칼슘 신호의 생세포 영상은 단일층에서 배양된 안정적인 세포주에서 칼슘 동원을 연구하는 데 광범위하게 활용됩니다. 이 프로토콜은 복잡한 1차 조직에서 생세포 염료를 이용한 칼슘 신호전달의 생세포 형광 영상을 설명하며, 기계 학습 소프트웨어를 활용해 수천 개의 개별 세포의 형광 강도를 동시에 정량화하여 분석을 간소화합니다.
방법 논문
칼슘 신호의 생세포 영상은 단일층에서 배양된 안정적인 세포주에서 칼슘 동원을 연구하는 데 광범위하게 활용됩니다. 이 프로토콜은 복잡한 1차 조직에서 생세포 염료를 이용한 칼슘 신호전달의 생세포 형광 영상을 설명하며, 기계 학습 소프트웨어를 활용해 수천 개의 개별 세포의 형광 강도를 동시에 정량화하여 분석을 간소화합니다.
칼슘 신호 전달은 다양한 생물학적 과정에서 매우 중요하며, 원발 조직에서 칼슘 플럭스를 연구하는 방법을 개발할 필요성을 강화합니다. 복잡한 1차 상피 배양에서 단일 세포 해상도로 칼슘 신호 전달을 연구하는 것은 도전적이며, 따라서 연구가 부족한 상태입니다. 본 연구는 일차 기도 상피 배양에서 실시간 칼슘 신호 전달을 모니터링하기 위한 방법과 기계 학습 기반 분석을 위한 새로운 접근법을 제시합니다. 환자 유래 1차 기도 상피 배양을 ALI(공기-액체 인터페이스)에서 분화하고 외부 형광 지시 염료를 주입하여, 칼슘 이동을 단일 세포 해상도로 후반형광현미경으로 측정하였다. 우리는 머신러닝 기반 세포 분할을 활용해 시간이 지남에 따라 각 세포에 형광 강도를 할당하는 새로운 소프트웨어를 개발했습니다. 전반적으로, 적응된 영상 장비와 소프트웨어는 1차 상피 배양 내 단일 세포를 빠르고 편향 없이 분석할 수 있게 합니다. 여기서 제시하는 단계별 프로토콜은 향후 개별 세포와 1차 상피 배양을 구성하는 세포 유형 내 칼슘 연구를 가능하게 할 것입니다.
세포 내 칼슘 동원 변화는 유전자 발현 변화와 선천 면역 반응 조절 등 다양한 세포 과정을 결정합니다 1,2. 세포 내 칼슘 수치는 소포체와 미토콘드리아 1,2,3과 같은 세포 내 칼슘 저장고에서 방출됨을 통해 변화할 수 있습니다. 세포 내 공간으로의 세포외 칼슘 유입은 수동적 및 능동적 운반을 통해 세포질 칼슘을 변화시킬 수 있습니다. 칼슘 이동의 생세포 영상은 주로 세포 내 염료 또는 유전적으로 암호화된 염료인 GCaMP(녹색 칼슘 활성화 다중체/단백질)4에 의해 분석됩니다. 문헌에서 흔히 사용되는 것은 AM(아세톡시메틸) 공액 염료로, 염료가 원형질막 5,6,7,8을 통해 침투할 수 있게 합니다. 세포에 들어가면 AM 모이에티는 내인성 세포 내 에스테라제에 의해 절단되고, 염료는 음전하를 얻어 세포질공간 9에 갇히게 됩니다. 이 전하가 증가함에 따라 염료는 원형질막에 상주하는 유기 음이온 채널을 통해 배출될 수 있습니다. 따라서 유기 음이온 배출체 억제제인 프로브네시드가 염료의 세포 유출을 방지하고 최적의 세포질 신호를 유지하기 위해 첨가된다10,11. 연구에서는 일반적으로 비율 염료인 Fura-2 AM과 강도계 염료인 Fluo-4AM을 사용하여 단일층 배양된 안정 세포주에서 칼슘 신호를 분석합니다. 이 연구는 최근 개발된 강도계 칼슘 염료인 Cal-520 AM을 사용하여 공기-액체 계면에서 배양된 다층 배양물의 후반형광 영상 프로토콜을 적용하는데, 이 염료는 Fluo-4 AM에 비해 감도가 향상되었습니다. 따라서 복잡한 1차 상피 배양에서 단일 세포 해상도로 미묘한 신호를 강력하게 시각화하는 데 적합합니다. 현재 문헌은 안정적인 세포주에서 벌크 반응을 실시간으로 담은 칼슘 영상이 풍부합니다. 그러나 현재는 생체 내에서 조직이 다양한 세포 구조를 구성하며, 조직 항상성 유지에 있어 다양한 세포 유형별 역할을 지지한다는 것이 널리 알려져 있습니다.12, 13, 14, 15. 이러한 공통된 지식에도 불구하고, 서로 다른 세포 유형들이 칼슘 신호를 조정하고 칼슘 이온 항상성을 조절하는 메커니즘은 아직 알려져 있지 않습니다. 따라서 여기서 제시된 방법들은 단일 세포 칼슘 신호 검출을 가능하게 하고, 원발 기도 조직에서 하위 분석 처리량을 향상시킬 것입니다.
우리는 이전에 발표되고 엄격히 검증된 인간 비강 상피 1차 배양 모델을 활용하여 생물학적으로 더 적합한 생세포 및 세포질 칼슘 이미지를 구현하는 도구로 활용하고 있습니다16, 17, 18. 간단히 말해, 상피세포는 환자의 비강 브러시에서 분리되어 반투과성 막 위에서 배양되며, 트랜스웰은 배양 웰 내에 현탁되어 공기-액체 인터페이스(ALI)를 유지합니다. 이 인터페이스는 특수 배지와 결합되어 서로 다른 세포 유형 16,17,18의 존재를 위해 직교 기법을 사용해 엄격히 검증되었습니다. 더불어, 현재의 방법들은 1차 비강 배양과 유사한 방식으로 배양되는 1차 기관지 배양에도 적용 가능하다는 것이 밝혀졌습니다19.
이 글에서는 이러한 1차 기도 상피 배양에서 단일 세포 해상도로 생생 칼슘 신호를 측정하고 분석할 수 있는 적응된 방법을 소개합니다. 이러한 다층 배양은 현미경으로는 시각화하기 어렵습니다; 하지만 현재 구조는 다층 배양 내 단일 층에 신뢰성 있게 집중할 수 있게 해주어, 이 특정 층에서 칼슘 이동을 감지할 수 있습니다. 이 방식은 관류 시스템이 필요하지 않다는 점에서 여러 가지 장점이 있는데, 관류 시스템은 비용이 많이 들고 특수 현미경을 사용하지 않으면 적응이 어렵습니다. 공초점 영상에 비해 시간 해상도가 향상된 에피형광 현미경이 사용되었습니다. 발광 다이오드(LED)의 사용은 레이저 기반 공초점 시스템에 비해 광독성을 최소화합니다. 여기 제시된 프로토콜에서는 외부 강도 염료가 사용되는데, 이는 전체 세포 집단에서 칼슘의 빠르고 상대적인 변화를 가능하게 하며 대부분의 형광 현미경 장비와 호환됩니다. 이는 많은 현미경에서 제공되지 않는 깊은 자외선(UV) 여기가 필요한 일반적인 비율 염료보다 유리합니다. 더불어, GCaMP는 트랜스펙션 또는 트랜스듀션이 필요하므로, 특정 세포 유형에서 보다 표적화된 칼슘 이미징을 위한 기술을 강화합니다. 1차 상피 배양에서 전도 및 형질전환 효율이 낮기 때문에, 이 기법은 전체 세포 집단을 모니터링하는 데 적합하지 않습니다.
또한, 이 연구는 생체 핵 염색을 기반으로 단일 세포 분할을 가능하게 하는 새롭고 특화된 머신러닝 기반 소프트웨어를 개발했습니다. 소프트웨어는 각 세포의 형광 강도 값을 시간에 따라 기록할 수 있습니다. 초기 방법은 안정된 상피세포주(Calu-3)를 사용했습니다. 그 후 이 방법들은 1차 상피 배양에서 단일 세포 칼슘 이동화 연구를 위해 전환되었습니다. 칼슘 염료와 프로브네시드의 농도, 인큐베이션 단계 타이밍, 영상 설정 등 변수들이 최적화되었습니다. 여기서 칼슘 신호는 0.2 fps(초당 프레임)의 프레임 속도로 기록되며, 이는 칼슘 신호 모니터링에 적합합니다. 더 빠른 칼슘 과도성을 측정하기 위해 프레임 속도를 높일 수있습니다. 최적 변수들은 더 복잡한 1차 비강 배양에서 적용되고 추가로 최적화되었습니다.
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시약과 사용된 장비는 재료표에 나열되어 있습니다.
1. 칼루-3 세포 유지 및 배양
2. Calu-3 세포에 Cal 520 AM 또는 Fluo-4 AM을 장착하는 프로토콜
주의: 플루오-4 AM과 Cal-520 AM은 DMSO에 용해되어 위험하다고 간주됩니다. 프로베네시드는 급성 위험으로 분류됩니다. 화학물질을 다룰 때는 피부 접촉을 피하기 위해 장갑과 실험복을 착용해 주시기 바랍니다. 모든 화학물질은 지정된 화학 폐기통에 버리세요.
3. Calu-3 안정 세포주를 위한 현미경 설정
4. 라이브 칼슘 비디오 획득
5. Cal 520 AM 또는 Fluo-4 AM으로 1차 기도 세포를 장전하는 프로토콜
6. 1차 비강 삽입물을 위한 현미경 설정
7. 피지 소프트웨어를 이용한 분석

8. 칼슘 스위트를 이용한 분석
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생세포에서 칼슘 이동성을 측정하기 위해 Calu-3 세포 또는 분화된 1차 비강 배양물을 세포 내 염료와 함께 배양합니다. 칼슘 의존 신호의 상대적 변화는 세포 내 칼슘 저장 또는 세포 외 공간에서 세포질 내 칼슘 이동량의 증가로 측정됩니다. 세포질에 지속적으로 칼슘이 증가하는 것은 ER 거주 SERCA(Sarco/Endoplasmic Reticulum Calcium ATPase) 단백질의 잘 알려진 가역적 억제제인 thapsigargin이 추가된 후 형광 증가로 나타난다21. 여기서 칼슘 분석법이 Calu-3 안정 세포주와 1차 기도 비강 배양 모두에서 견고하게 작동함을 보여준다.
현미경 기반 검사를 사용하면 개별 세포의 반응에 집중할 수 있습니다. 세포질의 형광 칼슘 염료를 기반으로 수작업으로 세포를 추적했으며, Hoechst 생체 핵 염색의 존재로 확인되었습니다(
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이 글에서는 생백신 1차 비강 및 기관지 배양과 안정적인 상피 세포주에서 단일 세포 칼슘 신호 전달을 분석하는 방법을 제시하였습니다. Cal-520 AM과 Fluo-4 AM 칼슘 리포터는 두 장비 모두에서 유용한 칼슘 지표입니다. Cal-520 AM은 Fluo-4 AM의 0.16에 비해 양자 수율이 0.75로 더 높고 칼슘에 대한 친화도가 약간 더 높아 더 민감합니다(Cal-520 AM의 Kd는 320 nM, Fluo-4 AM은 345 nM입니다). 더불어, Cal-520 AM은 Fluo-4 AM22에 비해 세포 저류율이 향상된 것으로 보고되었습니다. 그러나 두 염료 모두 타프시가르진 매개 칼슘 방출에 대한 현재 연구에서는 좋은 성과를 보였다22,23.
이 생물학적 모델은 ...
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저자들은 상충하는 이해관계가 없다고 선언한다.
저자들은 타리니 구나와르데나의 주요 비강 조직 배양 도움을 준 데 감사드립니다. 또한 아이오와 대학교의 우슈(Wu Shu)는 주요 기관지 배양물을 아낌없이 배양하고 배송한 공로도 있습니다. 또한 분석 및 영상 어댑터 설계에 도움을 준 가브리엘 랑게벨트와 디안 리우도 있습니다. 또한 아동 병원의 영상 시설에도 감사드립니다. 또한 캐나다 낭포성 섬유증 지부와 미국 낭포성 섬유증 재단의 자금 지원에도 감사드립니다.
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| 이름 | 회사 | 카탈로그 번호 | 댓글 |
|---|---|---|---|
| 24웰 플레이트 & nbsp; | Thermofisher와 nbsp; | 142475 | |
| 24웰 트랜스웰 인서트와 nbsp; | 코닝 | CLS3470-48EA | |
| 96웰 평평한 투명 바닥 검은색 폴리스티렌 TC 처리 마이크로플레이트 | 코닝 | 3603 | |
| Cal-520 AM | AAT 바이오퀘스트 | 21130 | -20° 위치에 분리 및 저장; C, DMSO에 녹아 |
| 칼슘 스위트 소프트웨어 | 코드는 저희 연구실에 연락하여 요청할 수 있습니다 | ||
| EMEM, 1x. | Wisent | 320-005-CL | 저장 온도는 4도; 참고; |
| 태아 소 혈청 | Wisent | 080-450 | -20° 위치에 분리 및 저장; C |
| 플루오-4 AM | AAT 바이오퀘스트 | 20550 | -20° 위치에 분리 및 저장; C, DMSO에 녹아 |
| 젠장 | 바이오샵 | HEP001.5 | 상온에서 보관 |
| Hoechst | Thermofisher와 nbsp; | H3570 | 저장 온도는 4도; 참고; |
| 인간 상피 대장항생암 세포 계통 | ATCC | HTB-55 | |
| 염화마그네슘 | 시그마 | 7786-30-3 | 상온에서 보관 |
| 마이크로 디쉬 35mm, 낮은 유리 바닥 | 이비디 | 80137 | 상온에 보관 중이며; |
| 페니실린-스트렙토마이신 용액 | Wisent | 450-200-EL | 저장 온도는 4도; C |
| 인산염 완충 식염수(PBS) | Wisent | 3111-010-CL | 상온에 보관 중이며; |
| 염화칼륨 | 시그마 | 7447-40-7 | 상온에 보관 중이며; |
| 프로베네시드 | 서모피셔 | P36400 | -20° 위치에 분리 및 저장; C, 수용성 |
| 염화나트륨 | 바이오샵과 nbsp; | SOD004 | 상온에 보관 중이며; |
| 탑시가르긴과 nbsp; | 서모피셔 | T7458 | -20° 위치에 분리 및 저장; C 용해된 DMSO |
| TripLE 익스프레스 효소(1X), 페놀 레드 & nbsp; | 서모피셔 | 12605010 | 저장 온도는 4도; C |
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