방법 논문

단백질 기반 Hydrogels 대상이 힘-클램프 Rheometry

DOI:

10.3791/58280

2018년 8월 21일

이 논문에서

요약

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새로운 힘-클램프 rheometry 기술은 낮은 볼륨 단백질 기반의 히드로 샘플 음성 코일 모터와 힘 센서 사이의 곁의 기계적 성질을 조사 하는 데 사용 됩니다. 아날로그 비례-적분-미분 (PID) 시스템 강제로 원하는 프로토콜을 경험된의 '죄'에 대 한 수 있습니다.

초록

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여기, 우리는 단백질 기반 hydrogels의 biomechanical 속성 특성 힘-클램프 rheometry 메서드를 설명 합니다. 이 메서드는 아날로그 비례-적분-미분 (PID) 시스템을 사용 하 여 원통형 단백질 기반의 히드로 샘플, 선형 음성 코일 모터와 힘 변환기 사이 곁에 힘 제어 프로토콜을 적용. 작업 중 PID 시스템 측정 및 설정 포인트 세력 간의 차이 최소화 하 여 힘을 미리 정의 된 프로토콜에 따라 하이드로 겔 샘플의 확장을 조정 합니다. 단백질 기반 hydrogels이 독특한 접근 방식 다른 단백질 농도와 매우 낮은 볼륨 하이드로 겔 샘플 (< 5 µ L)의 밧줄 수 있습니다. 힘 램프 프로토콜, 어디 적용된 스트레스 증가 하 고 선형 시간 감소, 아래 시스템 표준 탄성의 측정 및 단백질의 폴딩 (유엔)와 관련 된 탄성과 히스테리시스 동작의 연구 활성화 및 점 탄성 매개 변수입니다. 상수-힘, 힘 펄스는 단계 같은 모양, 탄성 응답 인해 힘에 있는 변화에 아래에서 점 탄성, 전개 및 refolding 단백질 도메인에서 분리 된입니다. 낮은 볼륨 샘플 및 다양 한 기계적 섭 적용에 다양성, 힘-클램프 rheometry 대량 접근을 사용 하 여에서 단백질의 기계적 응답을 조사 하기 위해 최적화 됩니다.

서론

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독특한 물리적 특성 떨어져, 단백질 기반 hydrogels 붐비는 환경에 있는 단백질의 연구를 활성화 한 '당겨'에 몇 십억 분자의 측정 함으로써 힘 분광학을 혁명의 약속을 잡으십시오 피부와 다른 조직에 있어서 그 비슷한. 단백질 도메인 유지 hydrogels, 강제로, biomechanical 반응의 연구를 수 있도록 내부 접힌 파트너 및 화학 조건 바인딩. 또한, biomechanical 응답 hydrogels 내부 단백질 도메인의 단일 분자 힘 분광학 기법으로 본 응답을 유사 합니다. 예를 들어 화학 denaturants 및 산화 제 접힌된 상태, 단일 단백질 도메인 수준1,2,3 와 거시적인 레벨4,5 에서 안정성을 감소 , 6 , 7. osmolytes 단일 단백질8,9, 동일한 힘 조건....

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프로토콜

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1. 시 약 솔루션 준비

  1. [20 m m tris (hydroxymethyl) aminomethane 및 150 mM NaCl, pH 7.4] Tris 버퍼를 사용 하 여 원하는 농도에 관심사의 단백질을 용 해/diluting 하 여 시작 단백질 솔루션을 준비 합니다.
    참고: hydrogels로는 상호 연결에 대 한 작은 단백질 농도 단백질 사용에 따라 달라 집니다 및 일반적으로 > 1 m m 이다.
  2. Tris(bipyridine)ruthenium(II) 염화 암모늄 persulfate (APS) (1 M)의 주식을 준비 ([Ru(bpy)3]2 +) APS 용 해 하 여 (6.67 m m) 솔루션 및 Tris 버퍼에서 [Ru(bpy)3]2 + 파우더.

2. 단백질 기반 하이드로 겔 합성

  1. 누르면된 플런저와 1 mL 주사기에 23 G 바늘을 수정.
  2. 면도날을 사용 하 여 ()와 함께 0.022의 내부 직경에 0.044의 외부 직경 10 cm 소계 (PTFE) 튜브를 잘라. PTFE 튜브의 한쪽 끝을 바늘과 주사기를 연결 합니다.
  3. 실 란 솔루션으로 튜브의 두 번째 끝을 삽....

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결과

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그림 1A 는 L-£/ L8 하이드로 겔을 합성 하는 데 사용 하는 광 반응의 체계를 보여 줍니다. 그림 1B 는 photoactivation 전후 PTFE 튜브 히드로 혼합물을 보여줍니다. 그림 1C 트리 스 솔루션 내부 돌출된 L eGFP L8 하이드로 겔을 선물 한다. 하이드로 겔 샘플 노치 등 없는 구조적 결함이 있다. 명확 하 게 보이는 손상 Hydrogels 폐기 해야한다.

조립의 렌더링 및 힘-클램프 고분자의 분해 뷰 그림 2A2B에 선물 된다.

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토론

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여기, 우리는 낮은 볼륨 단백질 기반 hydrogels의 biomechanical 응답을 조사 하는 힘-클램프 rheometry 기법을 설명 합니다. 또한, 균일 한 원통형 낮은 볼륨 단백질 하이드로 겔 샘플을 합성 하는 프로토콜 제공 됩니다. 프로토콜도는 걸이에 어떤 기계적 변형 또는 단백질 기반 하이드로 겔 샘플 또는 젤의 미끄럼에 손상을 유발 하지 않고 다른 유형의 다양 한 신축성으로 단백질 기반 hydrogels 넥타이 하는 방법에 설명 합니다 제공 됩니다. 선형 음성 코일 및 힘 센서, 아날로그 PID 시스템 힘 램프 및 지속적인 힘 등 힘 제어 프로토콜의 응용 프로그램을 사용 합니다. 최근,이 기술은 다른 실험적인 솔루션7에 BSA 기반 hydrogels의 다른 복사해올된 농도의 biomechanical 반응을 하 사용 되었습니다.

공식화 하 고 단백질 hydrogels 작업할 때 중요 한 측면은 측정의 재현성. 젤은 너무 낮.......

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공개 사항

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저자는 공개 없다.

감사의 글

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연구 성장 이니셔티브 (보너스 번호 101 X 340), 국립 과학 재단, 주요 연구 계측 프로그램 (부여 번호 로부터 재정 지원을 인정합니다 PHY-1626450), 더 큰 밀워키 재단 (쇼 수상)와 위스콘신 대학 시스템 (응용된 연구 부여).

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재료

이 논문에 사용된 재료 목록
이름회사카탈로그 번호댓글
SI-KG4A 포스 트랜스듀서월드 정밀 기기 (WPI)SI-KG4A
리니어 보이스 코일 모터설비 솔루션LFA2010
소 혈청 알부민록키 마운틴 바이오 제제 (RMBIO)BSA-AAF-1XG / 100 G
TrizmaSigma-AldrichT1503-1KG
염화나트륨Sigma-AldrichS7653-1KG
암모늄 퍼설페이트 Sigma-Aldrich248614-100G
Tris(bipyridine)ruthenium(II) chlorideSigma-Aldrich544981-1G
익스프레스 의료 용품  6-0 나일론 봉합사 12/PK피셔 사이언티픽NC0395626
1mL 주사기만, Luer-Lok TipBD309628
실란, SigmacoteSigma-AldrichSL2-25ML
마이크로보어 PTFE 튜빙, 0.022"ID x 0.042"OD, 100피트/롤Cole-ParmerEW-06417-21
피하 주사 바늘, 23 게이지헬스케어 공급 전문가305194
Jensen Global JG24-1.5X 레드 IT 분배 팁 - 24 게이지KIMCOJG24-1.5X
USH-103D USHIO 100W 짧은 아크 수은 램프ALBUSH-103D USHIO
의료 핀셋
의료 가위
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참고문헌

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  1. Cao, Y., Li, H. How do chemical denaturants affect the mechanical folding and unfolding of proteins? Journal of Molecular Biology. 375 (1), 316-324 (2008).
  2. Carrion-Vazquez, M., et al.

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재인쇄 및 허가

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