상업용 마이크로파 반응기에서 고체상 펩타이드 합성을 수행하기 위한 간단하고 저렴하며 새로운 장치가 제시됩니다.
상업용 마이크로파 반응기에서 고체상 펩타이드 합성을 수행하기 위한 간단하고 저렴하며 새로운 장치가 제시됩니다.
마이크로파 조사 및 가열의 도움을 받아 고체상 펩타이드 합성(SPPS)을 수행하기 위해 집에서 제작한 장치가 제시됩니다. 용기 바닥에 위치한 프릿을 통해 용매와 부산물을 배출하는 기존의 SPPS 반응 용기와 달리, 제시된 장치는 용매, 부산물 및 과도한 시약을 제거하기 위해 진공 상태에서 가스 분산 튜브를 사용합니다. 동일한 가스 분산 튜브는 커플 링 및 탈보호의 반응 단계에서 SPPS 비드의 질소 가스 교반을 공급합니다. 마이크로파 가열은 알파, 알파 다이얼킬화 아미노산 잔류물인 알파-아미노이소부티르산(Aib)과 같은 입체 장애 잔류물의 SPPS 커플링에 유용합니다. 이 자체 제작 장치는 수동 Fmoc SPPS 방법을 통해 표준 실온 조건과 시약에서 결합하기 어려운 것으로 악명 높은 Aib 잔기에 의해 지배적인 헵타메릭 및 옥타메릭 펩타이드를 준비하는 데 사용되었습니다. 또한, 일반적인 상업용 마이크로파 SPPS 반응기는 SPPS 합성에만 전념하기 때문에 SPPS가 아닌 사용자가 접근할 수 없습니다. 대조적으로, 제시된 장치는 장치가 상업용 마이크로파 반응기에서 사소하게 제거되기 때문에 화학 반응의 기존 마이크로파 가속을 위한 마이크로파 반응기의 다양성을 보존합니다.
1960년대에 Merrifield가 도입한 고체상 펩타이드 합성 SPPS는 펩타이드 및 화학 합성에 혁명을 일으켰으며 노벨 화학상 1,2호상을 수상했습니다. 그 후 수십 년 동안 많은 연구자들이 Merrifield의 독창적인 기술을 개선하여 SPPS 관행을 지배하는 두 가지 대안, 즉 플루오레닐메톡시카르보닐(FMOC) 기반 대 tert-부틸 옥시카르보닐(BOC) 기반3. FMOC에서 고체 수지의 펩타이드를 최종적으로 절단하려면 BOC 기술의 HF와 비교하여 트리플루오라세트산을 함유한 칵테일이 필요하므로 FMOC 기반 방법은 많은 실험실에서 선호되는 선택입니다.
최첨단 SPPS 방법은 때때로 원하는 염기서열에 의해 도전을 받습니다. 최근 몇 년 동안 응집체(aggregation)4, 디케토피페라진 형성(diketopiperazine formation)5, N-메틸화 아미노산 잔기(N-methylated amino acid residue)6에 대한 몇 가지 특이한 우려를 극복하는 발전이 있었습니다. 커플링 수율을 최적화하기 위한 노력의 일환으로 수천 개의 커플링 시약과 첨가제가 조사되었습니다7. 특히, COMU 8,9 또는 산성 플루오라이드10,11,12를 통한 카르복실산 활성화는 Oxyma13 및 하이드록시벤조트리아졸(HOBt)과 같은 첨가제와 함께 α,α-dialkylated residue와 같은 특히 까다로운 커플링을 위해 개발되었습니다.
다른 비시약 기반 방법은 확장된 반응 시간, "이중 커플링" 및 가열, 특히 마이크로파 가열을 포함하여 어려운 커플링에 대한 수율을 증가시키기 위해 사용되었습니다 14,15,16. 실제로, 마이크로파 가열을 사용하는 상업적으로 이용 가능한 자동 펩타이드 합성기는 반응 속도를 가속화하고 펩타이드의 최종 순도를 개선하며 용매 폐기물을 최소화하는 것으로 나타나기 때문에 시장에서 가장 상업적으로 성공적인 장치 중 하나입니다. 불행히도 이러한 장치는 비쌀 수 있으며 경우에 따라 $100,000 이상의 비용이 듭니다.
우리 실험실은 알파 - 아미노 이소 부트리산 (Aib) 17 , 18 , 19의 강한 helicogenic 잔류 물을 포함하는 펩티드의 변형을 준비하는 데 관심이 있습니다. 알파 카본의 다이얼킬화로 인해 발생하는 입체 장애로 인해 Aib는 결합이 어려운 것으로 악명이 높습니다. 위에서 언급한 방법(산성 불화물, 마이크로파 가열20)과 영리한 "디펩타이드" SPPS 화학21은 SPPS를 AIB의 커플링 문제에 적용하는 데 사용되었습니다. Aib 이량체의 수지 외 준비는 전체 수율을 개선하는 동시에 추가적인 습식 화학과 고온(50°C)21을 필요로 합니다. 더욱, 우리는 불소화 대리인의 유독한 성격 때문에 Aib의 산성 불화물을 사용하는 것을 피했습니다. 불행히도 우리 실험실에는 SPPS 부산물의 필수 배출을 위한 전용 반응 용기가 있는 전용 마이크로파 기반 자동 SPPS 합성기가 없습니다. 그럼에도 불구하고, SPPS와 마이크로파 조사22를 사용하여 AIB 기반 올리고머를 제조하는 데 놀라운 성공을 거둔 Clayden 그룹의 최근 보고서는 SPPS 합성을 위해 우리 실험실의 CEM Discover SP 마이크로파 장치를 조정하도록 자극했습니다.
우리는 먼저 마이크로파 반응기를 수동 SPPS/마이크로파 장치23으로 변환하기 위해 CEM의 상업적으로 이용 가능한 액세서리를 조사했습니다. 비용 외에도 이 액세서리는 수동 SPPS 에만 마이크로파 장치를 사용해야 합니다. 다른 실험실 사용자는 더 이상 마이크로파 장치의 뛰어난 기능에 액세스할 수 없습니다. 따라서 상업용 액세서리의 구현은 우리의 경우 허용되지 않는 것으로 간주되었습니다.
대신, 우리는 비교적 저렴한 구성 요소를 통해 밀리몰 규모에서 마이크로파 보조 SPPS를 수행하는 장치를 조립했습니다. 아래 프로토콜은 간단하고 비교적 저렴한 구성 요소를 사용하여 수동 마이크로파 지원 SPPS를 적용하는 방법을 설명합니다.
1. 장치 조립(그림 1)
알림: 장치 조립을 위한 모든 구성 요소는 재료 표에 나와 있습니다.
2. 시약 준비
3. 펩타이드 수지의 제조
4. FMOC 제거
참고: 수지에는 C 말단 잔기로 사전 로드된 다양한 FMOC 보호 아미노산이 사전 로드된 상태로 사용할 수 있습니다. 따라서 FMOC 제거는 일반적으로 수지를 팽창시킨 후 첫 번째 단계입니다.
5. FMOC 아미노산의 커플링
6. SPPS 펩타이드 사이클을 반복합니다.
7. 펩타이드 분열
당사 장치로 제조된 펩타이드 서열의 예는 그림 2 및 그림 3에 나와 있습니다. 표 1 은 솔루션, 마이크로파 매개변수 및 우리가 사용한 세척을 요약합니다. MALDI-TOF 질량 분석기 확인이 그림에 나와 있습니다. 이 펩티드의 대량 회수율은 80% 이상입니다. 의미심장하게도, 이러한 모든 염기서열은 인접한 알파, 알파-다이얼킬화 아미노산 사이에 다중 결합을 가지고 있습니다. 이들은 펩타이드 결합 형성을 통해 함께 결합하기 가장 어려운 잔류물 중 하나입니다.

그림 1: 집에서 제작한 마이크로파 보조 수동 SPPS 장치. (A) 1) ETFE "티"를 보여주는 회로도; 2) 진공에 ETFE 벨브; 3) 질소 가스에 대한 ETFE 밸브; 4) 가스 분산 튜브, 5) 파이렉스 시험관 반응 용기; 6) 1/8" 테프론 튜브를 가스 분산 튜브에 결합하는 NMR 유형 격막; 7) 질소 가스 흐름을 제어하는 니들 밸브; 8) 반응 폐기물을 수집하기 위한 사이드 암 플라스크. 제조업체에 대해서는 Table of Materials(재료표 )와 구성 요소의 카탈로그 번호를 참조하십시오. (B) 조립된 이미지의 사진. 번호 매기기는 그림 1A와 동일합니다. 약어: SPSS = 고체상 펩타이드 합성; ETFE = 에틸렌 테트라플루오로에틸렌; NMR = 핵 자기 공명. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 2: 마이크로파 SPPS 방법 및 MALDI-TOF 확인을 통해 합성된 펩타이드 1의 구조. (A) CHCA를 매트릭스로 사용했습니다. m/z = 880.18에서 피크는 부가칼륨 [MK+]이며 계산된 m/z=880.45입니다. (B) 조잡한 펩타이드의 HPLC 흔적 1. 용매 구배는 0.1% 수성 TFA에 대해 20%에서 80%까지 MeCN이며 20분입니다. 관찰 파장 = 222nm. 약어: SPSS = 고체상 펩타이드 합성; MALDI-TOF = 매트릭스 보조 레이저 탈착 이온화-비행 시간; CHCA = 알파-시아노-4-하이드록시신남산, HPLC = 고성능 액체 크로마토그래피; MeCN = 아세토니트릴; TFA = 트리플루오로아세트산. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 3: 마이크로파 SPPS 방법 및 MALDI-TOF 확인을 통해 합성된 펩타이드 2의 구조. (A) CHCA를 매트릭스로 사용했습니다. m/z = 1022.7에서의 피크는 m/z=1023.5로 계산된 칼륨 부가물 [MK+]에 할당됩니다. m/z = 966.5에서의 피크는 수분 손실24를 통해 C-말단 옥사졸론에 잠정적으로 할당되었으며 m/z = 967.5로 계산되었습니다. (B) 조잡한 펩티드 2의 HPLC 미량. 용매 그래디언트는 0.1% 수성 TFA에 대해 20분 동안 20%에서 80%까지 MeCN입니다. 관찰 파장 = 222nm. 약어: SPSS = 고체상 펩타이드 합성; MALDI-TOF = 매트릭스 보조 레이저 탈착 이온화-비행 시간; CHCA = 알파-시아노-4-하이드록시신남산, HPLC = 고성능 액체 크로마토그래피; MeCN = 아세토니트릴; TFA = 트리플루오로아세트산, 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
| 걸음 | 용액/용매 | 부피 (mL) | 시간(분) | 온도 (°C) | |
| 1 | 탈보호화 | 모르폴린 20% | 7 | 2 | 90 |
| 2 | 세척 | 디엠프 | 4, 4, 4 | - | RT (RT) |
| 3 | 탈보호화 | 모르폴린 20% | 7 | 2 | 90 |
| 4 | 세척 | 디엠프 | 4, 4, 4 | - | RT (RT) |
| 5 | 커플링 | Fmoc-AA-OH, OXYMA, DIC | 5, 2, 2 | 10 | 100 |
| 6 | 세척 | 디엠프 | 4, 4, 4 | - | RT (RT) |
| 7 | 반복하다 | ||||
| 끝 | 분열 | TFA/팁/H2O | 1 | >120 |
표 1: 0.1mmol 규모의 마이크로파 보조 SPPS의 1주기 단계: FMOC 탈보호, 세척 및 FMOC-아미노산 결합. 0.2M FMOC-AA-OH, 0.5M 옥시마, 1.0M DIC 각 단계에 대해 마이크로피펫터로 직접 테스트 튜브에 수동으로 추가한 용액. 약어: SPSS = 고체상 펩타이드 합성; FMOC = 플루오레닐메톡시카르보닐; DIC = 디이소프로필 카르보디이미드.
보충 파일 1: Fmoc 보호 그룹 제거에 대한 CEM Discover SP 마이크로파 반응기 보고서 및 Fmoc-protected 아미노산 결합에 대한 CEM Discover SP 마이크로파 반응기 보고서. 이 파일을 다운로드하려면 여기를 클릭하십시오.
여기에 제시된 장치는 마이크로파 보조 SPPS 동안 용매, 과잉 시약 및 폐기물을 제거하고 질소 가스 교반을 추가하는 간단하고 참신하며 저렴한 방법을 호출합니다. 용기 바닥에서 프릿(frit)을 발생시키는 기존의 SPPS 용기와 달리, 제시된 장치는 진공 상태에서 가스 분산 튜브를 호출하여 용기를 흡인합니다. 따라서 반응 용기는 일반 시험관이며, 마이크로파 반응기 제조업체가 "개방형 용기 감쇠기" 내에서 권장하는 위치에서 가열됩니다.
당사의 주요 혁신은 진공 상태에서 "가스 분산 튜브"를 통해 시험관에서 용매와 반응 부산물을 제거하는 것입니다. 마이크로파 조사 하에서 화학적 변형을 하는 동안과 용매(N,N-디메틸포름아미드(DMF) 또는 N-메틸 피롤리디논, NMP)로 세척하는 동안 SPPS 비드는 튜브를 통해 분산된 질소 가스에 의해 교반됩니다. 진공 및 질소 가스는 용제에 대한 내성을 최적화하기 위해 ETFE 밸브에 의해 제어됩니다. SPPS 폐기물은 사이드 암 삼각 플라스크에 수집됩니다. 모든 구성 요소는 1/8" 테프론 튜브를 통해 연결됩니다. 우리가 "집" 진공을 사용하는 동안 기계식 진공 펌프도 사용할 수 있습니다. 위의 그림 1은 우리 장치의 개략도입니다.
성공적인 SPPS에는 장치뿐만 아니라 온도, 시간 및 화학 시약의 화학 프로토콜이 필요합니다. Clayden et al.22의 프로토콜을 사용하여 기존의 실온 SPPS 방법을 통해 준비하기가 불가능하지는 않더라도 어려운 여러 펩타이드를 준비했습니다. 아미노산 결합을 위해 디이소프로필 카르보디이미드(DIC)와 옥시마를 커플링 칵테일로 사용하고 100°C에서 10분 동안 조사합니다. Oxyma는 커플링 공정13 동안 잔류물의 라세미화를 억제하는 것으로 생각됩니다. FMOC 탈보호를 위해 DMF에 20% 모르폴린을 사용하고 90°C에서 2분 동안 조사한 다음 한 번 더 반복합니다. 반응 사이에 DMF를 사용하여 SPPS 비드(Wang resin)를 반복(3x) 헹굽니다.
이 수동 장치를 사용하여 잔기당 약 40분의 속도로 합성이 어려운 펩타이드를 준비했습니다. 우리는 아직 이 속도의 가능한 최적화를 연구하지 않았습니다. 예를 들어, 마이크로파 반응기 내의 시간은 결과를 감소시키지 않고 "목표 온도에서의 시간"이 아닌 "총 반응 시간"으로 제한될 수 있다고 생각합니다. 이는 목표 온도에 점근적으로 접근하는 데 소요되는 시간 때문입니다(자세한 내용은 보충 파일 1 참조). 또한, 원칙적으로 마이크로파에서 반응 용기를 제거하지 않고 모든 시약과 용매를 첨가할 수 있습니다. 그러나 우리는 모든 단계에서 수지를 검사할 수 있는 것을 선호합니다.
우리의 사용 사례는 SPPS에 있지만, 고체상 방법이 덴드리머25, RNA26 및 전기화학 합성27과 같은 다양한 합성에 점점 더 많이 적용되고 있다는 점에 유의해야 합니다. 다양한 사용 사례에서 마이크로파 지원의 이점을 얻을 수 있으며, 이 장치에 적합합니다. 마지막으로, 이 장치는 마이크로파 보조 SPPS를 수행하도록 구성되었지만 기본 반응 용기는 시험관입니다. 그러므로, 장치는 통상적인 실온 SPPS뿐만 아니라, 예를 들어, 오일 배스에서 고온에서 수행되는 SPPS에 사용될 수 있다.
저자는 공개할 이해 상충이 없습니다.
저자들은 Fairfield University의 INSPIRE 보조금 지원, Fairfield University의 화학 및 생화학과의 지원, 실험실 관리에 대한 전문 지식을 갖춘 Dorothy Szobcynski 박사의 도움에 감사드립니다. 또한 저자는 펩타이드 및 유기 합성에 관한 논의를 해준 Jillian Smith-Carpenter 교수와 Aaron Van Dyke 교수에게 감사를 표합니다. 저자는 Fairfield University의 College of Arts & Sciences의 출판 기금의 지원에 감사드립니다.
| 이름 | 회사 | 카탈로그 번호 | 댓글 |
|---|---|---|---|
| CEM 디스커버 SP 마이크로파 원자로 | CEM | 단종됨. 최근 제품 라인에서 Discover 2.0으로 대체되었습니다 | |
| 디이소프로필카보디이미드 (DCC) | TCI 아메리카 | ||
| 디메틸포름아마이드 (DMF) | 열보 사이언티브 케미컬스 | ||
| 가스 분산관, 마이크로 및 nbsp; | 켐글래스 | CG-207-02 | 중간 다공성 |
| 미세 중격 | 켐글래스 | CG-3022-20 | "NMR 튜브" 타입 비중격 |
| 모르폴린 | 열보 사이언티브 케미컬스 | ||
| N-Fmoc 보호 아미노산 | |||
| 오익스마 퓨어 | TCI 아메리카 | ||
| 권총용 에어렌마이어 플라스크 | 다양한 판매자들 | 폐기물 수거 | |
| "티" | 아이덱스 | P-713 | ETFE |
| 테플론 튜빙 1/8인치, 그리고 nbsp; | 레스테크 | 25306 | 외경 x 0.063" 내경, 3m |
| 시험관(마이크로파 외부에 반응 용기를 사용하는 홀더) 및 nbsp; | 다양한 판매자들 | (30 x 175) | |
| 시험관 (반응 용기) | 코닝 글라스 | 9820-25X | 파이렉스 25 x 200 mm, 림 없는 |
| 밸브 | 아이덱스 | P-721 | ETFE (2회) |
| 왕 SPPS 수지, 1% 가교 디비닐벤젠, 100-200 메쉬 | 고급 화학기술 |