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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
이 프로토콜에는 전체 신장 작업 업 사 질병 마우스 모델에서을 수행 하는 설명 합니다. 사 병의 모든 마우스 모델에 적용할 수 있는 사 기능의 자세한 기능, 구조, 및 기계적 분석 방법 허용.
인간의 신장 질환을 모방 murine 모델의 사용은 점점 일반적 되고있다. 우리의 연구는 당뇨병 신 장병 및 podocyte 관련 VEGF A 녹아웃 쥐; 사 기능 평가에 초점을 맞춘합니다 따라서,이 프로토콜 설명 전체 신장 작업-최대 광대 한 양의 신장 및 단일 마우스에서 얻을 수 사 기능에 관한 정보를 사용 하면 사 병의 이러한 마우스 모델을 평가 하기 위해 우리의 실험실에 사용 합니다. 사 기능을 평가 하기 위해 문학에서 제시 하는 다른 방법, 비교이 문서에 설명 된 메서드를 사용 하 여 여러 측면에서 완전히 평가 하 사 형 수 있습니다. 이 메서드를 사용 하 여 연구원 모델의 신장 형을 결정 하 고 표현 형을 개발 하는 왜에 관해서는 메커니즘을 평가할 수 있습니다. 질병의 기계 장치에 중요 한 정보는이 모델에 잠재적인 치료도 검토할 때 필요 합니다. 방법의 구조와 매우 구조 시험 뿐만 아니라 오 줌 알 부 민 크 비율 및 개별 사 물 침투성, 측정을 통해 사 여과 방 벽의 상세한 기능 평가 대 한 허용 정기 산 Schiff 얼룩이 및 전자 현미경을 사용 하 여. 또한, mRNA와 단백질 수준에 유전자 dysregulated의 분석을 사 기능의 기계적 분석을 수 있습니다. 이 프로토콜 사 질병의 모든 마우스 모델에 적용 될 수 있는 일반 하지만 적응할 수 있는 방법을 설명 합니다.
인간의 신장 질환을 모방 murine 모델의 사용은 점점 일반적 되고있다. 이러한 murine 모델 포함 자발적인 모델을 자연스럽 게 고혈압 쥐 (SHR)1, streptozotocin (STZ)-당뇨병 쥐와 쥐2, 유도 및 db/db 타입 II 당뇨병 쥐3와 같은 유전자 조작된 모델 기본 podocyte 특정 초점 단편 사 경화 증 (FSGS) 모델4, podocyte 특정 혈관 내 피 성장 인자 (VEGF-A) 노크 아웃 (VEGF-A 코) 모델5, 그리고 Alport 증후군6, 모델 인수 5/6 신7 과8의 일방적인 ureteral 방해 (UUO) 모델 등 모델. 이러한 모델에서 사 기능의 다양 한 측면을 평가, 몇 가지 기술을 사용할 수 있습니다. 이 방법은 종이의 목적은 완전히 평가 사 기능 신장 질환의 마우스 모델에서 수행 해야 하는 포괄적인 작업 최대 보여.
이 메서드를 사용 하 여 뒤에 근거는 그것 완전히 여러 측면에서 평가 하 사 형 수 있습니다. 이 평가 사 침투성, 단백질, 물, 사 구조 이상, 그리고 식/mRNAs 및 단백질 정상 사 기능에 대 한 필수의 접합에 변화를 포함 한다. 이 메서드를 사용 하 여 연구원 모델의 신장 형을 결정 하 고 표현 형을 개발 하는 왜에 관해서는 메커니즘을 평가할 수 있다. 이것은 이러한 모델에 잠재적인 치료도 검토할 때 필요한은 질병의 메커니즘에 대 한 중요 한 정보 이다.입니다.
문학, 그것은 사 질병 표현 형의 소변에서 알 부 민 증가 수준에 의해 결정 됩니다의 마우스 모델을 제시 하는 일반적인 발생. 그러나, 증거가 제안 사 기능을 결정 하는 하나의 방법을 하지 항상 효과; 총 신장 기능, 그리고 개별 glomeruli의 정보를 제공 합니다만 요 알 부 민 배설 속도 또는 오 줌 알 부 민 크 비율 (uACR)를 측정. 이전 연구 침투성 다른 glomeruli 같은 신장5,,910에서에서 변화할 수 있다 설명 했다. 또한, 개별 glomeruli의 침투성의 평가 평가 사 기능;의 더 민감한 방법 개별 사 물 침투성 측정 기술 (LpA / V나) uACR9측정 보다 사 기능에서 변화에 더 민감한 것으로 나타났습니다. 이 분석 결과 저항 proteinuria c57BL/6 배경11등을 마우스 모델에서 유용 합니다. 현재 방법 종이의 장점은 그것은 알 부 민을 총 신장 침투성 뿐만 아니라 개별 사 침투성 물 검사.
사 구조적 이상이의 검사는 종종 얼룩 등 정기 산 Schiff (PA), trichrome, 그리고 실버 얼룩의 배터리에 의해 평가 됩니다. 이러한 점수 매기기 방법을 통해 신장 질병의 수준을 평가 하는 훈련된 신장 병리학 자 가능 모든 좋은 방법, 사 매크로 구조에 변화에 항상 나타나지 않으면 비록 급성 신장 손상 모델12. 이 메서드는 실행 위에서 설명한 신장 조직학 기술, 뿐만 아니라 사 울트라 구조 또한 평가 되어야 합니다 전자 현미경 (EM)를 통해 제시 한다. 얼룩진된 glomerulus 상대적으로 일반 조명 현미경; 정상 볼 수 있습니다. 그러나, EM, 작은 변화, 사 지하실 멤브레인 (GBM) 폭에서과 평가 시 podocyte 발 과정 겸, 내 피 fenestrations, 그리고 하위-podocyte 공간 범위 분석 이다. 따라서, 사 울트라-구조와 마이크로 구조 사 역의 메커니즘을 확인 평가 생명 이다.
평가 사 구조 이상, 뿐만 아니라 사 질병의 메커니즘을 더 명료 하 mRNA와 단백질 표정 및 접합로 단백질 활성화 (예를 들어, 인 산화), 변화를 시험 한다. 사 병을 볼 때 또는, 예를 들어, 코/오버-expressing 유전자는 podocyte 전용 VEGF-A 코 마우스5, 같이 사 셀에 특히 중요 하다 단백질 mRNA의 변화만 내 검사는 사 세포, 그리고 전체 신장 하지입니다. 이 프로토콜 있는 glomeruli 마우스 신장 피 질에서 격리 되며 다음 단백질/RNA 격리 하는 방법을 설명 합니다. 이 질병 모델의 glomeruli 단백질/mRNA dysregulation의 특정 분석을 수 있습니다.
이 프로토콜의 광대 한 양의 신장 및 단일 마우스에서 얻을 수 사 기능에 관한 정보를 사용 하는 사 질병 마우스 모델에서 실행 되어야 하는 최대-전체 신장 작업에 설명 합니다. 사 병의 모든 마우스 모델에 적용할 수 있는 사 기능의 자세한 기능, 구조, 및 기계적 분석 방법 허용.
모든 실험은 영국 입법 및 지역 윤리 위원회 승인에 따라 실시 했다. 동물 연구는 연구 윤리 위원회는 브리스톨의 대학에 의해 승인 되었다.
1. 오 줌 알 부 민 크 비율 (uACR)
참고: uACR는 알 부 민을 GFB의 침투성을 평가 하기 위해 사용 됩니다. 소변에서 알 부 민의 존재는 크 소변 유량 변화에 대 한 제어를 정규화 GFB 걸쳐 증가 침투성을 나타냅니다. 단백뇨는 만성 신장 질환에 대 한 일반적인 마커.
2. 조직 및 혈액 컬렉션
참고: 사 조직과 신장 신장 질병의 구조, 단백질, 및 mRNA 식 마커를 평가 하기 위해 사용할 수 있습니다. 혈액 마커 크는 glomeruli의 여과 용량에 있는 감소를 나타내는, 신 장병에 최대 통제 될 수 있는 등 신장 기능을 평가 하기 위해 사용할 수 있습니다.
3. 플라즈마 크
참고: 플라즈마 크는 glomeruli의 여과 용량에 있는 감소를 나타내는, 신 장병에 최대 통제 될 수 있습니다. 프로토콜 여기 설명 하지는 않지만, 혈액 우 레 아 질소 (롤빵) 수준 또한 평가 될 수 있습니다.
4입니다. Glomeruli 격리
참고: Glomeruli 개별 glomeruli 비보 전,의 침투성 뿐만 아니라 특정 단백질의 표현과 사 병의 mRNA 마커를 평가 하기 위해 고립 될 수 있다.
5. 사 물 침투성 (LpA / V나)
참고: 사 LpA / V나 분석 결과 ex vivo 측정이 가능 개별 glomeruli의 침투성의 빠른 재현 하는 방식으로. 증가는 사 LpA / V나 는 신장 질병의 암시는 GFB의 나타냅니다.
6. 정기 산 Schiff (PA) 얼룩
참고: 사 모 세관 루프의 지하실 막과 관 상피 파스 얼룩 강조 표시 됩니다. 사 셀, mesangial 매트릭스 및 잠재력 확장, 및 잠재적인 변경 (즉, 두껍게 및 부정) GBM의의 상세한 시각화 수 있습니다.
7. 전송 전자 현미경 (TEM)
참고: 가장 GBM, podocyte 발 프로세스, 가벼운 현미경 검사 법으로 표시 되지 않습니다 내 피 fenestrations 등 신장에 매우 구조적 이상이 시험을 수 있습니다. 이 어디 신장 손상 안 그래서 발음 (즉, 단백뇨 및 주요 구조 이상) 모델에서 중요 하다.
8입니다. 면역 형광이 Podocyte과 내 피에 대 한
참고: Immunostaining는 사 병에서 축소 수 내 피 모 세관 루프는 단백질 식 패턴의 시각화 수 있습니다.
9. 단백질 추출 및 서 부 럽
참고: 신장 질환에서 dysregulated 것으로 알려져 식 단백질을 평가 하기 위해 수 있습니다 부 럽. 예를 들어 podocin 및 nephrin 식 감소 podocyte 손실을 나타냅니다.
10. RNA 추출 및 연쇄 반응 (PCR)
참고: mRNA 표정 분석 어떻게 유전자 유전자 발현 및 대체 접합 변화 등 신장 질환에 통제 되는지 결정 하기 위해 수 있습니다.
야생 타입 (WT), (VEGF-A 코), 밖으로 유도할 수 있는 podocyte 전용 VEGF A 노크와 VEGF-A 코 X Neph-VEGF165b 쥐 대사 케이지를 사용 하 여 소변 수집 (VEGF-A 코 쥐-인간의 VEGF A165b isoform에 podocytes에서 표현 하는 구성 방식)입니다. 측정 오 줌 알 부 민 크 비율의 주 0, 4, 10, 14에서 VEGF-A 코의 doxycycline 유도 후, 시 VEGF-A 코 쥐 10 주 WT littermate 컨트롤에 비해 진보적인 단백뇨를 개발. 그림 2A, 및 그림 2B에 각 마우스 값의 기준선에 정규화 된 절대 값을 볼 수 있습니다. 그러나,에서 단백뇨 VEGF-A X Neph VEGF-A-165b 생쥐 (그림 2)에서 관찰 되지 않는 그 VEGF A165b은 단백뇨5의 모델에서 보호입니다.
사 LpAV나 개별 glomeruli WT, VEGF-A 코, VEGF-A X Neph VEGF-A-165b 신장에서 sieved에서 측정 했다. 어떻게는 glomerulus는 고 수축의 예로 그림 3A에서8 %BSA perifused 표시 하면 관찰. 이 수축 사 LpA를 결정 하는 데 사용은 / V나 각 glomerulus (그림 3B)에 대 한. VEGF A 코 쥐 했다는 크게 증가 사 LpA / V나 14 주에 WT 제어 glomeruli에 비해 VEGF 코 유도 포스트. 비록 낮은 VEGF-A X Neph VEGF-A-165b 쥐, 증가 사 LpA / V나 14 주5에서 VEGF A165b-식으로 하지 못했습니다.
싶어 서 신장 피 질 부분의 VEGF-A 코의 유도 후 14 주 얼룩 VEGF-A 코 또는 VEGF-A X Neph-VEGF-165b 생쥐 (그림 4A)에서 어떤 사 구조 이상 공개 하지 않았다. 그러나, 그들을 통해 사 울트라 구조 분석, 시 VEGF-A 코 쥐 했다 증가 GBM 폭을 개발, 내 피 fenestrae의 수를 감소, SPS 범위 감소 및 평균 podocyte 슬릿 폭을 증가 (그림 4C-4 층 ). 평균 podocyte 피트 폭 및 슬릿 변하지 않게 남아 있었다 (그림 3B 및 3 세대)의 수를 처리합니다. -표현의 VEGF-A 코 쥐에서 VEGF A165b는 GBM을 변화를 방해 하 고 슬릿 폭 (그림 4C 와 4 층). 그러나, A VEGF165b이 했다 변경 된 fenestrae 수와 SPS 범위 (그림 4D 및 4E)5에 영향을 주지 않습니다.
RT-PCR 체질된 glomeruli에서 추출한 RNA에 수행 이라고 밝혔다 인간의 VEGF A165b mRNA만 (그림 5A) VEGF-A 코 X Neph-VEGF-A165b 쥐에. VEGF A165b ( -식에 의해 방지 되었다 VEGF-A 코 생쥐에서 감소 VEGFR-2의 사 단백질 표정 발견 체질된 glomeruli 및 서쪽에 게 더 럽 히기를 통해 단백질의 수준을 평가 하 고에서 단백질을 추출 하는 경우 그림 5B 와 5 C)5.

그림 1입니다. 사 침투성 (LpA) 장비의 도식 설정. (A)는 glomerulus 적발 (B) 흡입을 사용 하 여 홀더 내 micropipette에 안정성에 대 한 마운트에 고정 됩니다. (C) 사각형 microslide입니다. (D) 4 X 비디오 카메라와 현미경의 목적. (E) 37 ° c 1 %BSA 솔루션 따뜻하게 ((F)) 8 %BSA 솔루션 37 ° c 예 열 (G) 원격 탭 베어링 두 포함 하는 perifusate 라인 빠른 perifusate 교류를 허용 합니다. (H) 다음은 glomerulus 목욕 microslide로 perifusate의 경로입니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.

그림 2입니다. 요 알 부 민 크 비율입니다. (A) uACR 값 0, 4, 10, 및 14 주 WT, VEGF-A 코와 VEGF-A X Neph-VEGF-165b 쥐에서 VEGF-A 코의 유도 후에. (B) 같은 uACR 값을 기준 값 (주 0) 각 개별 마우스의 정규화. uACR 주 10와 14 WT littermate 컨트롤에 비해 VEGF-A X Neph VEGF-A-165b 쥐에 방해 했다 VEGF-A 코 쥐에 크게 증가 (* p < 0.05; 양방향 ANOVA, 쌍; 사이의 비교에 대 한 보정 n = 4-12 시간 포인트; 당 쥐 오차 막대: [SEM] 의미의 표준 오류). 이 그림은 스티븐 스 외5에서 수정 되었습니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.

그림 3입니다. 사 물 침투성의 측정입니다. (A) 는 glomerulus 흡입; 통해 micropipette에 잡힌 perifusate 1 %BSA (Ai)에서 8 %BSA (좋아), 전환 그리고 사 수 축을 관찰. (B) 측정 전후에 8 %BSA 스위치를 사용 하 결정 사 LpA / V나. (C) 마우스 VEGF-A 코 개발 한 증가 사 LpA / V나 14 주에 포스트 VEGF-A WT 컨트롤에 비해 코의 유도. 이것은 크게 막을 수 없습니다 VEGF-A X Neph VEGF-A-165b 쥐에 있는 (* p < 0.05; 한 가지 방법은 ANOVA, Bonferroni 보정 쌍; 사이의 비교에 대 한 n = 4-9 마우스, 15-30 glomeruli; 오차 막대: sem의). 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.

그림 4입니다. 사 구조 분석입니다. (A) 파 신장 피 얼룩 WT, VEGF-A 코와 VEGF-A X Neph-VEGF-165b 쥐 (Ai-iii)에서 glomeruli에 어떤 구조적 이상이 표시 하지 않았다. EM은 VEGF-A 코 glomeruli (Aiv-vi)에 매우 구조적 이상이 나타났다. (B) 평균 FPW 그룹 사이 변화 하지 않았다. (C)는 GBM 증가 VEGF-A 코 glomeruli는 VEGF A165b. fenestrae 수 VEGF-A 코 glomeruli, VEGF A165b. (E)는 SPS 보도 의해 불변에 남아 있었다 감소 되었다 (D) 에 의해 방지 되었다 이었다 VEGF-A 코 glomeruli, 또한 VEGF A165b. 슬릿 폭 평균 VEGF-A 코 glomeruli에 증가 되었다 (F) 불변에 남아 있었다에서 감소는 VEGF A165b. (G) 슬릿 수에 의해 방지 되었다 아니었다 변경 3 개 그룹 사이 (* p < 0.05; 한 가지 방법은 ANOVA, Bonferroni 보정 쌍; 사이의 비교에 대 한 n = 3 마우스, 9 glomeruli; 오차 막대: sem의). 이 그림은 스티븐 스 외5에서 수정 되었습니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.

그림 5. 마커의 mRNA와 단백질 표정. (A) RT-PCR 인간의 VEGF A165b mRNA 표현 했다 VEGF-A 코 X Neph-VEGF-A165b 쥐에서 체질된 glomeruli 분명만 보였다. (B) 서 부 럽 표시는 VEGFR-2 단백질 표정 VEGF-A 코 glomeruli 아래로 통제 되는 VEGF-A 코 X Neph-VEGF-A165b glomeruli에서 방지 되었다 (* p < 0.05; 한 가지 방법은 ANOVA, Bonferroni 보정 쌍; 사이의 비교에 대 한 n = 3-6 쥐; 오차 막대: sem의). 이 그림은 스티븐 스 외5에서 수정 되었습니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.
저자는 공개 없다.
이 프로토콜에는 전체 신장 작업 업 사 질병 마우스 모델에서을 수행 하는 설명 합니다. 사 병의 모든 마우스 모델에 적용할 수 있는 사 기능의 자세한 기능, 구조, 및 기계적 분석 방법 허용.
이 작품은 영국 심장 재단, 리처드 밝은 VEGF 연구, 믿음과 MRC에 의해 지원 되었다.
| 대사 케이지 | Harvard Apparatus | 52-6731 | |
| Tris 완충 식염수(10x) | Sigma-Aldrich | T5912-1L | |
| 소 혈청 알부민 | Sigma-Aldrich | A2058 | |
| 마우스 알부민 ELISA 정량 세트 | Bethyl Laboratories | E90-134 | |
| TMB ELISA 기질 용액 | ThermoFisher Scientific | 34028 | |
| 황산 | , 시그마-알드리치 | , 339741 | |
| SPECTRstar nano | ,BMG, Labtech | ,SPECTRstar nano 또는 동급의 | |
| RNAlater 안정화 솔루션 | , ThermoFisher Scientific | AM7020 | |
| 4-15% 프리캐스트 단백질 겔 | ,BIORAD | 4568084 | |
| 4x Laaemmli 샘플 버퍼 | ,BIORAD | 161-0747 | |
| 미니 트랜스 블롯 셀 | BIORAD | 1703930 | |
| 10x Tris 러닝 버퍼 | BIORAD | 1610732 | |
| Coomassie Brilliant Blue Dye | ThermoFisher Scientific | 20278 | |
| 크레아티닌 컴패니언 | 엑소셀 | 1012 스트립 플레이트 | |
| 글루타르알데히드 용액 | Sigma-Aldrich | G5882 | |
| Cacodylate 나트륨 | Sigma-Aldrich | C0250 | |
| 10x 인산염 완충 식염수 | ThermoFisher Scientific | AM9625 | |
| 염화나트륨 | Sigma-Aldrich | S7653 | |
| 아세트산나트륨 | Sigma-Aldrich | S2889 | |
| 인산나트륨 | Sigma-Aldrich | 342483 | |
| 중탄산나트륨 | Sigma-Aldrich | S5761 | |
| 마그네슘 황산 | 염 시그마-알드리치 | M2643 | |
| 염화칼슘 | 시그마-알드리치 | C5670 | |
| D(+)포도 | 당시그마-알드리치 | G8270 | |
| EDTA 혈액 수집 튜브 | BD | 367835 | |
| 23-25G 바늘 | BD | PMC0735 | |
| EDTA | 시그마-알드리치 | E9884 | |
| 10 ml 유리 바이알 | Thomas Scientific | 0914X10 | |
| Falcon 10 ml 폴리프로필렌 튜브 | ThermoFisher Scientific | 10110101 | |
| 0.5 ml 튜브 | ThermoFisher Scientific | 10681894 | |
| 일회용 조직 금형 | ThermoFisher Scientific | 22-363-553 | |
| 마우스 수술 절개 키트 | ThermoFisher Scientific | 13-005-204 | |
| 최적 절단 매체 | ThermoFisher Scientific | 23-730-571 | |
| 4% 파라포름알데히드 | ThermoFisher Scientific | AAJ19943K2 | |
| 유리 모세관 | Harvard Apparatus | EC1 64-0770 | |
| 사구체 투과성 장비 | - 상업적으로 사용할 수 없음 | LpA 장비의 인용: Salmon et al. 2006; J. Physiol | |
| 스테인레스 스틸 체 | Cole-Parmer | WZ-59984 | |
| PAS(Periodic Acid-Schiff) 염색 시스템 | Sigma-Aldrich | 395B-1KT | |
| Hematoxylin | Sigma-Aldrich | H3136 | |
| Xylene | MerckMillipore | 108298 | |
| Poly-Prep Slides | Sigma-Aldrich | P0425-72EA | |
| 장착 매체 | ThermoFisher Scientific | 8030 | |
| 오스뮴 테트록사이드 용액 | Sigma-Aldrich | 75632 | |
| Aradite Resin | Agar Scientific | CY212 | |
| 우라닐 아세테이트 | Agar Scientific | AGR1260A | |
| Lead Citrate | Agar Scientific | AGR1210 | |
| Cryostat | ThermoFisher Scientific | 예: 957000H | |
| 소수성 펜 | ,Abcam | ,ab2601 | |
| Nephrin(1243-1256), 항체 | Acris | BP5030 | |
| Anti-Podocin | , Sigma-Aldrich, | P0372-200UL, | |
| Anti-CD31 | ,BD, Biosciences, | 550274 | |
| Alexa Fluor, 2차 항체 | ,ThermoFisher Scientific | A32732 | |
| DAPI | Vector Labs | H-1200 | |
| NP40 세포 용해 완충액 | 이 있는 Vectashield 장착 배지ThermoFisher Scientific | FNN0021 | |
| 프로테아제 및 인산가수분해효소 억제제 중단 칵테일 | ThermoFisher Scientific | 78437X4 | |
| 10x 전달 완충액 | BIORAD | 1610734 | |
| PVDF 멤브레인 | ThermoFisher Scientific | LC2002 | |
| 웨스턴 블로팅 | 피셔 | 10713387 | |
| TRIzol | ThermoFisher Scientific | 15596018 | |
| DNA I | New England Biolabs | M0303S | |
| M-MLV 역전사효소 | |||
| HRP-Conjugated Secondary Antibody | Abcam | ab6721 | |
| ThermoFisher Scientific | 18418012 | ||
| 랜덤 프라이머 | ThermoFisher Scientific | 48190011 | |
| dNTP | ThermoFisher Scientific | 18427088 | |
| 리보뉴클레아제 억제제 | ThermoFisher Scientific | 10777019 | |
| DEPC 물 | ThermoFisher Scientific | AM9915G | |
| 형광등 현미경 | 라이카 마이크로시스템즈 | ||
| Image J 분석 소프트웨어 | Image J | ||
| PCR Thermocycler | ThermoFisher Scientific | ||
| TEM 현미경 | 브리태니커 |