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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
이 프로토콜은 전체 췌장에서 마우스 내피 세포를 분리하는 방법을 설명합니다.
췌장은 신체 내에서 신진대사 균형을 유지하는 데 중요한 기관이며, 부분적으로는 인슐린과 글루카곤과 같은 대사 호르몬과 소화 효소의 생성으로 인해 발생합니다. 췌장은 또한 고도로 혈관화된 기관으로, 췌장 모세혈관의 복잡한 네트워크에 의해 촉진되는 특징입니다. 이 광범위한 모세혈관 네트워크는 췌장 발달 및 기능에 중요한 고도로 창공된 내피 세포(EC)로 구성됩니다. 따라서 EC의 기능 장애는 당뇨병 및 암과 같은 질병에서 췌장의 기능 장애에 기여할 수 있습니다. 따라서 췌장 ECs(pECs)의 기능을 연구하는 것은 췌장 생물학을 이해하는 것뿐만 아니라 그 병리학을 개발하는 데에도 중요합니다. 마우스 모델은 대사 및 심혈관 질환을 연구하는 데 유용한 도구입니다. 그러나 EC의 개체수가 상대적으로 적고 acinar 조직에서 잠재적으로 방출될 수 있는 풍부한 소화 효소로 인해 세포 손상으로 이어질 수 있으므로 마우스 pEC의 분리에 대해 설명되는 충분한 세부 정보가 포함된 확립된 프로토콜이 없습니다. 이러한 문제를 해결하기 위해 우리는 부드러운 물리적, 화학적 해리와 항체 매개 선택을 결합하여 마우스 pEC를 농축하고 회수하는 프로토콜을 고안했습니다. 여기에 제시된 프로토콜은 전체 마우스 췌장에서 온전하고 실행 가능한 EC를 추출하는 강력한 방법을 제공합니다. 이 프로토콜은 다중 다운스트림 분석에 적합하며 다양한 마우스 모델에 적용할 수 있습니다.
신진대사 조절과 항상성의 핵심인 췌장은 고도로 혈관화된 기관입니다. 췌장은 내분비와 외분비 기능을 모두 가지고 있어 각각 혈당과 소화 효소의 조절을 조절합니다. 이 두 구획은 췌장 혈관의 광범위한 네트워크로 함께 연결되어 산소, 호르몬 및 효소의 교환 및 운반을 촉진합니다. 결정적으로, 이 조밀한 모세혈관 네트워크는 글루카곤 분비 알파(α) 세포, 인슐린 분비 베타(β) 세포 및 소마토스타틴 분비 델타(δ) 세포 1,2로 구성된 췌장 내 호르몬 조절 세포 클러스터인 랑게르한스 섬을 관통합니다. 이 섬은 췌장 질량의 1-2%에 불과하지만 총 혈류의 20%를 받으며3 이는 섬 혈관 구조의 중요성을 강조합니다. 췌장 모세혈관은 주로 벽화 주피세포(pericyte)로 둘러싸인 고도로 창호화된 내피 세포(EC)로 구성되어 있습니다. 이러한 모세관 EC는 섬의 발달, 성숙 및 (기능 장애)에 중요한 역할을 하며 다양한 내분비 세포 및 외분비 세포와 밀접한 누화를 형성합니다4 (그림 1).
내피 기능 장애는 제1형 당뇨병과 제2형 당뇨병 모두에서 관찰되었으며, 이는 췌장 섬 기능 장애로 인해 발생하는 가장 흔한 질환입니다 5,6. 섬의 미세혈관 밀도와 형태는 모두 당뇨병에서 바뀔 수 있다7. 더욱이, 당뇨병으로도 나타날 수 있는 매우 공격적인 종양인 췌장암은 높은 미세혈관 밀도와 낮은 관류를 특징으로 한다8. 정상 췌장 조직과 질병이 있는 췌장 조직 모두에서 EC의 중추적인 구조적 및 기능적 역할을 감안할 때, 건강이나 질병을 유발하는 메커니즘을 밝히기 위해 발달, 생리학 및 병리학 분야에서 pEC를 연구할 필요가 있습니다.
서로 다른 쥐(예: 뇌 9,10, 폐11, 심장12, 간13, 골격근14, 지방 조직(15)와 인간(예: 뇌16, 내장 지방 조직17,18, 말초 신경19, 폐20,21,22 및 장간막 동맥23)에서 EC를 분리하기 위한 수많은 프로토콜이 개발되었습니다) 조직. 이러한 프로토콜은 일반적으로 효소 분해(예: 콜라겐분해효소, 트립신 24, 디스파제24,25 및 리베라제26)의 사용과 항체 기반 농축 단계를 포함합니다. 더욱이, 이러한 프로토콜은 37°C에서 격렬한 교반과 함께 고농도의 효소에서 장시간 소화에 의존하는 경향이 있습니다(표 1). 췌장에는 과다한 내인성 소화 효소가 있다는 것을 포함한 췌장의 독특한 특성으로 인해 이러한 기존 프로토콜은 pEC를 분리하는 데 직접 적용할 수 없습니다. 첫째, 췌장의 세포외 기질(ECM) 구성이 다른 조직과 다릅니다. 콜라겐 분해 효소는 EC 분리에 일반적으로 사용되지만, 서로 다른 조직 특이적 해리 기능을 가진 여러 하위 유형이 있으므로 최적화가 필요합니다. 둘째, pEC 분리에 중요한 것은 췌장 내인성 효소의 방출 및 활성화가 분리 과정을 크게 방해할 수 있다는 것입니다. 이를 위해 외분비 아시나르 세포(zymogens, protease, RNase27의 주요 공급원)의 파열을 최소화하기 위해 주의를 기울여야 하는데, 이는 추가적인 세포 손상을 유발하고 세포 생존율을 낮추고 전반적인 회복율에 영향을 미칠 수 있다 27,28,29.
이러한 문제를 해결하기 위해 기존 EC 분리 프로토콜의 방법을 채택하고 마우스 췌장에서 EC 분리에 적합한 새로운 프로토콜을 수립했습니다. 구체적으로, 여기에서는 콜라겐분해효소 유형 I(일반적으로 폐 EC 분리를 위해 구현됨), 낮은 소화 온도 및 교반 없음(췌장 효소 유발 물질의 활성화를 방지하기 위해) 및 DNase30,31,32 보충(DNA 유도 세포사멸 방지 및 세포 생존력 개선을 위해) 및 CD31에 대한 항체를 사용하는 워크플로우(그림 2)를 설명합니다33 (PECAM1, pan-EC 마커). 설명된 프로토콜은 유전자 발현 프로파일링 및 단백질 분석에 사용할 수 있는 마우스 췌장에서 분리된 EC 집단을 생성합니다.
조직 분리는 City of Hope(미국 캘리포니아주 두아르테)에 있는 Beckman Research Institute의 IACUC(Institutional Animal Care and Use Committee)에서 승인한 연구 프로토콜 #17010에 따라 수행되었습니다. 여기서는 Tie-2CreERT2를 사용합니다. 생후 8-12주령에 C57BL/6 배경의 Rosa26-TdTomato 마우스 라인. 이 라인에서, EC는 앞서 설명한 바와 같이 타목시펜으로 유도될 때 TdTomato로 표지됩니다34. 그러나 이 프로토콜은 유전자형과 유전적 배경이 다른 모든 연령대의 성인 마우스에 적용할 수 있습니다.
1. 조직 채취 (예상 시간 : 1-2 시간)
참고: 예상 시간은 동물당 15분이며, 해리 샘플당 최대 3마리의 동물을 모으는 것이 좋습니다.
2. 콜라겐 분해 효소 준비 (예상 시간 : 15-30 분)
3. 소화 (예상 시간 : 40 분-1 시간)
4. 내피 세포(EC) 농축(예상 시간: 2-3시간)
5. pECs 배양
이 프로토콜에 따라, 3개의 마우스 췌장을 풀링할 때 약 2 x 106 개의 살아있는 세포를 얻을 수 있으며, 단일 마우스 췌장에서 750,000개의 세포를 얻을 수 있습니다. EC의 농축을 검증하기 위해 다음과 같은 분석을 수행했습니다: 1) 정량적 PCR: 플로우 스루(FT) 샘플(즉, non-CD31 항체 결합 분획)과 비교하여, EC 분획은 Pecam1 (CD31 인코딩) 및 Kdr (VEGFR2 인코딩) 수치가 현저히 높았고, 두 개의 EC 마커 유전자33 및 췌장 내분비 세포의 전사 인자인 NK6 homeobox 1 (Nkx6.1) 수치가 낮았습니다(그림 4A); 2) 웨스턴 블로팅(western blotting): 3가지 제제(pEC-1-3)의 EC가 풍부한 샘플은 예상 크기(~130kDa)에서 CD31의 강력한 신호를 보여주었습니다. 이에 비해 입력 샘플과 FT 샘플은 최소한의 CD31 신호를 보여주었습니다. 양성 대조군으로서, pEC 세포주인 MS1 세포의 용해물도 강한 CD31 신호를 보였습니다(그림 4B). 3) 트리판 블루 염색: 분리된 세포의 생존율이 약 50%임을 발견했습니다(그림 4C). 4) 발표된 프로토콜에 따른 유세포 분석15 : 살아있는 세포 집단에 대한 게이팅(Gating)을 통해 CD31+ 세포는 88%, TdTomato+ 세포는 76%임을 확인했습니다. 주목할 점은 대부분의 분리된 세포가 CD31과 TdTomato를 동시에 발현한다는 것입니다(그림 4E). 음성 대조군으로, 염색되지 않은 MS1 세포와 IgG로 배양된 MS1은 CD31로 표시된 살아있는 세포를 보여주지 않았습니다. 양성 대조군, 즉 CD31로 염색된 MS1 세포는 100%에 가까운 살아있는 CD31+ 세포를 보여주었습니다(그림 4F). 또한 분리된 세포를 배양하고, 발표된 프로토콜36에 따라 PECAM1의 면역형광 염색을 수행하고, 분리된 세포에서 두 마커의 강력한 신호를 보여 EC의 존재를 암시하는 TdTomato를 이미지화했습니다(그림 4G).

그림 1: 췌장과 췌장섬의 혈관형성에 대한 그림. 췌장 내피 세포(EC)와 섬 내 EC의 그림 묘사. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 2: 워크플로우 개요. 1) 췌장 해부, 2) 기계적 분해, 3) 효소 배양, 4) 원심분리, 5a) 상층액 제거 및 5b) 상층액 제거 및 5b) 6) 및 8) 펠릿 재구성 및 항체 결합, 9) 마이크로비즈 배양, 10) MACS 컬럼 농축, 11) 생존율을 위한 세포 계수, 12) 다운스트림 분석. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 3: 조직 처리 단계. (A) 복강, (B) 고립된 쥐 췌장, (C) 잘린 쥐 췌장의 이미지. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 4: 마우스 췌장에서 분리된 EC 분획의 검증. (A) FT 샘플의 qPCR 및 농축을 위해 CD31을 사용한 농축된 EC 분획. Pecam1 (CD31), Kdr (VEGFR2) 및 Nkx6.1 (췌장 β세포 특이 전사 인자) 33. * t 검정을 기반으로 한 FT와 비교하여 p <0.05를 나타냅니다. n = 각각 3 마리의 마우스로 구성된 3-4 개의 풀링 샘플. (B) CD31의 웨스턴 블로팅. pEC-1-3은 3개의 개별 풀링된 마우스 샘플에서 농축된 EC를 나타냅니다. 30mg의 세포 용해물을 각 레인에 로드한 후 Ponceau S 염색을 수행했습니다. (C) 생존율 분석을 위한 농축 pEC의 세포 계수 및 트리판 블루 염색. (D) 4', 6-디아미디노-2-페닐린돌(DAPI) 및 CD31 항체로 염색된 마우스 pEC에 대한 유세포 분석 게이팅 전략. (E) 염색되지 않은 MS1(왼쪽 상단), AlexaFluor-488 2차 항체로 염색된 MS1(IgG 대조군, 오른쪽 상단), CD31로 염색된 MS1(왼쪽 하단) 및 CD31로 염색된 분리된 마우스 pECs(오른쪽 하단)의 유세포 분석 히스토그램. (F) 유세포 분석을 사용하여 정량화된 살아있는 세포의 비율. (G) DAPI(파란색) 대조염색 및 내인성 TdTomato 형광 리포터(빨간색)를 사용한 CD31 발현의 면역형광(녹색). 스케일 바 = 100μm. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 5: 쥐 췌장에서 CD31 및 CD144 특이성. (A) CD31(마젠타) 및 CD144(시안색)를 사용한 쥐 췌장의 면역형광, DAPI 대조염색. 광시야 형광 도립 현미경에서 10x 렌즈를 사용하여 캡처한 이미지. 눈금 막대 = 100μm. 점선은 섬 지역을 구분합니다. (B) scRNA-seq (GSE128565)37에 의해 검출된 C57BL6 마우스의 섬 EC에서 Cdh5 및 Pecam1 발현을 보여주는 UMAP(Uniform Manifold Approximation and Projection). 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
| 효소 | 쓰다 | 온도와 시간 | 참조 |
| 콜라겐분해효소 I | 단일 세포 해리, 전체 췌장 EC 농축 | 37°C, 20분 | 이 프로토콜 |
| 콜라겐분해효소 IV | Islet Isolation 및 비효소적 해리 | 37°C, 20분 | 46 |
| 콜라겐분해효소 + 트립신 | 쥐 췌장의 관 세포 검사 | 37°C, 30분 | 47 |
| 콜라겐분해효소 B | 췌장의 단세포 현탁액 | 37°C, 30분 | 48 |
| 콜라겐분해효소 NBI | 섬 격리 | 37°C, 30분 | 49 |
| 콜라겐 분해 효소 P | Acinar 실행 가능한 현탁액 | 37 °C, 15 분 | 45 |
| 콜라겐분해효소 XI | 섬 격리 | 37 °C, 15 분 | 35 |
| 디스플레이 | 단일 세포 현탁액 | 37 °C, 45 분 | 24 |
| 리베아제 | 단일 세포 현탁액 | 37 °C, 10 분 | 25, 48 |
| 트립신 | 단세포 해리, 전체 췌장 | 4 °C, O/N | 28 |
표 1: 쥐 췌장 샘플을 처리하는 데 사용되는 다양한 프로토콜 요약.
저자는 공개할 내용이 없습니다.
이 프로토콜은 전체 췌장에서 마우스 내피 세포를 분리하는 방법을 설명합니다.
저자는 City of Hope의 Brian Armstrong 박사와 University of California, Riverside의 Mindy Rodriguez에게 기술 지원에 감사를 표합니다. 이 연구는 NIH(R01 HL145170에서 ZBC), Ella Fitzgerald Foundation(ZBC), City of Hope(Arthur Riggs Diabetes Metabolism and Research Institute Innovation Award) 및 California Institute of Regenerative Medicine 보조금 EDU4-12772(AT로)의 보조금으로 부분적으로 자금을 지원받았습니다. 이 간행물에 보고된 연구에는 수상 번호 P30CA033572에 따라 NIH의 국립 암 연구소(National Cancer Institute of the NIH)에서 지원하는 광학 현미경 및 디지털 이미징에서 수행된 작업이 포함되었습니다. 그림 1 과 그림 2 는 BioRender로 제작되었습니다.
| 1.5 mL eppendorf | USA Scientific | 1615-5500 | |
| 10 cm 접시 | Genesee Scientific | 25-202 | |
| 25G 바늘 | BD | 305145 | |
| 2X Taq Pro Universal SYBR qPCR Master Mix | Vazyme | Q712-03-AA | |
| 5 mL eppendorf | Thermo Fisher | 14282300 | |
| 6웰 플레이트 | Greiner Bio-One | 07-000-208 | |
| 70 µ m 여과기 | Fisher | 22-363-548 | |
| Anti-CD31-biotin | Miltenyi Biotech | REA784 | |
| 소 혈청 알부민 열 충격 처리 | Fisher | BP1600-100 | |
| CaCl2 | Fisher | BP510 | |
| 원심분리기 | Eppendorf | ||
| Collagen Type 1, 송아지 피부에서 | Sigma Aldrich& 주의; | C9791 | 프로토콜 |
| 콜라겐분해효소 유형 1의 부착 시약 | Worthington Bio | LS004197 | |
| Countess 자동 세포 계수기 | 써모 피셔 | ||
| DAPI | 써모 피셔 | D1306 | 면역형광 |
| 일회용 안전 메스 | Myco Instrumentation | 6008TR-10 | |
| DNAse I | 로슈 | 260913 | |
| D-PBS (Ca2+,Mg2+) | 써모 피셔 | 14080055 | |
| 에탄올 | Fisher | BP2818-4 | |
| 태아 소 혈청 | Fisher | 10437028 | |
| 인큐베이터 | 37 °로 유지; C 5% CO2 | ||
| LS 컬럼 | Miltenyi Biotech | 130-042-401 | |
| M199 | Sigma | M2520-1L | |
| MACS MultiStand with the QuadroMACS Separator | Miltenyi Biotech | 130-042-303 | |
| 미디엄 199 | 시그마 알드리치 | M2520-10X | |
| 마이크로비즈 안티-비오 | 틴Miltenyi Biotech | 130-090-485 | |
| 현미경 | Leica | 세포 형태를 평가하기 위해 | |
| 분자 등급 물 | Corning | 46-000-CM | |
| NaCl | Fisher | S271-1 | |
| New Brunswick Innova 44/44R Orbital shaker | Eppendorf | ||
| PECAM1 (CD31) 항체 | Abcam | ab56299 | immunofluorescence |
| PECAM1 (CD31) 항체 | R& D Systems | AF3628 | |
| 인산염 완충 식염수 (10X) (Ca2+ 없음, Mg2+ 없음) | Genesee Scientific | 25-507-XB | |
| 프라이머 36B4 포워드 마우스 | IDT | AGATTCGGGATATGCTGTTGGC | |
| 프라이머 36B4 Revese 마우스 | IDT | TCGGGTCCTAGACCAGTGTTC | |
| 프라이머 Kdr 포워드 마우스 | IDT | TCCAGAATCCTCTTCCATGC | |
| 프라이머 Kdr 리버스 마우스 | IDT | AAACCTCCTGCAAGCAAATG | |
| 프라이머 Nkx6.1 리버스 마우스 | IDT | CACGGCGGACTCTGCATCACTC | |
| 프라이머 Nxk6.1 포워드 마우스 | IDT | CTCTACTTTAGCCCCAGCG | |
| 프라이머 PECAM1 포워드 마우스 | IDT | ACGCTGGTGCTCTATGCAAG | |
| 프라이머 PECAM1 리버스 마우스 | IDT | TCAGTTGCTGCCCATTCATCA | |
| RNase ZAP | Thermo Fisher | AM9780 | |
| RNase-free water | Takara | RR036B | |
| 멸균 12" 긴 집게 | F.S.T | 91100-16 | |
| 멸균 가는 집게 | F.S.T | 11050-10 | |
| 멸균 가는 가위 | F.S.T | 14061-11 | |
| 조직 배양 접시 2cm | Genesee Scientific | 25-260 | |
| TRIzol 시약 | Fisher | 15596018 | |
| Trypan 블루 | 코닝 | MT25900CI | |
| 트립신 억제제 | Roche | 10109886001 | |
| Tween-20 | |||
| VE-Cadherin 항체 | Abcam | ab33168 | 면역형광 |
| 수조 |