여기서, TIRF 현미경 기반 시험관내 재구성 분석법이 제시되어 두 미세소관 집단의 역학을 동시에 정량화하고 비교한다. 가교된 미세소관 다발 및 단일 미세소관 상에서 다수의 미세소관-관련 단백질의 집단 활성을 동시에 보는 방법이 기술된다.
이 콘텐츠를 보려면 JoVE 구독이 필요합니다. 로그인하거나 오늘 무료 평가판을 시작하세요.
방법 논문
* These authors contributed equally
여기서, TIRF 현미경 기반 시험관내 재구성 분석법이 제시되어 두 미세소관 집단의 역학을 동시에 정량화하고 비교한다. 가교된 미세소관 다발 및 단일 미세소관 상에서 다수의 미세소관-관련 단백질의 집단 활성을 동시에 보는 방법이 기술된다.
미세소관은 세포에서 별개의 구조로 조직되는 αβ-튜불린 이종이량체의 중합체이다. 미세소관 기반 아키텍처 및 네트워크에는 종종 동적 특성이 다른 미세소관 어레이의 하위 집합이 포함되어 있습니다. 예를 들어, 분열 세포에서, 가교결합된 미세소관의 안정한 다발은 동적 비가교된 미세소관에 근접하여 공존한다. TIRF-현미경-기반 시험관 내 재구성 연구는 이들 상이한 미세소관 어레이의 역학의 동역학의 동시 시각화를 가능하게 한다. 이 분석에서, 이미징 챔버는 단일 필라멘트로 존재하거나 가교된 다발로 조직되는 표면 고정화된 미세소관으로 조립된다. 튜불린, 뉴클레오티드 및 단백질 조절제의 도입은 관련 단백질 및 단일 및 가교된 미세소관의 동적 특성의 직접적인 시각화를 가능하게 한다. 또한, 동적 단일 미세소관이 번들로 구성될 때 발생하는 변화를 실시간으로 모니터링할 수 있습니다. 여기에 설명 된 방법은 개별 단백질의 활성 및 국소화에 대한 체계적인 평가뿐만 아니라 동일한 실험 조건 하에서 두 개의 서로 다른 미세 소관 하위 집합에 대한 단백질 조절제의 상승 효과를 허용하여 다른 방법으로는 접근 할 수없는 기계론적 통찰력을 제공합니다.
미세소관은 세포 내 수송 및 소기관 위치에서부터 세포 분열 및 신장에 이르기까지 여러 세포 과정에 필수적인 구조적 스캐폴드를 형성하는 바이오 폴리머입니다. 이러한 다양한 기능을 실행하기 위해 개별 미세 소관은 유사분열 스핀들, 섬모 축삭, 뉴런 번들, 상 간 배열 및 식물 피질 배열과 같은 미크론 크기의 배열로 구성됩니다. 이 구조에서 발견되는 유비쿼터스 건축 모티프는 길이를 따라 가교 된 미세 소관 묶음입니다1. 몇몇 미세소관-기반 구조의 흥미로운 특징은 번들링된 미세소관과 비가교된 단일 미세소관이 가까운 공간적 근접성에서 공존한다는 것이다. 이러한 미세소관 하위집단은 적절한 기능을 위해 필요에 따라 서로 뚜렷하게 다른 중합 역학을 나타낼 수 있습니다2,3,4,5. 예를 들어, 유사분열 스핀들 내에서, 안정한 가교결합된 다발과 동적 단일 미세소관은 세포 중심6에서 미크론 스케일 영역 내에 존재한다. 따라서 공존하는 미세 소관 집단의 동적 특성이 어떻게 지정되는지를 연구하는 것은 ....
액세스가 제한되었습니다. 이 콘텐츠를 보려면 로그인하거나 체험판을 시작하세요.
1. 시약 준비
| 용액 | 구성 요소 | 권장 저장 기간 | 노트 | ||
| 5X BRB80 | 400 mM K-파이프, 5 mM MgCl2, 5 mM EGTA, KOH로 pH 6.8, 필터 멸균 | 최대 2년 | 4 °C에서 보관 | ||
| 1X BRB80 | 80 mM K-파이프, 1 mM MgCl2 | ||||
액세스가 제한되었습니다. 이 콘텐츠를 보려면 로그인하거나 체험판을 시작하세요.
상기 기재된 실험은 647 nm 형광단-표지된 비오티닐화 마이크로소관, 560 nm 형광단-표지된 비오티닐화 마이크로소관, 및 560 nm 형광단-표지된 가용성 튜불린 혼합물을 사용하여 수행되었다. 미세소관은 가교결합 단백질 PRC1 (GFP 표지)에 의해 가교결합되었다. 표면-고정화된 다발 및 단일 미세소관이 생성된 후(단계 5.11), 이미징 챔버를 TIRF 100X 1.49 NA 오일 대물 상에 장착하고 560 nm 및 647 nm 형광 채널에서 관찰하였다. 단일 미세소관은 647 nm 채널에서 그들의 형광 신호에 의해 확인되었다. 두 채널 모두에서 형광 신호를 갖는 미세소관은 미리 형성된 다발로 확인되었다(그림 4). 동일한 형광 표지를 가진 비오티닐화 및 비오티닐화 미세소관으로 실험을 수행하는 경우, 다발에 대한 검출된 형광 강도는 단일 미세소관의 형광 강도보다 약 두 배 또는 그 이상이 될 것이다. 각 개체군의 비율과 밀도에 따라, 단계 5.6 및 5.10에서 미세.......
액세스가 제한되었습니다. 이 콘텐츠를 보려면 로그인하거나 체험판을 시작하세요.
여기에 설명 된 실험은 전통적으로 단일 미세 소관 또는 한 유형의 어레이에서 수행되는 기존의 미세 소관 재구성 분석의 범위와 복잡성을 크게 확장합니다. 현재의 분석은 두 집단, 즉 단일 미세소관 및 가교결합된 다발에 대한 조절 MAP 활성을 동시에 정량화하고 비교하는 방법을 제공한다. 또한,이 분석은 두 가지 유형의 번들을 검사 할 수 있습니다 : 역학이 시작되기 전에 안정적인 씨앗으로 미리 형성된 번들과 두 개의 성장 끝이 서로 만나서 가교 될 때 새로 형성되는 번들. 더욱이, 단백질 농도 및 완충액 조건과 같은 종래의 실험 변수 이외에도, 이들 분석은 다발에서 인접한 필라멘트 사이의 길이 및 각도와 같은 미세소관 어레이의 기하학적 특징의 영향을 평가할 수 있게 하며, 이는 미세소관 역학 및 MAP 활성16의 중요한 결정인자로 부상하고 있다.
다중 미세소관 기반 구조물의 시험.......
액세스가 제한되었습니다. 이 콘텐츠를 보려면 로그인하거나 체험판을 시작하세요.
저자는 경쟁 이익이 없다고 선언합니다.
이 사업은 NIH (No. 1DP2GM126894-01)의 보조금과 퓨 자선 신탁 및 스미스 가족 재단의 기금으로 R.S.에 지원되었습니다. 저자들은 프로토콜의 개발 및 최적화에 기여한 Shuo Jiang 박사에게 감사드립니다.
....액세스가 제한되었습니다. 이 콘텐츠를 보려면 로그인하거나 체험판을 시작하세요.
| 이름 | 회사 | 카탈로그 번호 | 댓글 |
|---|---|---|---|
| (&플러스mn;)-6-Hydroxy-2,5,7,8-tetramethylchromane-2-carboxylic acid (Trolox) | Sigma Aldrich | 238813 | |
| 1,4-piperazinediethanesulfonic acid (PIPES) | Sigma Aldrich | P6757 | |
| 18x18 mm #1.5 coverslips | 전자 현미경 과학 | 63787 | |
| 2-메르캅토에탄올 (BME) | Sigma Aldrich | M-6250 | |
| 24x60 mm #1.5 커버슬립 | 전자 현미경 과학 | 63793 | |
| 405/488/560/647 nm 레이저 쿼드 밴드 | Chroma | TRF89901-NK | |
| 아세톤 | 시그마 Aldrich | 320110 | |
| 아데노신 5'-트리포스페이트 디소듐 염 수화물 (ATP) | Sigma Aldrich | A7699-5G | |
| Avidin, NeutrAvidin® 비오틴 결합 단백질(Molecular Probes;) | Thermo Fischer Scientific | A2666 | |
| 목욕 초음파 처리기: Branson 2800 클리너 | Branson | CPX2800H | |
| Beckman Coulter 폴리카보네이트 두꺼운 벽 튜브, 11 x 34 mm | Beckman-Coulter | ||
| 343778 Beckman Coulter 폴리카보네이트 두꺼운 벽 튜브, 8 x 34 mm | Beckman-Coulter | ||
| 비오틴-PEG-SVA, MW 5,000 | Laysan Bio | #Biotin-PEG-SVA-5000 | |
| 소 혈청 알부민(BSA) | Sigma Aldrich | 2905 | |
| 카탈라아제 | Sigma Aldrich | C40 | |
| Corning LSE 미니 마이크로 원심분리기, AC100-240V | Corning | 6670 | |
| 섬세한 작업용 물티슈 | Kimtech | 34120 | |
| 디티오트레이톨 (DTT) | GoldBio | DTT10 | |
| 방출 필터 | Chroma | ET610/75m | |
| 에탄올 (200-proof) | Decon Labs | 2705 | |
| 에틸렌 글리콜 테트라아세트산 (EGTA) | Sigma Aldrich | 3777 | |
| 글루코스 산화효소 | Sigma Aldrich | G2133 | |
| GMPCPP | Jena Bioscience | NU-405 | |
| 구아노신 5'-트리포스페이트 나트륨 소금 수화물 (GTP) | Sigma Aldrich | G8877 | |
| Hellmanex III 세제 | Sigma Aldrich | Z805939 | |
| 이멀젼 오일, Type A | Fisher Scientific | 77010 | |
| 카파-카제인 | Sigma Aldrich | C0406 | |
| Lanolin | Fisher Scientific | S25376 | |
| 렌즈 세척 조직 | ThorLabs | MC-5 | |
| 염화마그네슘(MgCl2)Sigma | Aldrich | M9272 | |
| 메틸셀룰로오스 | 시그마 알드리치 | M0512 | |
| 마이크로퓨지 16 벤치탑 원심분리기 | Beckman-Coulter | A46474 | |
| 현미경 슬라이드, 다이아몬드 화이트 유리, 25 x 75mm, 90도; 그라운드 엣지, WHITE Frosted | Globe Scientific | 1380-50W | |
| mPEG-숙시니미딜 발레레이트, MW 5,000 | 레이산 바이오 | #NH2-PEG-VA-5K | |
| 옵티마&트레이드; Max-XP 테이블탑 초원심분리기 | Beckman-Coulter | ||
| 파라핀 | Fisher Scientific | P31-500 | |
| PELCO 리버스(자동 폐쇄), 미세 핀셋 | Ted Pella | 5377-NM | |
| Petrolatum, White | Fisher Scientific | 18-605-050 | |
| 플라즈마 클리너, 115V | Harrick Plasma | PDC-001 | |
| 수산화칼륨(KOH) | Sigma Aldrich | 221473 | |
| 소듐 바이카보네이 | 시그마 알드리치 | S6014 | |
| 설탕 | 시그마 알드리치 | S7903 | |
| Thermal-Lok 1-위치 건식 열 목욕 | USA Scientific | 2510-1101 | |
| 1.5 및 2.0 mL 튜브용 Thermal-Lok 블록 | USA Scientific | 2520-0000 | |
| Thermo Scientific™ 피어싱&트레이드; 채권 파괴&거래; TCEP 용액, 중성 pH; 500mM | Thermo Fischer Scientific | PI-77720 | |
| TIRF 100X NA 1.49 오일 오브젝티브 | Nikon | CFI Apochromat TIRF 100XC 오일 | |
| TIRF 현미경 | Nikon | Eclipse Ti | |
| TLA 120.1 로터 | Beckman-Coulter | ||
| TLA 120.2 로터 | Beckman-Coulter | ||
| 튜불린 단백질(>99% 순수): 돼지 뇌 | 세포골격 | T240 | |
| 튜불린 단백질(비오틴): 돼지 뇌 | 세포골격 | T333P | |
| 튜불린 단백질(형광 HiLyte 647): 돼지 뇌 | 세포골격 | TL670M | |
| 튜불린 단백질(X-로다민): 소 뇌 | 세포골격 | TL620M | |
| 벡타본드® 시약, 조직 절편 접착 | 벡터 Biolabs | SP-1800-7 | |
| VWR® 개인용 인큐베이터, 120V, 50/60Hz, 0.6A | VWR | 97025-630 |
액세스가 제한되었습니다. 이 콘텐츠를 보려면 로그인하거나 체험판을 시작하세요.