B형 간염 바이러스(HBV)유래 펩타이드 매트릭스에 기초하여, HBV 특이적 CD4 T 세포 반응은 HBV 특이적 CD4 T 세포 에피토프의 식별과 병행하여 평가될 수 있었다.
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방법 논문
B형 간염 바이러스(HBV)유래 펩타이드 매트릭스에 기초하여, HBV 특이적 CD4 T 세포 반응은 HBV 특이적 CD4 T 세포 에피토프의 식별과 병행하여 평가될 수 있었다.
CD4 T 세포는 만성 B형 간염의 병인에 있는 중요한 역할을 합니다. 다목적 세포 집단으로서, CD4 T 세포는 분비한 사이토카인에 기초한 뚜렷한 기능성 하위 집합으로 분류되었습니다: 예를 들어, CD4 T 도우미 1 세포를 위한 IFN-γ, CD4 T 도우미 2 세포에 대한 IL-4 및 IL-13, CD4 T 여포 도우미 세포를 위한 IL-21 및 CD4 T 헬퍼 셀용 IL-17. HBV 유래 펩티드 자극 후 사이토카인 분비를 기반으로 한 B형 간염 바이러스(HBV)-특이적 CD4 T 세포의 분석은 HBV 특이적 CD4 T 세포 반응의 크기뿐만 아니라 HBV 특이적 CD4 T 세포의 기능적 서브세트에 대한 정보를 제공할 수 있었다. 전사학 및 메타볼로믹스 분석과 같은 새로운 접근법은 HBV 특이적 CD4 T 세포에 대한 보다 상세한 기능 정보를 제공할 수 있습니다. 이러한 접근법은 일반적으로 펩타이드-주요 조직적합성 복합-II 멀티머를 기반으로 실행 가능한 HBV 특이적 CD4 T 세포의 격리가 필요하며, 현재 HBV 특이적 CD4 T 세포 에피토프에 대한 정보는 제한적이다. HBV 유래 펩타이드 매트릭스를 기반으로, HBV 특이적 CD4 T 세포 반응을 평가하고 만성 HBV 감염 환자로부터 말초 혈액 단핵세포 샘플을 사용하여 HBV 특이적 CD4 T 세포 에피토프를 동시에 식별하는 방법이 개발되었다.
현재 항원 특이적 T 세포를 분석하는 3가지 주요 접근법이 있다. 첫 번째 접근법은 T 세포 수용체와 펩타이드 (epitope)사이의 상호 작용에 기초한다. 항원 특이적 T 세포는 펩티드-주요 조직적합성 복합체(MHC) 다중머로 직접 염색될 수 있다. 이 방법의 장점은 다운스트림 전사학/메타볼로믹스 분석에 적합한 실행 가능한 항원 특이적 T 세포를 얻을 수 있다는 것입니다. 이 방법의 한계는 특정 항원에 대한 전체 T 세포 반응에 대한 정보를 제공할 수 없다는 것입니다, 특정 항원에 대한 확인된 에피토프의 수가 현재 제한되어 있는 동안 검증된 에피토프 펩티드가 필요하기 때문이다. B형 간염 바이러스(HBV)-특이적 CD8 T 세포 에피토프에 비해, HBV 특이적 CD4 T 세포 에피토프가1,2로확인되어현재 HBV 특이CD4 T 세포의 분석에 덜 적용할 수 있게 되었다.
두 번째 접근법은 항원 펩타이드 자극3후 일련의 활성화 유도 마커의 업레조절에 기초한다. 일반적으로 사용되는 마커는 CD69, CD25, OX40, CD40L, PD-L1, 4-1BB4를포함한다. 이 방법은 현재 예방접종대상자5,6,인간 면역결핍 바이러스 감염 환자7,중증 급성호흡기증후군 코로나바이러스 2감염환자8,9에서항원 특이적 T세포 반응을 분석하는 데 사용되어 왔다. 펩타이드-MHC 멀티머 기반 분석과 는 달리, 이 방법은 검증된 전형체에 의해 제한되지 않으며 다운스트림 분석을 위한 실행 가능한 세포를 얻을 수 있었다. 이 방법의 한계는 항원 특이적 T 세포의 사이토카인 프로파일에 대한 정보를 제공할 수 없다는 것이다. 또한, 일부 활성화된 항원 특이적 세포에 의한 이러한 활성화 유도 마커의 발현은 분석에서 배경 신호에 기여할 수 있으며, 이는 특히 표적 항원 특이적 T 세포가 드물 때 문제가 될 수 있다. 현재, HBV 특이CD4 T 셀4에대한 이 방법의 제한된 적용이 있다. 이 방법이 HBV 특이적 CD4 T 세포를 신뢰할 수 있는 방식으로 분석하기 위해 활용할 수 있는지 여부는 추가 조사가 필요합니다.
세 번째 접근법은 항원 펩타이드 자극 후 사이토카인 분비를 기반으로 한다. 활성화 유도 마커 기반 분석과 마찬가지로 이 방법은 검증된 전형에 의해 제한되지 않습니다. 이 방법은 항원 특이적 T 세포의 사이토카인 프로파일을 직접 밝힐 수 있었다. 이 방법의 감도는 항원 특이적 T 세포의 사이토카인 분비에 의존하기 때문에 활성화 유도 마커 기반 방법보다 낮으며 테스트된 사이토카인의 수는 일반적으로 제한적이다. 현재, 이 방법은 HBV 특이적 T 세포의 분석에 널리 사용된다. HBV 특이적 T 세포를 분비하는 사이토카인은 직접 전 생체 펩타이드자극(10,11)에의해 거의 검출될 수 없기 때문에, HBV 특이적 T 세포의 사이토카인 프로파일은 보통 10일 후에 시험관내 펩타이드 자극 팽창팽창,13,14,15,16을분석한다. 매트릭스 형태로 펩티드 풀의 배열은 항원 특이적에피토프(17,18)의식별을 용이하게 하기 위해 활용되고 있다. 펩타이드 매트릭스와 사이토카인 분비 분석의 조합으로 HBV 특이적 CD4 T 세포 반응을 평가하고 HBV 특이적 CD4 T 세포 에피토프를 동시에 식별하는 방법이개발되었다 16. 이 프로토콜에서는 이 메서드의 세부 정보가 설명되어 있습니다. HBV 코어 항원은 이 프로토콜에서 데모의 예로 선택된다.
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연구에 포함된 각 환자로부터 서면 통보 된 동의를 얻었다. 연구 프로토콜은 사우스 웨스트 병원의 의료 윤리위원회의 사전 승인에 반영된 1975 년 헬싱키 선언의 윤리 지침을 준수합니다.
1. HBV 유래 펩타이드 매트릭스의 설계
2. 말초 혈액 단핵 세포의 분리 (PBMC)
3. HBV 펩타이드 매트릭스를 사용하여 PBMC의 생체 외 확장
4. 세포 내 흐름 세포측정에 의한 HBV 특이적 CD4 T 세포 반응 분석

5. HBV 특정 HLA-DR 제한 CD4 T 세포 에피토프의 식별
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CD4 T 세포를 분비하는 사이토카인의 빈도는 단일 생산자와 이중 생산자 모두의 합으로 계산됩니다. 도 1에서입증된 바와 같이, TNF-α 분비 CD4 T 세포의 주파수와 배경 제어(DMSO)에서 CD4 T 세포를 분비하는 IFN-γ 의 주파수는 각각 0.154% 및 0.013%이다. TNF-α 분비 CD4 T 세포의 주파수와 펩타이드 풀 코어11에 특정 된 IFN-γ 분비 CD4 T 세포의 주파수는 각각 0.206 및 0.017, 그래서 TNF-α 분비 CD4 T 셀 응답 및 IFN γ 분비 CD4 T 셀 응답이 펩 티 드 풀에 대 한 부정적인 것으로 간주 됩니다. TNF-α 분비 CD4 T 세포의 주파수와 펩타이드 풀 코어09에 특정 된 IFN-γ 분비 CD4 T 세포의 주파수는 각각 2.715 % 및 0.973 %이므로 TNF-α 분비 CD4 T 셀 응답 및 IFN-γ 비밀 CD4 T 셀 응답이 펩 타이드 풀에 대한 긍정적 인 것으로 간주됩니다.
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이 프로토콜에서 가장 중요한 단계는 다음과 같이 나열됩니다: 1) PBMC 확장을 시작할 가능성이 높은 충분한 PBMC; 2) PBMC 확장에 적합한 환경; 및 3) 에피토프 식별 전에 PBMC 배양에서 잔류 펩티드 풀을 완전히 제거합니다.
이 프로토콜의 모든 분석은 CD4 T 셀의 강력한 증식에 따라 달라집니다. 일반적으로 10일 확장 후 PBMC 수는 초기 수의 2~3배입니다. 세포 수와 PBMC의 생존 가능성은 PBMC 확장의 2가지 주요 요소입니다. 목적은 에피토프 식별없이 HBV 특정 CD4 T 세포를 분석하는 경우, 혈액 샘플의 양이 제한되는 경우에 특히 초기 PBMC 수를 줄이는 것이 합리적이다. 우리의 경험에 따르면, PBMC의 시작 수는 1.5×105 셀 / 웰 미만인 경우 성공적인 PBMC 확장을 거의 얻을 수 없습니다. 확장에 신선한 PBMC를 사용할 때 셀 생존도 문제가 되지 않습니다. 확장에 극저온 보존 된 PBMC를 사용하는 동안, P...
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이 작품은 중국 국립 자연과학 재단(81930061), 충칭자연과학재단(cstc2019jcyj-bshX0039, cstc2019jcyj-zdxxX0004), 중국키에 의해 지원되었습니다.
전염병 전문 프로젝트 (2018ZXX10723203).
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| 이름 | 회사 | 카탈로그 번호 | 댓글 |
|---|---|---|---|
| 알부민 소 V (BSA) | Beyotime | ST023 | |
| APC 활용 항 인간 TNF -&알파; | eBioscience | 17-7349-82 | Keep protected from light |
| Benzonase Nuclease | Sigma-Aldrich | E1014 | Limit cell clumping |
| B lymphoblastoid cell lines (BLCLs) | FRED HUTCHINSON CANCER RESEARCH CENTER | HLA-DRB1*0803 homozygote | |
| B lymphoblastoid cell lines (BLCLs) | FRED HUTCHINSON CANCER RESEARCH CENTER | HLA-DRB1*1202 homozygote | |
| 세포 배양 플라스크 (T75) | Corning | 430641 | |
| 세포 배양 플레이트 (96-well, 평평한 바닥) | Corning | 3599 | 평평한 바닥 |
| 세포 배양 플레이트 (96-well, 둥근 바닥) | Corning | 3799 | 둥근 바닥 |
| 세포 여과기 | Corning | CLS431751 | Pore size 70 &뮤; m, 흰색, 멸균 |
| 원심분리기 튜브(15 mL) | KIRGEN | KG2611 | 멸균 |
| 원심분리기 튜브(50 mL) | Corning | 430829 | 멸균 |
| 원심분리기, 냉장 | Eppendorf | 5804R | |
| 원심분리기, 냉장 | Thermo | ST16R | |
| 원심분리기, 냉장 | Thermo | Legend Micro 21R | |
| Cytofix/Cytoperm Kit (Transcription Factor Buffer Set) | BD Biosciences | 562574 | Prepare solution before use |
| Dimethyl Sulfoxide (DMSO) | Sigma-Aldrich | D2650 | Keep at room temperature to prevent crystallization |
| Dulbecco' s 인산염 완충 식염수 | NaCl(8000mg), KCl(200mg), KH2PO4(200mg) 및 Na2HPO4.7H2O(2160 mg)를 포함하는 ddH2O(1000ml)를 준비합니다. PH를 7.4로 조정합니다. 오토클레이브를 통해 살균합니다. | ||
| Ficoll-Paque 프리미엄 | GE 헬스케어 | 17-5442-03 | |
| 필터 팁 (0.5-10) | Kirgen | KG5131 | 멸균 |
| 필터 팁 (100-1000) | Kirgen | KG5333 | 멸균 |
| 필터 팁 (1-200) | Kirgen | KG5233 | 멸균 |
| FITC-conjugated Anti-human CD4 | BioLegend | 300506 | 빛 |
| 정착성 생존도 염료 eFluor780 | eBioscience | 65-0865-14 | 빛으로부터 보호 유지 |
| GolgiStop 단백질 수송 억제제(모넨신 포함) | BD Biosciences | 554724 | 단백질 수송 억제제 |
| 혈구계 | 브랜드 | 718620 | |
| HBV 코어 항원 유래 펩타이드 | 중국펩타이드 | ||
| HEPES | Gibco | 15630080 | 100 ml |
| 인간 혈청 AB | Gemini Bio-Products | 100-51 | 100 ml |
| Ionomycin | Sigma-Aldrich | I0634 | |
| KCl | Sangon Biotech | A100395-0500 | |
| KH2PO4 | Sangon Biotech | A100781-0500 | |
| LSRFortessa 유세포 분석기 | BD | ||
| L-글루타민 | Gibco | 25030081 | 100ml |
| 마이크로 원심분리기 튜브(1.5mL) | Corning | MCT-150-C | 전 고압멸 |
| Microplate Shaker | Scientific Industries | MicroPlate Genie | |
| Mitomycin C | Roche | 10107409001 | |
| Na2HPO4.7H2O | Sangon Biotech | A100348-0500 | |
| NaCl | Sangon Biotech | A100241-0500 | |
| PCR 튜브 (0.2 mL) | Kirgen | KG2331 | |
| PE/Cy7-conjugated Anti-human CD8 | BioLegend | 300914 | 로부터 보호해 주세요 |
| ; | eBioscience | 12-7319-42 | 빛으로부터 보호 유지 |
| 페니실린 스트렙토마이신 | Gibco | 15140122 | 100ml |
| PerCP-Cy5.5-conjugated Anti-human CD3 | eBioscience | 45-0037-42 | 빛으로부터 보호 유지 |
| Phorbol 12-myristate 13-acetate (PMA) | Sigma-Aldrich | P1585 | |
| 재조합 인간 IL-2 | PeproTech | 200-02 | |
| 재조합 인간 IL-7 | PeproTech | 200-07 | |
| RPMI 매체 1640 | Gibco | C11875500BT | 500 ml |
| 피루브산 나트륨, 100mM | Gibco | 15360070 | |
| Trypan 블루 스테인(0.4%) | Gibco | 15250-061 | |
| Ultra-LEAF Purified Anti-human HLA-DR | BioLegend | 307648 | |
| Wizard Genomic DNA 정화 키트 | Promega | A1125 |
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