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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
이 작품에서는, 우리는 변형 체 falciparum 감염 적혈구에 의해 발표 하는 extracellular 소포 (EVs)의 역할을 조사 하기 위해 프로토콜 설명 합니다. 특히, 우리는 내 피 세포와 EVs의 상호 작용에 초점.
말라리아는 변형 체 기생충으로 인 한 생명이 질병, P. falciparum 되 가장 아프리카 대륙에서 우세 하 고 대부분 말라리아 관련 사망자에 대 한 책임 세계적으로. 조직, 혈관 부전, 및 염증 응답 기생충 격리 등 여러 가지 요인 말라리아에 감염 된 사람들에 있는 질병의 진화에 영향. P. falciparum-감염 된 적혈구 (iRBCs) 출시 작은 extracellular 소포 (EVs) 기생충과 호스트 사이의 pathogenesis 및 휴대 통신을 중재 하는 화물 분자의 다른 종류를 포함. EVs는 효율적으로 있는 그들은 그들의 기능을 조절 하는 세포에 의해 촬영. 여기 우리는 기생충-호스트 상호 작용에서 EVs의 역할을 해결 하기 위해 전략을 논의. 첫째, 우리는 녹색 셀 링커 염료를 사용 하 여 레이블 및 내 피 세포에 의해 EV 국제화를 추적 간단 방법을 설명 합니다. 둘째, 우리 보고 붙일 레이블된 dextran을 사용 하 여 내 피 세포 단층에서 침투성을 측정 하는 간단한 방법. 마지막으로, 우리 내 피 세포 기능에 작은 비 코딩 RNA 분자의 역할을 조사 하는 방법을 보여 줍니다.
세계 보건 기구에 따르면 말라리아의 212 백만 새로운 경우 2015 년에 전세계 있었고 약 429,000 명이 사망, 주로 어린이 나이1의 5 년. 종종 연관 된 혈관 부전, 심한 질병으로 이어지는 메커니즘 남아 병이 정의2. 변형 체iRBCs extracellular 소포 (EVs)로 알려진 작은 이중 지질 막 분야 분 비. 그것은 알려져 이러한 EVs는 잠재적으로 관련 감염 프로세스 및 호스트 면역 반응 감염; 그러나, 약간 말라리아 감염3동안 이러한 작은 소포의 정확한 기능에 대 한 알려져 있다. 그들은 두 가지 중요 한 역할을 재생 가능: 한 반면에, 그들은 수 있습니다 기여할 병 인 세포4,5;를 활성화 하 여 그리고 다른 한편으로, 그들은 셀룰러 통신 기생충 및 기생충과 호스트6,7을 중재할 수 있습니다. 사실, EVs를 통해 서로 간의 기생충 단백질 또는 핵 산을 전송할 수 있습니다. 예를 들어 Trypanosoma brucei rhodesiense EVs 독성 요소 Serum Resistance-Associated (SRA)를 전송할 수 있습니다 그리고 다른 T. brucei 와 호스트 모두 적혈구8타겟팅 할 수 있습니다. 또한, P. falciparumiRBCs EVs 내의 핵 산을 전송 하 여 서로 간에 통신 합니다. 기생충을 최적화 하 고의 성장을 동기화 수 있습니다. 사실, EVs gametocyte 변환의 주요 레 귤 레이 터 수 되 고 따라서 전송 단계7의 규정에 기여.
뿐만 아니라 EVs는 기생충을 통제, 그들은 또한 기생충-호스트 상호 작용을 중재. 우리는 최근에 iRBCs에서 EVs 호스트 파생 microRNAs (miRNAs; 21-25의 뉴클레오티드9의 범위에 작은 RNA 종) 인간의 내 피 세포에 의해 채택 되었다을 포함 발견 했다. EVs에 miRNAs 안정 Ago2와 복잡 한 형성 (구성원 RNA 유도 침묵의 복잡 한), 받는 사람 세포에 전달 되 면 구체적으로 유전자 발현을 침묵 하 고 셀10의 장벽 속성에 영향을 미치는입니다. 표준 프로토콜 EVs의 기능을 조사 하기 위해 개발 되었습니다. 자, 먼저 받는 사람 세포에 의해 그들의 통풍 관을 조사 하기 위해 EVs의 형광 라벨 수 있는 프로토콜을 설명 합니다. 또한, confocal 현미경을 사용 하 여 셀 내부 EV의 운명을 추적 수는. 여러 형광 염료 EVs를 추적을 사용할 수 있습니다. 아민-반응성 염료, 5-(and-6) Carboxyfluorescein Diacetate Succinimidyl 에스테 르 (CFSE) 그리고는 소포 안에 한 번 Calcein-오전 될 형광. 밝게 하 고 더 많은 일정 한 신호를 제공 하기 때문에 우리 PKH, amphiphilic 레이블을 사용을 선호 합니다. 이 방법은 EVs와 받는 사람 세포 간의 상호 작용을 이해 하는 중요 한 정보를 제공 합니다. 경우에 따라 EVs는 세포의 표면에 묶는, 하는 동안 일부 소포는 급속 하 게 채택 되었다. 글귀, 시 EVs는 그들은 그들의 규정 하는 기능을 발휘 하는 세포에 그들의 화물을 제공 합니다.
여기, 우리는 세포 단층을 통해 형광 dextran의 전송을 측정 하 여 체 외에서 내 피 세포의 장벽 기능을 측정 하는 프로토콜을 설명 합니다. 방사선된 마커 같은 더 민감한 추적기를 사용할 수 있습니다. 그러나, 그들은 사용 하기 위해 특별 한 안전 조치를 요구 한다. 다른 분석 실험 꽉 접합 무결성 측정 transendothelial 전기 저항 (TEER) 같은 생체 외에서 의 장벽 기능을 측정 하기 위해 존재 한다. 마지막으로 조로-1, 긴밀 접합 단백질 면역 형광에 의해 시각화 뿐만 아니라10으로 꽉 접합 무결성 평가 수 있습니다. EVs 잠재적인 규정 특성을 가진 여러 화물을 포함 하는 복잡 하 고 유형이 다른 엔터티 있기 때문에, 그것을 받는 사람 세포에 미치는 영향을 연구 하는 특정 RNA overexpress 유용 합니다. 따라서, 우리는 또한 관심10의 miRNA를 표현 안정적 셀 라인을 생성 하는 것을 목표로 하는 프로토콜을 정의 합니다.
인간의 Rbc는 Swissethics (swissethics.ch)의 지침에 따라 건강 한 기증자의 혈액에서 얻은 했다.
참고: P. falciparum 기생충 문화 (3D 7)와 EV 생산은 이전에 설명 된 Mbagwu, 외 알. 11 P. falciparum 인간의 병원 체 이기 때문에 처리에 대 한 현지 규정을 참조 하십시오. 문화는 유지 되어야 한다 살 균 전체 시간.
1. 형광 EVs의 라벨
참고: 다음 절차는 EV 막의 지질 지역에서 큰 지방 족 꼬리와 안정적으로 녹색 형광 염료 (PKH67)를 통합 하는 라벨 기술 이용 합니다. 반응은 200 µ L PKH67의 20 µ M 최종 농도 포함 하는 볼륨을 얼룩 마지막에 수행 됩니다. 주위 온도 (20-25 ° C)에서 모든 단계를 수행
2. Confocal 현미경 검사 법에 의해 EVs의 시각화
참고: 다음 프로토콜 설명 유리 coverslips에 성장 하는 내 피 세포에 의해 EV 국제화의 추적을 합니다. 내 피 세포는 반 불멸 하 게 인간의 골 수 내 피 세포12에 설명 된 대로.
3. 내 피 세포 침투성
참고: 내 피 세포 침투성 내 피 세포 단층에 걸쳐 rhodamine B isothiocyanate-dextran (평균 MW 70000)의 이전을 측정 하 여 평가입니다. Dextran 혈관 침투성을 공부 하는 훌륭한 도구를 제공 합니다.
4. 결정 Puromycin 감도
참고: lentivirus와 셀 라인을 시험 하기 전에 그것은 그 특정 셀 라인에 대 한 선택 된 약물의 kill 곡선을 결정 하는 것이 중요. 모든 셀, 선택 된 약물의 증가 복용량을 사용 하는 복용량 응답 실험을 수행 하는 데 필요한 약물 농도의 최소 금액을 결정 합니다. 각 포유류 세포 라인 실험, 전에 다른 감도 있기 때문에 항생제의 최적 농도 아래 서 kill 곡선 적정 개발 하 여 결정 되어야 합니다.
5. 변환 Lentiviral 벡터와 내 피 세포의
여기, 우리 호스트 셀 EVs의 상호 작용을 조사 하는 프로토콜을 설명 합니다. 붙일 레이블된 EVs의 글귀는 confocal 현미경 검사 법 (그림 1)에 의해 모니터링 됩니다. 그러나 내 피 세포 효율적으로 차지 EVs, EVs와 보육 시간 통풍 관을 추적 하기 위해 낙관 될 수 있다. 셀 내부 EVs의 더 나은 지역화, phalloidin와 말라 얼룩. 다음, 우리는 내 피 세포의 단층 성장 필터 멤브레인을 사용 합니다. Rhodamine B isothiocyanate-dextran 필터 멤브레인의 최고 약 실에 적용 하 고 내 피 단층의 침투성 바닥 챔버 (그림 2A)에 형광 dextran의 전송을 모니터링 하 여 측정 된다. 일반적으로, 내 피 세포의 침투성은 EVs (그림 2B)의 증가 금액으로 부 화에 따라 영향을 받습니다. 그들은 우물을 통해 단층, 그렇지 않으면 염료는 신속 하 게 확산을 형성할 것 이다 다는 것을 확인 하는 몇 일 동안 세포를 성장 하는 것이 중요 하다. 그것은 중요 한 것은 치료 없이는 dextran 것 이다 확산 천천히 셀 단층을 통해입니다.
MicroRNAs EVs의 핵심 구성 요소 받는 사람 세포를 전송 후, 그들은 유전자 발현 조절. 특히 miRNAs의 역할을 조사 하기 위해 받는 사람 셀 라인에 그들을 overexpress에 매우 유용 하다. 여기는 내 피 세포로 miRNAs transduce 하는 방법에 설명 합니다. 첫 번째 단계 puromycin 안정적 불리고 세포 (그림 4A)을 선택 하려면 내 피 세포를 죽이의 농도 결정 해 이루어져 있다. 마지막으로,는 miRNAs의 표현의 수준은 제어 하 고 정량 (그림 4B)에 의해 검증 될 수 있습니다.

그림 1: EVs는 내 피 세포에 의해 채택. 순화 EVs는 PKH67, 녹색에 내 피 세포의 단층으로 4 h incubated 표시 했다. 치료 되지 않는 내 피 세포는 부정적인 컨트롤로 사용 됩니다. 씻은 후 광범위 한 언바운드 EVs를 제거 하려면, 셀 걸 (빨간색) 얼룩 phalloidin와 핵 (파란색) 얼룩 Hoechst 33342 스테인드 했다. 세포는 confocal 현미경 검사 법에 의해 관찰 되었다. 이미지는 레이저 confocal 현미경 및 63 x 1.3 나 오일 목표를 사용 하 여 촬영 했다. Hoechst 33342 405에 흥분은 nm와 배출 수집 450-470 nm (파랑); PKH67 488에 흥분은 nm, 505-530 nm (녹색); 수집 배출량 그리고 Phalloidin-594 543에서 흥분 nm, 배출량 620에서 수집 된 nm. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.

그림 2: 내 피 장벽에 EV 통풍 관의 효과. Dextran rhodamine 표시의 보급의 개략도 (A): 내 피 세포 성장 필터 멤브레인 위에 합류, 형광 dextran 상단 챔버에 적용 되 고 막 통해 시간이 지남에 확산. 침투성에 EVs의 효과입니다 상단 챔버에 EVs의 추가 후 아래쪽 챔버에 dextran의 보급의 속도 측정 하 여 평가 됩니다. EVs의 (B) 증가 금액 내 피 세포와 알을 품는. 시간이 지남에 트랜스-잘 막에 걸쳐 dextran rhodamine 표시의 전송 침투성 측정 할 수 있습니다. 침투성 내 피 계층에 걸쳐 50, 100 µ g/mL EVs의 외피의 2 h 후 크게 증가 된다. 데이터 3 실험에서 평균을 (± s.e.m.)을 나타냅니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.

그림 3: puromycin의 적정. Puromycin (10mg/mL)의 재고 솔루션 10% 열 비활성화 (56 ° C, 30 분) 태아 송아지 혈 청, 2mm 글루타민, 1mm 나트륨 pyruvate, 100 U/mL 페니실린/스 보충 RPMI 1640에 희석입니다. 15 µ L의 총 관 a.에 있는 매체의 10 mL에 추가 됩니다. 다음 튜브 A에서 솔루션의 7.5 mL 튜브 B. RPMI의 2.5 mL를 혼합 마지막으로, 희석의 100 µ L 7.5 µ L/mL, 5.62 µ L/mL의 최종 농도 게 셀의 100 µ L에 추가 됩니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.

그림 4: miR451a overexpressing 내 피 세포의 생성. 내 피 세포에 puromycin의 살인 곡선의 (A) 결정. 내 피 세포 puromycin 복용량을 증가 함께 알을 품을 했다. 생존은 MTS 분석 결과 72 h 후에 측정 됩니다. 데이터는 하나의 대표적인 실험의 평균을 (± s.e.m.)을 나타냅니다. (B) RNAs miR451a overexpressing 내 피 세포에서 파생 된 또는 부정적인 제어 수확 했다 그리고 miR451a 사본 실시간 PCR에 의해 공인 되었다. 정량 결과가 정부 유전자로 u 6을 사용 하 여 2 Ct 방법으로 정규화 하 고 (± s.e.m.) 의미를 표현 (n = 3 실험). 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.
저자는 공개 없다.
이 작품에서는, 우리는 변형 체 falciparum 감염 적혈구에 의해 발표 하는 extracellular 소포 (EVs)의 역할을 조사 하기 위해 프로토콜 설명 합니다. 특히, 우리는 내 피 세포와 EVs의 상호 작용에 초점.
이 연구 재정적으로 일부 의학-생물학 연구 (미국적)를,는 고트프리트 줄리아 Bangerter-Rhyner-재단 (MW 미국적)를, 그리고 Fribourg의 대학 (에 미국적)의 연구 수영장에 대 한 노바 티 스 재단에 의해 지원 되었다. 추가 보조금 외국 학자 (갑과 SM) 스위스 정부 우수 장학금 포함 됩니다. 우리 기술 지원에 대 한 이자벨 Fellay와 Solange Kharoubi 헤스 감사합니다.
| PKH67 녹색 형광 세포 링커 미니 키트 | Sigma-Aldrich | MINI67-1KT | |
| 희석제 C | Sigma-Aldrich | G8278 | |
| 폴리-L-라이신 | Sigma-Aldrich | P8920 | |
| PBS | ThermoFisher - Gibco | 10010023 | |
| Phalloidin CF594 | Biotium | #00045 | |
| Hoechst 33342 | ThermoFisher | H3570 | |
| ProLong Gold Antifade Mountant | ThermoFisher | P36934 | |
| Rhodamine B isothiocyanate– Dextran | ThermoFisher | R9379-250MG | |
| PET 막 투명 Falcon 삽입물 플레이트 24 웰 | Falcon | 353095 | |
| 내피 세포 성장 중간 MV | Promocell | C-22020 | |
| Puromycin dihydrochloride | Sigma-Aldrich | P9620-10ML | |
| MTS 세포 증식 색량 분석 키트 | Biovision | K300-500 | |
| hexadimethrine bromide | Sigma-Aldrich | 107689-10G | |
| MISSION Lenti microRNA, Human has-miR-451a | Sigma-Aldrich | HLMIR0583 | |
| MISSION Lenti microRNA, ath-miR416, Negative Control 1 Transduction | Particles Sigma-Aldrich | NCLMIR001 | |
| MISSION Lenti microRNA, Human | Sigma-Aldrich | NCLMIR0001 | |
| Leica TCS SP5 | Leica Microsystems | ||
| miRNeasy 미니 키트 | Qiagen | 217004 | |
| TaqMan MicroRNA 역전사 키트 1000 반응 | ThermoFisher | 4366597 | |
| has-mir-451a RT/750 PCR rxns | ThermoFisher | 001141 | |
| U6 snRNA | ThermoFisher | 001973 | |
| TaqMan Universal Master Mix II, with UNG | ThermoFisher | 4440038 | |
| StepOnePlus Real-Time PCR System | ThermoFisher | 4376600 |