2010년 10월 2일
우리는 사는 박테리아에 stomatal 응답을 액세스하는 간단하고 재현성 프로토콜을 개발했습니다. 이 방법은 표피 껍질의 사용에 비해 잎사귀의 입힐 수있는 총알과 조작은 이전에 보고된 최소화합니다.
본 절차에서는 살아있는 박테리아 세포에 반응하는 공변세포의 움직임을 평가하기 위해 잎 이미징 기법을 사용합니다. 먼저, 글리세롤 스톡으로부터 박테리아를 배양하여 접종액을 준비합니다. 그다음, 건강한 어린 잎을 수집하여 propidium iodide로 염색합니다.
염색된 잎을 절단하여 잎 조각을 박테리아 현탁액 위에 놓고 배양합니다. 마지막으로 현미경으로 잎 표면을 관찰하여 기공 개구부를 측정할 수 있습니다. 형광 현미경을 사용하여 얻은 결과는 박테리아에 반응하여 기공 개구부가 변화함을 보여줍니다.
표피 박리법과 같은 기존 방법과 비교하여 이 방법이 가진 주요 장점은, 박테리아와 접촉하는 잎이 온전한 상태로 유지되어 박테리아가 잎으로 침투하는 자연적인 조건을 모사할 수 있다는 점입니다. 이 실험 절차를 시작하기 위해, Arabidopsis 종자를 성장 배지와 질석, 퍼라이트를 1:1:1 비율로 혼합한 배지에 파종합니다. 식물을 생장 챔버에서 재배하며 필요에 따라 물을 줍니다.
식물은 추대 전 어린 잎이 완전히 전개되었을 때인 4~6주 후에 사용할 준비가 됩니다. 실험 시작 이틀 전에 박테리아 배양 스트리크를 준비하십시오. 글리세롤 스톡에서 Pseudomonas ringe를 변형된 LB 배지에 스트리크하고 28 °C에서 24시간 동안 배양하십시오.
접종원을 준비하려면 신선한 배양물을 사용하고, 항상 글리세롤 스톡(glycerol stocks)으로부터 배양 플레이트를 시작하십시오. 계대 배양 후 박테리아의 독성이 약해지므로, 플레이트에서 성장한 박테리아를 사용하여 10 milliliter의 pseudomona singe 액체 배양을 시작하십시오. 50 milliliter 삼각 플라스크에 배양물을 넣고 28 °C에서 격렬하게 흔들어주며 하룻밤 동안 배양하여 600 nm에서의 광학 밀도(OD)가 0.8에서 1 사이가 되도록 하십시오.
600 nm에서 OD를 측정하고 1,360 ×g에서 10분 동안 원심분리하여 세포를 수확합니다. 최종 OD가 0.2가 되도록 증류수에 세포를 재현탁합니다. 이 OD 값은 mL당 10⁸ CFU(colony forming units)에 해당합니다.
박테리아 준비가 완료되면, 잎을 준비하고 잎을 염색하기 위한 분석을 수행합니다. 먼저, 물에 20 µM propidium iodide(PI) 용액을 준비합니다. 용액 10 mL면 한 번에 작은 잎 3장을 염색하기에 충분합니다.
생장 챔버에서 식물을 꺼내어 핀셋을 사용하여 완전히 확장된 어린 잎 3장을 떼어냅니다. 잎 전체를 PI 용액에 5분 동안 담급니다. 그 다음 잎을 꺼내어 증류수로 짧게 헹굽니다.
다음으로, 잎의 뒷면이 아래로 향하도록 현미경 슬라이드 위에 놓습니다. 날카로운 면도날을 사용하여 잎의 중앙맥을 제외하고 네 조각으로 자릅니다. 이는 잎이 슬라이드 위에 평평하게 놓여 박테리아와 잎이 함께 배양될 수 있도록 하기 위함입니다. 슬라이드 위 잎 조각들 아래에 박테리아 현탁액 300 µL를 첨가하고, 잎의 뒷면이 접종물과 접촉하고 있는지 확인합니다.
식물을 재배할 때와 동일한 환경 조건에서 시료를 배양합니다. 현미경으로 잎을 관찰할 시간이 되면, 잎 조각을 새로운 슬라이드로 옮기고 잎의 뒷면이 위를 향하도록 배치합니다. 슬라이드 마운팅 시 커버 슬립은 사용하지 않는다는 점에 유의하십시오.
동일한 잎 샘플을 배양 기간 동안 여러 번 촬영할 수 있으며, 연구 목적에 따라 시간 경과 분석(time course)을 설정할 수 있습니다. 본 과정에서는 레이저 주사 공초점 현미경을 사용하여 잎을 조사하고, 동일한 잎 샘플의 하단 표면을 관찰하여 PI의 형광을 검출하며, 시간에 따른 기공의 이미지를 캡처합니다. 이후 기공 개구부의 너비를 측정하기 위해 해당 이미지들을 저장합니다.
각 시점의 처리군별로 최소 60개 이상의 기공의 기공 개구폭을 측정하십시오. LSM 이미지 브라우저를 사용하여 기공 개구폭의 평균과 표준 오차를 산출합니다. 결과의 통계적 유의성은 양측 paired wise Student's t-test를 사용하여 계산할 수 있습니다.
여기에 제시된 T-test는 레이저 주사 공초점 현미경으로 관찰한 애기장대 잎 표면의 전형적인 현미경 이미지입니다. 명시야 뷰에서 propidium iodide는 생존 세포의 세포벽을 염색하여, 손상되지 않은 세포를 식별할 수 있게 함과 동시에 공변세포의 가시성을 높여줍니다. 이러한 마이크로그래프에서는 완전히 닫힌 기공부터 넓게 열린 기공까지 다양한 범위의 기공 개폐 상태를 확인할 수 있습니다.
완전히 닫힌 기공은 공변세포의 모양으로 식별합니다. 열린 기공의 경우 기공 너비는 0 µm로 간주합니다. 표시된 기공 너비는 기공 구멍의 가장 넓은 영역을 가로질러 그은 직선을 사용하여 측정합니다.
이는 살아있는 잎 접종 분석의 전형적인 실험 결과입니다. Arabidopsis 잎을 세 가지 서로 다른 Pseudomonas 균주와 함께 암소에서 배양했을 때, 박테리아 균주당 무작위로 선택된 60개 기공의 개구부 너비를 측정한 결과 P-S-T-D-C 3000 균주만이 암소의 기공을 열 수 있었습니다. 이 기술은 식물-박테리아 상호작용 분야의 연구자들이 식물 종의 병원체에 대한 초기 반응 메커니즘을 탐구할 수 있는 길을 열어주었습니다.
본 연구는 기존 방식에 비해 손상을 최소화하면서 온전한 잎을 사용하여 살아있는 박테리아에 대한 기공의 반응을 평가하는 새로운 프로토콜을 제시합니다. 이 기술을 통해 박테리아 노출에 따른 공변세포의 움직임을 실시간으로 관찰할 수 있습니다.
이 방법은 살아있는 박테리아 자극에 반응하는 기공의 역동성을 실시간으로 비파괴적으로 평가할 수 있게 하여, 식물-병원균 상호작용 연구에서 기전적 리스크 제거(de-risking)를 지원합니다. 잎의 무결성을 유지하고 자연적인 감염 조건을 모방함으로써, 농약 또는 생물 농약 개발을 위한 초기 단계의 타겟 검증에 대한 예측 신뢰도를 높여줍니다. 이러한 접근 방식은 호스트 생리 기능에 대한 박테리아의 직접적인 영향과 이차적 스트레스 반응을 구분하는 핵심적인 발견의 변곡점을 해결합니다.
이 방법은 초기 발견 연속 과정에 부합하여 타겟 검증의 가설 테스트를 지원하며, 식물 면역 조절제 또는 항독성 제제에 초점을 맞춘 스크리닝 캠페인을 위한 재현 가능한 분석법 개발을 가능하게 합니다.