여기에서는 엔도솜 유래 나노소포체의 대규모 생산을 위한 자기 분리 보조 고속 균질화 방법을 생물학적 기원과 천연 세포외 소포체(EV)의 생물학적 기원과 유사한 구조, 형태 및 단백질 조성을 공유하는 새로운 유형의 엑소좀 모방체(EM)로 설명합니다.
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여기에서는 엔도솜 유래 나노소포체의 대규모 생산을 위한 자기 분리 보조 고속 균질화 방법을 생물학적 기원과 천연 세포외 소포체(EV)의 생물학적 기원과 유사한 구조, 형태 및 단백질 조성을 공유하는 새로운 유형의 엑소좀 모방체(EM)로 설명합니다.
세포외 소포체(EV)는 생리학 및 병리학적 연구, 질병 진단 및 치료에 상당한 관심을 끌고 있습니다. 그러나 그들의 임상 번역은 스케일업 제조 접근 방식의 부족으로 인해 제한되었습니다. 따라서, 본 프로토콜은 엔도솜 유래 엑소좀 모방체(EM)의 새로운 유형으로서 엔도솜 유래 나노소포체의 대규모 생산을 위한 자기 분리 보조 고속 균질화 방법을 제공하며, 이는 기존의 초원심분리 방식보다 약 100배 높은 수율을 가지고 있습니다. 이 방법에서 자성 나노 입자(MMP)는 세포내이입(endocytosis)을 통해 부모 세포에 의해 내재화되고 이후 엔도솜 내에 축적되었습니다. 그런 다음, MNP가 로드된 엔도솜을 수집하고 저긴장 처리 및 자기 분리를 통해 정제했습니다. 고속 균질화기는 MNP가 로드된 엔도솜을 단분산 나노소포로 분해하는 데 사용되었습니다. 그 결과 엔도솜 유래 소포는 동일한 생물학적 기원과 구조를 특징으로 하며, 나노 입자 추적 분석, 투과 전자 현미경 및 웨스턴 블로팅을 특징으로 합니다. EM의 형태 및 단백질 조성은 네이티브 EV와 유사하며, 이는 EM이 임상 번역을 위한 네이티브 EV의 저비용 및 고수율 대용품 역할을 할 수 있음을 시사합니다.
세포외 소포체(EV)는 30-150nm의 크기 범위를 가진 거의 모든 세포에서 분비되는 작은 소포로, 풍부한 생리 활성 물질을 함유하고 있습니다. 기원 세포에 따라 EV는 높은 이질성을 보이며, 모세포에 특이적인 여러 구성 요소를 가지고있습니다 1. EV는 체액으로 방출되어 먼 부위로 운반되어 조직 복구, 종양 진단 및 치료, 면역 조절을 위한 광범위한 생체 활성 분자 및 약물을 전달하는 데 활용될 수 있는 작용2을 위해 표적 세포에 의해 흡수됩니다 3,4. 그러나 체액에서 유사한 생물물리학적 특성을 갖는 다른 생물학적 나노입자(예: 지단백질) 및 나노소포(예: 비엔도솜 경로에서 파생된 EV)는 필연적으로 EV 분리 및 정제에 영향을 미칩니다. 현재까지 초원심분리는 EV 분리의 황금 표준으로 남아 있으며, 자당 밀도 구배 원심분리, 한외여과, 폴리에틸렌 글리콜 침전, 크로마토그래피 및 면역자성 비드 분리를 포함한 기타 분리 방법이 개발되었습니다5. EV 치료제의 임상 번역 및 상용화를 제한하는 현재 병목 현상은 EV의 확장성과 재현성이 높은 분리를 허용하는 분리 기술의 심각한 부족입니다 6,7,8. 기존의 EV 분리 기술(예: 초원심분리 및 크기 배제 크로마토그래피)은 낮은 수율(1 x 107-1 x 108/1 x 10 6 세포), 긴 생산 주기(24-48시간), 제품 품질의 낮은 재현성, EV에 대한 현재 임상 수요를 충족할 수 없는 고가의 에너지 집약적인 생산 장비가 필요합니다6.
네이티브 EV의 합성 대리물인 엑소좀 모방체(EM)는 매우 유사한 구조, 기능 및 생산 확장성으로 인해 중요한 주목을 받고 있습니다. EM의 주요 공급원은 연속 절편(continuous sectioning)9,10을 가진 전체 부모 세포의 직접 압출에 의한 것으로, 네이티브 EV(native EV)11,12로서 강력한 생물학적 기능을 보여준다. 예를 들어, 인간 탯줄 중간엽 줄기세포(hUCMSCs)에서 유래한 EM은 네이티브 EV와 유사한 상처 치유 효과를 발휘하며 단백질 구성이 더 풍부하다13. 전체 세포에서 파생된 EM은 EV의 생물학적 복잡성을 가지고 있지만 주요 단점은 다양한 세포 소기관과 세포 파편에 의해 필연적으로 오염되기 때문에 제품의 이질성입니다. 단백질 국소화 분석은 또한 전체 세포 압출에서 유래한 EM이 미토콘드리아와 소포체(endoplasmic reticulum)로부터 많은 비EV 특이적 단백질을 포함한다는 것을 밝혀냈다13. 더욱이, EM을 제조하는 대부분의 방법은 여전히 시간과 에너지가 많이 소요되는 공정인 초원심분리를 필요로 한다14. 엑소좀이 세포 엔도솜에서만 유래한다는 사실을 고려하여, 우리는 생체공학적 엔도솜 유래 나노소포가 전체 세포 압출 방법으로 생성된 잘 확립된 세포막 유래 EM과 비교하여 엑소좀과 EM 간의 생물학적 상동성을 더 잘 재현할 수 있다는 가설을 세웠습니다 14. 그럼에도 불구하고 엔도솜 유래 나노 소포의 제조는 실행 가능한 접근 방식이 없기 때문에 어렵습니다.
다양한 질병 치료를 위한 무세포 치료제와 나노 단위의 약물 전달 시스템의 대용물로 EV를 활용하여 임상 연구가 수행되었습니다. 예를 들어, 골수 중간엽 줄기세포에서 유래한 EV는 COVID-19로 인한 중증 폐렴 치료에 사용되어 유망한 결과를 얻었습니다. 최근에는 CD24 단백질을 운반하는 유전자 조작 EV도 COVID-19 환자 치료에 강력한 치료 효과를 입증했습니다15,16. 그러나 EV 요법의 임상적 요구 사항은 낮은 수율과 비용 때문에 전통적인 분리 방법으로는 여전히 충족할 수 없습니다. 이 연구는 자기 분리 보조 고속 균질화 접근 방식을 통한 엔도솜 유래 나노 소포의 대규모 생산을 보고합니다. MNP의 세포내이입 경로를 이용하여 자기 분리를 통해 MNP가 로드된 엔도솜을 분리한 다음 고속 균질화를 통해 엔도솜을 단분산 나노소포로 제형화합니다. 이 프로토콜에 의해 수집되는 엔도솜의 유형은 다양하기 때문에 업계에서 우수제조관리기준(GMP)을 확립하기 위해서는 여전히 심층적인 연구가 필요합니다. 이 새로운 EM 준비 접근 방식은 더 시간 효율적(고속 균질화 5분)하여 네이티브 EV와 상동적인 나노 소포를 얻을 수 있습니다. 초원심분리보다 동일한 양의 세포에서 기하급수적으로 더 많은 소포를 생성하며, 이는 일반적으로 다양한 세포 유형에 적용될 수 있습니다.
참고: 이 방법의 개략도는 그림 1에 나와 있습니다.
1. EM 준비 및 격리
2. EM 특성화(그림 2 및 그림 3)
3. In vitro EM 기능 검출
자기 분리 보조 고속 균질화에 의한 EM 준비의 작업 흐름은 그림 1에 나와 있습니다. 세포는 10nm 폴리리신 변형 IONP를 내재화하며, 이는 세포내이입(endocytosis)을 통해 엔도솜에 특이적으로 축적됩니다(그림 3A). 저긴장성 완충액으로 처리하고 균질화한 후, IONP가 로드된 엔도솜을 세포에서 방출하고 이어서 자기 분리에 의해 수집합니다. 분리된 엔도솜은 고속 균질화에 의해 EM이라고도 하는 단분산 나노소포로 추가로 재구성됩니다. 최적화된 EM 준비 조건을 식별하기 위해 여러 주요 파라미터(예: 균질화 속도 및 시간)를 탐색했습니다(그림 2). 마지막으로 5분 동안 140 x g 의 균질화 속도를 생성된 EM의 입자 크기 및 수율을 고려하여 최적화된 조건으로 선택했습니다. 자유 IONP 및 IONP 부하 EM은 결국 IONP가 없는 EM을 얻기 위해 두 번째 자기 분리를 통해 최종 제품 솔루션에서 제거됩니다. 이 방법은 부모 세포 엔도솜에서 매우 균일하고 단분산된 나노소포를 생산하며, 네이티브 EV와 동일한 생물학적 기원을 공유합니다.
초원심분리로 얻은 EV와 이 방법으로 생성된 EM을 비교하기 위해 EV와 EM에 대해 BMSC 및 293T를 준비했습니다. EM의 직경과 형태는 NTA와 TEM에 의해 분석되었습니다. BMSC-EM의 형태는 전형적인 그릇 모양의 소포 모양의 구조를 가지며 지질 이중층으로 구분됩니다(그림 3A). NTA에서 분석한 바와 같이 BMSC-EM과 293T-EM은 모두 기본 EV(BMSC-EV 및 293T-EV)와 유사한 유체역학적 직경을 가지고 있습니다(그림 3B). 고속 균질화의 BMSC-EMs 수율은 10 9/1 × 10 6 셀× 8.16 × 10 8-1.42 109/1 셀이었고, 초원심분리로 제조된 네이티브 EV의 수율은 10 8/1 × 106셀×10 7-1.12 × 7.2에 불과했습니다. 마찬가지로, 고속 균질화의 293T-EM 수율은 108-7.58 × 108/1 × 10 6 세포에서 3.71 ×였으며, 이는 기존의 초원심분리기 방법(≈5.5 × 10 6/1 × 10 6세포)으로 제조된 네이티브 293T-EV의 수율보다 최대 약 100배 높았습니다(그림 4A).
또한, 웨스턴 블로팅 결과는 BMSC-EM이 EV(CD63 및 Annexin)와 동일한 단백질 바이오마커를 함유하고 있음을 보여주었습니다. EM과 EV는 모두 칼넥신 발현에 대해 음성이며, 이는 이 방법으로 생성된 EM이 원형질막 오염이 거의 없음을 시사합니다(그림 3C). BCA 단백질 분석 키트를 통해 EM과 EV 간의 단백질 농도에는 유의한 차이가 없으며, BMSC-EM과 BMSC-EV는 11.15μg/1 × 109개 입자 및 14.71μg/1 × 109개 입자로 유사한 총 단백질 농도를 나타냈습니다. 또한, 293T-EM 및 293T-EV는 각각 약 31.8μg/1 × 10 9 입자 및 9.95 μg/1 × 109 입자의 총 단백질 농도를 나타냈습니다(그림 4B). 이러한 결과는 EM이 네이티브 EV와 유사한 단백질 구성을 가지고 있음을 나타냅니다. EM이 세포내이입될 수 있는지 여부를 검출하기 위해 PKH26 표지된 EM 및 EV를 BMSC 및 ID8과 함께 1 × 109 입자/mL의 농도로 8시간 동안 공동 배양하고, 공초점 형광 현미경으로 세포를 관찰하여 EM이 EV뿐만 아니라 작용을 위해 세포에서 쉽게 흡수될 수 있음을 확인했습니다(그림 5).

그림 1: 자기 보조 고속 균질화 방법의 개략도. 1단계: 세포는 세포내이입(endocytosis)을 통해 IONP를 엔도솜(endosome)으로 내재화합니다. 2단계: 저긴장 처리 및 균질화 후 IONP가 로드된 엔도솜을 포함한 세포 기관을 수집합니다. 3단계: 자기 분리를 통해 IONP가 탑재된 엔도솜을 정제합니다. 4단계: 엔도솜을 균질화하여 단분산 나노소포로 재구성합니다. 5단계: 자기 분리를 통해 자유 IONP 및 IONP 부하 EM을 제거하여 IONP가 없는 EM을 수집합니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 2: EM 준비 조건의 최적화 . (A) 시간이 5분으로 설정되었을 때 균질화 속도 변화에 반응하는 BMSC-EM의 직경과 PDI를 DLS로 분석했습니다. (B) 균질화 속도를 140 x g 으로 설정했을 때 균질화 시간 변화에 반응하는 BMSC-EM의 직경 및 PDI를 DLS로 분석하였다. (C) 서로 다른 저장 시점에서의 BMSC-EM의 직경과 PDI는 DLS로 분석되었습니다. (D) 시간을 5분으로 설정했을 때 균질화 속도 변화에 반응하는 BMSC-EM의 직경과 농도를 NTA로 분석하였다. (E) 균질화 속도를 140 x g 으로 설정했을 때 균질화 시간 변화에 반응하는 BMSC-EM의 직경 및 농도를 NTA로 분석하였다. (F) BMSC 세포와 다른 농도의 IONP와의 동시 배양에 반응하는 BMSC-EM의 직경과 수율을 NTA로 분석했습니다. p < 0.0001입니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 3: EM의 특성 분석. (A) 세포내이입된 IOP, 엔도솜 및 EM을 사용한 부모 세포의 형태에 대한 TEM 특성 분석. 눈금 막대는 500nm를 나타냅니다. (B) BMSC-EM, BMSC-EV, 293T-EM 및 293T-EV의 유체역학적 직경은 NTA를 특징으로 합니다. (C) BMS-EM, BMC-EV 및 BMSC 세포 용해물의 웨스턴 블롯 분석 결과. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 4: EM의 수율은 EV보다 높습니다. (A) BMSC 및 293T로 제조된 EM 및 EV의 수율은 NTA로 분석되었습니다. (B) BMSC 및 293T로 제조된 EM 및 EV의 단백질 수율. **p < 0.01. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 5: BMSC 및 ID8에 의해 내재화된 PKH26 표지 EV 및 EM의 대표적인 형광 현미경 이미지. 눈금 막대는 10μm를 나타냅니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
무세포 치료제 및 나노 단위 약물 전달 시스템의 대체물인 EV는 아직 임상적 기대치를 충족하지 못했으며, 주요 장애물은 확장 가능하고 재현 가능한 생산 및 정제 방법이 부족하다는 것입니다6. 따라서 다양한 유형의 EM이 유사한 생물학적 복잡성을 가진 EV 유사체로 개발되었습니다14. 현재까지 가장 일반적으로 사용되는 EM의 예는 세포 원형질막 유래 나노소포입니다. 이러한 나노소포체의 제조는 전체 모세포(17)를 직접 압출시킴으로써 비교적 쉽고 간단하다. 그러나 세포 원형질막 유래 나노 소포는 두 가지 단점으로 인해 천연 EV를 재현 할 수 없습니다 : 첫째, 이러한 나노 소포의 생물학적 기원은 천연 EV와 비교하여 다른 지질 및 단백질 조성을 포함하는 세포 원형질 막에서 비롯됩니다. 둘째, 비 EV 소기관 및 세포 파편에서 나오는 단백질, 핵산 및 지질을 포함한 오염으로 인해 불가피한 EM 이질성이 발생합니다. 이 방법에서는 IONP로 세포를 배양하고 자기 분리를 통해 IONP가 로드된 엔도솜을 수집한 다음 고속 균질화를 통해 단분산 나노소포를 생성하여 결국 두 번째 자기 분리를 통해 IONP가 없는 EM을 얻었습니다. 또한 균질화 속도 및 시간과 같은 다양한 파라미터가 EM 크기 및 수율에 미치는 영향을 조사하여 EM 준비 조건을 최적화했습니다. 이 프로토콜은 흥미로운 생물학적 현상을 이용합니다: MNP(예: 10nm IONP)는 세포내이입(endocytosis)을 통해 거의 모든 세포에 효율적으로 내재화될 수 있으며 다른 세포소기관이 아닌 엔도솜에 독점적으로 축적될 수 있습니다. 이 독특한 생물학적 공정은 자기 분리를 통해 비 EV 오염 없이 MNP 부하 엔도솜을 분리할 수 있게 했습니다. 그 대가로 이러한 정제된 세포 엔도솜에 의해 준비된 나노 소포는 네이티브 EV의 생물학적 복잡성을 보다 충실하게 재현할 수 있습니다.
또한, EV 분리 방법의 황금 표준은 초원심분리로, 방대한 세포 배양 배지와 5시간 이상의 긴 처리 시간이 소요되며 1 x 10 6 세포에서 1 × 107-1 × 108 입자만 생성합니다6. 종래의 전체 모세포 압출 방법에는 초고압 막 압출 및 초원심분리를 포함하는 여러 단계가 포함되며, 이는 상대적으로 수율이 높지만 고가의 장비를 필요로 한다17. 그러나 EM 생산 수율, 효율성, 비용 및 인력은 당사 프로토콜을 활용하여 크게 향상됩니다. 고속 균질화기는 이 프로토콜에서 5분의 짧은 처리 시간을 위한 일반적이고 저렴한 장비이며, 이 방법은 기본 EV에 비해 1 × 106 셀에서 최대 100배 더 많은 EM을 생산할 수 있습니다. 그러나, 이 방법은 고속 균질화 동안 엔도솜 단백질의 손실과 같은 몇 가지 한계가 있으며, 세포에 의해 엔도사이토화된 MNP가 리소좀으로 전달될 수 있는 것으로 나타났으며, 이는 잠재적인 오염이 될 수 있다18.
관점에서 EM은 본래의 대응물처럼 중요한 생물학적 기능을 발휘하도록 설계될 수 있으며, 이는 새롭고 유망한 유형의 생물학적 치료제 역할을 할 수 있습니다. 생리활성 물질(예를 들어, 단백질 및 핵산)은 특정 부모 세포(예를 들어, 줄기세포(19))를 선택하거나 유전자 변형(예를 들어, 융합 단백질(20))을 통해 EM에 통합될 수 있다. 예를 들어, 살아있는 배아 줄기 세포를 압출하여 세포 유래 나노 소포는 회복 또는 상처 치유 과정에 긍정적인 영향을 미친다19. 유전자 변형은 특정 생물학적 기능을 가진 EM을 생성하는 대체 접근법입니다. 예를 들어, 세포가 글리코실포스파티딜이노시톨(GPI) 앵커 신호 펩타이드에 융합된 항-표피 성장 인자 수용체(EGFR) 나노바디의 벡터로 형질주입되었을 때, EGFR 나노바디는 EGFR-발현 종양 세포(20)를 표적화하기 위해 EV의 표면에 앵커링될 수 있다. EM은 여러 전임상 연구에서 cell-free 치료제 및 나노 단위 약물 전달 시스템의 대용품으로 잘 수행되었지만, 임상 조사에서 EV 및 EM의 이질성 및 재현성에 대한 우려와 함께 EM 또는 EV 기반 치료에 대한 포괄적인 기계론적 이해가 부족합니다. 종합하면, EM의 생물학적 기능과 임상적 의미는 추가 조사가 필요합니다.
D.W.와 P.G.는 중국과학원 기초 의학 및 암 연구소(IBMC)에서 제출한 특허 출원의 공동 발명자입니다. 다른 저자는 이해 상충이 없음을 선언합니다.
저자들은 중국과학원(Chinese Academy of Sciences) 기초 의학 및 암 연구소(Institute of Basic Medicine and Cancer, IBMC)의 공유 계측 핵심 시설(Shared Instrumentation Core Facility)에서 기기를 사용하는 것을 인정합니다. 이 연구는 중국국가자연과학재단(NSFC; 82172598), 중국 저장성 자연과학재단(LZ22H310001), 중국 저장성 건강위원회 551 건강인재 양성 프로젝트, 항저우시 과학기술국 농업 및 사회 발전 연구 프로젝트(2022ZDSJ0474) 및 첸탕 학제간 연구 보조금의 지원을 받았다.
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
|---|---|---|---|
| Annexin 항체 | ABclonal | A11235 | Western blotting |
| BCA 분석 키트 | Beyotime | P0012 | 단백질 농도 분석 |
| Calnexin | GeneTex | HL1598 | Western blotting |
| CD63 항체 | ABclonal | A19023 | Western blotting |
| Beyotime | P0013 | Western용 세포 용해 완충액 | 블로팅 |
| 원심분리기 | Beckman | Allegra X-30R | 세포 원심분리기 |
| CO2 incubator | Thermo | Cell culture | |
| Confocal 레이저 스캐닝 형광 현미경 | NIKON | A1 HD25 | 사진 형광 사진 |
| DMEM basic (1x) | GIBCO | C11995500BT 세포 배양 | |
| 동적 광 산란(DLS) | Malvern | Zetasizer Nano ZS ZEN3600 | 직경 분석 |
| 전기 유리 균질화 | SCIENTZ(중국 닝보) | DY89-II | 저속 균질화 |
| 엑소좀 고갈 FBS | 시스템 생명과학 | EXO-FBS-50A-1 | 세포 배양 |
| 고속 균질화 | SCIENTZ(중국 닝보) | XHF-DY | 고속 균질화 |
| 자기 화격자 | Tuohe Electromechanical Technology (상하이, 중국) | NA | 자기 분리 |
| PKH26 일반 세포막 라벨링용 적색 형광 세포 링커 키트 | Sigma-Aldrich | PKH26GL-1KT | 이 키트에는 에탄올 및 희석제 C의 PKH26 세포 링커가 포함되어 |
| 리신 변성 산화철 나노 입자(IONP) | Zhongke Leiming Technology(베이징, 중국) | Mag1100-10 | 세포 배양 |
| 칼륨 염화물 | 알라딘 | 7447-40-7 | 세포 저장성 치료 |
| 프로테아제 억제제 칵테일 | Beyotime | P1030 | 단백질분해효소 억제제 |
| 구연산 | 알라딘 | 7447-40-7 | 세포 저장성 치료 |
| 투과전자현미경(TEM) | JEOL | JEM-2100plus | 형태학 이미지 |
| 초원심분리기 | Beckman | Optima XPN-100 | 엑소좀 원심분리기 |
| ZetaView 나노 입자 추적 분석기 | Particle Metrix | PMX120 | 나노 입자 추적 분석 |
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