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Research Article
Mohammad Ali Mohammadi1, Ali Afgar2, Ashkan Faridi3, Seyed Mohammad Mousavi2, Ali Derakhshani2, Mehdi Borhani4, Majid Fasihi Harandi2
1Student Research Committee, School of Medicine,Kerman University of Medical Sciences, 2Research Center for Hydatid Disease in Iran,Kerman University of Medical Sciences, 3Department of Parasitology and Mycology, Faculty of Medicine,Kurdistan University of Medical Sciences, 4State Key Laboratory for Zoonotic Diseases, Key Laboratory of Zoonosis Research, Ministry of Education, Institute of Zoonosis, College of Veterinary Medicine,Jilin University
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
우리는 세 번째 세대 렌티 바이러스 벡터를 사용하여 Echinococcus granulosus 의 다른 발달 단계에서 신속한 일시적인 형질 도입 기술을 설명합니다.
낭포성 echinococcosis 또는 hydatid 질병은 송곳니의 장에 숨어있는 작은 촌충 인 Echinococcus granulosus 에 의해 야기 된 가장 중요한 동물 유행성 기생충 질병 중 하나입니다. 병인과 질병 조절 및 예방의 메커니즘을 이해하기 위해 유전자 연구를 적용해야 할 긴급한 필요성이 있다. 그러나 효과적인 유전자 평가 시스템의 부족은 Echinococcus 종을 포함한 cestode 기생충의 기능적 유전학에 대한 직접적인 해석을 방해합니다. 본 연구는 E. granulosus의 metacestode 및 strobilated 형태에서 렌티바이러스 유전자 일시적 형질도입의 가능성을 입증한다. 프로토스콜렉세스(PSCs)를 수성체 낭종으로부터 분리하고 특정 이족 배양 배지로 옮겨 스트로빌화된 웜으로 발전시켰다. 웜을 형질도입 과정 대조군으로서 HEK293T 세포와 함께 수확된 3세대 렌티바이러스로 형질감염시켰다. 24 h 및 48 h에 걸쳐 스트로빌화 된 웜에서 뚜렷한 형광이 검출되었으며, 이는 E. granulosus에서 일시적인 렌티 바이러스 형질도입을 나타냅니다. 이 연구는 촌충에서 렌티 바이러스 기반 일시적인 형질도입에 대한 첫 번째 시도를 제시하고 편평충 생물학에 대한 실험 연구에서 잠재적 인 영향을 미치는 유망한 결과를 보여줍니다.
낭포성 echinococcosis (CE)는 Taeniidae 1,2 가족 내의 작은 촌충 인 Echinococcus granulosus에 의해 유발되는 가장 중요한 기생충 질병 중 하나입니다. E. granulosus에 대한 면역 진단 및 백신 개발에 대한 광범위한 연구가 수행되었습니다. 그러나 기생충 생물학의 분자 기초에 대한 부적절한 지식은 하이다티드 질병 3,4,5,6의 진단, 관리 및 예방에 큰 한계를 제기합니다.
최근 몇 년 동안, 게놈 시퀀싱 및 전사 방법의 개발로 인해, 여러 연구 그룹 7,8,9에 의해 편평충에 대한 광범위한 분자 연구가 수행되었습니다. 그러나 기생충의 세계에서, 기생 편평충의 유전자 전달 기술의 발전은 일부 원생동물10,11,12를 위해 개발 된 재현성이 높은 일시적인 형질도입 방법과 비교하여 여전히 제한적입니다.
바이러스 전달 시스템의 사용은 지난 20 년 동안 전이유전자 전달 및 유전자 / 단백질 조사를위한 필수 도구로 부상했습니다13. 렌티바이러스는 분열 세포와 비분열 세포를 모두 감염시켜 유사분열 후 세포 14,15,16을 감염시킬 수 있다. 최근의 증거는 포유동물 세포에서 렌티바이러스 기반 형질도입 시스템을 사용하는 것이 이전의 녹인/녹다운 기술의 한계 대부분을 극복할 수 있는 잠재력을 제공한다는 것을 나타낸다. GFP 발현과 같은 적절한 분자 마커를 갖는 발현 렌티바이러스 벡터의 설계 및 구축은 앞서16에서 설명되었다. 따라서, 우리는 E. granulosus의 protoscoleces 및 strobilated worms에서 GFP 리포터 유전자의 렌티바이러스 일시적 형질도입을 평가한다.
이 연구는 국립 의학 연구 개발 연구소 및 연구 윤리 검토위원회, No. 958680의 승인을 받았다. 렌티바이러스는 BSL-2 유기체로 분류되고; 따라서, 이 프로토콜의 모든 실험실 배양 절차는 멸균 실험실 관행을 사용하여 수행되었고, NIH 가이드라인에 따라 층류 후드 하에서 수행되었다. 도 1은 상이한 E. 과립 단계에 대한 연구 프로토콜의 개략적인 프리젠테이션을 도시한다.
1. 수국 낭종 수집
2. 성인 벌레를 얻기 위해 E. granulosus의 PSCs의 Biphasic 재배
참고: 분리된 PSC는 층류 캐비닛 클래스 II 하에서 멸균 조건에서 배양되어야 합니다. 다음 단계19로 진행하기 전에 이phasic 배양 배지의 고체 및 액체 상을 별도로 준비한다.
3. E. granulosus의 PSCs의 단식 재배
4. 바이러스 생산 및 준비를위한 세포 배양
참고: 인간 배아 신장 293T (HEK293T) 세포는 Kerman University of Medical Sciences의 병리학 및 줄기 세포 연구 센터로부터 벡터 생산을 위해 수득되었다.
5. 3세대 렌티바이러스 벡터를 이용한 바이러스의 제조 및 제조
참고: 렌티바이러스 벡터 pCDH513b(전사 벡터) 및 PLPII, PLPI 및 PMD2G(헬퍼 벡터)를 사용하여 GFP 리포터 유전자를 발현하였다. 재료 표 및 보충 그림 S1을 참조하십시오.
6. 바이러스와 함께 E. granulosus 의 다른 단계의 일시적인 형질도입
여기에서, 우리는 세 번째 세대 렌티바이러스 벡터를 사용하여 E. granulosus에서 신속하고 효율적인 일시적 형질도입 기술을 기술한다. PSCs를 이phasic 배지에서 배양하여 앞서 기술한 바와 같이 스트로빌화된 웜을 수득하였다(25,26). Protoscolece는 시험관 내에서 6 주 후에 스트로빌 화 된 웜으로 발전합니다. E. granulosus의 상이한 단계는 질내 PSC (도 2A), 질내 PSC (도 2B), 및 첫 번째 및 세 번째 proglottid 형성 (도 2C-E)을 갖는 스트로빌화된 웜을 포함하는 이phasic 배양 배지에서 관찰되었다. 프로토콜렉세스 및 단식 및 이phasic 배양물로부터 수득된 스트로빌화된 웜을 각각 GFP 발현 렌티바이러스로 형질감염시켰다(도 3). 자기 형광 효과를 피하기 위해, 현미경 관찰은 샘플의 세 그룹 모두에서 배경 형광과 비교되었고, 이 배경 수준 이상의 모든 샘플은 형질감염된 것으로 간주되었다.
우리는 현장 조명을 조정하고 셔터를 낮추어 각 처리에 대한 제어 샘플에서 가능한 자기 형광 방출을 방지했습니다. 이어서, 렌티바이러스 벡터-처리된 샘플을 검사하였고, 여기서 검정장에 대한 녹색 발광은 효과적인 일시적 형질도입으로 간주되었다. HEK293T 세포-일시적 형질도입 과정 대조군-발현된 GFP를 명확하게 발현시킨다 (도 3D). 성인 웜은 tegumental 층에서 GFP를 가장 뚜렷하게 표현했습니다 (그림 3F); 그러나, PSCs는 48 h 후에 GFP 발현의 다소 더 낮은 수준을 입증하였다. PSC 주변의 일부 낭종 유체 잔류 물 및 / 또는 발아층 파편은 형질 감염된 샘플의 배경에서 약간의 형광을 일으켰습니다. HEK293T 세포 및 스트로빌화된 웜에서의 형광의 강도는 24 h 및 48 h 후에 증가하였다 (PSCs에서 경미한 변화가 관찰되었다).

그림 1: 연구 프로토콜의 개략적인 프레젠테이션. 약어: PSC = protoscoleces. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 2 : 이phasic 배양 배지에서 Echinococcus granulosus의 다른 단계. (A) 질내 PSC, (B) 질내 PSC, (C, D) 스트로빌 화 과정에서 웜, (E) 세 번째 프로글로티드 형성을 가진 스트로빌 화 웜, (F) 배양 배지에서 스트로빌레이션의 다른 단계의 웜. 배율 막대 = 200μm. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

도 3: 광과 형광 현미경에서 Echinococcus granulosus 및 대조군 세포주의 상이한 단계의 일시적인 형질도입 . (A,D) 형질도입 과정 대조군으로서의 HEK293T 세포, (B, E) 프로토스콜렉세스, 및 (C, F) 스트로빌화된 웜. (G, H, I) 혼합 빛과 꽃차례 현미경. 배율 막대 = 50μm, 100μm 및 500μm입니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
보충 도 S1: pCDH-CMV-MCS-EF1-GreenPuro cDNA 클로닝 및 발현 벡터의 맵. 이 파일을 다운로드하려면 여기를 클릭하십시오.
저자는 공개 할 이해 상충이 없습니다.
우리는 세 번째 세대 렌티 바이러스 벡터를 사용하여 Echinococcus granulosus 의 다른 발달 단계에서 신속한 일시적인 형질 도입 기술을 설명합니다.
이 간행물에서보고 된 연구는 엘리트 연구원 보조금위원회가이란 테헤란의 국립 의학 연구 개발 연구소 (NIMAD)의 수상 번호 958680으로 지원되었습니다.
| 12-웰 배양 플레이트 | SPL Life Sciences | 30012 | |
| 25 cm2 배양 플라스크 | SPL Life Sciences | 70325 | |
| 6-웰 배양 플레이트 | SPL Life Sciences | 30006 | |
| 칼슘 클로라이드 | Sigma-Aldrich | C4901-500G | 작업 농도: 2.5 mM |
| CMRL 1066 매체 | Thermo Fisher Scientific | 11530037 | |
| CO2 인큐베이터 | memmert | ICO150 | |
| D-(+)-Glucose | Sigma-Aldrich | G8270-1KG | |
| DMEM | Life Technology | 12100046 | |
| Dog bile | 안락사된 개에서 분리하고 0.2 &mu로 살균; m 주사기 필터 | ||
| Eosin Y | Sigma-Aldrich | E4009-5G | 는 작업 제외 테스트를 위해 Eosin의 0.1%를 준비합니다 |
| Fetal Bovine Serum (FBS) | DNAbiotech | DB9723-100ml | 열 비활성화 의 FBS (30분에 40분 > C) |
| 태아 송아지 세럼 (FCS) | DNAbiotech | DB9724-100ml | 열 비활성화 의 FCS (30분에 40분 ° C) |
| HEK293T | 세포BONbiotech | BN_0012.1.14 | 인간 배아 신장 293T |
| HEPES 완충 식염수(HBS) | Sigma-Aldrich | 51558-50ML | 2x 농축액 |
| 반전 형광 현미경 | OLYMPUS | IX51 | |
| 페니실린 | 시그마-알드리치 | P3032-10MU | 작업 농도: 100 IU/mL |
| 펩신 | 로슈 | 10108057001 | 작업 농도: 2 mg/mL, pH 2 |
| 인산염 완충 식염수(PBS) | DNAbiotech | DB0011 | 이 시약은 D.W |
| 폴리브레네(트랜스펙션 시약) | Sigma-Aldrich | TR-1003-G | |
| BioIdea | BI-1006-05 | ||
| 중탄산나트륨(NaHCO3) | Sigma-Aldrich | S5761-1KG | |
| 스트렙토 마이신 | 시그마 - 알드리치 | S9137-25G | 작업 농도 : 100 & g/mL |
| 3세대 렌티바이러스 플라스미드(pCDH513b) | SBI 시스템 생명과학(BioCat GmbH) | CD513B-1-SBI | 전달 벡터(이란 마슈하드에 소재한 이란 교육문화연구센터(ACECR)의 분자 의학 연구부에서 상업적으로 획득) |
| 3세대 렌티바이러스 플라스미드(pLPI 및 pLPII) | 인비트로겐(Life Technologies) | K4975-00 | 헬퍼 벡터(이란 마슈하드에 소재한 이란 교육문화연구센터(ACECR)의 분자 의학 연구부에서 상업적으로 획득) |
| 3세대 렌티바이러스 플라스미드(pMD2G) | Addgene | Plasmid 12259 | 헬퍼 벡터(이란 마슈하드에 소재한 이란 교육문화연구센터(ACECR)의 분자 의학 연구부에서 상업적으로 획득) |
| 트리스/EDTA 버퍼(TE) | DNAbiotech | DB9713-100ml | |
| Trypsin | Sigma-Aldrich | T9935-50MG | 1x 작업 용액 (pH 7.4– 7.6) |