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Research Article
Weikun Xiao1, Arshia Ehsanipour1, Alireza Sohrabi1, Stephanie K. Seidlits2
1Department of Bioengineering,University of California, Los Angeles, 2Department of Bioengineering, Jonsson Comprehensive Cancer Center, Broad Stem Cell Research Center, Brain Research Institute,University of California, Los Angeles
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
여기, 우리 두뇌 매트릭스를 모방 하도록 설계 하는 기가 가변 생체 내의 세포종 환자에서 파생 된 셀의 3 차원 문화에 대 한 프로토콜을 제시. 이 접근 한 생체 외에서세포종 세포 vivo에서 일반적으로 문화에서 길을 잃 었의 많은 특성을 유지 하는 실험 플랫폼을 제공 합니다.
세포종 (GBM)은 가장 일반적인, 그러나 가장 치명적인, 중추 신 경계 암 이다. 최근 몇 년 동안, 많은 연구는 어떻게는 세포 외 기질 (ECM) 히 알루 론 산 (HA) 등 독특한 두뇌 환경의 용이 GBM 진행 및 내 습에 집중 했다. 그러나, 대부분의 생체 외에서 문화 모델 GBM 세포는 ECM의 컨텍스트 외부 포함. GBM 셀 murine xenografts 또한 일반적으로 사용 됩니다. 그러나, vivo에서 모델 어렵게 종양 동작으로 복잡 한 종양 microenvironment의 개별 특징의 기여를 분리. 여기, 우리는 하 하이드로 겔-기반, 3 차원 (3D) 문화 플랫폼 연구원 하 농도 및 강성 독립적으로 변경할 수 있도록 설명 합니다. 높은 분자량 HA 및 폴 리 에틸렌 글리콜 (PEG)는 마이클 형 추가 라이브 세포의 존재를 통해 가교 된 hydrogels를 구성 됩니다. 3D 하이드로 겔 문화 환자 파생 GBM 세포 전시 생존 및 확산의 속도 만큼 좋은, 또는 때 교양으로 표준 gliomaspheres 보다 더 있습니다. 하이드로 겔 시스템은 또한 특정 세포-ECM 상호 작용의 효과 분리 하는 ECM 모방 펩 티 드의 수 있습니다. Hydrogels 광학 투명는 라이브 셀 3D 문화에 몇 군데 있습니다. 마지막으로, 하 히드로 문화 분자 및 세포 분석, PCR, 등 서 부 럽 cryosectioning 뒤에 면역 형광 염색 법에 대 한 표준 기술로 호환 됩니다.
3 차원 (3D) 문화 시스템 기본 조직 그들의 2 차원 (2D) 대응1,2보다 더 나은에서 셀과 그들의 주변 세포 외 기질 (ECM) 간의 상호 작용을 정리. 조직 공학의 발전은 새로운 매트릭스 microenvironment 영향 셀 동작 및 2)의 효능의 1) 어떻게 화학 및 물리적 구성 요소에 대 한 제어 조사를 가능 하 게 하는 정교한, 3D 문화 플랫폼 굴복 했다 치료 질병, 암2등의 숫자에 대 한 전략. 생체 외에서 모델 조직 요인, 내 분 비 및 면역 신호, 등에 대 한 계정이 없습니다 따라서 완전히 vivo에서 모델을 대체할 수 없습니다 하는 동안 그들은 재현성, 실험 제어를 포함 하 여 몇 가지 장점을 제공합니다 경제성 그리고 속도입니다. 여기, 우리 두뇌 모방 hydrogels는 3d에서 환자 파생 뇌 종양 세포의 문화 종양 생리학, 특히, 치료 저항3취득의 역학의 여러 측면을 캡처를 사용 하 여를 설명 합니다. 체 외에 다른 방법에 비해, 이러한 문화는 더 나은 종양 모델 vivo에서 및 임상 관찰3을 나타냅니다.
세포종 (GBM)은 1-2 년4,5의 메디아 생존으로 뇌에서 가장 빈번 하 고 치명적인 암 이다. 최근 몇 년 동안, 많은 연구는 GBM6,,78종양 매트릭스 환경의 영향에 집중 했다. 독특한 두뇌 ECM GBM 셀 이동, 확산, 그리고 치료 저항6,7,8,9,,1011 에 영향을 미칠 것으로 보고 되었습니다. , 12. 히 알루 론 산 (HA) 두뇌, 그것은 다른 개 그와 상호 작용 및 하이드로 겔 같은 한 형태로 proteoglycans 메쉬13에 풍부한 glycosaminoglycan (개 그)입니다. HA overexpression에 GBM 종양 및 암 진행8,9,13,,1415,16에 후속 효과 많은 연구 보고 ,17. 다른 ECM 구성 요소 GBM 종양 성장과 침공6,7,,1518에 영향을 줍니다. 예를 들어 fibronectin 및 vitronectin, GBM에 overexpressed 일반적으로, "RGD" 시퀀스에 대 한 바인딩을 통해 세포 표면 integrin 수용 체의 heterodimerization를 유발 하 고 종양 생존19 홍보 하는 복잡 한 신호 폭포를 시작 ,,2021. 생 화 학적 영향 외에 조직 매트릭스의 물리적 특성 GBM 진행22,23에 영향을 줍니다.
치료에 저항을의 지속적인 수집 GBM 치4의 주요 드라이버 중 하나입니다. 2D 또는 gliomasphere 모델에서 유망한 결과 보여주는 마약 이후 동물 연구와 임상 사례3, microenvironmental 요인의 효과 GBM 종양 응답1에 크게 기여 했다는 것을 나타내는 데 실패 했습니다. 동물 모델 3D를 제공할 수 있는, 순수 microenvironment xenografted 환자 세포에 적절 한 고 임상 관련 결과24,25, 두뇌 microenvironment에는 vivo에서 의 복잡성을 생성 기능, 세포-매트릭스 상호 작용을 포함 하 여 특정 핵심 생물 학적 결과 확인 하기 위해 도전 하기가. 새로운 치료 대상의 단순화 된 문화 플랫폼 생화학 및 생물 속성 정의 사용 하 여에서 도움이 됩니다.
GBM 종양 microenvironment26,27 의 이전에 보고 된 소재 모델과 달리는 달성 하지 않았습니다 진정한 직교 제어할 ECM, 소재 플랫폼의 개별 생 화 학적 및 물리적 특징 보고 여기 수 있습니다 여러 개의 독립적인 기능 GBM 세포 표현 형을 기여의 분리 하 고 여기, 선물이 환자 파생 GBM 셀의 3 차원 문화에 대 한 HA 기반, 기가 가변 하이드로 겔 시스템. Hydrogels 두 폴리머 구성 요소에서 형성 된다: 1) 생물학적으로 활성 하 고 2) 생물학으로 비활성 폴 리 에틸렌 글리콜 (PEG). 못은 낮은 단백질 흡착과 최소한의 immunogenicity28널리 생체 및 친수성 소재. 여기, 하 체인에 glucuronic 산 moieties의 약 5%는 기능성 가교를 상업적으로 사용할 수 있는 4-팔-못 maleimides 마이클 형 추가 통해 종료를 수 있도록 thiol 그룹. 가장 일반적인 형태로 본문에, 하 고 분자량 (HMW) 체인에 존재합니다. 여기, 낮은 정도의 HMW 하의 (500-750 kDa) 수정 하 고 CD4429를 포함 하 여 그것의 세포 수용 체의 기본 상호 작용을 유지 하기 위해 도움이 됩니다. Maleimides에 총 thiols의 일정 한 어 금 니 비율을 유지 하면서 하 thiol 위한 페그 thiol를 대체 하 여 하 농도 결과 hydrogels의 기계적 성질에서 분리 될 수 있습니다. 또한, 화학 량 론 컨트롤 시스테인 종료 펩 티 드의 maleimide로 끝나는 각 4-팔-말뚝에 정의 된 평균 수 켤레를 사용할 수 있습니다. ECM 파생, 접착제 펩 티 드의 integrins는 생화학 및 화학 신호는 불리고1경작된 한 세포에와 상호 작용 수 있습니다. Maleimide-thiol 추가 셀 캡슐화 및 환자에서 파생 된 세포의 생존을 극대화 하는 데 필요한 시간을 최소화 하는 생리 적 조건 하에서 매우 빠르게 발생 합니다. 또한, 히드로 문화 일반적인 조직 표본 처럼 취급 될 수 있으며 표준 특성화 기법 등 서 부 럽, cytometry, 면역 형광 염색 법와 호환. 다음 프로토콜 환자 파생 GBM 셀 및 생 화 확 적인 분석에 대 한 기술 3D 문화 수립 hydrogels 날조를 위한 절차를 설명 합니다.
모든 인간의 조직 컬렉션 단계 제도 승인된 프로토콜에서 실행 되었다.
1입니다. 히 알루 론 산의 Thiolation
참고: 어 금 니 비율 진술 된다 카복실산 그룹의 총 수와 관련 하 여 별도로 지정 하지 않는 한.
2입니다. 가교 자료의 준비
3. 하이드로 겔 가교 및 세포 캡슐화
참고: 예를 들어 서 여기, 4 개인, 80 µ L hydrogels 0.5% (w/v) 하 고 1 kPa의 압축 계수의 캡슐화는 설명된3. 다양 한 속성 hydrogels 항복 예 조리법에 대 한 표 1을 참조 하십시오: 두 hydrogels integrin 바인딩 펩 티 드 RGD 통합 및 두 hydrogels 시스테인 모자 펩 티 드 활동에 대 한 부정적인 컨트롤로 통합. 환자 파생 GBM 세포의 농도 시드 500000 셀/mL입니다.
4. lysate 준비 부 럽
5. 하이드로 겔 문화에서 단일 셀을 추출 Cytometry에 대 한
6입니다. cryopreservation Hydrogels 단면에 대 한의
7. 총 RNA 추출 하이드로 겔 샘플에서
참고: 여기, 우리는 광고를 사용 하 여 프로토콜 설명 (재료의 표 참조) 히드로 배양 세포에서 총 RNA 추출 키트. 버퍼 및 모든 자료 사용 키트에서 사용할 수 있습니다.
Thiolated 하의 각 배치에 대 한 thiolation 정도 H1-NMR 또는 덮어의 테스트를 사용 하 여 확인 한다. 하 수정 여기 일관 되 게 설명 하는 절차를 사용 하 여 생성 (정의 하과 thiols의 어 금 니 비율) ~ 5 %thiolation (그림 1).
이 새로운 문화 플랫폼 설정 대규모 실험을 구현 하기 전에 좋은 문화 생존을 보장 하기 위해 엄격한 테스트를 수행할 각 연구실을 요구할 것 이다. 우리의 80 µ L hydrogels는 시드 밀도 500000 셀/mL (40, 000 셀/젤)와 지속적으로 확산 속도 비교, 또는 gliomasphere 문화 (그림 2A-2 C)보다 더 나은 결과. HA/말뚝 hydrogels는 광학 투명 셀 동작 관찰할 수 있습니다 라이브, 3D 문화 단계 대비 또는 형광 현미경을 사용 하 여에서 직접. 그림 3A 보여줍니다, 캡슐화, 후 4 일 RGD 포함 hydrogels GBM 셀 전시는 침략 적 표현 형, 셀 하이드로 겔에서 경작 하는 동안 못 말 CYS을 사용 하 여 컨트롤 구형 형태.
연구원 일 개월 이식된 종양 진보적인 성장24,32에 도달할 때까지 대기 해야 하는 종이 식 모델에서 일반적으로 환자 파생 된 세포는 또한 새로운 문화 환경에 적응 하려면 시간이 걸릴. 따라서, 대부분의 세포 지 수 성장 단계 입력 되도록 약물 치료 같은 실험을 시작 하기 전에 4-8 일 경작 하는 것이 좋습니다. 약물 치료, 넘어 경쟁력 hydrogels에 RGD와의 세포 상호 작용 방해, 수용 성 쿠-RGD, 같은 시 약 배양 (그림 3A)에 추가할 수 있습니다.
우리의 하이드로 겔 시스템 glioma 세포 생물학 조사에 대 한 많은 일반적인 방법와 호환 됩니다. 일반적으로 설치류이 종이 식 종양을 모니터링 하는 데 사용 되는 생물 발광 영상를 사용 하 여 실행 가능한 세포의 상대적인 숫자 관찰할 수 있습니다 히드로 문화에서 치료의 과정. 그림 3B GBM 셀 하이드로 겔 경작에 erlotinib 치료의 효과 6 일 동안을 평가 했다,이 방법의 예를 제공 합니다. 서쪽 오 점 또는 PCR lysates를 준비할 때 일반적으로, 히드로 문화 조직 샘플으로 처리할 수 있습니다. 쪼개진된 폴 리 ADP 중 합 효소의 서쪽 오 점 분석 치료 CD44 최저의 세포에 있는 apoptosis의 상대적 정도 wildtype GBM 셀 0.5%에서 경작 하 hydrogels (그림 3C)보다 높은 임을 나타냅니다. 마찬가지로, cytometry 그대로 조직 (그림 2)에서 단일 셀을 해방에 대 한 표준 프로토콜을 사용 하 여 통해 분석에 대 한 단일 셀 정지 히드로 문화에서 준비 될 수 있습니다. 세포 기능, 히드로 기반, 3D 문화 cryosections ECM 배양된 세포에서 보존 한다. 예를 들어 증 착 패턴 유형 IV 콜라겐 변화의 erlotinib 치료 하이드로 겔 문화 (그림 3D)의 시.

그림 1 : 대표 H 1 Thiolated 히 알루 론 산의-NMR 스펙트럼. 통합된 봉우리 HA glucuronic 산 그룹의 대략 5%는 thiol로 수정 된 나타냅니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.

그림 2 : 히드로 캡슐화 된 세포의 증식. 12-잘 접시에 조작된 80 µ L 젤의 A) 예제 이미지. 가교, 후 hydrogels 세포 배양 매체에 부 어 했다. 확산 속도의 B) 대표 결과 cytometry 사용 하 여 측정. GBM 셀 (HK301)은 1 µ M와 알을 품을 캡슐화 하거나 뿌리고 후 4 일째에 2.5 h에 대 한 듀 (5-ethynyl-2-deoxyuridine). 클릭 반응 켤레 아오 외 에 설명된대로 법인된 듀 형광 염료를 사용 했다 2017.3 부정적인 컨트롤, 어디 아무 듀 문화에 추가 되었습니다, 포함 했다. C) 대표 confocal 현미경 이미지의 라이브 (녹색) 그리고 죽은 (레드) 세포 24 시간 후에 GBM 셀 (HK157)의 하이드로 겔 문화 설립 되었다. 스케일 바 = 200 µ m. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.

그림 3 : 특성화. 0.5% (w/v) HA 히드로 배양 세포 캡슐화 후 8 일에 대 한 다양 한 조건에서의 A) 대표 위상 대비 이미지. 화살표는 침략 적 형태와 셀을 나타냅니다. 생물 발광 신호 B) 대표 이미지 1 µ M erlotinib와 차량 (DMSO) 치료의 15 일 후 측정. 1mm D 소 세포 배양 매체 영상 이전 1 시간에 추가 되었습니다. 셀은 lentivirus 캡슐화 이전 반딧불 luciferase 제정 표현을 위한 인코딩으로 불리고 있었다. C) 대표 면역-오 점 이미지 분석 죽 hydrogels 0.5% (w/v) 하 고 1 kPa 압축 계수에서 경작 하 GBM 셀 (HK301)에 많은 ADP 중 합 효소 (cl-PARP) 식 습. 모든 자른 이미지 표시 같은 오에서 했다. D) 대표 얼룩 콜라겐 IV (녹색) 및 Hoechst 33342 (블루) HK301 셀 하이드로 겔 교양 12 일에에서 1 µ m erlotinib와 차량 (DMSO) 치료 후. 눈금 막대 = 200 µ m. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.
| 젤 타입 | 일부는 (40 µ L 각) | 파트 B (40 µ L 각) | ||||
| 4Arm-말뚝-말 (50 mg/mL) | 시스테인 또는 RGD (2.81 m m) | PBS (pH 7.4) | 4Arm-말뚝-thiol (50 mg/mL) | PBS (pH 7.4) | 하-S (13.3 mg/mL) | |
| 0.5% (w/v) HA 1kPa | 10 Μ L | 4.00 Μ L | 26 Μ L | 1.00 Μ L | 9.00 Μ L | 30.0 Μ L |
| 0.5% (w/v) HA 2kPa | 20.0 Μ L | 4.00 Μ L | 16.0 Μ L | 8.00 Μ L | 2.00 Μ L | 30.0 Μ L |
| 0.1% (w/v) HA 1kPa | 10 Μ L | 4.00 Μ L | 26 Μ L | 8.00 Μ L | 26.0 Μ L | 6.00 Μ L |
표 1입니다. 하이드로 겔 제형 저조한 하 농도 및 기계적 특성의 독립 제어.
저자 들은 아무 경쟁 금융 관심사 선언 합니다.
여기, 우리 두뇌 매트릭스를 모방 하도록 설계 하는 기가 가변 생체 내의 세포종 환자에서 파생 된 셀의 3 차원 문화에 대 한 프로토콜을 제시. 이 접근 한 생체 외에서세포종 세포 vivo에서 일반적으로 문화에서 길을 잃 었의 많은 특성을 유지 하는 실험 플랫폼을 제공 합니다.
이 작품은 NIH (R21NS093199)와 UCLA 아크 3R의 수상에서 자금을 지원 했다. 우리의 충심으로 감사 합니다는 HK301 및 HK157 셀 라인의 제공에 대 한 닥터 할리 로드의 실험실으로 이동합니다. 우리 또한 감사 UCLA 조직 병리학 코어 연구소 (TPCL) cryosectioning, 고급 조명 현미경/분광학 핵심 시설 (연금)에서 캘리포니아 Nanosystems 연구소 (CNSI) ucla confocal 현미경, UCLA Crump 연구소의 사용에 대 한 IVIS 이미징 시스템, UCLA 분자 계측 센터 (MIC) 흐름에 대 한 계측을 제공 하기 위한 자기 공명 분광학, 및 교류 Cytometry 코어에 Jonsson 종합 암 센터 (JCCC) UCLA에서 제공를 사용 하 여에 대 한 분자 영상 cytometry입니다.
| pH 측정기 | Thermo Fisher | N/A | pH 2-10 감도의 모든 pH 측정기 |
| Stir plate | Thermo Fisher | N/A | 일반 실험실 장비 |
| 삼각 플라스크(125mL) | Thermo Fisher | FB-501-125 | |
| 투석 튜브 | Thermo Fisher | 21-152-14 | |
| 2L 폴리프로필렌 비커 | Thermo Fisher | S01916 | |
| 히알루론나트륨 | Lifecore | HA700k-5 | 500-750 kDa 범위 |
| 1-에틸-3-(3-디메틸아미노프로필) 카르보디이미드(EDC) | 써모 피셔 | PI-22980 | |
| N-하이드록시숙신이미드(NHS) | 시그마 알드리치 | 130672-5G | |
| 염산(HCl) | Thermo Fisher | SA48-500 | |
| 수산화나트륨(NaOH) | Thermo Fisher | SS266-1 | |
| 시스타민 디하이드로클로라이드 | Thermo Fisher | AC111770250 | |
| 디티올트레이톨(DTT) | Thermo Fisher | BP172-25 | |
| Ellman의 테스트 시약(5-(3-Carboxy-4-nitrophenyl)디설파닐-2-니트로벤조산 | , 시그마 알드리치 | D218200-1G | |
| 중수소수(산화중수소) | Thermo Fisher | AC166301000 | |
| 0.22&마이크로; m 진공 구동 필터 | CellTreat | 229706 | |
| 인산염 완충 식염수(PBS) | Thermo Fisher | P32080-100T | |
| Hanks' Balanced Salt Saline(HBSS) | Thermo Fisher | MT-21-022-CV | |
| 4-arm-PEG-maleimide | JenKem Technology | A7029-1 | 분자량 약 20kDa |
| 4-arm-PEG-thiol | JenKem Technology | A7039-1 | 분자량 약 20kDa |
| L-시스테인 | 시그마 알드리치 | C7880-100G | |
| RGD ECM 모방 펩타이드 | Genscript Biotech | N/A | "GCGYGRGDSPG" 시퀀스의 맞춤형 펩타이드, N-터미널은 아세틸화 실리콘 몰드여야 합니다 |
| Sigma Aldrich | GBL664201-25EA | 면도날을 사용하여 단일 조각으로 | |
| 절단 완전한 배양 배지 | 다양 | 비 혈청 보충 (GeminiBio의 G21), 표피 성장 인자 50ng / mL (Peprotech), 섬유 아세포 성장 인자 20ng / mL (Pepro Tech) 및 heprain 25 µ를 사용한 DMEM / F12 (Thermofisher); g/mL(Sigma Aldrich), 배양 배지는 실험실마다 다릅니다. | |
| 환자 유래 GBM 세포 | N/A | N/A | |
| 20G 바늘 | BD 의료 | 305175 | |
| 1mL 주사기 Thermo | Fisher | 14-823-434 | |
| 10mL 주사기 | BD 의료 | 302995 | |
| RIPA Buffer | Thermo Fisher | PI-89901 | |
| 프로테아제/ 인산가수분해효소 억제제 미니 정제 | 시그마 알드리치 | 5892970001 | |
| 보텍스 쉐이커 | Thermo Fisher | 12-814-5Q | |
| TrypLE 익스프레스 | 써모 피셔 | 12604013 | |
| 70µ m cell strainer | Thermo Fisher | 22-363-548 | |
| 파라포름알데히드 | Thermo Fisher | AC416785000 | PBS에 4%(w/v)를 용해하고 pH 7.4 |
| D-sucrose | Thermo Fisher | BP220-1 | |
| 최적 절단 온도(O.C.T.) 화합물 | Thermo Fisher | NC9373881 | |
| Cell Culture incubator | Thermo Fisher | N/A | 일반 5 % CO2 및 37C |
| 냉장고 / 냉동고 | Thermo Fisher | N / A | -20C 및 -80C 용량의 일반 실험실 장비 |
| 일회용 임베딩 금형 | Thermo Fisher | 12-20 | |
| Lyapholizer | Labconco | N / A | Any -105C 동결 건조기 |
| HEPES | Thermo Fisher | BP310-500 | |
| 앰버 바이알 | Kimble Chase | 60912D-2 | |
| 와이드 오리피스 피펫 팁 | Thermo Fisher | 9405120 | |
| 2-methylbutane | Thermo Fisher | 03551-4 | |
| 드라이 아이스 | N/A | N/A |