Method Article

하이드로겔 어레이는 3D 종양 모델에서 매트릭스 성분 및 치료제의 스크리닝 효과를 위한 처리량 증가를 가능하게 합니다.

DOI:

10.3791/63791

June 16th, 2022

In This Article

Summary

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본 프로토콜은 맞춤형 UV 조명 장치를 사용하여 3D 매트릭스-모방 배양물에서 환자 유래 교모세포종 세포의 화학요법 반응에 대한 기계적 및 생화학적 단서의 영향을 평가하기 위한 실험 플랫폼을 기술하며, 조정 가능한 기계적 특징을 갖는 하이드로젤의 고처리량 광가교를 용이하게 한다.

Abstract

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세포 - 매트릭스 상호 작용은 생화학적, 기계적, 기하학적 단서를 통해 복잡한 생리 학적 과정을 중재하여 병리학 적 변화와 치료 반응에 영향을 미칩니다. 약물 개발 파이프라인 초기에 매트릭스 효과를 고려하면 새로운 치료제의 임상 성공 가능성이 높아질 것으로 예상된다. 3D 세포 배양에서 특정 조직 미세 환경을 재순환시키는 생체 재료 기반 전략은 존재하지만 이를 약물 스크리닝에 주로 사용되는 2D 배양 방법과 통합하는 것은 어려운 과제였습니다. 따라서, 여기에 제시된 프로토콜은 세포 생존을 위한 기존 약물 스크리닝 파이프라인 및 종래의 분석과의 통합을 용이하게 하기 위해 다중 웰 플레이트 포맷으로 소형화된 생체재료 매트릭스 내에서 3D 배양을 위한 방법의 개발을 상세히 기술한다. 배양된 세포에서 임상적으로 관련된 표현형을 보존하는데 중요한 매트릭스 특징이 고도로 조직- 및 질병-특이적일 것으로 예상되기 때문에, 매트릭스 파라미터의 조합 스크리닝은 특정 적용을 위한 적절한 조건을 식별하기 위해 필요할 것이다. 여기에 설명된 방법들은 매트릭스 역학 및 리간드 프리젠테이션의 직교 변이에 대한 암 세포 반응을 평가하기 위해 소형화된 배양 포맷을 사용한다. 구체적으로, 본 연구는 화학요법에 대한 환자 유래 교모세포종 (GBM) 세포의 반응에 대한 매트릭스 파라미터의 효과를 조사하기 위해 이 플랫폼의 사용을 입증한다.

Introduction

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신약 개발의 예상 비용은 지난 10 년 동안 꾸준히 상승했으며 현재 추정치에서 10 억 달러 이상이었습니다 1. 이 비용의 일부는 임상 시험에 들어가는 약물의 높은 실패율입니다. 약물 후보의 약 12 %는 궁극적으로 2019 년 미국 (미국) 식품 의약품 안전청 (FDA)의 승인을 얻습니다. 많은 약물이 예기치 않은 독성2로 인해 I 단계에서 실패하는 반면, 안전성 시험을 통과 한 다른 약물은 효능 부족으로 인해 실패 할 수 있습니다3. 비효능으로 인한 이러한 감소는 약물 개발 동안 사용되는 암 모델이 임상적 효능의 비예측으로 악명 높다는 사실에 의해 부분적으로 설명될 수 있다4.

시험관내 및 생체내 모델 사이의 기능적 불균형은 비종양 세포 및 물리적 ECM 5,6을 포함하는 그들의 천연 미세환경으로부터 암 세포를 제거하는 것에 기인할 수 있다. 일반적으로 연구 그룹은 Matrigel (마우스 육종에서 유래 한 단백질성 기저막 매트릭스)과....

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Protocol

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환자 유래 GBM 세포주 (GS122 및 GS304)는 UCLA 기관 검토 위원회 (IRB # 10-000655)가 승인 한 프로토콜에 따라이 라인을 개발 한 David Nathanson 교수 (공동 작업자)에 의해 제공되었습니다. 세포주가 개별 환자와 다시 연결될 수 없도록 비확인 세포를 제공하였다.

1. 하이드로겔 용액의 제조

  1. 행크의 균형 잡힌 소금 용액 (HBSS)에 HEPES 분말을 20mM로 용해시켜 HEPES 완충 용액을 준비하십시오. 완전 용매화 후 pH를 7로 조정한다.
  2. HEPES 완충 용액에서, 티올화된 HA (700 kDa 공칭 분자량, 물질 표 참조)를 이전 보고서31에 따라 제조하여 각 글루쿠론산의 카르복실산 잔기의 6 % -8 %가 완충 용액 중 10 mg / mL의 농도로 티올로 변형되도록합니다.
    참고: 주변광에 의한 티올 산화를 방지하기 위해 호박색 바이알을 사용하는 것이 좋습니다.
    1. 자석 교반 플레이트 (<1,000 rpm)를 사용하여 완전히 용해 될 때까지 실온에서 교반하십시오, 전형적으로 약 45 분.
  3. HA가 용해되....

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Results

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AFM 측정은 맞춤형 Arduino 제어 LED 어레이를 사용하여 광가교 중에 UV 조도(mW/cm2)의 함수로서 하이드로겔 역학의 정밀한 제어를 확인했다(그림 2A). 이 프로토콜에 사용된 하이드로겔 제형은 표 2에서 확인할 수 있다. 제공된 템플릿에 있는 LED의 간격은 384웰 플레이트의 다른 모든 웰의 간격과 일치하므로 플레이트 내부에 젤을 형성할 수 있습니다(그림 2B). 단일 하이드로젤의 표면에서 미크론 스케일 영역에 대한 AFM 심문은 더 부드러운 평균 영 모듈리를 갖는 하이드로젤이 또한 더 뻣뻣한 하이드로젤보다 더 작은 모듈리 범위를 갖는다는 것을 보여주었다(도 2C-E).

생존력을 극대화하는 세포.......

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Discussion

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현재의 연구는 HA 기반 내에서 3D, 소형화 된 배양물을 생성하는 동시에 인테그린 결합에 사용할 수있는 매트릭스 강성과 펩타이드를 변경하는 방법을 제시합니다. 이 기술은 매트릭스 파라미터가 증가된 처리량으로 세포 표현형(예를 들어, 화학요법에 노출된 암 세포의 생존력)에 어떻게 영향을 미치는지에 대한 체계적인 연구를 가능하게 한다. 본원에 제시된 것을 포함하는 이전의 접근법들은 최종 제형 내의 전체 중합체 퍼센트를 변화시킴으로써 조정된 히드로겔 강성을 가지며, 여기서 더 뻣뻣한 히드로겔은 더 높은 중합체 함량21,31을 갖는다. 그러나, 이러한 접근법은 본질적으로 처리량을 낮추는 과정인 원하는 각각의 강성에 대해 독특한 하이드로겔 제형을 제조할 필요가 있다. 여기서, 하이드로겔 강성은 가교 동안 UV 조도를 변화시킴으로써 조정되어, 다중 강성의 하이드로겔이 단일 전구체 용액으로부터 얻어질 수 있다. 여기에 설명된 맞춤형 조.......

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Disclosures

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저자는 공개 할 것이 없습니다.

Acknowledgements

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저자들은 Carolyn Kim, Amelia Lao, Ryan Stoutamore, Itay Solomon이 포토겔화 계획의 초기 반복에 기여한 것에 대해 구체적으로 인정하고 싶습니다. 세포주 GS122 및 GS304는 데이비드 네이선슨에 의해 관대하게 제공되었다. 모든 인물은 BioRender.com 로 만들어졌습니다. UCLA 핵심 시설, 분자 스크리닝 공유 자원 및 나노 및 피코 특성화 실험실이이 작업에 도움이되었습니다. Chen Chia-Chun은 UCLA Eli와 Edythe Broad Center of Regenerative Medicine and Stem Cell Research Training Program의 지원을 받았습니다. Grigor Varuzhanyan은 종양 세포 생물학 교육 프로그램 NIH 그랜트 (T32 CA 009056)의 지원을 받았다.

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Materials

List of materials used in this article
NameCompanyCatalog NumberComments
1.1 kOhm 저항기, 6 WDigikey35601k1ft
1.7 mL 마이크로 원심분리기 튜브Genesse Scientific21-108
15 mL 원뿔형 튜브Fisher Scientific14-959-70C
365 nm LEDDigikeyltpl-c034uvh365
384 웰 플레이트Bio Greiner One781090
40 µ m 세포 여과기MTC bioC4040
4-Armed thiol 말단 폴리에틸렌 글리콜 (20 kDa)Laysan Bio4arm-PEG-SH-20K-1g
6 NPN BJTsDigikey2n5550ta
80 Ohm resistors, 0.125 WDigikeyerjj-6enf80r6v
8-Armed norbornene 말단 폴리에틸렌 글리콜 (20 kDa)Jenkem TechnologyA7025-1
Accutase혁신적인 세포 기술AT104500  세포 해리  시약
AFM 프로브Novascan0.01 N / m 공칭 스프링 상수, 2.5 µ m SiO2 입자
Arduino IDEArduino1.8.19
Arduino NanoMakerfireMini Nano V3.0 ATmega328P 마이크로컨트롤러 보드
bFGFPeprotech100-18B20 ng/mL
CCK8Abcamab228554
원심분리기Thermoscientificsorvall legend xtr
CP100STGilsonF148415간접 변위 피펫 팁
Cubis Semi-Micro BalanceSartoriusMSA225S100DI
DMEM - F12 (50-50)Life Technologies113300571x
DMSO Fisher ScientificBP231-100
DPBS Ca (-) Mg (-)Genesse Scientific25-508
EGFPeprotechAF100-1550ng/mL
에탄올, 무수Fisher ScientificA405PDI 물을 추가하여 70%로 희석
Fisherbrand Class B Amber Glass 나사산 바이알Fisher Scientific03-339-23C
Fisherbrand 계량 종이Fisher Scientific09-898-12B
G21 보충제Gemini Bio400-16050x
Hanks Balanced Salt SolutionThermo Fisher Scientific14175095
HCl, ACS, 12MSigma AldrichS25838A으로 희석하기 위해 DI 물을 첨가
Sigma AldrichH3149-100Ku25 µ g/mL
HEPES시그마 AldrichH7006-100G
열풍 총WagnerHT1000
Integrin 결합 시알로단백질(IBSP) 펩타이드Genscript맞춤 주문GCGYGGGGNGEPRGDTYRAY
리튬 페닐-2,4,6 트리메틸벤조일포스피네이트(LAP), >95%시그마 Aldrich900889-1G
자기 교반 플레이트열 ScientificSP194715
MicrocentrifugeThermo ScientificSorvall legend micro 21R
Microman E single Channel PipettorGilsonFD10004Positive displacement
pipette Micropipette TipsVarious ManufactursVarious sizes
mLine micropipetteSartorious
N-acetyl CysteineSigma AldrichA7250-10G
Nanowizard 4BrukerAFM 현미경
NaOHFisher Scientificss255-1DI 물을 추가하여 1M
NormoicinInvivogenant-nr-1500x
Osteopontin 펩타이드Genscript맞춤 주문GCGYGTVDVPDGRGDSLAYG
피펫 에이드드러먼드4000102
일반 현미경 슬라이드Globe Scientific1301
Press-To-Seal 실리콘 절연체, 12-4.5mm 직경 x 2mm 깊이Grace Bio Labs664201-A단일 시트에서 8개의 개별 금형을 만들도록 절단
처리처리 3.5.4
리피터 M4Eppendorf4982000322
리피터 피펫 팁Sartorious300894301 mL 크기
RGD 펩타이드GenscriptGCGYGRGDSPG
Scoth 테이프
혈청학 피펫Genesse Scientific12-102,12-1045,10 mL 피펫
솔더 페이스트Digikey315-NC191LT15T5-ND
솔더 와이어
스트레이트 해부 겸VWR Scientific82027-408
Synergy H1 플레이트 리더Biotek
T-75 세포 배양 처리 플라스크Genesee Scientific25-209
TemozolomideSigma AldrichT2577일반적으로 10 µ에서 사용됩니다. M에서 100 & 마이크로; M
Tenascin-C 펩타이드GenscriptGCGYGRSTDLPGLKAATHYTITIR
GV
티올 화 히알루론산(700kDa), 6-8% 변형Lifecore BiomedicalHA700K5
VWR Spinbar, Flea MicroVWR58948-375
돼지 장 점막에서 1M 헤파린 나트륨 염자

References

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$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
  1. Scannell, J. W., Blanckley, A., Boldon, H., Warrington, B. Diagnosing the decline in pharmaceutical R&D efficiency. Nature Reviews Drug Discovery. 11 (3), 191-200 (2012).
  2. Waring, M. J., et al. An analysis of the attrition of drug....

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