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방법 논문

Single-Particle Interferometric Reflectance Imaging Characterization of individual extracellular vesicles and population dynamics(개별 세포외 소포체 및 집단 역학의 단일 입자 간섭계 반사율 이미징 특성화)

1.7K 조회수

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DOI:

10.3791/62988

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2022년 1월 10일

이 논문에서

요약

이 프로토콜은 세포외 소포체(EV) 크기, EV 수, EV 표현형 및 EV 바이오마커 공동 국소화의 다단계 및 포괄적인 측정을 위해 설계된 단일 입자 간섭계 반사 이미징을 제공합니다.

초록

세포외 소포체(EV)는 대부분의 세포에서 분비되는 지질 이중층이 있는 나노미터 크기의 소포입니다. EV는 단백질, 지질, DNA 및 RNA를 포함한 다양한 생물학적 분자를 운반하며 다양한 조직과 기관에서 세포 간 통신을 촉진하는 것으로 가정됩니다. 최근 EV는 다양한 질병에 대한 진단 및 치료제를 위한 바이오마커로 큰 주목을 받고 있습니다. EV 특성화를 위해 많은 방법이 개발되었습니다. 그러나 현재의 EV 분석 방법에는 모두 다른 제한 사항이 있습니다. 따라서 EV 절연 및 특성화를 위한 효율적이고 효과적인 방법을 개발하는 것은 이 최첨단 연구 분야가 성숙해짐에 따라 중요한 단계 중 하나로 남아 있습니다. 여기에서는 정제되지 않은 생물학적 소스의 EV와 다른 방법론으로 정제된 EV를 검출하고 특성화할 수 있는 방법으로서 단일 입자 간섭계 반사 이미징 센서(SP-IRIS)를 간략하게 설명하는 자세한 프로토콜을 제공합니다. 이 고급 기술은 EV 크기, EV 수, EV 표현형 및 바이오마커 공동 국소화 분석을 위한 다단계 및 포괄적인 측정에 사용할 수 있습니다.

서론

세포외 소포체(EV)는 혈액, 모유, 타액, 소변, 담즙, 췌장액, 뇌척수액 및 복막액을 포함한 수많은 생물학적 액체에서 분리할 수 있는 세포 기원의 나노미터 크기의 막 소포체입니다. EV의 유도는 세 가지 주요 메커니즘을 통해 발생합니다: 세포사멸(apoptosis), 다소포체(multivesicular body)와 원형질막(plasma membrane)의 융합을 통한 방출(release), 원형질막(plasma membrane)의 블리빙(blebbing)1. 공여체 세포 구성 요소가 인접 또는 먼 세포 및 조직으로 EV로 전달된다는 증거는 이러한 막으로 둘러싸인 패키지가 부분비뿐만 아니라 장거리 또는 내분비 신호 전달 캐스케이드에서 중요한 역할을 할 수 있음을 시사합니다 1,2,3. EV는 세포의 표현형에 대한 스냅샷을 제공할 수 있기 때문에 다양한 질병 치료를 위한 진단 및 치료 도구로 사용할 수 있는 잠재력이 활발한 연구 분야가 되었습니다 4,5,6,7,8

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프로토콜

혈청 샘플은 캔자스 대학교 메디컬 센터(KUMC) 프로토콜에서 승인된 IACUC(Institutional Animal Care and Use Committees)에 따라 마우스에서 수집되었습니다. 이러한 실험에서 이러한 생물학적 시료를 사용하는 것도 KUMC의 승인을 받았습니다.

1. 시료 준비(1일차)

  1. 나노 입자 추적 또는 이에 상응하는 기술을 사용하여 EV 농도를 측정합니다.
  2. 배양 용액으로 샘플을 5 x 10,7-5 x 10,8 EVs/mL의 농도로 희석합니다. 최소 50μL가 필요합니다.
    참고: EV 농도를 알 수 없는 샘플의 경우 1μg/mL의 총 단백질을 대체 측정으로 사용할 수 있습니다. 샘플의 농도가 낮을 것으로 예상되는 경우 로딩하기 전에 배양 용액에서 최소 1:1 희석을 수행합니다.
  3. 진동과 무뚝뚝한 움직임이 없는 평평한 표면에 24웰 플레이트를 놓습니다.
    참고: 대비를 향상시키기 위해 접시 아래에 흰색 종이를 놓을 수 있습니다.
  4. 우물 주변 지역에 물을 추가합니다(그림 2).

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결과

그림 7 (왼쪽 패널)은 칩의 CD63 스폿에 결합되고 각각 녹색, 적색, 청색 채널에서 CD81, CD63 및 CD9에 대해 염색된 HEK293 컨디셔닝 미디어에서 파생된 EV의 3색 합성 이미지를 보여줍니다. 그림 7 (오른쪽 상단 패널)은 캡처된 각 EV가 각 채널에서 다양한 강도로 하나 이상의 색상의 공동 위치 파악을 표시할 수 있음을 보여주는 확대 이미지입니다. 포획된 EV의 염색 차이는 단일 소포에서 3개의 테트라스파닌 발현의 이질성을 나타내며 데이터 분석 소프트웨어로 정량화할 수 있습니다. 그림 7 (오른쪽 하단 패널)은 50nm 이상인 EV의 사이징 히스토그램을 보여줍니다. 사이징 히스토그램은 CD63 스폿에서 캡처된 EV의 모드 크기가 50nm임을 보여줍니다. 스폿 이미지에 바인딩된 각 EV의 색상 공동 국소화, 강도 및 크기는 측정의 기본 데이터를 구성.......

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토론

현재의 EV 특성화 방법은 주로 정제된 EV에 의존하며, 이는 EV 정제 방법의 현재 실험적 한계에 의해 제한됩니다 9,10,11,12,13. SP-IRIS(Single-particle interferometric reflectance imaging)는 시료 분석에 필요한 정제 단계를 제거하여 일반적인 EV 워크플로우와 관련된 시간과 비용을 절감할 수 있는 효과적인 기술입니다. 필요한 시료 입력은 일반적으로 매우 작기 때문에 나머지 시료는 추가 분석 방법에 사용할 수 있습니다.

또한 항원 특이적 방식으로 EV를 측정할 수 있는 기능.......

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공개 사항

Clayton Deighan과 George Daaboul은 NanoView Biosciences Inc.의 직원이자 주주입니다.

감사의 글

이 작업은 University of Kansas School of Medicine Research Equipment and Resource Procurement Award Program의 일부 후원을 받았습니다. PCG, LKC, FD 및 AR은 NIA R21 AG066488-01의 자금으로 지원되었습니다.

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재료

이 논문에 사용된 재료 목록
이름회사카탈로그 번호댓글
10cm 멸균 페트리 접시FisherFB0875712
15mL 멸균 튜브n/a다양한
24웰 세포 배양 플레이트, 평평한 바닥Fisher08-772-1
차단 솔루션NanoView BiosciencesEV-TETRA-C는 ExoView Human Tetraspanin Kit에서 찾을 수 있습니다.
칩파일NanoView BiosciencesEV-TETRA-C는 ExoView Human Tetraspanin Kit에서 찾을 수 있습니다.
칩NanoView BiosciencesEV-TETRA-C는 ExoView Human Tetraspanin Kit에서 찾을 수 있습니다.
ChuckNanoView BiosciencesEV-TETRA-C는 ExoView Human Tetraspanin Kit에서 찾을 수 있습니다.
Corning Easy Grip 일회용 폴리스티렌 멸균 병 250mlFisher09-761-4
Corning Easy Grip 일회용 폴리스티렌 멸균 병 500mlFisher09-761-10
탈이온(DI) 물FisherLC267404
EMS 스타일 핀셋(탄소 섬유 팁포함) Fisher50-193-0842
ExoView 인간 테트라스파닌 키트NanoView BioscienceshCD81, hCD9, hCD63, IgG Control
 + hEV-A용 염색용 EV-TETRA-C 캡처(hEV-CD63-647, hEV-CD81-555, hEV-CD9-488) 키트당 16개 칩
ExoView R100 이미저NanoView BiosciencesEV-R100간섭계 현미경, 3색 형광 및 라벨 프리 크기 조정 및 카운팅을 포함한 고사양 카메라 세포외 소포
광 라벨이 부착된 휴마 CD9 IgG 항체NanoView BiosciencesEV-TETRA-C는 ExoView Human Tetraspanin Kit에서 찾을 수 있습니다.
형광 라벨이 붙은 인간 CD63 IgG 항체NanoView BiosciencesEV-TETRA-C는 ExoView 인간 테트라스파닌 키트에서 찾을 수 있습니다.
형광 라벨을 붙인 인간 CD81 IgG 항체NanoView BiosciencesEV-TETRA-C는 ExoView 인간 테트라스파닌 키트에서 찾을 수 있습니다.
인큐베이션 솔루션NanoView BiosciencesEV-TETRA-C는 ExoView Human Tetraspanin Kit에서 찾을 수 있습니다.
500rpm에서 쉐이킹할 수 있는 디지털 설정이 있는 오비탈 쉐이커 또는 마이크로플레이트 쉐이커
솔루션:NanoView BiosciencesEV-TETRA-C는 ExoView Human Tetraspanin Kit에서 찾을 수 있습니다.
솔루션 BNanoView BiosciencesEV-TETRA-C는 ExoView Human Tetraspanin Kit에서 찾을 수 있습니다.
솔루션 CNanoView BiosciencesEV-TETRA-C는 ExoView Human Tetraspanin Kit에서 찾을 수 있습니다.
솔루션 DNanoView BiosciencesEV-TETRA-C는 ExoView Human Tetraspanin Kit에서 찾을 수 있습니다.
스퀘어/플랫 팁 핀셋Fisher50-239-62
스트레이트 스트롱 포인트 볼리 스타일 핀셋Fisher16-100-124
Thermo Scientific 접착제 PCR 플레이트 씰FisherAB-0558
체 형: 다양한 플레이트 씰, NanoView Biosciences EV-TETRA-C는 ExoView Human Tetraspanin Kit에서 찾을 수 있습니다.

참고문헌

  1. Maas, S. L. N., Breakefield, X. O., Weaver, A. M. Extracellular vesicles: Unique intercellular delivery vehicles. Trends in Cell Biology. 27 (3), 172-188 (2017).
  2. Shah, R., Patel, T., Freedman, J. E. Circulating extracellular vesicles in human disease. The New E....

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재인쇄 및 허가

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