우리는 세포 증식 염색을 사용하여 제브라피시 T-급성 림프모구성 백혈병 모델에서 정지 세포를 식별했습니다. 염색은 분열하지 않는 세포에 유지되고 세포 증식 중에 감소하여 추가 조사를 위해 휴면 세포를 선택할 수 있습니다. 이 프로토콜은 세포 정지의 맥락에서 자가 재생을 연구하기 위한 기능적 도구를 제공합니다.
우리는 세포 증식 염색을 사용하여 제브라피시 T-급성 림프모구성 백혈병 모델에서 정지 세포를 식별했습니다. 염색은 분열하지 않는 세포에 유지되고 세포 증식 중에 감소하여 추가 조사를 위해 휴면 세포를 선택할 수 있습니다. 이 프로토콜은 세포 정지의 맥락에서 자가 재생을 연구하기 위한 기능적 도구를 제공합니다.
세포 정지는 정상 및 암 줄기 세포(CSC)에 설명된 성장 정지 또는 느린 증식 상태입니다. Quiescence는 항증식성 화학 요법 약물로부터 CSC를 보호할 수 있습니다. T세포 급성 림프모구성 백혈병(T-ALL) 환자 유래 이종이식(PDX) 마우스 모델에서 정지 세포는 치료 저항성 및 줄기 농도와 관련이 있습니다. 세포 증식 염료는 세포 분열을 추적하는 데 널리 사용되는 도구입니다. 형광 염료는 세포막의 아민기와 세포 내부의 거대분자에 공유 결합되어 있습니다. 이를 통해 최대 10개의 분열에 대해 라벨링된 세포를 추적할 수 있으며, 이는 유세포 분석으로 해결할 수 있습니다.
궁극적으로 증식 속도가 가장 높은 세포는 세포 분열할 때마다 희석되기 때문에 염료 유지율이 낮고, 휴면 상태이며 분열 속도가 느린 세포는 가장 높은 유지력을 갖습니다. 휴면 세포를 분리하기 위한 세포 증식 염료의 사용은 T-ALL 마우스 모델에서 최적화되고 설명되었습니다. 기존 마우스 모델을 보완하는 rag2:Myc 유래 제브라피시 T-ALL 모델은 백혈병 줄기세포(LSC)의 빈도가 높고 대규모 이식 실험을 위한 제브라피시의 편리성으로 인해 T-ALL에서 자가 재생을 조사할 수 있는 훌륭한 장소를 제공합니다.
여기에서는 세포 증식 염료를 사용한 제브라피시 T-ALL 세포 염색, 제브라피시 세포의 염료 농도 최적화, 성공적으로 염색된 생체 내 세포 패시에이지, 이식된 동물에서 살아있는 세포 분류를 통해 다양한 염료 머무름 수준을 가진 세포 수집을 위한 워크플로우에 대해 설명합니다. T-ALL에 LSC에 대한 잘 정립된 세포 표면 메이커가 없다는 점을 감안할 때, 이 접근 방식은 생체 내에서 정지 세포를 조사할 수 있는 기능적 수단을 제공합니다. 대표적인 결과를 위해, 우리는 생착 효율과 고농도 및 저염료 보유 세포의 LSC 빈도를 설명합니다. 이 방법은 약물 반응, 전사 프로필 및 형태를 포함한 정지 세포의 추가 특성을 조사하는 데 도움이 될 수 있습니다.
성체 줄기세포는 주어진 장기에서 분화된 세포 유형의 재생을 담당하며, 주로 휴면 상태, 분열하지 않는 상태로 존재한다 1,2. 예를 들어, 혈액을 유지하는 조혈모세포(hematopoietic stem cell, HSC)는 대부분 정지 상태를 유지하며, 극히 일부만이 세포주기에 들어가 자가 재생하거나 분화하여 성숙한 혈액 성분을 생성한다3. 이와 유사하게, 암의 경우, 암 줄기세포(cancer stem cell, CSCs)라고 불리는 희귀한 세포의 하위 집단(subpopulation)이 자가 재생 능력을 가지고 있으며, 악성 종양의 장기 유지를 담당한다4. 암 줄기세포는 생체 내에서 정지 상태 또는 느린 성장 상태로 존재하며, 이로 인해 항증식성 암 치료5를회피하고, 면역 체계의 제거를 회피하고6, 산화 스트레스를 줄이고, DNA 복구 경로를 향상시킬 수있다7. 치료 후 남겨진 CSC의 수가 적어도 종양이 다시 증식할 수 있으며, 이로 인해 환자의 재발이 발생할 수 있다8. 따라서 셀룰러 정지를 이해하는 것은 CSC의 잠재적 취약성을 식별하고 이를 표적으로 하는 새로운 방법을 개발하는 데 큰 가능성을 제공합니다.
카르복시플루오레세인 숙시니미딜 에스테르(carboxyfluorescein succinimidyl ester, CFSE) 염색 및 그 유도체와 같은 세포 증식 염료는 세포 분열 빈도를 추적하는 데 일반적으로 사용된다9. 염료는 세포막을 가로질러 투과되며 세포 내부로 들어가면 세포 내 에스테라아제에 의해 활성화되어 형광 생성물이 됩니다. 생성된 형광 화합물은 세포내 단백질(10)의 숙시니미딜 부분과 아민 작용기 사이에 형성된 공유 아미드 결합을 통해 세포 내부에 유지됩니다. 각 세포 분열과 함께 형광 화합물은 생성된 두 세포 사이에서 균등하게 분할되어 2배 신호 희석을 일으킵니다. 이 염료는 유세포 분석11을 통해 최대 10개의 세포 분열을 검출할 수 있습니다.
이 접근법은 이전에 염료11,12의 높은 머무름을 가진 세포의 느린 순환 집단을 식별함으로써 시험관 내에서 CSC 집단을 농축하는 데 사용되었습니다. T-ALL에서 CFSE는 마우스의 환자 유래 이종이식에서 생체 내 종양 성장을 추적하는 데 사용되었습니다. 세포 라벨링과 3주간의 이식 후 유세포 분석 결과 CFSE 형광을 여전히 유지하는 드문 세포 집단이 나타났습니다. 이 집단은 환자에서 줄기세포, 치료 저항성, 재발 유발 세포와의 높은 유사성과 관련이 있었다13. 따라서 이 염료는 T-ALL에서 백혈병 줄기세포(LSC) 표현형을 연구하는 데 유용한 도구를 제공합니다.
이 연구의 목적은 제브라피시 T-ALL 모델을 사용하여 생체 내 정지를 연구하기 위해 세포 증식 염료의 적용을 확장하는 것입니다. 특히, rag2:Myc-driven zebrafish T-ALL model14 는 마우스 모델 및 인간 질병15에 비해 LSC의 빈도가 높기 때문에 자가 재생 연구를 위한 훌륭한 장소를 제공한다. 또한, 제브라피시를 사용하면 대규모 이식 연구가 가능하며, 이는 생쥐에 비해 훨씬 저렴한 관리 및 유지 관리 비용으로 수행할 수 있습니다16. 제브라피쉬는 간단한 형광 현미경을 사용하여 종양 발생 속도를 추정하기 위해 형광 표지된 종양 세포를 쉽게 볼 수 있기 때문에 실시간 이미징 응용 분야에도 탁월합니다16.
이 프로토콜에서는 세포 증식 염료로 제브라피시 T-ALL 세포를 염색한 후 합성 CG1 제브라피시에서 염색된 세포의 생체 내 증식을 수행하는 워크플로우를 설명합니다. 백혈병 발병 시, 염료를 유지한 세포의 분류와 LSC 자가 재생률을 정량화하기 위한 후속 제한 희석 이식 실험에 사용하는 방법에 대해 설명합니다. 이 프로토콜은 정지 LSC를 표적으로 하기 위한 잠재적 화합물의 생체 내 약물 스크리닝을 포함한 추가 응용 분야로 확장될 수 있습니다. 또한 수집된 세포는 전사체 프로파일링, 단백질체학 및 대사체학과 같은 다양한 다운스트림 분석에 사용할 수 있으며, T-ALL에서 정지 LSC의 거동에 대한 고유한 통찰력을 제공합니다.
이 프로토콜에서는 이전에 CG1 균주에서 생성된 GFP 표지 제브라피시 T-ALL 세포를 사용하여 수혜자 합성 CG1 제브라피시15에 직접 주입할 수 있습니다. 간단히 말해서, 백혈병은 단세포 CG1 제브라피시 배아에 rag2:Myc 및 rag2:GFP 의 DNA 미세 주입에 의해 생성되었습니다. 동물은 형광 현미경을 사용하여 주사 후 3주부터 백혈병 발병을 모니터링했습니다. GFP 양성 백혈병 세포를 FACS로 분리하고 수혜자 CG1 제브라피시에 연속적으로 이식하여 고빈도의 LSC를 가진 클론을 생성했습니다. 전체 프로토콜에 대한 자세한 내용은 Blackburn et al.15에 설명되어 있습니다.
대안적으로, 1차 rag2:Myc-유래 T-ALL은 제브라피시 배아17의 DNA 미세주입에 의해 생성될 수 있다. GFP와 같은 rag2 기반 형광 리포터를 사용하여 rag2:Myc 의 DNA 미세 주입은 B 세포, T 세포 및 혼합 ALL18의 발달을 초래할 수 있습니다. 이 프로토콜에 사용된 백혈병 클론은 이전에 T-ALL15로 확인되었습니다. 제브라피시와 관련된 모든 실험 절차는 켄터키 대학교의 기관 동물 관리 및 사용 위원회(프로토콜 2019-3399)의 검토 및 승인을 받았습니다.
1. in vivo 제브라피시 T-ALL 세포 증식
2. 형광 표지된 백혈병 세포의 채취
3. 염색 및 제브라피시 세포 생존율을 위한 세포 증식 염료(CellTrace Far Red) 농도 최적화
참고: 이 프로토콜의 경우 종양 세포가 GFP 라벨링되어 있기 때문에 CT-FR이라고 하는 스펙트럼 중복을 피하기 위해 원적색 세포 증식 염료(CellTrace Far Red)를 사용했습니다.
4. 생체 내에서 CT-FR 염색된 T-ALL 제브라피시 세포 증식
5. CT-FR 염색 제브라피시 T-ALL 세포 분류 준비
6. 정렬
알림: 분류에 사용할 때를 제외하고 모든 튜브와 기증자 플레이트를 얼음 위에 두십시오.
7. 희석을 제한하고 종양 발병을 추적하면서 분류된 세포를 이식합니다.
8. 백혈병 줄기세포 빈도 측정

그림 1: 제브라피시 T-ALL 모델에서 정지 세포를 분리하기 위해 세포 추적 염색을 사용하기 위한 워크플로우. 세포 증식 염색으로 제브라피시 T-ALL 세포 염색, CG1 제브라피시로 증식(상단 패널), 세포 증식 염색의 머무름에 따른 세포 분류(중간 패널)의 개략도. 수집된 세포는 LSC(하단 패널)의 빈도를 측정하기 위한 제한 희석 분석에 사용되었습니다. 약어: T-ALL = T-세포 급성 림프구성 백혈병; LSC = 백혈병 줄기 세포; CT-FR = CellTrace 원적색; FITC = 플루오레세인 이소티오시아네이트; PE = 피코에리트린. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
위에서 설명한 프로토콜에 따라 세포 증식 염료인 CT-FR을 유지한 세포를 분류하고 이를 제한 희석 분석(LDA)에 사용하여 CT-FR High 및 CT-FR Low 집단에서 LSC 빈도를 추정했습니다. 유세포 분석 실험에 대한 게이팅을 설정하기 위해 단색 대조군 외에 형광단 없음(색상 없음) 대조군을 사용했습니다 (그림 2A). 이러한 사분면은 분류 게이트 설정을 위해 FITC 및 PE 양성 및 음성 모집단을 식별하는 데 사용되었습니다. CT-FR 단색 양성 대조군은 이식되지 않은 제브라피시에서 WT 세포를 염색하여 분류 당일에 준비되었으므로 신호 강도는 샘플에서 전파된 세포의 신호보다 훨씬 높을 것으로 예상됩니다.
CT-FR 염색된 GPF T-ALL(그림 2B)에서 0.13%의 낮은 빈도로 우측 상단 사분면에 나타나는 세포는 CT-FR High로 간주되었으며 "CT-FR high"로 표시된 분류 게이트가 이 사분면에 배치되었습니다. CT-FR Low인 백혈병 세포를 수집하기 위해 오른쪽 하단 사분면에 또 다른 게이트를 만들었습니다. CT-FR High cell은 종양 샘플에서 낮은 농도로 존재했기 때문에 제한 희석 실험에 필요한 수의 세포를 수집하기 위해 많은 수의 세포(~2.5 × 10,6)를 분류했습니다.
CG1 제브라피쉬에 LDA를 위해 분류된 세포를 이식한 후, 제브라피시를 6주 동안 모니터링했습니다. CT-FR High의 세포는 CT-FR Low 세포 집단(p = 0.0134)에 비해 LSC 주파수가 4배 더 높았습니다(그림 3A). 이식 후 28일째 되는 날의 동물의 대표적인 이미지가 (그림 3B)에 나와 있습니다. CT-FR High, 10 cell dose 그룹에서는 9마리 중 8마리(89%)에서 백혈병이 발병한 반면, CT-FR Low 그룹에서는 10마리 중 2마리(20%)가 백혈병에 걸렸다(그림 3A). CT-FR High 그룹의 동물은 백혈병에 대한 잠복기가 현저히 짧았습니다(p = 0.0014)(그림 3C). 마지막으로, CT-FR High의 동물은 전체 생존율이 현저히 낮았습니다(p = 0.0408)(그림 3D). 6주차에 CT-FR Low 동물의 70%가 살아 있는 반면 CT-FR High 동물은 10%에 불과했습니다. 이러한 결과는 rag2:Myc 기반 제브라피시 T-ALL 모델에서 천천히 분열하는 정지 세포 집단 내에서 자가 재생 LSC의 농축과 이 집단을 분리하기 위한 세포 증식 염색의 활용을 보여줍니다.

그림 2: 유세포 분석을 사용한 세포 분류. (A) 갓 CT-FR로 염색된 WT 세포와 GFP-표지된 T-ALL 세포의 FACS 플롯을 사용하여 CT-FR 염색된 WT 세포를 분류하기 위한 게이트를 생성했습니다. GFP+ T-ALL 세포. (B) 증식된 CT-FR 염색된 GFP+ T-ALL 세포의 대표적인 예. 오른쪽 상단 사분면의 셀은 CT-FR High로 간주되었고 오른쪽 하단 사분면의 셀은 CT-FR Low로 간주되었습니다. 약어: T-ALL = T-세포 급성 림프구성 백혈병; CT-FR = CellTrace 원적색; GFP = 녹색 형광 단백질; FITC = 플루오레세인 이소티오시아네이트; PE = 피코에리트린; FACS = 형광 활성화 세포 분류; WT = 와일드 타입. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 3: 세포 증식 염색의 머무름이 높은 세포에서 상당히 더 높은 LSC 빈도. (A) 이식 후 두 가지 용량의 세포(10개 및 25개 세포)를 증가시킨 백혈병 양성 동물의 수를 나타내는 제한 희석 분석의 데이터. 계산된 LSC 빈도와 95% 신뢰 구간이 명시되어 있습니다(p = 0.0134). (B) 이식 후 28일 후의 동물의 대표 이미지; 척도 막대 = 10mm. (C) 동물의 >50%가 GFP 양성이 되는 데 필요한 시간으로 간주되는 중대한 백혈병에 대한 잠복기로, 상당한 백혈병 부담을 나타냅니다. (D) 10개의 세포를 이식한 동물의 생존 곡선. 약어: LSCs = 백혈병 줄기 세포; CT-FR = CellTrace 파 레드. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
LSC는 기존의 항증식 화학요법 치료에 내성이 있는 것으로 알려져 있으며, 이러한 세포에 대한 표적 치료법을 찾는 것은 재발 발생을 줄이고 환자 예후를 개선하는 데 큰 가능성을 가지고 있습니다20. 이전 연구에서는 T-ALL PDX 모델13에서 약물 내성 및 줄기성과 관련된 소량의 정지 세포 집단을 식별하기 위해 형광 세포 증식 염색을 사용하는 방법을 설명했습니다. 이 연구에서는 T-ALL의 제브라피시 모델에서 느리게 분열하거나 정지된 세포를 해결하기 위해 유사한 세포 증식 염색을 사용하는 방법을 설명합니다. 우리는 이 도구를 사용하여 세포 증식 염색의 머무름이 가장 높은 세포에서 LSC의 농축을 설명했습니다. 이러한 조사를 제브라피시로 확장하면 많은 이점이 있습니다. 제브라피쉬는 번식력이 매우 높습니다. 각 교배 쌍은 매주 수백 마리의 자손을 낳을 수 있어 이식에 힘을 실어주고 많은 수의 동물을 필요로 하는 희석 연구를 제한할 수 있습니다 15,17,21. 또한, 제브라피쉬는 in vivo 이미징에 매우 편리하여 간단한 형광 현미경 검사로 양성 동물을 신속하게 스크리닝할 수 있습니다16. 따라서 이 프로토콜은 제브라피시 T-ALL 모델에서 정지 세포에 대한 추가 조사의 기초가 될 수 있습니다.
여기서 우리는 이전에 CG1 제브라피시15에서 생성된 고주파의 LSC를 가진 T-ALL 클론의 사용을 설명하고, 따라서 동결된 세포를 사용하기 위해 단순히 해동하고 증식시켰다. 대안적으로, rag2:Myc-driven T-ALL은 제브라피시 배아의 DNA 미세주입, T-ALL이 발생하는 동물을 스크리닝하고 이전에 설명한 바와 같이 양성 제브라피시로부터 백혈병을 채취하여 생성할 수 있다17. 합성 제브라피쉬의 사용은 또한 이러한 유형의 연구에 많은 이점을 제공합니다. 동물이 유전적으로 동일하기 때문에 이식된 세포는 새로운 미세 환경에 적응할 필요 없이 숙주 내에서 강력하게 생착할 수 있어 LSC 빈도 15,17,22를 정확하게 추정할 수 있습니다.
합성 동물을 사용하는 대신 화학적 또는 방사선 매개 면역 절제를 거친 야생형 제브라피시 균주를 사용하여 이 프로토콜을 따를 수 있습니다. 면역 절제 동물을 사용하는 경우, 동종 이식에서 성공적인 생착을 위해 더 많은 세포가 필요할 수 있으므로 제한 희석 분석을 최적화하기 위해 주의를 기울여야 합니다. 또한, 21일 후에는 면역 체계가 회복되기 때문에 더 짧은 관찰 기간이 필요할 수 있다17. 이 프로토콜은 인간 세포의 이종 이식으로도 확장될 수 있습니다. 제브라피쉬는 암이종장기이식을 위한 효율적이고 비용 효율적인 모델로 부상했으며, 이는 제브라피시를 보완하는 마우스의 이종장기이식을 보완한다16. 성체 면역 결핍 prkdc−/−, il2rga−/− 제브라피쉬는 37°C에서 최대 60일 동안 인간 세포를 성공적으로 생착하는 데 사용되었다23. 이 모델을 사용하면 여기에 설명된 대로 염색된 세포를 증식하고 생체 내에서 분할하는 대신 인간 세포를 염색하고 시험관 내에서 분열시킨 다음 분류하여 생체 내 연구를 위해 prkdc−/−, il2rga−/− 제브라피시에 이식할 수 있습니다. 제브라피시를 이종이식 모델로 사용할 때 몇 가지 제한 사항을 고려해야 합니다. 예를 들어, 제브라피쉬는 37°C에서 생존할 수 있도록 적응해야 합니다. 또한, 제브라피시에는 폐 및 유방과 같은 특정 장기가 없기 때문에 특정 암에 대해 기형외과 이식이 불가능할 수 있습니다16.
결론적으로, 제브라피시 T-ALL 모델에서 세포 증식 염색을 사용하는 것은 정지 LSC와 질병 발병 및 치료 저항성에서의 역할을 조사하기 위한 유망한 방법을 제공합니다. 비용 효율성 및 유전적 동질성을 포함한 CG1 제브라피시의 장점을 활용하는 이 프로토콜은 T-ALL의 LSC 생물학을 이해하기 위한 강력한 플랫폼을 제공합니다. 제브라피시 모델의 사용은 마우스 및 PDX 모델을 보완하여 궁극적으로 T-ALL 환자의 예후를 개선할 수 있는 최적화된 표적 치료법을 개발할 수 있습니다.
저자는 공개할 이해 상충이 없습니다.
이 연구를 위한 자금은 미국 국립암연구소(National Cancer Institute, R37CA227656에서 JSB로)에서 제공했다. 이 연구는 또한 켄터키 대학교 마키 암 센터(P30CA177558)의 유세포 분석 및 면역 모니터링 공유 리소스의 지원을 받았습니다.
| 이름 | 회사 | 카탈로그 번호 | 댓글 |
|---|---|---|---|
| 26 G/2" 마이크로 주사기 | Hamilton | 87930 | NA |
| 35 µ m 필터 캡 FACS 튜브 | Falcon | 352235 | NA |
| 40 µ m 세포 여과기 | CELLTREAT | 229482 | NA |
| 96-well skirted PCR plate | Thermo Fisher Scientific | AB0800 | NA |
| 세포 분류기 | Sony Biotechnology | SY3200 | NA |
| CellTrace Far Red | Thermo Fisher Scientific | C34564 | NA |
| 원뿔형 튜브 | VWR | 10026-078 | NA |
| DAPI | Thermo Fisher Scientific | 62248 | NA |
| DMSO | Sigma-Aldrich | D4818 | NA |
| Dulbecco's인산염 완충 식염수(PBS) | Caisson Labs | 22110001 | NA |
| Epifluorescence 실체 현미경 | Nikon | SMZ25 | NA |
| Fetal Bovine Serum (FBS) | Sigma-Aldrich | 12306C | NA |
| Fish system water | N/A | N/A | 0.03-0.05% 염도, pH 6.5-8, 중탄산나트륨 |
| 마이크로 원심분리기 튜브 | Thermo Fisher Scientific | C2171 | NA |
| MS-222 | Pentaire | TRS-1 | 트리카인 메실레이트, 마취제 |
| 페트리 접시 | Corning | 07-202-011 | NA |
| 면도날 | American Line | 66-0089 | NA |
| Trypan Blue | Thermo Fisher 과학적 | T10282 | 북미 |