본 프로토콜에서는 알팔파(Medicago sativa L.) 줄기 횡단면에서 리그닌과 펙틴 세포벽 성분의 침착을 시각화합니다. 본 연구의 목적은 바람직한 줄기 소화율 특성을 가진 새로운 알팔파 라인을 개발하기 위해 표적이 될 수 있는 줄기의 특정 조직을 식별하는 것입니다.
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방법 논문
본 프로토콜에서는 알팔파(Medicago sativa L.) 줄기 횡단면에서 리그닌과 펙틴 세포벽 성분의 침착을 시각화합니다. 본 연구의 목적은 바람직한 줄기 소화율 특성을 가진 새로운 알팔파 라인을 개발하기 위해 표적이 될 수 있는 줄기의 특정 조직을 식별하는 것입니다.
식물이 성장함에 따라 세포벽 성분이 축적되면 반추동물의 사료 영양가가 제한됩니다. 특히, 식물 조직 내의 리그닌 침착은 세포벽 탄수화물인 셀룰로오스와 헤미셀룰로오스의 분해를 방해하여, 사료로부터 얻을 수 있는 에너지 양을 감소시킵니다. 반면, 세포벽의 소화율이 높은 펙틴 성분은 쉽게 분해될 수 있습니다. 다양한 줄기 세포 유형에서의 리그닌 및 펙틴 침착에 관한 정보는 알팔파 계통 간의 줄기 소화율 차이를 일으키는 요인에 대한 기전적 통찰력을 제공할 수 있습니다. 반추위액 내에서 줄기 횡단면을 in vitro 배양하면 줄기 조직이 반추위 내에서 겪는 과정을 모사할 수 있습니다. 이 방법은 조직학적 염색 및 현미경 관찰과 결합하여, 시간에 따른 조직 분해 과정의 변화와 줄기 내 리그닌 및 펙틴의 위치를 시각화할 수 있게 합니다. Wiesner 염색은 리그닌의 guaiacyl (G) 알데히드 단위와 반응하여 이를 푸크시아색으로 염색합니다. 마찬가지로, ruthenium red는 펙틴의 카복실기와 상호작용하여 줄기 내 펙틴을 분홍색에서 오렌지색, 갈색 범위의 색조로 염색합니다. 본 프로토콜에서는 반추위 미생물에 노출시킨 후 알팔파 줄기 횡단면을 소화시키고, 이어 염색을 통해 세포벽 내의 리그닌 및 펙틴 패턴을 시각화하는 방법을 설명합니다. 이 방법은 리그닌과 펙틴의 존재 또는 부재 여부를 통해 줄기 조직을 식별하는 데 사용할 수 있으며, 알팔파 계통 간의 비교 분석을 용이하게 합니다.
모든 식물 세포는 세포벽으로 둘러싸여 있습니다. 셀룰로스, 헤미셀룰로스, 리그닌, 펙틴은 세포벽의 구성 성분이며, 반추동물 식이의 필수 요소인 식물 섬유의 일부가 됩니다. 펙틴은 소화율이 매우 높은(수용성) 다당류인 반면1, 리그닌은 섬유 분해를 제한하는 소화 불가능한 폴리머입니다2. 따라서 리그닌은 식물의 소화율을 낮추며, 결과적으로 반추동물이 조사료로부터 얻을 수 있는 에너지를 감소시킵니다. 하지만 리그닌은 가도관 요소를 강화함으로써 식물 전체에 물을 전달하는 것과 같은 중요한 식물 생리 기능을 지원합니다3. 이전 연구에 따르면 리그닌을 줄이거나 펙틴을 증가시키는 줄기 섬유의 변화가 줄기의 소화율과 조사료의 영양 가치를 높일 수 있음을 보여주었습니다4. 따라서 본 프로토콜은 이 두 가지 세포벽 성분에 집중합니다. 줄기 세포벽 내 리그닌과 펙틴의 총 농도만으로는 줄기 섬유 소화율의 기저 기전을 설명하기에 불충분합니다5. 반추위액을 이용한 in vitro 배양과 조직학적 염색을 통해, 줄기 섬유 소화율이 각기 다른 식물들 간의 세포벽 성분 차이를 시각화함으로써 세포 수준에서의 통찰을 얻을 수 있습니다4,6. 본 프로토콜에서는 일반적인 다년생 사료용 콩과 식물인 알팔파(Medicago sativa L.)를 모델 종으로 사용하여, 잎보다 리그닌 함량이 높고 펙틴 함량이 낮은 줄기 조직 내 리그닌과 펙틴의 패턴을 설명합니다.
In vitro 반추위액 배양은 반추 동물의 위 내 사료 소화를 모사하여, 사료의 해부학적 구조가 소화율에 미치는 영향을 관찰할 수 있게 해줍니다. 시험관 내에 반추위와 유사한 조건을 조성함으로써, 유리 슬라이드에 부착된 줄기 횡단면을 여러 시점에서 회수하여 반추위액 노출에 따른 조직 분해 정도를 평가할 수 있습니다6. 이 방법은 알팔파 줄기의 해부학적 구조를 시각화하고7 줄기가 소화됨에 따라 서로 다른 세포벽 성분을 포함하는 세포 유형들이 어떻게 변화하는지 조사하는 비교적 단순하고 신속하며 비용 효율적인 접근 방식을 제공합니다.
줄기 횡단면의 조직학적 염색을 통해 세포벽 성분을 시각화할 수 있습니다. 플로로글루시놀과 염산(HCl)이 결합하여 Wiesner 염색액을 형성하며, 이는 G C6C3 알데하이드(coniferaldehyde) 단량체9와 반응함으로써 guaiacyl-rich 리그닌 단위가 포함된 줄기 조직을 강조합니다8. 리그닌은 여러 단량체 하위 단위로 구성되지만, 본 논문 전체에서 "리그닌"이라는 용어는 Wiesner 염색액과 반응하여10 본 프로토콜을 통해 시각화되는 G-단위 단량체만을 지칭합니다. 물관(xylem vessels)과 같은 일부 조직은 항상 리그닌화되어 있습니다6. 그 외의 경우, 알팔파 줄기 조직의 리그닌 침적은 2차(형성층) 성장이 시작될 때 시작되며, 이는 줄기 마디 간의 신장 정지와 일치합니다6. 루테늄 레드는 때때로 에스테르화되어 있으며 일부 측쇄를 공유하는 카르복실기를 포함하는 펙틴 물질에 결합합니다11. 중층(middle lamella)과 1차 세포벽에 존재하는 펙틴의 카르복실기는 루테늄 레드와 상호작용합니다11. 펙틴은 세포 신장에 관여하므로 1차 성장 중인 세포에 존재합니다. 본 원고 전반에서 "펙틴"이라는 용어는 존재할 수 있는 펙틴 전체 군을 일반적으로 지칭합니다. 조직학적 염색을 반추위 in vitro 배양과 병행하면 줄기 내 세포벽 성분의 위치 관찰이 용이해지며, 반추위 소화 과정 동안 서로 다른 세포 유형이 어떻게 변화하는지 확인할 수 있습니다. 궁극적으로 이 프로토콜은 리그닌 및 펙틴을 함유한 줄기 세포를 식별하고, 알팔파 계통 및 배양 시간에 따른 패턴을 특성화하는 데 사용될 수 있습니다.
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본 연구는 동물 실험에 관한 기관 지침(IACUC 2301-40689B)을 준수하여 수행되었습니다.
1. 샘플 튜브 라벨링
2. 줄기 횡단면 절편 제작 및 슬라이드 마운팅
3. 줄기 횡단면의 in vitro 배양 준비
4. 줄기 횡단면의 in vitro 배양
5. 리그닌 확인을 위한 횡단면 염색
6. 펙틴 확인을 위한 횡단면 염색
7. 명시야 이미지 촬영
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원심분리 튜브를 사용하여 반추위 조건을 시뮬레이션함으로써 Medicago sativa 줄기 횡단면의 상대적으로 빠르고 저렴한 in vitro 소화를 가능하게 했습니다. 슬라이딩 마이크로톰을 사용하여 100 μm 두께의 M. sativa 줄기 횡단면을 제작했습니다(그림 1A). 줄기 횡단면을 양면테이프로 유리 슬라이드에 부착하고(그림 1B), 4 h에서 96 h까지의 배양 기간 동안 반추위액 접종액에 침지시켰습니다(그림 1C). in vitro 배양을 위해 캡이 있는 일회용 50 mL 원심분리 튜브를 배양 용기로 사용하였으며, 배양 기간 동안 반추위 미생물을 유지하기 위해 1 mm로 분쇄한 옥수수대 기질 0.2 g을 첨가했습니다. 튜브는 39 °C로 유지되는 항온수조에서 배양했습니다(
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본 연구에 사용된 알팔파 재료는 5개 알팔파 라인의 클론으로 구성되었습니다. 두 개의 실험 라인은 16 h IVNDFD와 96 h IVNDFD가 모두 낮거나, 또는 16 h IVNDFD와 96 h IVNDFD가 모두 높은 모주를 대상으로 in vitro 중성 세제 섬유 소화율(IVNDFD)에 대한 두 차례의 이질적 선택을 거쳐 선정되었습니다12. 유전적 배경이 알려지지 않은 세 개의 상업적 라인도 연구에 포함되었으며, 근적외선 분광 분석을 통해 (a) 리그닌 함량이 가장 높은 개체, (b) 리그닌 함량이 가장 낮은 개체, (c) 중성 세제 섬유 및 산성 세제 섬유 함량이 가장 낮은 개체를 모주로 선정하였습니다. 이 5가지 알팔파 라인은 2021년 5월 온실에서 미국 미네소타주의 두 곳에 위치한 반복 필드 시험지로 이식되었습니다. 각 성장 시즌의 1차 및 2차 수확 시기에, 식물 성숙도의 영양 생장기, 초기 꽃봉오리 형성기, 초기 개화기, 개화기 및 녹색 꼬투리 ...
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저자들은 잠재적인 이해 상충으로 해석될 수 있는 어떠한 상업적 또는 재정적 관계 없이 본 연구가 수행되었음을 밝힙니다. 본 출판물에 언급된 상표명 또는 상업적 제품은 오직 구체적인 정보를 제공하기 위한 목적이며, 미국 농무부(U.S. Department of Agriculture)의 추천이나 지지를 의미하지 않습니다. USDA는 기회균등 제공자이자 고용주입니다. 모든 실험은 실험이 수행된 국가인 미국의 현행 법률을 준수하였습니다.
저자들은 이전의 관련 연구에 대한 통찰력을 제공해 준 R. Ted Jeo에게 감사를 표합니다. 출판용 이미지를 제작하기 위해 현미경 이미지 획득 및 분석 소프트웨어를 사용할 수 있도록 지원해 준 University of Minnesota - Twin Cities의 University Imaging Center에 감사드립니다. 본 연구는 미국 농무부 농업연구청[062-21500-001-000D]과 비원조 협력 협정(No. 58-5062-2-016)의 지원을 받아 수행되었습니다.
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| 이름 | 회사 | 카탈로그 번호 | 댓글 |
|---|---|---|---|
| 알루미늄 호일 | 보드워크 | 7106BW | 18인치 × 1,000피트; 광민감성 염색액을 빛으로부터 보호하는 데 사용됨 |
| 염화칼슘 이수화물, 최소 99% | Sigma Life Science | C7902-500G | CAS No. 10035-04-8; McDougall용 시약’S 완충액 |
| 카메라 소프트웨어 | Nikon | NIS-Elements AR 5.42.04 | 이미지 획득 및 분석에 사용되는 64비트 이미징 소프트웨어 |
| 이산화탄소 가스 | Matheson | UN1013 | 유틸리티 등급; 조제 및 배양 동안 무산소 상태를 유지하는 데 사용됨 |
| 순환식 항온수조 | 정밀도 | — | 시료를 일정 온도로 유지하는 데 사용되는 온도 조절 순환식 항온수조 39 °C |
| 옥수수 대 표준물질 | 미네소타 대학교 | 제공된 텍스트가 없습니다. 번역할 내용을 입력해 주세요. | 2023년 가을 미국 미네소타주 세인트폴에서 수확하여 1mm 크기로 분쇄한 후 미생물 배지로 사용함 |
| 커버글라스 | Thermo Scientific | 3419 | 24 mm × 30 mm, No. 1.5 두께, 1 oz |
| FX 대형 포맷 CMOS 이미지 센서가 탑재된 Digital Sight 10 컬러 현미경 카메라 | Nikon | MQA20000 | 명시야 현미경 이미지를 획득하는 데 사용되는 디지털 컬러 카메라 |
| 해부 현미경 | Nikon | SMZ18 | 줄기 횡단면의 방향 설정 및 배치를 위해 사용되는 실체 현미경 |
| 양면 테이프 | SelloTape Office Vinyl 양면 테이프 | 4270 | 2 mm × 53 μm; 줄기 횡단면을 유리 슬라이드에 고정하는 데 사용됨 |
| 전자저울 | 및 | GH-202 | 소수점 넷째 자리까지 읽기 가능한 분석 저울 |
| 삼각 플라스크 (125 mL) | Kimax | 25600 | 125 mL 플라스크; 5번 마개와 호환됨 |
| 삼각 플라스크 (25 mL) | Pyrex | 4980 | 25 mL 플라스크; 0번 마개와 호환 가능 |
| 에탄올 (200 proof) | Fisher Scientific | 04-355-720 | 염색액 조제 및 염색 전 세척에 사용되는 절대 에탄올 |
| 압출법 보온판 (압출 polystyrene 강성 폼 단열재) | Owens Corning | 1407788 | 1인치 × 2피트 × 2피트, R-5, 15 PSI 폼 보드; 절편 제작 시 줄기 마디 간격을 지지하는 데 사용됨 |
| 포셉 | Fisher Scientific | 10-316A | 줄기 세그먼트, 슬라이드 및 마운팅된 절편을 다루는 데 사용되는 실험실용 핀셋 |
| 슬라이드 글라스 | FisherBrand | 125503 | 25 mm × 75 mm × 1 mm; 줄기 횡단면 고정용으로 사용됨 |
| 구형 플라스크 (6 L) | Pyrex | CLS43205L-4EA | 더 많은 양의 용액 조제 또는 취급에 사용되는 6 L 유리 플라스크 |
| 글리세린, 실험실 등급 액체 | Fisher 과학 교육 | 525342C | CAS No. 56-81-5; 봉입 및 보관 용액에 사용되는 글리세롤 |
| 50등급 2겹 치즈클로스 | JINIOHEE 숍 | B0FL27KXRN | 100% 면, 표백 백색; 반추위 물질 및 반추위액 여과에 사용 |
| 메스실린더 (10 mL) | Pyrex | 700024 | 액체 부피 측정을 위해 사용되는 10 mL 메스실린더 |
| 염산 | Fisher | A1445-500 | CAS No. 7647-01-0; 플로로글루시놀(phloroglucinol)과 함께 사용하여 비즈너 염색약(Wiesner stain)을 조제하는 데 사용됨 |
| 산업용 초강력 매직 마커 | 샤피(Sharpie) | 13601 | 가는 팁; 내수성 표시로 배양 튜브에 라벨을 부착하는 데 사용됨 |
| L-시스테인 염산염 수화물 | Sigma-Aldrich | C121800-10G | CAS No. 345909-32-2; 배양액 조제에 사용되는 환원제 |
| 저보풀 티슈 | Kimberly-Clark | 34155 | 4.5인치 × 8.5인치; 섬유가 남지 않게 슬라이드에서 과잉 액체를 흡수하는 데 사용됨 |
| 저프로파일 마이크로톰 칼날 | Leica 819 | 63065-LP | 균일한 줄기 횡단면 제작에 사용되는 교체용 로우 프로파일 블레이드 |
| 황산마그네슘 칠수화물 | Fisher Chemical | M80-500 | CAS No. 10034-99-8; McDougall용 시약’s 완충액 |
| 마그네틱 스터링 바 | Fisher Scientific | 03-411-783 | 76 mm × 12 mm; 버퍼 및 접종액 혼합용으로 사용됨 |
| 우편 주소 라벨 | 에이버리 | 5167 | 1/2 인치 × 1 3/4인치; 시료 및 슬라이드 식별용으로 사용됨 |
| 페인트 브러시 | Loew-Cornell | — | Series 7000, 3번 라운드; 줄기 횡단면의 이동 및 조작에 사용되는 세밀 붓 |
| 덮개가 있는 페트리 접시 | Becton Dickinson 실험실 소모품 | 81731119 | 60 mm × 15 mm; 초순수 내 줄기 횡단면의 일시적 보관에 사용됨 |
| 플로로글루시놀, 1,3,5-트리하이드록시벤젠 | Sigma-Aldrich | P3502-25G | CAS 번호 108-73-6; Wiesner 염색액 조제에 사용되는 시약 |
| 피펫 (100 μL) | Gilson | P 1000; 767547M | 염색액 분주에 사용되는 가변 부피 피펫 |
| 플라스틱 다용도 깔때기 | Nalgene | 10-437-23E | 150 mm; 시약 옮기기 및 여과에 사용됨 |
| 폴리프로필렌 비커 (4 L) | Nalgene | 1201-4000 | 접종액의 조제 및 혼합에 사용되는 4 L 화학 내성 비커 |
| 염화칼륨 | Fisher Chemical | P217-500 | CAS No. 7447-40-7; McDougall용 시약’S 완충액 |
| 면도날 | 페르소나 | 66-0089 | 두께 0.009인치; 줄기 시료의 수동 트리밍에 사용됨 |
| 루테늄 레드, 암모니아화 루테늄 옥시클로라이드 | 시그마 | R-2751 | CAS No. 11103-72-3; 펙틴성 물질을 시각화하는 데 사용되는 조직학적 염색제 |
| 가위 | Fiskars | 1063071 | 테이프, 폼 및 기타 소모품 절단에 사용되는 범용 가위 |
| 나사캡 원추형 원심분리 튜브 (50 mL) | Corning | 430828 | 폴리프로필렌, 비발열성; 시료 보관, 배양, 세척 및 저장에 사용됨 |
| 슬레지 마이크로톰 | Leica | 2000R | 제작에 사용된 슬라이딩/슬레지 마이크로톰 100 μm- 두꺼운 줄기 횡단면 |
| 탄산수소나트륨, ACS 등급 | Fisher Chemical | S233-3 | CAS No. 144-55-8; McDougall용 시약’s 완충액 |
| 염화나트륨 | Fisher Chemical | — | CAS 번호 7647-14-5; McDougall용 시약’s 완충액 |
| 수산화나트륨 | Fisher Chemical | S318-500 | CAS 번호 1310-73-2; 환원 용액 조제에 사용됨 |
| 무수 인산수소나트륨 (Na2HPO (고배율 광학 현미경)4) | Sigma Aldrich | S-9763 | CAS 7558-79-4 |
| 무수 황화나트륨, ACS, 최소 98.0% | Oakwood Chemicals | 245960 | CAS No. 1313-84-4; 배양액 조제에 사용되는 환원제 |
| 스푼뉴라 실험실용 스푼 | Fisher Scientific | 14-375-10 | 분말 시약 전송에 사용되는 실험실용 스파툴라 |
| 교반기 | Sybron 사의 Thermolyne | 7200 | 완충액과 접종액을 혼합하는 데 사용되는 마그네틱 교반기 |
| 광구 니들이 장착된 주사기 (60 mL) | Monoject | 935401028 | 접종액 분주에 사용되는 굵은 바늘이 장착된 60 mL 주사기 |
| 시험관 랙 | Thermo Scientific | 14-809-44 | 50 mL 배양 튜브를 정리하고 지지하는 데 사용되는 랙 |
| 온도계 | FisherBrand | 13201663 | 용액 및 항온수조 온도를 확인하는 데 사용되는 실험실용 온도계 |
| 정립 현미경 | Nikon | Eclipse Ni | 염색된 줄기 횡단면의 시각화 및 이미징에 사용되는 정립 명시야 현미경 |
| 유틸리티 펌프 | Little Giant Pump Co. | 502203 | 모델 2E-38N; 115 VAC, 60 Hz, 1.7 A; 물을 순환시키고 일정한 중탕 온도를 유지하는 데 사용됨 |
| 약포지 | VWR 과학 제품 | 12578-165 | 고체 시약 및 옥수수대 배지를 칭량하고 옮기는 데 사용되는 일회용 칭량지 |
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