이 프로토콜에는 구두 노출 및 감염 세균성 병원 체, 과일 파리 초파리 melanogaster 하 고 전염 성 박테리아 헛간 창 자 감염을 다음의 수를 측정 하는 방법을 설명 합니다. 우리는 더 비행 생존 다음 구강 세균 감염에 면역 돌연변이의 효과 설명 합니다.
이 프로토콜에는 구두 노출 및 감염 세균성 병원 체, 과일 파리 초파리 melanogaster 하 고 전염 성 박테리아 헛간 창 자 감염을 다음의 수를 측정 하는 방법을 설명 합니다. 우리는 더 비행 생존 다음 구강 세균 감염에 면역 돌연변이의 효과 설명 합니다.
과일 파리 초파리 melanogaster 감염 및 타고 난 면제의 최고의 개발된 모델 시스템 중 하나입니다. 대부분의 작업은 조직의 감염을 중점적으로, 구두로 파리 감염 방법이 필요로 하는 병원 균을 창 자 immunocompetence의 메커니즘에 대 한 관심의 최근 증가 되었습니다. 여기 선물이 구두로 개별 파리 기회 주의 세균성 병원 체 (녹 농 균)와 D. melanogaster (녹 entomophila)의 자연 스러운 세균성 병원 체에 노출 하는 프로토콜. 이 프로토콜의 목표는 이러한 병원 균을 남성과 여성의 파리를 노출 하는 강력한 방법을 제공. 우리는 관련 병원 체의 전송에 있는 연구에 대 한 생존 고기, 미생물 부하, 흘리기, 박테리아를 보여주는 대표적인 결과 제공 합니다. 마지막으로, 우리 확인 Dcy 돌연변이 (창 자 상피의 보호 peritrophic 매트릭스 부족) 및 돌연변이 (부족 기능 면역 결핍 (IMD) 통로) 양념, 구강 세균 감염에 걸릴 표시. 이 프로토콜은 따라서, 파리 감염, 창 자 감염 결과 세균 전송에 변화의 다양 한 유전과 환경 자원의 연구에 확장 될 수 있는 구강 경로 사용 하 여 감염 하는 강력한 방법을 설명 합니다.
과일 파리 (로 알려진 식초 비행), D. melanogaster, 광범위 하 게 사용 되었습니다 모델 생물으로 감염 및 병원 체1,2의 다양 한에 대 한 면역에 대 한. 이 작품은 감염의 생리 적인 결과에 대 한 근본적인 통찰력을 제공 하고있다 하 고 또한 기본 parasitoid, 세균, 곰 팡이, 및 바이러스 감염에 대 한 호스트 면역 반응을 분자 경로 탈피에 개척 했다. 이 지식 뿐만 아니라 곤충과 다른 무척 추 동물의 타고 난 면역 반응을 이해 하는 데 유용 하지만 초파리 발견이는 했다 면역 메커니즘의 많은 곤충과 포유류 사이 보존 진화론은, 때문에 또한 있다 포유류에서 주요 면역 메커니즘의 인간3를 포함 하 여.
Drosophila 감염 및 면역에 대부분 작업 조직의 감염, 샤프트의 또는 분사4,,56곤충의 몸으로 직접 병원 균을 제공 하는 접종 방법을 사용 하 여에 집중 했다. 허용 제어 감염 복용량의 납품에이 방법의 장점은 명확 하 고 조직의 감염에 대 한 작업의 큰 몸에 의해 지원. 그러나 D. melanogaster 의 많은 자연적 사건 세균 병원 균 용기 immunocompetence 호스트 방어7,8, 에 중요 한 역할을 담당 하는 유기 물 분해에 먹이 통해 취득 되는, 9 , 10 , 11 , 12 , 13 , 14 , 15. 조직의 감염을 사용 하는 실험 이러한 방어를 무시 하 고, 따라서 곤충 자연 병원 균에 대 한 방어를 탑재 하는 방법의 완전히 다른 그림을 제공. 이것은 특히 관련 된 작업의 목표 어디 자연 병원 체의 사용 및 감염의 경로 중요 한16,17생태와 감염의 진화에 대 한 예측을 테스트 하는 경우 이다. 최근 작품 병원 체에 의해 크게 촬영 경로 질병 결과18,19에 미치는 영향을 강조 했다, 고유 면역 경로20,21elicits의 보호 효과 확인할 수 있습니다. endosymbionts16, 상속 그리고 심지어 플레이 호스트 방어17의 진화에 중요 한 역할을 수 있습니다.
또 다른 이유는 감염의 구두 노선 고용 배설물 배설 구강 감염22,23, 를 다음 중 세균성 흘리기를 측정 하 여 변화 조사 병원 체 전송에서 수 있다는 점입니다 24. 자연 인구25,26, 도전 호스트가 질병 전송에서의 소스를 이해 하지만 전송, 제어 실험실에서 발산 하는 병원 체 등의 구성 요소를 측정 조건27유용한 대체 접근 제공 합니다. 먹이 파리 박테리아와 유전과 환경 컨텍스트 제어 실험 조건에서의 다양 한에서 발산 하는 측정 박테리아, 전송 호스트 사이에서 변이의 소스를 식별 가능 하다.
여기, 우리가 구두 D. melanogaster 세균성 병원 균 감염에 대 한 프로토콜을 설명 하 고 박테리아의 성장을 측정 하 고 흘리기에 대 한 그 다음 (그림 1). 우리 두 슈 도모 나 스 박테리아에이 프로토콜 설명: 피 녹 농 균 (PA14), 기회 주의 병원 체의 악성 긴장 그리고 병원 체 P. entomophila비행 자연의 보다 적게 악성 긴장. Pseudomonads는 광범위 한 호스트 범위, 곤충, 선 충, 식물 및 척추 동물, 감염 일반적인 그람 음성 박테리아 이며 대부분 환경4,6에서 발견 된다. 장 epithelia12,13,,1415, 병리학에서 결과 초파리 피 녹 농 균 및 P. entomophila 의 장 감염 28. 그러나 우리가이 두 세균성 병원 체에 초점을, 여기에 설명 된 방법은 적용할 수 있는 원칙에 작은 수정에 대 한 관심의 모든 세균성 병원 체에. 구두 노출, 다음 우리는 감염 된 후 생존, 측정 하 고 개별 파리 내 미생물 부하 측정 그리고 가능한 미생물 환경, 콜로 니 형성 단위 (CFUs) 표현으로 창 고. 마지막으로, 발생 하기 때문에 창 자 immunocompetence 상피 방 벽 및 체액 응답의 조합에서 우리는 또한 이러한 방어 방해는 비행 거리 선의 생존을 측정 합니다. 특히, Drosocrystallin (Dcy) 돌연변이 이전 용기29에 고갈 된 peritrophic 매트릭스 때문에 구강 세균 감염에 더 취약 되도록 표시 되었습니다. 우리는 또한 IMD 통로30를 통해 그람 음성 세균에 대해 항균 성 펩 티 드 생산에서 장애가 있는 양념 (Rel) 돌연변이에 생존을 측정 합니다.
1. 파리를 유지
2. 준비 실험 파리
3. 세균성 문화
4. 구두 파리 감염
5. 녹음 Survivorship 감염 다음
6. 세균 부하 측정
7. 측정 세균성 흘리기
여기, 선물이 실험에서 설명 결과 D. melanogaster P. 농 균 또는 P. entomophila구두로 감염 되었다. 그림 2 설명 OD600 의 세균성 문화에 12h 또는 24h 노출 기간에 따라 파리의 성공적인 구강 감염 = 25, 100 P. 녹 농 균 (그림 2A)을 P. entomophila (그림 2B C), 각각. 그림 2B P. entomophila, 파리 큰 광학 밀도의 세균성 문화에 노출 되 면 세균성 부하에서 증가 의해 표시의 더 집중된 문화 사용의 중요성을 보여 줍니다. 남성과 여성의 오 레 곤 R (OreR) 파리 같은 속도 (그림 3) P. 녹 농 균 감염 하 고 피 농 균 CFUs (그림 4A)의 동일한 수를 창 고. 그러나 P. entomophila 감염, 남성과 여성의 OreR 파리 (그림 4B) 시간에 따라 변화 하는 방식으로 박테리아 헛간의 수에 차이가 있습니다. 남성과 여성 서로 다른 속도로 P. 녹 농 균 (그림 5A), P. entomophila (그림 5B)에서 죽어. 우리는 또한 Dcy 돌연변이 (이 창 자 상피의 보호 peritrophic 매트릭스 부족) 및 양념 돌연변이 (이 기능 IMD 면역 통로 부족), 다음 P. entomophila 및 P. 농 균 감소 생존 표시 참조 구강 감염 (그림 5C).

그림 1: 생존, 흘리기, 그리고 초파리 melanogaster구강 감염 다음 내부 세균 부하를 측정 하기 위한 프로토콜의 개요 개요. 3 잠재적인 실험 D. melanogaster의 구강 감염을 다음의 그림. 튜브를 단일 파리를 전송 하 고 감염 된 그들의 수명을 기록 하 여 '생존'을 측정 합니다. '피 눈물' 단일 파리 1.5 mL microcentrifuge 튜브 뚜껑에 루이스 매체의 50 µ L 전송 하 여 측정 합니다. 튜브에서 24 시간 후 비행 및 소용돌이 1 x PBS의 100 µ L로 튜브를 제거 합니다. 제거 하 고 파운드 영양 한 천 세균성 흘리기 계산 하에이 솔루션을 접시. 흘리기 동일한 비행에 경도, 24 h 후 뚜껑에 루이스 매체와 신선한 튜브에 파리를 전송 하 고 세척 하 고 지금 오염 된 튜브를 도금 하 여 측정 합니다. 파리의 '내부 부하'는 감염 된 비행, 표면 살 균, 그리고 마지막으로 파운드 영양 한 천에 homogenate를 도금 하기 전에 조직 하 여 측정할 수 있습니다. 이 계산에 측정 되었다 흘리기 후 수행할 수 있습니다 어떻게 '내부 부하'와 발산 상관. 이 그림에 사용 된 플라이 그림 원래 B. Nuhanen36에 의해 그려진 했다. 저자는 위키미디어37에서 찍은 예 카 플 란-마이어 곡선을 동반 하는 그것을 수정 했습니다. 다른 모든 삽화는 원래. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.

그림 2: 다음 구강 감염 박테리아의 감염 복용량. (A) 남성 및 여성의 오 레 곤-R의 감염 복용량 P. 농 균 문화에 노출 다음 파리 (OD600 = 25) 12 h에 대 한. 평균 및 SE 3 남성 3 여성에서 계산 했다. 4 P. entomophila 문화 중 하나에 노출 다음 outcrossed 야생 형 암컷의 (B) 감염 복용량 (OD600 = 100, 75, 50, 그리고 25) 24 시간 5% 자당 해결책을 제어 또는. 통계적 차이 (F3,76 = 18.567, p < 0.001) 노출 치료 사이 감염 복용량에 바 위에 다른 문자로 표시 됩니다. 수단 OD600 5 파리에서 계산 된 = 0 복용량, 및 모든 다른 복용량에 대 한 18-20. (C) 남성과 여성의 오 레 곤-R의 감염 복용량 P. entomophila 문화에 노출 다음 파리 (OD600 = 100) 24 h에 대 한. 평균 및 SE 20 남성 및 20 여성에서 계산 했다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.

그림 3: 내부 P. 농 균 부하 구강 감염 후 파리에서. 남성 및 여성의 오 레 곤-R의 평균 ± SE 세균성 부하 P. 농 균 구강 감염 다음 파리 (OD600 = 25) 최대 168 h 후 감염. 평균 고 각 시간 점의 SE 3 개인에서 계산 됩니다. 파리의 내부 세균 부하 시간에 따라 크게 변화 (p < 0.001). 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.

그림 4: 구강 감염에 따라 발산 하는 박테리아. (A) P. 농 균 같은 파리 하는 데 사용 그림 3에서에서 최대 120 h 후 감염에 의해 창 고. 평균 및 SE 3 남성 3 여성에서 계산 했다. 남성과 여성의 오 레 곤-R에 의해 창 고 (B) P. entomophila P. entomophila 구강 감염 다음 파리 (OD600 = 100) 감염 된 후 120 h까지. 평균 및 SE 34 남성과 38 여성에서 계산 했다. P. 녹 농 균 및 P. entomophila, 비행에 의해 CFUs 헛간의 수는 크게 시간에 따라 변화 (p < 0.001). 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.

그림 5: 구강 세균 감염 다음 파리의 생존. 카 플 란-마이어 (KM) (A) 오 레 곤-R 남성과 여성의 생존 곡선 P. 농 균 구강 감염 다음 파리 (OD600 = 25) 또는 5% 자당 해결책을 제어. KM 생존 곡선 처리 그룹 당 20 파리의 4 튜브에서 계산 했다. (B) 남성 및 여성 OreR P. entomophila 구강 감염 후 파리 (OD600 = 100). KM 생존 곡선 4 단일 제어 파리와 남성과 여성 모두에 대 한 34 감염 된 파리에서 계산 했다. (C) 면역 돌연변이: Dcy (Drosocrystallin-peritrophic 매트릭스 돌연변이) 및 Rel (양념-IMD 돌연변이), P. entomophila (Pe), P. 녹 농 균 (Pa14), 또는 제어 5% 자당 솔루션에 노출. 모든 감염 된 그룹 컨트롤 파리 보다 더 빨리 크게 다이 (p < 0.001). 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.
우리는 안정적으로 구두로 D. melanogaster 세균성 병원 균 감염에 대 한 프로토콜을 제시. 우리 피 녹 농 균 및 P. entomophila에 초점을 맞추고 있지만이 프로토콜 쉽게 다른 세균 종, 예를 들어, Serratia marcescens7. 의 감염 수 있도록 적용할 수 이 프로토콜의 주요 측면은 세균성 종 사이 달라 집니다. 따라서, 가장 효율적인 감염 복용량, 해당 독성 및 호스트 유전자 감수 해야 모두 간주 되며 이상적으로 파일럿 연구에서 테스트. 다양 한 광학 밀도의 세균성 문화에 파리를 제공 하 고 그들의 감염 복용량 및 생존 측정 새로운 세균성 종 또는 비행 라인 작업할 때 적절 한 시작 지점입니다.
프로토콜 단계와 같은 비행 수 유 전에 기아 고 5% 자당 해결책에 다시 중단 세균성 펠 릿 평범 구강 감염에 노출7,8, 중 세균 감염의 안정성 향상 9 , 그러나 10., 그것은 노출, 동안 파리 본질적으로 살고 있는 세균성 문화의 표면에 주의 하는 것이 중요. 이 문화에 산책 하는 과정에서 박테리아 파리의 표면, 특히 표 피 또는 bristles24주위에 박 혀 될 것 이다. 이 epicuticular 박테리아, 성공적인 장 감염을 반영 하지 않습니다 하지만 여전히 비행 균질 및 도금에 의해 검출 될 것. 잘못 된 반응에 대 한 가능성을 줄이기 위해, 그것은 표면에 필수 최대 1 분 동안 70% 에탄올에 침수를 통해 파리를 소독.
세균의 발산 속도 고려할 때 구강 감염 필수적 이다. 호스트 환경에 출시 하는 병원 균의 수는 종종 측정 하기 어려운 고 내부 부하 따라서 전송26,27감염의 심각도 대 한 프록시로 종종 이루어집니다. 세균성 피 눈물 함께 측정 세균성 부하 질병의 심각도 및 확산38의 이러한 두 가지 중요 한 구성 요소 사이의 관계의 시험을 수 있습니다. 제시 하는 방법의 한 가지 한계는 파괴적인 샘플링을 필요 시 금 파리의 내부 세균 부하 이다. 이것은 병원 체 성장과 동일한 개인 내의 클리어런스의 경도 동향 조사를 어려운 있습니다. 그러나, 각 코 호트에서 평균 미생물 부하 주어진 내에서 경도 병원 체 역학을 반영 한다는 가정 아래 감염의 다른 단계에서 개인의 파괴적 샘플링 동료에 의해이 제한을 극복 하기 위해 가능 하다 개별. 세균성 피 눈물 같은 한계에서 고통을 하지 않습니다 그리고 우리가 어떻게 발산 수 정해질 횡단면 샘플에서 또는 경도 조사 어떻게 개인 내에서 시간이 지남에 따라 발산 하의 예를 제공 합니다.
많은 호스트와 병원 체 특성은 공동으로 질병25,,2639를 전송 하는 개인의 성향을 결정 합니다. 가능성이 이러한 특성의 의미 호스트 병원 체 시스템 사이 변화 한다, 하는 동안 흘리는 찌 끼 구두 전송의 주요 결정 가능성이 높습니다. 세균성 흘리기를 측정 하는 능력이이 가설을 테스트 하는 기회를 엽니다. 플라이 라인의 원하는 패널에서 호스트 병원 체 역학, 성격 경험 수 구두 감염 개인, 그리고 그들의 전염 성 기간 동안 감염, 감염 호스트와 함께 그들을 배치. 이러한 '받는 사람' 파리 직접 전송 측정의 방법으로 다양 한 시간 점에서 내부 세균 부하에 대 한 분석 다음 수 있습니다.
이 작품 면역, 감염 및 진화 (http://ciie.bio.ed.ac.uk; 그랜트 참조 번호 095831)에 대 한 센터를 위한 Wellcome 트러스트에서 전략적 수상에 의해 지원 되었다. PFV는 브 랑 코와 이즈 친교 (https://brancoweissfellowship.org/)와 장관의 친목 (생물 과학의 학교에 딘 버 러의 대학);에 의해 지원 되었다 JASJ는 NERC E3 DTP 박사 재학에 의해 지원 되었다.
| 이름 | 회사 | 카탈로그 번호 | 댓글 |
|---|---|---|---|
| 바이알 | Sarstedt Ltd. | 58.490 | 폴리스티렌 플랫 베이스 튜브 75mm x 23.5mm, 23ml |
| 한천 | Sigma-Aldrich | A7002 | 한천, 회분 2.0-4.5% |
| 흑설탕 | Bidvest | 66032 | 연갈색 연질 설탕 |
| 옥수수 | Dove's Farm | 유기농 옥수수 가루 | |
| 페르미판 효모 | Bidvest | 96360 | 건조, 인스턴트 효모 |
| 메틸-4-하이드록시벤조에이 | 트Sigma-Aldrich | H5501 | >=99.0%, 결정질 |
| 자당 | Sigma-Aldrich | 84097 | 자당 BioUltra, 분자생물학용, >=99.5% (HPLC) |
| 페트리 접시 | Fisher Scientific UK Ltd. | 15788517 | X600 페트리 접시 90 X 16.2MM 멸균 트리플 벤트 |
| 팔콘 튜브(50ml) | Greiner Bio-one Inc | 210261 | 원심분리기 튜브, 50ml, 스커트, 자루, 멸균 |
| Eppendorf 튜브(0.5ml) | Sarstedt Ltd. | 72.699 | Sarstedt 마이크로 튜브 원뿔형 베이스 푸시 캡 0.5ml 표준 중립 |
| 에펜도르프 튜브(1.5ml) | Sarstedt Ltd. | 72.690.001 | Sarstedt 마이크로 튜브 원뿔형 베이스 푸시 캡 1.5ml 표준 중립 |
| 에탄올 | VWR International Ltd. | 20821.33 | 에탄올 절대 ANALAR NP ACS / R.PE - 분석 등급 |
| 2 L 원뿔형 플라스크 | VWR International Ltd. | 214-0038 | 좁은 목, 2L 삼각 플라스크 |
| 멸균 여과지 | Fisher Scientific UK Ltd. | 1001-020 | 일반 원 및 시트; 입자 보유 : 더 큰 than11um; 여과 속도: 150 헤르츠베르크; 기류 : 10.5s / 100mL / in2; 중간 다공성; 매끄러운 표면; 1 학년; 유형: 원형; 직경 : 20mm |
| 보석 샘플 용기 | Fisher Scientific UK Ltd. | 129A | 7ml 폴리스티렌 샘플 용기 |
| 슈도모나스 절연 한천 | Sigma-Aldrich | 17208 | 한천 13.6g/L, 염화마그네슘 1.4g/L, 동물 조직의 소화 분해 20g/L, 황산칼륨 10g/L, 트리클로산 0.025g/L |
| LB 육수, Miller | Fisher Scientific UK Ltd. | BP1426 | 에는 리터당 트립톤 10g, 효모 추출물 5g, 염화나트륨 10g이 포함되어 있습니다 |
| . | 59-101 | Flystuff- 100mm 페트리 접시 | |
| TRI 시약 솔루션에 | Life Technologies | AM9738 | |
| 96-웰 마이크로플레이트 | Scientific Laboratory Supplies Ltd. | 353072 | Falcon 96 웰 클리어 플랫 바텀 TC 처리 폴리스티렌 세포 배양 마이크로 플레이트 뚜껑 멸균 |
| 유 | Fisher Scientific UK Ltd | 12649595 | Pestle, 사전 멸균; 액시겐; 티슈 그라인더; 파랑; 불활성 폴리프로필렌 구조; 1.5 및 2.0mL 원심분리기 튜브에 적합합니다. 개별 포장; 100/PK |
| 글리세롤 | 과학 실험실 용품 회사 | CHE2068 | 글리세롤 AR 99.5 % 2.5 L |
| 면모-비 흡수성 | Cowens Ltd | ABL | 비 흡수성 대량 20 봉지 x 500 |
| 면모-흡수제 | Cowens Ltd | ABS | BP 소량 20 봉지 x 500 |
| Vortex | Fisherbrand | Whirlimixer 75W 50-6-Hz 220-240V | |
| 궤도 인큐베이터 | Gallenkamp | INR-200-010V | 220 V, 50 Hz, 5 A. 공칭 온도: 70°C. 흔들림 주파수: 0...400 rpm. |
| 흡광도 마이크로플레이트 리더 | Biotek Instruments Ltd | ELx808™ 흡광도 마이크로플레이트 리더 | |
| Gen 5 마이크로플레이트 리더 및 이미저 소프트웨어 | Biotek Instruments Ltd | 흡광도 마이크로플레이트 리더 | |
| 원심분리기 | Beckman Coulter | 392304 | Allegra X-12R 벤치탑 원심분리기, 냉장 50Hz 230V |
| Step One Plus 실시간 qPCR 시스템 | Thermofisher Scientific | 4376600 | Applied biosystems Step One Plus 실시간 qPCR 시스템 |
| Step One Software 2.3 | Thermofisher Scientific | For Stepone 및 SteponePlus 실시간 qPCR 시스템 | |
| R 통계 소프트웨어 | https://cran.r-project.org/ | ||
| 10 µ L 피펫 팁 | Greiner Bio-one Inc | 741015 | Easlyload gilson 스타일. 눈금, 클리어, 리필, 960 pcs |
| 200 µ L 피펫 팁 | Greiner Bio-one Inc | 741065 | Easlyload gilson 스타일. 눈금, 클리어, 리필, 960 pcs |
| 1000 µ L 피펫 팁 | Greiner Bio-one Inc | 741045 | Easlyload gilson 스타일. 눈금, 클리어, 리필, 960 pcs |
| 20 µ L 필터 피펫 팁 | Greiner Bio-one Inc | 774288 | 필터 팁 gilson 스타일. 클리어, 랙 블루, 단일 포장, R/Dnase 무료, 96pcs |
| 200 µ의 10개 랙; L 필터 피펫 팁 | Greiner Bio-one Inc | 739288 | 필터 팁 gilson 스타일. 투명, 랙 블루, 단일 포장, R/Dnase 무료, 96pcs |
| 1000 µ의 10개 랙; L 필터 피펫 팁 | Greiner Bio-one Inc | 740288 | 필터 팁 gilson 스타일. 투명, 랙 블루, 단일 포장, R/Dnase 프리, 60개씩 10개 랙 |