이 콘텐츠를 보려면 JoVE 구독이 필요합니다. 로그인하거나 오늘 무료 평가판을 시작하세요.

방법 논문

TIRF 현미경에 의한 시험관 내에서 가교 및 단일 미세 소 의 역학의 동시 시각화

2.4K 조회수

DOI:

10.3791/63377

2022년 2월 18일

* These authors contributed equally

이 논문에서

요약

여기서, TIRF 현미경 기반 시험관내 재구성 분석법이 제시되어 두 미세소관 집단의 역학을 동시에 정량화하고 비교한다. 가교된 미세소관 다발 및 단일 미세소관 상에서 다수의 미세소관-관련 단백질의 집단 활성을 동시에 보는 방법이 기술된다.

초록

미세소관은 세포에서 별개의 구조로 조직되는 αβ-튜불린 이종이량체의 중합체이다. 미세소관 기반 아키텍처 및 네트워크에는 종종 동적 특성이 다른 미세소관 어레이의 하위 집합이 포함되어 있습니다. 예를 들어, 분열 세포에서, 가교결합된 미세소관의 안정한 다발은 동적 비가교된 미세소관에 근접하여 공존한다. TIRF-현미경-기반 시험관 재구성 연구는 이들 상이한 미세소관 어레이의 역학의 동역학의 동시 시각화를 가능하게 한다. 이 분석에서, 이미징 챔버는 단일 필라멘트로 존재하거나 가교된 다발로 조직되는 표면 고정화된 미세소관으로 조립된다. 튜불린, 뉴클레오티드 및 단백질 조절제의 도입은 관련 단백질 및 단일 및 가교된 미세소관의 동적 특성의 직접적인 시각화를 가능하게 한다. 또한, 동적 단일 미세소관이 번들로 구성될 때 발생하는 변화를 실시간으로 모니터링할 수 있습니다. 여기에 설명 된 방법은 개별 단백질의 활성 및 국소화에 대한 체계적인 평가뿐만 아니라 동일한 실험 조건 하에서 두 개의 서로 다른 미세 소관 하위 집합에 대한 단백질 조절제의 상승 효과를 허용하여 다른 방법으로는 접근 할 수없는 기계론적 통찰력을 제공합니다.

서론

미세소관은 세포 내 수송 및 소기관 위치에서부터 세포 분열 및 신장에 이르기까지 여러 세포 과정에 필수적인 구조적 스캐폴드를 형성하는 바이오 폴리머입니다. 이러한 다양한 기능을 실행하기 위해 개별 미세 소관은 유사분열 스핀들, 섬모 축삭, 뉴런 번들, 상 간 배열 및 식물 피질 배열과 같은 미크론 크기의 배열로 구성됩니다. 이 구조에서 발견되는 유비쿼터스 건축 모티프는 길이를 따라 가교 된 미세 소관 묶음입니다1. 몇몇 미세소관-기반 구조의 흥미로운 특징은 번들링된 미세소관과 비가교된 단일 미세소관이 가까운 공간적 근접성에서 공존한다는 것이다. 이러한 미세소관 하위집단은 적절한 기능을 위해 필요에 따라 서로 뚜렷하게 다른 중합 역학을 나타낼 수 있습니다2,3,4,5. 예를 들어, 유사분열 스핀들 내에서, 안정한 가교결합된 다발과 동적 단일 미세소관은 세포 중심6에서 미크론 스케일 영역 내에 존재한다. 따라서 공존하는 미세 소관 집단의 동적 특성이 어떻게 지정되는지를 연구하는 것은 ....

액세스가 제한되었습니다. 이 콘텐츠를 보려면 로그인하거나 체험판을 시작하세요.

프로토콜

1. 시약 준비

  1. 1 및 표 2에 요약된 바와 같이 완충제 및 시약을 준비 한다. 실험 중에 달리 명시되지 않는 한 모든 용액을 얼음 위에 보관하십시오.
용액구성 요소권장 저장 기간노트
5X BRB80400 mM K-파이프, 5 mM MgCl2, 5 mM EGTA, KOH로 pH 6.8, 필터 멸균최대 2년4 °C에서 보관
1X BRB8080 mM K-파이프, 1 mM MgCl2

액세스가 제한되었습니다. 이 콘텐츠를 보려면 로그인하거나 체험판을 시작하세요.

결과

상기 기재된 실험은 647 nm 형광단-표지된 비오티닐화 마이크로소관, 560 nm 형광단-표지된 비오티닐화 마이크로소관, 및 560 nm 형광단-표지된 가용성 튜불린 혼합물을 사용하여 수행되었다. 미세소관은 가교결합 단백질 PRC1 (GFP 표지)에 의해 가교결합되었다. 표면-고정화된 다발 및 단일 미세소관이 생성된 후(단계 5.11), 이미징 챔버를 TIRF 100X 1.49 NA 오일 대물 상에 장착하고 560 nm 및 647 nm 형광 채널에서 관찰하였다. 단일 미세소관은 647 nm 채널에서 그들의 형광 신호에 의해 확인되었다. 두 채널 모두에서 형광 신호를 갖는 미세소관은 미리 형성된 다발로 확인되었다(그림 4). 동일한 형광 표지를 가진 비오티닐화 및 비오티닐화 미세소관으로 실험을 수행하는 경우, 다발에 대한 검출된 형광 강도는 단일 미세소관의 형광 강도보다 약 두 배 또는 그 이상이 될 것이다. 각 개체군의 비율과 밀도에 따라, 단계 5.6 및 5.10에서 미세.......

액세스가 제한되었습니다. 이 콘텐츠를 보려면 로그인하거나 체험판을 시작하세요.

토론

여기에 설명 된 실험은 전통적으로 단일 미세 소관 또는 한 유형의 어레이에서 수행되는 기존의 미세 소관 재구성 분석의 범위와 복잡성을 크게 확장합니다. 현재의 분석은 두 집단, 즉 단일 미세소관 및 가교결합된 다발에 대한 조절 MAP 활성을 동시에 정량화하고 비교하는 방법을 제공한다. 또한,이 분석은 두 가지 유형의 번들을 검사 할 수 있습니다 : 역학이 시작되기 전에 안정적인 씨앗으로 미리 형성된 번들과 두 개의 성장 끝이 서로 만나서 가교 될 때 새로 형성되는 번들. 더욱이, 단백질 농도 및 완충액 조건과 같은 종래의 실험 변수 이외에도, 이들 분석은 다발에서 인접한 필라멘트 사이의 길이 및 각도와 같은 미세소관 어레이의 기하학적 특징의 영향을 평가할 수 있게 하며, 이는 미세소관 역학 및 MAP 활성16의 중요한 결정인자로 부상하고 있다.

다중 미세소관 기반 구조물의 시험.......

액세스가 제한되었습니다. 이 콘텐츠를 보려면 로그인하거나 체험판을 시작하세요.

공개 사항

저자는 경쟁 이익이 없다고 선언합니다.

감사의 글

이 사업은 NIH (No. 1DP2GM126894-01)의 보조금과 퓨 자선 신탁 및 스미스 가족 재단의 기금으로 R.S.에 지원되었습니다. 저자들은 프로토콜의 개발 및 최적화에 기여한 Shuo Jiang 박사에게 감사드립니다.

....

액세스가 제한되었습니다. 이 콘텐츠를 보려면 로그인하거나 체험판을 시작하세요.

재료

이 논문에 사용된 재료 목록
이름회사카탈로그 번호댓글
(&플러스mn;)-6-Hydroxy-2,5,7,8-tetramethylchromane-2-carboxylic acid (Trolox)Sigma Aldrich238813
1,4-piperazinediethanesulfonic acid (PIPES)Sigma AldrichP6757
18x18 mm #1.5 coverslips 전자 현미경 과학63787
2-메르캅토에탄올 (BME)Sigma AldrichM-6250
24x60 mm #1.5 커버슬립전자 현미경 과학63793
405/488/560/647 nm 레이저 쿼드 밴드 ChromaTRF89901-NK
아세톤시그마 Aldrich320110
아데노신 5'-트리포스페이트 디소듐 염 수화물 (ATP)Sigma AldrichA7699-5G
Avidin, NeutrAvidin® 비오틴 결합 단백질(Molecular Probes;)Thermo Fischer ScientificA2666
목욕 초음파 처리기: Branson 2800 클리너BransonCPX2800H
Beckman Coulter 폴리카보네이트 두꺼운 벽 튜브, 11 x 34 mmBeckman-Coulter 
343778 Beckman Coulter 폴리카보네이트 두꺼운 벽 튜브, 8 x 34 mmBeckman-Coulter 
비오틴-PEG-SVA, MW 5,000Laysan Bio#Biotin-PEG-SVA-5000
소 혈청 알부민(BSA)Sigma Aldrich2905
카탈라아제Sigma AldrichC40
Corning LSE 미니 마이크로 원심분리기, AC100-240VCorning6670
섬세한 작업용 물티슈Kimtech34120
디티오트레이톨 (DTT)GoldBioDTT10
방출 필터ChromaET610/75m
에탄올 (200-proof)Decon Labs2705
에틸렌 글리콜 테트라아세트산 (EGTA)Sigma Aldrich3777
글루코스 산화효소Sigma AldrichG2133
GMPCPPJena Bioscience NU-405
구아노신 5'-트리포스페이트 나트륨 소금 수화물 (GTP)Sigma AldrichG8877
Hellmanex III 세제 Sigma AldrichZ805939
이멀젼 오일, Type AFisher Scientific77010
카파-카제인Sigma AldrichC0406
LanolinFisher ScientificS25376
렌즈 세척 조직ThorLabsMC-5
염화마그네슘(MgCl2)SigmaAldrichM9272
메틸셀룰로오스시그마 알드리치M0512
마이크로퓨지 16 벤치탑 원심분리기Beckman-Coulter A46474
현미경 슬라이드, 다이아몬드 화이트 유리, 25 x 75mm, 90도; 그라운드 엣지, WHITE FrostedGlobe Scientific1380-50W
mPEG-숙시니미딜 발레레이트, MW 5,000 레이산 바이오#NH2-PEG-VA-5K
옵티마&트레이드; Max-XP 테이블탑 초원심분리기Beckman-Coulter 
파라핀Fisher ScientificP31-500
PELCO 리버스(자동 폐쇄), 미세 핀셋Ted Pella5377-NM
Petrolatum, WhiteFisher Scientific18-605-050
플라즈마 클리너, 115VHarrick PlasmaPDC-001
수산화칼륨(KOH)Sigma Aldrich221473
소듐 바이카보네이시그마 알드리치S6014
설탕시그마 알드리치S7903
Thermal-Lok 1-위치 건식 열 목욕USA Scientific2510-1101
1.5 및 2.0 mL 튜브용 Thermal-Lok 블록USA Scientific2520-0000
Thermo Scientific™ 피어싱&트레이드; 채권 파괴&거래; TCEP 용액, 중성 pH; 500mMThermo Fischer ScientificPI-77720
TIRF 100X NA 1.49 오일 오브젝티브NikonCFI Apochromat TIRF 100XC 오일
TIRF 현미경NikonEclipse Ti
TLA 120.1 로터Beckman-Coulter 
TLA 120.2 로터Beckman-Coulter 
튜불린 단백질(>99% 순수): 돼지 뇌세포골격T240
튜불린 단백질(비오틴): 돼지 뇌세포골격T333P
튜불린 단백질(형광 HiLyte 647): 돼지 뇌세포골격TL670M
튜불린 단백질(X-로다민): 소 뇌세포골격TL620M
벡타본드® 시약, 조직 절편 접착벡터 BiolabsSP-1800-7
VWR® 개인용 인큐베이터, 120V, 50/60Hz, 0.6AVWR97025-630
343776393315트 362224357656

참고문헌

  1. Subramanian, R., Kapoor, T. M. Building complexity: insights into self-organized assembly of microtubule-based architectures. Developmental Cell. 23 (5), 874-885 (2012).
  2. Baas, P. W., Rao, A. N., Matamoros, A. J., Leo, L. Stability properties of neuronal mic....

액세스가 제한되었습니다. 이 콘텐츠를 보려면 로그인하거나 체험판을 시작하세요.

재인쇄 및 허가

태그

미세소관 역학가교 결합 미세소관인 비트로 재구성형광 이미징미세소관 다발단백질 조절 인자표면 고정화미세소관 조직화