여기에서 현탁액 HEK293 셀 기반 AAV 생산 프로토콜이 제시되어 상용 공급업체에서 연구 목적으로 사용할 수 있는 구성 요소를 사용하여 벡터 생산에 필요한 시간과 노동력을 줄일 수 있습니다.
방법 논문
여기에서 현탁액 HEK293 셀 기반 AAV 생산 프로토콜이 제시되어 상용 공급업체에서 연구 목적으로 사용할 수 있는 구성 요소를 사용하여 벡터 생산에 필요한 시간과 노동력을 줄일 수 있습니다.
아데노 관련 바이러스 벡터(AAV)는 중추신경계(CNS)를 조사하기 위한 놀라운 도구입니다. AAV와 같은 혁신적인 캡시드. PHP.eB, 생쥐에 정맥 주사를 통한 CNS의 광범위한 transduction을 보여줍니다. 비교 가능한 형질도입을 달성하려면 중추신경계 실질에 직접 주입하는 것과 비교하여 100배 더 높은 역가(최소 1 x 1011 게놈 복제/마우스)가 필요합니다. 우리 그룹에서는 AAV를 포함한 AAV 생산. PHP.eB는 부착 HEK293T 세포와 삼중 형질 주입 방법에 의존합니다. 부착 세포로 높은 AAV 수율을 달성하려면 노동 및 재료 집약적인 공정이 수반됩니다. 이러한 제약은 원뿔형 튜브에서 현탁 기반 세포 배양을 위한 프로토콜의 개발을 촉진했습니다. 부착 세포에서 생성된 AAV를 현탁액 생산 방법과 비교했습니다. 형질주입 시약인 폴리에틸렌이민 또는 TransIt을 이용한 현탁액에서의 배양을 비교하였다. AAV 벡터는 요오딕사놀 그래디언트 초원심분리에 의해 정제된 후 원심 필터를 사용하여 완충액 교환 및 농축에 의해 정제되었습니다. 부착 방법을 사용하면 평균 2.6 x 1012 게놈 사본(GC)을 얻을 수 있는 반면, 현탁법과 폴리에틸렌이민은 총 7.7 x 1012 GC를, TransIt은 총 2.4 x 1013 GC를 산출했습니다. 부유세포 시스템과 비교하여 부착체로 생산된 벡터 간의 in vivo transduction 효율에는 차이가 없습니다. 요약하면, 현탁액 HEK293 셀 기반 AAV 생산 프로토콜이 도입되어 벡터 생산에 필요한 시간과 노동력을 줄이는 동시에 연구 목적으로 상용 공급업체에서 제공하는 구성 요소를 사용하여 3배에서 9배 더 높은 수율을 달성할 수 있습니다.
아데노 관련 바이러스(AAV)는 1965년에 발견되었으며 이후 수많은 응용 분야에서 사용되고 있습니다1. AAV는 유전자 및 신경 기능을 연구하거나, 신경 회로를 매핑하거나, 질병에 대한 동물 모델을 생성하기 위해 신경 과학 연구에 적용되었습니다2. 전통적으로, 이것은 대부분의 자연적인 혈청형이 혈액 뇌 장벽을 통과하지 않거나 그렇게 하기 위하여 과다 복용을 필요로 하지 않기 때문에, 관심사의 위치에 직접 주사해서 행해집니다 1,2,3.
AAV의 발견과 함께. PHP.B4 및 AAV와 같은 차세대 캡시드. PHP.eB5 및 AAV. CAP-B106의 경우, 간단한 전신 주사를 사용하여 중추신경계(CNS)를 표적으로 할 수 있습니다. 공간 매핑은 AAV의 표적이 되는 세포를 보여줍니다. 셀룰러 수준 6,7의 PHP.eB. 특정 프로모터/인핸서와 함께 이러한 캡시드는 신경과학자들이 비침습적 AAV 전달을 통해 유전자 및 뇌 기능을 연구할 수 있는 광범위한 기회를 제공합니다 4,8.
AAV에는 더 낮은 용량이 필요합니다. AAV9 (4 x 1012 GC/mouse)7에 비해 PHP.eB(일반적으로 1 - 5 x 1011 게놈 사본(GC)/mouse)는 직접 주입 전략(일반적으로 1 x 109 GC/μL 주입)에 비해 더 많은 벡터를 생성해야 합니다. 대부분의 천연 혈청형은 요오드릭산올 정제 9,10,11,12와 함께 고전적인 부착 세포 배양 시스템을 사용하여 생산할 수 있습니다. AAV의 경우. PHP.eB 이것은 하나의 실험에 충분한 벡터를 얻기 위해 세포를 배양하고 transfection하는 노동 집약적인 과정을 수반한다8. 따라서, 원뿔형 튜브의 부유 세포 배양에서 AAV의 생산이 개발되었습니다. 최대 300mL 용량의 코니컬 튜브는 크기가 작아 인큐베이터 공간과 플라스틱을 모두 절약할 수 있습니다. 부유 세포는 15cm 플레이트의 부착 세포보다 배양 및 대량으로 처리하기가 훨씬 쉽습니다. 프로토콜의 transfection 구성 요소는 동일하게 유지됩니다. 따라서, 이전에 부착 시스템과 함께 사용되었던 플라스미드는 현탁 세포에서의 생산에 기초하여 이 프로토콜에서 쉽게 사용될 수 있습니다. 이 프로토콜은 실험실의 다른 연구원들에게 성공적으로 이전되어 다양한 캡시드 및 구조물에 성공적으로 사용되었습니다.
모든 실험 절차는 네덜란드 왕립 과학 아카데미(KNAW)의 기관 동물 관리 및 사용 위원회의 승인을 받았으며 프로젝트 번호 AVD8010020199126에 따라 동물 실험에 관한 네덜란드 법률을 따랐습니다. 그림 1에는 전체 프로토콜에 대한 개략적인 개요가 나와 있습니다. 세포 파종에서 AAV 정제에 이르기까지 프로토콜을 완료하는 데 6일이 걸립니다.
1. 시약 준비
2. HEK293 부유세포 배양
3. 형질주입
4. 세포 채취
5. 요오딕사놀 정화
대부분의 학술 실험실은 AAV 생산을 위해 부착 HEK293T 세포를 사용합니다 8,9. 이는 직접 주입에 소량의 AAV가 필요할 때 비교적 잘 작동하지만, AAV와 같은 전신 캡시드와 유사한 transduction을 달성하려면 100배 더 높은 titer(최소 1 x 1011 GC/mouse)가 필요합니다. PHP.eB입니다.
이 프로토콜에서는 원뿔형 튜브에서 배양된 현탁액 HEK293 세포를 사용하여 AAV를 생산했습니다. 소규모 배양은 50mL 튜브에서, 대규모 배양은 600mL 튜브에서 수행할 수 있습니다. 특정 Shaker(재료 표 참조)의 경우 최대 16개의 대형 튜브를 동시에 배양할 수 있는 랙을 사용할 수 있습니다. 이 랙은 50 mL 튜브용 특수 인서트와 함께 사용됩니다(그림 2A). 이 시스템은 이 프로토콜의 배양 및 형질주입 부문에 상당한 시간 이득을 제공합니다. 생산의 초기 설정은 루시페라아제 및 녹색 형광 단백질(GFP)10,11에 대한 리포터 구성으로 수행되었습니다. 병행하여, GFP 작제물은 이전에 공표된 프로토콜12에 기술된 바와 같이 12, 15cm2 플레이트로 제조하였다. 평균적으로 폴리에틸렌시민(PEI)을 사용하여 총 7.7 x 1012 GC의 수율을 달성하고 TransIt을 사용하여 2.4 x 1013 GC를 달성했습니다(그림 2B). PEI의 경우, 이는 거의 3배의 개선입니다. TransIt의 경우 부착 배양으로 얻은 역가(2.6 x 1012)에 비해 9.2배 개선되었습니다. 부유 세포를 transfection하는 데 사용할 경우 TransIt은 PEI에 비해 수율이 약 3배 향상됩니다(그림 2B).
이어서, AAV 벡터의 성능을 in vivo에서 테스트하였다. GFP 벡터는 PEI 및 TransIt으로 제작되었으며 고전적 부착 시스템으로 생성된 GFP 벡터와 비교되었습니다. 주입 후 4 주에, 마우스 (6 주 C57BL / 6 암컷 마우스 무게 20-25 g)는 희생되고, 마우스의 뇌에서 GFP 발현은 조직학 (그림 3A)에 의해 평가되었습니다. 시상 뇌 절편에 대한 비교 분석이 수행되었습니다. 이러한 생산 방법을 사용하여 생산된 바이러스의 형질도입 패턴에서는 차이가 관찰되지 않았습니다(그림 3B). 두 방법 중 하나를 사용하여 생성된 벡터의 루시페라아제 활성도 평가되었습니다. 형질도입은 3주 동안 생체내에서 측정하였다; 시간 경과에 따른 발현 패턴은 어떤 transfection 시약을 사용하든 유사합니다(그림 4).
다음으로, 프로토콜은 팀의 다른 구성원에 의해 테스트되고 구현되었습니다(표 2). PEI를 이용한 다른 캡시드 생산은 성공적이었으며, 평균 수율은 3.5 x 1012 GC 벡터였습니다. 캡시드 B10 생산의 경우, PEI에 비해 TransIt을 사용하면 3배 개선을 달성할 수 있습니다. 또 다른 프로젝트의 경우, AAv.PHP.eB로 패키징된 여러 작제물은 3.7 x 1012의 평균 수율을 나왔는데, 이는 마우스당 5 x 1011 GC의 용량으로 7마리의 마우스를 정맥 주사하기에 충분하다. 이러한 결과는 여러 연구자들이 다양한 캡시드 및 구성 조합을 위해 프로토콜을 성공적으로 사용할 수 있음을 보여줍니다.

그림 1: 생산의 개략도. 1일차(D1)에 세포를 300mL 튜브에서 배양합니다. 2일차(D2)에 세포는 관련 플라스미드로 transfection됩니다. 5일째(D5)에 세포를 수확하고 10x 트윈 용해 완충액을 사용하여 용해합니다. 용해 후 세포 파편은 원심분리를 통해 제거됩니다. 이어서, 세포 용해물을 여과하여 큰 단백질을 제거하고, 폴리에틸렌 글리콜(PEG) 8000을 사용하여 AAV 바이러스를 침전시킨다. 6일째(D6)에 요오딕산올 정제 및 농축을 실시한다. 전날의 PEG 농축액을 DNase로 처리한 후 요오드릭산올 구배를 통해 배치합니다. 정제된 벡터는 이어서 탈염되고 원심 필터를 사용하여 농축됩니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 2: 인큐베이터 설정 및 AAV 수율. (A) 바이러스 생산 세포는 진탕 직경이 50cm인 진탕 인큐베이터에서 배양됩니다. 이 인큐베이터에는 메카트로닉스 부서에서 생산한 600 mL 튜브용 어댑터 플레이트와 50 mL 튜브용 특수 인서트가 장착되어 있습니다. (B) 초기 설정 후, 리포터는 폴리에틸렌이민(PEI; 7.7 x 1012 GC total, n=5) 또는 TransIt(2.4 x 1013 GC total, n=5)을 형질주입 방법으로 사용하고 Verhaagen et al.12에 설명된 바와 같이 고전적 부착 방법(2.6 x 1012 GC total, n=5)으로 달성한 수율과 비교합니다. 데이터는 평균 ± 표준 편차로 표시됩니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 3: in vivo 평가 후 GFP 발현 패턴. (A) 유비쿼터스 프로모터 CMV 즉시-조기 인핸서, 닭 β-액틴 프로모터 및 토끼 β-글로빈 스플라이스 수용체 부위(CAG)에 이어 녹색 형광 단백질(GFP), 우드척 간염 바이러스(WHV) 전사 후 조절 요소(WPRE) 및 폴리아데닐화 꼬리(pA)를 포함하는 전형적인 AAV 벡터 구조체의 개략도 13. 여기서, 6주령 암컷 마우스(n=3)는 5 x 1011 총 게놈 사본(gc)/마우스를 포함하는 꼬리 정맥 주사를 받았다. 주입 후 4주에, 마우스를 희생시키고, 조직학에 의해 뇌를 분석하였다. (B) 폴리에틸렌이민(PEI) 또는 TransIt 형질주입 시약이 있는 부착 HEK293T 세포 및 현탁 세포를 사용하여 시상 절편에서의 형질도입 패턴의 대표적인 묘사는 사용된 생산 방법에 관계없이 유사한 형질주입 패턴이 관찰됩니다. 스케일 바 = 1000 μm. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 4: transfection 방법에 관계없이 유사한 루시페라아제 활성. (A) 유비쿼터스 프로모터 CMV 즉시-조기 인핸서, 닭 β-액틴 프로모터, 및 토끼 β-글로빈 스플라이스 수용체 부위(CAG) 루시페라아제(LUC)를 V5 태그 및 소 성장 호르몬 폴리아데닐화 꼬리(BGHpA)와 함께 포함하는 데 사용된 작제물의 개략도, 5 x 1011 GC 합계/마우스(n=3)를 꼬리 정맥을 통해 주입하고, 두개골 영역에서의 루시페라아제 활성(빨간색 원, 예시 이미지에서)를 생물 발광 이미지로서 매주 측정하였다. (B) 생물 발광 활성은 상대 발광 단위(RLU)로 측정되었으며, PEI 생산의 경우 파란색 막대, TransIt의 경우 갈색 막대로 표시되었습니다. 선택된 뇌 영역의 루시페라아제 활성에 유의한 차이는 그룹 간에 관찰되지 않았습니다. 데이터는 평균 ± 표준 편차로 표시됩니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
표 1: Transfection 파라미터. 이 표를 다운로드하려면 여기를 클릭하십시오.
표 2: 구현된 프로토콜의 수율. 다른 연구원들이 AAV를 생산하기 위해 사용하는 현탁 프로토콜. 이 표를 다운로드하려면 여기를 클릭하십시오.
AAV의 전신 투여는 중추신경계로의 유전자 전달을 위한 강력한 도구입니다. 그러나 AAV의 생산은 비용이 많이 들고 힘든 과정입니다. 부유 셀을 사용하면 15cm2 플레이트에 HEK293T 부착 배양에 비해 노동력과 플라스틱이 줄어 듭니다. 또한 여기에 구현된 원뿔형 튜브는 다루기 쉽고 실험실 공간 사용을 극대화합니다. 이 프로토콜은 두 명의 연구원에 의해 설정되었으며 이후 실험실의 다른 사람들에 의해 적용되었습니다. 3명의 독립적인 연구원에 의한 일련의 생산은 평균적으로 배치당 6-7마리의 마우스를 주입하기에 충분한 벡터를 산출했습니다.
HEK293 부유 전지의 사용은앞서 13,14에서 설명되었습니다. 그러나, 기술된 부유 세포주는 연구 목적으로 자유롭게 이용할 수 없다. 이것은 설명된 방법을 적용할 때 학술 연구자들에게 병목 현상입니다. 이 프로토콜에 기술된 부유 세포주는 연구 목적으로 자유롭게 사용할 수 있습니다. 부유 세포의 배양은 공간과 시간을 절약하기 위해 Erlenmeyer의 튜브 대신 원뿔형 튜브에서 수행되었습니다. Erlenmeyer's를 사용하면 최대 4개의 생산물을 동시에 배양할 수 있는 반면, 원뿔형 튜브를 사용하는 12개의 생산물을 배양할 수 있습니다. 원뿔형 튜브는 수확을 위해 원심분리기로 직접 옮길 수 있습니다.
부유 세포 배양 시스템의 한 가지 대안은 바큘로바이러스 시스템입니다. 바큘로 시스템의 장점은 이러한 세포와 배지를 공개적으로 사용할 수 있고 쉽게 적용할 수 있다는 것입니다. 학계의 경우, 바로 사용할 수 있는 AAV transfer plasmids12의 대규모 라이브러리를 포함하는 Addgene과 같은 리포지토리를 사용할 수 있습니다. 여기에는 결함이 있는 ITR과 같은 주의 사항이 있을 수 있지만 플러그 앤 플레이 실험을 위한 좋은 소스 역할을 합니다. HEK293 기반 생산 시스템을 유지하기로 결정했는데, 이는 사용 가능한 플라스미드가 바큘로바이러스로 구축물을 옮기지 않고 생산에 직접 사용될 수 있기 때문입니다.
transfection의 경우, polyethyleneimine은 상대적으로 저렴하며, 따라서 선택되는 transfection 시약입니다. 대안으로, 벡터의 수율을 증가시키기 위해 새로운 transfection 방법(TransIt)을 평가했습니다. 플라스미드 양의 절반을 사용하여 3배의 개선이 관찰되었습니다. 따라서 TransIt은 더 많은 재고가 필요할 때 흥미로운 대체 transfection 시약이 됩니다. 이것의 한계는 비용으로, 작은 배치에 대한 흥미를 떨어뜨립니다.
요약하면, 여기에서는 학술 실험실 환경에서 부유 세포에서 고수율 AAV를 생성하는 데 사용할 수 있는 프로토콜을 제시합니다. 높은 수율로 AAV를 생산하기 위해 학술 실험실 환경에서 사용할 수 있는 도구가 설명되어 있습니다.
Mirus는 초기 테스트를 위해 TransIT의 무료 샘플을 제공했으며, 그 후 추가 사용을 위해 시약을 구입했습니다. 저자는 보고할 다른 경쟁적인 재정적 이해관계가 없습니다.
이 연구는 네덜란드 왕립 예술 과학 아카데미(KNAW) 연구 기금과 Start2Cure(0-TI-01)의 보조금으로 지원되었습니다. 프로토콜 설정에 대한 의견과 조언을 해주신 Leisha Kopp에게 감사드립니다. 피규어는 Biorender를 사용하여 생성되었습니다.
| 이름 | 회사 | 카탈로그 번호 | 댓글 |
|---|---|---|---|
| 39 mL, 퀵-씰 라운드-탑 폴리프로필렌 튜브, 25 x 89 mm - 50Pk | Beckman Coulter | 342414 | |
| 어댑터 600 mL 원뿔형 튜브, 로터 S-4x1000용, | eppendorf | 5920701002 | |
| Adapter Plate, 600 ml | Infors HT/ TPP | 587633 | |
| , 750 mL 원형 버킷 | eppendorf | 5820747005 | |
| Centrifuge 5920 R G, 230 V, 50-60 Hz, 로터 S-4x1000, 원형 버킷 및 어댑터 15 mL/50 mL conical tube 포함 | eppendorf | 5948000315 | |
| Distilled Water | Gibco | ||
| DNase I 재조합, RNase-free | Roche | 4716728001 | |
| DNase I 재조합, RNase-free | Roche | 4716728001 | |
| DPBS, 칼슘, 마그네슘 | Gibco | 14040091 | |
| DPBS, 칼슘 없음, 마그네슘 | 없음 Gibco | 14190144 | |
| Fisherbrand 일회용 PES 필터 유닛 0,2 | Fisher | ||
| Fisherbrand 일회용 PES 필터 유닛 0,45 | |||
| 홀더는 팔콘 튜브에도 맞습니다 | Infors HT/ TPP | 31362 | |
| 600ml 세포 배양 튜브용 홀더 | Infors HT/ TPP | 66129 | |
| 인큐베이터 Minitron 50mm | Infors HT | 500043 | |
| LV-MAX 생산 매체 | Gibco | ||
| N-Tray Universal | Infors HT/ TPP | 31321 | |
| OptiPrep - Iodixanol | Serumwerk bernburg | 1893 | |
| PEI MAX - Transfection Grade Linear Polyethylenimine Hydrochloride (MW 40,000) | Poly-sciences | 24765-100 | |
| Phenol red solution | 시그마-알드리치 | 72420100 | |
| 폴리(에틸렌 글리콜) 8000 | 시그마-알드리치 | 89510 | |
| TransIT-VirusGEN | mirus | Mir 6706 | |
| 트리판 블루 솔루션, 0.4% | Gibco | 5250061 | |
| TubeSpin 생물반응기-50ml | TTP | 87050 | |
| TubeSpin 생물반응기-600ml | TTP | 87600 | |
| 바이러스 생산 세포: | Gibco | A35347 | |
| Vivaspin, 20 MWCO 100 000 | Cytvia | 28932363 |
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