이 문서는 초파리 번데기 망막 조직의 immunohistochemistry, 서쪽 분석 및 RNA 추출에 대 한 처리에 대 한 프로토콜 함께 해 부에 대 한 수술 메서드를 제공 합니다.
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방법 논문
이 문서는 초파리 번데기 망막 조직의 immunohistochemistry, 서쪽 분석 및 RNA 추출에 대 한 처리에 대 한 프로토콜 함께 해 부에 대 한 수술 메서드를 제공 합니다.
초파리 번데기 망막 개발 하는 동안 전체적 프로세스의 연구에 대 한 우수한 모델 시스템을 제공합니다. 이 종이에 선물이 섬세 한 초파리 번데기 망막의 해 부에 대 한 신뢰할 수 있는 프로토콜. 외과 접근 pupae를 열고 정확 하 게 추출 눈 두뇌 단지를 쉽게 사용할 수 서 도구를 활용 합니다. 이러한 수 고정, 들어서는 immunohistochemistry, 망막에 다음 현미경 슬라이드에 장착 되며 목표 세포 또는 subcellular 구조를 감지 하는 경우를 몇 군데. 또는, 떼어낸된 망막 뇌 조직에서 분리, 적절 한 버퍼에 lysed 고 단백질 젤 전기 이동 법 또는 mRNA 추출 (각각 단백질 또는 유전자 식 평가)에 대 한 활용. 상당한 연습과 인내심, 기정 프로토콜을 마스터 해야 할 수 있습니다 하지만 일단 마스터, 프로토콜 수 주로 손상된 망막의 상대적으로 빠른 절연 있습니다.
초파리 망막 색소 세포 벌집 격자1,2,,34배열에 의해 포위 하는 약 750 ommatidia 구성 됩니다. 각 ommatidium 8 포토 리셉터 신경, 4 렌즈 은닉 원추 세포, 그리고 두 가지 기본 안료 세포에 포함 되어 있습니다. 각 ommatidium를 주변 안료 생산 격자 세포와 감각 강 모 그룹 있습니다. 포스트 mitotic 자연 및 틀에 박힌 6 각형 배열, 초파리 번데기 망막 세포 접착5,6,를 포함 하 여 전체적 프로세스의 연구에 대 한 우수한 모델 시스템을 제공 7,8,9,10 및 apoptosis11,12,13,,1415.
여러 게시 프로토콜 초파리 번데기16,,1718에서 눈 뇌 단지 추출 공기 압력을 이용 한다. 프로토콜 설명 여기 대신 활용 하 서 도구를 신중 하 고 정확 하 게 격리 눈-뇌 손상된 망막 조직을 얻기의 목적으로 단지. 이것은 망막에 대 한 활용 하는 경우 중요 한 형태학, 단백질, 또는 유전자 발현 분석 때문에 망막 손상 세포 스트레스 또는 죽음, 세포 표현 형 또는 진 식을 수정할 수 발생할 수 있습니다. 또한, 연습 후, 6 ~ 10 눈 두뇌 단지 10 ~ 15 분, 나이 및 해 부 눈 조직의 발달 단계에서 가변성을 최소화의 목표를 용이 하 게 고립 될 수 있다.
고정, immunostaining, 및 아래에 설명 된 전체 마운트 프로토콜은 형광 현미경 검사 법에 대 한 초파리 눈의 준비에 적합 하다. 망막은 관심사의 단백질을 대상으로 하는 항 체와 알을 품을 수 있다. 예를 들어 외화 접합 부품에 항 체 특성 셀을 포함 하 여, 모양 및 배치 평가19될 수 있도록 셀의 꼭대기 크기를 시각화 하기 위해 활용할 수 있습니다. 고정, 이전 서쪽 분석, 단백질 또는 RNA qRT-PCR에 사용 하기 위해 또는 RNA 시퀀싱을 추출 하기 위해 뇌에서 눈 죽 습 수 대신 수 있습니다.
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1. 조직 준비
2입니다. 눈-두뇌 단지의 해 부
3. 면역 형광 검사에 대 한 조직의 처리
4. 서 부 럽 눈 조직의 준비:
5. 눈 조직의 RNA 추출 준비:
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번데기 눈은 그 드라이브 morphogenesis 발달 과정을 조사 하는 우수한 모델 역할을 쉽게 액세스할 수 있는 조직 이다. 여기, 우리 망막 해 부는 면역 형광 꼭대기 외화 접합 (그림 3A, C) 또는 apoptosis (그림 3)25동안 활성화 되는 Dcp-1 caspase (그림 3D)를 감지 하는데. 이러한 방식을 명확 하 게 모집 등 (18 h APF)에서 1 차 셀의 morphogenesis 키 전체적 과정 동안 세포를 관찰 할 수, 격자의 윤 각 ommatidium (18-24 h APF), 주위 세포의 설립은 3 차 틈새 (21-24 h APF), 셀 크기와 모양 (18 h 40 h APF)에서 및 apoptosis (18 ~ 33 h APF)에서 변경 합니다. 이러한 전체적 이...
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여기에 설명 된 초파리 번데기 눈 해 부 방법 10 ~ 15 분 이내 6-10 눈 두뇌 단지의 격리에 대 한 수 있습니다. 그러나, 인 내와 연습 절 개 기술을 지배 품질 및 해의 속도 향상 시키기 위해 필수적입니다. 이 짧은 해 부 시간 각 눈 약 동일한 개발 단계, 표현 형 또는 유전자 표현의 데이터 집합에서 망막에 있는 가변성을 감소를 통해. 우리의 프로토콜은 조직적으로 찢 어 또는 깎기, 눈에 손상을 수 있는 스트레스 통로 활성화를 유도 또는 때문에의 위험을 최소화 하면서 섬세 한 망막 조직을 분리 하도록 대체 프로토콜 마스터를 덜 연습 해야, 하는 동안 세포 죽음입니다. 우리는 초보자 첫 번째 마스터 pupae 젊은 눈 해 부를 하기 전에 40 h APF 경작의 해 부를 조언. 거기는 항상 충분 한 pupae 컬렉션 (1.3 단계)에 사용할 수 있도록 것입니다 모든 실험 (단계 1.1)에 대 한 복제 설정 교차 하는 것이 좋습니다. 망막은 번데기 개발 연구원에 관심의 뚜렷한 전체적 이벤트에 따라 다양 한...
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저자는 공개 없다.
우리는 원고에 잭 드럼과 도움이 의견에 대 한 우리의 검토 감사합니다. 이 작품은 R15GM114729에 의해 지원 되었다.
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| 이름 | 회사 | 카탈로그 번호 | 댓글 |
|---|---|---|---|
| Adobe Photoshop | Adobe | 이미지 처리 소프트웨어 | |
| 대나무 부목, 6" | Ted Pella Inc | 116 | |
| 베타 메르캅토에탄올 | 시그마-알드리치 | M3148 | |
| 베타-글리세롤 포스페이 | 시그마-알드리치 | 50020 | |
| 검은색 해부 접시 | 가장자리까지 SYLG170 또는 SYLG184(곱게 간 숯 가루로 검은색)으로 채워진 유리 페트리 접시. 중합을 위해 24-48시간 동안 실온에 두십시오. | ||
| 블레이드 홀더 | Fine Science Tools | 10053 | |
| 소 혈청 알부민 | Sigma-Aldrich | A7906 | |
| cOmplete, EDTA free 프로테아제 억제제 칵테일 정제 | Roche | 4693132001 | |
| Confocal microscope (Zeiss LSM 501) | Carl Zeiss | 또는 이와 유사한 현미경 | |
| Diethyl Pyrocarbonate (DEPC) | Sigma-Aldrich | 40718 | |
| 양면 테이프 | 3M | 665 | |
| Drosophila 식품 매체, 영양이 풍부한 | 7.5% 자당, 15% 포도당, 2.5% 한천, 20% 맥주 효모, 5% 펩톤, 0.125% MgSO4.7H2O, 0.125% CaCl2.2H2 | ||
| >0Drosophila 식품 매체, 표준 | 블루밍턴 초파리 스톡 센터 옥수수 가루 레시피. (https://bdsc.indiana.edu/information/recipes/bloomfood.html) | ||
| 에틸렌디아민테트라아세트산 | 시그마-알드리치 | E6758 | |
| PBS의 고정액 | 4% 포마데히드, pH 7.4. | ||
| 형광 현미경 (TCS SP5 DM 현미경) | Leica Microsystems | 또는 유사한 현미경 | |
| 집게 | Fine Science Tools | 91150-20 | 집게는 자주 날카롭게 해야 합니다. |
| 포름알데히드 | Thermo Scientific | 28908 | |
| 유리 9-웰 디쉬 | Corning | 7220-85 | 9-웰 디쉬라고도 함 |
| 유리 커버 슬립 (22 x 22 mm) | Fisher Scientific | 12-542-B | |
| 유리 현미경 슬라이드 (25 x 75 x 1 mm) | Fisher Scientific | 12-550-413 | |
| 유리 페트리 접시 | Corning | 3160-100BO | |
| 글리세롤 | Sigma-Aldrich | G5516 | |
| Image Studio 소프트웨어 버전 5.2.5 | LI-COR Biosciences | 웨스턴 블롯의 정량화를 위한 이미지 처리 소프트웨어. | |
| Laemmli 샘플 버퍼 | Bio-Rad | 161-0737 | 2X 농축 단백질 샘플 버퍼, 제조업체의 지침에 따라 베타 메르캅토에탄올을 보충합니다. |
| 샘플 버퍼를 줄이는 레인 마커 | ThermoFisher Scientific | 39000 | 5X 농축 단백질 시료 버퍼. |
| 마이크로 원심분리기 튜브 | Axygen | MCT-175-C | |
| 미세해부 가위 | Fine Science Tools | 15000-03 | |
| Microwell 트레이 (72 x 10 µ L wells) | Nunc | 438733 | |
| 마운팅 매체 | PBS N-프로필갈레이트에 0.5% N-프로필갈레이트 및 80% 글리세롤 | ||
| Sigma-Aldrich | P3130 | ||
| 뉴클레아제가 없는 PBS(0.1% DEPC의 PBS, pH 7.4) | PBS에 적절한 양의 DEPC를 첨가하고 잘 섞은 후 실온에서 일정한 교반으로 밤새 배양합니다. 최소 20분 동안 오토클레이브합니다. 4°C에 저장; C | ||
| PBS (인산염 완충 식염수 pH 7.4) | Sigma-Aldrich | P5368 | 제조업체의 지시에 따라 준비 |
| PBS+pi (PBS 플러스 프로테아제 및 포샤타제 억제제) | 10mM NaF, 1mM 베타-글리세롤 포스페이트 및 1mM Na3VO4 PBS, pH 7.4. | ||
| PBT | 0.15% TritonX 및 0.5% 소 혈청 알부민, PBS, pH 7.4 | ||
| 핀 홀더 | Fine Science Tools | 26016-12 | |
| 1차 항체: 염소 항-GAPDH | Imgenex | IMG-3073 | 웨스턴 블로팅용. 1:3000에서 사용 |
| 1차 항체: 토끼 anti-cleaved Dcp-1 | 세포 신호 | 9578S | 면역형광용. 1:100 1차 |
| 쥐 anti-DEcad | Developmental Studies Hybridoma Bank | DCAD2 | . 1:20 |
| 1 차 항체 : rat anti-DEcad | DOI : 10.1006 / dbio.1994.1287 | DCAD1 | 우에무라 타다시의 선물. 1:100에 사용됩니다. |
| RNA 제거 키트: Relia Prep RNA 조직 Miniprep 키트 | Promega | Z6110 | |
| Rnase 오염 제거 시약(RNase Away) | Molecular BioProducts | 7002 | |
| 메스 블레이드 | Fine Science Tools | 10050 | 스케이프 블레이드의 작은 조각을 부수고 블레이드 홀더에 고정합니다. |
| 2차 항체: 488-conjugated 당나귀 항쥐 IgG (H+L) | Jackson ImmunoResearch | 712-545-153 | 면역형광용. 1:200 |
| 2차 항체: cy3-conjugated goat anti-rabbit IgG (H+L) | Jackson ImmunoResearch | 111-165-144 | 면역형광용. 1:100 |
| 2차 항체에서 사용: HRP-conjugated goat anti-rat IgG (H+L) | Cell Signaling Technology | 7077 | 웨스턴 블로팅용. 1:3000 |
| 2차 항체: HRP-conjugated rabbit anti-goat IgG (H+L) | Jackson ImmunoResearch | 305-035-003 | 웨스턴 블로팅용. 1:3000 |
| 나트륨 염화물 | Sigma-Aldrich | S3014 | |
| 나트륨 플루오라이드 | Sigma-Aldrich | 215309 | |
| 바나데이트 나트륨 | Sigma-Aldrich | 50860 | |
| 분광광도계 (NanoDrop) | ThermoFisher Scientific | 2000c | |
| 실체 해부 현미경 (M60 또는 M80) | Leica Microsystems | 또는 이와 유사한 현미경 | |
| Sylgard (black) | Dow Corning | SYLG170 | |
| Sylgard (투명) | Dow Corning | SYLG184 | 색상 곱게 분쇄 된 숯 가루가있는 검정색 |
| 조직 : Kimwipes | KIMTECH | 34120 | |
| TritonX | Sigma-Aldrich | T8787 | |
| Trizma hydrochloride pH7.5 | Sigma-Aldrich | T5941 | |
| 텅스텐 바늘, 미세 | Fine Science Tools | 10130-10 | 핀 홀더에 삽입 |
| 텅스텐 바늘, 견고한 | Fine Science Tools | 10130-20 | 핀 홀더에 삽입 |
| WTLB (Western Tissue lysis Buffer) | 50mM Tris-HCl (pH 7.5)에서 150mM NaCl, 1.5 % Triton X-100, 1mM EDTA, 20 % 글리세롤, 10mM NaF, 1mM 베타 글리세롤 인산염 및 1mM Na3VO4. 10mL 용액당 1개의 cOmplete 프로테아제 칵테일 테이블을 보충하십시오. | ||
| 효모 페이스트 | (현지 슈퍼마켓) | ~20mL 증류된 H2O에 용해된 Fleischmann's ActiveDry 효모(또는 이와 유사한 것) 약 2테이블스푼 |
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