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Research Article
Thinh Nguyen*1, Thomas Potter*1, Christof Karmonik2, Robert Grossman2, Yingchun Zhang1,3
1Department of Biomedical Engineering, Cullen College of Engineering,University of Houston, 2Department of Neurosurgery,Houston Methodist Hospital and Research Institute, 3Guangdong Provincial Work Injury Rehabilitation Center
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
이미징 방법, 방법, 이미징 spatiotemporal fMRI 제한 된 뇌 파 소스 라고 하는 뇌 파 fMRI multimodal 여기 설명 되어 있습니다. 제시 방법 고용 조건에 따라 활성 fMRI 하위 지도, 또는 priors, 공간 특이성을 향상 하 고 잘못 된 결과 제한 하는 방식으로 뇌 파 소스 지역화 가이드.
Electroencephalography (뇌 파)와 기능적 자기 공명 영상 (fMRI)는 두뇌 활동을 식별 하기 위한 기본적인 비 침범 성 방법의 두. FMRI의 공간 정밀 뇌 파의 높은 시간 해상도 결합 하 여 복합 방법을 모색 하지만이 방법의 복잡성은 현재 개선 필요. 여기에 제시 된 프로토콜 최근에 개발한 spatiotemporal fMRI 제한 된 뇌 파 소스를 이미징 소스 편견을 바로 잡기 위해 fMRI 하위 영역의 동적 모집을 통해 뇌 파 fMRI 소스 지역화를 개선 하고자 방법에 설명 합니다. 프로세스 검사, 3D 대뇌 피 질의 모델, 그리고 독립적인 EEG 및 fMRI 처리의 세대 동시 EEG 및 fMRI에서 복합 데이터 수집 시작합니다. 처리 된 fMRI 활성화 지도 다음 여러 priors, 그들의 위치 및 주변 지역으로 분할 됩니다. 이러한 뇌 파 소스 지역화에 대 한 2 단계 계층적 베이지안 알고리즘에서 priors로 가져옵니다. (운영자 정의)의 각 창에 대 한 fMRI 활성화 지도의 특정 세그먼트 식별 모델 증거로 알려진 매개 변수 최적화를 활성화. 이러한 크로스 토크를 감소 시키고 다른 조건에 따라 활성 fMRI 영역에서 잘못 된 활동을 피하고 메서드를 이미징 multimodal의 특이성을 증가 확인 된 대뇌 피 질의 활동에 부드러운 제약 조건으로 사용 됩니다. 메서드 생성 대뇌 피 질의 지도 활동 및 시간-과정의 최종 결과로 찍은 또는 메서드 동안 추가 분석 (상관 관계, 원인, 등의 분석)에 대 한 기준으로 사용 수 있습니다 (그것은 찾을 수 없습니다 그것의 형식에 의해 다소 제한 EEG-invisible 소스), 그것은 광범위 하 게 대부분의 주요 처리 소프트웨어와 호환 이며 대부분 neuroimaging 연구에 적합.
Electroencephalography (뇌 파)와 기능적 자기 공명 영상 (fMRI) 보완 기능 neuroimaging 형식으로 볼 수 있습니다. FMRI hemodynamic 신호 (초) 순서 가난한 시간적 해상도1,2기본 신경 활동을 직접 측정 일시적인 대규모 두뇌 활동을 캡처합니다. 반면, 뇌 파 직접 빈약한 공간적 해상도3,4하지만 매우 높은 시간 해상도 (밀리초 수준), 뇌의 동적 electrophysiological 활동을 측정합니다. 이러한 속성은 각 개별 방법5의 유리한 측면을 최적화 하도록 설계 된 복합 접근에 이르렀다. EEG와 fMRI의 동시 사용 unimodal fMRI 또는 뇌 파와 관련 된 한계를 극복 하기 위해 우수한 시간적 해상도 뇌 파의 fMRI의 높은 공간 정확도와 결합 될 수 있습니다.
EEG 및 fMRI 통합을 위한 방법-정보를 fMRI 뇌 파 소스 지역화6,7로 시작합니다. 그러나이 기술은 뇌 파 소스 지역화를 개선 하기 위해 fMRI 파생 된 공간 정보를 활용 하 여,, 1 개의 결점은 "하드-제약 조건으로" fMRI의 응용 프로그램에 의해 발생 하는 잠재적인 공간 바이어스-공간 정보 fMRI 파생 된 것으로 간주 한 절대 진리입니다. 이 화해6-8이어야 하는 두 가지 큰 문제를 제기 한다. 첫째, 혈액 산소 수준 의존 (대담한) 대조의 정적 지도 사용 하 여 실수로 댐핑 밖에 진정한 활동 하는 동안 안에서 떨어지는 어떤 잘못 된 활동을 강화할 수 있습니다 고려 되어야 한다. 둘째, 대담한 활성화 지도 이상으로 발생 하는 소스에서 크로스 토크 결과 내에서 진정한 활동의 프레 젠 테이 션에 영향을 미칠 또는 잘못 된 활동을 일으킬 수 있습니다. 그럼에도 불구 하 고, 뇌 파 역 문제의 모델링 될 수 있는 사전 공간 지식 남아 유리한 솔루션5제공 하는 fMRI의 높은 공간 해상도 사용 하 여 제한 해 부와 기능 감에서 둘 다.
이 종이, fMRI priors는 계층적 베이지안 모델9에 따라 최적의 하위 집합을 계산 하 여 EEG와 fMRI 사이의 일시적인 불일치의 문제를 해결 하는 접근을 이미징 spatiotemporal fMRI 제한 된 뇌 파 소스를 보여 줍니다. FMRI priors 시간 변형 fMRI 제약을 이끌어 뇌 파 데이터에 대 한 관심의 특정 윈도우에서 데이터 기반으로 계산 됩니다. 제안 된 접근 활용 fMRI의 높은 공간 해상도로 정보를 정확 하 게 동적 신경 이미지 하는 시간에 따라 변화, 공간 선택적 방식으로 대뇌 피 질의 활동의 전류 밀도 매핑 계산 뇌 파의 높은 시간 해상도 활동입니다.
여기에 제시 된 프로토콜 설계 하 고 수행한 윤리적 인간 연구에 대 한 모든 지침에 따라 설정 앞 대학 휴스턴과 휴스턴 감리교 연구소의 각각 제도적 리뷰 보드.
1. 동시 EEG/fMRI 녹음
2. 구조상 MRI 데이터 분석 및 앞으로 모델 생성
3. 기능성 MRI 데이터 분석
4. 뇌 파 데이터 분석
참고:이 섹션에서 세부 정보 (참조 테이블의 자료 에 대 한 상세) 사용 되는 소프트웨어와 관련 있을 수 있습니다. 다른 소프트웨어 패키지를 사용 하는 경우 해당 설명서를 참조 하십시오.
5. spatiotemporal fMRI 제약-EG 소스 이미징
기본적인 수준에서 뇌 파 소스 지역화 앞으로 역 문제를 해결 하는 포함 한다. 구축 하 고 앞으로 문제를 해결 하는 데 필요한 구성 요소는 그림 5C에 표시 됩니다. 주제-특정 T1 이미지, 3 개의 층을 사용 하 여-뇌, 두개골, 그리고 피부-세그먼트 고 메쉬. 이러한 레이어 벰 모델 생성에 대 한 입력으로 제공 됩니다. 마찬가지로, 피사체의 회색 문제 계층 구조 MRI에서 세그먼트 되었고 소스 공간을 구성 하는 데 사용. 뇌 파 센서 위치 공동 엄밀한 기하학적 변환의 시리즈를 사용 하 여 머리 모델에 등록 했다. 앞으로 모델 어떻게 전기 활동을 대표 하면, 두 피에 각 뇌 파 센서 위치에 잠재적인 측정을 야기할 것 이라고 소스 공간에 어떤 위치에서 발생.
fMRI는 뇌 기능 활동 우수한 공간 해상도와 정확도의 3D 이미지를 제공합니다. 기존의 fMRI 분석 특정 작업에 의해 크게 활성화 뇌 복을 식별 하는 GLM 메서드를 다음과 같습니다. 이 분석의 일반적인 결과 fMRI 활성화 지도: 단일 뇌 지도 그림 6의A와 같이 회색 물질 표면에 투영 될 수 있는 활성 복을 강조. 우리는 추가 하위 지도, 어떤 특정 시간 창 (그림 6B) 뇌 파 측정 두 피 잠재력 지역화에 대 한 잠재적인 공간 사전으로 각 행동에 취득된 활성화 지도 나눕니다. 그림 8 위에서 설명한 제한 spatiotemporal fMRI 소스 분석의 초점 을된 회로도를 나타냅니다. FMRI 활성화 지도의 적절 한 부분 집합만 지정 된 창 크기에 해당 뇌 파 데이터 세그먼트에 대 한 뇌 파 소스 재건을 생성 하는 데 사용 됩니다. 모든 뇌 파 시간-윈도우, 분석으로 대뇌 피 질의 활동의 완전 한 개조 완화 적용 하는 모든 뇌 파 시간 지점에서 같은 fMRI priors의 공간 바이어스 spatiotemporally 특정 패션에서 이루어집니다.
우리는 시각/모터 활성화 작업 연구9, 모터 출력 시각 입력에서 두뇌 활동의 순서는에 적용 될 때 제한 된 spatiotemporal fMRI 소스 분석 방법의 성공적인 응용 프로그램 입증 복구 높은 spatiotemporal 정확도 (그림 9). 창 크기에 대 한 사용자의 선택에 일부 의존 하는 동안 복원된 소스 이미징 결과 그림 10에서 같이 일반적으로 강력한 변화를 했다. 이 위해, 창 크기를 선택 해야 합니다는 실험에 의해 (즉, 창 크기가 너무 클 증명할 수 급속 한 활동 또는 진동, 잘못 된 창 크기 너무 짧은 낮은 주파수 신호를 놓칠 수 있습니다 하는 동안 그들의 특별 한 연구에 가장 적합 하 ) (그림 10).

그림 1 : 두 피 뇌 파 임피던스 검사. 레코더 소프트웨어 사용자 인터페이스, 프로토콜 단계 1.2 키 아이콘을 가리키는 화살표가 스크린샷. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.

그림 2 : 하드웨어 설치를 기록 하는 동시 EEG/fMRI의 도식-규모에 그려진 하지. (1) 스캐너; (2) 참가자 입고 gelled 뇌 파 수동 모자; (3) 뇌 파 증폭기와 파워 팩 연결 EEG 모자; (4) 광학 섬유 케이블 앰프를 연결 하는 USB 2 어댑터 (라고도 부); (5) 부, 증폭기 및 녹음 컴퓨터; 간의 인터페이스 (6) 데이터 수집 컴퓨터; (7) 패러다임 프레 젠 테이 션 컴퓨터, 익스프레스 카드 출력 이벤트 타이밍 마커;를 갖춘 (8) 트랜지스터-트랜지스터 논리 (TTL) 트리거 케이블, 프레 젠 테이 션 컴퓨터와 미스터 스캐너 하드웨어 이벤트 타이밍 마커 부;를 제공 (9) 미스터 스캐너 하드웨어 타이밍 마커 (10)의 시작에서 제공 하는 새로운 fMRI 슬라이스/볼륨 수집 및 (11) 시계 동기화를 신호; (12) 시계 동기화 장치, 뇌 파 증폭기의 시계와 미스터 스캐너 시계; 간의 동기화를 제공 하 (13) 인터페이스 모듈, 미스터-스캐너와 시계 동기화 장치; 사이 인터페이스 (14) 실험 패러다임;의 시각적 표시에 대 한 모니터 (제어 실에서 스캐너 룸 볼 15) 유리 창. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.

그림 3 : 실험 패러다임. 제목 두 가지 범주 중 하나에 속하는 시각적 자극의 시리즈를 표시 했다: 쾌적 한 얼굴과 불쾌 한 얼굴12. 각 재판에서 50 s 녹색 화면 기준선은 줬던, 무작위로 선택 된 10 s 시각적 자극에 의해 따라. 주제는, 자극의 전체 기간에 대 한 자신의 오른손으로 고무공을 쥐 어 짜기로 했다 경우 이미지는 불쾌 한 얼굴 인식 되었다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.

그림 4 : EEG 데이터 기록의 스크린샷을. 녹음 과정에서 뇌 파 데이터의 대표 섹션. (A) 펄스 시퀀스를 fMRI로 뇌 파 기간 데이터 적용, 미스터 스캐너 아티팩트 발음 됩니다. (B) 뇌 파 기간 데이터 fMRI 펄스 시퀀스 없이, 아니 분명 미스터 스캐너 아티팩트 볼 수 있습니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.

그림 5 : 앞으로 모델 생성. (A) 머리 모형 공간에 뇌 파 전극의 정렬. 빨간색과 파란색 원 대표 디지털된 EEG 센서 위치, 노란색 동그라미 나타냅니다 디지털된 EEG 표준 포인트: 교정, preauricular, 왼쪽 오른쪽 preauricular. (B) 수동 변환, 번역 등 뇌 파 센서 공간 (프로토콜 단계 2.4)의 회전을 포함 하 여 센서 정렬 프로세스에 대 한 옵션. (C) 주제 특정 벰 모델 생성, 3 구획을 포함 하 여: (3) 뇌, (4) 두개골, 그리고 (5) 피부. (1) 백 질 층의 표면에 분산된 소스 공간. (2) 뇌 파 센서 위치는 모델에 정렬 됩니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.

그림 6 : fMRI 활성화 지도 및 관심 영역 추출. (A) fMRI 활성화 지도 검사의 용이성에 대 한 비정상적된 표면에 표시. 영역 색상 코딩 빨간색에서과 노란색은 크게 활성화 (p-수정 < 0.05). (B) 의 fMRI 활성화 지도에서 추출한 8 대표 영역입니다. Atlas 기반 분리 3 priors에 모터 활동의 note 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.

그림 7 : 분석기 소프트웨어 사용자 인터페이스의 스크린샷-미스터 스캐너 유물의 제거. (A) 스캐너 아티팩트 수정 하기 전에: fMRI 펄스 시퀀스;의 시작 전에 뇌 파 데이터 섹션 (a) (fMRI 펄스 시퀀스 중 b) 뇌 파 데이터 섹션, 스캐너 아티팩트 명확 하 게 볼 수 있습니다; (c) 주파수 (FFT)의 콘텐츠 데이터 섹션 (b); (스캐너 그라데이션 유물 보정 및 cardioballistic 유물 수정에 대 한 분석기 d) 소프트웨어의 기본 제공 분석 모듈. 스캐너 유물 보정 후 (B) : 미스터 스캐너 유물; 제거 후 뇌 파 데이터 섹션 (a) (b) 주파수 (FFT)의 콘텐츠 데이터 섹션에 (a). 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.

그림 8 : 전체 분석 프로세스의 도식. (A) 뇌 파 데이터 처리 및 창 크기 선택. (B) fMRI 데이터 분석, 소스 분석을 위한 공간 priors로 사용할 관심 영역 추출에 의해 따라. (C) 소스 분석 창 크기와 % 오버랩에 의해 지정 된 각 뇌 파 세그먼트에서 수행 합니다. (D) 완료의 시간 과정 동안 대뇌 피 질의 활동을 재건. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.

그림 9 : 복원된 대뇌 피 질의 활동 한 대표적인 주제의 시각/모터 활성화 패러다임을 받았다. 두 방법을 대조에서 재구성 결과 소스: spatiotemporal fMRI 제한 (위)와 시간 불변 fMRI 제한 소스 영상 (아래). 그림 참조9에서 허가로 재현. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.

그림 10 : 다른 창 크기를 사용 하 여 대상 피 질에서 활동 시간-과정을 재구성. (a) 활동 시간-코스 작은 창 크기를 사용 하 여 개축 매우 비슷한 결과 보였다 (상관 R > 0.95). (b) 더 큰 창 크기를 사용 하 여 높은 불균형 귀착되 었 다 (R < 0.7). 그림 참조9에서 허가로 재현. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.
저자는 공개 없다.
이미징 방법, 방법, 이미징 spatiotemporal fMRI 제한 된 뇌 파 소스 라고 하는 뇌 파 fMRI multimodal 여기 설명 되어 있습니다. 제시 방법 고용 조건에 따라 활성 fMRI 하위 지도, 또는 priors, 공간 특이성을 향상 하 고 잘못 된 결과 제한 하는 방식으로 뇌 파 소스 지역화 가이드.
이 작품 NIH DK082644, 휴스턴 대학에 지원 했다.
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