여기, 선물이 단일 subtelomere에서 MS2 시퀀스 태그를 포함 하는 암 세포 클론을 생성 하는 프로토콜. MS2 GFP 시스템에 의존 하는이 방법은 생 성적표의 telomeric 반복 포함 된 RNA (테라)에서 살아있는 세포에서 단일 telomere 표현의 시각화 수 있습니다.
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방법 논문
여기, 선물이 단일 subtelomere에서 MS2 시퀀스 태그를 포함 하는 암 세포 클론을 생성 하는 프로토콜. MS2 GFP 시스템에 의존 하는이 방법은 생 성적표의 telomeric 반복 포함 된 RNA (테라)에서 살아있는 세포에서 단일 telomere 표현의 시각화 수 있습니다.
Telomeres는 복사할 수, 반복 포함 하는 긴 noncoding RNAs (테라), telomeric를 야 기한는 telomere 생물학, telomere 길이 항상성 섬으로 형성 등 중요 한 역할을 제안 되었습니다. 최근 연구 결과 밝혀 테라 분자도 마우스 배아 줄기 (ES) 세포에 유전자 발현을 조절 하기 위해 내부 염색체 영역 상호 작용. 이 증거에 따라 RNA 형광 제자리에서 교 잡 (RNA-물고기) 분석만 하위 집합으로 나타났습니다 테라의 성적표는 염색체 끝에 지역화. 테라 분자의 역학의 더 나은 이해는 그들의 기능 및 행동의 메커니즘을 정의 하는 데 도움이 됩니다. 여기, 우리 고 MS2 GFP 시스템을 사용 하 여 암 세포에서 단일 telomere 테라 성적표를 시각화 하는 방법을 설명 합니다. 이 목표에 선물이 안정적인 클론을 생성 하는 프로토콜 MS2 시퀀스에서 단일 subtelomere 통합을 포함 하 AGS 인간 위 암 세포 라인을 사용 하 여. MS2 태그 telomere에서 테라의 전사 (MS2-GFP) GFP 융합 MS2 RNA 의무적인 단백질의 공동 식 시 라이브 세포 형광 현미경 검사 법에 의해 시각 MS2 태그 테라 분자의 표현을 결과입니다. 이 방법은 수 연구원은 암 세포에서 단일 telomere 테라 분자의 역학을 공부 하 고 다른 셀 라인에 적용 될 수 있습니다.
긴 noncoding RNA 테라 염색체의 subtelomeric 지역에서 복사할 및 그것의 녹음 방송 종료 telomeric 반복로1,2내 염색체 끝을 향해. 이러한 이유로, 테라 사본 그들의 5' 끝에 subtelomeric 파생 시퀀스의 구성 하 고 telomeric 반복 (척추 동물에 UUAGGG)3종료. 역할 제안 되었습니다 테라,7,8 끝 telomeres4,5, DNA 복제6, 염색체 가운데 동종 재결합을 추진에서 섬으로 형성을 포함 하 여 중요 한 , 9, telomere 구조10및 telomere 길이 항상성2,11,,
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1입니다. 네오 마이 신 내성 클론의 선택
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그림 1 실험적인 전략의 개요를 나타냅니다. 프로토콜 및 AGS 셀에서 테라 MS2 클론의 세대를 위한 나타내는 타임 라인의 주요 단계 (그림 1A) 표시 됩니다. 1 일에서 6 잘 플레이트의 여러 우물 MS2 카세트와 sgRNA/Cas9 (참조 그림 1B) 벡터 표현 페는. 2 개의 다른 subtelomere 15q 전용 가이드 RNA 순서 Cas9 nickase 표현에서 복제는 pX335 벡터, 공동 transfected MS2 카세트는 2 개의 sgRNA pX335 벡터를 생성. 접시의 한 잘 transfection 효율을 확인 하기 위해 벡터를 표현 하는 GFP와 페 수 있습니다. 2 일에 셀 trypsinized 이며 .......
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이 문서에서 우리는 subtelomere 15q 통합 MS2 시퀀스를 포함 하는 인간의 암 세포 클론을 생성 하는 방법을 제시. 이러한 클론을 사용 하 여, subtelomere 15q에서에서 복사할 MS2 태그 테라 분자 MS2 GFP 융해 단백질의 공동 식으로 형광 현미경 검사 법에 의해 검색 됩니다. 이 방법은 단일에서 표현 하는 테라의 역학을 공부 하는 연구자 수 생활에서 telomere21세포. 이 프로토콜에서 테라 MS2 클론 AGS 셀 라인, 테라, 테라 식 이기 때문에 인간의 위 암 샘플24upregulated 공부 하는 재미 있는 모델 시스템을 나타내는 선택 됩니다. 그러나, 여기에 설명 된 프로토콜은 다른 셀 라인에서 테라 MS2 클론 선택 적용할 수 있습니다. MS2 시퀀스의 통합 원리에 홍보하실 수 있습니다 subtelomere 다른 telomere 15q에 특정 MS2 카세트 및 CRISPR 전략을 사용 하 여. 여기에 .......
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저자 아무 경쟁 금융 관심 선언
우리는 Trento의 대학에 CIBIO의 고급 이미징 시설 및 비엔나에서 BioOptics 빛 현미경 시설 최대 F. Perutz 실험실 (MFPL)에서 직원에 게 감사. 이러한 결과 연구는 기금을 받았다 Mahlke Obermann 재단 및 연구, 기술 개발 및 실증에 대 한 유럽 연합의 7 차 프레임 워크 프로그램에서 부여 계약 없음 609431 적에 EC는 이탈리아 정부 대학 교육 및 연구 (MIUR)에서 리 타 레비 Montalcini 친교에 의해 지원 됩니다.
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| 이름 | 회사 | 카탈로그 번호 | 댓글 |
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| AGS 세포 | - | - | Christian Baron(Université de Montré al)을 사용합니다. |
| F12K 너트 믹스 1X | GIBCO | 21127022 | AGS 세포 |
| L-글루타민용 배양 배지 | 코닝 | MT25005CI | 세포 배양 배지의 구성 요소 |
| 페니실린 스트렙토마이신 용액 | CORNING | 30-002-CI | 세포 배양 배지의 구성 |
| Fetal Bovine Serum | Sigma Aldrich | F2442 | 세포 배양 배지의 구성 |
| DMEM 1X | GIBCO | 피닉스 세포 | |
| CaCl2 | Sigma Aldrich | C1016 | 피닉스 세포 형질주입에 사용됨 |
| HEPES | 시그마 알드리치 | H3375 | 피닉스 세포 형질주입에 사용됨(HBS 용액), |
| KCl | 시그마, 알드리치 | P9333 | 피닉스 세포 형질주입(HBS 용액)에 사용됨, |
| 포도당, | 시그마, 알드리치 | D9434 | 피닉스 세포 형질주입(HBS 용액)에 사용됨, |
| NaCl | 시그마, 알드리치 | S7653 | 피닉스 세포 형질주입(HBS 용액) 및 레트로바이러스 침전에 사용됨 |
| Na2HPO4 | Sigma Aldrich | S3264 | 피닉스 세포 형질주입에 사용됨(HBS 용액), |
| TRYPSIN EDTA SOLUTION, 세포 | 분할에 사용되는 | CORNING | 59430C |
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| SDS | Sigma Aldrich | 71729 | 게놈 DNA 추출을 위한 세포 용해 완충액의 구성 요소 |
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