이 프로토콜들은 대조군과 돌연변이 초파리 배아 상피에서 주름 격격 접합부의 조직 및 폐쇄 기능을 어떻게 특성화할 수 있는지 개괄합니다.
방법 논문
이 프로토콜들은 대조군과 돌연변이 초파리 배아 상피에서 주름 격격 접합부의 조직 및 폐쇄 기능을 어떻게 특성화할 수 있는지 개괄합니다.
이 프로토콜의 목적은 초파리 배아의 외배엽에서 유래한 상피 조직에서 주름진 격격 접합부(pSJs)의 조직과 장벽 기능을 평가하는 것입니다. pSJ는 표피, 침샘, 기관, 후장 등 외배엽 조직의 외측막에 폐쇄 장벽을 형성하며, 척추동물 조직의 긴밀한 접합부와 기능적으로 유사합니다. 초파리에서는 pSJ 형성에 필요한 30개의 단백질이 확인되었습니다. 코어 pSJ 단백질은 처음에는 측막 길이를 따라 국소되지만, 배아 발생 16단계에서 접합부의 꼭대기 측면 부위, 즉 부착부 접합부의 바로 아래에 위치해 강하게 농축됩니다. 배아 발생 후반 15단계에 이르면 이 조직들은 완전히 기능하는 폐쇄 접합부를 갖게 됩니다. 본 논문은 대조군 및 돌연변이 배아에서 pSJ의 조직과 기능을 조사하는 데 사용할 수 있는 면역염색 및 염료 투과성 프로토콜을 설명할 것입니다. 이 프로토콜들의 성공적인 활용은 pSJ의 차단 기능을 입증하고, 미지의 유전자가 접합부의 핵심 성분을 암호화하는지 여부를 검증하는 데 활용될 수 있습니다.
상피 조직의 중요한 기능 중 하나는 유기체 내에서 서로 다른 영역을 구획화하는 것입니다. 이러한 독특한 환경을 조성하는 것은 장기 기능과 외부 위협으로부터 유기체를 보호하는 데 필수적입니다. 상피 세포 사이에 형성된 폐쇄 접합부는 해당 상피의 꼭대기와 기저 면을 사이에 용질이 세포 측으로 흐르는 것을 막아 이러한 환경을 구축하고 유지하는 역할을 한다. 척추동물 생물에서는 폐쇄 접합부를 타이트 접합부라고 하며, Drosophila melanogasster 1,3과 같은 무척추동물에서는 격격 접합부(sj)라고 부릅니다. 절지동물에는 조직 분포와초구조로 구분되는 두 가지 유형의 SJ가 있습니다. 주름진 격격 접합부(pSJs)는 표피, 침샘, 기관, 후장 등 외배엽에서 유래한 조직에서 발견됩니다. 이들은 세포 사이 세포 외 공간에 전자 밀도가 높은 사다리 형태의 배열이 부착 접합부 3,5 바로 아래에 위치하는 것으로 초구조적으로 특징지어집니다. 반면, 매끄러운 격격 접합부(sSJ)는 중장 및 말피기관 같은 내배엽 유래 조직에서 발견되며, 세포사이에 전자 밀도가 높은 중격을 보이지 않습니다.
초파리에 대한 유전학 연구는 pSJ 구조와 기능에 필요한 30가지 단백질을 확인했으며, 접합부에 존재하지만 그 형성이나 유지에 아무런 기능을 하지 않는 추가 단백질도 확인했습니다(7번 검토). 이 분석을 통해 과학자들은 SJ 단백질을 세 가지 범주로 분류했습니다. 핵심 SJ 단백질은 접합부에 존재하며 접합부의 형성과 유지에 필수적입니다. 코어 pSJ 단백질로 확인된 단백질은 17종으로, 여기에는 Coracle(Cora), Neurexin IV, Macroglobulin complement-related(Mcr), Kune-kune, 그리고 ATPasealpha 8,9,10,11,12가 포함됩니다. 접합부의 형성 및/또는 유지에 필요한 보조 pSJ 단백질로 9개의 단백질이 확인되었으나, 반드시 접합부에 존재하지는 않습니다. 이 클래스에는 Rab5, Rab11, 그리고 코일드13,14와 같은 단백질이 포함됩니다. 마지막으로, pSJ 상주 단백질은 pSJ에 국소하지만, 접합부의 형성과 유지에는 필수적이다. 이 그룹의 네 멤버 중 예로는 Discs Large와 Fasciclin III15,16이 있습니다.
기능적으로 온전한 pSJ의 형성은 모든 핵심 pSJ 단백질이 완전히 발현되는 배아 발생 중간에 시작되는 다단계 과정입니다. 일부 핵심 pSJ 유전자는 모체에서 발현되지만, 모두12-17단계까지 강한 접합 발현을 보인다. 12단계에서는 핵심 pSJ 단백질이 측막 길이 전체에 국소화됩니다. 13-16단계 동안 핵심 pSJ 단백질은 엔도사이토스화되어 pSJ 부위의 측막으로 재순환됩니다. 이 과정에는 Rab5와 Rab11을 포함한 pSJ 보조 단백질이필요합니다. 16단계에 이르면 핵심 pSJ 단백질은 측막을 따라 pSJ 부위에 밀착적으로 국한됩니다. 이 관찰과 일치하게, 접합부의 완전한 폐쇄 기능은 배아 발생12의 후기 15단계에서 나타납니다. 이는 염료 투과성 분석법을 사용하여 가장 잘 입증할 수 있습니다. 접합부가 형성되기 전에, 로다민과 같은 형광 표지가 붙은 10 kDa 덱스트란 구슬이 세포 내 세포 간 공간을 통과할 수 있습니다. 표지된 덱스트란을 혈구에 주입하면, 기관, 침샘, 후장 등 관상피의 내강에 빠르게 축적됩니다. 15단계 말에 pSJ가 생리학적으로 조여지면, 주입된 덱스트란은 상피의 기저면에 제한되어 이 기관들의 내강(첨단 영역)에 축적될 수 없습니다.
핵심 pSJ 단백질들은 각 핵심 pSJ 단백질이 올바른 세포 내 위치를 파악하기 위해 다른 모든 핵심 pSJ 단백질의 존재를 필요로 한다는 특징을 공유한다18,19. pSJ 형성에서의 이러한 상호의존성은 핵심 pSJ 단백질의 특징이며, 이 글에서 제시하는 프로토콜의 근간입니다. 핵심 또는 보조 pSJ 유전자의 돌연변이는 배아 치사성을 초래하며, 16단계 배아에서는 다른 핵심 pSJ 단백질이 정상 첨단 측측 부위에 밀착되지 않고 외막을 따라 잘못 위치하는 것이 특징입니다. 반면, pSJ 거주 유전자의 돌연변이는 핵심 pSJ 단백질의 위치 오류로 이어지지 않는다15. 핵심 및 부속 pSJ 유전자 돌연변이에서 pSJ의 기능 장애는 16기 또는 17기 돌연변이 배아의 기관, 침샘 또는 후장 내강에 표지된 10 kDa 덱스트란이 축적됨에 의해 드러난다. 마지막으로, 코어 단백질과 보조 pSJ 단백질의 구별점은 세포 내 위치입니다. 핵심 pSJ 단백질은 형성되면 pSJ와 밀접하게 연관되어 있는 반면, 보조 pSJ 단백질은 접합부 조립에 필수적이지만 반드시 접합부에 존재하지는 않습니다. 보조 pSJ 단백질의 대표적인 예는 Rab5와 Rab11입니다. 두 단백질 모두 세포질 단백질로, 원형질에서 초기 엔도좀으로 화물을 재순환하는 엔도좀으로 이동시키고, 다시 원형질막으로 돌아오는 데 도움을 줍니다. 새로운 잠재적 pSJ 단백질이 핵심 성분인지 보조 단백질인지 구별하기 위해서는 일반적으로 특정 항체를 만들거나 형광 표지가 부착된 재조합 단백질을 발현하여 이러한 단백질들이 pSJ 성숙 과정의 여러 시점에서 어디에 위치하는지 파악하는 것이 도움이 됩니다.
이 프로토콜의 목적은 잠재적인 핵심 및 부속 pSJ 단백질과 pSJ 상주 단백질을 명확히 구분하는 데 있습니다. 여러 연구에서 pSJ 단백질이 발달 과정에서 형태발생과 첨단-기저 극성에 관여하는 추가적이고 비차단적인 역할도 밝혀졌습니다 17,20,21,22. pSJ 생물학에 대한 관심이 높아지고 더 많은 잠재적 pSJ 단백질이 발견됨에 따라, 여기서 제시된 간단하고 해석 쉬운 프로토콜은 연구자들이 이러한 단백질의 pSJ 조직과 차단 기능을 올바르게 특성화하는 데 도움이 될 것입니다. 문헌에서는 pSJ 단백질을 특성화하기 위한 다양한 실험적 접근법이 기술되었으며, 여기에는 광표백 후 형광 회복(FRAP)과 투과전자현미경 6,23이 포함됩니다. 이러한 접근법은 종종 매우 유용하지만, 여기서 제시된 면역염색 분석법은 비용이 많이 들고 시간이 많이 드는 초구조적 방법 없이 pSJ 단백질 위치를 빠르게 시각화할 수 있는 반면, 염료 투과성 분석법은 영상만으로는 달성할 수 없는 pSJ 무결성의 기능적 판독을 제공합니다. 또한, 이러한 검사는 고품질 형광 현미경과 기본적인 미세 주입 장비 같은 표준 실험실 장비를 사용하여 수행할 수 있습니다. 이 검사들은 초파리 16기 배아 분석에 최적화되어 있으며, sSJs의 조직이나 기능 평가에는 적합하지 않음을 유의해야 합니다.
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1. 배아 단계
2. 배아의 고정 및 면역염색
3. 면역염색된 배아의 영상 및 데이터 분석
4. 염료 주입 준비
5. 배아 착상 및 염료 주입
6. 영상 및 데이터 분석
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여기서 제시된 프로토콜은 16기 초파리 배아의 외배엽 조직에서 pSJs의 조직과 기능을 조사하는 데 사용됩니다. 이 프로토콜은 pSJ에게만 적용되며 sSJ를 심문하는 데 사용할 수 없습니다. 16단계 배아에서 다른 pSJ 단백질을 pSJ 영역에 위치시키지 못하고 16단계에서 폐쇄 접합부를 형성하지 못하는 유전자 돌연변이는 핵심 pSJ 유전자 또는 보조 pSJ 유전자에 속합니다. 두 가지 주요 차이점은 야생형 배아에서 기능적 접합부가 형성되면 암호화된 단백질이 세포 내 pSJ에 국소화되는지 여부입니다. 이 경우 해당 단백질은 핵심 pSJ 단백질로 분류됩니다. 이 원리를 입증하기 위해, 우리는 먼저 야생형 배아에서 배아 발생 13단계에서 16단계까지 핵심 pSJ 단백질의 위치가 어떻게 성숙하는지 보여준다(그림 1A-D). 여기서는 침샘에 초점을 맞추는데, 침샘은 윗부분이 샘의 내강을 향하는...
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여기서는 형광 현미경 기능을 갖춘 소규모 실험실에서 수행할 수 있는 두 가지 비교적 간단한 분석법을 사용하여 핵심 및 보조 pSJ 단백질을 식별하는 프로토콜을 제시합니다. 첫 번째 검사는 고정된 돌연변이 배아의 공초점 영상을 이용해 성숙한 분광 상피에서 pSJ의 분자 조직을 조사합니다. 두 번째 분석은 16단계 생체 배아에 염료 표지된 10 kDa 덱스트란 분자를 주입하여 pSJ의 폐쇄 기능의 무결성을 검사합니다. 이러한 프로토콜의 단순성과 pSJ 조직 및 기능의 결함이 핵심 및 보조 pSJ 돌연변이를 완전히 진단할 수 있다는 점은, FRAP이나 전자현미경과 같은 더 노동 집약적이고 기술적으로 도전적인 접근법보다 유리하게 만듭니다. 이 프로토콜들은 초파리의 배아 발생 중 pSJ의 조직과 기능에 특이적으로 적용되며, sSJ나 후기 발달 단계에는 적용되지 않습니다.
핵심 및 보조 pSJ 돌연변이 후기 배아에서 모든 핵심 p...
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저자들은 공개할 이해 상충이 없습니다.
이 연구에 사용된 파리 자원을 제공해 주신 블루밍턴 초파리 자원 센터에 감사드립니다. 연구에 사용된 항체를 제공해 주신 발달 연구 하이브리돔 뱅크에 감사드립니다. 또한 케이스 웨스턴 리저브 대학교 생물학과에 대해 유전형 분석 및 배아 분류를 위한 배아 분류 및 단계별 분류에 사용해 준 것과, 염료 주입 실험을 위한 DMi8 역형 형광 현미경을 사용해 준 것에 대해 감사드립니다. 이 연구에서 제시된 염료 주입 실험에 사용된 여러 바늘을 뽑아주신 CWRU 의과대학 유전학 및 유전체과학 교수 헬렌 살츠에게 감사드립니다. 이 프로젝트는 국립과학재단(IOS 2111069)의 보조금으로 REW에 지원되었습니다.
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| 10배 PBS | NaCl 90g, Na2HPO4 20g, NaH2PO4 8.3g을 혼합합니다. H2O와 dH20을 1L에 섞습니다. 필터를 멸균합니다. 면역염색 세척 단계에서는 dH2O로 1배로 희석하세요. | ||
| 10% 트라이톤 X-100 용액 | 플랫폼 록커에 1ml Triton X-100과 9ml dH2O를 섞어 녹일 때까지 섞으세요. 실온에서 보관하세요. | ||
| 표백제 50% | 배아를 탈코리온화하기 전에 상업용 표백제 10ml(7.5% 차가염소산나트륨)와 물 10ml를 섞으세요. | ||
| 사과 주스 접시 | 15g 초파리 한천을 725ml dH2O에 삶으세요. 설탕 25g과 사과 주스 250ml를 넣고 잘 섞을 때까지 섞습니다. 용액을 55도까지 식힌 후 1.3g 테고셉트를 넣고 부드럽게 섞으세요. 60 x 15 크기의 페트리 플레이트에 부어 식힙힙니다. 4도에서 보관하세요. | ||
| 차단 해법 | 15개의 원뿔형 튜브에 1X PBS 100 ul과 100 ul 100% Triton X-100, Normal Donkey Serum 100 ul을 섞어 15개의 원뿔형 튜브에 넣으세요. | ||
| 배아 세척 용액 | 70g NaCl과 2ml Triton X-100을 dH2O에 섞어 10X 배아 세척액을 만드세요. dH2O로 1배로 희석해 작용을 원합니다. | ||
| 수정 | 전자레인지에 1X PBS 10ml를 예열하세요. 0.4 g 를 더합니다; 파라포름알데히드와 피펫을 섞으려고 합니다. 14N NaOH 10 ul을 첨가해 빠르게 녹여. 녹을 때까지 90도 히트 블록 위에 올려놓으세요. 고체 파라포름알데히드가 사라지면 14N HCL 10ul을 추가해 pH를 중성으로 조정합니다. 파라포름알데히드를 사용할 때는 항상 실험복, 장갑, 고글을 착용하세요. | ||
| 매체 장착 | 글리세롤 9ml와 1M 트리스 염기 pH 8.0을 섞으세요. n-프로필-갈레이트 0.05g 추가, nbsp; 섞고 가열해서 녹여요. 에펜도르프 튜브에 0.5ml를 분리해 넣습니다. | ||
| 로다민 덱스트란 용액 | 로다민 표지된 10 kDa 덱트론을 0.5M 인산나트륨, pH 7.5 및 5 mM 염화칼륨에 녹여 신선한 염료 용액을 만듭니다. | ||
| 효모 페이스트 | 상업용 효모(레드 스타) 50g에 자당 한 꼬집, 그리고 충분한 물을 섞어 걸쭉한 반죽을 만듭니다. 4도에서 보관하세요. |
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