이온 채널의 정화는 종종 도전, 하지만 일단 달성, 그것은 잠재적으로 수 체 외에서 조사 기능 및 채널의 구조. 여기, 표현과 포유류 bestrophin 단백질, 캘리포니아2 +의 가족의 정화에 대 한 단계적 절차 설명-Cl- 채널을 활성화.
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이온 채널의 정화는 종종 도전, 하지만 일단 달성, 그것은 잠재적으로 수 체 외에서 조사 기능 및 채널의 구조. 여기, 표현과 포유류 bestrophin 단백질, 캘리포니아2 +의 가족의 정화에 대 한 단계적 절차 설명-Cl- 채널을 활성화.
인간 게놈 4 bestrophin paralogs를, 즉 BEST1, BEST2, BEST3, 및 BEST4 인코딩합니다. BEST1, BEST1 유전자에 의해 부호화는 캘리포니아2 +-Cl- 채널 (CaCC) 주로 망막 안료 상피 (RPE) 표시를 활성화. BEST1의 생리 및 병 적인 의미 BEST1 유전자에서 200 개 이상의 독특한 돌연변이 최고의 vitelliform 등 적어도 5 망막 퇴행 성 장애의 스펙트럼에 유전자 연결 되었다는 사실에 의해 강조 표시 됩니다. 황 반 영양 장애 (최고의 질병) 따라서, bestrophin 채널을 단일 분자 수준에서의 물리학을 이해 엄청난 의미를 보유 하고있다. 그러나, 순화 된 포유류 이온 채널을 얻는 것은 종종 어려운 작업입니다. 여기, 우리는 BacMam 잠재 유전자 전달 시스템 및 친 화력과 크기 배제 크로마토그래피에 의해 그들의 정화와 포유류 bestrophin 단백질의 표현에 대 한 프로토콜을 보고합니다. 순화 된 단백질 지질 bilayers에 결정학 electrophysiological 녹음 등 후속 기능 및 구조 분석에 활용 될 가능성이 있다. 중요 한 것은,이 파이프라인 함수 및 다른 이온 채널의 구조 연구에 적용할 수 있습니다.
Bestrophins은 박테리아에서 인 간에1다양 한 종족을 통해 보존 하는 이온 채널의 가족 이다. 인간에서는, BEST1 유전자, 염색체 11q12.3에 있는 막 단백질 Bestrophin-1 (BEST1) 주로 눈2,3 망막 안료 상피 (RPE) 세포의 basolateral 막에 표현 되 인코딩 ,4. 585 아미노산의 첫 번째 ~ 350 높은 종 중 보존 하 고는 막 횡단 영역을 포함, 구성 BEST1 인간1,,56CaCC 역할을 합니다. 또한, 닭에 BEST1 homologs와 Klebsiella 균 으로 작동 homopentamers7,8, 진화를 통해 환경 보호의 높은 수준을 제안.
인간에서는, 200 개 이상의 돌연변이....
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1. 생산 BacMam 식 Baculoviruses
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뚜렷이 페 접착제 HEK293 세포 (그림 1A)의 형광 강도 서 스 펜 션 F HEK293 세포 (그림 1B)에 예상된 단백질 표정 수준에 대 한 좋은 지표입니다. 대상 단백질은 잘 표현 또는 과도 transfection 후 HEK293 세포에서 잘못 지역화, 것이 좋습니다 고려 식 구조를 수정 하는 (예., GFP 태그의 위치를 변경 또는 돌연변이/잘림 에 대상 단백질). 작은 HEK293 F 현 탁 액 문화 (예를 들어, 25 mL 문화)는 단백질 표정, 중 감염 나 배양 온도 되었습니다 이전 경험에서 가장 중요 한 조건을 최적화 하는 데 사용 됩니다.
성공적인 정화 단일 주요 피크 크기 배제 크로마토그래피 (
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이 프로토콜 표현과 미래 생체 외에서 분석에 사용할 포유류 bestrophin 이온 채널의 정화에 대 한 유용한 파이프라인을 설명 합니다. FPLC 장치는 크기 배제 크로마토그래피에 대 한 필요, 주사기 펌프는 친화성 크로마토그래피 바인딩 하 고, 세척, 하 고, 방출 하는 등의 모든 단계에 대 한 충분 한 이다. 푸시 솔루션 (주사기)에 열을 통해 주사기 펌프를 사용할 때는 열에 공기 방울을 밀어 피하기 위해 봄 측면 아래에 배치 필수적 이다. 친화성 크로마토그래피 후 단백질의 순도, 후속 실험에 대 한 충분 한 이미 경우 FPLC 장치 되지 않을 수 있습니다 필요한 모든 있도록 크기 배제 크로마토그래피를 생략할 수 있습니다.
PBacMam 플라스 미드에서 baculoviruses를 만들기 위해 약 2 주 걸립니다, 효율을 품행 단백질 homologs에 대 한 초기 화면 실시 될 수 있습니다 정도 transfected HEK293 세포를 수확 하 여 (예.......
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저자는 공개 없다.
이 프로젝트는 NIH 교부 금 EY025290, GM127652, 및 시작 자금 로체스터의 대학에 의해 투자 되었다.
....액세스가 제한되었습니다. 이 콘텐츠를 보려면 로그인하거나 체험판을 시작하세요.
| 이름 | 회사 | 카탈로그 번호 | 댓글 |
|---|---|---|---|
| HEPES | 피셔 사이언티픽 | AC327265000 | |
| NaCl | Fisher Scientific | AC446212500 | |
| 글리세롤 | Fisher Scientific | G33-500 | |
| 이미다졸 | Fisher Scientific | AC301870010 | |
| MgCl2 | Fisher Scientific | AC197530010 | |
| TCEP | 피셔 사이언티픽 | AA4058704 | |
| 아프로티닌 | 피셔 사이언티픽 | AAJ63039MA | |
| 루펩틴 | 피셔 사이언티픽 | AAJ61188MB | |
| 펩스타틴 A | 피셔 사이언티픽 | AAJ20037MB | |
| 페닐메틸설포닐 플루오라이드 | 피셔 사이언티픽 | AC215740050 | |
| DDM 솔 그레이 | 드 아나트레이스 | D310S | |
| DDM 아나 | 그레이드 아나트레이스 | D310 | |
| SF-900 II SFM | ThermoFisher | 10902179 | |
| 프리스타일 매체 | ThermoFisher | 12338018 | |
| NanoDrop 분광 광도계 | ThermoFisher | ND-2000 | |
| 고압 균질화 장치 | Avestin | Emulsiflex-C5 | |
| HisTrap 컬럼 | GE | 17-5248-01 | |
| Superdex-200 컬럼 | GE | 28990944 | |
| AKTA Pure | GE | 29018224 | |
| Ultra-15 원심 필터 장치 | Millipore | UFC910024 | |
| Ultra-4 원심 필터 장치 | Millipore | UFC810024 | |
| Ultra-0.5 원심 필터 장치 | Millipore | UFC505024 | |
| Optima XE-90 초원심분리기 | Beckman Coulter | A94471 | |
| Mini-PROTEAN Tetra Cell | Bio-Rad | 1658004 | |
| Mini-PROTEAN 프리캐스트 겔 | Bio-Rad | 4561084 | |
| T100 Thermal Cycler, | Bio-Rad | 1861096 | |
| PolyJet 트랜스펙션 시약 | SignaGen | SL100688 | |
| pEG BacMam 벡터 | Vollum Institute의 Gouaux 실험실에서 획득 |
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