이 프로토콜은 고순도의 인간 모유에서 세포외 소포를 신속하게 분리하고 효과적으로 분리할 수 있도록 설계되었습니다.
이 프로토콜은 고순도의 인간 모유에서 세포외 소포를 신속하게 분리하고 효과적으로 분리할 수 있도록 설계되었습니다.
약 20-1000nm 크기의 나노 크기 입자인 세포외 소포(EV)는 치료 잠재력으로 인해 빠르게 주목을 받고 있습니다. 특히, 인간 모유 유래 세포외 소포(HBMDEV)는 주로 미숙아에게 영향을 미치는 장 질환인 괴사성 소장결장염의 실험 모델에서 보호를 제공하여 사망률이 50%에 달하는 것으로 나타났습니다. 그러나 감동 초원심분리, 크기 배제 크로마토그래피 등과 같은 전통적인 세포외 소포 분리 기술은 시간이 많이 걸리거나 특수 기기가 필요하며 둘 다 임상 환경에서 실용적이지 않습니다. 따라서 환자에게 HBMDEV를 신속하게 반응적으로 투여할 수 있는 간단한 분리 방법이 필요합니다. 여기서 제안된 것은 지방과 세포 파편을 제거하기 위한 인간 모유의 원심분리와 고수율 및 기능성 세포외 소포를 생성하는 나머지 탈지유의 빠른 한외여과의 조합입니다. 이 기술을 사용하면 임상 환경에서 실용적인 치료 옵션으로 HBMDEV를 사용할 수 있습니다.
세포외 소포(EV)는 엔도좀 경로(미세소포체가 원형질막과 융합하여 세포 화물이 세포외 공간으로 방출되는 것을 촉진할 때) 또는 원형질막 경로(즉, 발아)를 통해 크기가 약 20-1000nm인 유비쿼터스 나노입자입니다. EV에는 지질, 단백질, 핵산, 다양한 대사산물 및 출처에 따라 기타 내용물과 같은 숙주 세포 화물이 포함되어 있습니다. 또한 EV는 세포간 통신, 혈관신생, 면역 억제, 종양 미세환경 리모델링, 암 진행 등에 중요합니다.1,2,3,4. 특히, 인간 모유(HBM)는 EV가 풍부하고 수유부가 쉽게 접근할 수 있습니다5. 최근에는 인간 모유 유래 EV(HBMDEV)가 질병 치료를 위한 치료 벡터로 주목을 받고 있습니다 1,2. 미숙아 또는 저체중아 신생아는 괴사성 소장결장염을 포함한 여러 감염에 취약합니다. 회장 또는 결장 괴사를 특징으로 하는 괴사성 장염은 경미한 장 염증에서 영아 사망률이 50%에 달하는 다기관 장기 부전까지 다양합니다6. 모유 유래 EV를 사용한 전처리는 시험관 내 및 생체 내 NEC의 실험 모델에서 장 염증으로부터 보호하기에 충분합니다 2,7. 따라서 HBMDEV의 활용은 임상 환경에서 NEC 치료를 위한 실행 가능한 옵션이 될 수 있습니다.
HBMDEV의 치료 가능성에도 불구하고 시간이 많이 걸리거나 특수 장비가 필요하다는 점에서 현재의 격리 기술을 사용하는 데 알려진 한계가 있으며 둘 다 임상 환경에서 보편적으로 실용적이지 않습니다. EV 격리의 "황금 표준"에는 여러 차례의 차등 초원심분리가 포함되며, 이는 EV의 만족스러운 수율을 생성하지만 구조적 무결성과 기능에 영향을 미칠 수 있습니다 8,9. 또한, 초원심분리 시간은 최소 2시간일 수 있으며, 이는 임상 환경에서 비용이 많이 드는 자원입니다9. 절연 키트는 시간을 절약하고 어느 정도 비용 효율적인 것으로 입증되었습니다. 그러나 이러한 방법을 사용한 분리는 수율이 낮아 확장성이 낮아집니다. 따라서 EV 수율을 희생하지 않으면서 시간을 절약하고 비용 효율적인 HBMDEV 분리 기술이 필요합니다.
이 프로토콜은 기존의 임상적으로 이용 가능하고 FDA 승인 도구를 사용하여 HBM에서 EV를 신속하게 분리하는 단계별 방법을 설명하는 것을 목표로 합니다. 이를 달성하기 위해 표준 원심분리와 임상 등급 필터 확장 시스템을 활용하여 HBM에서 EV를 분리했습니다. 이러한 소포는 예상 크기 범위 내에 있고, 알려진 EV와 일치하는 형태를 나타내며, EV 마커가 풍부하며, 기존의 초원심분리 분리 기술을 사용하여 분리된 EV와 기능적으로 유사합니다. 따라서 이 HBM EV 분리 프로토콜은 임상 환경에서 HBM에서 분리된 EV의 실용적이고 신속한 분리 및 적용을 허용할 수 있습니다.
모유는 버밍엄에 있는 앨라배마 대학교(UAB) 지역 집중 치료실에서 수집되었습니다. 환자가 사용하기 위해 모유를 해동한 후 수집한 샘플을 수집했으며 환자는 전체 수유를 할 수 없었습니다. 이러한 사료는 일반적으로 폐기되지만 연구 목적으로 수집되었습니다. 비식별화된 개인으로부터 샘플을 수집하여 실험 시간까지 -80°C에서 보관했습니다. 이 컬렉션은 UAB 내부 검토 위원회 프로토콜 N160203002의 승인을 받았습니다. 사용된 시약과 장비는 재료표에 나와 있습니다.
1. 세포외 소포 분리(차등 초원심분리)
2. 세포외 소포 분리(급속여과법)
3. 나노사이트 추적 분석
4. 세포외 소포의 음성 염색 및 투과 전자 현미경
참고: 엑소좀 농도가 108 범위인 샘플을 투과 전자 현미경(TEM)에 사용했습니다.
5. 단백질 농도
6. 웨스턴 블롯
7. IEC-6 세포의 시험관 내 배양
초원심분리 및 신속 분리를 이용한 EV 분리
독단적으로 HBM으로부터의 EV 분리에는 유지방 및 기타 큰 입자를 제거하기 위한 원심분리, 여과, 여러 차례의 초원심분리 및 PBS에서 EV 농축 샘플의 재현탁이 포함됩니다. 급속 여과 방법은 원심분리를 활용하여 유지방과 세포 파편을 제거한 다음 0.22μm 필터 확장 필터를 통해 여과하여 잔류 파편을 추가로 제거하여 기존 초원심분리에 필적하는 EV 농축 샘플을 생성합니다(그림 1).
필터 확장 급속 여과 시스템의 HBMDEV 특성화
Nanosight 추적 분석은 초원심분리(그림 2A)와 급속 필터 분리 HBMDEV(그림 2B) 사이에 비슷한 입자 크기를 보여주었습니다. 두 방법 모두 분리된 EV의 평균 크기가 약 100nm임을 나타냅니다. EV는 숙주 세포에서 다양한 표적으로 분비하기 위해 다양한 화물(즉, 단백질, 지질, miRNA 등)을 운반합니다. 따라서, 조사된 첫 번째 표적 단백질은 열충격 단백질 70(Hsp70)으로, EV를 통해 수송되는 것으로 알려진 단백질이다13. 웨스턴 블롯 분석은 급속 여과를 사용하여 분리된 EV가 초원심분리를 사용하여 분리된 EV와 유사한 Hsp70 발현을 나타냈음을 보여줍니다(그림 3A 및 보충 그림 1A). 또한, EV는 CD9 및 CD63과 같은 테트라스파닌의 표면 발현을 통해 식별될 수 있습니다14. 웨스턴 블롯 분석은 급속 여과를 통해 분리된 EV가 실제로 CD9(그림 3B 및 보충 그림 2B) 및 CD63(그림 3C 및 보충 그림 3C)을 발현하는 것으로 나타났습니다. 마지막으로, 투과 전자 현미경을 통한 HBMDEV의 형태학적 분석은 두 분리 기술 간에 유사한 소포 형태를 나타냈습니다(그림 4A-D).
여러 실험실에서 EV가 세포 스트레스 동안 세포 생존을 촉진하는 보호 특성을 부여한다는 것을 보여주었습니다 2,3,7. 이전에 발표된 보고서와 유사하게 신속 여과 방법을 사용하여 분리된 EV는 과산화수소 유도 세포 사멸로부터 장 상피 세포(IEC-6)를 보호할 수 있습니다2 (그림 5A,B). 이러한 데이터는 급속 여과 방법을 사용하여 분리된 HBMDEV가 차등 초원심분리를 사용하여 분리된 HBMDEV와 비교 품질을 가질 뿐만 아니라 기능적으로도 유사하다는 것을 시사합니다.

그림 1: 인간 모유에서 EV를 분리하는 초원심분리와 급속여과 방법의 차이점을 설명하는 개략도. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 2: 초원심분리 및 급속여과 방법을 사용하여 인간 모유에서 분리된 EV의 나노사이트 추적 분석. (A) 초원심분리를 사용하여 분리된 인간 모유 EV(1x PBS에서 1:1000로 희석)의 NTA. 표시된 데이터는 3-4개의 독립적인 시험을 단일로 표현한 것입니다. (B) 급속 여과를 사용하여 분리된 인간 모유 EV의 NTA. 표시된 데이터는 3-4개의 독립적인 시험을 단일로 표현한 것입니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 3: 초원심분리 및 급속 여과를 사용하여 분리된 EV의 웨스턴 블롯 분석. (A) 열충격 단백질 70(Hsp70) 10μg의 1초 노출. "L"은 사다리를 나타내고, "U"는 초원심분리를 나타내며, "R"은 급속 여과를 나타냅니다. 급속 여과에 의해 얻은 샘플을 110,000 × g 에서 70분 동안 원심분리하여 두 번 농축했습니다. 표시된 이미지는 4개의 독립적인 시험 중 하나를 나타냅니다. (B) CD9 10μg의 22초 노출. "L"은 사다리를 나타내고, "U"는 초원심분리를 나타내며, "R"은 급속 여과를 나타냅니다. 급속 여과 샘플은 70분 동안 110,000 × g에서 원심분리하여 농축하고 2회 수행했습니다. 표시된 이미지는 4개의 독립적인 시험 중 하나를 나타냅니다. (C) CD63 10μg의 22초 노출. "L"은 사다리를 나타내고, "U"는 초원심분리를 나타내며, "R"은 급속 여과를 나타냅니다. 급속 여과 샘플은 70분 동안 110,000 × g에서 원심분리하여 농축하고 2회 수행했습니다. 표시된 이미지는 4개의 독립적인 시험 중 하나를 나타냅니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 4: 초원심분리 및 급속여과를 사용하여 분리된 EV의 투과전자 현미경 분석. (A) 8,000× 배율의 초원심분리를 사용하여 분리된 EV의 전자 현미경 사진. 스케일 바 = 800nm. 표시된 이미지는 세 가지 독립적인 시험 중 하나를 나타냅니다. (B) 20,000× 배율의 초원심분리를 사용하여 분리된 EV의 전자 현미경 사진. 스케일 바 = 200nm. 표시된 이미지는 세 가지 독립적인 시험 중 하나를 나타냅니다. (C) 8,000× 배율의 급속 여과를 사용하여 분리된 EV의 전자 현미경 사진. 스케일 바 = 800nm. EV는 70분 동안 110,000 × g 에서 원심분리하여 농축하고 2회 수행했습니다. 표시된 이미지는 세 가지 독립적인 시험 중 하나를 나타냅니다. (D) 20,000× 배율의 급속 여과를 사용하여 분리된 EV의 전자 현미경 사진. 스케일 바 = 200nm. EV를 110,000 × g 에서 70분 동안 원심분리하여 농축하고 2회 수행했습니다. 표시된 이미지는 세 가지 독립적인 시험 중 하나를 나타냅니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 5: 초원심분리 및 급속 여과를 사용하여 분리된 EV의 기능 분석. (A) EV가 없는 완전 RPMI-1640 배지에서 배양된 IEC-6 세포의 세포 생존력. 세포를 400μM, H, 2, O2 및 10μg/mL의 EV로 동시에 하룻밤 동안 처리했습니다. 표시된 데이터는 두 개의 독립적인 시험 중 하나를 나타냅니다. (B) EV가 없는 완전 RPMI-1640 배지에서 배양된 IEC-6 세포의 세포 수. 세포를 400μM, H, 2, O2 및 10μg/mL의 EV로 동시에 하룻밤 동안 처리했습니다. 표시된 데이터는 두 개의 독립적인 시험 중 하나를 나타냅니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
보충 그림 1: 초원심분리 및 급속 여과를 사용하여 분리된 EV에서 Hsp70의 웨스턴 블롯 특성화. 10μg의 열충격 단백질 70(Hsp70)을 1초 동안 노출시켰습니다. "L"은 사다리를 나타내고, "U"는 초원심분리를 나타내며, "R"은 급속 여과를 나타냅니다. 급속 여과 샘플은 70분 동안 110,000 × g에서 원심분리하여 농축하고 2회 수행했습니다. 각 샘플은 단일 생물학적 복제를 나타냅니다. 이 파일을 다운로드하려면 여기를 클릭하십시오.
보충 그림 2: 초원심분리 및 급속여과를 사용하여 분리된 EV에서 CD9의 웨스턴 블롯 특성화. CD9 10μg의 5분 노출. "L"은 사다리를 나타내고, "U"는 초원심분리를 나타내며, "R"은 급속 여과를 나타냅니다. 급속 여과 시료를 110,000 × g 에서 70분 동안 원심분리하여 농축하고 2회 수행하였다. 각 샘플은 단일 생물학적 복제를 나타냅니다. 이 파일을 다운로드하려면 여기를 클릭하십시오.
보충 그림 3: 초원심분리 및 급속 여과를 사용하여 분리된 EV에서 CD63의 웨스턴 블롯 특성화. 10μg의 CD63을 10분 동안 노출시킵니다. "L"은 사다리를 나타내고, "U"는 초원심분리를 나타내며, "R"은 급속 여과를 나타냅니다. 급속 여과 시료를 110,000 × g 에서 70분 동안 원심분리하여 농축하고 2회 수행하였다. 각 샘플은 단일 생물학적 복제를 나타냅니다. 이 파일을 다운로드하려면 여기를 클릭하십시오.
EV는 다양한 염증 메커니즘을 조절하고 보호 이점을 제공할 수 있다는 문헌에 따르면 주목을 받고 있습니다 2,7. 그러나 임상 환경에서 EV의 실제 사용의 한계는 EV를 분리하고 충분한 수율을 추출하는 데 필요한 시간입니다 8,15. 여기에서는 FDA 승인 여과 시스템을 사용하여 HBM에서 EV를 빠르고 효율적으로 분리하기 위한 단계별 프로토콜이 설명되었습니다. 이 방법의 유용성은 수율 저하 없이 기존 EV 절연 방법을 절반으로 줄입니다. 따라서 이 프로토콜은 가까운 장래에 EV 요법이 승인될 경우 임상 환경에서 인간 모유 유래 EV의 실제 치료 적용을 허용할 수 있습니다.
기존 EV 격리 프로토콜은 소스 유체에서 EV의 일관되고 효과적인 수율을 입증했습니다. 그러나 황금 표준, 차등 초원심분리, 상용 키트 사용 등 전통적인 격리 수단에는 한계가 없는 것은 아닙니다. 차등 초원심분리를 통한 EV의 분리는 효과적이지만 최소 ~3시간 2,8,15의 결합된 스핀 시간을 포함하는 프로토콜에서는 시간이 많이 걸립니다. EV 수를 적절하게 정량화하기 위한 프로토콜과 결합된 격리 시간은 임상 환경에서 시간 제약 하에서 사용하기 어렵게 만들 것입니다. 더욱이 상용 키트는 효과적이지만 비용이 많이 듭니다. 또한 이러한 키트의 높은 비용을 감안할 때 키트당 처리할 수 있는 샘플 수가 적습니다 8,15.
이 프로토콜은 EV 수율이나 순도를 희생하지 않고 시간과 비용을 절약하는 이러한 제한에 대한 솔루션을 제공합니다. 이 프로토콜이 효과적이려면 프로토콜을 수행할 때 따라야 하는 주요 단계가 있습니다. 모유의 희석 및 초기 원심분리는 우유 샘플에서 세포외 파편과 유지방을 제거하는 데 필요합니다. 이 잔해물을 제거하는 것은 필터 확장 시스템의 막힘을 방지하는 데 중요하므로 하나의 샘플에 여러 필터를 사용할 필요가 없습니다. 또한 PBS로 필터 확장 시스템을 세척하는 것은 샘플을 준비하기 위해 필터를 프라이밍하기 때문에 중요합니다. 프라이밍은 프라이밍 과정에서 샘플이 손실되지 않도록 하는 데 도움이 됩니다. 모유 샘플의 함량에 따라 여과 전에 샘플을 희석 및 원심분리하는 것과 관계없이 하나 이상의 필터 확장 세트가 필요할 수 있다는 점에 유의해야 합니다. 이 경우 둘 이상의 필터를 사용할 수 있습니다. 그러나 새로운 필터 확장 세트는 샘플을 여과하기 전에 프라이밍해야 합니다.
이 프로토콜은 인간 모유에서 EV를 분리하는 데 효과적이고 일관되지만 고려해야 할 몇 가지 제한 사항이 있습니다. 샘플을 여과 하기 전에 원심분리 단계(두 스핀 사이의 총 시간 ~20분)가 필요합니다. 원심분리 없이 희석된 시료를 여과하려고 하면 필터 확장 시스템이 반복적으로 막히고 시료가 손실되며 EV 분리 프로토콜에 추가 시간이 추가됩니다. 더욱이 NTA 및 TEM 분석에서 입증된 바와 같이 샘플은 순수하지 않았습니다. 여과 전에 원심분리되지 않은 샘플을 사용하려고 하면 원치 않는 오염 물질이 샘플에 유입될 수 있으며, 이는 분리된 EV의 향후 다운스트림 적용에 따라 표적을 벗어난 효과를 생성할 수 있습니다. 또한 이 프로토콜은 인간 모유에서 EV를 분리하는 경우에만 구현되었습니다. 따라서 다른 유체로부터 EV를 분리하는 이 프로토콜의 효능은 조사되지 않았습니다. 모든 체액의 수성 특성을 감안할 때 이 프로토콜을 사용하여 EV를 다른 소스로부터 분리하는 경우 EV 순도와 수율에 차이가 없을 것으로 예상됩니다.
또한 이 프로토콜은 작은 세포외 소포(sEV)를 분리하는 데 효율적이라는 점에 유의해야 합니다. NTA에 따르면 HBM 유래 EV의 크기는 ~100nm였으며, 이는 샘플에 더 큰 EV가 존재하지 않음을 시사합니다. 그 이유는 이 연구 당시 실험실의 주요 초점인 엑소좀 및 기타 더 작은 EV의 분리에 주로 사용되는 0.22μm 필터를 사용하여 샘플을 필터링했기 때문입니다. 이론적으로 기공 크기가 더 큰 필터를 사용하면 더 큰 EV를 격리할 수 있습니다. 그러나 이러한 질문은 본 연구의 범위를 벗어납니다.
인간 모유 유래 EV는 임상 사용을 위해 쉽게 접근할 수 있는 천연 치료 원천을 나타냅니다. EV 작업을 임상 환경에 도입하는 데 있어 한 가지 제한 사항은 모든 시설에서 잠재적으로 사용할 수 있는 실용적인 방법으로 EV를 격리하는 것입니다. 이 프로토콜은 이러한 한계를 극복하도록 설계되었으며 병원 환경에서 쉽게 적용할 수 있으며 상업적으로 이용 가능한 기존 병원 등급의 FDA 승인 여과 시스템을 사용하여 구현하거나 표준 초원심분리기보다 훨씬 저렴한 가격에 구입할 수 있습니다. 이 방법은 비용 효율적이며 임상 환경에서 이미 사용되는 여과 시스템에서 EV가 풍부하고 순수한 샘플을 생성합니다.
저자는 이 기사의 연구, 저자 및/또는 출판과 관련하여 잠재적인 이해 상충이 없음을 선언했습니다.
이미지와 그림은 biorender.com 사용하여 생성되었습니다. 이 간행물에 보고된 연구는 UAB 고해상도 이미징 시설의 지원을 받았습니다. 이 작업은 NIH/NICHD 5R21HD104481의 지원을 받았습니다.
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