뇌 질환에 대한 면역 반응을 조사하기 위한 한 가지 일반적인 접근법은 면역 세포의 변화를 분석하는 것입니다. 여기에서는 쥐 뇌 조직과 두개골 골수에서 면역 세포를 분리하기 위한 두 가지 간단하고 효과적인 프로토콜이 제공됩니다.
방법 논문
뇌 질환에 대한 면역 반응을 조사하기 위한 한 가지 일반적인 접근법은 면역 세포의 변화를 분석하는 것입니다. 여기에서는 쥐 뇌 조직과 두개골 골수에서 면역 세포를 분리하기 위한 두 가지 간단하고 효과적인 프로토콜이 제공됩니다.
뇌 질환(예: 뇌 허혈 및 자가면역 뇌척수염)에 의해 유발되는 면역 반응이 뇌뿐만 아니라 두개골에서도 발생한다는 증거가 늘어나고 있습니다. 뇌 손상(예: 뇌졸중) 후 뇌와 두개골 골수에서 면역 세포 집단의 변화를 분석하기 위한 핵심 단계는 다운스트림 분석을 위한 충분한 수의 고품질 면역 세포를 얻는 것입니다. 여기에서는 뇌와 두개골 골수에서 면역 세포를 분리하기 위한 두 가지 최적화된 프로토콜이 제공됩니다. 두 프로토콜의 장점은 단순성, 속도 및 많은 양의 생존 가능한 면역 세포를 생성하는 효능에 반영됩니다. 이러한 세포는 세포 분류, 유세포 분석 및 전사체 분석과 같은 다양한 다운스트림 응용 분야에 적합할 수 있습니다. 프로토콜의 효과를 입증하기 위해 유세포 분석을 사용하여 뇌졸중 뇌와 정상 뇌 두개골 골수에 대해 면역표현형 분석을 수행했으며, 결과는 발표된 연구의 결과와 일치했습니다.
신경계의 중심 허브인 뇌는 두개골에 의해 보호됩니다. 두개골 아래에는 수막으로 알려진 세 층의 결합 조직, 즉 경막(dura mater), 거미막(arachnoid mater) 및 피아 마터(pia mater)가 있습니다. 뇌척수액(CSF)은 지주막하(subarachnoid)와 지주막(pia mater) 사이의 지주막하 공간을 순환하며 뇌를 완충하고 림프계를 통해 노폐물을 제거합니다 1,2. 이 독특한 아키텍처는 뇌의 안정성을 유지하고 잠재적인 손상으로부터 뇌를 보호하는 안전하고 지원적인 환경을 제공합니다.
뇌는 오랫동안 면역 특권을 가진 것으로 여겨져 왔습니다. 그러나 실질에 상주하는 미세아교세포 외에도 맥락총(choroid plexus)과 수막(meninges)을 포함한 뇌의 경계가 다양한 면역 세포를 수용한다는 증거가 늘어나면서 이 개념은 부분적으로 포기되었습니다3. 이 세포는 항상성을 유지하고, 뇌 건강을 감시하며, 뇌 손상에 대한 면역 반응을 시작하는 데 중요한 역할을 합니다. 특히 최근의 연구 결과에 따르면 두개골은 뇌수 면역에 관여하며 손상 후 뇌의 면역 반응에 기여할 수 있습니다. 2018년, Herisson et al.은 두개골 골수와 수막을 연결하는 직접 혈관 채널을 발견하여 백혈구 이동을 위한 해부학적 경로를 확립했습니다 4,5. 나중에, Cugurra et al.은 수막의 많은 골수성 세포(예: 단핵구 및 호중구)와 B 세포가 혈액에서 유래하지 않는다는 것을 입증했습니다6. 저자들은 calvaria bone-flap transplantation 및 selective irradiation 요법과 같은 기술을 사용하여 두개골 골수가 CNS 손상 후 CNS 실질뿐만 아니라 수막의 골수성 세포에 대한 국소 공급원 역할을 한다는 설득력 있는 증거를 제시했다6. 또한, 또 다른 연구에서는 수막 B 세포가 두개골 골수에 의해 지속적으로 공급된다고 제안했다7. 최근에는 거미막 출구(arachnoid cuff exit, ACE)라고 불리는 새로운 구조가 면역 세포 이동을 위한 경막과 뇌 사이의 직접 관문으로 확인되었다8.
이러한 흥미로운 발견은 면역 세포가 손상된 뇌에 침투하는 기원(예: 허혈성 뇌졸중 후)에 중요한 의미를 갖습니다. 뇌졸중 후 많은 면역 세포가 뇌에 침투하여 급성 뇌 손상과 만성 뇌 회복에 기여한다는 많은 증거가 있습니다. 일반적인 개념은 이러한 세포가 뇌에 침투하는 혈액 속의 순환 백혈구라는 것인데, 이는 주로 뇌졸중으로 인한 혈액-뇌 장벽 손상에 의해 촉진됩니다. 그러나 이 개념은 도전을 받고 있습니다. 한 연구에서 쥐의 두개골과 경골의 면역 세포는 다르게 표지되었으며, 뇌졸중 후 6 시간에는 두개골에서 호중구와 단핵구의 감소가 크게 발견되었습니다. 경골과 더 많은 두개골 유래 호중구가 허혈성 뇌에 존재했습니다. 이러한 데이터는 급성 뇌졸중 단계에서 허혈성 뇌의 호중구가 주로 두개골 골수에서 발생한다는 것을 시사한다4. 흥미롭게도 CSF가 이 마이그레이션을 안내할 수 있습니다. 실제로, 최근의 두 가지 보고에 따르면, 뇌척수액은 두개골 채널을 통해 뇌에서 두개골 골수로 신호 신호를 직접 전달할 수 있으며, 중추신경계 손상 후 두개골 골수에서 세포 이동과 조혈을 지시할 수 있습니다 9,10.
이러한 최근의 발견에 비추어 볼 때, 뇌 질환에 대한 면역 반응을 연구할 때 뇌와 두개골 골수의 면역 세포의 변화를 분석하는 것이 중요해졌습니다. 이러한 연구에서는 세포 분류, 유세포 분석 및 단일 세포 RNA 염기서열 분석(scRNA-seq)과 같은 다운스트림 분석을 위해 충분한 수의 고품질 면역 세포가 필요합니다. 여기에서 전반적인 목표는 뇌 조직과 두개골 골수에서 단세포 현탁액을 준비하기 위한 두 가지 최적화된 절차를 제시하는 것입니다. 두개골의 종골(전두골, 후두골 및 두정골)은 일반적으로 골수를 추출하는 데 사용되며, 이 골수는 이 연구에서 특별히 두개골 골수라고 합니다.
이 프로토콜은 Duke Institute Animal Care and Use Committee(IACUC)의 승인을 받았습니다. 본 연구에서는 수컷 C57Bl/6마리 마우스(3-4개월령, 22-28g)를 사용하였다. 시약 및 사용된 장비에 대한 자세한 내용은 재료 표에 나열되어 있습니다.
1. 쥐 두뇌에서 단세포 현탁액
참고: 그림 1 은 뇌세포 분리 프로토콜의 개요를 보여줍니다.
2. 마우스 calvaria에서 골수 단세포 현탁액의 제조
참고: 그림 2 는 두개골 골수 분리 절차의 개요를 보여줍니다.
쥐의 뇌 조직으로부터 면역 세포를 준비하기 위해, 프로토콜은 일반적으로 생존율이 높은 세포를 생성합니다(84.1% ± 2.3%[평균 ± SD]). 이 세포의 약 70%-80%는 CD45 양성입니다. 정상적인 쥐의 뇌에서는 거의 모든 CD45+ 세포가 예상대로 미세아교세포(CD45LowCD11b+)입니다. 이 프로토콜은 유세포 분석 분석, 형광 활성화 세포 분류(FACS) 및 scRNA-seq 분석을 포함한 다양한 응용 분야의 실험실에서 사용되었습니다. 예를 들어, 유세포 분석은 스트로크 모델에서 수행되었습니다(그림 3). 마우스는 과도 뇌졸중 모델, 30분 필라멘트 중뇌동맥 폐색(MCAO)14을 받았습니다. 뇌졸중 후 3일째 되는 날, 쥐의 뇌에서 세포를 준비하고 일반적인 면역 세포 표면 마커로 염색했습니다. 게이팅 전략은 그림 3A에 나와 있습니다. 선행 연구13,15와 일치하게, 동측 반구에서 CD45High 세포의 현저한 증가가 관찰되었으며(그림 3B,C), 이는 면역 세포가 뇌로 침투했음을 나타냅니다.
두개골 골수 프로토콜의 경우, 두개골 골수 세포(약 2 x 106 세포)의 상당한 수율이 우수한 생존율로 일관되게 달성되었습니다(93.8% ± 1.8% [평균 ± SD]). 예상대로 이러한 세포의 대부분은 CD45 양성입니다. 이 프로토콜의 유용성을 설명하기 위해 비교 연구를 수행하여 순진한 쥐의 대퇴골과 두개골 골수 모두에서 면역 세포 구성을 특성화했습니다(그림 4). 대표적인 그림에서 볼 수 있듯이, 대퇴골과 두개골 골수 사이의 면역 세포 조성은 유사했습니다(그림 4A,B). 흥미롭게도, 호중구의 빈도는 두개골보다 대퇴골에서 더 높은 것으로 보인다(그림 4C). 그러나 이 발견은 이 파일럿 연구에서 표본 크기가 작았기 때문에 추가 검증이 필요합니다.

그림 1: 뇌세포 분리 프로토콜 개요. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 2: 두개골 골수 세포 분리 프로토콜. (A) 절차 개요. (B) 두개골 절단에 권장되는 패턴. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 3: 뇌졸중 뇌의 면역 세포에 대한 대표적인 유세포 분석. (A) 게이팅 전략의 예. 이 그래프는 미세아교세포(CD45LowCD11b+), NK 세포(CD45HighNK1.1+), 호중구(CD45HighLy6G+), T 세포(CD45HighCD11b-CD3+) 및 B 세포(CD45HighCD11b-CD19+)와 같은 면역 세포 집단을 나타냅니다. 이 예는 뇌졸중 후 3일째에 동측 반구의 뇌 면역 세포를 분석한 것입니다. (나,씨) 면역 세포를 뇌졸중 뇌에 침투시킵니다. 젊은 수컷 마우스는 일시적인 중뇌동맥 폐색(MCAO)을 받았습니다. 3일째에는 뇌를 채취하여 왼쪽(반대측)과 오른쪽(동측) 반구로 나눴습니다. 뇌 세포는 기술된 프로토콜에 따라 준비된 후 유세포 분석을 실시하였다. 대표적인 플롯은 동측 반구로의 면역 세포 침투가 증가했음을 보여줍니다(CD45High cells; B). 정량적 데이터는 막대 그래프(C)에 표시됩니다. 세포 수는 유세포 분석 데이터에 기록된 세포 수와 부피를 기반으로 계산되었습니다. 데이터는 SEM± 평균으로 표시됩니다. *p < 0.05. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 4: 두개골 골수 세포의 대표적인 유세포 분석. 비교를 위해 대퇴골의 골수 세포 분석이 포함되었습니다. 이 그래프는 NK 세포(CD45+NK1.1+), 호중구(CD45+CD11b+Ly6G+), T 세포(CD45+CD11b-CD3+) 및 B 세포(CD45+CD11b-CD19+)와 같은 면역 세포 집단을 나타냅니다. (A) 대퇴골 골수에 대한 대표 플롯. (B) 두개골 골수에 대한 대표 플롯. (C) 대퇴골과 두개골 골수 사이의 면역 세포 구성 비교. 데이터는 평균± SEM으로 표시됩니다. *p < 0.05. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
여기에서는 뇌와 두개골 골수에서 면역 세포를 분리하기 위한 간단하면서도 효과적인 두 가지 프로토콜을 제시합니다. 이러한 프로토콜은 다양한 다운스트림 응용 분야, 특히 유세포 분석에 적합할 수 있는 대량의 생존 가능한 면역 세포를 안정적으로 생성할 수 있습니다.
다양한 뇌 질환에서 신경 염증을 연구하기 위해 뇌에서 면역 세포 준비를 위한 많은 프로토콜이 수립되어 다양한 실험실에서 사용되었습니다 15,16,17. 일반적인 접근법에는 효소 기반 세포 해리와 그래디언트 분리가 포함됩니다. 일반적으로 이러한 프로토콜에서는 뇌 조직을 다진 다음 콜라겐 분해 효소와 DNase를 모두 함유 한 효소 소화 용액에서 37 ° C에서 30-60 분 동안 부드럽게 흔듭니다. 분해 후 세포는 피펫팅 또는 Dounce 균질화와 같은 기계적 방법을 사용하여 추가 해리를 거칩니다. 세포 여과기(예: 70μm 여과기)를 통과한 후 세포는 기울기 원심분리(종종 30%/70% 밀도 그래디언트 용액)를 거쳐 미엘린, 적혈구 및 파편을 제거하고 백혈구를 농축합니다. 그러나 이 접근법은 37°C에서 장기간 효소 배양이 필요하며, 이는 뇌 면역 세포의 전사체와 단백질체를 실질적으로 변화시킬 수 있습니다. 실제로, 체계적인 조사에 따르면 효소 접근법은 특정 뇌 세포의 전사체(transcriptome)와 단백질형(proteotype)에 심오한 변화를 일으킨다고 합니다 18. 이는 scRNA-seq와 같은 후속 전사체 분석에서 아티팩트로 이어질 수 있습니다. 대조적으로, 여기에 보고된 프로토콜은 절차 전반에 걸쳐 저온에서 기계적 해리 접근 방식을 사용하여 세포 대사를 억제합니다. 이렇게 하면 transcriptional 및 proteomic 상태를 더 잘 보존하여 잠재적인 아티팩트를 최소화할 수 있습니다. 프로토콜 개발 과정에서 뇌 조직을 균질화하기 위해 대형 Dounce 균질화기를 사용하는 것이 더 낮은 세포 사멸로 더 많은 세포 수를 달성하는 데 중요하다는 것을 알게 되었습니다. Dounce 균질화 중에는 세포외 기질, 세포 파편 및 세포질 구성 요소의 대량의 존재가 세포에 독성을 유발할 수 있습니다. 과도한 양의 완충액을 사용하면 이러한 독성 물질을 희석하는 데 도움이 되므로 유해한 영향을 완화하여 세포 생존력을 높일 수 있습니다. 유세포 분석 데이터는 이 프로토콜로 준비된 면역 세포의 약 85%의 생존율을 확인했습니다. 또한, 30% 밀도의 구배 용액만으로 원심분리하면 뇌 면역 세포를 효과적으로 풍부하게 하고 미엘린을 제거한다는 점이 주목할 만합니다. 이는 또한 세포 준비 비용을 줄일 수 있습니다.
두개골 골수의 면역 세포에 대한 연구는 아직 제한적입니다. 쥐의 두개골 calvarium에서 세포를 분리하는 데 일반적으로 사용되는 방법은 두개골을 작은 조각으로 자른 다음 유봉으로 조각을 기계적으로 분쇄하는 것입니다6. 현재 프로토콜에서는 간단한 원심분리가 사용됩니다. 이 방법은 대퇴골 및 경골에서 골수를 준비하기 위해 발표된 프로토콜에서 채택된것입니다 19. 이러한 긴 뼈의 경우 원심분리를 통해 골수를 채취하기 위해 뼈의 한쪽 끝만 잘라내면 됩니다. 두개골의 경우 이 단계를 수정하여 골수를 엽니다. 재현 가능한 세포 수를 얻기 위해 두개골을 절단할 때 일관된 패턴을 사용하는 것이 좋습니다. 또한, 골수 세포의 회수를 극대화하기 위해 두개골 조각은 각 원심분리 사이에 혼합하여 2-3번의 원심분리를 거칠 수 있습니다.
두 프로토콜 모두 제한 사항이 있습니다. 첫째, 30% 밀도 구배 용액 원심분리를 사용하면 불완전한 관류로 인해 발생할 수 있는 뇌에 남아 있는 적혈구를 효과적으로 제거하지 못할 수 있습니다. 더욱이, 미엘린 구조가 특정 조건에서 조절되는 경우, 30% 밀도 구배 용액은 미엘린 제거를 위한 최적의 농도가 아닐 수 있습니다. 이 경우 밀도 구배 용액의 또 다른 작업 농도를 설정해야 합니다. 둘째, 유세포 분석 분석이 설명된 프로토콜을 사용하여 뇌 면역 세포의 우수한 세포 생존력을 나타내지만, 악티노마이신 D가 사용될 수 있는 전사체 분석과 같은 다른 응용 분야에 대해서는 여전히 평가가 필요합니다. 셋째, 종골은 두개골 골수를 준비하는 데 사용됩니다. 그러나 면역 세포는 두개골의 다른 많은 부분에 존재한다는 점에 유의해야 합니다. 마지막으로, 뇌막, 특히 경막은 다양한 면역 세포를 보유하고 있으며 뇌의 항상성과 기능 장애에 중요한 역할을 한다20. 수막의 면역 분석을 위해, 다른 곳에서 발표된 프로토콜이 채택될 수 있다 17,21,22,23.
요약하면, 쥐의 뇌와 두개골 모두에서 면역 세포를 분리하기 위한 두 가지 강력한 프로토콜이 설명됩니다. 이러한 프로토콜은 다양한 다운스트림 애플리케이션에 적합한 고품질 셀을 대량으로 획득하는 데 유용할 것으로 예상됩니다.
Kathy Gage의 탁월한 편집 기여에 감사드립니다. 일러스트 피규어는 BioRender.com 로 제작되었습니다. 이 연구는 마취과(Duke University Medical Center)와 NIH 보조금 NS099590, HL157354 및 NS127163의 자금으로 지원되었습니다.
| 이름 | 회사 | 카탈로그 번호 | 댓글 |
|---|---|---|---|
| 0.5 mL microcentrifuge tubes | VWR | 76332-066 | |
| 1.5 mL microcentrifuge tubes | VWR | 76332-068 | |
| 15 mL conical tubes | Thermo Fisher Scientific | 339651 | |
| 18 G x 1 in BD PrecisionGlide Needle | BD Biosciences | 305195 | |
| 1x HBSS | Gibco | 14175-095 | |
| 50 mL conical tubes | Thermo Fisher Scientific | 339653 | |
| 96-well V-bottom microplate | SARSTEDT | 82.1583 | |
| AURORA flow cytometer | Cytek bioscience | ||
| BSA | Fisher | BP9706-100 | |
| CD11b-AF594 | BioLegend | 101254 | 1:500 희석 |
| CD19-BV785 | BioLegend | 115543 | 1:500 희석 |
| CD19-FITC | BioLegend | 115506 | 1:500 희석 |
| CD3-APC | BioLegend | 100312 | 1:500 희석 |
| CD3-PE | BioLegend | 100206 | 1:500 희석 |
| CD45-Alex 700 | BioLegend | 103128 | 1:500 희석 |
| CD45-BV421 | Biolegend | 103133 | 1:500 희석 |
| Cell Strainer 70 um | Avantor | 732-2758 | |
| Dressing Forceps | V. Mueller | NL1410 | |
| EDTA | Invitrogen | 15575-038 | |
| Fc Block | Biolegend | 101320 | 1:100 희석 |
| Forceps | Roboz | RS-5047 | |
| LIVE/DEAD Fixable Blue Dead Cell Stain Kit | Thermo Fisher Scientific | N7167 | 1:500 희석 |
| Ly6G-BV421 | BioLegend | 127628 | 1:500 희석 |
| Ly6G-PerCp-cy5.5 | BioLegend | 127615 | 1:500 희석 |
| NK1.1-APC-cy7 | BioLegend | 108723 | 1:500 희석 |
| Percoll (density gradient medium) | Cytiva | 17089101 | |
| Phosphate buffer saline (10x) | Gibco | 70011-044 | |
| RBC Lysis Buffer (10x) | BioLegend | 420302 | |
| Scissors | SKLAR | 64-1250 | |
| WHEATON Dounce Tissue, 15 mL Size | DWK Life Sciences | 357544 |
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