이 프로토콜은 모델 막 단백질을 지질 이중층으로 합성하고 통합하는 연구를 위해 거대 단층 소포(GUV) 내에 CFE(cell-free expression) 시스템을 캡슐화하는 데 사용되는 역에멀젼 방법을 설명합니다.
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이 프로토콜은 모델 막 단백질을 지질 이중층으로 합성하고 통합하는 연구를 위해 거대 단층 소포(GUV) 내에 CFE(cell-free expression) 시스템을 캡슐화하는 데 사용되는 역에멀젼 방법을 설명합니다.
CFE(Cell-Free Expression) 시스템은 합성 세포의 생체 감지 및 에너지 재생과 같은 세포 기능의 생체 모방을 가능하게 하는 합성 생물학의 강력한 도구입니다. 그러나 광범위한 세포 과정을 재구성하려면 막 단백질을 합성 세포의 막으로 성공적으로 재구성해야 합니다. 용해성 단백질의 발현은 일반적으로 일반적인 CFE 시스템에서 성공적이지만, 합성 세포의 지질 이중층에서 막 단백질을 재구성하는 것은 어려운 것으로 입증되었습니다. 여기에서는 합성 세포 내부의 CFE 반응의 캡슐화 및 배양을 기반으로 모델 합성 세포로서 거대 단층 소포체(GUV)에서 모델 막 단백질인 박테리아 글루타메이트 수용체(GluR0)를 재구성하는 방법을 시연합니다. 이 플랫폼을 활용하여 GluR0의 N-말단 신호 펩타이드를 프로테오로돕신 신호 펩타이드로 치환하는 것이 GluR0를 하이브리드 GUV의 막으로의 성공적인 동시 번역 전위에 미치는 효과를 입증합니다. 이 방법은 합성 세포에서 다양한 막 단백질의 세포 없는 재구성을 허용하는 강력한 절차를 제공합니다.
상향식 합성생물학은 지난 10년 동안 생명공학, 약물 전달 및 재생 의학 분야에서 수많은 잠재적 응용 분야가 있는 신흥 분야로 점점 더 많은 관심을 받고 있습니다 1,2. 특히 상향식 합성생물학의 초석으로서의 합성세포의 개발은 합성세포의 유망한 응용과 체외 생물물리학 연구를 용이하게 하는 세포와 같은 물리적, 생화학적 특성으로 인해 광범위한 과학계를 매료시켰습니다 3,4,5,6 . 합성 세포는 종종 다양한 생물학적 과정이 재현되는 세포 크기의 거대 단층 소포(GUV)에서 엔지니어링됩니다. 세포 세포골격재구성 (Reconstitution of cell cytoskeleton) 7,8, 광 의존 에너지 재생 (light-dependent energy regeneration) 9, 세포 통신(cellular communication) 10,11 및 생체 감지 (biosensing12)는 합성 세포에서 세포와 같은 행동을 재구성하기 위한 노력의 예입니다.
일부 세포 과정은 용해성 단백질에 의존하지만, 감지 및 통신과 같은 자연 세포의 많은 특성은 종종 이온 채널, 수용체 및 수송체를 포함한 막 단백질을 사용합니다. 합성 세포 개발의 주요 과제는 막 단백질의 재구성입니다. 지질 이중층에서 막 단백질을 재구성하는 기존의 방법은 세제 매개 정제에 의존하지만, 이러한 방법은 힘들고 발현 숙주에 독성이 있는 단백질에는 비효율적이거나 GUV의 막 단백질 재구성에 적합하지 않은 경우가 많습니다13.
단백질 발현을 위한 대체 방법은 무세포 발현(CFE) 시스템입니다. CFE 시스템은 세포 용해물 또는 정제된 전사-번역 기계를 사용하여 다양한 단백질의 시험관 내 발현을 가능하게 하는 합성 생물학의 강력한 도구였습니다14. CFE 시스템은 또한 GUV에 캡슐화될 수 있으므로 광 수확 합성 세포9 또는 기계감응성 바이오센서(15,16)의 생성과 같은 다양한 응용 분야에 대해 프로그래밍할 수 있는 구획화된 단백질 합성 반응을 가능하게 합니다. 재조합 단백질 발현 방법과 유사하게, 막 단백질 발현은 CFE 시스템에서 까다롭습니다17. CFE 시스템의 응집, 잘못된 접힘 및 번역 후 변형 부족은 CFE 시스템을 사용한 성공적인 막 단백질 합성을 방해하는 주요 병목 현상입니다. CFE 시스템을 사용한 상향식 막 단백질 재구성의 어려움은 부분적으로 신호 펩타이드, 신호 인식 입자, translocons 및 chaperoning 분자에 의존하는 복잡한 막 단백질 생물 발생 경로가 없기 때문입니다. 그러나 최근 여러 연구에서 번역 중 마이크로솜 또는 리포솜과 같은 막성 구조의 존재가 성공적인 막 단백질 발현을 촉진한다고 제안했습니다 18,19,20,21. 게다가, Eaglesfield et al. 및 Steinküher et al.은 막 단백질의 N-말단에 신호 펩티드로 알려진 특정 소수성 도메인을 포함하면 그 발현을 크게 향상시킬 수 있음을 발견했습니다22,23. 이러한 연구는 GUV 멤브레인의 존재 하에서 단백질 번역이 발생하고 적절한 N-말단 신호 펩타이드가 활용되면 합성 세포에서 막 단백질 재구성의 문제를 극복할 수 있음을 시사합니다.
여기에서는 GUV에서 막 단백질 재구성을 위한 재조합 요소(PURE) CFE 반응을 사용하여 단백질 합성을 캡슐화하기 위한 프로토콜을 제시합니다. 박테리아 글루타메이트 수용체24 (GluR0)를 모델 막 단백질로 선택하고 N-말단 신호 펩타이드가 막 재구성에 미치는 영향을 연구합니다. Eaglesfield et al.22에 의해 막 단백질 재구성 효율이 향상되는 것으로 밝혀진 프로테오호돕신 신호 펩타이드의 효과는 PRSP-GluR0로 표시된 GluR0의 돌연변이 변이체를 구성하고, 그 발현 및 막 국소화를 본래 신호 펩타이드를 품고 있는 야생형 GluR0(이하 WT-GluR0라고 함)로 비교하여 조사합니다. 이 프로토콜은 CFE 캡슐화를 위해 견고하게 만드는 변형을 가미한 반전 에멀젼 방법(inverted emulsion method)(25)을 기반으로 한다. 제시된 방법에서, CFE 반응은 먼저 CFE 시스템을 포함하고 지질 단층에 의해 안정화되는 미크론 크기의 액적을 생성하는 지질 내 오일 용액을 사용하여 유화됩니다. 그런 다음 에멀젼 방울은 다른 지질 단층으로 포화된 오일-물 계면 위에 층을 이룹니다. 그런 다음 에멀젼 방울은 원심력을 통해 오일-물 계면을 가로질러 이동하게 됩니다. 이 과정을 통해 액적은 또 다른 단층을 얻어 이중층 지질 소포를 생성합니다. 그런 다음 CFE 반응을 포함하는 GUV를 배양하고, 그 동안 막 단백질이 발현되어 GUV 막에 통합됩니다. 이 프로토콜은 GluR0의 cell-free 발현을 위해 지정되었지만, 다른 막 단백질의 cell-free synthesis 또는 cytoskeleton reconstitution 또는 membrane fusion studies와 같은 다른 synthetic cell 응용에 사용할 수 있다26.
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이 연구에 사용된 시약 및 장비는 재료 표에 나와 있습니다.
1. 작은 단층 소포(SUV)가 있는 경우 벌크 CFE 반응
2. GUV에 캡슐화된 CFE 반응
3. 캡슐화된 CFE 반응 배양 및 이미징
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CFE 반응을 캡슐화하기 전에, 네이티브 및 프로테오로돕신 신호 펩타이드(신호 펩타이드 서열은 보충 표 1에 제시됨)를 함유하는 GluR0-sfGFP의 두 가지 변형체와 용해성 sfGFP를 벌크 반응에서 개별적으로 발현하고, 플레이트 리더를 사용하여 sfGFP 신호를 검출하여 발현을 모니터링했습니다(그림 2A). 막 단백질은 100nm SUV의 부재 또는 존재 하에서 발현하였다. 또한, sfGFP 신호를 그 농도와 상관시키는 보정 곡선을 사용하여(보충 그림 1), 합성된 단백질의 농도를 추정하였다(보충 표 2). 분명히, 용해성 sfGFP는 세 가지 단백질 중에서 가장 높은 발현을 보였는데, 이는 막 단백질의 발현이 CFE 시스템에 부담을 주어 반응을 늦추고 수율을 낮춘다는 것을 시사합니다. 또한, 평균적으로 SUV가 있는 상태에서 막 단백질을 발현하는 반...
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세포 신호 전달 또는 세포 여기와 같이 세포막을 통한 분자 또는 정보의 전달에 의존하는 거의 모든 세포 과정에는 막 단백질이 필요합니다. 따라서 막 단백질의 재구성은 다양한 응용 분야에 대한 다양한 합성 세포 설계를 구현하는 데 있어 주요 병목 현상이 되었습니다. 생체막에서 막 단백질의 전통적인 세제 매개 재구성에는 부드러운 팽창 또는 전기 형성과 같은 GUV 생성 방법이 필요합니다. 팽윤 접근법은 일반적으로 작은 크기의 소포를 생성하며, 합성 세포를 생성할 때 종종 발생하는 복잡한 용액이 캡슐화될 때 전기형성 수율이 크게 떨어집니다32. 또한, 세제는 막 단백질을 용해시키며, 재구성 과정에서 세제가 제거되면 단백질이 잘못 접힐 수 있습니다33,34. 반면에, 여기에 제시된 접근법은 막 단백질이 지질 이중층으로의 동시 번역 통합에 의존하며, 이는세포 ...
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저자는 이해 상충이 없음을 선언합니다.
APL은 미국 국립과학재단(National Science Foundation, EF1935265), 미국 국립보건원(National Institutes of Health, R01-EB030031 및 R21-AR080363), 육군 연구실(Army Research Office, 80523-BB)의 지원을 인정합니다
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