이 프로토콜은 시판되는 DNA 젤 얼룩이 있는 미토콘드리아 핵종의 특정 라벨링, 초고해상도 구조조명 현미경(SR-SIM)에 의한 라이브 라벨링 세포의 타임랩스 시리즈 획득, 핵운동의 자동 추적을 설명합니다.
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이 프로토콜은 시판되는 DNA 젤 얼룩이 있는 미토콘드리아 핵종의 특정 라벨링, 초고해상도 구조조명 현미경(SR-SIM)에 의한 라이브 라벨링 세포의 타임랩스 시리즈 획득, 핵운동의 자동 추적을 설명합니다.
미토콘드리아 핵형성은 단백질로 코팅된 미토콘드리아 DNA 분자에 의해 형성된 소형 입자입니다. 미토콘드리아 DNA는 tRNA, rRNAs 및 몇몇 필수 미토콘드리아 폴리펩티드를 인코딩합니다. 미토콘드리아 핵형성은 핵분열/융합 및 기타 형태학적 변화를 겪는 동적 미토콘드리아 네트워크 내에서 분열및 분배됩니다. 고해상도 라이브 형광 현미경 검사법은 핵신의 위치와 움직임을 특성화하는 간단한 기술입니다. 이 기술을 위해, 핵형성은 그들의 단백질 분대, 즉 전사 인자 a (TFAM)의 형광 태그를 통해 일반적으로 표지됩니다. 그러나 이 전략은 아티팩트(TFAM에 대해 보고됨)를 유발할 수 있는 형광 단백질 태그가 지정된 구성물의 과발현이 필요하며 많은 경우에 실현 가능하지 않습니다. 유기 DNA 결합 염료는 이러한 단점을 가지고 있지 않습니다. 그러나, 그(것)들은 항상 핵과 미토콘드리아 DNA 둘 다의 얼룩을 보여주기, 따라서 미토콘드리아 핵형성에 특이성이 결여됩니다. 이러한 염료의 물리 화학적 특성을 고려하여 핵산 젤 얼룩(SYBR Gold)을 선택하고 살아있는 세포에서 미토콘드리아 핵세포의 우대 라벨링을 달성했습니다. 염료의 특성, 특히 DNA에 결합시 높은 밝기는 초고해상도 구조 조명 이미지의 타임 시리즈를 사용하여 미토콘드리아 핵운동의 후속 정량화를 허용합니다.
원형 16.5 kbp DNA 분자는 미토콘드리아의 유전 물질을 구성하며, 미토콘드리아 산화 인산화 복합체에 필요한 22 tRNAs, 2 rRNAs 및 13개의 폴리펩티드를 인코딩합니다. 미토콘드리아 DNA는 미토콘드리아 전사 인자 a(TFAM) 및 여러 다른 단백질에 결합하여 미토콘드리아 핵형성1,,2,,3,,4. 미토콘드리아 핵형성은 세포 주기 상, 스트레스 및 기타 요인에 따라 형태학적리모델링,핵분열 또는 융합동안 미토콘드리아네트워크의성분 들 간에 이동 및 재분배(Pernas et al.7). 또한, 미토콘드리아 핵소자의 움직임은, 전신 성 홍반성 루푸스 질환8에 연루되어 다른 질병에 역할을 할 수 있다. 형광 현미경 검사법은 세포기관의 살아있는 세포 연구를 위한 간단한 기술입니다, 그러나 기술은 미토콘드리아 핵형성의 크기보다는 더 큰 >200 nm의 해결책을 가지고 있습니....
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참고: 여기에서 언급된 모든 세포주들은 10% 태아 소 혈청(FBS), 글루타민, 페니실린/스트렙토마이신 및 피루바테로 보충된 고당포도도당 덜베코의 변형 된 독수리 배지 (DMEM)에서 배양되었습니다. 인큐베이터에서 최대 37°C까지 예열하여 라벨링 및 이미징 당일에 사용되는 모든 매체 및 보충제를 5%CO2로평형화한다. 라벨링을 포함한 모든 세포 배양 작업은 층류 후드 하에서 멸균 조건에서 일어난다.
1. 라이브 셀 라벨링
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SG를 통해 라이브 셀 라벨링의 특성화
먼저, 다양한 희석제에서 염료를 배양시 세포내SG의 분포는 공초점 현미경으로 특징지어졌다. SG 또는 피코그린의 고농도로 배양한 후, 둘 다 염료는 대부분 핵에 표지하고 세포질에서 반점 염색을 나타내었다(도1),유사하게 다른 양전하파된 사이아닌 염료(즉, 피코그린)에 대한 출판된 데이터와 유사하게15. 그러나, 1:10,000 희석에서 SG로 배양시, 희미한 염색이 핵에 나타났고, 세포질에서는 밝은 반점의 패턴을관찰하였다(도 1). 한편, 피코그린 염료를 1:10,000으로 배양하여 대부분 핵 염색을 산출했다. SG 신호는 동일한 농도에서 피코그린보다 훨씬 밝습니다. 데이터는 SG가 그밖 유사한 DNA 결합 염료 보다는 화상 진찰 미토콘드리아 DNA.......
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프로토콜에는 몇 가지 중요한 구성 요소가 있습니다 : 미토콘드리아 DNA의 우선 라벨링을 얻으려면 배양 중에 DNA 결합 염료의 농도가 매우 낮게 유지되어야합니다 (예 : 일반적인 상용 재고의 1 :10,000 희석), 인큐베이션 시간은 30 분이어야합니다. 인큐베이션 시간은 1 h를 초과해서는 안됩니다. 다른 DNA 결합 염료는 낮은 농도에서 라벨링시 강한 신호를 생성할 만큼 충분히 밝지 않습니다.
우리의 프로토콜의 한계는 염료가 투과 단계 동안 미토콘드리아 핵형성으로부터 세척된다는 것입니다. 따라서, 기재된 절차는 통상적인 면역형광 프로토콜에 적합하지 않다. 이 경우 고정 된 세포의 핵형성은 DNA 또는 미토콘드리아 전사 인자 (TFAM)에 대한 항체와 같은 다른 기술로 효율적으로 표지 될 수 있습니다.
DNA 결합 유기 염료를 가진 미토콘드리아 핵세포의 직접 표지는 형광 성 단백질 표지에 비해 장점이 있습니다: 모든 유형의 .......
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저자는 공개 할 것이 없다.
저자는 아시파 아크타르와 안젤리카 람볼드 (면역 생물학 및 후성 유전학에 대한 막스 플랑크 연구소 모두) HeLa 세포를 제공하기위한 인정.
....액세스가 제한되었습니다. 이 콘텐츠를 보려면 로그인하거나 체험판을 시작하세요.
| 이름 | 회사 | 카탈로그 번호 | 댓글 |
|---|---|---|---|
| Elyra PS1 | Carl Zeiss | 다중 모드 초고해상도 현미경 초고해상도 구조 조명 현미경(SR-SIM)용 모듈 | |
| 고포도당 DMEM | GIBCO/ThermoFisher | 31966021 | |
| ibidi 35mm 접시, 유리 바닥 | Ibidi Gmbh | 81158 | |
| ibidi 8웰 마이크로슬라이드, 유리 바닥 | Ibidi Gmbh | 80827 | |
| Imaris 8.4.1 | Bitplane/Oxford Instruments | 이미지 처리 및 시각화 소프트웨어 패키지 | |
| iXon 885 | Andor Technologies | EMCCD 카메라(이면조사형 센서 포함 | |
| LSM880 Airyscan | Carl Zeiss | 어레이 검출기가 있는 레이저 스캐닝 컨포칼 현미경 | |
| Mitotracker CMXRos Red | ThermoFischer | M7512 | 빨간색 라이브 셀 미토콘드리아 stain |
| Mitotracker Deep Red FM | ThermoFischer | M22426 | 원적외선 미토콘드리아 염색 |
| picoGreen | ThermoFischer | P7581 | 세포 투과 DNA 염색 |
| Plan Apochromat 100x/1.46 오일 대물 | Carl Zeiss | ||
| SYBR Gold | ThermoFischer | S11494 | cell permeant DNA stain |
| Zen Black 2012 software | Carl Zeiss | 이미지 획득 및 처리 소프트웨어 |
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