이 연구는 네이티브 수용체 조직을 보존하는 소포 기반의 단일 분자 이미징 방법을 제시하여 수용체 조립, 기능 및 질병 연구에서 정확한 화학량론 정량화와 광범위한 응용을 가능하게 합니다.
방법 논문
이 연구는 네이티브 수용체 조직을 보존하는 소포 기반의 단일 분자 이미징 방법을 제시하여 수용체 조립, 기능 및 질병 연구에서 정확한 화학량론 정량화와 광범위한 응용을 가능하게 합니다.
수용체 조립을 이해하는 것은 생리학적 과정에서 수용체의 기능과 조절의 기저에 있는 메커니즘을 밝히는 데 중요합니다. 기존의 체외 단일분자 연구는 이종 발현 시스템에서 단백질을 분리하는 데 의존하지만, 세포 표면 단백질의 조직 및 조립과 관련된 생체 내 생리학적 복잡성을 포착하지 못하는 경우가 많습니다. 이 프로토콜은 TIRFM(Total Internal Reflection Fluorescence Microscopy)을 사용하여 나노 스케일 소포 내에 캡슐화된 GFP 태그 Ryanodine Receptor 2(RyR2) 분자를 연구합니다. 동물에서 빠르게 추출된 장기에서 생성된 이러한 소포는 추출 시 수용체의 조립 상태에 대한 스냅샷을 효과적으로 제공하여 동물의 생리학적 환경 변화에 대응하여 소단위 화학량론 및 수용체 조직에 대한 자세한 분석을 가능하게 합니다. 이 접근 방식은 TIRFM과 단계적 광표백 분석을 활용하여 수용체 화학량론의 판독값을 제공합니다. 단일 분자 수준에서 수용체를 이미징하면 살아있는 동물에 조립된 수용체 집단 내의 이질성을 쉽게 감지하고 질병 상태와 관련된 조립 변화를 모니터링할 수 있습니다. 결과적으로, 이 방법은 수용체 어셈블리의 분포와 생리학적 환경의 변화와의 상관 관계를 결정하기 위한 강력한 도구를 제공합니다.
막수용체(membrane receptor)는 인체 전반의 생리학적 과정에서 중요한 역할을 한다1. 주요 기능은 세포 내 신호 전달 이벤트를 시작하기 위해 세포 외 자극의 전달을 통해 세포 간의 통신을 중재하는 것입니다. 신호 전달에 대한 근본적인 역할로 인해 기존 치료제의 거의 70%가 막 수용체를 표적으로 합니다2. 그들은 종종 여러 화학량론(multiple stoichiometry) 3,4을 가진 헤테로머 형태로 조립된 여러 소단위체(subunit)로 구성된 올리고머 구조(oligomeric structure)이다. 수용체가 어떻게 기능적 복합체로 조직되는지 이해하는 것은 건강과 질병에 대한 수용체의 역할을 규명하는 데 매우 중요하다 5,6. 면역침전(immunoprecipitation 및 western blotting)과 같은 전통적인 생화학적 방법은 평균화된 앙상블 측정을 제공하여 수용체 하위 집단7의 이질성을 모호하게 합니다. 대조적으로, 단일 분자 기술은 개별 수용체를 직접 관찰할 수 있어 수용체 집단 내 이질성을 정량화할 수 있습니다 8,9,10. 단일 분자 기술은 막 수용체 조립, 화학량론 및 올리고머화를 정량화하는 표준이 되었습니다11,12. 이 접근법은 분리된 단백질 또는 세포 배양 조건을 사용하여 생리학적으로 관련된 많은 막 수용체에 널리 적용되었습니다. 단일 분자 연구는 주로 단백질을 세포 환경에서 분리할 수 있는 체외 발현 시스템에 의존합니다. 그러나 살아있는 시스템 내의 복잡성은 이러한 유형의 이종 발현 시스템에 완전히 반영되지 않습니다.
이러한 한계를 극복하기 위해 우리는 심장 및 신경 조직에서 직접 유래한 나노소포 내에서 멤브레인 수용체를 캡처하여 생리학적으로 관련된 상태의 멤브레인 수용체를 분리하고 이미지화하는 접근 방식을 개발했습니다. 이 방법은 소포 형성 시 수용체 조립 상태를 효과적으로 보존하여 다양한 생리학적 환경에서 수용체의 반응을 나타내는 중추적인 지표인 수용체 소단위 화학량론을 직접 시각화할 수 있습니다. 이 접근 방식을 통해 이종 발현이나 재구성을 필요로 하지 않고 살아있는 동물 내의 복잡한 생물학적 환경에서 발생하는 막 수용체의 화학량론적 조립을 조사할 수 있습니다. TIRFM(Total Internal Reflection Fluorescence Microscopy)을 사용하여 소포로 캡슐화된 수용체의 단일 분자 해상도 이미징을 달성하고 광표백 흔적을 추출하여 소단위 구성을 결정합니다.
TIRFM은 유리 표면의 ~150nm 내에서 형광단을 선택적으로 여기시켜 용액 3,10의 분자에서 배경 형광을 감소시키기 때문에 단일 분자 막 단백질 이미징에 매우 적합합니다. 이러한 감금은 신호 대 잡음비를 크게 향상시켜 개별 막 수용체 복합체를 정확하게 검출할 수 있습니다. 형광 표지된 수용체의 단계적 광표백을 분석함으로써 소단위 화학량론을 직접 결정하고 수용체 집단 내 잠재적 이질성을 평가할 수 있습니다12. 이는 특히 라이노딘 수용체 2(Ryanodine Receptor 2, RyR2)와 관련이 있는데, 이 채널은 호모-테트라머(homo-tetramer)로만 조립되는 심장의 흥분-수축 결합과 그 조립이 이루어지지 않은 뇌의 시냅스 기능에 중요한 역할을 하는 큰 세포 내 Ca²⁺ 방출 채널입니다 1,13,14. 신경 조직에 여러 RyR 동형이 존재한다는 점을 감안할 때, RyR2가 심장에서와 같이 4개의 동일한 소단위로 구성된 뇌에서 순전히 동질체 사합체 복합체를 형성하는지 또는 RyR1 또는 RyR3와의 이질체 조립이 생체 내에서 발생하는지 여부는 불분명합니다 15,16,17,18.
이 방법은 심장과 뇌의 특정 영역에서 소포를 분리함으로써 RyR2 조직의 잠재적인 조직 특이적 차이를 조사할 수 있습니다. 우리는 심장 조직에서 RyR2의 특성을 활용하여 체외 단일 분자 소단위 화학량론에 대한 통계적으로 강력한 기초를 제공하기 위해 호모테라머만 형성할 수 있으며, 알려진 사합체 어셈블리는 다른 기관에서 알려지지 않은 어셈블리를 조사하기 위한 대조군 역할을 합니다. 생리적 상호 작용을 유지하면서 원래 상태의 수용체를 이미지화할 수 있는 능력은 다양한 장기와 다양한 생리학적 조건에서 수용체 조립을 연구하기 위한 강력한 프레임워크를 제공합니다. 이 프로토콜은 GFP 태그가 지정된 RyR2의 소포 분리, 고정화 및 단일 분자 이미징을 위한 워크플로우를 설명하여 수용체 화학량론의 정확한 특성화를 가능하게 합니다. 이 기술은 심장 및 신경 조직의 RyR2 조직에 대한 이해를 증진시킬 뿐만 아니라 다양한 생리학적 및 병리학적 맥락에서 수용체 조립 및 조절을 연구하기 위한 광범위한 응용 프로그램을 제공합니다 19,20,21.
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1. 시료 준비
2. 이미징
3. 이미지 처리 및 데이터 분석
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이 방법의 적용 가능성을 확인하기 위해 먼저 심장 및 신경 조직 동결 절편의 컨포칼 이미징을 통해 GFP-RyR2의 발현 및 국소화를 확인했습니다(그림 1). 심장 조직의 형광 신호는 심근세포에서 RyR2의 예상 국소화와 일치하는 횡방향 줄무늬 패턴을 보였지만 뇌의 특정 영역, 즉 피질, 해마, 소뇌에서 높은 강도를 보였으며, 이는 지역 특이적 발현을 나타냅니다.
당사의 최적화된 전처리 프로토콜(그림 2A)을 사용하여 이러한 조직에서 소포를 생성한 후, 나노입자 추적 분석(NTA)을 사용하여 샘플 전반에 걸쳐 일관된 크기 분포를 확인함으로써 심장 유래 소포와 뇌 유래 소포 간의 비교를 확인했습니다(그림 2B
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이 연구는 GFP 태그가 지정된 RyR2를 모델 시스템으로 사용하여 막 수용체의 생체 외 캡슐화 및 단일 분자 이미징을 위한 상세하고 재현 가능한 프로토콜을 수립합니다. 이 프로토콜은 네이티브 조직에서 직접 수용체 복합체의 화학량론적 분석을 가능하게 하여 막 단백질의 생리학적 맥락을 보존함으로써 현재 방법을 크게 발전시켰습니다. 기존의 체외 발현 시스템과 비교했을 때, 이 접근법은 과발현 또는 세제 용해화로 인해 발생하는 아티팩트를 최소화하여 수용체 조립체에 대한 생물학적으로 더 관련성 있는 통찰력을 제공합니다 5,8.
이 방법의 중요성은 광표백 단계를 사용하여 단일 분자 수준에서 수용체 화학량론을 검출할 수 있는 능력에 의해 강조되며, 이를 통해 이질적인 집단을 해결하고 미묘한 구조적 변형을 검출할...
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저자는 선언할 이해 상충이 없습니다.
UKY Light microscopy core와 Bioelectronics and Nanomedicine Center의 시설 사용에 감사드립니다. 이 작업에 대한 지원은 NIH(GM138837 및 GM138882)에서 제공했습니다. 그림 2 (https://BioRender.com/s69w811)와 그림 3 (https://BioRender.com/y54b47)은 BioRender에서 제작되었습니다.
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| 이름 | 회사 | 카탈로그 번호 | 댓글 |
|---|---|---|---|
| 35mm 접시 | No. 1.5 커버슬립 | 14mm 유리 직경 | Mattek | P35G-1.5-14-C | |
| Andwin Scientific Tissue-Tek Cryomold 금형/어댑터 | Fisher Scientific | NC9542860 | |
| APTES | Millipore Sigma | 440140-100ML( | 3-아미노프로필)트리에톡시실란 |
| Bio-Gen PRO200 실험실 균질화기 | Pro Scientific | 1204B59 | |
| cellSENS | Olympus Scientific Solutions | 해당 없음 | |
| EMCCD 카메라 | 및도르 | 해당 사항 없음 | iXon Ultra 897 |
| 에탄올 절대 ≥ 분자 생물학을 위한 100% (v/v) USP(200 Proof)VWR | 71006-012 | ||
| Leica CM1860 | Leica | n/a | 극저온 조절기 |
| MetaMorph Advanced | Molecular Devices | n/a | |
| Nanosight NS300(Nanosight NTA 소프트웨어 포함) | Malvern Panalytical | n/a | |
| Nikon AXR 도립 공초점 현미경 | Nikon | n/a | |
| Olympus IX83 전동 자동 초점 도립 형광 현미경 | Olympus | n/a | TIRFM |
| 파라포름알데히드 4% PBS 즉시 사용 가능한 고정 시약 | VWR | 76221-378 | |
| 인산염 완충 식염수(PBS) 20x, 초순수 등급 | VWR | 97062-950 | |
| 수산화나트륨, 비드, 시약 등급 | VWR | 97064-526 | |
| SUNBRIGHT OE-020CS + | NOF America Corporation | n/a | Oleyl-O(CH2CH2)nCO-CH2CH2-COO-NHS |
| Tissue-Tek OCT 화합물 | Sakura | M71484 | |
| VectaMount AQ 수성 마운팅 매체 | 벡터 실험실 | H-5501-60 |
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