현재 연구는 기계 학습을 사용하여 TgF344-AD 쥐를 포함한 설치류 모델의 운동 결함을 검사하기 위한 미세 운동 행동 테스트를 설명합니다.
방법 논문
현재 연구는 기계 학습을 사용하여 TgF344-AD 쥐를 포함한 설치류 모델의 운동 결함을 검사하기 위한 미세 운동 행동 테스트를 설명합니다.
운동 기능 장애는 알츠하이머병(Alzheimer's disease, AD) 및 관련 치매와 같은 신경 퇴행성 질환의 중요한 구성 요소이지만 종종 과소 평가됩니다. 새로운 연구에 따르면 인간의 소근육 운동 행동, 시공간 능력 및 실행 기능과 관련된 작업이 질병을 조기에 발견하는 데 잠재력이 있을 수 있습니다. 그러나 이러한 작업이 AD와 관련된 인지 및 기능 저하를 예측하는 정확한 메커니즘에 대해서는 알려진 바가 거의 없습니다. 현재 방법에서는 무료 오픈 소스 머신 러닝 소프트웨어를 사용하여 다른 신경퇴행성 질환 및 정상 노화와 비교하여 AD의 전임상 모델에서 질병 진행에 따른 운동 능력의 변화를 조사하기 위해 소근육 운동 과제인 KINEMAT(Kinematic Motor Ability Task)가 만들어졌습니다. 여기서, 개념 증명은 Harmaline 유발 운동 장애가 있거나 없는 Fisher 344 CDF 쥐에 대한 파일럿 연구에서 미세 운동 과제의 설계, 테스트 및 구현과 함께 확립되었습니다. 알츠하이머병 쥐 모델(TgF344-AD)을 사용한 추가 검증을 통해 모델 타당성과 작업 민감도를 추가로 입증했습니다. 쥐들은 방 앞쪽에 있는 작은 구멍을 통해 손을 뻗어 다양한 난이도의 세 그릇 중 하나에서 설탕 알갱이를 꺼내도록 훈련되었습니다. 펠릿 회수는 성공(설탕 펠릿을 성공적으로 잡아 먹는 것), 드롭(잡는 즉시 간식을 잡는 것) 또는 실패(펠릿을 조달하지 못하거나 잡으려고 할 때 펠릿이 그릇에서 떨어짐)의 세 가지 분류 중 하나를 사용하여 점수가 매겨졌습니다. 대조군과 Harmaline 처리한 쥐 사이에서 운동 능력의 유의미한 차이가 관찰되었으며, 이는 총 도달 범위가 감소하고 발 자세 변동성이 증가한 것으로 입증되었습니다. TgF344-AD 쥐는 또한 모든 보울에서 총 도달 범위가 감소하고 성공률이 감소한 것으로 나타났습니다. 이를 설치류의 소근육 운동 과제로 검증함으로써 시간이 지남에 따라 병리학 및 증상이 나타남에 따라 AD를 포함한 신경퇴행성 질환의 정상적인 노화 및 전임상 모델을 연구할 수 있는 향후 잠재력이 있습니다.
알츠하이머병(Alzheimer's disease, AD) 또는 다른 하위 유형(예: 루이소체(Lewy bodies)을 동반한 치매)로 인해 치매 환자의 운동 기능이 손상된 것으로 나타났습니다. 악력과 보행 속도는 인지 장애가 있는 노인과 그렇지 않은 노인을 구별할 수 있지만, 1,2 치매의 다른 하위 유형(즉, 낮은 특이성)을 반드시 구별할 수는 없습니다1,2. 따라서 행동과 질병 상태 간의 복잡한 패턴과 관계를 평가하기 위해 기계 학습과 짝을 이룰 수 있는 초기 치매에 대한 새로운 진단 도구가 계속 필요합니다 3,4. 동물 모델은 신경퇴행성 질환의 진행을 조사하여 조기 질병 발병, 행동 상관 관계에 대한 통찰력을 제공하고 기계 학습을 분석 파이프라인에 통합하여 중증도와 증상을 구별하는 데 유용합니다 5,6,7.
인간의 새로운 행동 방법은 시공간 능력 및 실행 기능과 같은 인지 처리와 함께 소근육 운동 기술을 포함하는 작업을 식별했습니다 8,9,10. 예를 들어, 기능적 상지 작업은 신경 퇴행 패턴을 추적하고 경도 인지 장애(MCI)와 AD를 구별할 수 있습니다. 이 작업에서 인간은 숟가락을 사용하여 생 강낭콩(한 번에 두 개)을 중앙 가정용 컵에서 대상 컵으로 이동합니다. 숟가락으로 콩을 얻는 과제 단계는 콩이 목표 컵으로 운반되는 단계보다 인지(특히 시공간 기억)와 더 강한 연관성을 보여줍니다11,12. 숟가락이 컵에 들어갈 때 컵 안의 콩을 흔들 수 있으며, 이는 참가자의 움직임이 작업을 더 어렵게 만들 수 있음을 의미합니다. 또한, 임상시험이 진행되고 가정용 컵에 담긴 콩의 수가 줄어들면 작업이 더 어려워집니다(즉, 숟가락으로 콩을 얻는 시간이 늘어남)13. 이 작업은 AD 특이적 병리학(아밀로이드)9,14 및 신경퇴행(해마 위축)10,15과 상관관계가 있는 것으로 나타났으며, 이는 그 성과가 질병 진행 초기에 영향을 받는 신경 회로와 행동 과정에 따라 달라질 수 있음을 시사합니다. 운동의 시작, 계획, 실행 및 교정은 대뇌 피질에 위치한 상부 운동 뉴런의 세포체가 척수의 하부 운동 뉴런에서 시냅스를 이루는 운동 피질을 포함하여 뇌를 가로지르는 다양한 네트워크에 의해 제어되는 것으로 알려져 있습니다16. 이 하부 운동 뉴런은 근육과 직접 소통하여 신경근 접합부에서 움직임을 제어합니다. 상행관(ascending tract)은 주변부에서 척수(spinal cord)로 감각 정보를 전달하는 반면, 뇌 내의 하행관(descending tract)은 근육으로 돌아가는 방법과 위치에 대한 방향 정보를 전달합니다17,18. 특히 3xTg-AD 마우스 및 TgF344-AD 랫트를 포함한 유전 동물 모델은 이전에 AD 유전자가 운동, 조정 및 기타 운동 장애에 미치는 영향을 연구하는 데 사용되었기 때문에 이러한 경로가 AD 병리학에 의해 어떻게 선택적으로 영향을 받는지 이해하는 것이 질병 진행을 이해하는 데 중요합니다 19,20,21. 일반적으로 이러한 작업은 전신 운동과 관련된 대근육 운동 장애에 초점을 맞추지만, 인간의 운동 결핍은 훨씬 더 다양하여 설치류에서 식별하기 어려울 수 있습니다22. 따라서 이러한 가변성을 포착하기 위해 인간과 동물 모델 간의 격차를 해소하기 위한 새로운 작업이 필요합니다.
운동 장애와 떨림과 일반적으로 관련이 있는 뇌 영역 중 하나는 소뇌23입니다. 소뇌는 정확하고 조정된 움직임을 조절하는 중요한 조절자이며, 이러한 자발적인 움직임을 교정하고 적응하기 위해 하행 경로를 통해 피드백을 제공하는 감각 정보의 처리자 역할을 합니다24,25. 소뇌 위축은 알츠하이머병 환자에게서 인정되어 왔지만, 해마와 같은 다른 영역과는 달리 소뇌의 아밀로이드 침착 증가는 위축 증가와 상관관계가 없다는 점에 유의하는 것이 중요하다26. 알츠하이머병 병리학의 진행은 소뇌에서 다르지만, 소뇌와 해마 사이에는 AD 27,28,29에서 중단될 가능성이 있는 다중 시냅스 양방향 연결이 있습니다. 특히, 소뇌와 해마 사이에는 기능적 연관성이 있는데, 소뇌 종양 절제술 후 기억력 결핍이 발생하는 것으로 기록되어 있습니다 30,31,32,33,34,35,36,37. 설치류의 경우, 해마 장소 세포는 소뇌 섭동(cerebellar perturbation)으로 파괴된다38. 이러한 기억력, 사교성, 운동 조절 능력의 중복적 결핍은 인지 기능 저하 전에 발생하는 운동 경로의 잠재적인 조기 변화를 발견하는 것이 중요하다는 점을 강조한다 30,31,38,39. 초기 알츠하이머병 연구에서 소근육 운동 과제를 구현함으로써, 우리는 알츠하이머병에 대한 전통적인 이해를 단순히 인지 장애로 재구성하기 시작할 수 있으며, 질병 진행을 예측할 수 있고 인지 장애가 있는 사람과 그렇지 않은 고령화를 더 크게 구별할 수 있는 조기 운동 변화로 진단 노력을 돌릴 수 있습니다.
미세한 운동 행동이 뇌 구조의 변화를 어떻게 나타낼 수 있는지 이해하기 위해 위에서 설명한 인간 작업의 설치류 버전을 만들고 테스트했습니다. 이 설치류 작업은 KINEMAT (KINEmatic Motor Ability Task)로 명명되었으며, 받침대나 계단에서 단일 펠릿을 회수해야 하는 이전 도달 작업과 작업의 모든 단계에서 일관된 펠릿 배치의 결과로 보다 단순한 채점 작업에서 벗어납니다 40,41,42,43,44,45,46, 47,48쪽. 이 미세한 모터 도달 작업에는 새로운 채점 방법, 다양한 난이도의 볼, 인간을 모방하기 위한 자체 교란 기능이 포함되며, 펠릿 이동 및 후속 참가자 전략 조정이 설계의 핵심입니다. 이 작업은 기계 학습 도구인 Social LEAP Estimates Animal Poses(SLEAP) 및 키포인트-MoSeq49,50을 사용하여 소근육 운동 능력과 도달 행동에 대한 편견 없고 정량적인 측정을 가능하게 합니다. 설치류의 숙련된 도달 작업을 위해 다른 주목할만한 계산 모델이 개발되었지만, 44,45,51, keypoint-MoSeq는 움직임을 정확하게 정량화하고 자세를 잡는 50을 가능하게 하기 위해 노이즈를 제거합니다. 작업 수행 및 운동 학습 전략은 Harmaline52를 사용하여 일반 및 모터 교란 쥐에서 고성능 머신 비전 카메라를 사용하여 재구성되었습니다. 하마린(Harmaline)은 하부 감람핵(inferor olivary nucleus)을 과활성화하고 글루타메이터성 등반 섬유(glutamatergic climbing fibers)를 통해 소뇌 기능을 방해한다53,54. 또한, TgF344-AD 랫트의 하위 집합에서 소근육 운동 능력을 조사했습니다. 따라서, 소근육 운동 과제는 개념 증명으로서 Harmaline 처리 및 TgF344-AD 쥐에서 일반적인 쥐와 비교하여 측정 가능한 손상을 찾을 수 있을 것으로 예상되었습니다. 이 프로토콜은 미세 운동 작업을 구성하고, 동물을 훈련 및 테스트하고, SLEAP 및 keypoint-MoSeq를 사용하여 도달 행동을 정량화하는 방법을 설명합니다.
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여기에 설명된 모든 방법은 애리조나 주립 대학의 IACUC(Institutional Animal Care and Use Committee)의 승인을 받았습니다.
1. 챔버의 설계 및 시공
2. 컴퓨터 및 카메라 하드웨어

그림 1: 미세 운동 작업의 개략도. (A) 쥐가 설탕 알갱이를 얻기 위해 슬롯을 통해 손을 뻗는 미세 운동 작업에 대한 만화 표현. 도달 범위는 기계 학습 분석을 위해 기록됩니다. 세 개의 개별 그릇이 사용됩니다: (왼쪽 아래) 트레이닝 볼, (가운데 아래) Plain/Less 볼, (오른쪽 아래) 장애물이 빨간색으로 표시된 Plinko 볼. (B) (위) 트레이닝 보울, (가운데) Plain/Less 보울 및 (아래) Plinko 보울을 포함한 각 보울 설계도의 개식. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
3. 동물 준비
4. 습관화 (2일)
5. 형성 (10 일)
6. 테스트 준비:
7. 테스트(9일)

그림 2: 소근육 운동 과제를 수행하는 쥐의 훈련 및 테스트. (A) 실험 일정. 쥐는 2일 동안 장치에 익숙해진 다음 10일 동안 성형 절차를 거쳤습니다. 동물들은 각 그릇마다 3일 동안 세 개의 그릇 모두에 걸쳐 소근육 운동 능력을 테스트했습니다. 그런 다음 동물들에게 하말린을 주사하고 3일에 걸쳐 각 그릇에 대해 재검사했습니다. (B) 랫트(n = 6)는 성형 과정에서 두 가지 다른 보울(트레이닝 볼과 플레인)을 받았고, 리치를 개선하기 위해 5일째에 보울 유형을 전환했습니다. 기준(F(9, 45) = 13.5, p < 0.001)에 도달하기 위해 10일에 걸쳐 쉐이프가 크게 증가했습니다. 회색 막대는 원래 튜브와 현재 길쭉한 튜브 훈련 그릇 사이의 스위치를 나타냅니다. (C) 3개의 그릇을 모두 테스트한 경우, 9일간의 테스트 기간 동안 총 도달 거리에서 유의한 차이가 있었습니다(F(8, 32) = 3.74, p = 0.003). 참고: 랫 2는 성형 후 제거되었습니다. Plinko 보울은 Less 보울(p = 0.001)과 플레인 보울(p = 0.027) 간에 상당한 차이를 보였습니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
8. Harmaline을 사용한 미세 운동 파괴 모델링
참고 : 미세 운동 작업에서 미세 운동 능력 및 성능에 대한 운동 장애의 영향을 확인하기 위해 쥐에게 모노 아민 산화 효소 -A의 가역적 억제제이며 열등한 올리브52 , 55 , 56 , 57을 표적으로 하는 β 탄수화물 알칼로이드 인 Harmaline (10 mg / kg)을 주입했습니다. 설치류 모델의 Harmaline은 자세와 균형에 영향을 미치고, 미세한 운동 협응을 제한하며, 상지의 운동 장애를 유발합니다.
9. 머신러닝을 활용한 영상분석
참고: 데이터 수집 및 비디오 녹화 후, 도달 범위는 수동으로 계산되었으며 다음과 같이 점수가 매겨졌습니다: 성공(펠릿 회수 및 소비), 드롭(펠릿을 회수하지만 소비 전에 펠릿을 드롭), 실패(펠릿을 회수할 수 없음). 이 수작업 점수 데이터는 기계 학습 분석을 위한 실측 데이터로 사용되었습니다.

그림 3: 그릇을 가로지르는 도달 범위와 처리의 변화. (A) 기준선(n = 5) 테스트의 경우, 3개의 보울 모두에서 총 리치(H(df) = 8.48, p = 0.014, Kruskal-Wallis)에서 상당한 차이가 있었으며, Plinko 보울 유형(p = 0.011, Bonferroni 보정을 사용한 Post-hoc Dunn의 테스트)에서 더 많은 리치가 발생했습니다. (B) Harmaline (n = 5) 섭동은 그릇 유형 간에 차이를 일으키지 않았습니다. 오류는 S.E.M. *p < 0.05로 보고됩니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 4: 컨디션 간 성능과 보울 유형 간의 성능 비교. (A) 기준선 테스트 중에 유의한 보울(F(2) = 5.78, p = 0.007)과 결과 차이(F(2) = 3.92, p = 0.029)가 있었습니다. 볼 유형이 더 어려워짐에 따라 리치 시도가 증가했지만, 하멀린 상태의 모든 볼에서 리치가 베이스라인에서 감소했습니다. (B) Harmaline 처리된 쥐에서는 그릇에 걸친 도달 거리 수에 대한 차이가 발견되지 않았습니다. (C) 성능별로 분석했을 때 기준선 테스트 동안 유의한 결과 차이(F(2) = 2.07, p < 0.001)가 있었습니다. (D) Harmaline 처리된 쥐에서 보울 또는 결과 성능에 대한 차이는 발견되지 않았습니다. 오류는 S.E.M. 으로 보고됩니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 5: 기준선 조건과 Harmaline 조건의 비교. (A) 조건 간 성능 성공에는 차이가 없었습니다. (B) 고장 횟수의 경우, 기준선과 Harmaline 조건(H(df) = 4.85, p = 0.028, Kruskal-Wallis) 간에 유의한 차이가 있었으며, Harmaline 조건(p = 0.028, Bonferroni 보정을 사용한 Post-hoc Dunn의 검정)에서 유의미한 효과가 발견되었습니다. 오류는 S.E.M. 으로 보고됩니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 6: 학습 및 도달 속도. (A) Harmaline 동물은 기준 조건(t-stat = 2.833, p = 0.022)에 비해 교란 학습률을 보였다. (B) 분당 총 도달 거리의 경우, 보울(적음)과 상태(하말린)(F(1,5) = 9.83, p = 0.002, 혼합 선형 모델), 보울(플링코)과 상태(하말린)(F(1,5) = 22.67, p < 0.001, 혼합 선형 모델) 사이에 유의한 상호 작용이 있었습니다. Harmaline은 기준선에 비해 모든 볼 유형(Less: p = 0.01, Plinko: p < 0.001)에서 분당 총 도달 거리를 줄였습니다. 오류는 S.E.M. *p < 0.05, ***p < 0.001로 보고됩니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 7: 기계 학습은 고유한 포즈와 작업 전략을 식별합니다. (A) SSEAP 를 사용하여 레이블이 지정된 쥐 발의 노드 위치. (B) 도달하는 동안 keypoint-MoSeq에 의해 식별되는 음절의 예. (C) 연속된 음절 사이의 바이그램 전이 빈도 매트릭스. 전이 확률은 총 바이그램 수로 정규화됩니다. (D) Harmaline과 Baseline 사이의 음절 전이 차이를 비교하는 전이 그래프. 그래프의 노드는 음절을 나타내고 가장자리는 음절 사이의 전환을 나타냅니다. 더 눈에 띄는 가장자리는 더 높은 주파수의 음절 전환을 나타냅니다. 빨간색 연결은 상향 조절된 전이를 나타내고, 파란색 연결은 Harmaline 처리된 동물에서 하향 조절된 전이를 나타냅니다. 빨간색 원은 상향 조절된 사용을 나타내고 파란색 원은 Harmaline 처리된 동물에서 표시된 음절의 하향 조절된 사용을 나타냅니다. 주파수가 0.005 미만인 음절 쌍은 제외되었습니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
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쥐가 체중의 90%에 도달한 음식 제한에 도달한 후, 2일 동안 챔버에 익숙해진 후 1-2주 동안 성형 절차를 거쳤습니다. 성공, 삭제 및 실패한 도달 횟수는 각 조건에 대해 눈이 먼 훈련된 관찰자에 의해 점수가 매겨졌습니다. 9일(기준선) 동안 쥐는 3가지 다른 그릇 구성(Plain, Less 및 Plinko)에서 미세 운동 능력을 테스트했습니다. 그런 다음 동일한 쥐(그룹당 n = 5마리, 질병으로 인해 훈련 그릇 성형 후 1마리 제거)에게 3일에 걸쳐 하루에 한 번 Harmaline(10mg/kg, i.p.)을 주사하여 도달 능력, 전략 및 성과(그림 2A). 설계 및 시공 단계에서 예비 훈련 볼은 도달 능력을 높이지 못했습니다(1-4일차). 그 결과 길쭉한 특징이 있는 훈련 그릇이 재설계되었으며, 동물들은 지속적으로 펠릿에 손을 뻗기 시작했고(5-10일차), 10일차에는 훈련 기준에 도달했습니다(
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설치류에 대한 도달 작업은 일반적으로 단일 펠릿으로 제한되며 신경 퇴행성 병리학 환자에게 일반적인 어려움인 장애물이나 자체 교란 기능을 포함하지 않습니다. 여기에 제시된 방법은 재창조된 펠릿 도달 작업과 머신 러닝을 모두 사용하여 개별 숫자 움직임 외에도 포즈 기능 및 전환 분석을 통해 조정과 전략을 모두 감지할 수 있습니다. 여기에서 생성된 소근육 운동 과제는 포즈 분석과 포즈 간 전환을 통해 조정과 전략을 감지했습니다. 일반적인 도달 작업은 일반적으로 실험 대상이 회수할 수 있도록 단일 음식 보상이 놓인 선반과 관련이 있습니다. 단일하고 반복적인 도달 전략에 의존하는 단일 펠릿 반복에는 작업 난이도, 종단적으로 사용될 때 잠재적인 학습, 테스트 전반에 걸친 펠릿 배치 변경으로 인한 전략 조정의 어려움과 관련된 메트릭이 부족하며, 이는 이 새로운 방법으로 포착됩니다. 전통적인 단일 펠릿 작업에서 이러한 누락은 설치류가 단일의 반복적인 리치에 대한 숙달로 인해 속도와 ...
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저자는 경쟁하는 재정적 이해관계가 없다고 선언합니다.
이 연구는 Institute for Mental Health Research, Institute for Social Science Research, Arizona Department of Health Sciences [ADHS14-052688], US Department of Health and Human Services, National Institutes of Health [P30AG019610], Arizona Alzheimer's Disease Research Center REC Fellows Program, Arizona Alzheimer's Consortium 및 Nancy Eisenberg Junior Faculty Scholar Award의 지원을 받았습니다. 피규어는 Biorender.com 사용하여 생성되었습니다. 디자인 지원에 응해 주신 Nelson Yamada, Akash Kuppravalli, Jeanne Kamau에게 감사의 말씀을 전합니다.
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| 이름 | 회사 | 카탈로그 번호 | 댓글 |
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| 3D 프린팅 재료 | 아마존 (서곡) | B07PGY2JP1 | PLA 필라멘트 1.75mm PLA 3D 프린터 필라멘트, 치수 정확도 +/- 0.03mm |
| 카메라 | 에드먼드 옵틱스 | BFS-U3-13Y3M-C | 1.3 MP, 모노, 170 FPS, ON 세미 파이썬 1300 x2 |
| 카메라 케이블 | 에드먼드 옵틱스 | ACC-01-2300 | USB 3.1, 3 m, Type-A에서 Micro-B로(잠금) 케이블 |
| 카메라 렌즈 | 토르 연구소 | MVL5WA | 4.5mm EFL, F/1.4, 1/2" 포맷 머신 비전 렌즈 |
| 카메라와 삼각대 연결 | 에드먼드 옵틱스 | 88-210 | 카메라와 삼각대의 연결 |
| 청소용 물티슈 | 아마존 (산니-클로스) | B00KMZ7KMO | AF3 표면 소독제 클리너 와이프 캔스터 약한 향 160 ct p13872 |
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| 패널 글루 | 아마존 (스딘타르) | B0B1DLRPNZ | 유리 접착제 |
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