본 연구에서는 소의 탈핵 난자를 이용하여 멸종 위기 사슴 종의 복제 배아를 얻는 프로토콜을 제시합니다. 여기에서는 이종 간 체세포 핵 이식의 상세한 방법론과 투명대 제거 난자를 세포질체(cytoplasts)로 사용하는 방법을 설명합니다. 또한, 얻어진 결과에 대해 상세히 논의합니다.
방법 논문
본 연구에서는 소의 탈핵 난자를 이용하여 멸종 위기 사슴 종의 복제 배아를 얻는 프로토콜을 제시합니다. 여기에서는 이종 간 체세포 핵 이식의 상세한 방법론과 투명대 제거 난자를 세포질체(cytoplasts)로 사용하는 방법을 설명합니다. 또한, 얻어진 결과에 대해 상세히 논의합니다.
동물에게 적용되는 생식 생명공학 기술은 유전적 가치가 높은 종의 개체 수를 증가시키는 것을 가능하게 합니다. 또한, 이러한 기술은 우수한 형질을 가진 개체의 유전 물질을 보존, 유지 및 확산시키는 데 도움을 줍니다. 선택된 개체들의 유전적 구조 작업은 가축 종에 대한 수많은 연구로 이어졌으며, 이러한 연구 결과들을 다른 동물 집단이나 특정 개체에 적용하는 것을 목표로 하고 있습니다. 그러한 접근 방식 중 하나는 체세포 핵 이식(SCNT) 또는 복제를 사용하는 것으로, 이는 기존 표본과 동일한 유전 물질을 가진 배아를 생성하는 데 사용됩니다. 이 기술의 한계 중 하나는 야생 동물로부터 얻을 수 있는 난자의 가용성이 제한적이라는 점입니다. 따라서 이에 대한 대안으로, 복제 대상 종의 체세포(핵 공여자)를 핵 공여자로 사용하고 이를 다른 목(order)이나 분류군에 속하는 종에서 얻은 탈핵 난자(세포질 공여자)에 삽입하는 종간 체세포 핵 이식(iSCNT) 기술이 등장했습니다. 이 접근 방식을 통해 생존 가능한 복제 배아를 얻을 수 있습니다. 브라질에는 9종의 사슴이 있으며, 그중 상당수가 무분별한 사냥, 서식지 상실 및 기타 원인으로 인해 멸종 위기에 처해 있습니다. 레드 브로켓 사슴(Mazama americana)은 이러한 상황으로 고통받는 종 중 하나입니다. 따라서 본 연구는 이후 수혜 암컷에게 이식하여 종의 생존을 보장하는 데 도움을 주기 위한 배아 은행을 구축하기 위해, iSCNT 기술을 이용하여 레드 브로켓 사슴의 복제 배아를 얻는 방법론을 제시합니다.
사슴과(Cervidae)는 현재 진성 뿔을 가진 55종의 우제류 포유류로 구성되어 있습니다. 진성 뿔이란 수컷의 두개골 상단에 노출된 뼈 구조물을 말하며, 암수 모두 뿔을 가진 순록(Rangifer tarandus)1과 암수 모두 뿔이 없는 중국물사슴(Hydropotes inermis)2은 예외입니다. 사슴류는 있어뿔사슴과, 소과, 돼지과, 페카리과, 낙타과, 톈과, 기린과 및 하마과를 포함하는 고래우제목(Cetartiodactyla)에 속합니다. 일반적으로 사슴류는 남극 대륙을 제외한 전 세계의 매우 다양한 서식지에 거주하는 초식성 반추동물입니다3.
현재 브라질에서는 사슴과(Cervidae)에 속하는 9종이 인정되고 있습니다: Odocoileus virginianus (흰꼬리사슴), Blastocerus dichotomus (습지사슴), Ozotoceros bezoarticus (팜파스 사슴), Mazama americana, Mazama rufa, Mazama jucunda, Mazama nana, Subulo gouazoubira, 그리고 Passalites nemorivagus4.
이 분류 체계는 Mazama 속이 다계통(polyphyletic)임을 보여주는 최근의 분자 연구 결과를 반영하며5, 이에 따라 Subulo6와 Passalites7가 별개의 유효한 속으로 인정되었습니다. 이러한 신열대구(Neotropical) 사슴류의 상당수는 서식지 상실, 경관 파편화, 그리고 그에 따른 개체군 격리로 인한 유전적 다양성 감소를 포함한 인위적 압박으로 인해 점점 더 위협받고 있습니다8.
지난 100년 동안 보조 생식 기술은 초기에 실험실 포유류에 성공적으로 적용되었으며, 점차 보존 우선순위가 높은 야생 종으로 확대 적용되고 있습니다9. 결과적으로 대다수의 생식 생명공학 기술은 포유류 모델을 사용하여 발전해 왔으며, 이에 따라 이 집단이 연구의 주된 관심 대상이 되었습니다. 인공 수정, 배아 이식, 체외 수정, 배우자 및 배아 성감별, 유전자원 동결 보존을 포함한 여러 생식 기술이 포유류에 성공적으로 적용되었습니다10. 그러나 특히 체세포 핵 이식(SCNT) 기술은 멸종 위기 종에 적용했을 때의 결과와 잠재적 영향력으로 인해 다른 기술들 사이에서 두드러진 주목을 받아왔습니다11.
이용 가능한 생식 생명공학 기술 중에서, 복제는 공여 동물과 유전적으로 동일한 개체를 생성할 수 있게 한다. 체세포 핵 이식(SCNT)은 복제에 사용되는 주요 전략으로, 체세포 핵을 핵이 제거된 난자에 도입하는 방식이다. 그러나 야생종의 경우, 난자 공여자의 부족과 난자 회수와 관련된 기술적 어려움으로 인해 그 적용이 제한되는 경우가 많다12. 이러한 제약으로 인해 보존 프로그램의 보완적 접근법으로서 종간 체세포 핵 이식(iSCNT)이 개발되었으며, 여기서는 가축의 난자를 멸종 위기종 유래 핵의 수용 세포질체로 사용한다 (그림 1). 이 접근법의 가능성은 iSCNT를 이용해 여러 야생종의 살아있는 새끼를 성공적으로 생산함으로써 입증되었다13,14,15.
난자와 공여 세포를 조작하는 방식에 따라 복제 배아 생산을 위한 다양한 전략들이 제안되어 왔습니다. 전통적인 방식에서는 투명대(zona pellucida)가 온전한 난자의 핵을 제거한 후, 공여 세포를 난주위강(perivitelline space)에 도입하고 전기융합을 통해 융합시킵니다16. 또 다른 방법은 미세주입법과 같은 미세조작 기술을 사용하여 체세포 핵을 투명대가 있는 난자에 직접 주입하는 것입니다17. 이와 대조적으로, 투명대 제거(ZP-free) 시스템은 복잡한 장비 없이 뭉툭한 피펫을 사용하여 핵 제거를 수행할 수 있어 여러 미세조작 단계를 생략함으로써 복제 절차를 간소화합니다18. 본 실험에서는 소의 세포질체(cytoplast)와 사슴의 핵체(karyoplast)를 사용하여 복제 배아를 얻기 위해, iSCNT 과정 중 ZP-free 난자를 세포질체로 사용할 것을 제안합니다.
브라질 세아라주 구아라미랑가(4°13'53.0'' S, 38°56'42.6'' W)에서 환경 당국에 의해 성체 암컷 레드 브로켓 사슴 한 마리가 수거되었습니다. 해당 동물은 브라질 포르탈레자의 세아라 주립대학교(UECE) 신열대구 사슴 보전 연구소(LACCERNE)로 사체 상태로 입고되었습니다. 부검 결과, 왼쪽 배면 외측 복부 영역으로 진입한 총기 발사체에 의한 다발성 외상성 손상으로 인해 사망한 것으로 나타났습니다. 본 표본의 사용은 세아라 주립대학교 동물실험 윤리위원회(CEUA-UECE, 프로토콜 번호 450620/2022) 및 브라질 환경 및 재생 가능 천연자원 연구소(IBAMA, 프로토콜 번호 02027.014734/99-34)의 승인을 받았습니다. 또한, 소 난소의 사용은 CEUA/UECE(프로토콜 번호 31032.004671/2024-81)의 승인을 받았습니다. 사용된 모든 시약과 장비의 상세 내용은 재료 표에 나열되어 있습니다. 본 연구를 뒷받침하는 데이터는 Zenodo의 DOI 번호 10.5281/zenodo.22129414에서 확인할 수 있습니다.
1. 용액 및 배양 배지
참고: 모든 여과 작업은 0.22 µm 멸균 필터를 통해 수행하고, 여과액은 4 °C에서 최대 일주일 동안 보관하십시오. 스톡 용액은 -20 °C에서 보관하십시오.
2. 공여 조직 샘플의 수집 및 처리
3. 세포 주기 동기화
4. 난자 수집
5. 난모세포 성숙 및 투명대 제거
6. 투명대 제거, 핵 제거 및 투명대 제거 난자의 재구성
7. 세포 융합
8. 난자 활성화 및 배아 배양
결과는 R 소프트웨어(v.4.5.2)를 사용하여 분석되었습니다. 분할률과 배반포 형성률은 Fisher의 정확 검정을 사용하여 쌍 간(사슴/소 vs 소/소)에 비교되었습니다. 사슴/소 쌍 4회, 소/소 쌍 6회로 총 10회의 반복 실험이 수행되었습니다. 또한, 모든 분석에서 유의 수준은 5%로 설정되었습니다.
분석 과정에서 지역 도축장에서 얻은 472개의 소 난자를 세포질 수용체로 사용하였다. 그러나 체외 성숙 및 이후의 전기융합 과정에서 73개의 구조체가 융합에 실패하여 이후 단계에서 제외되었으며, 그 결과 399개의 핵이식체/세포질 수용체 구조체가 성공적으로 융합되었다. 이 전체 수량 중 다음과 같은 쌍(핵이식체/세포질 수용체)이 사용되었다: 사슴/소 4회 반복(n = 175) 및 소/소 6회 반복(n = 224) (표 2).
iSCNT의 영향을 평가하기 위해, 투명대(zona pellucida)를 제거한 재구성 배아를 7일까지 마이크로웰에서 배양하였습니다. 투명대가 없는 상실배와 포배의 대표적인 현미경 사진이 그림 3에 제시되어 있습니다.
표 2는 본 실험에서 얻은 분할률 및 배반포 형성률을 나타냅니다. 분할률은 그룹 간(사슴/소 및 소/소 쌍)에 유의미한 차이가 없었습니다(P = 0.74). 반면, 배반포 형성률의 경우 통계적 차이(P=0.02)가 관찰되었으며, 종내 복제 그룹에서 더 높은 비율을 보였습니다. 다만, 종간 복제 개체 수가 일반적으로 적은 이러한 유형의 실험에서 나타나는 통계적 검정력의 한계를 강조하는 것이 중요합니다.

그림 1: 종간 체세포 핵 이식(Somatic Cell Nuclear Transfer)의 모식적 단계. 소를 세포질 공여자로, 사슴을 핵 공여자로 사용합니다. 복제 배아를 얻은 후, 이를 수용 암컷에게 이식하거나 향후 이식을 위해 동결 보존할 수 있습니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 2: 세포질 돌출부가 있는 활성화된 난모세포의 현미경 사진. (A) 돌출부를 3시 방향으로 위치시키기 위해 난모세포를 회전시킨 모습. (B) 자외선 조사 하에 세포질의 5-10%와 함께 돌출부를 흡입하는 모습. (C) 자외선 조사 하에 흡입 피펫 내에 있는 세포질과 그 돌출부. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 3: 종간 체세포 핵 이식으로 생성된 사슴 배아의 광학 현미경 사진. (A) 상실배 단계의 복제 배아. (B) 포배 단계의 복제 배아. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
| 등급 | 난포세포 층수 | 난포세포 층의 확장 |
| I | > 3 | 여러 개의 조밀하고 약간 느슨한 세포층을 포함하는 완전한 적운 덮개 |
| II | 2 - 3 | 외부 세포층의 미세 팽창 |
| III | 1 | 부분적인 난구세포 덮개 및 느슨한 세포층 |
| 정맥 내 투여 | 0 | 적운 없음 |
표 1: 종간 체세포 핵 이식 과정에서 핵 제거 후 세포질 제공자로 사용될 소 난자의 분류(Aguila 등의 연구에서 수정)19.
| 그룹 (핵 제거 세포질/핵 제외 세포질) | 반복 횟수 | 재구성된 배아 수 | 절단된 수 (%) | 배반포 수 (%) |
| 사슴/소 | 4 | 175 | 122 (69.7)a | 8 (4.6)a |
| 소/소 | 6 | 224 | 160 (71.4)a | 24 (10.7)b |
| 동일한 열에서 서로 다른 문자는 통계적 유의차를 나타냅니다. | ||||
| 분할률: P = 0.74 | ||||
| 배반포 형성률: P = 0.02 | ||||
표 2: 소 세포질을 이용한 붉은브로켓사슴 복제 배아의 체외 발달. 총 10회의 반복 실험이 수행되었으며, 사슴/소 쌍이 4회, 소/소 쌍이 6회였다. 분할률과 배반포 형성률은 재구성된 배아 수를 분모로 하여 계산하였다.
멸종 위기 종의 게놈은 가축, 특히 세포질 수용체(cytoplasts)의 가장 큰 공급원인 소와 돼지의 난자를 사용하여 재프로그래밍될 수 있다는 점이 이미 잘 입증되었습니다21. iSCNT에서 달성한 가장 큰 진전 중 하나는 마지막으로 알려진 개체의 죽음 이후 사라졌던 아종인 피레네 아이벡스(Capra pyrenaica pyrenaica)의 복제였습니다. 재구성된 배아는 아이벡스의 상피 세포와 염소(Capra hircus)의 난자를 융합하여 얻었습니다. 저자들은 외부 형태적 이상이 없는 암컷 한 마리의 출산에 성공했습니다. 그러나 새끼는 심각한 호흡 부전을 보였으며 출생 후 몇 분 만에 사망했습니다22.
“부활”의 가장 유력한 후보 중 하나는 매머드(Mammuthus primigenius)입니다. 복제가 가능하려면 식별 가능한 핵을 가진 생존 가능한 조직의 확보가 필수적인데, 이는 약 10,000년 전에 사라진 종에게는 어려운 일입니다. 그럼에도 불구하고, 동결 지층에서 발견된 매머드의 사체는 iSCNT23를 위한 최소 요구 사항을 충족합니다. 하지만 아마도 멸종 위기 종들이 이 기술의 혜택을 받기에 더 적합한 후보일 것입니다.
본 연구에서 관찰된 분할률은 핵과 세포질의 종간 조합이 활성화 및 첫 번째 배아 분할에 영향을 미치지 않았음을 보여주었습니다. 재구성 단계에서 구조물(핵이식체/세포질이식체)의 조작 및 융합은 두 그룹 모두에서 동일한 기술적 용이성을 나타냈으며, 이는 종 간의 구조적 호환성을 시사합니다. 포배 형성률과 관련하여, 결과는 iSCNT 배아의 재구성 및 초기 활성화는 제한 요인이 아니지만, 발달 후기 단계에서 핵-세포질 불호환성이 나타남을 시사합니다. 이는 불완전한 후성유전학적 재프로그래밍 또는 하이브리드 배아가 포배 단계에 도달하는 능력에 영향을 미치는 모계-접합자 전환과 관련이 있을 가능성이 높습니다24. iSCNT의 효율은 핵이식체와 세포질이식체가 계통학적으로 연관된 종에서 유래했을 때 더 높은 경향이 있는데, 이는 생존 가능한 하이브리드 자손의 자연적 생산이 두 종 사이의 어느 정도의 핵-세포질 호환성을 나타내기 때문입니다23. 따라서 아종 간 SCNT는 이미 건강한 자손을 생산하는 것으로 밝혀졌습니다. 저자들은 암컷 개의 세포질이식체와 늑대 섬유아세포를 사용하고 배아를 12마리의 암컷에게 이식하여 자손 한 마리를 출산시켰습니다25.
iSCNT의 사용은 생물학적 및 발달 효율성 측면에서 중대한 "능력 제한"에 직면하며, 이는 공여 핵과 수용 난자 사이의 진화적 거리가 멀어질수록 급격히 감소합니다. 밀접하게 연관된 종(예: 가축 소와 가우르)26 사이에서는 성공적이지만, 더 먼 분류학적 경계를 넘으려 할 때는 생존 가능한 자손이나 안정적인 배아 세포주를 생성하는 데 통상적으로 실패합니다.
클로닝은 유전적으로 우수한 개체의 증식을 가능하게 하고, 형질전환 동물의 생성을 지원하며, 유전자 은행을 통해 가치 있는 유전 자원의 장기 보존에 기여하므로 가축 육종 및 보존 프로그램의 중요한 도구입니다. 그럼에도 불구하고, 가축 육종 프로그램에서 클로닝의 도입은 이식된 배아 수 대비 생산되는 살아있는 동물의 수가 적다는 점으로 인해 여전히 제한적입니다18. 복제 배아 생산을 위한 현재의 접근 방식은 일반적으로 전통적 클로닝과 ZP-free 클로닝의 두 가지 범주로 나뉩니다. 전통적인 방식에서는 미세조작기를 사용하여 난자 핵을 제거하고 공여체 체세포를 수용자 세포질 내로 도입해야 합니다26. 전통적 클로닝과 달리, ZP-free 방법은 미세조작 없이 수행됩니다27. 본 연구에서 얻은 결과는 난할률이나 배반포 형성률 모두 iSCNT를 사용하여 확인한 결과와 매우 유사했습니다20,21.
마지막으로, 본 절차의 여러 단계들을 고려하여 핵심 주의 사항과 실질적인 문제 해결 방법을 강조하는 것이 중요합니다. 투명대(ZP) 제거와 관련하여, ZP-free 클로닝은 조작의 용이성, 비용 효율성, 그리고 이식된 배아당 상대적으로 향상된 생존 출산율28을 포함한 여러 장점을 제공합니다. 치명적인 세포질 손상을 유발하지 않으면서 완전한 핵 제거(탈핵)를 확인하는 것은 재구성된 구조가 클로닝 배아를 성공적으로 지원할 수 있는지를 결정합니다. UV 노출은 유해한 영향을 미치는 것으로 알려져 있으나29, 대부분의 클로닝 연구실에서 일상적으로 사용되어 왔습니다. 마지막으로, ZP-free 배아 배양은 보호 역할을 하는 외부 당단백질 껍질이 없기 때문에, 취급 중 물리적 취약성이 높고 할구 분리가 일어나는 것과 같은 주요 문제가 발생합니다30.
결론적으로, 본 연구에서 얻은 결과는 iSCNT 프로토콜이 사슴/소 조합에서 기술적으로 가능함을 보여주는 예비 증거로 해석되어야 하며, 생산적 효능에 대한 결정적인 증거로 보아서는 안 됩니다. 따라서 이러한 발견을 확인하기 위해 더 많은 반복 실험을 포함한 추가 연구가 필요합니다.
저자들은 공개할 이해관계 충돌이 없습니다.
본 연구는 Cearense Foundation for Scientific and Technological Development Support(FUNCAP, 브라질 포르탈레자, Grant 번호 11212233/2022)와 National Institutes of Science and Technology(INCT/CNPq, Grant 번호 406866/2022-8)의 지원을 받아 수행되었습니다.
| 이름 | 회사 | 카탈로그 번호 | 댓글 |
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| CellTram 미세주입기 | Eppendorf | 5196 000.021 | |
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