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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
광이성체화 양자 수율은 새로 개발된 광스위치의 조사에서 정확하게 결정되어야 하는 기본적인 광물리학적 특성이다. 여기에서, 우리는 모델 이중안정 광스위치로서 광변색 히드라존의 광이성체화 양자 수율을 측정하기 위한 일련의 절차를 설명한다.
광 구동 구조 변환을 겪는 광전환 유기 분자는 적응형 분자 시스템을 구성하는 핵심 구성 요소이며 다양한 응용 분야에서 활용됩니다. 광 스위치를 사용하는 대부분의 연구에서 흡수 및 방출의 최대 파장, 몰 감쇠 계수, 형광 수명 및 광이성체화 양자 수율과 같은 몇 가지 중요한 광물리학 적 특성은 전자 상태 및 전이 과정을 조사하기 위해 신중하게 결정됩니다. 그러나, 광이성체화 양자 수율의 측정, 흡수된 광자에 대한 광이성체화의 효율은, 전형적인 실험실 설정에서 종종 복잡하고 오류가 발생하기 쉬운 이유는 적절한 통합 방법에 기초한 엄격한 분광학적 측정 및 계산의 구현을 필요로 하기 때문이다. 이 기사에서는 광변색 히드라존을 사용하여 이중안정 광스위치의 광이성체화 양자 수율을 측정하기 위한 일련의 절차를 소개한다. 우리는이 기사가 점점 더 개발되고있는 이중 안정 광 스위치의 조사에 유용한 가이드가 될 것으로 기대합니다.
광변색 유기 분자는 빛이 비침습적으로 열역학적 평형으로부터 시스템을 멀어지게 할 수 있는 독특한 자극이기 때문에 광범위한 과학 분야에서 상당한 주목을 받고 있다1. 적절한 에너지로 빛을 조사하면 시공간 정밀도가 높은 광스위치의 구조적 변조가 가능합니다 2,3,4. 이러한 이점들 덕분에, 이중 결합(예를 들어, 스틸벤, 아조벤젠, 이민, 푸마라미드, 티오인디고스) 및 고리 개구/폐쇄(예를 들어, 스피로피란, 디티에닐렌, 풀지드, 공여체-수용체 스텐하우스 부가물)의 구성 이성체화에 기초한 다양한 유형의 광스위치가 개발되어 다양한 길이 스케일에서 적응성 물질의 핵심 성분으로서 활용되었다. 광스위치의 대표적인 응용 분야에는 광변색 물질, 약물 전달, 전환 가능한 수용체 및 채널, 정보 또는 에너지 저장, 분자 기계 5,6,7,8,9,10,11,12가 포함됩니다. 새로 설계된 광스위치를 제시하는 대부분의 연구에서, 흡수 및 방출의λmax, 몰 감쇠 계수 (ε), 형광 수명 및 광이성체화 양자 수율과 같은 광물리학적 특성은 철저하게 특징지어진다. 이러한 특성의 조사는 광학 특성 및 이성체화 메커니즘을 이해하는 데 중요한 전자 상태 및 전이에 대한 핵심 정보를 제공합니다.
그러나, 광이성체화 양자 수율의 정확한 측정-반응물에 의해 흡수된 조사 파장에서 광자의 수로 나뉘어 발생한 광이성체화 이벤트의 수-는 종종 몇 가지 이유로 인해 전형적인 실험실 설정에서 복잡하다. 광이성체화 양자 수율의 결정은 일반적으로 반응의 진행을 모니터링하고 조사 동안 흡수된 광자의 수를 측정함으로써 달성된다. 주요 관심사는 광화학 반응이 진행됨에 따라 용액에 의한 총 흡수가 시간이 지남에 따라 변화하기 때문에 단위 시간당 광자 흡수량이 점진적으로 변한다는 것입니다. 따라서, 단위 시간당 소비되는 반응물의 수는 조사 동안 측정되는 시간 섹션에 따라 달라진다. 따라서, 차등적으로 정의되는 광이성체화 양자 수율을 추정할 의무가 있다.
반응물과 광생성물이 모두 조사 파장에서 빛을 흡수 할 때 더 번거로운 문제가 발생합니다. 이 경우, 광화학적 이성체화는 양방향으로 일어난다(즉, 광가역적 반응). 전방 및 후진 반응에 대한 두 개의 독립적인 양자 수율은 관찰된 반응 속도로부터 직접 얻을 수 없다. 부정확 한 광도는 또한 오류의 일반적인 원인입니다. 예를 들어, 전구의 노화는 점차적으로 강도를 변화시킵니다. 400nm에서의 제논 아크 램프의 조도는 동작14의 1000 h 후에 30% 감소한다. 시준되지 않은 빛의 확산은 실제 입사 조도를 소스의 공칭 전력보다 훨씬 작게 만듭니다. 따라서 효과적인 광자 플럭스를 정확하게 정량화하는 것이 중요합니다. 참고로, 실온에서 준안정 형태의 열 이완은 무시되기에 충분히 작아야 한다.
이 백서에서는 이중안정 광스위치의 광이성체화 양자 수율을 결정하기 위한 일련의 절차를 소개한다. 이 분야의 선구적인 연구팀인 Aprahamian의 그룹에 의해 개발된 다수의 히드라존 광스위치는 그들의 선택적 광이성체화와 그들의 준안정 이성질체15,16,17의 현저한 안정성 덕분에 주목을 받고 있다. 그들의 히드라존 광스위치는 히드라존 그룹에 의해 결합된 두 개의 방향족 고리를 구성하고, C=N 결합은 적절한 파장에서 조사될 때 선택적 E/Z 이성체화를 겪는다(그림 1). 이들은 동적 분자 시스템18,19,20,21의 운동성 성분으로서 성공적으로 통합되었다. 이 작업에서, 우리는 아미드 그룹을 담지하는 새로운 히드라존 유도체를 제조하고 광이성체화 양자 수율의 결정을 위해 광전환 특성을 조사했다.
1. 광고정 상태(PSS)에서 1HNMR 스펙트럼 획득
2. PSS에서 UV-Vis 흡수 분광법
(1)
(2)3. 열 이완에 관한 운동 연구
(3)
(M) = the concentration of 1-E at the initial state; (M) = 특정 온도에서의 열역학적 평형에서의 1-E의 농도;
k(s-1) = 특정 온도에서의 열 이완의 속도 상수; t(들) = 가열 시간.
Arrhenius 방정식(Eq(4))에 따라 선형 피팅을 수행하여 실온에서 속도 상수를 추정합니다(그림 7).
(4)
(5)
(6)
(7)
(J·mol-1) = 열 이완을 위한 활성화의 깁스 에너지; k1(s-1) = 상승된 온도에서 추정된 열 이완의 속도 상수; k2(s-1) = 실온에서의 열이완 속도 상수(298.15 K); T1(K) = k1이 얻어지는 절대 온도; (K) = 실온 (298.15 K).4. 페리옥살레이트 액티노메트리
참고: 페리옥살레이트 액티노메트리에 대한 모든 절차는 주변광의 영향을 방지하기 위해 어두운 빛 또는 >600nm 빛에서 수행되어야 합니다.
(8)
(9)5. 광이성체화 양자 수율의 결정
(10)
(11)
; V(L) = 샘플의 부피; I (mol·s-1) = 큐벳에 도착하는 몰 광자 플럭스; l(cm) = 광로 길이; t1, t2(들) = 2개의 연속적인 조사 시점; F(t1), F(t2) = 시간 t1 및 t2에서의 광동역학 인자; A obs,t1, A obs,t2, Aobs,∞ = PSS에서의 특정 파장에서의 흡수율, t1 및 t2 각각.
(12)
(13)
조사 파장에서의 (M-1 cm-1) = 1-Z 및 1-E의 몰 감쇠 계수; ,
(M) = PSS에서의 1-Z 및 1-E의 몰 감쇠 계수; , (M) = PSS에서의 1-Z 및 1-E의 농도; 
Ctot(M) = 총 농도 1.436nm 빛을 갖는 NMR 튜브에 1을 조사하면(초기 상태에서 Z:E = 54:46), 히드라존 C=N 결합의 우세한 Z-to-E 이성체화로 인해 1-E의 비율이 증가합니다(그림 1). 이성질체 비는 1HNMR 스펙트럼에서 별개의 이성질체의 상대적 신호 강도로부터 용이하게 얻어질 수 있다(도 2). 436 nm에서 5일간 조사한 후, 샘플은 1-E의 92%를 함유하는 PSS에 도달한다. 높은 샘플 농도 (10mM)와 광원의 약한 강도로 인해 PSS에 도달하려면 장기간 조사가 필요합니다. 340nm에서의 후속 조사는 E-to-Z 이성체화를 유도하여, 조사 3일 후에 1-Z의 82%를 함유하는 PSS에 도달한다.
더 낮은 샘플 농도 (10 μM)로 인해 UV-Vis 분광법 실험 (436 및 340 nm에서 조사의 경우 각각 10 h 및 4 h)에서 PSS에 도달하려면 더 짧은 조사 시간이 필요합니다. 크로마토그래피에 의해 순수한 이성질체를 분리하거나 광이성체화에 의해 이를 얻는 것이 어렵기 때문에, PSSs에서 1의 UV-Vis 흡수 스펙트럼은 순수한 1-Z 및 1-E의 흡수 스펙트럼을 추론하는데 사용된다(도 4). 흡수 최대치의 파장(λmax, 1-Z의 경우 398 nm, 1-E의 경우 375 nm) 및 몰 감쇠 계수(ε)는 추론된 스펙트럼으로부터 얻을 수 있다. 순수한 이성질체의 UV-Vis 스펙트럼은 불완전한 광이성체화가 역광화학적 과정, 즉 조사 파장에서 흡수 밴드가 겹치는 것에 기인한다는 것을 시사한다.
광이성체화 양자 수율을 결정하기 위해, 열 이완 속도 및 효과적인 몰 광자 플럭스가 먼저 조사된다. 준안정 이성질체 1-E는 실온에서 매우 안정하기 때문에, 열적으로 구동되는 E-to-Z 이성체화는 1H NMR 분광법을 사용하여 고온(131 내지 143°C)에서 모니터링되고, 완화의 1차 속도 상수가 추정된다(도 6). 서로 다른 온도에서 얻어진 속도 상수는 상호 온도 대 플롯팅되고 Arrhenius 방정식(Eq(4))을 사용하여 선형적으로 피팅됩니다(그림 7). 그런 다음 실온에서 열 이완 속도 ((2.2 ± 0.5) × 10-10 s-1)와 1-E (101 ± 24 년)의 반감기를 외삽 할 수 있습니다. 따라서, 실온에서 광이성체화 공정에서 열 이완의 효과를 무시하는 것이 안전하다. 또한 단계 3.11에서 도시된 재배열된 아이어링 방정식(Eq(6))을 사용하여 하나의 속도 상수만 사용 가능한 경우 반감기를 추정할 수 있다.
조사 설정에서 효과적인 몰 광자 플럭스를 결정하기 위해서는 페리옥살레이트 용액 (f)에 의해 흡수 된 빛의 분율을 정확하게 측정해야합니다 (그림 8). 이 프로토콜에는 0.006M 페리옥살레이트 용액이 사용되지만, 낮은 흡광도25로 인해 조사에 >440nm 광을 사용하는 경우 0.15M 용액이 권장됩니다. 일단 f 가 측정되면, 페리옥살레이트 용액은 광환원 실험을 거친다. 조사시, 페리옥살레이트는 철 이온(Fe2+)으로 환원되고, 이는 후속적으로 3개의 페난트롤린 리간드에 의해 배위되어 [Fe(phen)3]2+ 복합체를 형성한다. 광환원 정도는 [Fe(phen)3]2+ 복합체의 흡수를 측정함으로써 얻을 수 있다(도 9). 효과적인 몰 광자 플럭스는 [Fe(phen)3]2+ 복합체의 공지된 몰 감쇠 계수 및 조사 파장에서의 광환원의 양자 수율로부터 계산될 수 있다. 이 실험에 사용된 광원의 조사 전력은 조사된 샘플의 희석 없이 몰광자 플럭스를 계산하기에 충분하다. 조사된 샘플의 흡광도가 1보다 높으면 조사한 후 페리옥살레이트 샘플을 희석해야 합니다.
일단 순수한 이성질체의 효과적인 몰광자 플럭스 및 몰 감쇠 계수가 얻어지면, 이제 광이성체화 양자 수율을 결정할 수 있다. 도 1 의 광이성체화는 방선측정 실험과 동일한 조사 셋업을 사용하여 수행되고 UV-Vis 분광법에 의해 모니터링된다. 광화학적 이성체화는 조사 파장에서 가역적이기 때문에, 전방 및 후진 반응에 대한 개별 양자 수율은 전체 반응 속도에 얽혀 있으며 직접 결정할 수 없다. 따라서 먼저 개별 양자 수율이 나중에 추출되는 조사 파장에서 의사 양자 수율 (Q)을 계산할 필요가 있습니다. 의사 양자 수율은 Eq(14)에 의해 정의되며, 이는 선형 독립적인 Eq(15)를 갖는 두 개의 선형 종속 단계(보충 정보)의 발현을 허용한다.
(14)
(15)
Eq(15)를 사용함으로써, 의사 양자 수율은 그것이 측정되는 관찰된 총 흡광도 및 조사 시간으로부터 얻어질 수 있다(보충 정보에서 Eq.(15)). 소위 광운동 인자라고 불리는 F(t)는 1-Z와 1-E가 모두 조사 파장에서 빛을 흡수할 때 직접 통합될 수 없는 시간 종속 변수이다. 시간 t1과 t2 사이의 조사 간격이 짧을 때, 시간 t1 내지 t2로부터의 F(t)의 적분은 (t2 - t1) {F(t1) + F(t2)}/2에 근사하여 보충 정보에서 Eq(11)를 수득한다(단계 5.7 및 Eq. (27) ). 계산된 의사 양자 수율의 평균화된 값은 436nm에서 43.0± 4.6M-1cm-1 및 340nm에서 20.3M-1cm-1± 405.6이다(표 1).
(11)
ΦZ→E와 ΦE→Z 사이의 수치 관계는 PSS에서의 이성질 비율(보충 정보에서의 Eq.(23))에 기초하여 얻어지고, 마지막으로, 개별 양자 수율은 Eq(12) 및 Eq(13)를 사용하여 결정될 수 있다(단계 5.9).
(12)
(13)
추정된 단방향 광이성체화 양자 수율은 436 nm 조사 하에서 ΦZ→E = 1.3 ± 0.1%, ΦE→Z = 0.6 ± 0.1% 및 ΦZ→E = 2.0 ± 0.1%, ΦE→Z = 4.6 ± 0.2% 조사이다.

그림 1: 빛과 열에 의해 유도되는 히드라존 스위치 1의 E/Z 이성체화. 두 이성질체 1-Z 및 1-E는 서로 다른 파장에서 광조사에 의해 상호 변환됩니다. 메타안정 1-E는 1-Z까지 열적으로 이완될 수 있다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 2: 298.15K에서 DMSO-d 6에서 PSS에 도달하기 위해 (B) 436 nm 또는 (C) 340 nm에서 조사 전후의 1H NMR 스펙트럼. 436 및 340 nm에서의 PSS 조성물은 각각 1-Z의 8 및 82%로 구성된다. 약어: PSS = 광고정 상태. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 3: 광이성체화 및 페리옥살레이트 화학을 위한 실험 설정. 큐벳의 샘플 용액은 대역 통과 필터가 장착 된 Xe 아크 램프 앞에 1cm 배치됩니다. 약어: d = 거리. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

도 4: 1의 UV-Vis 흡수 스펙트럼(DMSO 중 1 × 10-5 M). 청색 및 적색 실선은 각각 436 및 340 nm 조사 하에서 PSSs에서 1의 흡수 스펙트럼을 나타낸다. 파란색과 빨간색 점선은 각각 순수한 1-E 및 1-Z의 추론된 흡수 스펙트럼을 나타냅니다. 약어: PSS = 광고정 상태. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 5: 열 이완 과정을 모니터링하기 위한 실험 설정. 가열 욕조 순환기는 샘플의 가열 동안 온도를 일정하게 유지하는 데 사용됩니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 6: 서로 다른 온도에서 DMSO-d6에서의 1-E 대 가열 시간의 농도 플롯. 다른 온도에서 열 이완의 속도 상수는 플롯에서 얻어집니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

도 7: DMSO-d6에서 1의 열적 E-to-Z 이성체화의 아레니우스 플롯. 선형 적합도의 외삽은 실온에서 1-E의 열 반감기가 101 ± 24 년임을 시사합니다. 약어: k = 열 이완의 속도 상수; T = 온도. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

도 8: 0.05 M 수성H2SO4용액 중 0.006 M 페리옥살레이트에 의한 흡수된 광의 분획. 광조사 파장에서 흡수된 광의 측정된 분획은 페리옥살레이트 액티노메트리에 사용된다. 약어: f = 흡수된 빛의 분율. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

도 9: 조사된 페리옥살레이트 샘플(청색 선: 436 nm에서 조사, 적색 선: 340 nm에서 조사)과 조사되지 않은 페리옥살레이트 샘플 사이의 흡광도 차이. 510 nm에서의 흡광도 차이 (ΔA510) 및 [Fe(phen)3]2+ 복합체 (ε510 = 11100 M-1 cm-1)의 몰 감쇠 계수의 공지된 값은 몰 광자 플럭스를 계산하는데 사용된다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 10: 조사 시 모니터링된 UV-Vis 스펙트럼. (A) 436 nm 및 (B) 340 nm 조사로 조사. (C) 436 nm 및 (D) 340 nm 대 시간에서의 조사 동안 398 nm (순수한 1-Z의 λmax)에서의 흡광도를 플롯한다. 의사 양자 수율의 평균화된 값은 C 및 D의 처음 열 개의 데이터 포인트를 사용하여 얻어진다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
표 1: 조사 파장 하에서 추정된 의사 양자 수율 및 단방향 광이성체화 양자 수율. 이 테이블을 다운로드하려면 여기를 클릭하십시오.
보충 정보: 화합물 1의 이중안정 스위치의 광이성체화 양자 수율 및 특성화를 결정하기 위한 적절한 절차를 선택하는 사용자 가이드. 이 파일을 다운로드하려면 여기를 클릭하십시오.
저자는 이해 상충을 선언하지 않습니다.
광이성체화 양자 수율은 새로 개발된 광스위치의 조사에서 정확하게 결정되어야 하는 기본적인 광물리학적 특성이다. 여기에서, 우리는 모델 이중안정 광스위치로서 광변색 히드라존의 광이성체화 양자 수율을 측정하기 위한 일련의 절차를 설명한다.
이 사업은 2019년 중앙대학교 연구지원금과 한국연구재단(NRF-2020R1C1C1011134)의 지원을 받았다.
| 1,10-phenanthroline | Sigma-Aldrich | 131377-2.5G | |
| 340 nm 대역통과 필터, 25 mm 직경, 10 nm FWHM | Edmund Optics | #65-129 | |
| 436 nm 대역통과 필터, 25 mm 직경, 10 nm FWHM | Edmund Optics | #65-138 | |
| 무수 아세트산나트륨 | Alfa aesar | A13184.30 | |
| Dimethyl sulfoxide | Samchun | D1138 | HPLC 등급 |
| 디메틸 설폭 사이드 -d6 | 시그마 - 알드리치 | 151874-25g | |
| 쌍둥이 자리 2000; 300 MHz NMR 분광계 | Varian | ||
| H 2 < / sub>SO 4 < / sub> | Duksan | 235 | |
| 가열 수조 | JeioTech | CW-05G | |
| MestReNova 14.1.1 | Mestrelab Research SL, https://mestrelab.com/ | ||
| 천연 석영 NMR 튜브 | Norell | S-5-200-QTZ-7 | |
| 포타슘 페리옥살레이트 삼수화물 | Alfa aesar | 31124.06 | |
| 석영 흡수 셀 | Hellma | HE.110.QS10 | |
| UV-VIS 분광 광도계 | Scinco | S-3100 | |
| 크세논 아크 램프 | Thorlabs | SLS205 | 광섬유 어댑터가 제거되었습니다. |