인간 상아질 디스크와 포토리소그래피로 제작된 미세 채널을 포함하는 수직 적층형 상아질-치수 복합체 칩-온-어-칩(organ-on-a-chip) 장치의 제작 및 조립 과정과, 이어서 진행되는 치수 줄기세포의 파종 및 배양 방법을 설명합니다.
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인간 상아질 디스크와 포토리소그래피로 제작된 미세 채널을 포함하는 수직 적층형 상아질-치수 복합체 칩-온-어-칩(organ-on-a-chip) 장치의 제작 및 조립 과정과, 이어서 진행되는 치수 줄기세포의 파종 및 배양 방법을 설명합니다.
동물 모델 및 정적 세포 배양을 포함하여 치과 연구에 사용되는 기존의 전임상 모델은 상아질-치수 계면의 생리적 조건을 재현하고 치과용 생체 재료에 대한 인간의 생물학적 반응을 예측하는 데 있어 중요한 한계가 있습니다. 장기 칩(Organ-on-a-chip, OoC) 기술은 제어된 미세 유체 시스템 내에서 조직 특이적 미세 환경을 재현함으로써 대안적인 접근 방식을 제공합니다. 본 논문은 3층 구조의 폴리디메틸실록산(PDMS) 미세 유체 플랫폼 내에 인간 상아질 디스크를 통합한 상아질-치수 복합체 OoC 장치의 제작 및 조립을 위한 단계별 프로토콜을 설명합니다. 이 프로토콜은 상아질 디스크 준비, 포토리소그래피를 이용한 미세 구조 몰드 제작, PDMS 캐스팅 및 경화, 플라스마 보조 층 결합, 장치 조립, 누수 테스트, 그리고 정적 배양 조건에서의 치수 줄기세포 파종을 포함합니다. PDMS 층 두께 제어, 플라스마 표면 처리, 누수를 최소화하기 위한 장치 내 상아질 디스크 통합 등 장치 성능에 영향을 미치는 핵심 제작 파라미터에 대해 논의합니다. 장치 내 세포 부착 및 생존능은 주사전자현미경과 공초점 생사 염색법을 사용하여 평가되었습니다. 대표적인 결과는 미세 유체 조립체 내 상아질 디스크의 성공적인 통합, 누수 없는 상태의 유지, 그리고 상아질 표면에 생존 가능한 치수 줄기세포의 부착을 보여줍니다. 본 프로토콜은 치과용 생체 재료 및 미세 환경 자극에 대한 세포 반응을 조사하는 향후 연구를 지원할 수 있는 상아질-치수 복합체 OoC 플랫폼 제작을 위한 재현 가능한 접근 방식을 제공합니다.
동물 실험은 병리학적 및 생리학적 과정에 대한 이해를 증진하는 데 오랫동안 중요한 도구였으며, 약물 개발의 초기 단계에서 중심적인 역할을 해왔습니다1. 20세기에 걸쳐 인간의 기대 수명은 상당히 증가했으며, 이러한 개선이 오직 동물 연구 덕분이라고 정확히 정량화할 수는 없으나, 많은 현대적 의료 처치들이 동물 모델을 사용하여 개발되었거나 검증되었다는 점은 널리 인정되고 있습니다2. 주목할 만한 사례로는 소아마비, 홍역, B형 간염 백신의 개발, 페니실린의 안전성과 효능 평가, 그리고 인슐린 생산 등이 있습니다. 치과 및 생체 재료 연구 분야에서 이러한 모델들은 치아 우식 과정, 상아질-치수 복합체의 생물학 및 재생, 그리고 치주 조직의 생리 병리학을 탐구하는 데 핵심적이었습니다3,4.
이러한 방법론들이 광범위하게 사용되고 있음에도 불구하고, 현재의 약물 개발 파이프라인은 여전히 높은 실패율을 보이고 있으며, 많은 약물 후보 물질들이 전임상 실험실 환경 및 동물 모델에서 효능과 안전성을 입증했음에도 불구하고 임상 시험 단계에서 실패하고 있습니다5. 이러한 불일치는 종 간의 해부학적, 유전적, 생리학적 차이로 인해 동물 모델의 중개 예측 가능성을 제한할 수 있는 종간 차이와 관련이 있습니다6. 또한, 새로운 치료 접근법의 개발은 여전히 많은 시간과 비용이 소요됩니다7. 더욱이, 기존의 in vitro 모델은 주로 비생리적인 플라스틱 기질 상의 단순한 2차원(2D) 단층 배양을 이용하므로, 인체 구강 내에 존재하는 생화학적 및 물리적 신호, 세포 간 상호작용 및 세포외 기질(ECM) 신호를 재현하지 못합니다8,9. 2D 모델은 특정한 실험적 장점을 제공하지만, 바이오필름, 생체 재료, 상아질 및 치수 세포와 같은 다수의 구성 요소 사이에서 동시에 일어나는 복잡한 상호작용을 본질적으로 재현할 수 없습니다10. 결과적으로, 인간의 생물학적 반응을 더 정확하게 재현할 수 있는 대체 실험 플랫폼 개발에 대한 관심이 높아지고 있습니다. 2022년, FDA 현대화법 2.0(FDA Modernization Act 2.0)은 약물 승인 과정에서 동물 실험의 필수 요구 사항을 제거하였으며, 전임상 연구에서 장기 칩(organ-on-a-chip, OoC) 기술을 포함한 대체 플랫폼의 활용 가능성을 인정하였습니다11.
OoC는 특정 장기나 조직 구성 요소의 구조, 기능 및 미세환경을 복제하도록 설계된 미세유체 장치입니다12. 이러한 장치에는 세포가 자연적으로 노출되는 생리학적 미세환경의 핵심 측면을 재현하도록 설계된 미세채널 내에서 배양된 살아있는 세포와 조직이 배치됩니다. 구조적 모방을 넘어, 미세채널은 세포 환경에 대한 시공간적 제어를 가능하게 하고 조직 특이적 기능의 유지를 지원함으로써, 기존의 배양 시스템보다 생체 내(in vivo) 생리학에 더 가까운 실험 조건을 제공합니다12. 특히, OoC 장치의 미세채널은 배양액의 제어된 흐름을 촉진하며, 이는 거주 세포에 전단 응력(shear stress)을 가합니다13. 이러한 기계적 자극은 부착, 증식, 이동, 유전자 발현 및 세포 간 상호작용을 포함한 세포 반응에 영향을 미칩니다14,15. 또한, 지속적인 배양액의 흐름은 영양분 공급과 대사 폐기물 제거를 통해 미세환경 유지에 기여합니다16. 더욱이, 일부 OoC 플랫폼은 기존의 2D 배양과 비교하여 3차원(3D) 온칩 모델에서 세포 내 활성 산소종 및 세포 생존율을 포함한 산화 스트레스 관련 판독값의 제어 능력이 향상되었다고 보고되었습니다17. 따라서 OoC 시스템은 제어된 실험 조건 하에서 조직 생리학, 생체 재료 상호작용 및 질병 과정을 연구하기 위한 유망한 플랫폼으로 부상했습니다18. 치과 연구에서 OoC 기술은 점점 더 복잡한 구강 조직 인터페이스를 모델링하는 데 점진적으로 적용되어 왔습니다19. 초기 치아-온-어-칩(tooth-on-a-chip) 플랫폼은 생체 재료-상아질-치수 인터페이스를 모방했으며20, 이후 더 발전된 버전에서는 치수-상아질 복합체의 구조적 및 기능적 복잡성을 더 충실하게 복제하기 위해 혈관 및 삼차신경 분포를 통합했습니다21. 치수를 넘어, 미성숙 근관의 3D 모델을 통해 근관 세척제 평가와 치근단 유두 유래 줄기세포의 혈관 신생 발아(angiogenic sprouting) 연구가 가능해졌습니다22,23. 치주 수준에서는 잇몸-온-어-칩(gum-on-a-chip) 플랫폼이 숙주-미생물 상호작용을 조사하고 치료제로서 프로바이오틱스의 면역 조절 잠재력을 평가하는 데 사용되었으며24, 치주인대-온-어-칩(periodontal ligament-on-chip) 장치는 간질액의 흐름이 혈관 네트워크 형성 및 치주인대 줄기세포 스페로이드의 골분화에 어떻게 영향을 미치는지 입증했습니다25,26. 이러한 모델들을 보완하여, 특수 구강점막-온-어-칩 및 치과 임플란트-온-어-칩 시스템은 생리학적으로 유의미한 조건 하에서 숙주-재료 상호작용과 치과용 모노머의 세포 독성을 특성화함으로써 치과 미세유체 연구의 범위를 더욱 확장했습니다27,28.
OoC 시스템이 치과, 구강 및 두개안면 연구에 점점 더 많이 적용되고 있지만, 제작 워크플로우의 표준화와 재현성을 위한 지속적인 노력은 여전히 중요합니다. 문헌에는 다양한 장치 구성과 실험적 응용을 보여주는 여러 치아-온-어-칩(tooth-on-a-chip) 모델이 보고되었습니다20,29,30,31. 그러나 장치 구조, 제작 방법, 상아질 통합 방식 및 실험 매개변수 보고의 차이로 인해 재현성과 연구 간의 직접적인 비교가 제한될 수 있습니다. 특히, 마이크로채널 기하학적 구조, 상아질 통합 전략 및 제작 방식의 차이는 장치 내의 생물학적 및 기계적 미세환경에 영향을 줄 수 있습니다. 일부 보고된 모델은 상아질-치수 인터페이스의 특성을 재현하기 위해 상아질을 통합한 반면20,29,30, 다른 모델들은 대안적인 구성을 사용합니다31. 또한, 포토리소그래피, 레이저 커팅, 마이크로밀링 및 3D 프린팅과 같은 제작 방법은 의도한 장치 설계와 응용 분야에 따라 각각 고유한 장점과 한계가 있습니다. 더욱이, 생물학적 유용성을 결정짓는 결정적인 요인은 장치의 구조적 방향, 구체적으로 채널과 상아질 절편이 수평 또는 수직 구성으로 배치되었는지 여부입니다19,32. 수평 적층 구성에서는 나란히 배치된 구획들이 측면 구획화와 세포의 실시간 시각화를 용이하게 하여, 치주 복합체와 같이 본질적으로 측면 공간 조직을 가진 조직을 모델링하는 데 특히 적합합니다24,32. 그러나 이러한 설계는 구획의 측면 배치가 와동과 치수 사이의 상아질 장벽의 생체 내 방향을 충실히 복제하지 못하므로, 생체 재료-상아질-치수 복합체와 같은 수직 생물학적 인터페이스를 재현하는 능력에 본질적인 한계가 있습니다20,32. 수직 적층 구성은 천연 상아질 절편으로 분리된 두 구획을 y축을 따라 중첩함으로써 이러한 한계를 해결하며, 이를 통해 온전한 상아질을 통한 분자 이동의 동시 정량화와 배출 배지에서 측정되는 치수 세포 반응의 실시간 모니터링이 가능해집니다30. 하지만 이 방향의 알려진 한계는 상아질-세포 인터페이스의 단면 이미징에 관한 것입니다. 세포와 세포외 기질이 측면으로 배치된 수평 적층 구성에 비해, 동일 초점 평면 내에서 상아질-세포 인터페이스의 단면 이미지를 획득하는 것은 기술적으로 더 어렵기 때문입니다. 문헌에 여러 상아질-치수 복합체-온-어-칩 모델이 보고되었으나, 대다수는 구획이 동일 평면상에 나란히 배치된 수평 적층 구성을 채택하고 있으며10,20,21,29, 수직 적층 구성 내에 천연 상아질 절편을 통합한 경우는 상대적으로 적습니다30. 그럼에도 불구하고, 이러한 모델들 전반에 걸친 제작 방식과 보고 매개변수의 차이는 여전히 재현성과 연구 간 비교를 제한하고 있습니다33. 본 논문은 수직 적층 치아-온-어-칩 장치의 상세한 제작 프로토콜을 제공함으로써 방법론적 재현성을 개선하고, 이를 통해 치과 연구 커뮤니티 내에서 해당 플랫폼의 광범위한 도입을 촉진하는 것을 목표로 합니다.
본 원고는 포토리소그래피로 제작된 몰드를 이용해 제작된 3층 폴리디메틸실록산(PDMS) 미세유체 플랫폼 내에 인간 상아질 디스크를 포함하는 수직 적층형 상아질-치수 복합체 OoC 장치의 단계별 제작 및 조립 프로토콜을 설명합니다. 또한, 이 프로토콜은 정적 조건에서 장치 내에 치수 줄기세포를 파종하고 배양하는 방법을 설명합니다.
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본 연구는 헬싱키 선언을 준수하여 수행되었으며, 인간 샘플을 포함하는 연구에 대해 Universidad de La Frontera 윤리 위원회의 승인을 받았습니다.
1. 상아질 디스크 획득
참고: 프로토콜을 시작하기 전에 장치 설계를 준비하십시오(그림 1A–1C).

그림 1: 상아질-치수 복합체 장기 칩(OoC) 장치의 설계 및 제작 워크플로우. (A) 3층 구조를 보여주는 장치의 3차원 설계. (B) 주요 치수가 표시된 장치 설계의 평면도. (C) 3층 장치 구성의 측면도. (D) 두께 약 0.8 mm, 가로 세로 크기 약 5 mm × 5 mm로 준비된 대표적인 상아질 디스크. (E) 포토리소그래피로 제작되어 상단 및 하단 polydimethylsiloxane (PDMS) 층의 캐스팅에 사용된 실리콘 마스터 몰드. (F) 열 중합 후 실리콘 몰드에서 경화된 PDMS 층을 제거하는 과정. (G) 층 결합 전 PDMS 표면의 플라즈마 처리. (H) 플라즈마 본딩으로 조립되고 상아질 인터페이스가 통합된 최종 3층 상아질-치수 복합체 OoC 장치. (I) 누출 테스트 및 미세유체 실험 준비를 위해 튜빙에 연결된 조립된 장치. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
2. 상아질-치수 복합체 OoC 장치 제작
3. 치수 줄기세포의 부착 및 생존력 평가

그림 2: 상아-치수 복합체 OoC 장치 내 치수 줄기세포의 부착 및 생존능에 대한 대표 평가. (A) OoC 장치 내에서 24시간 동안 정적 배양한 후, 상아질 표면에 부착된 치수줄기세포(흰색 별표)를 보여주는 주사전자현미경 이미지. 배양 24시간 후, 부착된 세포가 마이크로채널에 노출된 상아질 표면의 54.35 ± 0.92%를 덮고 있었다. PDMS로 덮인 상아질 영역(검은색 별표)에서는 세포가 관찰되지 않았으며, 이는 장치 층 간의 밀봉이 효과적으로 이루어졌음을 나타낸다. 스케일 바 = 200 µm. (B) 정적 배양 24시간 후, 상아질 표면에 부착되어 녹색으로 염색된 생존 치수줄기세포를 보여주는 공초점 현미경 이미지(흰색 화살표). 적색으로 염색된 비생존 세포 또한 관찰됨(파란색 화살표). 스케일 바 = 50 µm. 이 그림의 더 큰 버전을 보시려면 여기를 클릭하십시오.
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치아-온-어-칩 장치의 성공적인 제작은 다음의 워크플로우를 따랐습니다. 그림 1A–1I, 상아질 디스크 준비를 포함하여 (그림 1D), 포토리소그래피 유래 몰드의 제작 (그림 1E), 경화된 PDMS 층의 제거 (그림 1F), 본딩 전 플라스마 활성화 (그림 1G), 최종 장치의 조립 (그림 1H), 그리고 장치를 미세유체 셋업에 연결하는 과정(그림 1I). 결과물인 장치는 3층 PDMS 조립체로 구성되었으며, 상부 및 하부 미세유체 채널이 상아질 표면의 양측에 배치되고 상아질 디스크가 중간층 내에 완전히 통합되었습니다.
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본 연구는 상아질과 치수 줄기세포를 포함하는 수직 적층형 tooth-on-a-chip 장치 제작을 위한 단계별 프로토콜을 기술하며, 정적 배양 조건 하에서 장치 내의 대표적인 세포 부착 및 생존능을 입증합니다. 이 프로토콜은 상아질 계면의 in vitro 연구에 적합한 상아질-치수 복합체 OoC 플랫폼의 제작 및 조립을 위한 재현 가능한 워크플로를 제공하기 위해 개발되었습니다. 이러한 워크플로의 구축은 특히 중요한데, 최근의 체계적 문헌고찰에서 상아질-치수 복합체용 미세유체 모델 분야가 여전히 초기 단계에 머물러 있으며, 장치 구조와 재료의 방법론적 이질성이 높아 현재의 tooth-on-a-chip 모델의 재현성과 표준화를 심각하게 저해하고 있음을 강조했기 때문입니다34. 본 연구는 상세하고 재현 가능한 프로토콜을 제공함으로써 이러한 한계를 해결하고, 보다 명확하게 정의된 생물학적 모델의 개발에 기여합니다. 구강 생물학에 적용된 OoC 개발의 더 넓은 맥락에서, França 등
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저자들은 공개할 경쟁적 재정적 이해관계나 이해상충이 없음을 선언합니다.
본 연구는 Universidad de La Frontera의 Dirección de Investigación의 Project DIM24-0004 및 Project PP24-0031, 칠레 국가연구개발청(ANID)의 FONDECYT Regular No. 1260116 및 FONDECYT de Iniciación No. 11230701의 지원을 받아 수행되었습니다.
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| 이름 | 회사 | 카탈로그 번호 | 댓글 |
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| 생물학 및 화학 재료 | |||
| 아세톤 | ExpertQ | SOLV 8 | 실리콘 웨이퍼 세척 |
| Alpha MEM 배양액 | Cytiva | SH30265.02 | 치수질 줄기세포 배양액 |
| 클로라민 (0.5%) | Merck | 7080-50-4 | 상아질 디스크 보존액 |
| 치수질 줄기세포 | 해당 없음 | 해당 없음 | 1차 세포 배양. 단계 3.2.1 및 3.2.2 참조 |
| EDTA (10%) | Winkler | N2222158E | 스미어 층 제거 |
| 에폭시 기반 음성 감광제 | Gersteltec | GM1060 | 포토리소그래피 몰드 제작 |
| 0.1 M Sorensen’s 인산염 완충액 내 글루타르알데하이드 (2.5%) | Sigma-Aldrich | 210908-06 | SEM 고정 |
| 건강한 사람의 치아 (대구치 또는 소구치) | 해당 없음 | 해당 없음 | 인체 시료 |
| 이소프로판올 | ExpertQ | SOLV 16 | 웨이퍼 세척, 현상 중지 및 PDMS 세척 |
| LIVE/DEAD 생존능 분석 키트 | Sigma-Aldrich | 451 | 형광 생존능 염색. |
| PBS (인산염 완충 식염수) | Corning | 46-013-CM | 세척 및 누출 테스트 |
| PDMS 베이스 및 경화제 (폴리디메틸실록산) | Dow | Sylgard 184 | 장치 제작 |
| PGMEA | Sigma Aldrich | 484431 | 감광제 현상 |
| 트리판 블루 | Sigma Aldrich | T8154-100ml | 세포 생존능 평가 |
| 트립신 | Corning | 25-053-CI | 세포 분리 |
| 초순수 | Cytiva | SH30529.01 | 세척액 |
| 소모품 및 실험실 기구 | |||
| 19G 주사바늘 | Vmatic | VCB19050 | 장치와 마이크로펌프 또는 주사기 연결 |
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| 층류 작업대 | BioBase | BBS8V1708313D | 장치 멸균 |
| 미세 유체 펌프 | New Era | 해당 없음 | 모델: 1002X-ES. 10 µL/min에서 누출 테스트 |
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| 휴대용 코로나 플라즈마 | Aurora Pro Scientific | APS-CD-20AC | PDMS 플라즈마 활성화 |
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| 진공 펌프 | ROCKER | 300 | PDMS 탈기 |
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