모 세관 전자 초점 단백질과 매우 작은 생물 학적 샘플에서 그들의 isoforms의 상세한 특성을 사용 하는 항 체 기반, 磁, 높은 처리량 기법입니다. 다음 자동화 하 고 운반할 방식 검색 및 특정 단백질과 그들의 isoforms의 정량화에 대 한 프로토콜을 설명합니다.
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모 세관 전자 초점 단백질과 매우 작은 생물 학적 샘플에서 그들의 isoforms의 상세한 특성을 사용 하는 항 체 기반, 磁, 높은 처리량 기법입니다. 다음 자동화 하 고 운반할 방식 검색 및 특정 단백질과 그들의 isoforms의 정량화에 대 한 프로토콜을 설명합니다.
Immunoblotting 생물학 견본에서 단백질 특성에 대 한 많은 실험실에서 일상적인 기술 되고있다. 대체 전략을 제공 하는 다음 프로토콜, 기존의 immunoblotting 모 세관 (cIEF), 많은 장점을가지고 초점 전자 비교. 이는 완전 한 서쪽 더 럽 히 절차 수행 ultrathin 모 세관 내부 항 체 기반, 자동, 급속 한, 및 양적 방법입니다. 이 기술은 젤 막,도 말의 스트립 전송 필요 또는 기존의 immunoblotting에 일반적으로 필요한 영화를 x 선 하지 않습니다. 여기, 단백질 분리 (전자 포인트, pI) 그들의 책임에 따라, 사용 하 여 보다는 microliter (400 nL) 총 단백질 lysate의. 전기 이동 법, 후 단백질 자외선 빛 치료, 기본 및 보조 (양 고추냉이 과산화 효소 (HRP) 활용)에 의해 모 세관 벽에 움직일 수 있다 항 체 외피, 누구의 바인딩을 통해 감지 향상 화학 (ECL), 점령 하 고 전 하 결합 소자 (CCD) 카메라에 의해 기록 된 수 있는 광 신호를 생성 한다. 디지털 이미지 분석 될 수 있다 및 계량 (피크 지역) 소프트웨어를 사용 하 여. 이 높은 처리량 절차 한 번;에 96 샘플을 처리할 수 있습니다 매우 민감한, picogram 범위의; 단백질 검출 그리고 자동화 때문에 높은 재현성 결과 생산입니다. 이러한 측면의 모두 매우 귀중 한 때 (예를 들어, 조직 샘플 및 생 검) 샘플의 수량 제한 요소입니다. 기술은 더 넓은 응용 프로그램 뿐만 아니라, 약물 또는 항 체, 바이오 마커 발견 및 진단 목적으로의 심사를 포함 하 여 있다.
모 세관 전자 초점 (cIEF) 그들의 충전1,2,3에 근거 하 여 단백질을 확인 하는 자동화 된, 모 세관 기반 immunoassay입니다. 그것은 매우 재현 하 고 신속 하 고 양적 단백질과 그들의 post-translationally 수정된 isoforms를 해결 하기 위한 능력입니다. 그것은 서쪽에 게 더 럽 히기와 같은 기존의 방법에 대안을 선물 한다. 매우 쉽게 액세스할 수 있는 샘플;에 풍부한 단백질의 존재 확인에 대 한 좋은 서쪽에 게 더 럽 히기 다양성, 시간 소비, 및 정확한 정량 모두 존재 도전, 특히 생물학 조직 샘플을 검사 하는 경우. 실제로, 다양성 서쪽 blotting에 고유의 문제는, 거기에 수많은 단계 참여, 로드 및 SDS 페이지 젤의 실행, 전송, 막에는 단백질의 다양 한 시 약으로 부 화 (예., 기본 및 보조 항 체, ECL), x 선 필름4에 개발. 현재, 서쪽 더 럽 히 기술 chemiluminescent 신호 (디지털 westerns)의 디지털 기록의 구현 개선 이다. 최근, 자동화 된 서쪽 더 럽 히 시스템 개발 되었습니다, 즉 모 세관 서 부, 보다 핸 즈 프리 하 고 젤 무료 시스템입니다. 전체 분석 결과 시스템3,4에 샘플 플레이트 (샘플 모든 필요한 시 약을)의 로드에 따라 자동입니다. 악기는 단백질 분리 등 모든 단계를 수행 합니다 다른 단계, 그리고 개발 및 정량화 chemiluminescent 신호 사이 모 세관 벽, 항 체 외피 단백질의 동원 정지 세척. 따라서, 여기에 제시 된 cIEF 절차는 높은 해상도 감도 제공 합니다.
이 메서드는 중요 한 신호를 생성 고 단백질1의 picograms에서 측정할 수 있습니다. 우수한 재현성 높은 감도이 기술을 임상 샘플의 분석을 위해 매우 유용 하다. 그것은 수 탐지 뿐 아니라 단백질의 포스트 번역 상 수정 (예: 다른 phosphorylated 단백질 isoforms) 구별. 이 기술을 성공적으로 사용 되었습니다 다른 신호 통로4,5 암3, 새로운 치료제 개발을 목표로 하는 임상 연구를 해 부하 고 단백질 바이오 마커 및 약물 발견에 대 한 큰 가능성이 있다 .
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1. 세포 문화, 자극, 및 세포의 용 해
참고:이 방법은 많은 세포 유형으로 사용할 수 있습니다. 방법을 설명 하기 위해 예를 들어 인간의 탯 줄 정 맥 내 피 세포 (HUVECs)를 사용 하 여 설명 되어 있습니다.
2. 샘플 혼합 준비 (150 µ L 샘플 혼합 계산)
3. 시스템 소프트웨어 (그림 1) 새로운 분석 결과 서식 파일을 디자인
4입니다. 프로토콜 cIEF 악기 설정에 대 한
5. 분석 결과 파일을 실행
6. 분석 데이터 (그림 s 1)
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디자인의 새로운 분석 결과: 분석 결과 플레이트 레이아웃 그림 1A에 표시 됩니다. 극대, 96 웰 스 384-잘 접시 12 웰 스의 블록에서에서 각 조건 (항 체)에 대 한 사용할 수 있습니다. 12 우물의 각 블록 A1-A12 또는 A13-A24에서 시작할 수 있습니다. 색상 코드 행 하나 다른 샘플 또는 시 약을 구별할 수 있습니다. 분석 결과 서식 파일 (그림 1B), 그에 대 한 관련 정보에서에서 특정 분석 결과 저장할 수 있습니다, 결과 분석의 나중 단계에서 사용할 수 있는. 그림 1C 는 프로토콜의 요약을 보여 줍니다.
HUVEC lysate에 ph...
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감도 및 단백질의 해상도 proteomic 연구 생물 학적 샘플에 대 한 중요 한 있습니다. 셀에 분 수량에 존재 하는 단백질을 감지할 수 있게 되 고 큰 가치가 있다. cIEF는 향상 된 감도 단백질과 그들의 isoforms4의 검출에 대 한 해상도 제공할 수 있습니다.
이 기술은 많은 proteomic 연구 보고서5,,67에 성공적으로 사용 되었습니다. 그래도, 몇 가지 제한이 연관, 등 모든 주요 항 체 그들은 기존의 immunoblots에서 잘 작동 하는 경우에 신호를 줄 수 있습니다. 아직, 유효한 항 체 때문에이 기술은 아주 새로운 cIEF, 기능 표시의 목록입니다. 마지막으로, 악기 한 번에 미만의 12 샘플 또는 이상의 96 샘플을 처리할 수 없습니다.
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저자는 아무 공개.
저자는 교수 레나 Claesson-웨일스어, 웁살라 대학, 스웨덴이이 프로젝트 개발을 위한 그녀의 지원에 대 한 감사 합니다. 또한, 저자 로스 스미스와 레나 Claesson-웨일스어, 웁살라 대학 그들의 중요 한 읽기 및 원고를 개선 하기 위한 제안을 위한 감사 합니다.
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| 이름 | 회사 | 카탈로그 번호 | 댓글 |
|---|---|---|---|
| NanoPro 1000 | ProteinSimple | ||
| Premix G2, pH 5– 8 (중첩) 분리 구배, pH 2– 4 플러그 | ProteinSimple | 040-972 | Ampholyte premix |
| DMSO 억제제 혼합물 | ProteinSimple | 040-510 | Phosphatase 억제제; cIEF 1:50 희석용 |
| 수성 억제제 혼합 | ProteinSimple | 040-482 | Protease 억제제; cIEF 1:25 희석용 |
| pI 표준 ladder 3 | ProteinSimple | 040-646 | cIEF 1:60 희석용 |
| 시료 사용 희석제 | ProteinSimple | 040-649 | |
| 항체 희석제 | ProteinSimple | 040-309 | |
| Wash concentrate | ProteinSimple | 041-108 | |
| 양극액 리필 | ProteinSimple | 040-337 | |
| 음극질 리필 | ProteinSimple | 040-338 | |
| 과산화물 XDR | 단백질Simple | 041-084 | |
| Luminol | ProteinSimple | 040-652 | |
| Bicine/CHAPS Lysis Buffer | ProteinSimple | 040-764 | |
| Capillaries-Charge Separation (1 pack) for | ProteinSimple | CBS700 | |
| 분석 플레이트/뚜껑 키트 | ProteinSimple | 040-663 | |
| Peroxidase-AffiniPure Donkey Anti-Rabbit IgG (H+L) | 잭슨 이뮤노리서치 | 711-035-152 | cIEF용 사용 (1: 300) |
| Peroxidase-AffiniPure 당나귀 안티-마우스 IgG (H+L) | 잭슨 이뮤노리서치 | 715-035-150 | 사용된 cIEF용 (1: 300) |
| Phospho-Erk 1/2 Primary Antibody | Cell Signaling | 9101 | 사용된 cIEF용 (1: 50) |
| Pan Erk Primary Antibody | Cell Signaling | 9102 | 사용된 cIEF용 (1: 100) |
| Compass software | ProteinSimple | ||
| HUVEC | ATCC | PCS-100-010 | |
| MV2 (EBM-2) | PromoCell | & 주의; C-22221 | 내피 세포 기저 매체 |
| 내피 세포 성장 매체 MV2 SupplementPack | PromoCell | C-39221 | VEGFA 이상의 MV2에 대한 보충 |
| PeproTech | 100-20 | ||
| Long R3 IGF | Sigma-Aldrich | 85580C/I1146 | 인슐린 유사 성장 인자 |
| Bioruptor (Sonicator) | Diagenode | B01020001 | |
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| NuPAGE 4-12% Bis-Tris 단백질 겔 | Thermo Fischer Scientific | NP0322BOX | |
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