본 프로토콜은 생체적합성 리포솜을 생성하기 위한 미세유체 기술인 옥탄올 보조 리포솜 어셈블리(OLA)를 설명합니다. OLA는 효율적인 캡슐화를 통해 단분산 미크론 크기의 리포솜을 생산하여 즉각적인 온칩 실험이 가능합니다. 이 프로토콜은 합성 생물학 및 합성 세포 연구에 특히 적합할 것으로 예상됩니다.
방법 논문
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본 프로토콜은 생체적합성 리포솜을 생성하기 위한 미세유체 기술인 옥탄올 보조 리포솜 어셈블리(OLA)를 설명합니다. OLA는 효율적인 캡슐화를 통해 단분산 미크론 크기의 리포솜을 생산하여 즉각적인 온칩 실험이 가능합니다. 이 프로토콜은 합성 생물학 및 합성 세포 연구에 특히 적합할 것으로 예상됩니다.
Microfluidics는 제어되고 높은 처리량 방식으로 다양한 종류의 액적과 소포를 생성하는 데 널리 사용되는 도구입니다. 리포솜은 지질 이중층으로 둘러싸인 수성 내부로 구성된 단순한 세포 모조물입니다. 이들은 합성 세포를 설계하고 체외 방식으로 생물학적 세포의 기초를 이해하는 데 유용하며 치료 응용 분야를 위한 화물 운송과 같은 응용 과학에 중요합니다. 이 기사에서는 단분산, 미크론 크기, 생체 적합성 리포솜을 생산하기 위한 온칩 미세유체 기술인 옥탄올 보조 리포솜 어셈블리(OLA)에 대한 자세한 작업 프로토콜에 대해 설명합니다. OLA는 내부 수성(IA) 상과 주변 지질 운반 1-옥탄올 상이 계면활성제 함유 외부 유체 흐름에 의해 끼워지는 버블 블로잉과 유사하게 기능합니다. 이것은 돌출된 옥탄올 포켓이 있는 이중 에멀젼 방울을 쉽게 생성합니다. 지질 이중층이 액적 계면에서 조립됨에 따라 포켓이 자발적으로 분리되어 추가 조작 및 실험이 가능한 단일 라멜라 리포솜이 생성됩니다. OLA는 꾸준한 리포솜 생성(>10Hz), 생체 재료의 효율적인 캡슐화, 단분산 리포솜 모집단과 같은 몇 가지 이점을 제공하며 매우 적은 양의 샘플(~50μL)이 필요하므로 귀중한 생물학적 제제로 작업할 때 중요할 수 있습니다. 이 연구에는 실험실에서 OLA 기술을 확립하는 데 필요한 미세 가공, 소프트 리소그래피 및 표면 패시베이션에 대한 세부 정보가 포함되어 있습니다. 원리 증명 합성 생물학 응용 프로그램은 막횡단 양성자 플럭스를 통해 리포솜 내부에 생체 분자 응축물의 형성을 유도함으로써 보여집니다. 이 함께 제공되는 비디오 프로토콜은 독자가 실험실에서 OLA를 설정하고 문제를 해결하는 데 도움이 될 것으로 예상됩니다.
모든 세포는 물리적 경계로서 원형질막을 가지고 있으며, 이 막은 본질적으로 양친매성 지질 분자의 자가 조립에 의해 형성된 지질 이중층 형태의 스캐폴드입니다. 리포솜은 생물학적 세포의 최소 합성 대응물입니다. 그들은 인지질로 둘러싸인 수성 루멘을 가지고 있으며, 이는 친수성 헤드 그룹이 수성 상을 향하고 소수성 꼬리가 안쪽으로 묻혀있는 지질 이중층을 형성합니다. 리포솜의 안정성은 소수성 효과뿐만 아니라 극성기 사이의 친수성, 소수성 탄소 꼬리 사이의 반 데르 발스 힘, 물 분자와 친수성 헤드 사이의 수소 결합 1,2에 의해 결정됩니다. 지질 이중층의 수에 따라, 리포솜은 두 가지 주요 범주, 즉 단일 이중층을 포함하는 단층 소포 및 다중 이중층으로 구성된 다층 소포로 분류될 수 있습니다. Unilamellar 소포는 크기에 따라 추가로 분류됩니다. 일반적으로 구형이며 작은 단층 소포(SUV, 직경 30-100nm), 큰 단층 소포(LUV, 직경 100-1,000nm), 마지막으로 거대 단층 소포(GUV, 직경 >1,000nm)3,4. 리포좀을 생산하기 위해 다양한 기술이 개발되었으며, 이들은 크게 벌크 기술5과 미세유체 기술6로 분류할 수 있다. 일반적으로 실행되는 벌크 기술에는 지질 필름 재수화, 전기 형성, 도립 에멀젼 전사 및 압출 7,8,9,10이 포함됩니다. 이러한 기술은 비교적 간단하고 효과적이며 합성 생물학 커뮤니티에서 널리 사용되는 주된 이유입니다. 그러나, 동시에, 이들은 크기의 다분산성, 층상에 대한 제어의 결여, 및 낮은 캡슐화 효율 7,11과 관련하여 주요한 단점을 안고 있다. 연속 액적 계면 교차 캡슐화(cDICE)12 및 액적 촬영 및 크기 여과(DSSF)13와 같은 기술은 이러한 한계를 어느 정도 극복합니다.
미세 유체 접근법은 지난 10년 동안 두각을 나타내고 있습니다. 미세 유체 기술은 특징적인 층류 및 확산 지배적 인 물질 전달로 인해 사용자 정의 마이크로 채널 내에서 유체 흐름을 조작하기위한 제어 가능한 환경을 제공합니다. 그 결과 랩온어칩(lab-on-a-chip) 장치는 분자의 시공간 제어를 위한 고유한 가능성을 제공하며, 시료 부피를 크게 줄이고 다중화 기능을 제공합니다(14). 리포좀을 만들기 위한 수많은 미세유체 방법들이 개발되었는데, 펄스 분사(pulsed jetting)15, 이중 에멀젼 템플릿(double emulsion templating)16, 일시적인 막 분출(transient membrane ejection)17, 액적 에멀젼 전달(droplet emulsion transfer)18, 유체역학적 포커싱(hydrodynamic focusing)19 등이 있다. 이러한 기술은 높은 캡슐화 효율과 높은 처리량을 가진 단분산, 단층, 세포 크기의 리포솜을 생산합니다.
이 기사에서는 유체역학적 핀치 오프 및 후속 용매 탈습윤 메커니즘20을 기반으로 하는 온칩 미세유체 방법인 옥탄올 보조 리포솜 어셈블리(OLA)에 대한 절차를 자세히 설명합니다(그림 1). OLA의 작동을 버블 블로잉 프로세스와 관련시킬 수 있습니다. 6방향 접합부는 내부 수성(IA) 상, 2개의 지질 운반 유기(LO) 스트림 및 2개의 계면활성제 함유 외부 수성(OA) 스트림을 단일 지점에 집중시킵니다. 그 결과 수중수(지질 + 옥탄올)수중 이중 에멀젼 방울이 생성됩니다. 이러한 액적이 하류로 흐를 때 계면 에너지 최소화, 외부 전단 흐름 및 채널 벽과의 상호 작용으로 인해 용매 포켓이 분리되어 단층 리포솜이 형성됨에 따라 계면에 지질 이중층이 형성됩니다. 옥탄올 포켓의 크기에 따라 디웨팅 과정은 수십 초에서 몇 분이 소요될 수 있습니다. 출구 채널의 끝에서 밀도가 낮은 옥탄올 방울이 표면으로 떠오르는 반면, 더 무거운 리포솜(더 조밀한 캡슐화 용액으로 인해)은 실험 준비가 된 시각화 챔버의 바닥으로 가라앉습니다. 대표적인 실험으로 리포좀 내부의 액체-액체 상분리(LLPS) 과정을 시연합니다. 이를 위해 필요한 성분은 LLPS를 방지하는 산성 pH에서 리포솜 내부에 캡슐화됩니다. 외부에서 pH 변화를 유발하여 막횡단 양성자 플럭스를 유발함으로써 리포솜 내부에 상분리된 응축물 방울이 형성됩니다. 이것은 OLA 시스템의 효과적인 캡슐화 및 조작 기능을 강조합니다.
1. 마스터 웨이퍼 제작
2. 미세유체 소자 준비
3. PDMS 코팅 유리 슬라이드 만들기
4. 미세유체 소자의 접합
5. 미세 유체 장치의 표면 기능화
알림: 표면 기능화에 앞서 제조업체의 프로토콜( 재료 표 참조)에 따라 압력 펌프를 보정하고 튜브를 조립하여 미세 유체 장치에 연결하는 것이 중요합니다.
6. 옥탄올 보조 리포솜 어셈블리(OLA)
본 연구는 대표적인 실험으로 리포좀 내부의 액체-액체 상분리(LLPS) 과정을 통해 멤브레인을 사용하지 않는 응축수를 형성하는 것을 보여줍니다.
시료 전처리
IA, OA, ES 및 사료 용액(FS)은 다음과 같이 준비됩니다.
IA: 12% 글리세롤, 5mM 덱스트란, 150mM KCl, 5mg/mL 폴리-L-라이신(PLL), 0.05mg/mL 폴리-L-라이신-FITC 표지(PLL-FITC), 8mM 아데노신 삼인산(ATP), 15mM 구연산염-HCl(pH 4)
OA: 12% v/v 글리세롤, 5% w/v F68, 150mM KCl, 15mM 구연산염-HCl(pH 4)
ES: 12% 글리세롤, 150mM KCl, 15mM 구연산염-HCl(pH 4)
FS: 12% 글리세롤, 150mM KCl, 75mM Tris-HCl(pH 9)
리포솜 내부의 응축수 형성
리포솜에서 LLPS의 현상을 입증하기 위해 양전하를 띤 폴리-L-라이신(PLL)과 음전하를 띤 다가 아데노신 삼인산(ATP)의 pH 민감성 복합 코아세르베이션의 간단한 분석이 선택되었습니다. 캡슐화 동안 폴리리신과 ATP의 상 분리를 방지하기 위해, 용액의 pH를 4로 유지하였고, 여기서 ATP는 중성이다. FS(pH 9의 완충액)를 첨가하여 ES의 pH를 증가시키면 막횡단 양성자 플럭스로 인해 리포솜 내부의 pH가 증가하여 ATP가 음전하를 띠고 양전하를 띤 PLL21로 상 분리가 촉발됩니다(그림 4A). 리포솜 생성의 약 2시간 후, IA 및 LO 압력이 꺼졌습니다. OA 채널 압력을 100 mbar로 유지하여 나머지 리포좀을 관찰 챔버 내로 천천히 흘려보냈다. 채널의 모든 리포솜이 EW에서 회수되면 흐름을 멈추고 리포솜이 움직이는 것을 방지하기 위해 압력을 차단했습니다. 더 낮은 pH에서 생성된 리포솜은 루멘에서 균일한 형광(캡슐화된 형광 PLL-FITC로부터)을 나타냈습니다(그림 4B, D). 표면에 떠 있는 옥탄올 방울은 추가 피펫팅 단계에 영향을 미치지 않도록 상단에서 5μL의 용액을 조심스럽게 피펫팅하여 제거했습니다. 이어서, 10 μL의 FS 완충액을 EW에 첨가하여, 캡슐화된 PLL 및 ATP의 상 분리를 유도하였다. 각 리포솜의 균일한 FITC 형광은 점차 뚜렷한 형광 축합물 방울로 변환됩니다. 결국, 개별 방울은 리포솜 내에서 자유롭게 확산되는 하나의 더 큰 응축수 방울로 병합되었습니다(그림 4C, E-G).

그림 1: OLA의 조립 및 작동을 보여주는 개략도. 압력 컨트롤러는 외부 수성, 옥탄올 내 지질 및 내부 수용액을 포함하는 저장소에 연결됩니다. 저장소에 삽입된 튜브는 OLA 장치의 각 입구에 연결됩니다. 3 개의 채널에서의 적절한 흐름은 물 중수 (지질 옥탄올) - 수중 이중 에멀젼의 형성을 유도한다. 형성된 이중 에멀젼은 출구 웰로 이동하며, 그 동안 옥탄올 포켓이 분리되어 리포솜을 형성합니다. 형성된 리포솜은 시각화 및 추가 실험을 위해 우물 바닥에 수집됩니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 2: OLA 칩의 준비(포토리소그래피, 미세 가공, 표면 처리). (A) 3개의 입구, 출구 및 6방향 생산 접합부를 포함하여 OLA 설계의 주요 기능을 보여주는 디지털 설계. (B) UV 리소그래피를 사용하여 생성된 여러 OLA 설계를 보여주는 마스터 웨이퍼의 개략도. (c) 마스터 웨이퍼 상에 캐스팅된 PDMS 엘라스토머를 알루미늄 호일로 만들어진 웰에 넣고, 70°C에서 2시간 동안 베이킹함으로써 경화시킨다. (D) 산소 플라즈마 처리를 사용하여 접합된 미세유체 소자로서, OLA 디자인을 포함하는 PDMS 블록이 PDMS-코팅된 유리 슬라이드에 부착된다. (e) 소자를 부분적으로 친수성으로 만들기 위해 제조된 칩의 표면 기능화. 이것은 외부 수성 채널에서 출구 채널을 향해 5분 동안 5% w/v PVA를 흐르게 함으로써 수행됩니다. 다른 채널의 양압은 PVA 용액이 이러한 채널로 들어가는 것을 방지합니다. (f) 출구 채널에 진공을 가하여 PVA를 제거합니다. 장치를 120°C에서 15분 동안 구운 다음 사용할 준비가 됩니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 3: OLA가 단분산 이중 에멀젼을 효율적으로 생산하고 궁극적으로 캡슐화가 우수한 리포솜을 생산한다는 것을 보여줍니다. (A) 이중 에멀젼 방울의 빠른 생성을 보여주는 명시야 이미지. (B) 형광 지질 채널은 부분적인 탈습윤으로 인한 옥탄올 포켓의 형성을 보여줍니다. 옥탄올 내 지질상은 DOPC(5mg/mL)와 Lis Rhod PE의 혼합물을 1,000:1 비율로 함유했습니다. (C) 황색 형광 단백질(YFP)의 캡슐화를 보여주는 내부 수성 채널. (A-C)의 삽입물은 각 패널의 대표적인 확대 보기를 보여줍니다(스케일 바 = 10μm). (D-F) 리포솜을 형성하는 출구 채널에서 옥탄올 포켓의 탈습식. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 4: 리포솜 내 pLL/ATP의 pH 유발 액체-액체 상 분리. (A) 리포솜 내에 캡슐화된 pLL 및 ATP의 균질 용액의 pH 의존적 전이(왼쪽)에서 상분리된 pLL/ATP 코아세르베이트(오른쪽)로의 개략도. 리포솜의 초기 산성 환경은 ATP의 분자 전하를 중성으로 만들어 코아세르베이션을 억제합니다. 리포솜 내부의 pH가 외부에서 적용된 pH 증가와 평형을 이루면 ATP는 음전하를 얻어 코아세르베이션을 유발합니다. (비씨) pLL(녹색 채널)과 멤브레인(빨간색 채널)의 공간 분포를 보여주는 선 그래프(각각 패널 [D] 및 [G]의 점선에 해당). (D-G) 리포솜 내에서 pLL/ATP 코아세르베이트의 형성을 보여주는 타임랩스 이미지. 염기성 완충액의 외부 첨가는 몇 분 동안 리포솜 내부의 pH 수준을 높이고 코아세르베이션을 시작합니다. t=0분은 제1 코아세르베이션 사건이 발생하기 직전의 시간을 의미한다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
보충 코딩 파일 1: OLA 설계의 CAD 파일입니다. 이 파일을 다운로드하려면 여기를 클릭하십시오.
세포 복잡성은 전체적으로 연구할 때 살아있는 세포를 이해하는 것을 매우 어렵게 만듭니다. 시험관 내에서 주요 구성 요소를 재구성하여 세포의 중복성 및 상호 연결성을 줄이는 것은 생물학적 시스템에 대한 이해를 높이고 생명 공학 응용 분야를 위한 인공 세포 모방을 만드는 데 필요합니다22,23,24. 리포솜은 세포 현상을 이해하는 데 탁월한 최소 시스템 역할을 합니다. 이러한 현상의 전체 목록에는 세포골격 역학 및 결과적인 막 변형(25,26), 생체 분자 응축물의 시공간 조절(27,28) 및 막(29)과의 상호 작용, 무세포 전사-번역 시스템(30), 무 세포 지질 합성(31) 및 단백질의 진화(evolution)32를 포함한 매우 다양한 생체 분자의 캡슐화가 포함된다.33,34. 리포솜은 또한 약물 전달을 위한 운반체로 널리 사용되어 왔으며 미국 식품의약국(FDA)과 유럽의약품청(EMA)의 임상적 사용 승인을 받았다11. 리포솜과 지질 기반 나노입자는 최근 COVID-19 백신과 같은 mRNA 백신을 포함하여 약물 전달을 위한 운반체로 사용됩니다35.
이 연구는 온칩 리포솜을 생성하기 위해 OLA 기술을 수행하기 위한 포토리소그래피, 미세유체 조립 및 표면 기능화에 대한 자세한 프로토콜을 설명합니다(그림 1 및 그림 3). OLA를 사용하여 제조된 리포솜은 단분산(변동 계수: 평균의 4%-11%) 및 생물학적 세포 크기 범위(일반적으로 직경 5-50μm)이며, 내부 및 외부 수성 채널(36)의 적절한 유속을 사용하여 조정할 수 있습니다. 예를 들어, 그림 1에서 볼 수 있는 리포솜 집단은 23.3μm ± 1.8μm의 크기 분포를 가지고 있습니다(n = 50). 10-30Hz의 전형적인 생산 속도로, 형성된 리포솜은 단일 이중층 특이적 막횡단 단백질인 알파-헤몰리신36을 멤브레인에 삽입하고 디티오네이트-표백 분석법37을 사용하여 이전에 확인된 바와 같이 단일층입니다. OLA는 또한 다양한 지질 조성물과 호환되므로 사용자가 지질을 선택할 수 있는 유연성을 제공합니다. 중요하게는, 초기에 사용된 지질 조성물이 최종 리포솜 조성물38에 반영된다는 것이다.
비교적 새로운 기술이기 때문에 OLA를 개선할 수 있는 여지가 더 있습니다. 예를 들어, PVA를 사용한 표면 기능화는 중요하지만 수행하기가 지루합니다. 장치를 표면 기능화하는 더 쉽고 간단한 방법은 칩 제조 시간과 칩 간 변동성을 크게 줄일 수 있습니다. 플루로닉 F68 계면활성제는 이중 에멀젼을 초기에 안정화시키는 외부 수성상에서 중요한 성분이고; 그럼에도 불구하고 어떤 경우에는 사용이 제한될 수 있습니다. Pluronic F68을 생체 적합성이 더 높은 계면활성제로 대체하거나 계면활성제를 완전히 제거하면 시스템의 다양성이 향상될 수 있습니다. 출구 채널에서 생성 된 이중 에멀젼을 이동하는 동안 전단으로 인해 파열 될 수 있습니다. 이중 에멀젼 안정성과 옥탄올 포켓 분리를 개선하기 위해 OLA 설계를 업그레이드하면 처리량이 증가할 수 있습니다. 그럼에도 불구하고 OLA는 주로 효율적인 캡슐화, 단분산 및 단층 리포솜, 제어된 온칩 실험을 포함하는 몇 가지 장점이 있습니다.
OLA는 리포좀의 성장과 분열39, 액체-액체 상 분리 과정(27)과 막(21)과의 상호작용 연구, 리포좀(40)의 박테리아 성장 바이오 제품 형성 이해 등 다양한 연구에 사용되고 적용되어 왔다. OLA 기반 고처리량 분석은 또한 멤브레인(41)을 가로지르는 이온 수송 및 지질 이중층(37)을 가로지르는 약물 투과성을 이해하고, 치료 목적(42)을 위한 약물 전달 시스템으로서, 멤브레인(43)에 대한 항균제의 효과를 연구하고, 액정(44)을 캡슐화하는 도구로서 사용된다. OLA 기술의 광범위한 응용 분야에 더하여, 특정 목적에 적합한 OLA의 변형 된 버전이 개발되고 있습니다 (45,46,47,48,49,50). 전반적으로 장단점을 고려할 때 OLA는 합성 생물학을 위한 다목적 플랫폼이라고 굳게 믿습니다.
저자는 이해 상충을 선언하지 않습니다.
YFP를 친절하게 제공해 주신 Dolf Weijers, Vera Gorelova, Mark Roosjen 님께 감사드립니다. S.D.는 네덜란드 연구위원회 (보조금 번호 : OCENW. 클라인.465).
| 이름 | 회사 | 카탈로그 번호 | 댓글 |
|---|---|---|---|
| 1-옥탄올 | 시그마-알드리치 | No. 297887 | |
| 1.5 mL 튜브 | Fisher scientific | 10451043 | Eppendorf 3810X 폴리프로필렌 미세원심분리기 튜브 |
| ATP | 시그마-알드리치 | No. A2383 | |
| 바이옵시 펀치 | 다윈 미세유체역학 | PT-T983-05 | 0.5 mm 및 3 mm 직경 |
| 구연산염 기반 | 시그마-알드리치 | No. 71405 | |
| Dextran | Sigma-Aldrich | No. 31388 | Mr~6,000 |
| 직접 쓰기 광학 리소그래피 기계 | Durham Magneto Optics Ltd | MicroWriter ML3 Baby | setup and software |
| DOPC lipid | Avanti | SKU:850375C | |
| F68 | Sigma-Aldrich | No. 24040032 | |
| Glass cover slip | Corning | #1, 24 x 40 mm | |
| 글리세롤 | Sigma-Aldrich | No. G2025 | |
| 염산 | Thermo Scientific Acros | No. 124630010 | |
| Liss Rhod PE 지질 | Avanti | SKU:810150C | |
| Parafilm | Sigma-Aldrich | No. P7793 | |
| Photoresist | Micro resist technology GmbH | EpoCore 10 | |
| Photoresist developer | 마이크로 레지스트 기술 GmbH | mr-Dev 600 | |
| 플라즈마 클리너 | Harrick 플라즈마 | PDC-32G | |
| 폴리디메틸실록산 | Dow | Sylgard 184 | PDMS 및 경화제 |
| Poly-L-lysine | Sigma-Aldrich | No. P7890 | |
| Poly-L-lysine– FITC 라벨 | Sigma-Aldrich | No. P3543 | |
| 폴리비닐 알코올 | Sigma-Aldrich | no. P8136 | 분자량 30,000– 70,000, 87%– 90% 가수분해 |
| 압력 컨트롤러 | Elveflow | OBK1 Mk3+ | Flow 컨트롤러 |
| 스카치 테이프 | 매직 테이프 인비저블 매트 테이프 | ||
| 실리콘 웨이퍼 | 실리콘 재료 | 0620R16002 | |
| 스핀 코터 | 로렐 테크놀로지스 코퍼레이션 | 모델 WS-650MZ-23NPP | |
| 스테인레스 스틸 90° 굽은 PDMS 커플러 | Darwin microfluidics | PN-BEN-23G | |
| Tris-base | Sigma-Aldrich | No. 252859 | |
| Tygon 튜빙 | Darwin microfluidics | 1/16" OD x 0.02" ID | |
| UV laser | 365nm 파장 |
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