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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
지방산 β산화는 간세포를 포함한 다양한 세포 유형에서 에너지를 생성하는 데 필수적인 대사 경로입니다. 여기에서, 우리는 14C표지된 팔미트산을 사용하여 갓 분리된 원발성 간세포에서 지방산 β산화를 측정하는 방법을 설명한다.
지방산 β산화는 간장의 에너지 요구를 충족시키고 전신 포도당 항상성을 유지하고 금식 상태에서 간 외 장기 기능을 지원하는 데 필수적인 케톤 생성 및 글루코 신 생성과 같은 추가 과정을위한 기질 및 보조 인자를 제공하는 핵심 대사 경로입니다. 지방산 β산화는 미토콘드리아와 퍼옥시좀 내에서 발생하며 지방산의 흡수 및 활성화, 효소 발현 수준 및 조효소 A 및 NAD+와 같은 보조인자의 가용성을 포함한 여러 메커니즘을 통해 조절됩니다. 간 균질물에서 지방산 β 산화를 측정하는 분석에서, 세포 용해 및 보조인자의 초생리학적 수준의 일반적인 첨가는 이러한 조절 메카니즘의 효과를 가린다. 또한, 균질물에서 소기관의 완전성은 제어하기가 어렵고 제제마다 크게 다를 수 있습니다. 온전한 원발성 간세포에서 지방산 β산화의 측정은 위의 함정을 극복합니다. 이 프로토콜은 14C표지된 팔미트산과 함께 인큐베이션된 갓 단리된 일차 마우스 간세포의 현탁액에서 지방산 β산화를 측정하는 방법을 기술한다. 배양의 시간 내지 수일을 피함으로써, 이 방법은 먹이를 먹인 마우스에 비해 금식 마우스로부터 분리된 간세포에서 관찰된 지방산 β산화의 활성화를 포함하여 본래의 간장의 단백질 발현 수준 및 대사 경로 활성을 더 잘 보존할 수 있는 장점이 있다.
지방산 β산화는 지질 대사에 필수적인 과정으로식이 요법에서 지방산 합성과 섭취의 균형을 맞추는 이화 경로를 제공합니다. 이 과정은 심장 근육, 신장 피질 및 금식 간을 포함한 여러 장기에 대한 에너지를 생성하고식이 요법, 지방 조직 지방 분해 및 내부 트리글리 세라이드 저장 1,2에서 얻은 지방산을 활용합니다.
β산화 경로를 통한 지방산의 산화는 아세틸-CoA로서 방출되는 한 번에 두 개의 탄소에 의한 지방 아실 사슬의 순차적 단축을 초래하며, 이 과정은 미토콘드리아와 퍼옥시솜 모두에서 발생한다. 대부분의 지방산은 β산화만을 겪지만, 일부는 이 경로에 들어가기 전에 다른 탄소에서 산화됩니다. 예를 들어, 피탄산과 같은 3-메틸-치환 지방산은 α산화 경로에 들어가기 전에 퍼옥시솜에서 β산화에 의해 하나의 탄소의 제거를 겪는다. 유사하게, 일부 지방산은 먼저 소포체에서 말단 메틸기의 산화(ω-oxidation)에 의해 디카르복실산으로 전환되고, β산화에 의해 퍼옥시좀에서 우선적으로 산화된다(3).
특정 소기관에 관계없이, 지방산은 먼저 조효소 A(CoA) 티오에스테르 또는 아실-CoA로 전환되어야 하며, β산화 경로를 통해 산화되어야 한다. 미토콘드리아 매트릭스에서 장쇄 아실-CoAs의 β-산화는 그들의 전좌를 위해 카르니틴 셔틀을 필요로 하며, 여기서 카르니틴 팔미토일트랜스퍼라제 1(CPT1)은 아실-CoAs를 아실카르니틴으로의 전환을 촉매하고, 이 과정4에서 속도 제한 효소이다. 일단 미토콘드리아 매트릭스로 전좌되면, 아실-CoAs는 재형성되어 미토콘드리아 β산화 기계장치의 기질 역할을 한다. 금식 상태에서, 간에서 β산화를 통해 생성된 아세틸-CoA는 주로 케토제네시스로 채널링된다. 퍼옥시솜은 매우 긴 사슬, 분지쇄 및 디카르복실산의 β산화를 위한 주요 부위로서 작용한다. 페록시솜은 지방산 기질을 수입하기 위해 카르니틴 셔틀을 필요로하지 않으며, 대신 ATP 결합 카세트 (ABC) 수송체 ABCD1-35의 활성을 통해 특파원 아실-CoAs를 수입합니다. 퍼옥시좀 내에서 아실-CoAs는 미토콘드리아 지방산 β산화 기계와 구별되는 전용 효소 세트에 의해 산화됩니다. 미토콘드리아와 퍼옥시솜 모두 지방 아실 사슬을 산화시키기 위해 NAD+ 와 유리 CoA의 공급이 필요합니다. 간에서의 CoA 수준은 금식에 대한 반응에서 증가하는 것으로 나타났으며, 이 상태6에서 발생하는 지방산 산화의 증가된 속도를 지지한다. 더욱이, 퍼옥시좀에서의 증가된 CoA 분해는 퍼옥시솜 지방산 산화의 선택적 감소를 초래한다7. 따라서, 세포 내 지방산 산화의 과정은 지방산의 활성화, 수송 및 산화에 관여하는 효소의 발현 수준 및 활성뿐만 아니라 여러 세포 구획에 걸친 보조인자 및 다른 대사산물의 농도에 의해 조절된다.
지방산 산화를 측정하기 위해 조직 균질물을 사용하는 절차는 이러한 과정을 조절하고 지원하는 세포 구조를 파괴하여, 생체내 대사를 정확하게 반영하지 않는 데이터의 수집으로 이어진다. 플레이팅된 원발성 간세포를 사용하는 기술이 이 시스템을 보존하는 반면, 단리된 세포를 장기간 배양하는 것은 동물 8,9 내에 여전히 살고 있을 때 세포에 존재했던 생체내 유전자 발현 프로파일의 손실을 초래한다. 다음 프로토콜은 일차 간세포를 분리하고 [1-14C]팔미트산을 사용하여 단리 직후 및 현탁액에서 지방산 β산화에 대한 그들의 능력을 분석하는 방법을 기술한다. 상기 분석은 [1-14C]팔미트산10,11의 β산화에 의해 생성된 아세틸-CoA와 같은 산성 가용성 대사산물(ASM) 또는 생성물과 관련된 방사능의 측정에 기초한다.
마우스 (C57BL / 6J, 남성, 9-11 주령)에 대한 모든 실험 절차는 웨스트 버지니아 대학의 IACUC (Institutional Animal Care and Use Committees)의 승인을 받았다.
1. 간세포 분리

그림 1: 관류 장치 및 관류 간. (A) 간을 캐뉼레이트하고 관류하는 데 사용되는 바늘에 연결된 출구 라인이 있는 연동 펌프. (B) 성공적인 통조림은 간장의 즉각적이고 균질한 블랜칭으로 나타난다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
2. 지방산 β산화 분석
참고: 이 분석은 삼중으로 수행되며, 각 반응 혼합물은 2mL의 최종 부피로 750,000 세포, 1.35 mg/mL 소 혈청 알부민 (BSA), 100 μM 팔미트산 및 0.4 μCi [1-14C]팔미트산을 함유한다.
주의: 방사성 화합물은 위험합니다. 방사성 물질을 구매, 취급, 저장 및 폐기하는 것은 기관, 주 및 연방 규정에 따라 이루어집니다.
| 버퍼/미디어 구성 요소 | 분량 | 최종 집중 | 지시 |
| 솔루션 C | |||
| 증권 시세 표시기 | 1.79 지 | 480 밀리지미터 | 50 mL에 물을 넣으십시오. 4 °C에서 보관 |
| MgSO4 헵타하이드레이트 | 1.48 지 | 120 밀리지미터 | |
| KH2PO4 | 0.81 지 | 119 밀리지미터 | |
| 크렙스-헨셀릿 버퍼(KHB), 무칼슘 | |||
| 나클 | 7.0 지 | 120 밀리지미터 | 900 mL에 물을 첨가하고, pH를 7.4로 조정하고, 최종 부피를 1 L로 가져와 4°C에서 보관한다. |
| 나HCO3 | 2.0 지 | 24 밀리지미터 | |
| 1 M 헤페스 pH 7.45 | 5 mL | 5 밀리지미터 | |
| 포도당 | 1 또는 2 g | 5.6 또는 11 mM | |
| 솔루션 C | 10 mL | ||
| 버퍼 1 | |||
| 증권 시세 표시기 | 500 mL | 구성 요소를 혼합하고 필터를 멸균하십시오. 4 °C에서 보관 | |
| 50 밀리지멘트 EGTA | 1.0 mL | 0.1 밀리지미터 | |
| 버퍼 2 | |||
| 증권 시세 표시기 | 500 mL | 구성 요소를 혼합하고 필터를 멸균하십시오. 4 °C에서 보관 | |
| 1 MCaCl2 이수화물 | 686 μL | 1.4 밀리지미터 | |
| 겐타미신 용액 | |||
| 겐타미신 황산염 | 0.5 지 | 50 밀리그램/mL | 10 mL에 물을 넣고 필터를 살균하십시오. 분취량 및 -20°C에서 저장 |
| 콜라게나제 용액 | |||
| 콜라게나제 I과 II 블렌드 | 10 밀리그램 | 7 밀리그램/mL | 바이알의 전체 내용물을 1.43 mL의 물에 녹인다. 분취량 및 -20°C에서 저장 |
| M199 | |||
| M199 | 파우치 1개 | 900 mL에 물을 첨가하고 pH를 7.2-7.4로 조정한다. 최종 부피를 1L로 가져 와서 필터를 멸균하십시오. 4 °C에서 보관 | |
| 나HCO3 | 2.2 지 | 26 밀리지미터 | |
| 1 M HEPES (세포 배양 등급) | 25 mL | 25 밀리지미터 | |
| 추가 포도당 (먹이를 먹인 마우스에만 해당) | 1 g | 11 밀리지미터 | |
| BSA 솔루션 | |||
| 무지방산 BSA | 400 밀리그램 | 20% (승 / v) | 2 mL의 물에 녹인다. 분취량 및 -20°C에서 저장 |
| 비방사성 팔미트산 용액 | |||
| 팔미트산 | 103 밀리그램 | 200 밀리미터 | 에탄올 2 mL에 녹이고 -20°C에서 보관하십시오. |
| 1 M 과염소산 | |||
| 70% 과염소산 | 3.5 mL | 1 엠 | 40 mL의 물에 희석하십시오. 실온에서 보관 |
표 1: 간세포 분리 및 지방산 β산화 분석에 필요한 완충액, 배지 및 기타 용액
| 반응 수 | M199 ± 억제제 | 간세포 현탁액 (μL) | 기판 혼합물 (μL) | ||||
| 부피 (μL) | 에토목시르 | ||||||
| 1 | 750 | - | 37°C에서 예열 | 750 | 예비-인큐베이트 37°C에서 15분 동안 | 500 | 37°C에서 15분 동안 인큐베이션 |
| 2 | |||||||
| 3 | |||||||
| 4 | + | ||||||
| 5 | |||||||
| 6 | |||||||
| 7 | + | 즉시 중지 | |||||
| 8 | |||||||
| 9 | |||||||
표 2: 에토목시르의 존재 및 부재 하에 삼중으로 분석된 간세포 현탁액에 대한 실험 셋업의 예.
여기에 설명 된 간 관류는 일반적으로 트리판 블루 배제로 추정 된 바와 같이 평균 생존율이 80 %인 30-40 백만 세포 / 간을 산출합니다 (그림 2). 관류 완충액 1 및 2를 제조하는데 사용되는 크렙스-헨셀릿 완충액(KHB) 내의 글루코스의 전형적인 농도는 11 mM이다. 공복 마우스로부터 분리된 간세포에서 지방산 β산화를 측정할 때, KHB 내의 글루코스의 농도는 공복 상태를 더 잘 나타내기 위해 낮아질 수 있다. 도 2에 나타난 바와 같이, 글루코스 농도를 5.6 mM로 낮추는 것은 간세포의 수율 또는 생존율에 부정적인 영향을 미치지 않는다.
표 2는 CPT1의 강력한 억제제인 에토목시르의 존재 및 부재 하에서, 미토콘드리아 지방산 산화10,13의 존재 및 부재 하에 삼중으로 분석된 간세포 현탁액에 대한 전형적인 실험 셋업을 나타낸다. 미토콘드리아 지방산 산화의 이러한 또는 다른 억제제의 존재 하에서, [1-14C]팔미트산 산화에 의해 생성된 임의의 잔류 14C 표지된 생성물은 퍼옥시좀에서의 β산화의 첫 번째 사이클에 기인할 수 있다. 따라서, 총 지방산 산화에 대한 미토콘드리아 지방산 산화의 기여β는 총 (-etomoxir)과 퍼록시솜 (+ 에토목시르) 지방산 산화 7,14,15 (도 3)의 차이로 계산될 수 있다.
간세포의 경우, [1-14C]팔미트산의 β산화의 산물과 관련된 방사능의 95% 이상이 ASM에서 발견되고, 나머지는 14C-CO210으로 방출된다. 배경 방사능과 관련된 분당 카운트 (CPM)는 [1-14 C] 팔미트산의 배치에 따라 다양합니다. 그러나, 이들은 여전히 15분 동안 기질 믹스와 함께 인큐베이션하도록 허용된 샘플에서 수득된 CPM보다 상당히 낮다(도 3A). 예상한 바와 같이, 금식 마우스로부터 분리된 간세포는 미토콘드리아 및 퍼옥시솜 지방산 β산화 속도의 강력한 증가를 보여주며, 이들 경로의 공지된 활성화와 일치한다16,17,18,19.

도 2: 본원에 기재된 절차를 사용하여 단리된 간세포의 생존력 및 수율. 간세포는 Ad libitum 을 먹인 수컷 마우스로부터 분리하거나 물에 자유롭게 접근하여 16-18 시간 동안 밤새 금식시켰다. (A) 간세포 생존력 및 (B) 간 당 수율. 데이터는 SEM에서 개별 간세포 제제 (원)에 대한 측정의 평균 (막대)으로 보고된다. 먹이± 금식 마우스로부터 분리된 간세포는 짝을 이루지 않은 두 꼬리 스튜던트 t-검정을 사용하여 비교되었다. * p < 0.05. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

도 3: 지방산 β산화능을 먹이고 금식한 수컷 마우스로부터 분리하고 현탁액에서 검정한 간세포. 갓 분리된 간세포를 기질 믹스의 첨가 전에 에토목시르 (45 μM, +Eto) 또는 DMSO (비히클, -Eto)와 함께 예비인큐베이션하였다. (a) 각 분석법에 도입된 총 CPM은 배경 방사능을 추정하기 위해 설정된 반응의 ASM 분획에서 회수되고, 총 (-Eto), 퍼옥시솜 (+Eto), 및 미토콘드리아 지방산 β산화. 이러한 데이터는 임의의 보정 (배경, 세포 수 또는 단백질 수준에 대해) 또는 임의의 다른 계산이 적용되기 전에 보여진다. (B) (A)의 데이터는 분석의 배경, 총 부피에 대해 보정되고, 1백만 개의 생존 가능한 세포로 정규화되고, 팔미트산이 먹이를 먹고 금식된 마우스로부터 분리된 간세포에서 산화되는 속도로서 표현된다. (C) 사용된 추정된 750,000개의 간세포/검정에 상응하는 총 단백질. (D) (A)에서의 데이터는 (B)에서와 같이 보정되지만 단백질의 mg으로 정규화된다. 데이터는 SEM에서 개별 간세포 제제 (원)에 대한 측정의 평균 (막대)으로 보고된다. 먹이± 금식 마우스로부터 분리된 간세포는 짝을 이루지 않은 두 꼬리 스튜던트 t-검정을 사용하여 비교되었다. * p < 0.05; ** p < 0.01. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
저자는 공개 할 이해 상충이 없습니다.
지방산 β산화는 간세포를 포함한 다양한 세포 유형에서 에너지를 생성하는 데 필수적인 대사 경로입니다. 여기에서, 우리는 14C표지된 팔미트산을 사용하여 갓 분리된 원발성 간세포에서 지방산 β산화를 측정하는 방법을 설명한다.
이 연구는 Roberta Leonardi에게 국립 보건원 보조금 R35GM119528에 의해 지원되었습니다.
| (R)-(+)-에토목시르 나트륨 염 | Tocris Bioscience | 4539/10 | |
| [1-14C]-팔미트산, 50– 60 mCi/mmol, 0.5 mCi/mL | 미국 방사성 표지 화학물질 | ARC 0172A | |
| 1 M HEPES, 멸균 | Corning | 25060CI | |
| 10 µ L 용적형 치환 피펫용 일회용 모세관/피스톤 | Mettler Toledo | 17008604 | |
| 1000 µ L, 200 &마이크로; L 및 10 &마이크로; L 피펫 및 팁 | |||
| 5 mL, 10 mL 및 25 mL 혈청학 피펫 | |||
| 50 mL 멸균 원심분리 튜브 | CellTreat | 229421 | |
| 70% 과염소산 | Fisher Scientific | A2296-1LB | |
| BSA, 지방산 무함유 | Fisher Scientific | BP9704100 | |
| CaCl2 이수화물 | MilliporeSigma | 223506 | |
| D-(+)-포도 | 당MilliporeSigma | G7021 | |
| EGTA | Gold Biotechnology | E-217 | |
| Ethanol | Pharmco | 111000200CSPP | |
| 필터 시스템, 0.22 μ m PES 필터, 500mL, 멸균 | CellTreat | 229707 | |
| 겐타마이신 황산염 | Gold Biotechnology | G-400-25 | |
| HDPE, 6.5mL 섬광 바이알 | Fisher Scientific | 03-342-3 | |
| 혈구계 | |||
| 피하 주사 바늘 22G, 1.5인치 | BD Biosciences | 305156 | |
| Isoflurane | VetOne | 502017 | |
| KCl | Fisher Scientific | BP366-1 | |
| KH2PO4> | MilliporeSigma | P5655 | |
| Liberase TM Research Grade | MilliporeSigma | 5401119001 | Thermolysin M199 배지 MilliporeSigma M5017의 중간 농도와 정제된 콜라겐분해효소 I 및 II의 정의된 혼합물 |
| MgSO4 헵타하이드레이트 | MilliporeSigma | M1880 | |
| 마이크로 원심분리기 | Fisher Scientific | accuSpin Micro 17 | |
| 미세 해부 가위 | Roboz Surgical Instrument Co | RS-5980 | |
| NaCl | Chem-Impex International | 30070 | |
| NaHCO3 | Acros 유기물 | 424270010 | |
| 팔미트산 | MilliporeSigma | P0500 | |
| 페니실린/스트렙토마이신(100x) | Gibco | 15140122 | |
| 인산염 완충 식염수(PBS) | Cytiva Life Sciences | SH30256.01 | |
| 용적식 피펫 MR-10, 10 &마이크로; L | Mettler Toledo | 17008575 | |
| 50 mL 코니컬 튜브용 인서트가 있는 냉장 원심분리기 | Eppendorf | 5810 R | |
| 둥근 바닥, 14 mL, 폴리프로필렌 배양 시험관 | Fisher Scientific | 14-956-9A | |
| 섬광 계수기 | Perkin Elmer | TriCarb 4810 TR | |
| ScintiVerse BD 칵테일 | Fisher Scientific | SX18-4 | |
| 흔들리는 수조, 30L 용량 | New Brunswick Scientific | 모델 G76 | |
| 멸균 세포 스트레이너, 100 &마이크로; m | Fisher Scientific | 22363549 | |
| 엄지 드레싱 펜치 | Roboz 수술 기구 Co | RS-8120 | |
| Trypan Blue | Corning | 25900CI | |
| 가변 흐름 연동 펌프 | Fisher Scientific | 138762 | |
| 수조, 2– 2.5L 용량 |