이 프로토콜은 과립세포 세포가 없는 제브라피시에서 깨끗한 I기 난모세포를 신속하게 분리하기 위한 수정된 절차를 설명하여 난모세포별 연구를 위한 편리한 방법을 제공합니다.
방법 논문
이 프로토콜은 과립세포 세포가 없는 제브라피시에서 깨끗한 I기 난모세포를 신속하게 분리하기 위한 수정된 절차를 설명하여 난모세포별 연구를 위한 편리한 방법을 제공합니다.
난모세포 발달에 대한 연구는 발달 생물학에서 중요한 의미를 지닙니다. 제브라피시(Danio rerio)는 난모세포에서 배아까지의 초기 발달 과정을 조사하기 위한 모델 유기체로 광범위하게 사용되었습니다. 제브라피시에서 난모세포는 체세포 과립세포(somatic granulosa cell)의 단일 층으로 둘러싸여 있습니다. 그러나 정확한 분석을 위해서는 순수한 난모세포를 얻는 것이 중요하기 때문에 난모세포에서 과립세포를 분리하는 것은 어려운 일입니다. 다양한 발달 단계에서 제브라피시 난모세포를 분리하기 위한 다양한 방법이 제안되었지만, 현재의 기술로는 과립구 세포를 완전히 제거하기에는 부족하여 난모세포에만 초점을 맞춘 게놈 분석의 정확도가 제한됩니다. 이 연구에서 우리는 제브라피시에서 순수 I기 난모세포를 분리하는 동시에 과립 세포 오염을 제거하는 빠르고 효율적인 프로세스를 성공적으로 개발했습니다. 이 기술은 생화학 및 분자 분석을 용이하게 하며, 특히 난모세포에 특이적인 후성유전학 및 게놈 구조 측면을 탐구하는 데 도움이 됩니다. 특히, 이 방법은 사용자 친화적이고, 난모세포 손상을 최소화하며, 후속 연구 및 분석을 위한 실용적인 솔루션을 제공합니다.
제브라피쉬는 발달 생물학에서 가장 중요한 모델 시스템 중 하나입니다. 최근 몇 년 동안 수많은 연구에서 난모세포에서 배아에 이르기까지 중요한 생물학적 사건과 조절 과정을 연구하기 위한 모델로 제브라피시를 활용했습니다. 여기에는 난모세포의 발달과 성숙의 복잡한 과정1, 모계 유전자의 기능2, 모체-접합 전이의 조절3, 광범위한 오믹스 분석4이 포함된다.
난소 난포5,6 내에서 발달 중인 난모세포를 둘러싸고 육성하는 체세포인 과립세포는 이러한 발달 과정에서 중추적인 역할을 합니다. 원시 생식세포(primordial germ cell, PGCs)가 난자(oogonia)로 진화함에 따라, 이들은 과립세포(granulosa cell)의 단층(monolayer)으로 둘러싸이게 된다7. 외부 thecal cell과 함께, oocyte 및 그 주변의 과립 세포는 성숙한 난포를 구성한다8. 생식 세포와 체세포 사이의 근본적인 차이점을 감안할 때, 특히 게놈 관련 분석의 경우 순수한 난모세포 샘플을 얻는 것이 필수적입니다.
제브라피쉬의 여포 구조 내에서, 과립세포 세포는 전형적으로 직경이 수 미크론에 불과하며8 이는 과립세포와 난모세포 사이의 긴밀한 상호 연결을 강조한다9. 이러한 밀접한 연관성은 과립구 세포와 난모세포의 수와 부피가 모두 상당한 차이(단일 난모세포에 비해 수백 개의 과립세포)로 인해 완전한 분리를 달성하는 데 어려움을 초래합니다10,11. 단일 과립 세포에 대한 최소한의 오염조차도 특히 난모세포를 표적으로 하는 다운스트림 분석을 방해할 수 있습니다. 따라서 게놈 및 후성유전학적 특성에 초점을 맞춘 연구에서는 과립종 세포를 제거하는 것이 필수적입니다.
잘 특성화된 형태학적 기준의 이점을 활용하여 각 단계의 난모세포는 직경11을 기준으로 구별할 수 있습니다. 제브라피쉬의 난자형성 과정은 형태학과 핵형(karyotype) 11에 따라 5단계로 분류된다. I기 난모세포(직경 7-140μm)는 감수분열 시작부터 감수분열 I의 초기 단계까지 난모세포를 포함하며, 결정적으로 이 난모세포는 투명하여 투과광을 통해 중심핵을 관찰할 수 있습니다(그림 1Ai). II기 난모세포(직경 140-340μm)는 점차 거품이 생기고 반투명해집니다. 난포가 커지고 대뇌 피질 폐포가 증식함에 따라 중앙의 생식 소포를 구별하기가 어려워집니다12 (그림 1Aii). III기 난모세포(직경 340-690μm)는 점차 비텔로게닌을 축적하고 신선한 난포는 점점 불투명해집니다(그림 1Aiii). 감수분열은 IV기 난모세포(직경 690-730μm)에서 염색체가 II감수분열의 중앙으로 들어가 정체됨에 따라 계속됩니다(그림 1Aiv). V기 난모세포(직경 730-750μm)는 성숙하여 배란을 위한 준비가 되었습니다 7,11(그림 1Av).
앞서 언급한 각 단계의 고유한 특성을 바탕으로, 콜라겐분해효소 I, 콜라겐분해효소 II, 히알루로니다아제를 함유한 소화액을 사용하여 제브라피시 난소를 소화한 후 특정 크기의 세포 여과기를 통해 여과함으로써 난모세포를 I기에서 III기까지 분리하는 방법이 제안되었다(13). 그러나 이 방법을 사용하면 다양한 발달 단계에서 난모세포를 얻을 수 있지만 난모세포와 과립세포를 완전히 분리하지는 못합니다. 다른 연구자들은 또한 난모세포에서 과립세포를 분리하는 방법을 제안했습니다. 그러나 이러한 방법은 주로 기계적 접근법에 의존하는데, 이는 난모세포 손상을 유발할 수 있고, 시간이 많이 소요되며, 분석을 위해 상당한 수의 난모세포를 얻기에는 부적절하다14,15.
기존 방법의 한계와 특정 연구 요구 사항을 감안할 때 이 연구는 난모세포와 과립세포를 철저히 분리하고 분석을 위한 충분한 수의 깨끗한 I 단계 난모세포를 얻는 절차를 확립하는 것을 목표로 합니다. 참조된 방법13을 확장하여, 우리는 더 부드럽고 난모세포의 분산과 과립구 세포의 해리를 촉진하는 개선된 소화 완충액( 재료 표 참조)을 사용합니다. 그 후, 난모세포는 세포 여과기를 통과한 후 세척 및 추가 현미경 선택을 거쳐 많은 수의 깨끗한 I기 난모세포를 얻을 수 있습니다.
모든 제브라피쉬는 관련 국가 및/또는 지역 동물 복지 기관에서 정한 엄격한 동물 관리 지침에 따라 처리되었습니다. 물고기의 유지 관리 및 처리는 지방 당국과 쓰촨 대학 서중국 병원 동물 윤리 위원회의 승인을 받았습니다(승인 번호 20220422003). 제브라피시 난소에는 다단계 난모세포가 혼합되어 있으며, 각 발달 단계는 성인 제브라피시 난소에 존재합니다. 그러나 이 연구를 위해 어린 제브라피시를 선택한 이유는 성체 물고기의 난소에서 크고 불투명한 후기 단계 난모세포(II-III)가 우세하기 때문입니다. 대조적으로, 청소년은 주로 I기 난모세포로 구성된 편평하고 길쭉한 난소를 가지고 있습니다(그림 1B) (그림 1B). 이전 연구는 성체 및 어린 제브라피시에서 초기 난자형성의 형태학적 특징이 매우 일관됨을 보여주었으며, 이는 어린 제브라피시 활용의 타당성을 뒷받침한다13. 그림 2에 요약된 아래 설명된 절차는 절개에서 깨끗한 I기 난모세포를 얻는 것까지 분리 과정에 대한 자세한 설명을 제공합니다. 추가 참조를 위해 연구에 사용된 시약, 완충액 및 장비는 재료 표에 나열되어 있습니다.
1. 난소 박리
2. 소화
3. 여과
4. 세탁
5. 품질 관리를 위한 선택
6. 핵 염색에 의한 확인
참고: 분리된 난모세포의 추가 정제를 위해 Hoechst 33342로 염색하여 이전 단계에서 놓쳤을 수 있는 과립구 세포에 부착된 개별 난모세포를 식별하고 제거했습니다.
그림 1 은 성체 제브라피시와 어린 제브라피시에서 관찰된 난소 형태를 보여주며, 다양한 발달 단계의 난모세포를 보여주며 참고 자료로 사용할 수 있습니다. 그림 1A 는 1차 성장 단계(I단계)에서 시작하여 배란란자(V단계)까지 각 발달 단계에서 난모세포의 형태와 크기를 그래픽으로 표현한 것입니다. 그림 1Ai-v 는 난모세포의 I기에서 V기에 해당하는 직경을 보여줍니다. 그림 1B (왼쪽 패널)는 어린 물고기(SL = 1.5cm인 6 wpf)의 난소 이미지를 보여줍니다. 특히, 청소년 난소는 뚜렷한 소엽 모양을 보이며, 주로 투명한 I기 난모세포가 풍부하고 더 적은 수의 II기 난모세포가 동반되는 것이 특징입니다. 이러한 I기 난모세포의 유병률은 난모세포의 관찰과 회수를 크게 용이하게 합니다. 오른쪽 패널은 성체 물고기 난소(6개월)의 형태를 묘사하고 있으며, 다양한 발달 단계의 난모세포를 관찰할 수 있습니다. 그러나 불투명한 말기 난모세포(II-III기)는 난소에서 우세합니다.
그림 2 는 해부부터 깨끗한 I기 난모세포를 얻기까지의 대표적인 과정을 보여줍니다. 그림 3 은 참조 방법과 수정된 방법을 모두 사용하여 얻은 I기 난모세포를 보여줍니다. Hoechst 염색 후 난모세포와 과립구 세포핵은 자외선 아래에서 청색 형광을 나타냈습니다. 참조 방법(그림 3A)을 사용하여 얻은 이미지에서 난모세포의 표면은 수많은 염색된 과립 세포핵으로 조밀하게 둘러싸여 있었습니다. 대조적으로, 수정된 방법(그림 3B)으로 분리된 I기 난모세포는 과립 세포핵 염색이 존재하지 않고 완전한 노출과 청결도를 나타냅니다.
우리의 발견은 I기 난모세포를 분리하기 위해 제안된 방법의 효과를 입증했습니다. teleost 물고기에서 난모세포의 발달 과정은 몇 가지 공통적인 특성을 나타낸다7. 종간 적용 가능성을 평가하기 위해 다른 어종에 대한 추가 분석이 수행되었습니다. 암컷 연못 미꾸라지는 현지 시장에서 구입했으며 초기 단계의 난모세포(직경 <100μm)는 동일한 절차에 따라 분리했습니다. 연못 미꾸라지의 난소 구성은 또한 여러 발달 단계에서 난모세포의 혼합물을 나타냈으며, 난모세포 형태와 크기가 같은 단계의 제브라피시와 현저하게 유사하다는 특징이 있습니다. 그림 4A에서 볼 수 있듯이, 다 자란 암컷 연못 미꾸라지의 난소는 투명한 초기 난모세포와 산재된 불투명한 후기 난모세포에 의해 지배되었습니다. 난모세포의 표면에서 과립세포(granulosa cell)의 투명한 단층(monolayer)이 관찰되었습니다. 제브라피시에서 관찰한 결과, 직경이 100μm 미만인 미꾸라지 난모세포는 디플로텐 단계 이전의 단계에 해당했습니다. 그림 4B 는 수정된 방법으로 얻은 깨끗한 연못 미꾸라지(Misgurnus anguillicaudatus) 난모세포를 보여줍니다. 제브라피시 난소와 비교했을 때, 연못 미꾸라지의 난소는 해리하기가 더 어렵습니다. 6-7시간의 소화 후에는 더 많은 초기 단계의 난모세포가 해리됩니다. 그럼에도 불구하고, 이 조정된 접근법은 원하는 깨끗하고 벌거벗은 난모세포를 산출했습니다. 제브라피쉬는 Cyprinidae 가족에 속하는 반면 연못 미꾸라지는 Cobitidae 가족으로 분류됩니다. 이 두 과(family)는 먼 분류학적 관계를 보이지만 난소 발달 단계와 형태는 매우 유사하여 이 방법이 일반적으로 다양한 어종의 난모세포를 분석하는 데 활용될 수 있음을 나타냅니다.

그림 1: 다양한 단계에서 제브라피시 난소와 난모세포의 대표 이미지. (A) 각 발달 단계(St)에서 난모세포의 형태 및 크기. i-v는 I기에서 V기까지의 난모세포의 이미지와 직경을 나타냅니다. 스케일 바 = 200 μm. (B) 성인 및 청소년 제브라피시의 난소 형태. 스케일 바 = 500 μm. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 2: 해부부터 깨끗한 I기 난모세포 획득에 이르는 분리 절차의 대표 이미지. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 3: 두 가지 방법을 통해 얻은 I기 난모세포. (A) 참조된 방법에 의해 분리된 병기(St) I 난모세포. (B) 변형된 방법을 통해 분리된 I기 난모세포. 난모세포(oocyte)와 과립세포핵(granulosa cell nuclei)을 Hoechst로 염색하고 자외선으로 여기시켰습니다. 스케일 바 = 100 μm. BF = 명시야. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 4: 수정된 방법으로 얻은 연못 미꾸라지의 초기 단계 난모세포. (A) 연못 미꾸라지의 난소와 난모세포의 대표 이미지. I, II는 다양한 배율에서 연못 미꾸라지의 난소를 나타내고 III-IV는 연못 미꾸라지의 초기 단계 난모세포를 나타냅니다. 스케일 바: i (500 μm); II (200 μm); III, IV (100 μm). (B) 연못 미꾸라지에서 분리된 초기 단계의 난모세포. 난모세포와 과립세포 핵을 Hoechst로 염색하고 UV 광선으로 여기시켰습니다. 스케일 바 = 100 μm. BF = 명시야. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
이 연구에서는 다운스트림 분석(특히 게놈 분석)을 위해 과립세포를 제외한 순수하고 깨끗한 I기 난모세포를 분리하는 방법을 개발했습니다. 이 수정된 방법을 참조된 방법13과 비교하면, 이 방법을 사용하여 얻은 I기 난모세포는 형태학적으로 온전하고 수가 충분하며 다른 체세포와의 오염이 없어 다양한 후속 연구 및 분석에 적합합니다. 더욱이, 다른 기계적 분리 방법(14,15)과 비교하여, 개선된 방법은 작동이 더 간단하고, 더 많은 수의 난모세포의 획득을 용이하게 하며, 난모세포의 손상을 방지한다.
더욱이, 1단계 제브라피시 난모세포를 효과적으로 분리하는 것 외에도 이 방법은 연못 미꾸라지에도 적용될 수 있으며, 이는 다양한 어종에 대한 광범위한 적용 가능성을 나타냅니다. 과립세포 오염이 유전자 발현 및 후성유전학적 분석에 미치는 영향을 조사하기 위해 참조 및 변형 방법을 사용하여 얻은 난모세포에 대해 RNA 염기서열 분석(RNA-seq) 및 CUT&Tag 분석을 수행했습니다. RNA-seq에 의해 몇 가지 다르게 발현된 유전자가 확인되었지만, 과립 세포에서 특이적으로 발현된 일부 유전자는 여전히 식별되었습니다(데이터는 표시되지 않음). 이 분석은 또한 다른 방법으로 분리 된 난모세포 간의 히스톤 변형에서 상당한 차이를 나타 냈습니다 (데이터는 표시되지 않음). 이러한 결과는 정확한 유전자 발현과 후성유전학적 분석을 위해 난모세포와 과립세포를 완전히 분리하는 데 있어 이 방법의 중요성을 강조합니다.
제안된 방법을 구현할 때 주의가 필요한 몇 가지 측면이 있습니다: (1) 제브라피시의 적절한 크기를 선택하는 것이 중요합니다. 이렇게 하면 충분한 난모세포가 확보되고 후속 세척 단계를 줄일 수 있습니다. SL이 <10mm인 제브라피쉬의 난소는 충분한 난모세포를 제공하지 못하기 때문에 샘플링 요구 사항을 충족하기 위해 더 많은 수의 물고기가 필요하고 번식 압력이 증가합니다. 반대로, SL이 15mm보다 큰 제브라피쉬는 소화 반응 중에 막이 쉽게 파괴되는 II-III기 난모세포의 점진적인 형성을 나타냅니다. (2) 큰 물고기를 사용하는 경우, 손상된 난모세포에 의한 세포 내용물의 누출로 인해 오염이 발생할 수 있으며, 이로 인해 소화 반응이 어느 정도 억제될 수 있습니다. 이러한 경우 기존 소화 완충액을 제거하고 L-15로 세척한 다음 추가 소화를 위해 새로운 Kinger's cell dissociation solution을 추가하는 것이 좋습니다. (3) 적절한 장비를 사용할 수 있는 경우 분해 중 흔들면 분리가 강화될 수 있습니다.
단계 3.1에서, 더 작은 과립세포는 세포 여과기를 통해 난모세포를 동반할 수 있습니다. 그러나 실제 관찰에 따르면 최종적으로 수집된 난모세포 샘플에는 과립구 세포가 포함되어 있지 않습니다. 불완전한 소화로 인해 일부 난모세포에 잔류 과립구 세포가 존재하는 경우를 제외하고, 다른 Hoechst 표지 과립구 세포는 시스템에서 검출되지 않았습니다. 여기에서 우리는 더 작고 가벼운 과립 세포가 배양 배지에 부유 상태로 남아 있을 수 있으며 이후에 여러 세척 단계에서 제거될 수 있다는 가설을 세웠습니다. 분리 효율은 또한 Hoechst 염색 후 과립세포 부착이 있는 난모세포와 깨끗한 난모세포의 비율을 계산하여 정량화했습니다. 1000개의 난모세포를 포함하는 샘플에서 최대 98%의 깨끗한 난모세포 비율이 관찰되었습니다.
많은 장점에도 불구하고 제안된 접근 방식에는 몇 가지 주목할 만한 제한 사항도 있었습니다. 첫째, 이 방법은 DNA 또는 RNA 추출, 염기서열 분석 및 온전한 살아있는 세포의 즉각적인 검출에 대해 검증되었지만 다른 분석 영역으로 확장할 수 있는 타당성과 신뢰성은 아직 검증되지 않았습니다. 또 다른 제한 사항은 제안된 방법이 다른 단계에 대한 분리 효율이 만족스럽지 않기 때문에 I기 난모세포를 분리하는 데만 적용할 수 있다는 것입니다. 따라서, 제안된 방법의 효율성과 적용성을 향상시키기 위한 추가적인 노력이 요구된다. 또한 향후 연구는 제안된 방법을 적용하여 난모세포를 다른 단계에서 효율적으로 분리하여 적용 가능성을 확대할 수 있는지 여부를 탐구하는 데 중점을 두어야 합니다.
저자는 밝힐 것이 없습니다.
이 연구는 중국국가자연과학재단(32170813, 31871449)과 쓰촨성 과학기술부(2024NSFSC0651)의 지원을 받았으며, 쓰촨대학교 화화병원 1·3·5 우수분야 프로젝트(2024HXFH035)가 수행했다. 저자들은 이 연구와 관련된 제브라피시 사육에 대해 소아외과 연구소의 Zhao Wang과 Yanqiu Gao에게 감사의 뜻을 전합니다. 저자들은 또한 본 검토에 참여한 모든 검토자들과 이 원고를 준비하는 동안 영어 편집 서비스를 제공해준 MJEditor(www.mjeditor.com)에게도 감사의 뜻을 전한다.
| 이름 | 회사 | 카탈로그 번호 | 댓글 |
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| Kinger의 세포 해리 솔루션 | PlantChemMed | PC-33689 | Kinger의 세포 해리 솔루션은 -20°C에서 안정적으로 저장할 수 있습니다. C는 포장 후 저온에서 해동한 후 사용할 수 있습니다(4°C; C). 그것은 제브라피쉬 난소를 해리시키는데 직접적으로 사용될 수 있습니다. 최적 온도는 28.5°C입니다. C, 약 2-3시간 동안. 지속 시간은 특정 해리 조건에 따라 단축 또는 연장(https://www.plantchemmed.com/chanpin?productNo=PC-33689)으로 조정할 수 있습니다. |
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