신경 막 프로테아좀(NMP)은 최근 체감각 뉴런의 하위 집합에서 촉각, 통증 및 가려움증 인식의 주요 조절자로 확인되었습니다. 이 기사에서는 세포 분류, 전사체 프로파일링 및 배양 기반 면역형광 분석을 사용하여 세포 유형 특이적 NMP 발현 및 기능을 분석하기 위한 강력한 워크플로우를 제시합니다.
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신경 막 프로테아좀(NMP)은 최근 체감각 뉴런의 하위 집합에서 촉각, 통증 및 가려움증 인식의 주요 조절자로 확인되었습니다. 이 기사에서는 세포 분류, 전사체 프로파일링 및 배양 기반 면역형광 분석을 사용하여 세포 유형 특이적 NMP 발현 및 기능을 분석하기 위한 강력한 워크플로우를 제시합니다.
감각 뉴런 신호 전달은 기능적 프로테아좀에 의존하며 세포내 국소화는 기능에 영향을 미칩니다. 특수한 프로테아좀 복합체인 신경막 프로테아좀(NMP)은 최근 말초 체감각 뉴런의 하위 집단에서 확인되었습니다. NMP는 체세포의 원형질막과 근위 및 원위 축삭 모두에만 국한됩니다. 단일 세포 RNA 시퀀싱(scRNA-seq)은 정상적인 조건에서 NMP가 기계적, 가려움증 및 통증 감각을 매개하는 MrgprA3+ 및 Cysltr2+ 뉴런에서 주로 발현되는 것으로 나타났습니다. 생쥐의 발 피부에서 급성, 선택적 NMP 억제는 열 감각에 영향을 주지 않고 기계적 및 통증 민감도를 감소시켰습니다. 특히, 전반적인 프로테아좀 억제와 달리 선택적 NMP 억제는 신경병증을 일으키지 않습니다. 시험관 내 연구에 따르면 NMP는 잠재적으로 신호 펩타이드의 방출을 통해 뉴런 간 통신을 촉진하고 자극에 대한 정상적인 뉴런 반응에 필수적입니다. 이러한 발견은 NMP가 정상적인 촉각, 통증 및 가려움증에 필요한 감각 뉴런 누화의 핵심 조절자임을 식별합니다. 따라서 NMP는 통증 관리의 잠재적 대상을 나타냅니다. 이 기사에서는 항체 공급 및 형광 활성화 세포 분류(FACS)를 사용하여 NMP 발현 및 비NMP 발현 뉴런 집단을 모두 분리하는 방법을 제시합니다. 이러한 집단은 scRNA-seq 또는 NMP 발현 역학의 배양 기반 분석을 통한 세포 유형 특이적 발현 프로파일링에 적합합니다. 이러한 방법은 NMP 발현 역학과 통증 관련 질병 상태에 대한 기여도를 조사하기 위한 강력한 워크플로를 제공합니다.
프로테아좀 기능은 말초 신경계(PNS)1,2,3,4,5,6의 최적 발달 및 유지에 필수적입니다. 프로테아좀 억제제를 사용한 시험관 내 및 생체 내 연구는 프로테아좀 활성이 신경 발달, 수초화, 흥분성 및 신경교 세포 기능에 중요하다는 것을 보여줍니다 7,8,9,10. 또한, 프로테아좀 억제제 기반 화학 요법은 환자의 30-60%에서 고통스러운 신경병증을 유발하며, 종종 사지의 만성 통증 및 감각 변화를 특징으로 합니다 8,9,11,12,13. 흥미롭게도, 이러한 동일한 억제제의 저용량 투여는 고통스러운 자극에 대한 민감도를 감소시켜 감각 처리에서 프로테아좀의 복잡한 역할을 시사합니다 6,14,15. 그러나 이러한 광범위한 연구에도 불구하고 PNS에서 프로테아좀의 특정 기능은 잘 이해되지 않았습니다.
프로테아좀은 생명의 모든 영역에서 주요 단백질 분해 기계이며 단백질 항상성을 유지하는 데 필수적입니다16. 20S 코어 프로테아좀은 α, β, β α 서브유닛의 4개의 칠량체 고리로 구성되며 유비퀴틴 독립적 단백질 분해를 매개합니다17,18. 조절 입자와의 결합은 유비퀴틴 의존성 단백질 분해를 매개하는 26S 및 30S 캡 프로테아좀을 형성합니다 4,17. 뉴런에서 프로테아좀은 모든 세포 구획에서 확인되었으며, 이들의 세포 내 국소화는 기능에 영향을 미치는 것으로 알려져있습니다 19. 그러나 일반적으로 사용되는 많은 프로테아좀 억제제는 차등적으로 국소화된 프로테아좀 집단을 선택적으로 표적으로 삼는 특이성이 부족합니다.
실제로, 막 불투과성 프로테아좀 억제제 및 비투과성 세포에서 항체 표지를 사용하여 뉴런 특이적 프로테아좀 복합체가 체감각 뉴런의 하위 집합에서 원형질막에 국한되는 것으로 밝혀졌습니다20. 프로테아좀 서브유닛에 대한 항체 공급 및 FACS 분류를 통해 NMP+ 및 NMP- 집단으로 분리된 일차 후근 신경절(DRG) 뉴런의 scRNA-seq 분석은 20개의 전사적으로 구별되는 세포 클러스터20을 초래했습니다. 추가 분석 결과 NMP+ 세포는 20개 클러스터 중 3개에만 클러스터링된 것으로 나타났습니다. 특정 뉴런 아형에 대한 유전자 마커 세트를 사용하여 13개의 서로 다른 체감각 뉴런 아형이 확인되었습니다20. 대부분의 NMP+ 뉴런은 MrgprA3+ 및 Cysltr2+ 감각 뉴런으로 클러스터링되었습니다20. 최소한의 NMP+ 세포가 특정 유전자 세트가 확인되지 않은 세 번째 클러스터로 클러스터링되었으므로 이 클러스터는 할당되지 않은 상태로 남았습니다20. MrgprA3+ 및 Cysltr2+ 뉴런은 각각 CGRP-θ 및 SST 뉴런 하위 유형에 해당하는 열, 기계적 및 소양증 유발 자극에 민감한 C형 통각 수용체입니다21,22. 확인된 20개의 세포 클러스터 중 7개의 NMP-클러스터는 슈완 세포, 위성 아교세포 및 면역 세포를 포함하여 비신경 세포와 일치하는 유전자 마커를 발현했으며 할당되지 않은 상태로 남아 있었습니다20. DRG 뉴런 배양 중에 비뉴런과 뉴런 세포를 분리하는 것이 불가능하기 때문에 이러한 세포 집단이 예상되었습니다20.
그 기능을 조사하면, NMP의 시험관 내 억제는 KCl, 히스타민 및 αβ-메틸렌아데노신 5'-삼인산 자극에 대한 신경 흥분성을 변경했습니다20. 생체 내에서 NMP 억제는 열 감각에 영향을 미치지 않으면서 기계적 및 통증 자극에 대한 민감도를 감소시켰습니다20. 이러한 발견은 NMP가 기계적, 통증 및 가려움증 감각의 핵심 조절자이자 통증 관리를 위한 잠재적인 치료 표적임을 보여줍니다20. 그러나 NMP 활동을 다양한 질병 맥락에서 통증 발달과 연결하는 특정 메커니즘은 잘 이해되지 않았습니다. 따라서 통증 및 신경병증 관련 상태에서 NMP 발현 역학 및 기능에 대한 추가 조사가 필요합니다.
여기에서는 NMP+ DRG 뉴런 집단을 식별하고 분리하기 위한 강력한 워크플로(그림 1)에 대해 설명합니다. 이 접근법은 FACS 분류, scRNA-seq 및 면역염색을 사용하여 NMP 발현 역학에 대한 세포 유형 특이적 조사를 가능하게 합니다. 이러한 접근법은 세포 유형별 방식으로 NMP 발현의 고해상도 분석을 가능하게 하며, 이는 정상 및 다양한 통증 관련 상태에서 NMP의 역할을 조사하는 데 사용할 수 있습니다.
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실험 동물을 사용하여 설명된 모든 방법은 시카고 로욜라 대학교 스트리치 의과대학의 기관 동물 관리 및 사용 위원회(IACUC)의 승인을 받았습니다.
1. 소화액, DRG 배지 및 FACS 배지 준비
2. 단세포 DRG 뉴런 현탁액의 제조
3. NMP 양성 뉴런을 표지하기 위한 항체 공급
4. FACS 분류를 통한 NMP 양성(NMP+) 및 NMP 음성(NMP-) 뉴런의 분리
5. NMP+ 및 NMP- 뉴런의 단세포 RNA 시퀀싱
6. 농축된 NMP+ 및 NMP- 뉴런의 일차 배양
7. 세포형 특이적 NMP 발현 분석
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NMP와 세포내 프로테아좀을 구별하는 능력은 막 불투과성 표지 접근법에 의존합니다. 항체 공급을 통해 살아있는 뉴런에 프로테아좀 서브유닛 특이적 항체를 사용하여 세포 외부에서만 접근할 수 있는 프로테아좀을 표지할 수 있습니다. 크기와 친수성으로 인해 항체는 온전한 세포막을 통과할 수 없습니다24. 살아있는 뉴런은 막 무결성을 유지하여 항체가 세포에 들어가는 것을 방지합니다. 이 접근법을 사용하면 NMP를 안정적으로 라벨링하고 이를 발현하는 뉴런(NMP+)과 발현하지 않는 뉴런(NMP-)을 구별할 수 있습니다(그림 2A). 2차 항체 표지만 받는 대조군 세포는 NMP 표지를 나타내지 않습니다(그림 2B). 또한, 이 방법은 DRG 뉴런의 하위 집단만이 NMP를 발현한다는 것을 보여줍니다...
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프로테아좀은 모든 세포에서 필수적이며 세포 전체의 모든 구획에서 발견될 수 있다(19). 중추 25,26,27 및 말초20 신경계의 뉴런에서 특수한 프로테아좀 복합체인 NMP가 최근 발견되면서 프로테아좀의 기능에 대한 현재의 이해가 바뀌었습니다. 이전 연구에서는 NMP가 감각 뉴런 사이의 누화를 매개하여 기계적, 통증 및 가려움증에 대한 민감도를 조절하는 신호 전달 프로테아좀으로 기능한다는 것을 보여주었습니다20. NMP는 세포질 20S 프로테아좀과 구조적으로 동일한 것으로 보이며, 이는 기능적 고유성이 막 국소화에서 발생함을 시사합니다20
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저자는 이해 상충이 없음을 선언합니다.
E.V.L은 로욜라 대학교 시카고 스트리치 의과대학의 스타트업 자금의 지원을 받았습니다. FACS에 대한 조언과 도움을 주신 Robert Ladd에게 감사의 말씀을 전하고 싶습니다.
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| Name | Company | Catalog Number | Comments |
|---|---|---|---|
| 1M HEPES 완충액, pH 7.3 | 품질 생물학 | 118-089-721 | FACS 버퍼 |
| PBS 10배 | 써모 피셔 사이언티픽 | 70011-044 | FACS 버퍼 |
| 16% 파라포름알데히드(PFA) 원액; EM 등급 | EMS | 15710 | 고정액 |
| 1x 인산염 완충 식염수(PBS) | 피셔 사이언티픽 | 10-010-023 | FACS 세척 |
| 5 mL 폴리스티렌 둥근 바닥 튜브 | 피셔 사이언티픽 | 14-959-6 | FACS 튜브 |
| 7-아미노악티노마이신 D(7-AAD) | 인비트로젠 | A1310 | 죽은 세포에 라벨을 붙입니다. |
| B27 보충 | 써모 피셔 사이언티픽 | 17504044 | 배양 배지 |
| 소 혈청 알부민 | 밀리포어시그마 | A9647; CAS : 9048-46-8 | BSA/TI/DMEM |
| 염화칼슘 이수화물(CaCl?-2H? O) | 밀리포어시그마 | C7902 | 완전한 식염수 용액 |
| 닭 항신경필라멘트 중쇄(NF-H) | 밀리포어시그마 | AB5539 | 항체 |
| DMEM/F12 1:1 | 써모 피셔 사이언티픽 | 11320033 | 배양 배지; BSA/TI/DMEM |
| 당나귀 안티 염소 IgG (H + L) Alexa Fluor Plus 555 | 써모 피셔 사이언티픽 | A32816 | 항체 |
| 당나귀 안티 토끼 IgG (H + L) Alexa Fluor Plus 488 | 써모 피셔 사이언티픽 | A32790 | 항체 |
| 다이라이트 405 당나귀 안티 치킨 | 잭슨 면역 연구 | 703-475-155 | 항체 |
| EDTA | 밀리포어시그마 | E5134; CAS : 6381-92-6 | Liberase TM/Liberase TL-파파인 작업 솔루션 |
| 태아 소 혈청(FBS) | 밀리포어시그마 | A9647 | 배양 배지/FACS 완충액/차단 용액 |
| 유리 파스퇴르 피펫, 9인치 | 피셔 사이언티픽 | 1367820D | 적정 |
| 염소 항 PSMA2 | 자체 제작 | NA | 항체 |
| HEPES 분말 | 밀리포어시그마 | H4034 | 완전한 식염수 용액 |
| 회크스트 | 써모 피셔 사이언티픽 | H21492 | 핵 염색 |
| 말 세럼 | 써모 피셔 사이언티픽 | 26050070 | 차단 솔루션 |
| IB4, 비오틴 접합체 | 밀리포어시그마 | L2140 | 항체 |
| 라미닌 | 시그마-알드리치 | L2020-1MG | 문화 요리 |
| L-글루타민 | 써모 피셔 사이언티픽 | 25030081 | 배양 배지 |
| Liberase 분쇄 낮음(TL) | 밀리포어시그마 | 54010200001 | Liberase TL 원액 |
| 자유효소 분쇄 보통(TM) | 밀리포어시그마 | 5401119001 | Liberase TM 원액 |
| 염화마그네슘 육수화물(MgCl?-6H? O) | 밀리포어시그마 | M2393 | 완전한 식염수 용액 |
| 마운팅 미디어 | 남부 바이오 텍 | 0100-01 | 플루오로마운트-G |
| 파파인 | 워 딩 턴 | 카탈로그 # : 9001-73-4 | Liberase TL-파파인 작업 솔루션 |
| 페니실린/스트렙토마이신 | 밀리포어시그마 | 15140122 | 배양 배지/FACS 완충액 |
| 폴리-L-라이신 브롬화수소화물(PLL) | 밀리포어시그마 | P4707 | 문화 요리 |
| 염화칼륨(KCl) | 밀리포어시그마 | P5405 | 완전한 식염수 용액 |
| 토끼 안티 CGRP | 면역스타 | 24112 | 항체 |
| 염화나트륨(NaCl) | 밀리포어시그마 | S9888; CAS : 7647-14-5 | 완전한 식염수 용액 |
| 소르비톨 | 밀리포어시그마 | 56755-엠 | 완전한 식염수 용액 |
| 스트렙타비딘 Alexa Fluor 647 접합체 | 써모 피셔 사이언티픽 | S21374 | 항체 |
| 자당 | 시그마-알드리치 | S0389-500G | 고정액 |
| 트립신 억제제 | 밀리포어시그마 | T9253; CAS : 9035-91-8 | BSA/TI/DMEM |
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