2D 단층 기반 방법과 저저막 추출물 오버레이를 사용하여 인간 유도 다능성 줄기세포로부터 원시 생식세포 유사 세포를 견고하게 생성하는 단계별 가이드라인.
방법 논문
2D 단층 기반 방법과 저저막 추출물 오버레이를 사용하여 인간 유도 다능성 줄기세포로부터 원시 생식세포 유사 세포를 견고하게 생성하는 단계별 가이드라인.
시험 관 내에서 인간 다능성 줄기세포 분화를 사용한 것은 초기 생체 내 발달 과정에서 발생하는 계통 특정 사건에 대한 이해를 크게 넓혔으며, 이 시기는 조사가 매우 어려운 시기입니다. 인간 배아에서 가장 먼저 지정된 배아 계통 중 하나는 원시 생식세포(PGC)의 유도로 표시되는 생식세포 계통입니다. PGC는 생애 후반기에 생애 생식체의 유일한 창조 개체군이며, 이들의 특성화는 생물체의 생식력을 향한 중요한 첫걸음입니다. 여기서는 인간 유도 다능성 줄기세포(hiPSCs)로부터 PGC 유사 세포(PGCLC)를 생성하는 견고한 프로토콜을 설명하며, hiPSC의 다능 상태와 세포 특성의 초기 평가부터 시작하여 효과적인 PGCLC 분화를 보장합니다. 이를 위해 PGCLC 분화에 사용되는 다양한 세포 밀도, 플레이트 코팅, hiPSC의 영향에 대해 논의합니다. 마지막으로, 면역형광과 유세포분석을 이용한 hPGCLCs의 특성화 및 정량화 워크플로우가 제공됩니다. 차별 프로토콜은 대부분의 실험실에서 쉽게 정하고 검사할 수 있으며 필요에 따라 조정할 수 있는 조건에 초점을 맞춥니다. 더불어 이 프로토콜은 빠르기 때문에 hiPSC가 PGCLC 분화에 적합한지 여부를 판단할 수 있습니다. 프로토콜은 다양한 hiPSC 군주와 배양 플랫폼에서 hPGCLC 결과의 일관성과 호환성을 촉진하여, 신뢰할 수 있는 특성 분석과 인간에서의 성공적인 시험 관 내 배우자 형성을 위한 후속 분화 단계의 추가 최적화를 지원하는 강력한 수확을 보장하는 것을 목표로 합니다.
인간 생식계 발달은 배아 발달 초기에 시작되는 매우 조율된 과정으로, 궁극적으로 난자와 정자를 기원시키는 원시 생식세포(PGC)의 지정에서 시작됩니다1. 생체 내에서 PGC 특정은 이식 직후 인접 세포 4,5의 유도 신호에 반응하여 발생합니다. PGC의 발달은 설치류에서 광범위하게 연구되었으며, 특히 BMP, WNT, TGFβ 6,7,8,9와 같은 신호 전달 경로의 관여를 유전학 연구에서 입증했습니다. 명세에 따라 PGC는 유전체 DNA 탈메틸화와 염색질 재형성을 특징으로 하는 후생유전학적 재프로그래밍을 거쳐, 이후 (성별별) 생식세포 동일성을 확립합니다 10,11,12,13,14.
포유류에서 PGC 명세는 신호 경로 간의 조정된 교차 반응에 의해 결정되며, 일부 측면은 POU5F1과 NANOG 9,15,16,17,18과 같은 다능성 인자의 관여를 포함하여 인간, 비인간 영장류, 돼지, 쥐 사이에서 진화적으로 보존되어 있습니다 . 공통된 특징에도 불구하고, 종별 PGC 분화 메커니즘과 유전자 조절 네트워크의 차이가 동물 모델에서 인간으로의 직접적인 번역을 제한합니다9, 19, 20, 21.
인간의 배우자 발생을 이해하려면 인간 물질을 이용한 연구가 필요하지만, 초기 인간 배아에 대한 접근이 제한적이어서 여전히 도전적이다. 유도 다능 줄기세포(HiPSCs)와 같은 인간 원시 생식세포 유사세포(hPGCLCs)를 시험관 내 분화할 수 있는 프로토콜의 지속적인 발전은 인간 생식샘 조직에 대한 의존도를 줄이고 업스케일링과 유전학 연구를 가능하게 했습니다18,22. 대부분의 확립된 hPGCLC 분화 전략은 3차원(3D) 집합체 또는 배아체에 의존합니다. 이러한 플랫폼을 활용한 여러 연구에서 hPGCLC가 초기 인간 PGC의 주요 후생유전학적 특징, 예를 들어 생식선 전사 프로그램23,24와 유전체 전체 DNA 메틸화 재프로그래밍25를 재현한다는 것이 밝혀졌습니다. 이 시험관 내 플랫폼들은 계통 결정과 후생유전학적 재설정 등 인간 PGC 생물학에 대해 상당히 발전된 지식을 가지고 있습니다. 그러나 집계 기반 hPGCLC 분화 프로토콜은 시간이 많이 소요되어 여전히 도전적이며, 견고한 후생유전학적 특성 분석, 추가 분화 분석, 또는 고처리량 실험 응용 분야에서의 hPGCLC의 총 수확량은 여전히 낮습니다.
최근에는 희석된 기저막 추출물(BMEx)과 낮은 수준의 BMP4를 결합해 hiPSC를 hPGCLCs로 분화하는 2D 단층 기반 피더 없는 방법이 조직 배양 플레이트에서 비교적 쉽게 확장할 수 있었고, 짧은 분화 창(5일)에서 높은 효율(~55%)을 달성했습니다26. 유도 전에 중간 액티빈 A 프라이밍 단계가 필요하고 더 높은 BMP4 농도(40–50 ng/mL)를 사용한 다른 2D 시스템과 비교할 때, 이 BMEx 방법은 유도 전 단계가 필요 없고 낮은 BMP4 농도(10 ng/mL)를 사용하면서도 비슷한 효율과 향상된 확장성을 유지했습니다.
여기서는 hiPSC 유지 초기 평가(다능성 및 세포 특성 포함)부터 시작하여 다양한 hiPSC 플레이트 코팅과 세포 밀도가 hPGCLC 분화에 미치는 영향을 테스트하는 단계별 가이드를 제공합니다. 또한 유세포분석 및 면역형광을 통한 후속 특성 분석도 기술합니다. 실험실 편차를 줄이기 위한 중요한 처리 지점과 문제 해결 지침을 제공하여 연구자들이 이 2D 형식으로 hPGCLC 분화를 일관되게 재현할 수 있도록 합니다.
이 프로토콜은 라이덴 대학교 의료센터(LUMC), LUMC 바이오뱅크 및 생체재료(TCBio), LUMC 라이덴 hiPSC 센터(BB24.037 하)의 지침과 규정을 따릅니다. 이 프로토콜에서 사용되는 모든 재료 및 대조 수(XY) hiPSC 라인(M54 및 M199)은 재료표에 나열되어 있습니다. 모든 조직 배양 절차는 전용 생물안전 2단계 조직 배양실에서 수행되었으며, 이 실내에는 가습 정상산소 인큐베이터(37 °C, 5%CO2), 다목적 벤치탑 원심분리기(스윙 버킷 로터), 그리고 입체현미경이 장착된 클래스 II 생물안전 캐비닛이 설치되어 있습니다.
주의: 모든 hiPSC 계통이 hPGCLCs26, 29로 구분되는 것은 아닙니다. 그러나 다른 hiPSC를 PGCLC 분화에 사용하고 PGCLC가 관찰된다면, 여기서 설명한 방법(그림 1A)을 통해 hPGCLC 생성을 확대할 수 있습니다.
1. hiPSC 배양용 조직 배양 플레이트 코팅
이 프로토콜은 희석된 BMEx와 비트론넥틴을 함께 코팅하는 조직 배양 플레이트를 설명합니다.
2. hiPSC 유지 통과
3. hPGCLC 분화
4. 면역형광 및 유세포검사를 통한 hPGCLCs 특성 규명
hiPSCs의 질과 안정 상태는 추가 분별에 중요합니다
hiPSC는 분별 실험과 분석 전에 최소 3번의 다양한 코팅 통로 동안 6웰 플레이트에 유지되었습니다. hiPSC는 세포 집락이 70–80%의 수합 지점에 도달했을 때 전달되었으며(그림 1B), 이는 hPGCLC 분화를 시작하는 최적의 hiPSC 합류점이기도 하다. 건강한 hiPSC 배양은 밝은 시야 이미지에서 볼 수 있는 어두운 영역이나 분화된 영역 없이 균일한 군집 형태를 보였다(그림 1B). 그러나 세포 집락이 최적의 수합 지점을 유지하지 못하거나 분화 징후를 보일 경우 hiPSCs의 질이 영향을 받았습니다(그림 1B). 낮은 합류 지점에서는 hiPSC가 계속 증식했고, 합류점이 통과 또는 분화 실험에 적합해질 때까지 집단 형성에 더 많은 시간이 필요했다. 높은 합류율에서는 hiPSC들이 서로 겹쳐 성장했고, 분화된 영역이 나타났습니다. hiPSCs의 다능성 상태는 SOX2 또는 POU5F1의 발현으로 확인되었으며, 이 두 전사인자는hiPSCs에서 다능성과 자기갱신을 유지하는 데 필수적이며, 가장 중요한 점은 SOX2가 hPGCLCs31에 의해 발현되지 않는다는 점이다. phalloidin 염색을 사용하여 세포골격 조직과 집단 형태를 평가하여 hiPSCs의 질을 나타냈다. 세포 형태의 차이는 SOX2 또는 POU5F1의 환원과 관련이 있음을 유의하세요(그림 1B).
hiPSC 유지 기질이 hPGCLC 분화에 미치는 영향
hiPSC를 서로 다른 코팅 기판에서 유지하는 것이 hPGCLCs로의 분화에 영향을 미치는지 평가하기 위해, hiPSCs는 다양한 기판(Geltrex, Matrigel, Cultrex, vitronectin)에서 배양되었습니다(그림 2). 모든 기질에서 hiPSC는 견고하고 균일한 핵 SOX2 또는 POU5F1 수치를 보였으며, 이는 다능성 상태를 나타낸다. 겔트렉스, 마트리겔, 컬트렉스에서 유지된 hiPSC 군락은 비트로넥틴의 둥근 군락과 비교해 형태가 유사했으며, 뚜렷한 군체 경계와 불규칙한 전체 군체 형태를 보였다(그림 2). 70–80% 합류율에 도달한 hiPSC는 40K 세포/cm² 밀도로 플레이트되어 Geltrex26에서 hPGCLCs로 분화되었습니다. 5일째 밝은 시야 이미지에서는 모든 조건에서 특징적인 hPGCLC 집락이 나타났다(그림 3). 더불어 모든 조건에서 삼중 양성 SOX17/TFAP2C/PDPN 또는 이중 양성 SOX17/POUF51 hPGCLC가 확인되었습니다(그림 3). 이는 분화 프로토콜이 다양한 조건에서 배양된 hiPSC와 함께 사용할 수 있음을 시사했습니다.
초기 hiPSC 세포 밀도가 hPGCLC 분화에 미치는 영향
최적의 hPGCLC 분화를 위해 최적의 시딩 밀도를 확인하는 것이 중요한데, 이는 다양한 hiPSC가 증식률이 다르기 때문입니다. 또한, hiPSC가 지속적으로 통과됨에 따라 hPGCLC 분화 효율이 떨어질 경우, hiPSC 시딩 셀 밀도를 조절하는 것이 권장됩니다. 시딩 세포 밀도가 hPGCLC 분화 효율에 미치는 영향을 평가하기 위해, hiPSC는 10K에서 100K cells/cm2 사이의 다양한 밀도로 시딩되었습니다(그림 4A). 5일째에는 인간 PGC 표지자에 대해 EPCAM과 인테그린 α6(ITGA6)라는 두 가지 다른 접합 항체를 이용한 플로우 사이토메트리로 hPGCLCs의 비율을 평가하였습니다32. 유동 세포분석 분석은 40K 세포/cm 2 에서 시딩된 M199 hiPSC에 대해 표준적인 순차적 게이팅 전략을 따랐습니다(그림 4B). 간단히 말해, 전체 세포 집단(모든 사건)을 이물질(입자 면적)을 배제하기 위해 게이트를 설정했고, 그 후 크기(FSC)와 과립도(SSC)를 기준으로 단일 세포를 선정했으며, 마지막으로 7AAD 염색을 기준으로 죽은 세포를 제외했습니다. 그 후, EPCAM-cy7과 ITGA6-BV421을 발현하는 세포를 정량하는 게이트를 염색된 샘플과 비염색 샘플을 사용해 설정하였다(그림 4B).
서로 다른 시딩 세포 밀도와 다양한 기질에서 배양된 hiPSC를 사용한 hPGCLC 분화 효율을 비교한 결과, 밀도에 따라 변하는 경향이 나타났다(그림 4C). 20–40K 세포/cm²의 시딩 밀도에서 M54와 M199 hiPSC는 Geltrex와 Cultrex에서 유지된 hiPSC에서 달성된 EPCAM+/ITGA6+ 이중 양성 hPGCLC의 비율이 가장 높았다. 흥미롭게도, 밀도가 높을수록 분화 효율이 낮아졌습니다. pPGC 마커인 SOX17/TFAP2C/PDPN 또는 SOX17/POUF51을 사용한 면역형광 검사 결과는 유세포검사 결과를 검증했습니다(그림 4D). 이 결과들은 최적의 분화 효율을 얻기 위해 특정 hiPSCs에 맞춰 시딩 밀도를 조정하는 것이 중요함을 시사합니다. 면역형광과 유세포분석법을 결합하면 hPGCLC 분화 분석법의 견고성을 향상시킵니다.

그림 1: hPGCLC 구분 워크플로우와 hiPSC의 품질. (A) 본 연구에서 사용된 워크플로우의 도식. hiPSCs는 배양 배지 내에서 유지되었으며, 분화 당일(0일, D0)에 60–80% 일치율에 도달했습니다. D0에서는 hiPSCs를 단일 세포로 해리하여 원하는 시딩 밀도(도금 배양 내)로 플레이트링했습니다. 다음 날, 세포들은 분화 배양물(D1–D3)으로 처리한 뒤, 이어서 스위치 배지(D3–D5)를 투여했습니다. D5에서는 hPGCLC가 면역형광 또는 유세포분석에 사용되었습니다. (B) 밝은필드 이미지(상단 행 - 4배 배율); SOX2, 팔로이딘 염색, DAPI 염색(중간 행)에 대한 면역형광; POU5F1, 팔로이딘 염색, DAPI 염색(하단 행)에서는 hiPSC가 서로 다른 수합도를 보였다. 스케일 바 = 50 μm. 그림 1A의 그림은 저자들이 Adobe Illustrator의 기본 드로잉 도구를 사용해 제작했으며; 유료 소프트웨어나 도구는 사용하지 않았습니다. 따라서 저작권 라이선스는 필요하지 않았습니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보시려면 여기를 클릭해 주세요.

그림 2: hiPSC 배양 중 다양한 코팅 기판의 영향. 밝은 필드 이미지(상단 줄); SOX2, 팔로이딘 염색, DAPI 염색(중간 행)에 대한 면역형광; POU5F1, 팔로이딘 염색, DAPI 염색(하단 줄)에서는 다양한 코팅 기판에서 배양된 hiPSC를 보여줍니다. 스케일 바 = 50 μm. 이 그림의 더 큰 버전을 보시려면 여기를 클릭하세요.

그림 3: hiPSC 배양 중 다양한 코팅 기질이 hPGCLC의 분화에 미치는 영향. 밝은 영역 이미지(상단 행 10배 확대); SOX17, TFAP2C, PDPN, DAPI 염색에 대한 면역형광(중간 행); 그리고 5일차에 다양한 코팅 기판에서 배양된 hiPSCs에서 시작하여 hPGCLCs의 분화를 POU5F1, SOX17, DAPI-염색(하단 행)(겔트렉스 사용)을 수행했습니다. 노란 점선은 hPGCLC가 있는 영역을 강조합니다. 스케일 바 = 25μm(상단 줄), 50 μm(중간 및 하단 줄). 이 그림의 더 큰 버전을 보시려면 여기를 클릭해 주세요.

그림 4: hiPSC 시딩 밀도가 hPGCLCs 분화에 미치는 영향. (A) hPGCLC의 분화 1일차(D1)와 D3 시각을 다른 hiPSC 시딩 밀도(40K cells/cm2, 60K cells/cm2, 80K cells/cm2)를 사용한 밝은필드 이미지. 스케일 바 = 250 μm. 4배 배율. (B) EPCAM+/ITGA6+ hPGCLCs의 비율을 정량화하기 위한 게이팅 전략을 보여주는 대표적인 유세포측 플롯. 이를 위해 M199 hiPSCs(겔트렉스 위에서)를 40K 세포/cm²의 시딩 밀도로 사용했습니다. (C) 다양한 코팅에서 배양하고 서로 다른 밀도로 씨앗을 심은 hiPSCs(M199 및 M54)를 사용했을 때 D5에서 EPCAM+/ITGA6+ hiPGCLCs의 비율을 나타내는 막대 그래프. (D) SOX17, TFAP2C, PDPN, DAPI 염색에 대한 면역형광 검사(왼쪽 패널); 그리고 hPGCLC의 분화 중 D5에서 SOX17, POU5F1, DAPI 염색(오른쪽 패널)을 40K 및 80K 세포/cm2에서 시딩한 hiPSCs(M199 및 M54, Geltrex 시)를 사용한다. 스케일 바 = 50 μm. 이 그림의 더 큰 버전을 보시려면 여기를 클릭하세요.
시험관 내 배우자 발생은 통제된 배양 조건과 환자 특이적 기반 하에서 인간 생식세포 발달, 생식 독성, 불임을 조사하는 강력한 실험 플랫폼입니다. hPGCLC와 hiPSC를 구분하는 여러 프로토콜이 보고되었으나, 연구실 간 표준화되고 확장 가능하며 재현 가능한 접근법의 제한으로 인해 진전이 저해되고 있습니다. 최근 연구들은 bMP4 기반 마이크로패턴 분화27, 3.5일 이내에 hPGCLC 생성이 가능한 빠른 2D 단층 플랫폼28, 착상 전 발달 및 파라크린 니치신호 전달을 모델링하는 3D 배양 시스템 등 hPGCLC 유도를 위한 단순화되고 효율적인 접근법을 기술했습니다. 이 프로토콜들이 hPGCLC 차별화를 효율적으로 지원했음에도 불구하고, 여전히 고처리량 플랫폼으로서의 역할은 부족합니다. hPGCLC 기반 연구가 특히 생식 독성학 선별에 광범위하게 적용되려면, 프로토콜이 견고하고 기술적으로 접근성이 좋으며 후속 정량 분석과 호환되어야 합니다. 여기서는 hPGCLC의 BMEx 차별화 프로토콜에 대한 단계별 분석을 제시하며, 재현성과 성능을 결정하는 중요한 기술적 매개변수를 강조합니다.
성공적인 분화의 주요 결정 요인은 hiPSCs의 초기 다능성 상태입니다. 통로 번호, 세포 건강, 계통 특이적 특성, 분화 전 배양 조건 등이 hPGCLC 분화 결과에 영향을 미칠 수 있습니다. 초기에는 hiPSC 유지 단계에서 코팅 기질, 시딩 세포 밀도, 배양판 형식에 주의를 기울일 수 있으며, 이들은 함께 hPGCLC 분화 초기 콜로니 구조와 신호 전달 환경을 정의합니다. 본 연구는 다양한 코팅과 다양한 씨앗 밀도에 대해 배양한 hiPSCs가 hPGCLCs의 분화에 미치는 영향을 보여줍니다(겔트렉스). 여기서 테스트한 두 hiPSC 계통은 20,000–40,000 세포/cm² 시딩 밀도에서 최대 분화 효율을 보였습니다. 이는 새로운 세포주를 도입하거나 장기간 전달 후 도입하거나 실험 레이아웃이나 배양 플레이트 형식을 변경할 때 최적의 씨앗 밀도를 결정할 필요성을 강조합니다. 표면적-부피 비율이나 성장 속도학의 사소한 변화조차도 높은 분화 효율을 유지하기 위해 최적화가 필요할 수 있습니다. 따라서 사용자는 먼저 hPGCLC 분화에 최적의 조건을 결정하기 위해 소규모 파일럿 실험을 수행할 것을 권장합니다.
견고함에도 불구하고, 이 방법은 인정해야 할 한계점이 있습니다. 여러 코팅과 밀도에 적합하지만, 분화 효율성은 후생유전학적 상태 및 통과 이력 등 hiPSC의 내재적 특성에 민감하며, 이는 완전히 조절되지 않습니다. 여러 검사된 hiPSCs는 hPGCLCs로 분리되지 못하는 것으로 보였다. 무엇보다도, 완전히 정의된 제품인 비트론넥틴과 달리, BMEx는 배치별로 변동이 있는 동물유래 제품으로, 이는 재현성에 영향을 줄 수 있습니다. 이전에 Matrigel, Cultrex, Geltrex의 서로 다른 배치를 시험하여 일관된 결과를 얻었지만, 이는 여전히 우려 사항이며, 향후 재현성과 전이 가능성을 보장하기 위해 BMEx에 대한 완전히 정의된 대안을 고려해야 합니다. 여기서는 두 개의 남성(XY) hiPSC 라인이 사용되었으나, 이 프로토콜은 여성(XX)과 남성(XY) 라인26 모두에서 테스트되었습니다. 마지막으로, 이 프로토콜은 hPGCLCs를 생성했으며, 이는 hPGC와 전사적으로 유사하고 추가 발달 능력을 가진 것으로 입증되었으나(26,34), 이후 생식세포 단계로의 추가 성숙은 여기서 다루지 않았다. 스크리닝 스타일 응용 분야에서 확장성이 입증되었지만, 자동화 기반 적응과 더 넓은 hiPSC 라인 패널에 걸친 실험실 간 검증이 번역 효용성을 더욱 강화할 것입니다.
기존의 hPGCLC 차별화 전략과 비교할 때, 이 프로토콜은 여러 가지 장점을 제공합니다. 고도로 특수화되거나 매트릭스 제한 방식과 달리, 일반적으로 사용되는 hiPSC 유지 기질과 배양 플레이트 형식을 수용하여 기술적 장벽을 낮춥니다. 밀도 최적화와 초기 단계 품질 관리에 대한 강조는 시험 관 내 배우자 형성 분야에서 지속적인 도전인 재현성을 더욱 향상시킵니다.
여기서 설명한 방법론적 틀은 생식 독성학, 불임 모델링, 발생생물학에 특히 관련성이 높습니다. 확장 가능한 형식과의 호환성은 중고처리량 화합물 스크리닝을 가능하게 하며, 재현성은 연구 간 비교와 협력 컨소시엄 노력을 지원합니다. 더 넓게는, hPGCLC 유도 프로토콜의 실험실 간 체계적 표준화와 기능 평가기준 18,35를 비교하는 것이 시험관 내 배우자 형성을 예측 가능한 인간 관련 플랫폼으로 발전시키는 데 필수적일 것입니다.
저자들은 이 원고 작성에 인공지능 도구가 사용되지 않았음을 명확히 하고 확인할 이해 충돌이 없습니다.
추바 데 소우사 로페스 그룹의 현재와 과거 회원 여러분께 영감을 주는 토론을 해주셔서 감사드립니다; LUMC의 유동 세포분석 코어 시설, LUMC hiPSC 호텔, LUMC의 영상 시설에 대한 전문 지식에 대해 감사드립니다. 이 연구는 노보 노르디스크 재단(NNF21CC0073729, EK, CLdM, SMCSL로 재개), EC(HORIZON-MSCA-2023-DN MSCA 101169308-IMPLANTEU)의 지원을 받았습니다; 중국 장학 위원회(CSC 20230920054에서 CF, CSC 202308410196에서 DW로 전환), 그리고 네덜란드 보건연구개발기구(ZonMW PSIDER-2021-10250022120001)에서 MP 및 SMCSL로 참여했습니다.
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