PGC 식 위한 준비

  1. 앞에서 설명한23으로 해 부 도구를 사전에 준비 합니다.
    참고: 눈 썹 머리 칼 수술을 수행 하는 동안 태아를 안정 시키기 위해 머리 루프의 도움으로 절 개를 만드는 데 사용 됩니다. 눈 썹 머리와 머리 루프 붕 규 산 유리 펫 파스퇴르는 화 염에 그려 왔다 처음으로 붙어 있으며 남았다 부분에 깨진 (참조 그림 1A, 화살촉) 큰 손 재주에 대 한 짧은, 좁은 팁 (그림 1B)를 만들 때 수술을 수행.
  2. SgRNAs 절차 이전 기술된24 을 사용 하 여 생성 합니다.
    참고: 짧게, 짧은 DNA 서식 파일 sgRNAs에 대 한 코딩 만들어집니다를 오류-무료, thermostable DNA 중 합 효소 겹치는 deoxyoligonucleotides 5' 살 균 소 T7 발기인, 단련 되 고 "입력"를 포함 하 여. SgRNA 합성 반응 생체 외에서 (키....

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결과

이식, 다음 CRISPR/Cas9 mutagenesis의 효능의 질적 결정 축산 성장과 성적 성숙 동물 유지에 노력을 소비 하기 전에 수행 되어야 합니다. 때문에 들고 토끼 뜀 이식 동물 somatically wildtype는 생식은 직접 측정을 위한 접근 하기 어려운, 기증자 태아의 시체를 저장 중요 해 집니다. 시체에서 DNA 분석 이식된 생식17에서 발생 하는 mutagenesis의 범위에 대 한 프록시 역할을 합니다.

Mutagenesis의 성공을 평가 하는 한 가지 방법은 직접 시퀀스 PCR amplicons 대상 게놈 영역에 걸친 것입니다. 이것은 특히 비용과 비효율적인 경우 하고자 많은 동물에서 수많은 개별적으로 복제 된 DNA 파편을 연속 된다. 대신, 그들은 모자이크 배아 유전자에서 파생 .......

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토론

이 보고서에서는 PGCs. 이식의 PGCs를 포함 하는 식물 조직의 이식에 대 한 상세한 프로토콜을 수정 하는 생식을 게놈 편집 기술 (예: CRISPR/Cas9)와 함께에서 사용 하면서 동물의 거의 모든 그것의 체세포 조직 유전자 야생 유형으로 유지. 성공 하려면 leapfrogging 위해 수행 간이식을 수행 하기 전에 고려해 야 할 중요 한 요인의 수가 있다.

돌연변이 체 대립 유전자와는 생식의 완전 한 교체를 위해 하나 먼저 sgRNAs의 비보에 효율을 결정 한다는 것이 좋습니다. 경험에 따르면 대부분 sgRNAs CRISPRDirect (https://crispr.dbcls.jp/) 또는 CRISPRScan (http://www.crisprscan.org/)에 의해 설계 된 효율적인 250 pg/배아에서 사용 하는 경우는. 그러나, 어떤 경우 (예를 들어, 의해 기습 외17,

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공개 사항

저자는 공개 상관이 있다.

감사의 글

이 작품은 보조금의 지원으로 수행 되었다 5R21HD080684-02, 아동 건강의 국가 학회 및 인간 발달에서. 저자 켄 조 그의 지속적인 열정과 지원에 대 한 감사를 기원 합니다. 저자 또한 싶습니다 원고, 숀 맥 나 마라와 국가 Xenopus 자원 (RRID:SCR_013731)에 마 Wlizla의 중요 한 독서에 대 한 그의 카메라, 리브가 Charney의 사용에 대 한 브루스 블 룸 베르크를 인정 하는 가치에 대 한 X. tropicalis 수 유 및 동물 관리 식이요법에 관한 대화.

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재료

이 논문에 사용된 재료 목록
이름회사카탈로그 번호댓글
Dumont #5 집게Fine Science Tools11252-20 또는 11252-30
눈썹 헤어 나이프홈메이드
헤어 루프홈메이드
파스퇴르 피펫, 붕규산 유리Fisher Scientific13-678-20A
Krazy Glue (시아노아크릴레이트 기반)Elmer's Products, Inc.KG581파스퇴르 피펫에 눈썹 털과 머리 고리를 부착하기 위해 다른 유사한 접착제를 사용할 수 있습니다.
올리고데옥시뉴클레오티드, 맞춤형 주문통합 DNA 기술sgRNA 합성을 위한 맞춤형 주문 템플릿 올리고, 설계 세부 사항은 Nakayama et al., 2014 참조.
메가스크립트 T7 키트Ambion/ThermoFisherAM1334또는 Megashortscript T7 (AM1354) 키트
페놀, 트리스 버퍼링모든 상업 공급업체의 고품질 증류 페놀
클로로포름모든 상업 공급업체의 고품질 클로로포름
에탄올모든 상업 공급업체
디에틸피로카보네이트(DEPC)Sigma Chemical Co.D5758-50ML
Cas9 단백질, 핵 국소화 신호 PNABio, Inc.CP01제조업체의 권장 사항에 따라 DEPC 처리 된 물을 사용하여 재구성
10X Marc의 Modified Ringers 솔루션Homemade. 1X MMR(EDTA 부족)에 대한 레시피(참조 26)는 100mM NaCl, 2mM KCl, 1mM MgSO4, 2mM CaCl2, 5mM Hepes입니다. 용액은 pH를 7.4로 조정합니다.
아가로스모든 분자 생물학 등급의 아가로스로 충분합니다:
60 X15 mm 페트리 플레이트Falcon351007
24웰 플레이트Falcon3047
L-Cysteine, Sigma Chemical Co.C7352-100G염기가 아닌 염기, HCl 염이 아님
단백질 분해 효소 KRoche03 115 828 001
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의 고품질 에탄올 : , , 일반적으로 Roche 혈청 미크론 혈청

참고문헌

  1. Gurdon, J. B., Hopwood, N. The introduction of Xenopus laevis into developmental biology: of empire, pregnancy testing and ribosomal genes. Int J Dev Biol. 44 (1), 43-50 (2000).
  2. Hellsten, U., et al. The genome of the Western clawed frog Xen....

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재인쇄 및 허가

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