이 프로토콜의 목표는 Asobara japonica 와 Drosophila melanogaster 에서 기생벌-숙주 상호작용의 기능적 분석을 용이하게 하는 것입니다. 최적화된 사육 방법, 단일 산란 감염 분석, RNAi 매개 유전자 다운을 통해
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방법 논문
이 프로토콜의 목표는 Asobara japonica 와 Drosophila melanogaster 에서 기생벌-숙주 상호작용의 기능적 분석을 용이하게 하는 것입니다. 최적화된 사육 방법, 단일 산란 감염 분석, RNAi 매개 유전자 다운을 통해
기생은 한 생물이 다른 생물(숙주)의 몸이나 자원을 이용하여 숙주에게 상당한 손상이나 사망을 초래하는 생물학적 상호작용입니다. 기생 동물 중에서 기생말벌은 가장 종이 풍부한 계통 중 하나로, 전체 곤충 종의 거의 20%를 차지합니다. 특히, 내기생벌은 숙주 몸에 직접 산란하여 다양한 독 인자를 사용해 숙주 발달, 면역, 생리를 조작합니다. 말벌 공격에 대응하여 숙주는 선천적 면역 기전을 통해 기생독 알을 제거하려 시도합니다. 그러나 개별 독 성분이 숙주 생물학을 조절하고 성공적인 기생을 촉진하는 분자 및 세포 메커니즘은 아직 잘 알려져 있지 않습니다. 여기서는 내기생충 말벌 Asobara japonica 와 그 숙주 Drosophila melanogaster 를 키우기 위한 표준화된 실험실 프로토콜을 설명합니다. A. japonica의 단성생식 및 유성생식 균주 모두 존재하며, 단위생식계통은 높은 기생 성공률을 보여 게놈 분석과 기생 분석을 위한 실험실 재고의 안정적인 유지를 가능하게 합니다. 독 유전자의 기능 분석에 최적화된 단일 산란 감염 분석법과 이중 가닥 RNA 기반 유전자 노크다운 방법이 적용되었습니다. 이 프로토콜들은 기생충-숙주 상호작용의 분자 메커니즘을 해부하는 실질적인 실험적 틀을 제공하며, 발생생물학, 면역학, 생리학 분야의 미래 연구를 촉진할 것입니다.
기생은 한 생물이 다른 생물의 영양 자원을 이용하는 생활 방식으로, 분류군 전반에 걸쳐 널리 퍼져 있습니다. 알려진 생물의 최대 절반이 생애 주기에서 기생 활동을 보이는 것으로 추정됩니다1. 기생충 중에서 기생벌은 특히 다양한 그룹으로, 전체 곤충의 약 20%를 차지합니다2. 곤충, 거미, 진드기 등 다양한 절지동물 숙주를 이용하며, 생활사와 기생 전략에서 놀라운 다양성을 보인다3. 이러한 특징들은 기생 말벌을 진화적·생태적으로 가장 성공적인 곤충 그룹 중 하나로 만듭니다.
기생독과 숙주 간의 상호작용은 진화적 '군비 경쟁'의 모델 시스템으로 광범위하게 연구되어 왔습니다. 특히, 내기생충 말벌은 독, 공생 바이러스, 기형세포 등 다양한 인자를 활용합니다 4,5. 이 인자들은 숙주의 생리와 발달을 조작하여 숙주 내에서 성공적인 발달을 보장합니다. 이러한 진전에도 불구하고, 기생의 분자 메커니즘은 대부분의 기생독 종에서 여전히 잘 이해되지 않고 있습니다. 주요 한계 중 하나는 작은 체형으로, 독 성분의 생화학적 식별에 어려움을 겪고 있습니다. 또한, 기생독과 그 숙주를 실험실 조건에서 동기화된 발달 단계로 유지하는 것은 기술적으로 어렵습니다.
차세대 시퀀싱 및 기타 오믹스 기술의 최근 발전으로 매우 작은 기생독 종에서도 유전체 전체 분석이 가능해졌습니다. 이러한 접근법은 이전에 접근할 수 없었던 분자 메커니즘을 연구하는 새로운 길을 열어, 기생독-숙주 상호작용을 전례 없는 해상도로 연구할 수 있게 했습니다. 이와 관련해 우리 연구실은 일본에서 처음 확인된 종인 Asobara japonica Belokobylskij (막목: Braconidae)에 집중합니다 6,7,8. A. japonica는 암컷이 교미하지 않고 자손을 낳는 thelytokous 단위생식 균주를 포함합니다. 이 기능 덕분에 전체 유전체 시퀀싱을 위해 유전적으로 균일한 유전체 DNA를 상당량 수집할 수 있습니다. 또한 이 종은 모델생물인 D. melanogaster를 포함한 다양한 초파리 종에 기생하며, 잘 확립된 사육 조건과 정확히 정의된 발달 단계 덕분에 재현 가능한 감염 검사와 기생벌 발달의 정확한 통제를 가능하게 합니다10.
A. japonica의 기생 기간 동안, 암컷 말벌이 독과 알을 하나 함께 파리 유충에 주입하면, 그 안에서 말벌 유충이 숙주와 함께 자랍니다. 특히 A. japonica는 숙주 D. melanogaster에서 높은 기생 성공률을 보여 이 기생벌-숙주 쌍은 강력한 실험 모델이 됩니다. 여기서는 A. japonica에서 안정적인 사육, 단일 산란 감염 분석, 그리고 이중 가닥 RNA(dsRNA) 기반 유전자 노크다운 방법에 대한 프로토콜을 설명합니다. 이 프로토콜들은 기생충-숙주 상호작용의 분자 메커니즘을 해부하는 신뢰할 수 있는 틀을 제공합니다.
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D. melanogaster와 A. japonica의 동기화 양식 방법에 대한 도식은 그림 1에 제시되어 있습니다.
1. 실험실에서 숙주 과일파리 Drosophila melanogaster 사육
2. 실험실에서 내기생벌 말벌 Asobara japonica 사육
3. 단일 산란 감염 분석
4. dsRNA 주입에 의한 RNA 간섭(RNAi) 말벌 생성
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아소바라 자포니카의 무성 및 유성 균주
A. japonica는 일본 전역에 널리 분포합니다. Thelytokous 단위생식 계통은 본도에서 우세하며, 아마미-오시마와 이리오모테지마 섬을 포함한 아열대 섬에서는 arrhonetokuous 유생식 계통이 발견됩니다 8,12. 유성균주에서는 수컷이 암컷보다 며칠 일찍 출현하여 성체 이동 시기가 뚜렷하게 나타납니다. A. japonica의 Thelytokous 단위생식은 모계에서 전파되는 내공생균인 Wolbachia의 감염에 의해 유도됩니다. 항생제 치료로 Wolbachia를 제거하면 수컷
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본 연구에서는 분자 수준에서 기생독-숙주 상호작용을 조사할 수 있는 다목적 실험 플랫폼을 구축했습니다. 사육 조건 최적화, 단일 산란 감염 분석법, RNAi 프로토콜을 통해 기생충 유래 인자의 기능적 연구를 위한 견고한 시스템을 제공합니다. 이 플랫폼은 기생 말벌이 숙주 발달을 조작하는 메커니즘을 밝히는 향후 연구를 촉진하며, 생물학적 해충 방제 전략 개발에도 기여할 수 있습니다.
A. japonica의 Wolbachia에 감염된 TK 균주는 기생 분석을 위한 매우 재현성 높은 실험 시스템을 제공합니다. 많은 기생충-숙주 연구에서 실험 결과는 종종 변동적이며, 숙주 생존과 기생충 성공률은 환경적·생리학적 조건에 민감하게 좌우됩니다. 반면, TK 균주는 일관되게 높은 기생 성공률을 보여, 감염 결과가 대체로 균일한 '기생충 우성' 상태를 효과적으로 만듭니다. 더불어, 단위생식(partthe...
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우리는 공개할 이해 상충이 없습니다.
저자들은 타치바나 카나타, 쿠도 시온, 마키노 토시야, 요리모토 슌타, 시게노부 슈지, 카와무라 아키코, 후지노키 아리, 이이다 마사코에게 기술 지원을 제공해 주셔서 감사드립니다. 또한 우리 연구실의 모든 회원들께도 감사드립니다.
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| 이름 | 회사 | 카탈로그 번호 | 댓글 |
|---|---|---|---|
| 50 mL tube | Greiner Bio-One | 210261 | 감염 분석 |
| 1 mL 주사기 | TERUMO | SS-01T | dsRNA 주입 |
| Agar | Daisin, Ltd. | P-700 | 사육 |
| Asnol Petri Dish φ40×13.5mm | As One Corporation | 1-8549-01 | 감염 분석 |
| Asnol Petri Dish φ55×17mm | As One Corporation | 1-8549-02 | dsRNA 주입 |
| Blue dye (Erioglaucine disodium salt) | Sigma-Aldrich Co. Llc. | 861146-25G | dsRNA 주입 |
| Butyl p-Hydroxybenzoate | Nacalai Tesque, Inc. | 06327-15 | 사육 |
| CO2 압력 조절기 | YAMATOSANGYO | YR-507F-2 | 감염 분석 |
| 공초점 레이저 스캐닝 현미경 | Zeiss | LSM700 | 이미지 분석 |
| 옥수수 가루 | Sunny Maize Co., Ltd. | No.4M | 사육 |
| DAPI | Thermo Fisher Scientific Inc. | PI62247 | 핵 염색, 1:10000 |
| 탈이온수 | Millipore Inc. | ZLXEV030WW | 감염 분석 |
| 이중 스테이지 유리 마이크로파이펫 풀러 | Narishige | PC-10 | dsRNA 주입 |
| Fiji | NA | https://fiji.sc | 이미지 분석 |
| 필터 용지 | Advantec | ITEM 526 | 사육 |
| 파리 사료 바이알 | Chiyoda Science Co., Ltd. | KFB-3M | 사육 |
| 파리 사료 바이알 플러그 | Chiyoda Science Co., Ltd. | AS-275 | 사육 |
| 포초 | Dumont Biologie | 11252-20 | 해부 |
| -20 ℃ 냉동고 | Nihon Freezer | GS-3120HC | 시료 저장 |
| -80 ℃ 냉동고 | Nihon Freezer | CLN-52UD2 | 시료 저장 |
| 유리 슬라이드 | Matsunami Glass Ind., Ltd | S7213 | 감염 분석 |
| 포도당 | Showa Sangyo Co., Ltd. | 사용 불가 | 사육 |
| KOD Plus Neo | Toyobo | KOD-401 | dsRNA 합성 |
| 인큐베이터 | Panasonic | MIR-254-PJ | 사육 |
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| 마이크로파이펫 그라인더 | Narishige | EG-401 | dsRNA 주입 |
| 미네랄 오일 | Nacalai Tesque, Inc. | 23306-84 | dsRNA 주입 |
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