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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
이 프로토콜은 형광 활성화 세포 분류 또는 면역자기 비드 분리를 통해 쥐 복강 내 백색 지방 조직(WAT) 저장소에서 지방 형성 및 섬유 염증성 기질 세포 하위 집단을 분리하는 기술적 접근 방식을 설명합니다.
백색 지방 조직(WAT)의 기질-혈관 분획(SVF)은 매우 이질적이며 성인기에 WAT의 확장 및 리모델링에 기능적으로 기여하는 수많은 세포 유형으로 구성됩니다. 이러한 세포 이질성의 의미를 연구하는 데 있어 엄청난 장벽은 in vitro 및 in vivo 분석을 위해 기능적으로 구별되는 cell subpopulation을 WAT SVF에서 즉시 분리할 수 없다는 것입니다. 단세포 염기서열 분석 기술은 최근 성체 마우스의 복강 내 WAT 저장소에서 기능적으로 뚜렷한 섬유-염증성 및 지방형성 PDGFRβ+ 혈관 주위 세포 하위 집단을 식별했습니다. 섬유-염증성 전구세포('FIP'라고 함)는 전염증성 표현형을 발휘할 수 있는 비지방성 콜라겐 생성 세포입니다. PDGFRβ+ 지방세포 전구세포(APC)는 세포 이식 시 in vitro 및 in vivo 모두에서 지방성이 높습니다. 여기에서는 쥐 복강 내 WAT 저장소에서 이러한 기질 세포 하위 집단을 분리하는 여러 방법을 설명합니다. FIP 및 APC는 FACS(Fluorescence-Activated Cell Sorting) 또는 비오틴화 항체 기반 면역자기 비드 기술을 활용하여 분리할 수 있습니다. 분리된 세포는 분자 및 기능 분석에 사용할 수 있습니다. 기질 세포 하위 집단의 기능적 특성을 개별적으로 연구하면 세포 수준의 생리학적 또는 병리학적 조건에서 지방 조직 리모델링에 대한 현재 지식이 확장될 것입니다.
백색 지방 조직(WAT)은 포유류의 에너지 저장을 위한 주요 위치를 나타냅니다. 이 조직 내에서 지방 세포 또는 "지방 세포"는 트리글리세라이드 형태로 과도한 칼로리를 저장하며, 이는 큰 단안 지질 방울로 포장됩니다. 또한, 지방세포는 에너지 항상성의 다양한 측면을 조절하는 다양한 인자를 분비합니다 1,2,3. 지방세포는 WAT 부피의 대부분을 구성합니다. 그러나 지방세포는 WAT 4,5에서 발견되는 전체 세포의 50% 미만만 차지합니다. WAT의 비지방세포 구획 또는 기질-혈관 분획(SVF)은 매우 이질적이며 혈관 내피 세포, 조직 거주 면역 세포, 섬유아세포 및 지방세포 전구세포(APC) 집단을 포함합니다.
WAT는 에너지 저장에 대한 수요가 증가함에 따라 규모를 확장할 수 있는 놀라운 능력이 탁월합니다. WAT에 지질을 적절하게 저장하면 비지방 조직으로의 유해한 이소성 지질 침착을 방지할 수 있으므로 이러한 조직 가소성을 유지하는 것이 필수적이다6. 개별 WAT 저장소가 과잉 칼로리에 대응하여 이러한 팽창을 겪는 방식은 비만 환경에서 인슐린 감수성을 결정하는 중요한 요인이다7. 대사 증후군이 있는 비만 개체에서 관찰되는 병리학적 WAT 확장은 대사적으로 유리한 피하 지방 조직을 희생하면서 내장 WAT 저장소의 우선적인 확장을 특징으로 합니다. 또한, 비만에서 인슐린 저항성은 WAT의 병리학적 리모델링과 관련이 있습니다. 이것은 기존 지방 세포의 비대 성장(크기 증가), 부적절한 혈관 신생, 만성 대사 염증, 세포 외 기질 구성 요소의 축적(섬유증) 및 조직 저산소증을 특징으로 합니다 8,9. 이러한 비만의 WAT 표현형은 지방이영양증(기능적 WAT의 부재) 상태에서 관찰되는 것과 유사하게 간 지방증 및 인슐린 저항성과 관련이 있습니다. 대조적으로, 건강한 WAT 확장은 대사적으로 건강한 비만 인구에서 관찰되며, 지방세포 증식을 통한 보호적인 피하 WAT의 우선적 확장 및 저장소 확장이 특징이다10. 새로운 지방세포의 모집은 지방세포 전구세포(APC)에서 새로운 지방세포 분화(de novo adipocyte differentiation)에 의해 매개됩니다("지방형성"이라고 함). 지방세포 증식은 WAT 섬유증 및 대사 염증의 정도가 상대적으로 낮은 것과 일치합니다 6,11. WAT 미세환경 내의 다양한 세포 유형은 비만에서 WAT의 건강과 확장성에 직접적인 영향을 미친다12. 따라서 WAT에 존재하는 다양한 세포 유형의 기능을 정의하는 것은 이 분야의 높은 우선 순위로 남아 있습니다.
지난 10년 동안 인간 및 마우스 WAT SVF13에서 네이티브 APC를 정의하고 격리하기 위해 몇 가지 전략이 채택되었습니다. 이러한 전략은 항체 기반 세포 분리 기술을 사용하여 일반적인 중간엽 줄기/전구 세포 마커의 세포 표면 발현을 기반으로 APC를 분리합니다. 이러한 접근법에는 형광 활성화 세포 분류(FACS), 형광단 표지 항체 사용 또는 면역자기 비드 분리(즉, 화학적으로 변형된 항체)가 포함됩니다. APC의 분리를 대상으로 하는 세포 표면 단백질에는 PDGFRα, PDGFRβ, CD34 및 SCA-1이 포함됩니다. 이러한 접근 방식은 APC를 강화하는 데 도움이 되었습니다. 그러나 이러한 마커를 기반으로 분리된 세포 집단은 매우 이질적입니다. 매우 최근의 단일 세포 RNA 염기서열분석(scRNA-seq) 연구는 murine WAT 14,15,16,17의 분리된 기질-혈관 분획(SVF) 내에서 기질 세포의 분자 및 기능적 이질성을 강조했습니다. 자체 scRNA-seq 및 기능 분석을 통해 성체 마우스의 복강 내 WAT의 기질 구획에서 기능적으로 구별되는 면역 조절 및 지방형성 PDGFRβ+ 혈관 주위 세포 하위 집단을 식별하고 특성화했습니다15. 섬유-염증 전구체(Fibro-inflammatory precursors, FIPs)는 PDGFRβ+ 세포의 두드러진 부분집단을 나타내며 LY6C 발현(LY6C+ PDGFRβ+ 세포)을 기반으로 분리할 수 있습니다15. FIP는 지방형성 능력이 부족하고, 다양한 자극에 대해 강력한 전염증 반응을 일으키며, 콜라겐을 생성하고, 항지방형성 인자를 분비한다15. 이러한 세포의 전염증성 및 섬유화 활성은 생쥐의 비만과 관련하여 증가하며, 이는 이러한 세포가 WAT 리모델링의 조절자로 연루됩니다. LY6C- CD9- PDGFRβ+ 부분집단은 지방세포 전구세포(APC)를 나타냅니다. 이러한 APC는 Pparg 및 기타 지방유발 유전자의 발현이 풍부하며, in vitro 및 in vivo15에서 성숙한 지방세포로 쉽게 분화할 수 있다. 여기에서는 FACS를 사용하여 성체 마우스의 복강 내 WAT 저장소에서 이러한 별개의 세포 집단을 분리하고 비오틴화 항체를 사용한 면역자성 비드 분리를 위한 자세한 프로토콜을 제공합니다. 이 프로토콜은 성체 남성 및 여성 마우스의 여러 복강 내 WAT 저장소에서 기능적으로 구별되는 지방 전구 세포 하위 집단을 분리하는 데 사용할 수 있습니다15. 이러한 기능적으로 구별되는 세포 집단을 고립된 상태에서 연구하는 것은 건강과 질병에서 지방 형성 및 복강 내 지방 조직 리모델링을 조절하는 분자 메커니즘에 대한 현재의 이해에 크게 기여할 수 있습니다.
아래 프로토콜은 쥐 부고환 WAT에서 지방 전구 세포의 분리에 대해 자세히 설명합니다. 그러나, 동일한 절차를 사용하여 수컷 및 암컷 마우스 모두의 장간막 및 후복막 WAT 저장소로부터 해당 세포를 분리할 수 있다15. 마우스에서 이러한 저장소를 식별하고 격리하는 방법에 대한 자세한 프로토콜은 Bagchi et al.18에서 찾을 수 있습니다. 이 프로토콜은 생후 6-8주 된 마우스의 사용에 최적화되었습니다. APC의 빈도 및 분화 능력은 노화와 관련하여 감소할 수 있습니다.
모든 동물 프로토콜 및 절차는 텍사스 대학교 사우스웨스턴 메디컬 센터 기관 동물 사용 및 관리 위원회(University of Texas Southwestern Medical Center Institutional Animal Use and Care Committee)의 승인을 받았습니다.
1. 생식선 백색 지방 조직에서 기질 혈관 분획 (SVF)의 분리
2. FACS를 사용한 APC 및 FIP 격리
3. adipogenic 및 non-adipogenic fractions의 면역자기 분리
4. 유세포 분석을 통한 지방형성 및 비지방성 분획의 순도 평가
5. FIP 및 APC의 순도를 평가하기 위해 정량적 PCR을 사용한 유전자 발현 분석
6. 세포 배양 및 분화
이 프로토콜은 성체 마우스의 복강 내 WAT 저장소에서 뚜렷한 기질 세포 집단을 분리할 수 있는 두 가지 전략을 설명합니다. APC 및 FIP는 FACS(그림 1) 또는 비오틴화 항체를 사용한 면역자성 비드 분리(그림 2)로 분리할 수 있습니다. 두 접근법 모두 상업적으로 이용 가능한 시약과 항체를 사용합니다. 면역자성 비드 분리는 gWAT SVF에서 지방형성 세포와 비지방성 세포를 분리합니다. 유세포 분석 결과 지방 분획 내 세포의 75%가 LY6C-CD9-APC를 나타내는 것으로 나타났습니다. >지방생성되지 않은 분획의 75%는 FIP(LY6C+ 세포)를 나타냈습니다.

그림 1: FACS에 의한 생식선 WAT에서 PDGFR β + 기질 세포 부분집단의 분리. (A) 절차의 개략도: 기질 혈관 분획(비지방세포 세포)은 효소 조직 분해 및 원심분리에 의해 성숙한 지방세포에서 분리되었습니다. 그런 다음 형광 활성화 세포 분류(FACS)를 사용하여 내피(CD31+) 및 조혈(CD45+) 계통 세포를 제거하고 LY6C+ PDGFRβ+ 세포(FIP) 및 LY6C-CD9-PDGFRβ+ 세포(APC)를 분리했습니다. (B) 대표적인 FACS 수집 게이트. 패널 A는 허가를 받아 ref.11에서 복제되었습니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 2: 면역자성 비드 분리에 의한 지방형성 및 비지방성 기질 세포의 분리. (A) 절차의 개략도: 1단계: CD31+ 및 CD45+ 셀이 자석에 결합합니다. 이것은 내피 세포와 조혈 계통 세포를 모두 제거합니다. CD31- 및 CD45- 세포를 함유하는 용출액을 채취한 후 각각 LY6C 및 CD9를 인식하는 항체로 배양하였다. 2단계: 자석에 결합하는 CD9+ 및 LY6C+ 세포. 단계 3: CD9- 및 LY6C- 세포를 포함하는 상층액(결합되지 않은 분획)을 지방 분획(APC)을 나타내므로 수집했습니다. 나노구에 결합된 비지방성 CD9+ 및 LY6C+ 세포는 FIP를 포함하는 비-APC 분획으로 용출되었습니다. (B) 지방형성 및 비지방형성 분획 내에서 APC(LY6C-CD9-) 및 FIP(LY6C+)의 빈도를 각각 평가하기 위한 유세포 분석 분석. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
광학 현미경 및 유전자 발현 분석은 FAC에 의해 또는 6-8주령 마우스의 gWAT에서 자성 비드 분리를 통해 분리한 APC가 Gonadal APC 배양 배지에서 세포의 초기 도금 후 7-10일 이내에 높은 수준으로 지질 함유 지방세포로 분화되었음을 보여줍니다(그림 3). 대조적으로, 비지방형성 전구체(예: 섬유-염증성 전구체 또는 FIP)는 섬유아세포와 유사하게 유지되었으며 동일한 배양 배지(Gonadal APC 배양 배지)에서 유지될 때 지방세포가되지 않았습니다(그림 3). non-APCs 배양에서 약간의 지질 축적을 보인 세포는 거의 없다는 점에 유의해야 합니다(그림 3D). 이는 세포 분리 중 APC 오염으로 인해 발생할 수 있습니다. 추가 세척은 이 분획의 순도를 향상시킬 수 있습니다.

그림 3: 성체 마우스의 gWAT에서 분리한 PDGFR β + 기질 세포 집단의 시험관 내 분화. (서기-인도) 6-8주 된 마우스 gWAT SVF에서 면역자기 비드 분리(A-B) 또는 FACS(C-D)로 분리한 분화된 기질 세포 하위 집단의 대표적인 명시야 이미지. 이미지는 Gonadal APC 배양 배지에서 세포를 도운장한 후 7일 후에 촬영되었습니다. 도금 후 7-10일 이내에 APC는 자발적인 지방 세포 분화를 겪습니다. 배율 10X. 스케일 = 250 μM. (E-F) A-D에 표시된 분화된 배양에서 지방 세포 선택 유전자의 mRNA 수준. 막대 그래프는 평균 + SEM을 나타냅니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
| FIP (영어) | 농축 유전자(vs. APC) | 포워드 프라이머 5'-3' | 리버스 프라이머 5'-3' |
| 라이6c1 | ACTGTGCCTGCAACCTTGTCT | GGCCACAAGAATGAGCAC | |
| CD9 (CD9) | GCGGGAAACACTCAAAGCCAT | AAAGCTGTTTCTTGGGGCAGG | |
| 11월 | GTTCCAAGAGCTGT그가앗그 | CTCTTGTTCACAAGGCCGAAC (영어) | |
| 에프hd1 | GGCCGCTCTAAGGTCTTCAAT | GTCAATAAAGCCGTCCCTTCC | |
| STMN4 | ACCTGAACTGGTGCGTCATCT | CTTGGAGGGAGG캇따악 | |
| 닥트2 | AGCCCCCT아아아가아악 | GGTCCTTGGCCACAGT카타 | |
| IL33 | 아ttccccggcaaagttcag | 아카그가gtct캣그카그타가 | |
| CCL2 (씨씨2) | CCACAACCACCTCAAGCACTTC | AAGGCATCACAGTCCGAGTCAC | |
| Tgfb2 | GGTGTTGTTCCACAGGGGTTA | CGGTCCTTCAGATCCTCCTTT | |
| 에프엔1 | GAGAGCACACCCGTTTTCATC (영문) | GGGTCCACATGATGGTGACTT | |
| DPP4 | TGGTGGATGCTGGTGTGTGTGT | 아아그그그cctctcttctctcttcct | |
| 티1 | TCTTTTTTCCCTTGCCCCTCTG | AGGTTGCAAGACTCTCGCTGT | |
| APC (APC) | Enriched Genes (vs. FIPs) | 포워드 프라이머 5'-3' | 리버스 프라이머 5'-3' |
| 아그트 | GTTCTGGGCAAAACTCAGTGC | GAGGCTCTGCTGCTCATCATT | |
| CXCL14 | TGGACGGGTCCAAGTGTGT아 | TCCTCGCAGTGTGGGTACTTT | |
| 엠디2 | ATCTGGGAGCTGATGAAGGA | AGTGGGT아카그카아아트그 | |
| PDE11a | CGAGCTTGT카가아가아가가 | TTCAGCCACCTGTCTGGAGAT | |
| LRN1 | CAACATGGGGAGCTGGTTTC 님 | GCACACTACGGAAAGCCAAAC | |
| 프파르그 | GCATGGTGCCTTCGCTGA | TGGCATCTGTGT카아캇그 | |
| 팹프4 | ACTGGGCGT가찡가랴 | 아카그크트그카카캣크gt | |
| 엘플 | CATCGAGAGAGGATCCGAGTGAA | TGCTGAGTCCTTTCCCTTCTG | |
| cd36 | 갸그트그크가아아gtg | GAGAATGCCTCCAAACACAGC |
표 1: FIP 및 APC의 분리를 검증하는 데 사용되는 qPCR 프라이머 염기서열
T.A.P.는 Novo Nordisk A/S의 직원이자 주주입니다.
이 프로토콜은 형광 활성화 세포 분류 또는 면역자기 비드 분리를 통해 쥐 복강 내 백색 지방 조직(WAT) 저장소에서 지방 형성 및 섬유 염증성 기질 세포 하위 집단을 분리하는 기술적 접근 방식을 설명합니다.
저자들은 탁월한 기술적 도움을 준 Lisa Hansen과 Kirsten Vestergaard, 그리고 원고를 비판적으로 읽어준 P. Scherer, N. Joffin, C. Crewe에게 감사를 표한다. 저자들은 여기에 설명된 프로토콜 개발에 탁월한 지침과 도움을 준 UTSW 유세포분석 코어에 감사를 표합니다. R.K.G.는 NIH NIDDK R01 DK104789, NIDDK RC2 DK118620 및 NIDDK R01 DK119163에 의해 지원됩니다. JP는 Innovation Fund Denmark의 박사 전 상을 후원합니다.
| Mechanical Tissue Preparation 및 SVF Isolation | |||
| 40 및 100 µ m 세포 스트레이너 | Fisher Scientific | 352340/352360 | |
| 1X 인산염 완충 식염수(PBS) | Fisher Scientific | 21040CV | |
| 5ml 폴리프로필렌 튜브 | Fisher Scientific | 352053 | |
| Digestion Buffer(10mL용) | |||
| 10 ml HBSS | Sigma | H8264 | |
| 10 mg 콜라겐 분해 효소 D (1 mg/ml 최종 참조) | 로슈 | 11088882001 | |
| 0.15g BSA (1.5 % 최종 cc) | Fisher Scientific | BP1605-100 | |
| <강력한>APC와 비APC의 면역자기 분리 | |||
| 5X MojoSort Buffer (MS buffer) | BioLegend | 480017 | |
| 5 ml MojoSort Magnet (MS magnet) | BioLegend | 480019 | |
| 100 µ L MojoSort 스트렙타비딘 나노비즈 | BioLegend | 480015 | |
| 순도 검사 및 FACS | |||
| 10X 적혈구 용해 버퍼 | eBioscience | 00-4300-54 | |
| Fc block (Mouse CD16/CD32) | eBioscience | 553141 | |
| 항체 | |||
| 비오틴 CD45 | BioLegend | 103103 | 농도: ≤ 0.25 & 마이크로; g 당 10 ^ 6 세포 종 : 마우스 < / > 클론 : 30-F11 |
| 비오틴 CD31 | BioLegend | 102503 | 농도 : ≤ 0.25 &마이크로; g 10 ^ 6 세포 당 종 : 마우스 < / > 클론 : MEC13.3 |
| 비오틴 CD9 | BioLegend | 124803 | 농도 : ≤ 0.25 µ g 10 ^ 6 세포 당 종 : 마우스 < / > 클론 : MZ3 |
| 비오틴 LY6C | BioLegend | 128003 농도 : ≤ 0.25 µ g per 10^6 cells 종(種): Mouse 클론: HK1.4 | |
| CD31-PerCP/Cy5.5 | BioLegend | 102419 | 농도: 희석 1:400 종(種): Mouse 클론: 390 |
| CD45-PerCP/Cy5.5 | BioLegend | 103131 | 농도: 희석 1:400 종(種): Mouse 클론: 30-F11 |
| CD140b PDGFRβ-PE | BioLegend | 136006 | 농도 : 희석 1 : 50 종 : mouse 클론 : APB5 |
| LY6C-APC | BioLegend | 128016 | 농도 : 희석 1 : 400 종 : Mouse 클론 : HK1.4 |
| CD9-FITC | BioLegend | 124808 | 농도 : 희석 1 : 400 종 : Mouse 클론 : MZ3 |
| Cell Culture and 분화 | |||
| Gonadal APC 배양 배지(500mL용) | |||
| 288 mL DMEM with 1 g/L glucose | Corning | 10-014-CV | |
| 192 mL MCDB201 | Sigma | M6770 | |
| 10 mL 소 태아 혈청(FBS)** lot#14E024 | Sigma | 12303C | |
| 5 mL 100% ITS 프리믹스 | BD Bioscience | 354352 | |
| 5 mL 10 mM L-아스코르브산-2-2인산염 | 시그마 | A8960-5G | |
| 50 &마이크로; L 100 g/ml FGF 기본적인 | R& D 시스템 | 3139-FB-025/CF | |
| 5 mL 펜/스트렙 | 코닝 | 30-001-CI | |
| 500 &마이크로; L Gentamycin | Gibco | 15750-060 | |
| **참고: 1차 APC의 지방 생성 용량은 상업용 FBS의 로트마다 다를 수 있습니다. FBS의 여러 로트/소스를 테스트해야 합니다. |