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방법 논문

유전자 치료 애플리케이션을 위한 조혈 줄기 및 전구 세포의 CRISPR/Cas9 유전자 편집

3.8K 조회수

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DOI:

10.3791/64064

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2022년 8월 9일

* These authors contributed equally

이 논문에서

요약

본 프로토콜은 생체 내에서 유전자 편집 세포의 강력한 생착을 위한 최적화된 조혈 줄기 및 전구 세포(HSPC) 배양 절차를 설명합니다.

초록

CRISPR/Cas9는 다양한 유전적 돌연변이를 교정하기 위해 널리 채택된 매우 다재다능하고 효율적인 유전자 편집 도구입니다. 시험관 내에서 조혈 줄기 및 전구 세포 (HSPC)의 유전자 조작의 타당성은 HSPC를 유전자 치료를위한 이상적인 표적 세포로 만듭니다. 그러나 HSPC는 생체 외 배양에서 생착 및 다중 계통 재 집단 잠재력을 적당히 잃습니다. 본 연구에서, HSPC 생착을 개선하고 생체내에서 증가된 수의 유전자-변형 세포를 생성하는 이상적인 배양 조건이 기술된다. 현재 보고서는 배양 배지 유형, 고유한 저분자 칵테일 보충제, 사이토카인 농도, 세포 배양 플레이트 및 배양 밀도를 포함하여 최적화된 체외 배양 조건을 표시합니다. 그 외에도 유전자 편집 이벤트의 검증과 함께 최적화된 HSPC 유전자 편집 절차가 제공됩니다. 생체내 검증을 위해, 마우스 수용자에서의 유전자 편집된 HSPC 주입 및 생착 후 분석이 표시된다. 결과는 배양 시스템이 시험관 내에서 기능성 HSC의 빈도를 증가시켜 생체 내에서 유전자 편집 세포의 강력한 생착을 초래한다는 것을 입증했습니다.

서론

동종 이식 환경에서 인간 백혈구 항원(HLA)과 일치하는 기증자에 접근할 수 없고 매우 다재다능하고 안전한 유전 공학 도구의 급속한 개발로 인해 자가 조혈모세포 이식(HSCT)은 유전성혈액 질환에 대한 치료 전략이 되었습니다1,2. 자가 조혈 줄기 및 전구 세포 (HSPC) 유전자 치료는 환자의 HSPC 수집, 유전자 조작, 질병 유발 돌연변이의 교정 및 유전자 교정 된 HSPC를 환자에게 이식하는 것을 포함합니다 3,4. 그러나 유전자 치료의 성공적인 결과는 이식 가능한 유전자 변형 이식편의 품질에 달려 있습니다. HSPC의 유전자 조작 단계 및 생체 외 배양은 장기 조혈 줄기 세포 (LT-HSC)의 빈도를 감소시켜 이식편의 품질에 영향을 미치므로 유전자 조작 HSPC 2,5,6을 다량 주입해야합니다.

SR1 및 UM171을 포함한 여러 소분자가 현재 ....

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프로토콜

면역결핍 마우스에 대한 생체내 실험은 인도 벨로르에 있는 크리스천 의과 대학의 동물 윤리 위원회(IAEC) 연구소의 지침에 따라 승인되고 수행되었습니다. 과립구 콜로니 자극 인자 (G-CSF) 동원 된 말초 혈액 샘플은 기관 검토위원회 (IRB) 승인을 얻은 후 정보에 입각 한 동의하에 건강한 인간 기증자로부터 수집되었습니다.

1. 말초 혈액 단핵 세포 (PBMNC)의 분리 및 CD34 + 세포의 정제

  1. 아래 단계에 따라 PBMNC 격리를 수행하십시오.
    참고: 체외 HSPC 배양 및 유전자 편집의 경우 최소 1 x 106 HSPC/그룹으로 시작하는 것이 이상적입니다. 생체 내 생착 분석의 경우, 그룹에 8 마리의 마우스가 포함되고 각 마우스에 최소 6 x 10 5 개의 세포가 주입 된 경우 최소5 x 106 HSPC / 그룹의 시작 세포 수가 이상적입니다. 시술에 충분한 수의 PBMNC (~ 1 x 109)를 얻으려면 20mL의 동원 된 말초 혈액 (mPB)으로 시작하는 것이 좋습니다.
    1. mPB 수집 후 20mL의 mPB를 멸균 1x 인....

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결과

본 연구는 생체 외 배양에서 CD34+CD133+CD90+ HSC의 보유를 용이하게 하는 이상적인 HSPC 배양 조건을 식별합니다. 유전자 변형 HSC의 향상된 생성과 함께 HSC의 배양 농축을 입증하기 위해 PBMNC 분리, CD34+ 세포 정제, 배양, 유전자 편집, 이식, 생착 특성화 및 생체 내 유전자 변형 세포를 위한 최적화된 절차가 제공됩니다(그림 1). 정제 후, HSPC 마커를 확인하기 위해 유세포 분석 평가를 수행하고, HSPC를 72시간 동안 배양하였다. 배양 72시간 후, HSPC를 Cas9 RNP로 핵핵화하고 추가로 2일 동안 배양하였다. RUS 칵테일을 함유한 최적화된 배양 조건은 CD34+CD133+CD90+ HSC의 생존력 증가와 더 높은 빈도 및 유전자 편집 빈도 증가를 보여주었습.......

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토론

HSPC 유전자 치료의 성공적인 결과는 주로 이식편에서 생착 가능한 HSC의 품질과 양에 달려 있습니다. 그러나 HSC의 기능적 특성은 체외 배양 및 유전자 조작 절차와 관련된 독성을 포함하여 유전자 치료 제품의 준비 단계에서 크게 영향을받습니다. 이러한 한계를 극복하기 위해 우리는 생체 외 배양에서 CD34+CD133+CD90+ HSC의 줄기를 유지하는 이상적인 HSPC 배양 조건을 확인했습니다. 많은 연구 그룹은 시험관 내23,24에서 제대혈(UCB) HSPC를 확장하기 위해 SR1 또는 UM171 또는 기타 분자를 독립형 분자로 사용했습니다. 이전 연구에서는 SR1과 UM17125의 조합을 사용했습니다. 배양 배지의 소분자 및 사이토카인은 동원된 성인 HSPC 및 자가 유.......

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공개 사항

저자는 경쟁하는 재정적 이익이 존재하지 않는다고 선언합니다.

감사의 글

저자는 CSCR의 유세포 분석 시설 및 동물 시설의 직원을 인정하고자합니다. A. C.는 ICMR-SRF 펠로우십, K. V. K.는 DST-INSPIRE 펠로우십, PB는 CSIR-JRF 펠로우십에서 자금을 지원합니다. 이 작업은 인도 정부 생명공학부(보조금 번호 BT/PR26901/MED/31/377/2017 및 BT/PR31616/MED/31/408/2019)에서 자금을 지원했습니다.

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재료

이 논문에 사용된 재료 목록
이름회사카탈로그 번호댓글
4D-핵세포® X 유닛LONZA BIOSCIENCEAAF-1003X
4D-핵융합기&거래; X Kit ( 16-well Nucleocuvette™ 스트립)LONZA BIOSCIENCEV4XP-3032
Antibiotic-Antimycotic (100X)THERMO SCIENTIFIC15240096
Anti-human CD45 APCBD BIOSCIENCE 555485 
반인간 CD13 PEBD BIOSCIENCE
반인간 CD19 PerCPBD BIOSCIENCE
반인간 CD3 PE-Cy7BD BIOSCIENCE557749
반인간 CD90 APCBD BIOSCIENCE
반인간 CD133/1 Miltenyibiotec130-113-673
안티-휴먼 CD34 PEBD BIOSCIENCE
안티-마우스 CD45.1 PerCP-Cy5BD BIOSCIENCE560580
혈액 방사선기-2000  BRIT (인도 생명공학과)BI 2000 
세포 배양 접시 (델타 표면 처리 6웰 플레이트)NUNC (THERMO SCIENTIFIC)
CrysoStor CS10BioLife solutions#07952
BusulfanCELON LABS (60mg/10mL)- 
Guide-it 재조합 Cas9TAKARA BIO632640
Cas9-eGFPSIGMAC120040 
  원심분리기 튜브-15ml코닝430790
  원심분리기 튜브-50mlNUNC (THERMO SCIENTIFIC)
DMSOMPBIO219605590
DNAaseSTEMCELL TECHNOLOGIES6469
Dulbecco′ s 인산염 완충 식염수- 1XHYCLONESH30028.02
EasySep™ Human CD34 Positive Selection Kit IISTEMCELL TECHNOLOGIES17856
EasySep 자석STEMCELL TECHNOLOGIES18000
전기영동 유닛ORANGE INDIAHDS0036
FBSTHERMO SCIENTIFIC
유세포 분석기 – ARIA IIIBD 바이오사이언스- 
플로우조 BD BIOSCIENCE -
Flt3-LPEPROTECH300-19-1000
겔 이미징 시스템CELL BIOSCIENCES11630453
HighPrep DTR 시약MAGBIOGENOMICSDT-70005
Human BD Fc BlockBD BIOSCIENCE553141
IL6PEPROTECH200-06-50
IMDM 매체THERMO SCIENTIFIC12440053
적외선 램프MURPHY-
인슐린 주사기 6mm 31GBD BIOSCIENCE
케타민KETMIN 50-
로딩 염료 6XTAKARA BIO9156
림프렙STEMCELL TECHNOLOGIES7851
마우스 레스트레이너AVANTORTV-150
나노 드롭 분광 광도계THERMO SCIENTIFICND-2000C
Neubauer 세포 계수 챔버ROHEM INSTRUMENTSCC-3073
NOD. Cg-PRKDCSCID IL2RGTM1Wjl/SzJ (NSG)잭슨 연구소RRID:IMSR_JAX:005557
NOD,B6. SCID Il2rγ &빼기;/&빼기; KitW41/W41 (NBSGW)The Jackson LaboratoryRRID:IMSR_JAX:026622
Nunc 델타 6웰 플레이트THERMO SCIENTIFIC140675
폴리스티렌 라운드 바텀 튜브BD352008
P3 일차 세포 핵 절제 용액LONZA BIOSCIENCEPBP3-02250
파스퇴르 피펫FISHER SCIENTIFIC13-678-20A
PCR 클린업 키트TAKARA BIO740609.25
마우스 파이 케이지FISCHER SCIENTIFIC50-195-5140
폴리스티렌 둥근 바닥 튜브 (12 x 75 mm)STEMCELL TECHNOLOGIES38007
Primer3Whitehead Institute for Biomedical Researchhttps://primer3.ut.ee/
퀵추출&트레이드; DNA 추출 솔루션LucigenQE09050
ReserveratrolSTEMCELL TECHNOLOGIES72862
SCFPEPROTECH300-07-1000
SFEM-IISTEMCELL TECHNOLOGIES9655
sgRNASYNTHEGO- 
SPINWINTARSON1020
StemReginin 1STEMCELL TECHNOLOGIES72342
ICE 분석 도구SYNTHEGOa href="https://ice.synthego.com/">https://ice.synthego.com/
Tris-EDTA 버퍼 용액 (TE) 1XSYNTHEGOgRNA와 함께 제공 
ThermocyclerAPPLIED BIOSYSTEMS4375305
TPOPEPROTECH300-18-1000
Trypan blueHIMEDIA LABSTCL046
UM171STEMCELL TECHNOLOGIES72914
UM729STEMCELL TECHNOLOGIES72332
XylazineXYLAXIN - INDIAN IMMUNOLOGICALS LIMITED-
555394 340421 561971 348057 140675 339652 10270106 324903 <

참고문헌

  1. Staal, F. J. T., Aiuti, A., Cavazzana, M. Autologous stem-cell-based gene therapy for inherited disorders: State of the art and perspectives. Frontiers in Pediatrics. 7, 443(2019).
  2. Naldini, L. G....

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