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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
이 절차의 전반적인 목표는 가벼운 외상성 뇌 손상을 가진 쥐에 해마의 양적 미세 구조 정보를 얻는 것입니다. 이것은 파라메트릭 확산지도의 고급 확산 가중 자기 공명 영상 프로토콜 및 관심 영역 기반 분석을 사용하여 수행됩니다.
온화한 외상성 뇌 손상 (mTBI)는 취득한 두뇌 상해의 일반적인 모형입니다. 외상성 뇌 손상을 가진 환자는 엄청난 가변성 및 이질성 (나이, 성별, 외상의 모형, 그밖 가능한 병리 등)를 보여주기 때문에, 동물 모형은 임상 연구에 있는 한계인 요인을 해명에 있는 중요한 역할을 합니다. 그(것)들은 TBI 다음 상해 그리고 수리의 생물학 기계장치를 조사하기 위하여 표준화되고 통제된 설정을 제공합니다. 그러나 모든 동물 모델이 mTBI의 확산과 미묘한 특성을 효과적으로 모방하는 것은 아닙니다. 예를 들면, 일반적으로 사용되는 통제된 피질 충격 (CCI) 및 측량 타악기 상해 (LFPI) 모형은 두뇌를 드러내고 mTBI에서 일반적으로 보이지 않는 광범위한 초점 외상을 유도하기 위하여 개두엽을 이용합니다. 따라서 이러한 실험 모델은 mTBI를 모방하는 데 유효하지 않습니다. 따라서 mTBI를 조사하기 위해 적절한 모델을 사용해야 합니다. 쥐에 대 한 Marmarou 무게 드롭 모델 가벼운 외상을 유지 하는 환자에서 볼 수 있듯이 유사한 미세 구조 변경 및 인지 장애를 유도; 따라서 이 프로토콜에 대해 이 모델이 선택되었습니다. mTBI는 종종 단지 미묘하고 확산 부상을 유도하기 때문에 기존의 컴퓨터 단층 촬영 및 자기 공명 영상 (MRI) 검사는 일반적으로 가벼운 부상 다음 손상을 표시하지 않습니다. 확산 가중 MRI를 사용하면 뇌 조직의 미세 구조적 특성을 조사 할 수 있으며 가벼운 외상 후 현미경 변경에 대한 더 많은 통찰력을 제공 할 수 있습니다. 따라서, 본 연구의 목적은 온화하고 확산된 뇌 손상을 얻은 후 질병 진행을 추적하기 위해 선택된 관심 영역(즉, 해마)의 정량적 정보를 얻는 것이다.
외상성 뇌 손상 (TBI)은 최근 몇 년 동안 더 많은 관심을 얻고있다, 이러한 뇌 손상은 평생인지, 신체적, 정서적, 사회적 결과를 초래할 수 있다는 것이 분명해짐에 따라 1. 이 증가 인식에도 불구 하 고, 가벼운 TBI (mTBI, 또는 뇌진탕) 여전히 종종 과소 보고 하 고 진단. MTBI는 침묵하는 전염병으로 언급되고, mTBI의 역사를 가진 개별은 약물 남용또는 정신 문제의 더 높은 비율을 보여줍니다 2. mTBI를 가진 몇몇 환자는 수시로 전통적인 컴퓨터 단층 촬영 (CT) 또는 자기 공명 화상 진찰 (MRI) 검사에 보이지 않는 상해의 확산 그리고 미묘한 본질 때문에 매년 진단되지 않습니다. 뇌 손상의 방사선 학적 증거의 이 부족은 미세 구조 변화에 더 민감한 확산 MRI와 같은 더진보 된 이미징 기술의 개발로 이어졌다 3.
확산 MRI는 미세 구조의 생체 매핑을 허용하고,이 MRI 기술은 TBI연구 4,5,6에서광범위하게 사용되어왔다. 확산 텐서에서 분수 이방성(FA) 및 평균 확산도(MD)가 계산되어 부상 후 미세 구조 조직의 변경을 정량화합니다. mTBI 환자에 있는 최근 검토는 FA에 있는 증가 및 차축 팽윤7의 표시일 수 있는 상해 다음 MD에 있는 감소. 반대로, MD의 증가와 FA의 감소는 또한 부종 형성, 축축성 변성, 또는 섬유 오정렬/중단에따른 실치구조의 중단을 뒷받침하는 것으로 제안되고 있다 8. 이러한 혼합 된 사실 인정은 다른 유형의 충격 및 심각도 (예를 들어, 회전 가속, 무딘 힘 외상, 폭발 상해 또는 전자의 조합)에 의해 야기 된 mTBI의 유의한 임상 이질성에 의해 부분적으로 설명 될 수있다. 그러나, 현재 는 미세 구조 조직에 있는 변경을 뒷받침하는 근본적인 병리학 및 생물학/세포 기초에 관하여 명확한 합의가 없습니다.
동물 모델은 TBI에 이어 부상및 수리의 생물학적 메커니즘을 보다 자세하게 조사하기 위해 표준화되고 제어된 설정을 제공합니다. TBI에 대한 몇몇 실험 모델은 인간 TBI의 상이한 양상(예를 들어, 초점 대 회전력에의한 확산 외상) 9,10을나타낸다. 일반적으로 사용되는 동물 모델은 제어된 피질 충격(CCI) 및 측면 유체 타악기 손상(LFPI) 모델11,12를포함한다. 실험 적 매개 변수는 잘 제어 될 수 있지만,이 모델은 뇌를 노출하는 개두절제술을 사용합니다. 두개골 또는 두개골 골절은 일반적으로 mTBI에서 볼 수 없습니다; 따라서 이러한 실험 모델은 mTBI를 모방하는 데 유효하지 않습니다. Marmarou 등13에서 개발 한 충격 가속 모델은 헬멧에 의해 보호되는 쥐의 머리에 특정 높이에서 떨어지는 무게를 사용합니다. 이 동물 모델은 가벼운 외상을 유지하는 환자에서 볼 수 있듯이 유사한 미세 구조 변경 및 인지 장애를 유도합니다. 따라서, 이러한 마마루 중량 투하 모델은 확산 mTBI14,15에대한 이미징 바이오마커를 조사하는 데 적합하다.
이 보고서는 Marmarou 중량 투하 모델을 사용하여 mTBI 래트 모델에서 고급 확산 MRI의 적용을 보여줍니다. 먼저 도시된 것은 경증 및 확산 외상을 유도하는 방법, 및 확산 텐서 이미징(DTI) 모델을 이용한 분석이 제공된다. 특정 생물학적 정보는 보다 진보된 확산 모델[즉, 확산 쿠르토시스 이미징(DKI) 및 백색 물질 관 청렴성(WMTI) 모델]의 사용으로 얻어진다. 구체적으로, 온화한 외상이 가해지고 미세 구조적 변화는 기존의 T2 가중 MRI 및 고급 확산 이미징 프로토콜을 사용하여 해마에서 평가됩니다.
이 프로토콜은 겐트 대학교동물윤리위원회(ECD 15/44Aanv)의 승인을 받았으며, 모든 실험은 유럽연합 집행위원회의 지침(지침 2010/63/EU)에 따라 수행되었습니다.
1. 동물 준비 및 헬멧 부착
2. 외상성 뇌 손상의 유도 (TBI)
3. 확산 자기 공명 화상 진찰 (MRI)
참고 : 확산 가중 화상 진찰은 외상 유도 의 앞에 그리고 1 일 행해둡션.
4. 이미지 처리
참고: 다음 섹션에서는 확산 이미지의 처리가 MRtrix3, ExploreDTI19 및 Open 액세스 도구 상자인 Amide 소프트웨어20에 설명되어 있습니다. 그러나 전처리 단계는 다른 툴박스(예: FSL, MedInria, DTIStudio)에서 수행될 수 있다.
5. 통계분석
참고: 다음 섹션에서는 SPSS 통계 24에서 확산 이미지의 처리를 설명합니다. 그러나 통계 분석은 다른 통계 도구 상자에서 수행할 수 있습니다.
연구에서, 모든 TBI 랫트(n=10)는 충격에서 살아남았고 마취23에서분리된 후 15분 이내에 충격 및 마취로부터 회복할 수 있었다. CT 이미지에, 두개골 골절의 증거가 없었고 T2 이미지는 외상 후 1 일 타박상 부위에서 출혈, 확대 심실 또는 부종 형성과 같은이상을 나타내지 않았다 (그림 5). 따라서 해부학 적 이미지의 이러한 육안 검사에 기초하여 큰 초점 병변이 검출되지 않아 부상의 확산및 경미한 특성을 확인했습니다.
T2 영상과 확산 데이터 세트(단계 4.4) 사이의 공동 등록(non-rigid) 단계의 품질을 색 인코딩된 FA 맵에 T2 이미지의오버레이를 추가하여 조사하였다(도 6). 이어서, FA, MD, AD 및 RD 파라메트릭맵을 계산하고(그림 1) 아미드 소프트웨어에 로드하였다. FA 맵에 기초하여, 해마 구조를 포함하는 ROI가그려졌다(그림 4). 확산 메트릭의 통계 값은 관심 영역 내의 모든 복셀에 대해 평균으로 계산되었으며 추가 분석을 위해 각 DTI 메트릭의 평균 값을 내보냈습니다. DTI 메트릭의 이상값을 검사하여 확산 데이터의 또 다른 품질 검사를 수행할 수 있습니다. 예를 들어, 해마의 FA 값은 약 0.15여야 합니다. 따라서 <0.10(등방성 확산을 나타내는 값) 또는 >0.30(백색 물질에서 볼 수 있는 값)의 값은 생물학적으로 믿을 수 없는 값으로 간주될 수 있습니다. 이러한 데이터 포인트는 추가 분석에서 거부되어야 합니다. 또한, WMTI 모델의 AWF, AxEAD, RadEAD 및 TORT뿐만 아니라 확산 쿠르토시스 모델의 AK, RK 및 MK에대한 평균 값을 계산하였다(그림 2, 도3).
우리의 연구에서, DTI 메트릭의 분석은 mTBI 그룹에서 의 영향에 따라 상당한 증가 FA 값 (p = 0.007), 감소 확산값 (MD 및 RD) (p = 0.007 및 p = 0.007, 각각)을 밝혔다(그림7). 이러한 RD 및 MD 감소는 sham 군과 유의하게 달랐다(p=0.005 및 p =0.004 각각). 확산 쿠르토시스 메트릭은 충격에 따른 RK(p= 0.005)의 현저한 감소를 보였지만AK 또는 MK의 변화는 없었다(그림 8). WMTI 모델을 사용하여, RadEAD(p=0.007) 및 TORT(p=0.007)는 충격 후 1일 mTBI 군에서 각각 유의한 감소 및 증가를 나타냈다(도9C,D). sham 그룹의 값은 큰 변화를 나타내지 않았습니다.

그림 1: 소수 항등도(FA), 평균 확산도(MD), 축 확산도(AD) 및 방사형 확산도(RD)에 대한 대표적인 파라메트릭 맵. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 2: 평균 쿠르토시스(MK), 축 근쿠르(AK) 및 방사형 첨도(RK)에 대한 대표적인 파라메트릭 맵입니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 3: 축수 분획(AWF), 축방향 및 방사형 여분의 축방향 확산도(AxEAD, RadEAD) 및 비틀거림(TORT)에 대한 대표적인 파라메트릭 맵. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 4: MRtrix3에서 마스크만들기. ROI는 해마의 부피를 포함하는 모든 슬라이스에 해마 주위에 그려지고, 볼륨은 마스크 파일로 저장됩니다. 이것은 개별적으로 또는 파라메트릭 맵의 각각을 공동 등록 할 수있는 연구 특정 템플릿 마스크 파일을 사용하여 각 쥐에 대해 수행 할 수 있습니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

도 5: CT 및 T2가 대표적인 mTBI 동물의 가중 이미지 1일 충격 후. CT 이미지(맨 위 행)에는 두개골 골절이 표시되지 않습니다. T2 가중 이미지(아래쪽 행)에서 출혈, 확대된 심실 또는 부종 형성이 없음을 입증하였다. 주의 사항, 부종 형성은 외과 적 개입에서 상처 부위 주변의 강렬한 영역으로 명확하게 볼 수 있습니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 6: ExploreDTI에서 EPI, 모션 및 에디 전류 보정에 대한 보정 후 해부학 적 이미지와 오버레이 된 확산 데이터 세트의 컬러 인코딩 된 FA 맵. 표시된 것은 왼쪽에 나쁜 수정 및 공동 등록과 오른쪽에 좋은 예입니다. 색상 인코딩이 올바른지 확인해야합니다 : 빨간색의 왼쪽 - 오른쪽 방향 (예 : 코퍼스 callosum), 녹색의 전방 후방 방향 및 파란색의 열등한 우수한 방향 (예 : cingulum). 또한 색상 인코딩된 FA 이미지는 해부학 적 이미지와 완벽하게 정렬되어야합니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

도 7: sham(n=10) 및 mTBI 동물에 대한 해마의 확산 텐서 메트릭의 변화(n=10). 충격에 이어, mTBI 동물(B,D)에서 FA(A)의 현저한 증가와 평균 확산도(B) 및 방사형 확산도(D)가 현저한 감소하였다. mTBI 랫트에서 축 확산도(C)에 대해 유의한 차이는 관찰되지 않았다. 가짜 동물은 어떤 중요한 DTI 변화도 나타내지 않았다 (*p & 0.0125). 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

도 8: sham(n=10) 및 mTBI 동물(n=10)에 대한 해마의 확산 쿠르토시스 메트릭의 변화. 충격에 이어, mTBI 동물의 RK(C)가 현저한 감소하였으나 AK(B) 또는 MK(A)에서는 변화가 없었다. 가짜 동물은 변경 사항을 표시하지 않았다 (*p & 0.0166). 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

도 9: sham(n=10) 및 mTBI 동물에 대한 해마의 백색 물질 관 무결성 메트릭의 변화(n=10). 충격 에 이어, MTBI 동물의 RadEAD (C)에서 현저한 감소와 TORT (D)가 현저한 증가했지만 AWF 또는 AxEAD (A,B)에는 변화가 없었다. 가짜 동물은 변경 사항을 표시하지 않았다 (*p & 0.0125). 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
저자는 공개할 이해상충이 없습니다.
이 절차의 전반적인 목표는 가벼운 외상성 뇌 손상을 가진 쥐에 해마의 양적 미세 구조 정보를 얻는 것입니다. 이것은 파라메트릭 확산지도의 고급 확산 가중 자기 공명 영상 프로토콜 및 관심 영역 기반 분석을 사용하여 수행됩니다.
저자는 연구 재단에 감사드립니다 - 플랑드르 (FWO) 이 작품을 지원하기위한 (부여 번호 : G027815N).
| <강>외상 유도강> | |||
| 0.9% NaCl 생리적 용액 | B Braun | 394496 | |
| 황동 무게 450g | 맞춤형 | 맞춤형 직경 18mm 및 210mm 높이 | |
| 카테터 | Terumo | Versatus-W | 26G |
| ethilon II | Ethicon | EH7824 FS-3 | , 4-0, 3/8, 16mm |
| 크기 | E | 유형 | |
| 플렉시 유리 튜브 | ISPA 플라스틱 | 416564 | M1 PMMA XT GOO 튜브 25x19mm (내부 직경 19mm, 최소 길이 1.50m) |
| 전임상 CT 스캐너 | Molecubes | X-cube | |
| 스틸 헬멧 | 맞춤형 | 제작 직경 10mm 및 3mm 두께 | |
| Vetbond 조직 접착제 | 3M | 1469SB | |
| Vetergesic (buprenorphin) | EcuPhar | VETERG20 | 0.05 mk / kg |
| Xylocaine 2 % 젤 | AstraZeneca | Xylocaine 2 % | 젤 |
| Xylocaine (lidocain 2 %) | Aspen / AstraZeneca | Xylocaine 2 % 젤 | 100 μ l 주입 |
| < 강> 확산 MRI < / 강> | |||
| 전임상 MRI 수집 소프트웨어 | Bruker Biospin MRI GmbH | Z400_PV51_CENTOS55 | ParaVision 5.1 MRI 소프트웨어 |
| 전임상 MRI 스캐너 | Bruker Biospin MRI GmbH | PharmaScan 70/16 | 7T MRI 스캐너 |
| 직교 볼륨 코일 | Bruker Biospin MRI GmbH | RF RES 300 1H 075/040 QSN TR | 모델 번호 : 1P T13161C3 |
| 작은 동물 생리 모니터링 장치 | Rapid Biomedical | EKGHR02-0571-043C01 | 호흡기 모니터링 용 장치 |
| 수성 가열 장치 | Thermo Fisher Scientific | Haake S 5P | 모델 번호 : 1523051 |
| < strong> 마취 < / strong> | |||
| 마취 이동식 장치 | 수의학 기술 | BDO - 메디패스, 이무이덴 | |
| 이소플루란: Isoflo | Zoetis | B506 | |
| 산소 발생기 | 수의학 기술 | 7F-3 | BDO - Medipass, Ijmuiden |
| 확산 이미지 처리 | |||
| Amide | http://amide.sourceforge.net | Version 1.0.5. | Medical Imaging Data Examiner Toolbox (Loening AM, Gambhir SS, " AMIDE: a Free Software Tool for Multimodality Medical Image Analysis", Molecular Imaging, 2(3):131-137, 2003) |
| ExploreDTI | http://www.exploredti.com | Version 4.8.6 | 확산 가중 MR 이미지의 (전)처리 및 분석을 위한 도구 상자(Leemans A, Jeurissen B, Sijbers J, and Jones DK. ExploreDTI: 확산 MR 데이터를 처리, 분석 및 시각화하기 위한 그래픽 도구 상자. In: 17th Annual Meeting of Intl Soc Mag Reson Med, p. 3537, Hawaii, USA, 2009) |
| MRtrix3 | http://www.mrtrix.org | Version 3.0_RC3-86-g4b523b41 Toolbox for (pre-)processing and analysis of diffusion weighted MR images (2009)MRtrix3u/uVersion -86-g4b523b41 | Toolbox for (pre-)processing and analysis of diffusion weighted MR images (확산 가중 MR 이미지의 (전)처리 및 분석을 위한 도구 상자 |